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文檔簡介

1、XPSpeak軟件比較好用,其實(shí)久仰大名,可是以前從未分過峰,一看英文界面就退卻了,這個(gè)月被 畢業(yè)論文壓的實(shí)在沒轍了,被逼的學(xué)了一點(diǎn)皮毛,很多高人都很強(qiáng)了, 我只是覺得還會有我這樣的小菜,所以還是說出來分享分享,同時(shí)高人也幫忙指導(dǎo)一下其中的不足和我不明白的地方,算是拋磚引玉吧XPSpeak有兩個(gè)界面一個(gè)是數(shù)據(jù)處理區(qū),一個(gè)是主界面(呵呵自己起的名字)圖是從幫助文檔里 粘的L'J-j fe dii- juufid 占比內(nèi). 叫idifcCa田 ULUikuHujuiXi臚和FFIH數(shù)據(jù)處理區(qū)前期我們主要使用的是數(shù)據(jù)處理區(qū),后期擬合調(diào)整參數(shù)時(shí),主界面才使用較多,主界面region有1-10指

2、是個(gè)需要處理擬合的原始圖譜序號,peak下面也有是個(gè)小框框,是操作每個(gè)需要處理擬合的原始圖譜中所有添加的擬合峰,可以同時(shí)添加十個(gè)擬合峰。具體使用方法后面會有提到這里就不多說了。首先先把數(shù)據(jù)打開,在”數(shù)據(jù)處理區(qū)-data ”,就會有很多導(dǎo)入格式和導(dǎo)出格式,如果你的數(shù)據(jù)格式選項(xiàng)里剛好有就 沒問題了,如果沒有,就把數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)成ASCH數(shù)據(jù),再導(dǎo)入,具體做法如有問題,可以找我,這里 也不多說了。數(shù)據(jù)可以用import(ASC)在這里我順便提一下(對于數(shù)據(jù)選擇,我認(rèn)為, 最好把要擬合的峰的數(shù)據(jù)用Orin gin從原始數(shù)據(jù)里看著圖挑出來,單獨(dú)處理需要擬合的峰,在整個(gè)原始峰中擬合不太方便,我個(gè)人覺得把需要擬合峰

3、的原始數(shù)據(jù)單獨(dú)處理比較好,可能有不對之處, 大家指出:) 現(xiàn)在我們開始。第一步:扣背地,"數(shù)據(jù)處理區(qū) Background ",點(diǎn)上后會出來個(gè)對話框最上面的兩個(gè)EE值是你 要擬合的峰的范圍,譬如我們知道我們ni的峰在8 5 18 5 9之間,看著這個(gè)峰,出峰的大致范圍在8 5 18 59,可實(shí)際上可能值有點(diǎn)偏,可 以再調(diào)節(jié)370.08600Binding Energy (eV)High BE 858A3-RegionBomidciiaw BE 851JS1No* of Ave* Pisat end-pointsNfliteBackgvundTJTe Tougaard 扣背底

4、的函數(shù)選擇,我比較喜愛第 三個(gè),就是 Tougaard,當(dāng)然,不同 的譜線形狀應(yīng)該選擇合適的函數(shù), 這三個(gè)總是能挑出來比較好用的, 需要讀者自己實(shí)踐了。不用管Shirley+IdLnear (0 for 囂liirj11452921Fm Tougaard onlyB1 97970.9調(diào)整 Shirley,Linear,參數(shù)好像是傾斜度Clo&e=j|調(diào)整Tougaard的參數(shù),點(diǎn)低 了就調(diào)高,點(diǎn)位置太高就把這 個(gè)值調(diào)小好像是扣背 底的時(shí)候, 選擇背底線 可以調(diào)整的 節(jié)點(diǎn)數(shù)吧大概估計(jì)一下那個(gè)要擬合的峰的范圍,置扣背底的函數(shù),這個(gè)上面有首尾要和原始圖譜剛好接上但不能相交!如果相交,調(diào)整 (

5、取決于你使用哪種函數(shù)),我的理解是點(diǎn)擊相應(yīng)的然后"accept”是細(xì)調(diào)。然后把上下限填上,Shirley,L in ear,Tougaard,這樣最上面的值就填好了接下來就是設(shè)三種。在扣背底的時(shí)候要注意,背底的線Shirley,L in ear,參數(shù)或者 Tougaard 的參數(shù) optimise是粗調(diào),根據(jù)情況自己手動(dòng)改參數(shù)第二步,加峰,”數(shù)據(jù)處理區(qū)Add Peak ”,后出現(xiàn)第一個(gè)添加的擬合峰的參數(shù)選擇。此時(shí),在主界 面的region 1后的peak列中會出現(xiàn)一個(gè)數(shù)字 0,添加的第一個(gè)峰和這個(gè)peak列中的0是對 應(yīng)的,所添加的峰的參數(shù)都可以通過主界面中再次調(diào)用以便修改,(在這首

6、先要說明一下,擬合峰的數(shù)量問題, 就是在這個(gè)位置我們怎么斷定原始圖譜是有多少個(gè)峰疊加成的,一是看參考文獻(xiàn),以及對自身樣品的峰位情況比較了解知道這個(gè)位置會出現(xiàn)幾個(gè)峰, 是要看擬合情況,如果按照常理,這個(gè)位置應(yīng)該有兩個(gè)峰,可是兩個(gè)峰擬合總是不對,峰寬不對等等,那就要考慮是否有第三個(gè)峰的情況了,)最頂上 選取電子軌道:s,p,d,f 我們需要的是Ni的2p 3/2,所以選pPeak TypeConstraintsrFWHM2我們應(yīng)該清楚這些位置出現(xiàn)兩個(gè)首先我們填取第一個(gè),文獻(xiàn)中有報(bào)因此我們就填854.7,后面有fix就 那就可r AreaHConstidinOptimise接著通過參考文獻(xiàn)的調(diào)研,或

7、者更多峰的大概位置,道應(yīng)該在854.7ev附近,是是否固定該值,如果我們有信心這個(gè)峰一定在這, 以選上,否則最好不選nstrints口 Ftv Optimise7 接著就是半高寬,可以根據(jù)圖譜大概估計(jì)大小,我們的 圖可以看出總得峰的半高寬大約為 4ev,根據(jù)文獻(xiàn)這個(gè) 位置只有兩個(gè)峰,所以我們就可以填 2ev,不固定該值(fix不選)讓他自動(dòng)調(diào)節(jié)-味 Loreniziait- Gauss iui (0;G, 100:L) soOptimisefaints然后就是峰面積,這個(gè)值可以隨便填一個(gè) 0-10的數(shù),然后 讓其自動(dòng)調(diào)節(jié),根據(jù)第一次擬合的情況酌情改正-Asvimnetiv (TS=0 for

8、o i '6.01200'TS W IL | 丄Actual FXBM: 2,000eVOptimise Peak最后一個(gè)就是高斯擬合的一個(gè)參數(shù),具體我也不是很清楚 了,但是我通常調(diào)到8 0左右,然后不固定選項(xiàng)Ancf?pt選擇Accept,則此峰參數(shù)已選好,如要修改此峰參數(shù),在主界面region 1, peak點(diǎn)0就跳出來此峰參數(shù)對話框,修改即可。如此重復(fù),直到把所有你認(rèn)為應(yīng)該有的峰添加完畢(本篇默認(rèn)為兩個(gè)擬合峰),此時(shí) 數(shù)據(jù)處理區(qū),會新出現(xiàn)三個(gè)峰,兩個(gè)細(xì)線,是你添加的峰,還有一個(gè)特粗的線,那個(gè)是你添 加的峰的合峰,然后就是再點(diǎn)數(shù)據(jù)處理區(qū)optimise region :或者

9、"主界面opotimise all"開始擬合,看看那個(gè)合峰是否和你的原始峰重疊,這個(gè)時(shí)候會跳出一個(gè)“fitting ”的對話框,完畢后,繼續(xù)點(diǎn) 數(shù)據(jù)處理區(qū)optimise region 或者"主界面opotimise all",重復(fù)操作,直到擬合的峰形峰位基本不動(dòng)為止,這時(shí)如果合峰和原始圖譜還有差距,那就需要更改擬合峰的峰位,半高寬:峰面積,和高斯參數(shù)。該完參數(shù)“ accept",然后繼續(xù)點(diǎn) 數(shù)據(jù)處理區(qū)optimise region :或者"主界面 opotimise all",不斷的修改參數(shù),直到最后合峰與原始圖譜基本重疊

10、。雖然該軟件是自動(dòng)擬合,但是改了參數(shù),圖形會有較小的改變,只要你給的參數(shù)越接近,擬合 到重疊就越快越好。這個(gè)時(shí)候圖基本就算擬合好了。說了這么多有點(diǎn)亂,希望能給不會用XPSpeak的人有些幫助。也希望高人指點(diǎn)一二,能讓上文有些名詞更正規(guī)一點(diǎn),經(jīng)驗(yàn)之談所以有很多自造詞。兩個(gè)單獨(dú)的峰由于靠的很近,會導(dǎo)致形成一個(gè)重疊峰的形成。如果想計(jì)算幾個(gè)峰之間 的面積比例關(guān)系的話,就需要先把這個(gè)重疊峰分離成幾個(gè)單獨(dú)的峰。據(jù)個(gè)例子,比如在做聚合物多晶 x 射線衍射的時(shí)候,不同晶型的衍射峰與無定形部分 的 衍射峰彼此重疊,這些峰對應(yīng)的面積比與他們之間的含量比成線性關(guān)系。通過計(jì)算晶 體衍射峰的面積與無定形衍射峰的面積,就

11、可以大致的到聚合物的結(jié)晶度。將數(shù)據(jù)作圖后(注意,這里的數(shù)據(jù)一般間隔的非常近,所以作出的圖點(diǎn)與點(diǎn)之間也比 較連續(xù)),檢查菜單欄 data 中看是否需要分峰的數(shù)據(jù)被勾上了。沒勾的話就選中。注意,如果數(shù)據(jù)的x范圍很大,而需要分峰的部分很小,比如,整個(gè)數(shù)據(jù)的x軸的范圍是 0-100, 而需要分的重疊峰的位置在 40-60,其他部分均為平的基線或其他無關(guān) 的峰,那么我們就需要在 worksheet 表格里把 0-40,以及 60-100 的數(shù)據(jù)都刪掉,只留 40-60這段范圍的數(shù)據(jù)。這步是一定要做的,否則分出來的峰非常不準(zhǔn)。刪除不需要的數(shù)據(jù)后,在 graph 窗口中可以看到只留下了重疊峰的數(shù)據(jù)圖, 這時(shí)

12、點(diǎn)菜 單欄中的 analysis->fit multi peaks->guassian or lorentzian(這兩個(gè)什么區(qū)別我也不是很清楚,感覺作出來的圖是一樣的) ,選中一個(gè)擬和方法后,會跳出一個(gè)對話框 number of peak, 問你要分成幾個(gè)峰,輸入個(gè)數(shù)確定后,又跳出一個(gè)對話框問你估計(jì)的 半峰寬。這里用它的默認(rèn)的就好了。然后在圖上觀察你認(rèn)為的幾個(gè)單獨(dú)峰的位置,雙擊 你認(rèn)為的位置后,會出現(xiàn)一條垂直的虛線,直至將幾個(gè)峰的峰值位置選好后,可以看到 這個(gè)重疊峰就被分成了幾個(gè)單獨(dú)的峰。其中綠色的擬和曲線是被分成的每個(gè)單獨(dú)的峰,紅 的是這幾個(gè)綠色峰的加和,紅色的線應(yīng)該跟你原來的重疊峰吻合的非常好。根據(jù)圖中的信息框的內(nèi)容可以得到擬和出來的峰函數(shù)的系數(shù)值。 根據(jù) result 窗口里面 的信息可以得到峰額面積,半峰寬以及中心位置。1. 安裝 origin7.02. 安裝插件 PeakFittingModule for origin 7.0,之后在 origin 中出現(xiàn)一個(gè)分峰的小圖標(biāo)。3. 選擇數(shù)據(jù)曲線,點(diǎn)擊分峰圖標(biāo),出現(xiàn)下圖: 選擇分峰的區(qū)域, NEXT 選擇濾波函數(shù), NEXT 設(shè)定基線, NEXT 基線運(yùn)算, NEXT 設(shè)定峰的類型,個(gè)數(shù),高度閾值,按 Pick Peaks , NEXT 增刪峰位, NEXT調(diào)整峰位,峰高,峰寬,使分峰的擬合結(jié)果與原圖

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