分子生物學(xué)復(fù)習(xí)題(基本完整版)_第1頁
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文檔簡介

1、WORD格式分子生物學(xué)復(fù)習(xí)題第一章1、蛋白質(zhì)的三維構(gòu)造稱為構(gòu)象 (conformation) ,指的是蛋白質(zhì)分子中所有原子在三維空間中的排布,并不涉及共價鍵的斷裂和生成所發(fā)生的變化。2、維持和穩(wěn)定蛋白質(zhì)高級構(gòu)造的因素有共價鍵(二硫鍵 )和次級鍵,次級鍵有4 種類型,即離子鍵、氫鍵、疏水性相互作用和X德瓦力。3、蛋白質(zhì)的二級構(gòu)造是指肽鏈中局部肽段的構(gòu)象,它們是完整肽鏈構(gòu)象(三級構(gòu)造 )的構(gòu)造單元,是蛋白質(zhì)復(fù)雜的立體構(gòu)造的根底,因此二級構(gòu)造也可以稱為構(gòu)象單元。 螺旋、 折疊是常見的二級構(gòu)造。4、一些肽段有形成螺旋和 折疊兩種構(gòu)象的可能性(或形成勢 ),這類肽段被稱為兩可肽。5、兩個或幾個二級構(gòu)造單

2、元被連接肽段連接起來,進(jìn)一步組合成有特殊幾何排列的局域立體結(jié)構(gòu),稱為 超二級構(gòu)造介于二、三級構(gòu)造間 。超二級構(gòu)造的根本組織形式有 , 和 等 3 類6、蛋白質(zhì)家族 (family):一類蛋白質(zhì)的一級構(gòu)造有30以上同源性,或一級構(gòu)造同源性很低,但它們的構(gòu)造和功能相似,它們也屬于同一家族。例如球蛋白的氨基酸序列相差很大,但屬于同一家族。超家族 (superfamily) :有些蛋白質(zhì)家族之間,一級構(gòu)造序列的同源性較低,但在許多情況下,它們的構(gòu)造和功能存在一定的相似性。這說明它們可能存在共同的進(jìn)化起源。這些蛋白質(zhì)家族屬于同一超家族。7、構(gòu)造域 是一個連貫的三維構(gòu)造,是可互換并且半獨立的功能單位,在真

3、核細(xì)胞中由一個外顯子編碼, 由至少 40 個以上多至200 個殘基構(gòu)成最小、最嚴(yán)密也最穩(wěn)定的構(gòu)造,作為構(gòu)造和功能單位,會重復(fù)出現(xiàn)在同一蛋白質(zhì)或不同蛋白質(zhì)中。8、蛋白質(zhì)一級構(gòu)造所提供的信息有哪些? 螺旋、 折疊各自的特點?第二章專業(yè)資料整理WORD格式1、DNA是由脫氧核糖核苷酸組成的長鏈多聚物,是遺傳物質(zhì)。具有以下根本特性:具有穩(wěn)專業(yè)資料整理WORD格式定的構(gòu)造,能進(jìn)展復(fù)制,特定的構(gòu)造能傳遞給子代;攜帶生命的遺傳信息,以決定生命的產(chǎn)生、生長和發(fā)育;能產(chǎn)生遺傳的變異,使進(jìn)化永不枯竭。專業(yè)資料整理WORD格式2、DNA鏈的方向總是理解為從5P 端到3OH端。 DNA的一級構(gòu)造實際上就是DNA分專業(yè)

4、資料整理WORD格式子內(nèi)堿基的排列順序。專業(yè)資料整理WORD格式3、DNA是雙螺旋構(gòu)造:主鏈由脫氧核糖和磷酸基團(tuán)以3, 5磷酸二酯鍵交互連接構(gòu)成的,專業(yè)資料整理WORD格式在雙螺旋的外側(cè),堿基在內(nèi)側(cè),堿基必須配對。一條鏈繞著另一條鏈旋轉(zhuǎn)、盤繞,一條鏈上的嘌呤與另一條鏈上的嘧啶相互配對,嘌呤與嘧啶以氫鍵保持在一起。4、雙螺旋 DNA 熔解成單鏈的現(xiàn)象稱為DNA 變性。已經(jīng)變性的 DNA 在一定條件下重新恢復(fù)雙鏈的過程稱為 復(fù)性。5、染色質(zhì) 是以雙鏈DNA 為骨架, 與組蛋白 (histon) 、非組蛋白 (non-histon) 以及少量的各種RNA等共同組成絲狀構(gòu)造。在染色質(zhì)中,DNA 和組蛋

5、白的組成非常穩(wěn)定,非組蛋白和RNA 隨專業(yè)資料整理WORD格式細(xì)胞生理狀態(tài)不同而有變化。6、常染色質(zhì) 是在細(xì)胞間期核內(nèi)染色體折疊壓縮程度較低,處于伸展?fàn)顟B(tài), 堿性染性著色較淺而均勻的那些染色質(zhì)。主要是單一拷貝和中度重復(fù)序列。異染色質(zhì) 是在細(xì)胞間期核內(nèi)染色質(zhì)壓縮程度較高,處于凝集狀態(tài),堿性染料著色較深的局部。7、核小體 是構(gòu)成真核生物染色質(zhì)的根本構(gòu)造單位,是DNA 和蛋白質(zhì)構(gòu)成的嚴(yán)密構(gòu)造形式。8、RNA 的種類及其各自的特點?第三章 基因和基因組1、基因被定義為轉(zhuǎn)錄功能單位,是編碼一種可擴(kuò)散產(chǎn)物的一段DNA 序列,其產(chǎn)物可以是蛋白質(zhì)或 RNA 。一個完整的基因應(yīng)該由兩局部組成,即編碼區(qū)和調(diào)控區(qū)。

6、2、基因組 是一種生物染色體內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和,包括構(gòu)成基因和基因之間區(qū)域的所有DNA 。所謂總和,還應(yīng)該指該物種的不同DNA 功能區(qū)域在 DNA 分子上構(gòu)造分布和排列的情況?;蚪M以及基因一般以DNA 的長度和序列表示。3、病毒基因組的構(gòu)造特點:與細(xì)菌相比較, 病毒的基因組很小, 所含遺傳信息量較小,只能編碼少數(shù)的蛋白質(zhì)。 病毒基因組由 DNA 或 RNA 組成。核酸的構(gòu)造可以是單鏈或雙鏈、閉合環(huán)狀或線狀分子。常有基因重疊現(xiàn)象,即同一DNA 分子序列可以編碼2 種或 3 種蛋白質(zhì)分子。4、細(xì)菌基因組的一般特點1基因組通常僅由一條環(huán)狀雙鏈DNA分子組成。但現(xiàn)發(fā)現(xiàn)有越來越多的線形基因組。2只有

7、一個復(fù)制起始點。 3有操縱子的構(gòu)造。數(shù)個相關(guān)參與一個生化過程的構(gòu)造基因串聯(lián)在一起,受同一調(diào)控區(qū)調(diào)節(jié),合成多順反子mRNA 。 4編碼蛋白質(zhì)的構(gòu)造基因是單拷貝的,但 rRNA 基因往往是多拷貝的。5非編碼的 DNA 所占比例少,類似病毒基因組。6基因組 DNA 具有多種調(diào)控區(qū),如復(fù)制起始區(qū)、復(fù)制終止區(qū)、轉(zhuǎn)錄啟動子、轉(zhuǎn)錄終止區(qū)等特殊序列。 7與真核生物類似,具有可移動的DNA 序列。5、真核生物基因組特點1基因組的分子量大。低等真核生物大約107-108 bp,而高等真核生物為5×108-1010 bp 2真核生物細(xì)胞往往有很多染色體,一般呈線狀。每個染色體DNA 有很多復(fù)制起始點。 3

8、細(xì)胞核 DNA 與蛋白質(zhì)穩(wěn)定地結(jié)合成染色質(zhì)的復(fù)雜構(gòu)造。染色質(zhì)內(nèi)除了含有 DNA 和組蛋白外,還有大量非組蛋白。 4由于存在核膜,細(xì)胞被分隔成細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì),因此,在基因表達(dá)中,轉(zhuǎn)錄和翻譯在時間和空間上是分隔的,不偶聯(lián)的。 基因組的大量序列是非編碼序列,有大量重復(fù)序列。 6真核生物的蛋白質(zhì)基因往往是單拷貝存在,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是單順反子 mRNA 。 7存在一些可移動的DNA 序列。 8絕大多數(shù)真核生物基因含有內(nèi)含子, 因而基因編碼區(qū)是不連續(xù)的。 9真核生物基因內(nèi)部也可能含有大量的重復(fù)序列。6、基因家族 :一組功能類似、構(gòu)造具有同源性的基因稱為基因家族?;蚣易宓姆诸愑卸喾N方式?;蚣易甯鞒蓡T在構(gòu)造上非

9、常類似,具有保守性,如rRNA 基因家族,但基因之間的間隔區(qū)可以有很大的長度差異和序列差異。重要的基因家族:rRNA基因家族、 5S rRNA基因、組蛋白基因家族、珠蛋白基因家族、生長激素基因家族、超基因。專業(yè)資料整理WORD格式7、超基因 (supergene)是指一組由多基因和單基因組成的更大的基因家族。在高等真核細(xì)胞中,一個基因簇內(nèi)含有數(shù)百個功能相關(guān)的基因,它們可能是由基因擴(kuò)增后構(gòu)造上輕微變化而產(chǎn)生的,這些基因的構(gòu)造有程度不等的同源性,功能上仍保持原始基因的根本功能,或者進(jìn)化成具有相關(guān)而不同的新功能,這樣的一簇基因稱為超基因家族。 有免疫球蛋白超基因家族、核受體超基因家族、細(xì)胞因子超基因

10、家族等。8、在初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物hnRNA 加工產(chǎn)生成熟的mRNA 時,被切除的非編碼序列稱為內(nèi)含子(intron) 。在成熟的mRNA 或蛋白質(zhì)中存在的序列稱為外顯子(exon)?;虻牟贿B續(xù)性是真核生物基因所特有的,但不是所有真核生物基因都一定具有這種不連續(xù)性。9、內(nèi)含子的功能:(1)含有可閱讀框架(ORF) ,內(nèi)含子的ORF 可能編碼酶或蛋白質(zhì),其中包括逆轉(zhuǎn)錄酶、成熟酶。(2) 含有各種剪接信,內(nèi)含子編碼的成熟酶直接參與內(nèi)含子本身的剪接功能。 (3) 對基因表達(dá)有影響,內(nèi)含子對基因表達(dá)在多個水平上施加影響。內(nèi)含子中的增強(qiáng)子序列增加了基因轉(zhuǎn)錄的起始反響。10、人類基因組方案(human geno

11、mic project ,HGP)的總體目標(biāo)是要完成人類全部24 條染色體3× 109bp 序列的分析。具體包括:人類基因組作圖(遺傳學(xué)圖譜、物理圖譜) 。對基因組 DNA 進(jìn)展切割和克隆。測定基因組的全部DNA 序列。基因的鑒定。信息系統(tǒng)的建立、信息的儲存和處理以及相應(yīng)軟件的開發(fā)。11、構(gòu)造基因組學(xué)(structual genomics) 以全基因組測序為目標(biāo)的基因構(gòu)造研究,闡述基因組中基因的位置和構(gòu)造,為基因功能的研究奠定根底。12、功能基因組學(xué)(functionalgenomics) 是利用構(gòu)造基因組學(xué)提供的信息,以大規(guī)模實驗方法及統(tǒng)計與計算機(jī)分析,全面系統(tǒng)地分析全部基因的功能

12、。13、蛋白質(zhì)組 (proteome) 是一個基因組在特定細(xì)胞內(nèi)所表達(dá)的蛋白質(zhì)。對于一種生物來說,它的基組 DNA 根本上是恒定的,但蛋白質(zhì)組是動態(tài)的。也就是不同組織的細(xì)胞中蛋白質(zhì)組是不同的,在同一細(xì)胞的不同生長狀態(tài)、病理狀態(tài)下也是不一樣的。蛋白質(zhì)組只指某一特定時間內(nèi)的蛋白質(zhì)集合體。14、生物信息學(xué) 是用數(shù)理和信息科學(xué)的觀點、理論和方法去研究生命現(xiàn)象,組織和分析呈指數(shù)增長的生物學(xué)數(shù)據(jù)的一門學(xué)科。生物信息學(xué)位于生物、計算機(jī)、數(shù)學(xué)等多個領(lǐng)域的穿插點上,其研究目標(biāo)是提醒“基因組信息構(gòu)造的復(fù)雜性及遺傳語言的根本規(guī)律。 生物信息學(xué)包含了基因組信息學(xué)、蛋白質(zhì)構(gòu)造模擬和藥物設(shè)計等3 個組成局部。目前的研究包

13、括下面幾個方面:相關(guān)信息的收集、儲存、管理與提供。新基因的發(fā)現(xiàn)和鑒定。非編碼區(qū)的信息構(gòu)造分析。大規(guī)模基因功能表達(dá)譜的分析。蛋白質(zhì)分子空間構(gòu)造預(yù)測、模擬和分子設(shè)計。藥物開發(fā)。第四章生物大分子的相互作用1、生物大分子之間特異性地、可逆解離地形成復(fù)合物的能力是生命活動的根底,這種特異性的、專業(yè)資料整理WORD格式可逆的相互作用被稱為生物分子的識別。專業(yè)資料整理WORD格式2、參與大分子相互作用的非共價鍵類型(1)疏水性相互作用, (2)X德瓦力,(3) 氫鍵,(4)靜電專業(yè)資料整理WORD格式相互作用。專業(yè)資料整理WORD格式3、參與蛋白質(zhì)相互作用的構(gòu)造域有:BRCT(breast cancer s

14、usceptibility gene C terminus)構(gòu)造域、專業(yè)資料整理WORD格式Lim構(gòu)造域、SH3構(gòu)造域、SH2 構(gòu)造域、Bromo構(gòu)造域、POZ構(gòu)造域、WW 構(gòu)造域、錨蛋專業(yè)資料整理WORD格式白重復(fù)序列 (ankyrin repeat ,ANK) 的構(gòu)造域、PH 構(gòu)造域、環(huán)指構(gòu)造域(ring finger domain) 。4、蛋白質(zhì)與RNA 的識別以“間接讀出 (indirectreadout)機(jī)制為主。所有的RNA 構(gòu)造,包括線狀序列、發(fā)夾、膨泡、內(nèi)環(huán)、假結(jié)、雙螺旋等都可以作為蛋白質(zhì)專一性識別的靶構(gòu)造。5、各種 DNA 結(jié)合蛋白,特別是轉(zhuǎn)錄因子(transcription

15、 factors) 都含有與DNA 相互作用的區(qū)域,稱為 DNA 結(jié)合構(gòu)造域 (DNA-binding domain) ,簡稱結(jié)合域。6、對基因進(jìn)展調(diào)節(jié)、控制的蛋白質(zhì),如各種普遍性(或根底 )轉(zhuǎn)錄因子、基因調(diào)控因子,相對于作用于它的靶位點DNA 序列而言,廣義地稱為反式作用因子(trans-acting factors) 。7、鋅指構(gòu)造蛋白質(zhì)是自然界中廣泛分布的一類含鋅蛋白質(zhì),構(gòu)成了一個超家族。鋅指構(gòu)造家族蛋白,以其形狀和結(jié)合鋅的復(fù)雜性,特別是鋅指四面體構(gòu)造,可以分為C2H2 , C4 和 C6等幾種類型。8、亮氨酸周期重復(fù)不在于形成一個疏水面,而在于兩個蛋白質(zhì)的兩個 螺旋之間, 依靠亮氨酸周

16、期性側(cè)鏈交織相插,螺旋靠攏, 在疏水作用之下形成一個穩(wěn)定的非共價結(jié)合的拉鏈構(gòu)造,即所謂的亮氨酸拉鏈(leucine zipper) 。專業(yè)資料整理WORD格式第五章基因工程原理1、根本概念1基因工程:是用酶學(xué)方法,把天然的或人工合成的、同源或異源的DNA 片段與具有復(fù)制能力的載體分子如質(zhì)粒、噬菌體、病毒等形成重組DNA分子,再導(dǎo)入不具有這種重組分子的宿主細(xì)胞內(nèi),進(jìn)展持久而穩(wěn)定的復(fù)制、表達(dá),使宿主細(xì)胞產(chǎn)生外源DNA或其蛋白質(zhì)分子。2基因組 DNA 文庫 P157:是某一生物體的染色體全部DNA 序列被隨機(jī)切割成適當(dāng)大小的片段后,插入到載體內(nèi)構(gòu)成的DNA 文庫。專業(yè)資料整理WORD格式( 3 cD

17、NA 基因文庫 P160:一群含有重組 DNA 的細(xì)菌,質(zhì)?;蚴删w的克隆,來自某細(xì)胞類型全部的 mRNA 。( 4扣除文庫 P163:將兩重不同組織來源的 mRNA 進(jìn)展比較,用扣除雜交排除一樣局部,即共同表達(dá)的那局部 mRNA ,選出剩余有差異的、 特異表達(dá)的 mRNA ,構(gòu)建成 cDNA 文庫,稱為 cDNA 扣除文庫。( 5分子雜交 P171:指具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定條件下適宜的溫度和離子強(qiáng)度可按堿基配對的原那么退火形成雙鏈的過程。6 PCR 技術(shù)原理: PCR 技術(shù)是利用兩種寡核苷酸引物,分別與雙鏈DNA 片段的兩端互補(bǔ),形成 DNA 聚合酶反響中的模板和引物的關(guān)系。7物

18、理圖譜:DNA 片段上限制性內(nèi)切酶酶切位點的圖譜,表示各種限制性內(nèi)切酶識別位點專業(yè)資料整理WORD格式在 DNA 序列上的線性排列。8 Southern 雜交:用于檢測DNA 片段混合物中存在特定序列的技術(shù)。又稱Southern 印跡。檢驗的目的DNA 通常用一種或一種以上的限制性內(nèi)切酶酶切,得到各種特定長度的片段,在凝膠電泳中依長度分成條帶,DNA 片段原位地轉(zhuǎn)移到NC 膜或尼龍膜上。然后,膜上的專業(yè)資料整理WORD格式DNA片段與標(biāo)記的探針DNA進(jìn)展雜交,已雜交的DNA片段可通過標(biāo)記的探針進(jìn)展放射專業(yè)資料整理WORD格式性或顯色反響定位。專業(yè)資料整理WORD格式 9 Northern雜交P

19、156:從真核生物的特定組織或發(fā)育階段的細(xì)胞別離出全部RNA或?qū)I(yè)資料整理WORD格式mRNA ,用變性凝膠電泳別離后轉(zhuǎn)移到NC膜上。用變性的探針DNA對NC膜上的RNA專業(yè)資料整理WORD格式進(jìn)展雜交。從顯影或顯色反響判斷陽性雜交的存在。( 10亞克隆 P156:當(dāng)載體中插入的外源 DNA 片段太大,難以作某些操作或分析時,需要對該克隆片段作些再切割,將大的 DNA 片段酶切成較小的片段,然后再與另外的新載體重組,并進(jìn)展轉(zhuǎn)化程序,這個過程稱為亞克隆。2、思考題1、 PCR 技術(shù)原理的是什么?179答:PCR 技術(shù)是利用兩種寡核苷酸引物,分別與雙鏈DNA 片段的兩端互補(bǔ), 形成 DNA 聚合酶

20、反響中的模板和引物的關(guān)系,這是 PCR 技術(shù)的核心。 PCR 聚合酶反響體系的一些重要條件包括:模板、一對寡核苷酸引物、4 種底物 dNTP 和 Tap DNA 聚合酶。反響分為3 步:雙鏈模板 DNA 變性、退火和鏈的延伸。專業(yè)資料整理WORD格式2基因工程中工具酶的種類?答:限制性內(nèi)切酶、DNA 連接酶、P141DNA 聚合酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、RNA聚合酶。專業(yè)資料整理WORD格式( 3 DNA 聚合酶的特點?P142答:需要提供合成模板;不能起始新的DNA 鏈,必須要有引物提供3'OH ;合成的方向都是5' 3'除聚合DNA 外還有其它功能;以脫氧核苷酸三磷酸(dNTP

21、) 為前體催化合成DNA 。4熟悉基因工程的載體的種類和特點?答:種類:質(zhì)粒載體,噬菌體載體, M13 噬菌體載體,柯斯質(zhì)粒載體,細(xì)菌人工染色體,酵母人工染色體,動物病毒載體特點:載體DNA是單個復(fù)制單元,在宿主細(xì)胞內(nèi)應(yīng)具有獨立復(fù)制能力;分子量盡可能的小, 便于細(xì)胞中別離純化,離體條件下操作;含有多種限制行內(nèi)切酶的單一切點;載體內(nèi)有不影響其復(fù)制,生長的非必要區(qū)域;具有多種選擇行標(biāo)記。專業(yè)資料整理WORD格式5基因工程載體的根本要求和特點P142根本要求:載體能夠獨立復(fù)制,具有復(fù)制起點。應(yīng)具有靈活的克隆位點和方便的篩選標(biāo)記。應(yīng)具有很強(qiáng)的啟動子,能為大腸桿菌RNA 聚合酶所識別。應(yīng)具有阻遏子,使啟

22、動子受到控制,只有當(dāng)誘導(dǎo)時才能進(jìn)展轉(zhuǎn)錄。專業(yè)資料整理WORD格式應(yīng)具有很強(qiáng)的終止子,只轉(zhuǎn)錄克隆的基因,所產(chǎn)生的mRNA較為穩(wěn)定。專業(yè)資料整理WORD格式特點:專業(yè)資料整理WORD格式1.載體DNA是單個復(fù)制單元,在宿主細(xì)胞內(nèi)應(yīng)具有DNA獨立復(fù)制能力;專業(yè)資料整理WORD格式2.分子量盡可能的小,以便容易從細(xì)胞中別離純化,便于離體條件下操作;專業(yè)資料整理WORD格式3.含有多種限制性內(nèi)切酶的單一切點。在切點內(nèi)可以與外源DNA進(jìn)展連接、重組;專業(yè)資料整理WORD格式4.載體內(nèi)有不影響其復(fù)制、生長的非必要區(qū)域,在此區(qū)域內(nèi)可以插入、承受外源DNA,外源專業(yè)資料整理WORD格式DNA與載體分子一起復(fù)制、

23、擴(kuò)增;專業(yè)資料整理WORD格式5.具有多種選擇性標(biāo)志,如營養(yǎng)缺陷型、抗藥性、形成噬菌斑的能力、外源性蛋白的產(chǎn)生等,作為區(qū)分重組的轉(zhuǎn)化子與非重組轉(zhuǎn)化子的指標(biāo)?;蚬こ痰母静襟EP1401.目的 DNA 的獲得; 2.載體的選擇與構(gòu)建;3.目的 DNA 與載體的重組;4.重組 DNA 的轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染等,從而導(dǎo)入宿主細(xì)胞;5.篩選含有重組DNA 分子的宿主細(xì)胞,獲得克隆。6 DNA 文庫構(gòu)建的根本步驟?P1581.載體 DNA 和雙臂的制備2.提取大分子DNA 和制備大片段3.載體與外源DNA 重組4.重組 DNA 的離體包裝5.重組 DNA 的轉(zhuǎn)化第六章1、名詞解釋DNA 半保存復(fù)制:在DNA 復(fù)制

24、時,子代雙鏈DNA 中,一條鏈來自親代,而另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻摹?fù)制叉: 復(fù)制起始點要形成一個特殊的叉形構(gòu)造,是復(fù)制有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)組裝成復(fù)合物和新鏈合成的部位。復(fù)制子:從復(fù)制起始點到終止點的區(qū)域為一個復(fù)制子。半不連續(xù)復(fù)制:在復(fù)制叉上發(fā)生一條新鏈為連續(xù)合成,另一條新鏈為不連續(xù)合成的復(fù)制機(jī)制,稱為半不連續(xù)復(fù)制。前導(dǎo)鏈:在DNA 復(fù)制時,復(fù)制叉上一條連續(xù)合成的鏈。后滯鏈:在DNA 復(fù)制時,復(fù)制叉上一條不連續(xù)合成的鏈。專業(yè)資料整理WORD格式岡崎片段: DNA 復(fù)制時后滯鏈所合成的短片段。2、思考題1.DNA 復(fù)制的特征?P195答:核酸生物合成的一般規(guī)那么;半保存復(fù)制;以復(fù)制子為單位進(jìn)展;復(fù)制的起始

25、點和終止點;具有復(fù)制叉構(gòu)造和復(fù)制方向;復(fù)制的模型。2.復(fù)制過程的幾個階段?P216答:第一階段,親代DNA 分子超螺旋構(gòu)象的松弛及螺旋的解旋,使復(fù)制的模板展現(xiàn)出來;專業(yè)資料整理WORD格式第二階段,是復(fù)制的引發(fā)過程,引物在5 3 方向的合成;第三階段, 是 DNA 鏈的延伸過程, 在引物 RNA 合成的根底上, 轉(zhuǎn)換成 DNA 鏈的 5 3向的合成;第四階段,是終止過程,復(fù)制進(jìn)展到終止位點ter,有蛋白因子Tus 參與,復(fù)制即終止。方專業(yè)資料整理WORD格式3.線粒體 DNA 的復(fù)制模式?答:4.DNA 鏈延伸的幾個階段?(P223)答:雙螺旋DNA 的不斷解螺旋;前導(dǎo)鏈DNA 的合成;后滯鏈

26、模板不斷引發(fā),合成新的RNA 產(chǎn)物;在 RNA 引物的根底上由DNA 聚合酶合成岡崎片段;除去 RNA 引物,填補(bǔ)空隙,岡崎片段連接成后滯鏈。5.真核與原核生物的復(fù)制一樣點與差異之處?P230答:一樣之處:都是半保存的和半不連續(xù)的復(fù)制,復(fù)制過程都有引發(fā)、延伸和終止三個階段,要求有模板以及有相應(yīng)功能的DNA 聚合酶和蛋白質(zhì)參與。不同之處:真核的每條染色體有多個復(fù)制起始位點,而原核只有一個起始位點;真核染色體在全部復(fù)制完成之前,各個起始點上不能開場新一輪復(fù)制,受到一種復(fù)制的調(diào)控;而原核DNA的起始點可以連續(xù)地開場新的復(fù)制事件,表現(xiàn)為一個復(fù)制子上有多個復(fù)制叉存在。專業(yè)資料整理WORD格式6.DNA

27、損傷修復(fù)的種類?P247答:直接修復(fù)、切除修復(fù)、重組修復(fù)、SOS 修復(fù)。專業(yè)資料整理WORD格式7.原核DNA聚合酶的一般特性?P211專業(yè)資料整理WORD格式答:有單鏈DNA 為模板,具有種脫氧核苷酸,從引物的3 -OH 基的引物,合成的方向總是3 -OH 端逐個延長。5 -3,由模板決定加上去何專業(yè)資料整理WORD格式第七章1、名詞解釋轉(zhuǎn)錄 (P251) :以 DNA 為模板,合成RNA 的信息傳遞過程稱為轉(zhuǎn)錄。反義鏈 (P252):在 DNA 雙鏈中,被RNA 聚合酶“閱讀 、含有合成RNA 分子信息的這條鏈稱為“模板鏈或反義鏈。上游順式作用元件: 指同一 DNA 分子中具有轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能

28、的在復(fù)制起始點前的特異DNA 序列。啟動子 (P257):是基因 DNA 中一段特定的核苷酸序列,是 RNA 聚合酶在轉(zhuǎn)錄起始時對模板DNA的識別位點和結(jié)合位點,基因轉(zhuǎn)錄的開場部位。終止子 (P269):是基因DNA 分子中決定轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物3'- OH 端、釋放出已合成RNA 分子的位點。2、思考題1.原核生物和真核生物基因轉(zhuǎn)錄的差異?答:原核生物只有一種RNA 聚合酶負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄所有類型的基因,而真核生物有三種以上的RNA聚合酶,負(fù)責(zé)不同基因類型的轉(zhuǎn)錄,合成不同類型的RNA ,在細(xì)胞核內(nèi)的位置也不一樣。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的差異。真核生物的初始產(chǎn)物很長,包含有內(nèi)含子序列,成熟mRNA 只占其中的小局部。

29、而原核生物的初始產(chǎn)物大多數(shù)為編碼序列,與蛋白質(zhì)序列成線性關(guān)系。真核生物轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)歷加工、修飾過程,即內(nèi)含子剪接。5' 端帽化和3' 多聚 A 化。這是真核生物中初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的成熟過程,而原核生物的初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物直接是成熟的mRNA ,很少需要成熟過程。與基因構(gòu)造相吻合,原核生物mRNA 是多順反子;大多數(shù)真核生物mRNA 是單順子結(jié)構(gòu)。一般而言,一個真核的mRNA 分子編碼一個蛋白質(zhì)分子。原核細(xì)胞中,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物直接可以成為蛋白質(zhì)合成的模板,因而一邊轉(zhuǎn)錄合成mRNA ,一邊翻譯合成蛋白質(zhì)。專業(yè)資料整理WORD格式2.熟悉原核生物啟動子的構(gòu)造與功能、其中的35 區(qū)、10 區(qū)等的構(gòu)造?專

30、業(yè)資料整理WORD格式域中的基序并與之結(jié)合,啟動轉(zhuǎn)錄的起始。一般將DNA上的轉(zhuǎn)錄位點定位+1 來排序,其下專業(yè)資料整理WORD格式游右側(cè)為正值,其上游左側(cè)為負(fù)值。原核生物不同基因的啟動子雖然構(gòu)造也有一定的專業(yè)資料整理WORD格式差異,但明顯具有共同的特點。構(gòu)造典型,都含有識別R,結(jié)合B 和起始I 三個位專業(yè)資料整理WORD格式點;序列保守,如-35 序列, -10 序列構(gòu)造都十分保守;位置和距離都比較恒定;直接和多聚酶相結(jié)合;常和操縱子相鄰;都在其控制基因的5端;決定轉(zhuǎn)錄的啟動和方向。專業(yè)資料整理WORD格式 -35 序列又稱為 Sextama 盒 ,其保守序列為 TTGACA ,與 -10

31、序列相隔 16 19bp。其功能是:為 RNA 聚合酶的識別位點。 RNA 聚合酶的核心酶只能起到和模板結(jié)合和催化的功能,并不能識別 -35 序列,只有亞基才能識別 -35 序列,為轉(zhuǎn)錄選擇模板鏈。-35 序列和 -10 序列的距離是相當(dāng)穩(wěn)定的,過大或過小都會降低轉(zhuǎn)錄活性。這可能是因為RNA聚合酶本身的大小和空間構(gòu)造有關(guān)。-10 序列也稱為 Pribnow 框盒 ,其保守序列為TATAA T,位于 -10bp 左右, 其中 3端的 “ T 十分保守。 A,T 較豐富,易于解鏈。它和轉(zhuǎn)錄起始位點“I 一般相距 5bp。其功能是:與RNA聚合酶嚴(yán)密結(jié)合;形成開放啟動復(fù)合體;使RNA 聚合酶定向轉(zhuǎn)錄

32、。3.原核生物轉(zhuǎn)錄的起始分幾個階段?P261答:核心酶在 因子參與下接觸到DNA 上,形成特異性結(jié)合;起始識別,RNA 聚合酶與啟動子結(jié)合,形成封閉性起始復(fù)合物;從封閉性轉(zhuǎn)變?yōu)殚_放性起始復(fù)合物,酶結(jié)合在 10 序列,啟動子活化,并解開雙鏈結(jié)構(gòu),暴露模板鏈;形成 DNA 酶底物 NTP 的三元起始復(fù)合物,酶移動到轉(zhuǎn)錄起始位點,在起始位點加上開頭的幾個核苷三磷酸。專業(yè)資料整理WORD格式4.真核生物基因類型II 啟動子的構(gòu)造與功能?P281專業(yè)資料整理WORD格式答:構(gòu)造:轉(zhuǎn)錄起始位點,是RNA 合成的開場位置。根本啟動子,根本啟動子和Inr一起專業(yè)資料整理WORD格式構(gòu)成核心啟動子。轉(zhuǎn)錄起始位點

33、下游元件。轉(zhuǎn)錄起始上游元件。專業(yè)資料整理WORD格式5.真核生物基因轉(zhuǎn)錄的一般規(guī)律?P271答:典型的真核基因轉(zhuǎn)錄單元為單順反子,而原核基因轉(zhuǎn)錄單元為多順反子。真核生物的RNA 聚合酶高度分工。轉(zhuǎn)錄的正常進(jìn)展,除了需要RNA 聚合酶以外,還需要許多蛋白質(zhì)因子的參與。真核基因DNA 的順式作用元件要比原核基因復(fù)雜得多。真核基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控以正調(diào)控為主。第八章轉(zhuǎn)錄后加工名詞解釋轉(zhuǎn)錄后加工 (P297):原核生物的tRNA , rRNA 轉(zhuǎn)錄成一個很長的RNA 分子后,在酶和蛋白質(zhì)參與下,切斷、加工成為成熟分子。專業(yè)資料整理WORD格式多順反子: 在原核細(xì)胞中,通常是幾種不同的mRNA連在一起, 相互

34、之問由一段短的不編碼蛋專業(yè)資料整理WORD格式白質(zhì)的間隔序列所隔開,這種mRNA 叫做多順反子mRNA 。RNA 編輯 (P327): RNA 編輯是 RNA 分子上一種轉(zhuǎn)錄后修飾現(xiàn)象,包括插入、缺失或核苷酸的替換。思考題1、內(nèi)含子 RNA 剪接的三種方式?第一類:自我剪切。由于內(nèi)含子的特殊構(gòu)造而能自發(fā)地進(jìn)展剪切。第二類:蛋白質(zhì)參與剪切的內(nèi)含子,主要在tRNA 前體中發(fā)現(xiàn)。剪切在一系列酶催化下進(jìn)展。第三類:內(nèi)含子是snRNP 參與剪接的內(nèi)含子。專業(yè)資料整理WORD格式2、原核生物tRNA前體以幾種方式存在?P297專業(yè)資料整理WORD格式多個一樣tRNA串聯(lián)排列在一起;專業(yè)資料整理WORD格式

35、不同的tRNA串聯(lián)排列;專業(yè)資料整理WORD格式tRNA 與些 RNArRNA 混合串聯(lián)排列在一起( 圖 8 1)。因而 RNA 前體必須經(jīng)歷加工,在tRNA 與一片段之間先切斷,完成此任務(wù)的似乎是RNase。然后, RNA 片段再進(jìn)展5端、 3專業(yè)資料整理WORD格式端加工,某些堿基進(jìn)展修飾專業(yè)資料整理WORD格式3、真核生物RNA前體的加工過程包括?P301專業(yè)資料整理WORD格式答:真核生物tRNA和rRNA前體的加工包括轉(zhuǎn)最初始產(chǎn)物中間隔序列的除去、內(nèi)含子的剪接、專業(yè)資料整理WORD格式5和3端修飾、堿基的修飾等。這些過程需要酶和蛋白質(zhì)的參與。專業(yè)資料整理WORD格式4、RNA 前體的

36、剪切過程要通過4 個步驟:首先在5端切除非編碼的序列,生成41S 中間物; 41S 的 RNA 切成 32S 和 20S 兩段,分別含有 28S rRNA 和 18S rRNA ,32S 中還含有 5.8S rRNA ;20S 剪切成 18S;32S 剪切成 28S rRNA 和 5.8S rRNA ,它們相互進(jìn)展堿基配對5、5端帽子構(gòu)造具有如下3 個功能。(1) 對 mRNA 的保護(hù)作用,保護(hù) mRNA 免受 RNase 從 5端開場的攻擊。(2) 5端帽子構(gòu)造使 mRNA 具有可翻譯能力 (translatability ,或 translatableness)。(3)5端帽子有利于成熟的

37、mRNA 從細(xì)胞核輸送到細(xì)胞質(zhì),只有成熟的mRNA 才能進(jìn)展輸送。第 9 章1、名詞解釋tRNA 荷載作用 (P347):氨基酸被活化,共價連接在tRNA 上。開放閱讀框架 (P355):起始密碼子和下游的終止密碼子之間的序列。肽鏈合成的延伸(P364):指第二個和以后的密碼子編碼的氨基酸不斷進(jìn)入核糖體,并形成肽鍵專業(yè)資料整理WORD格式的過程。核定位信號 (P377):指引一個蛋白質(zhì)分子從胞質(zhì)到核內(nèi)的典型信號序列。共翻譯轉(zhuǎn)動機(jī)制(P379):邊翻譯邊轉(zhuǎn)運的機(jī)制。分子伴侶 (P393):在蛋白質(zhì)折疊或組裝過程中,需要某些蛋白質(zhì)或肽鏈參與相互作用,幫助達(dá)到正確的構(gòu)象折疊,但又不是折疊或組裝產(chǎn)物的

38、一局部,起幫助作用的蛋白質(zhì)或肽鏈。分子伴素:非特異性地幫助蛋白質(zhì)折疊,建立起它的正確構(gòu)造的蛋白質(zhì)或肽鏈。遺傳密碼的特點(P337):遺傳密碼是三聯(lián)密碼;遺傳密碼無逗號;遺傳密碼子不重疊;遺傳密碼具有通用性;遺傳密碼具有簡并性;起始密碼子和終止密碼子。擺動假設(shè)要點 (P339):密碼子和反密碼子之間的堿基配對中,密碼子的5 端前兩位堿基必須嚴(yán)格按照Watson-Crick堿基配對原那么同反密碼子配對。密碼子的第3 個核苷酸為A 時,由于受到立體化學(xué)因素的影響,將產(chǎn)生與G,U 和 C 配對的一組特異構(gòu)象。滑動搜索模型P356:是闡述核糖體在帶有5 帽子構(gòu)造的真核生物mRNA 上如何啟動翻譯的起始反

39、響。三位點模型 P366:核糖體結(jié)合tRNA 有三個位點,即P 位點、 A 位點和 E 位點。信號肽的特點P379:幾乎所有的信號肽在整體上都是疏水的。信號肽一般位于蛋白質(zhì)的N 端,進(jìn)入膜后被信號肽酶水解,真核細(xì)胞信號肽酶位于 ER 膜,原核細(xì)胞位于質(zhì)膜內(nèi)側(cè)。信號肽的中部常常由 1214 個殘基構(gòu)成疏水性核,稱為信號肽疏水核。需要廣義地認(rèn)識信號肽,應(yīng)該認(rèn)為它是初生蛋白質(zhì)穿過膜所必須的疏水性肽段,它可以位于蛋白質(zhì)分子的各個部位。信號肽幾乎沒有嚴(yán)格的專一性。信號肽可能不是一一直線通過雙脂層膜,而是一種環(huán)狀構(gòu)造。導(dǎo)肽的特點 P384:帶正電荷的堿性氨基酸含量較豐富,從它們的分析來看是隨機(jī)性的。專業(yè)資

40、料整理WORD格式不含或根本上不含有負(fù)電荷的酸性氨基酸。羥基氨基酸含量較高。有形成兩親的 螺旋構(gòu)造的傾向。2、思考題1核糖體的組分和立體構(gòu)造?答:專業(yè)資料整理WORD格式2.原核和真核生物翻譯的起始?兩者起始反響的比較?P363專業(yè)資料整理WORD格式答:一樣點:只在核糖體小亞基上結(jié)合荷載的起始始密碼子;在已經(jīng)形成有小亞基、mRNA形成完整的起始復(fù)合物。tRNA ;在 mRNA 上必須找到適宜的起和起始 tRNA 的起始復(fù)合物之后,大亞基參與專業(yè)資料整理WORD格式不同點:原核細(xì)胞中, mRNA 首先與小亞基結(jié)合, 再有起始 tRNA 參加形成起始復(fù)合物。而真核細(xì)胞中,起始 tRNA 首先結(jié)合

41、于小亞基,形成四元復(fù)合物,然后在多種因子參與下結(jié)合 mRNA ,才形成起始復(fù)合物。小亞基起始復(fù)合物在 mRNA 上尋找起始密碼子的方式不同。3.翻譯延伸和終止的過程?P364、 P372答:延伸過程:進(jìn)位反響;轉(zhuǎn)位反響和肽鍵的形成;移位反響。終止過程:4.蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運的3 種機(jī)制? P376答:核孔對特定大分子起選擇性通道的作用,核孔以其充分折疊的構(gòu)象轉(zhuǎn)運蛋白質(zhì);分泌蛋白的邊翻譯邊轉(zhuǎn)運機(jī)制;翻譯后轉(zhuǎn)運機(jī)制。5.蛋白質(zhì)前體的共價修飾類型,蛋白質(zhì)的剪切形式,內(nèi)含肽的剪切過程?(P387,388,390)答:共價修飾的加工主要包括4 種類型:肽鏈N 端殘基 fMet 或 Met 的切除、二硫鍵的形成、

42、化學(xué)修飾和肽的剪切。蛋白質(zhì)的剪切形式有:前胰島素原、胰凝乳蛋白酶原、凝血酶原的活化,以及蛋白質(zhì)內(nèi)含子、外顯子和自我剪切等問題。專業(yè)資料整理WORD格式內(nèi)含肽的剪切過程:由內(nèi)含肽的N 端Ser 殘基的酰胺鍵,在構(gòu)造式樣B 中Ser, Thr殘基專業(yè)資料整理WORD格式的 -OH基的作用下,肽鍵變得不穩(wěn)定,呈順式構(gòu)象。C 端( 下游 )外顯肽的Ser/Thr/Cys殘專業(yè)資料整理WORD格式基攻擊上游外顯肽的酯/硫酯鍵, 導(dǎo)致N 端 (上游 )外顯肽與內(nèi)含肽N 端別離, 而轉(zhuǎn)移到下游專業(yè)資料整理WORD格式外顯肽的Ser/Thr/Cys的側(cè)鏈上,從而形成分支構(gòu)造。內(nèi)含肽C 端的Asn環(huán)化,形成琥專

43、業(yè)資料整理WORD格式珀酰亞胺環(huán),導(dǎo)致C 端剪切點斷裂。?;亟M,上下游兩個外顯肽形成天然的肽鍵。專業(yè)資料整理WORD格式6.蛋白質(zhì)折疊的意義和過程及自動裝配原那么?P391,392答:意義:在構(gòu)造上,這個過程使伸展的肽鍵成為特定的三維構(gòu)造;在功能上,它使無活性的分子具有特定生物學(xué)功能的蛋白質(zhì)分子。自裝配原那么:蛋白質(zhì)在離體就已具有自發(fā)裝配的能力,并且不需要外加能量。自裝配原那么只適用于小分子的蛋白質(zhì)。第 11 章1、名詞解釋操縱子 (P469):基因組中相關(guān)的基因聚集、串聯(lián)在一起,共同表達(dá)、共同調(diào)控,構(gòu)成一個表達(dá)和調(diào)控的單元,這種單元稱為操縱子。構(gòu)造基因 (P470):指編碼細(xì)胞構(gòu)造和根本代

44、謝活動所必要的RNA ,蛋白質(zhì)或酶。調(diào)控基因 (P470):指那些編碼那些控制其他基因表達(dá)的RNA 或蛋白質(zhì)的基因。反式作用因子(P470):調(diào)控因子在細(xì)胞內(nèi)可以自由移動,尋找和結(jié)合到靶位點上,因此稱反作用因子。誘導(dǎo)作用 (P470):某種酶或一組酶的合成是對特定物質(zhì)作出的反響。正調(diào)控 (P471):假設(shè)調(diào)控因子使靶基因的表達(dá)水平上升,這種調(diào)控方式稱為正調(diào)控。負(fù)調(diào)控 (P471):假設(shè)調(diào)控因子使靶基因的表達(dá)水平下降,甚至關(guān)閉,這種調(diào)控作用稱為負(fù)調(diào)控。乳糖操縱子的構(gòu)造(P473) :E.coli 的乳糖操縱子是乳糖分解代謝的3 個基因, lacZ 編碼半乳糖苷酶 ,lacY 編碼半乳糖透性酶,l

45、acA 編碼半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶構(gòu)成的一個典型的操縱子。色氨酸操縱子的構(gòu)造(P492):包括構(gòu)造基因(E、 D 、 C、 B 、 A) :分別編碼合成色氨酸途徑的酶或酶亞基。 以及調(diào)控區(qū)域: 阻遏基因 R、啟動子區(qū) P、操縱區(qū) O、前導(dǎo)肽編碼區(qū) L ,弱化子區(qū) a??勺瓒粜偷呢?fù)調(diào)控(P429):調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物阻遏蛋白使trp 操縱子關(guān)閉, 這種作用稱為可阻遏型的負(fù)調(diào)控。它是某些氨基酸等生物合成酶類有關(guān)基因表達(dá)調(diào)控的根本形式。弱化作用 (P495):是 RNA 聚合酶從啟動子出發(fā)開場轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄受到衰減子的調(diào)控。抗終止作用 (P508):抗終止因子pN 和 pQ 依賴于基因內(nèi)特殊序列和特殊蛋*子的相

46、互作用,影響 RNA 聚合酶對終止位點的識別功能,使RNA 聚合酶在終止位點通讀,形成一個較長的 mRNA 。 pN 和 NusA 蛋白如果作用于nut 位點,就能引起抗終止作用。2、思考題1.乳糖操縱子的正負(fù)調(diào)控?P474答:某種調(diào)控因子的存在,使操縱子的構(gòu)造基因關(guān)閉;而調(diào)控因子不存在,能使操縱子的構(gòu)造基因開啟的調(diào)控方式稱為負(fù)調(diào)控。2.前導(dǎo)肽序列的特點?P495答:前導(dǎo)序列某些區(qū)段富含GC,GC 區(qū)段之間容易形成莖環(huán)二級構(gòu)造,接著有 8 個 U 的寡聚專業(yè)資料整理WORD格式區(qū)段構(gòu)成一個不依賴于 因子的終止信號。在一定條件下mRNA 合成提前終止,產(chǎn)生162個核苷酸長度的前導(dǎo)RNA 。除了這個終止信號的發(fā)夾構(gòu)造之外,由1 區(qū)和 2 區(qū)序列構(gòu)成第二個發(fā)夾構(gòu)造。其中1 區(qū)處于 14 個氨基酸的前導(dǎo)肽序列中。 3 區(qū)也可以與 2 區(qū)互補(bǔ),形成另一個由2 區(qū)和 3 區(qū)組成的發(fā)夾構(gòu)造。一旦2區(qū)與 3區(qū)形成二級構(gòu)造,就會阻遏3 區(qū)與 4 區(qū)之間形成發(fā)夾構(gòu)造,即不形成終止信號。前導(dǎo)序列 RNA 中編碼了一段 14 個氨基酸的前導(dǎo)肽,在

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