關(guān)于菌物分類學(xué).pptx

1、第二章 菌物分類學(xué)2022/7/11菌物分類學(xué)：在分類的基礎(chǔ)上，對種類繁多的真菌進(jìn)行系統(tǒng)的歸納和整理，并建立起一定的分類體系，使之能全面反映各分類單元之間的相互關(guān)系。一、真菌分類的目的 根據(jù)國際上已經(jīng)承認(rèn)的一些分類系統(tǒng)給每一種真菌命名，以便交流有關(guān)真菌的各方面的知識；指出已知菌種之間的親緣關(guān)系，因為親緣關(guān)系相近的種其生物學(xué)特性也相似。二、真菌分類的基本規(guī)則(一)分類等級：真菌的分類等級依次為界、門、綱、目、科、屬、種。（二）基本分類單位種1、形態(tài)學(xué)種：根據(jù)形態(tài)特征的不連續(xù)性，對真菌個體進(jìn)行分類而區(qū)分的類群。2、生物學(xué)種：指原本可以相互交配繁殖，但由于地理隔離或生殖隔離，彼此沒有機(jī)會交配的一個自

2、然種群或個體種群3、系統(tǒng)發(fā)育種：經(jīng)過系統(tǒng)發(fā)育分析而確定的具有同一個系譜關(guān)系的個體類群2022/7/11原核生物界原生生物界植物界菌物界動物界粘菌門真菌門 林奈（Linnaeus）（1753）: 兩界系統(tǒng) 動物界 植物界 Whittaker（1969）: 五界系統(tǒng)有人提出設(shè)立另一個界：病毒界（一）兩界系統(tǒng)（二）三界系統(tǒng)（三）四界系統(tǒng)（四）五界系統(tǒng)（五）六界系統(tǒng)（六）三總界五界系統(tǒng)一、生物的界級分類學(xué)說第二節(jié) 真菌在生物中的分類地位生物界級學(xué)說發(fā)展的示意圖兩界系統(tǒng) 1753年，瑞典博物學(xué)家林奈（Carl vov Linne）在其名著植物種志首先提出。動物界植物界三界系統(tǒng)1939年，Conard提出

3、菌物界；1860年，Hogg提出設(shè)立原始生物界； 1971年，Dodson提出菌界；1866年，德國動物學(xué)家E.H.Haeckel建議三界系統(tǒng)。動物界植物界原生生物界四界系統(tǒng)1938年，Copeland提出四界系統(tǒng)，1956年成熟；1959年，Whittaker提出菌物界和原生生物界；1974年，Leedale提出真菌界和原核生物界。動物界植物界原始生物界菌界五界系統(tǒng) 1969年，R.H.Whittaker在Science上發(fā)表生物界級分類的新觀點(diǎn)中提出五界學(xué)說，影響很大。動物界植物界原生生物界真菌界原核生物界六界系統(tǒng)1949年，Jahn提出后生動物界、后生植物界、真菌界、原生生物界、原核生物

4、界和病毒界；1977年，我國王大耜也提出病毒界；1996年，美國的P.H.Raven等提出六界系統(tǒng)。動物界植物界原生生物界真菌界古細(xì)菌界真細(xì)菌界2022/7/11Cavaliver-Smith（1981，1988）提出八界系統(tǒng)，1995年真菌字典（第八版）接受了八個界的系統(tǒng)：原核生物界、原生動物界、膽藻界、真菌界、眼蟲動物界、藻物界、動物界、綠色植物界。涉及真菌的有三個界： 藻物界（Chromista）：卵菌、絲壺菌。 原生動物界（Protozoa）：粘菌、根腫菌。 真菌界（Fungi）：其它真菌，狹義真菌。八界系統(tǒng)Ainsworth等人的菌物分類系統(tǒng)綱要 目前得到學(xué)術(shù)界較廣泛采用的是Ains

5、worth的分類系統(tǒng)。菌物 真菌 根據(jù)真菌營養(yǎng)體的形態(tài)特征和繁殖方式的不同將之分為4個綱。藻狀菌綱：菌絲體無分隔，或者不形成真正的菌絲體。子囊菌綱：菌絲體有分隔，有性階段形成子囊孢子。擔(dān)子菌綱：菌絲體有分隔，有性階段形成擔(dān)孢子。半知菌綱：菌絲體有分隔，未發(fā)現(xiàn)有性階段。 Martin的分類系統(tǒng)真菌界的幾種分類系統(tǒng)第三節(jié) 菌物分類的依據(jù) 一、表型特征 1.形態(tài) 2.超微結(jié)構(gòu) 3.生物化學(xué) 5.核酸序列 6.其他1.形態(tài)： 菌體的基本外形 產(chǎn)孢結(jié)構(gòu) 孢子的種類、形狀、顏色、大小 總體形態(tài)特征2.超微結(jié)構(gòu) 鞭毛 細(xì)胞核分裂 子囊壁結(jié)構(gòu) 分生孢子個體發(fā)育 線粒體內(nèi)部構(gòu)造3.生物化學(xué) 色譜層析 蛋白電泳

6、菌物色素比較 同工酶二、現(xiàn)代方法（一）通過核酸分析鑒定真菌遺傳型（二）細(xì)胞化學(xué)成分用作鑒定指標(biāo)（一）通過核酸分析鑒定微生物遺傳型DNA堿基比例的測定核酸分子雜交法rRNA寡核苷酸編目分析微生物全基因組序列的測定1. DNA堿基比例的測定DNA堿基比例：是指(G+C) mol%值，簡稱GC比， 一般可用解鏈溫度法測定。特點(diǎn)：親緣關(guān)系相近的種，其GC比接近；GC比差距很大的微生物，其親緣關(guān)系必然較遠(yuǎn)；GC比是建立新分類單元的可靠指標(biāo)。2. 核酸分子雜交法 此法是測定核酸分子同源程度和不同物種間親緣關(guān)系的有效手段。適用范圍：DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA具體方法：固相雜交法DN

7、A-DNA分子雜交測定核酸同源性的原理 單鏈DNA（待測菌株） 轉(zhuǎn)硝酸纖維素膜 加入放射性標(biāo)志參照菌DNA（單鏈） 洗去未雜交DNA 閃爍計數(shù)器計數(shù)測定放射強(qiáng)度DNA-DNA雜交（固相雜交法）結(jié)論：DNA同源性60% （同種）；DNA同源性70%（同亞種）；DNA同源性6070%（不同亞種）；DNA同源性2060% （同屬）。3. rRNA寡核苷酸編目分析 一種通過分析原核或真核細(xì)胞中最穩(wěn)定的rRNA寡核苷酸序列同源性程度，以確定不同生物間的親緣關(guān)系和進(jìn)化譜系的方法。原核生物：16S rRNA真核生物：18S rRNA特點(diǎn)：核苷酸數(shù)適中，信息量大，易于分析（1）rRNA具有重要且恒定的生理功能

8、；（2）在16S rRNA分子中，含有高度保守的序列區(qū)域、中度保守和高度變化的序列區(qū)域，適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究；（3）16S rRNA分子量大小適中，便于序列分析；16S rRNA “分子尺”或“分子計時器” （4）rRNA在細(xì)胞中含量大(約占細(xì)胞中RNA的90%)，也易于提??；（5）16S rRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源分子是18SrRNA)，可以作為測量各類生物進(jìn)化的工具。16S rRNA “分子尺”或“分子計時器”16s rRNA核苷酸序列分析步驟 提取DNA PCR擴(kuò)增16S rRNA基因 PCR產(chǎn)物純化 16SrRNA基因序列測定 Genbank檢索相似性結(jié)果的一般判斷：SAB97% 同種SAB為85-97% 同屬SAB85 % 不同屬 概括各種生物間親緣關(guān)系的樹狀分枝圖，分無根樹和有根樹系統(tǒng)發(fā)育樹（phylogenetic tree）微生物的系統(tǒng)樹 細(xì)菌（Bacteria） 古生菌（Archaea） 真核生物（Eukary