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文檔簡介
1、Good is good, but better carries it.精益求精,善益求善。Hsp163蛋白純化分析中文暑期實驗生化部分一實驗?zāi)康?了解基本的分離提純蛋白質(zhì)的原理方法和技術(shù)。2提取分子和微生物實驗中自制重組細(xì)菌產(chǎn)生的蛋白質(zhì)HSP16.3。3測定HSP16.3的分子活性,了解其分子伴侶活性及寡聚結(jié)構(gòu)。4提純和檢測Tag酶蛋白。二背景介紹1HSP16.3HSP16.3是來自結(jié)核桿菌M.tuberculosis的小分子量熱休克蛋白(430bp)。HSP16.3在正常條件下僅有少量表達(dá),當(dāng)M.tuberculosis從對數(shù)期到穩(wěn)定期的轉(zhuǎn)變中顯著表達(dá),并成為細(xì)胞內(nèi)的主要蛋白。另外,HSP
2、16.3還是M.tuberculosis很強的抗原性蛋白,是T,B細(xì)胞發(fā)生免疫反應(yīng)的重要靶點。體外實驗表明,HSP16.3具有分子伴侶的活性,HSP16.3在39.5時可以抑制檸檬酸合成酶的熱聚集,且其活性不依賴于ATP,但不能保護(hù)檸檬酸合成酶的活性,說明HSP16.3是與部分去折疊的檸檬酸合成酶發(fā)生作用,體內(nèi)蛋白的再折疊可能還需要其它蛋白參與。通過凝膠層析還可分離出HSP16.3與檸檬酸合成酶形成的復(fù)合物,并在隨后的SDS中得到證實。HSP16.3可能是通過暴露疏水表面來行使其分子伴侶活性的。實驗表明:HSP16.3在較溫和溫度和低濃度變性劑誘導(dǎo)下,如極低濃度的鹽酸胍(0.05M),尿素(0
3、.3M)或30的溫度處理時,會暴露疏水表面使得其分子伴侶活力迅速上升。HSP16.3是144個氨基酸組成的,分子量為16277Da,其序列分析結(jié)果表明它屬于-crystalline相關(guān)的小分子量熱休克蛋白(sHSP)家族的一員,具有-crystalline蛋白家族典型的C末端保守序列:D/N-G-V-L-T-T/V-X-V/A。小分子量熱休克蛋白(smallheatshockprotein,sHSP)家族的蛋白具有多種不同的生物學(xué)功能,但都具有分子伴侶的活性,能與變性的蛋白質(zhì)底物作用并不依賴于ATP參與。這一類蛋白的結(jié)構(gòu)研究表明它們往往通過形成特定的寡聚結(jié)構(gòu)來發(fā)揮功能,如M.Janneschi
4、iHSP16.5形成二十四聚體,小麥HSP16.9形成十二聚體。HSP16.3是迄今為止發(fā)現(xiàn)的幾種原核生物的sHSP之一,目前,對sHSP功能,作用機制了解還很少。2Tag酶三實驗原理1、超聲波處理法破碎細(xì)菌借助超聲波的震動力破碎細(xì)胞壁和細(xì)胞器。處理的效果與樣品濃度和使用頻率有關(guān)。破碎微生物細(xì)菌和酵母菌時時間要稍長,使用時應(yīng)注意降溫防止過熱。Ni-NTA親和層析(Ni-NTAAffinityChromatography)(1)金屬螯合親和層析金屬螯合親和層析介質(zhì)上偶聯(lián)的配基亞氨基二乙酸鈉(IDA),在偏堿的環(huán)境中容易于二價金屬離子如Zn2,Cu2,Ni2發(fā)生可逆螯合吸附,二價金屬離子又與流動相
5、中的半胱氨酸、組氨酸、咪唑等物質(zhì)發(fā)生可逆性的螯合吸附。金屬離子在螯合介質(zhì)與分離分子間起著橋梁的作用,金屬離子一端與螯合介質(zhì)連接,另一端與被分離組分結(jié)合。這兩種結(jié)合方式都是可逆的,可以根據(jù)需要從不同結(jié)合部分解析下來。例如,以EDTA為洗脫劑可以從金屬離子與螯合介質(zhì)的結(jié)合部位洗脫下來,以咪唑為洗脫劑可以從金屬離子與被分離分子的結(jié)合部位洗脫下來,利用這一特性可以分離不同用途的蛋白質(zhì)。(2)NiIDA和NiNTAIDA只有三個金屬螯合位點,與金屬離子結(jié)合并不緊密,由此導(dǎo)致最后純化產(chǎn)物不純等問題。而NiNTA中,NTA是一個四配位基的螯合劑,可以與鎳離子六個配位基中的四個螯合,鎳離子剩下的兩個配位基則與
6、目標(biāo)蛋白六個組氨酸殘基(6xHistag)結(jié)合,在較高強度的洗脫條件下,仍保持良好的結(jié)合力。半胱氨酸和色氨酸也能與固定金屬離子產(chǎn)生結(jié)合作用,但這種結(jié)合力要遠(yuǎn)小于組氨酸殘基與金屬離子的結(jié)合力。圖1不同的配基與鎳離子的螯合(左)Ni氨三乙酸配合物,NTA與鎳離子中四個配位基結(jié)合,結(jié)合更緊密;(右)Ni亞氨二乙酸配合物,IDA與鎳離子的三個配位基結(jié)合。3、紫外吸收法測蛋白質(zhì)含量蛋白質(zhì)分子中,酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸殘基的苯環(huán)含有共軛雙鍵,使蛋白質(zhì)具有吸收紫外光的性質(zhì)。吸收高峰在280nm處,其吸光度(即光密度值)與蛋白質(zhì)含量成正比。此外,蛋白質(zhì)溶液在238nm的光吸收值與肽鍵含量成正比。利用一定波長
7、下,蛋白質(zhì)溶液的光吸收值與蛋白質(zhì)濃度的正比關(guān)系,可以進(jìn)行蛋白質(zhì)含量的測定。4.透析(Dialysis)經(jīng)由半透膜的兩端及透析液中的分子,經(jīng)濃度的差異而互柤產(chǎn)生自由擴散(Diffusion)的現(xiàn)象叫作透析作用。通常將半透膜制成袋狀,將生物大分子溶液置入袋內(nèi),將此透析袋浸入水或緩沖液中,樣品溶液中的大分子量的生物大分子被截留在袋內(nèi),而鹽和小分子物質(zhì)不斷擴散透析到袋外,直到袋內(nèi)外兩邊的濃度達(dá)到平衡為止。透析技術(shù)可用于除鹽、除生物小分子雜質(zhì)和濃縮樣品。透析的動力是擴散壓,擴散壓由跨膜兩邊的濃度梯度形成的。透析的速度正比于膜的厚度,正比于欲透析的小分子溶質(zhì)在膜內(nèi)外兩邊的濃度梯度,還正比于膜的面積和溫度,
8、通常是4透析,升高溫度可加快透析速度。5、SDSpageSDS聚丙烯酰胺凝膠電泳是最常用的定性分析蛋白質(zhì)的電泳方法,特別是用于蛋白質(zhì)純度檢測和測定蛋白質(zhì)分子量。SDS即十二烷基磺酸鈉(CH3-(CH2)10-CH2OSO3-Na+),是一種陰離子表面活性劑即去污劑,它可以斷開分子內(nèi)和分子間的氫鍵,破壞蛋白質(zhì)分子的二級和三級結(jié)構(gòu),強還原劑b-巰基乙醇可以斷開半胱氨酸殘基之間的二硫鍵,破壞蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。電泳樣品加入樣品處理液后,要在沸水浴中煮35min,使SDS與蛋白質(zhì)充分結(jié)合,以使蛋白質(zhì)完全變性和解聚,并形成棒狀結(jié)構(gòu)。SDS與蛋白質(zhì)結(jié)合后使蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物上帶有大量的負(fù)電荷,平均每兩個氨基
9、酸殘基結(jié)合一個SDS分子,這時各種蛋白質(zhì)分子本身的電荷完全被SDS掩蓋。這樣就消除了各種蛋白質(zhì)本身電荷上的差異。樣品處理液中通常還加入溴酚藍(lán)染料,用于控制電泳過程。另外樣品處理液中也可加入適量的蔗糖或甘油以增大溶液密度,使加樣時樣品溶液可以沉入樣品凹槽底部。SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳還可以用于未知蛋白分子量的測定,在同一凝膠上對一系列已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白及未知蛋白進(jìn)行電泳,測定各個的標(biāo)準(zhǔn)蛋白的電泳距離(或遷移率),并對各自分子量的對數(shù)(logMr)作圖,即得到標(biāo)準(zhǔn)曲線。測定未知蛋白質(zhì)的電泳距離(或遷移率),通過標(biāo)準(zhǔn)曲線就可以求出未知蛋白的分子量。SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳經(jīng)常應(yīng)用于提純過程中純度的
10、檢測,純化的蛋白質(zhì)通常在SDS電泳上應(yīng)只有一條帶,但如果蛋白質(zhì)是由不同的亞基組成的,它在電泳中可能會形成分別對應(yīng)于各個亞基的幾條帶。SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳具有較高的靈敏度,一般只需要不到微克量級的蛋白質(zhì),而且通過電泳還可以同時得到關(guān)于分子量的情況,這些信息對于了解未知蛋白及設(shè)計提純過程都是非常重要的。6天然聚丙烯酰胺凝膠電泳(NativeGel)天然聚丙烯酰胺電泳,是指未加SDS,也未經(jīng)強還原劑如DDT和巰基乙醇處理的天然聚丙烯酰胺凝膠電泳。目的是為了使生物大分子在電泳過程中保持其天然的形狀和電荷。利用蛋白質(zhì)分子中帶有凈電荷的數(shù)目差異,以及分子質(zhì)量、形狀不同,在電場中泳動的速度和方向有區(qū)別,
11、從而達(dá)到分離的目的。在電泳分離后仍能保持蛋白質(zhì)和酶等生物大分子的生物活性。與其他方法相比,NativeGel電泳分辨率較低,使用合適濃度和孔徑的凝膠、有足夠長度的凝膠、小體積加樣等方法,可提高分辨率。四、材料、儀器與步驟細(xì)胞收集和破碎材料:經(jīng)誘導(dǎo)表達(dá)目的蛋白(HSP16.3)的大腸桿菌設(shè)備:大型低溫離心機,高速低溫離心機,細(xì)胞超聲破碎儀,4/-20冰箱試劑:BufferA(25mmol/LTrisHCl,,0.15mol/LNaCl,pH8.0)實驗步驟:(1)將150ml菌液(經(jīng)誘導(dǎo)表達(dá)目的蛋白的大腸桿菌)轉(zhuǎn)入大離心瓶中(2tubes/組),離心收菌,5000rpm,10min,4oC(留沉
12、淀);(2)配制BufferA緩沖液:配制時先分別加入4.31gTris.HCl和1.51gNaCl,用去離子水定容至500ml,HCl調(diào)pH值至8.0,配制成終濃度為25mmol/LTrisHCl,,0.15mol/LNaCl,pH8.0的溶液。(3)倒掉上清,將離心管中的菌體沉淀懸于40mlBufferA緩沖液(pET系統(tǒng)用BufferA,25mmol/LTrisHCl,150mmol/LNaCl,pH8.0),再移至小燒杯中;(4)超聲破碎細(xì)菌(冰浴):工作功率400KW,工作5秒,停止5秒,每次50個循環(huán),共3次,每次間歇12min;超聲注意事項:*盛裝菌液的小燒杯要放在冰盒底部,防止
13、超聲過程中冰融后燒杯移位;*探頭要距離燒杯底部有一定距離,大約5mm,但又不能離底部過遠(yuǎn);*探頭一定要插入液體內(nèi)方能開機,嚴(yán)緊空載開機;工作時鉆頭要在液面中間,保證超聲效果;*超聲過程中冰會融化,應(yīng)及時添加冰。*所用超聲機適合破碎30ml以上的溶液;*基本參數(shù)都已設(shè)定,不要隨便修改已設(shè)定好的參數(shù),開機后只需調(diào)整功率輸出旋鈕,把輸出功率調(diào)整到200W左右;一般情況下工作功率設(shè)定在200W左右即可,但由于本作超聲機鉆頭較細(xì),加大功率至300W;*在使用中出現(xiàn)的問題應(yīng)及時通知老師;*超聲破碎后,要用去離子水再超聲五次,擦干探頭,防止殘留菌液結(jié)垢。(4)將破菌產(chǎn)物離心,12000rpm,30min,4
14、oC;(5)留上清,沉淀溶于30ul的bufferA中,4冰箱保存,分別對上清和沉淀留樣,通過SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳,鑒定表達(dá)情況和蛋白可溶情況。2.NiNTA親和層析蛋白材料:高速離心得到的蛋白上清,Ni-NTA介質(zhì)設(shè)備:制冰機,4/-20冰箱,親和層析柱,電磁攪拌器,紫外分光光度計試劑:BufferA(25mmol/LTrisHCl,,0.15mol/LNaCl,pH8.0)1mol/L咪唑溶液50mmol/LNiSO4洗脫液1(20mM咪唑):在20ml的bufferA中加入400l1mol/L咪唑,配成終濃度為25mmol/LTris.HCl,150mmol/LNaCl,20mmol
15、/L咪唑,pH8.0的溶液;洗脫液2(200mM咪唑):在16ml的bufferA中加入4ml1mol/L咪唑,配成終濃度為25mmol/LTris.HCl,150mmol/LNaCl,20mmol/L咪唑,pH8.0的溶液。實驗步驟:處理介質(zhì):向柱中加入1mlNTA介質(zhì)后,按下列順序清洗和處理層析柱:去離子水(3柱體積,約20ml)BufferA(10ml)平衡介質(zhì)。加入蛋白樣品:加入40ml超聲破菌后的蛋白上清樣品(保留穿過液),手動加液,最后保留30l穿過液樣品用作SDSPAGE檢測。洗脫雜蛋白:用10mlbufferA洗脫介質(zhì)。將柱用bufferA裝滿后放入4冰箱過夜。洗脫目標(biāo)蛋白:用
16、20ml洗脫液1(20mM咪唑)洗脫介質(zhì),保留30l穿過液樣品用作SDSPAGE檢測;用20ml洗脫液4(200mM咪唑)洗脫介質(zhì),手動收集,每管1ml。以bufferA為參比,測量上述三次洗脫收集的洗脫液的OD280。NTANi2瓊脂糖再生:10ml1M咪唑20ml去離子水10ml50mMNiSO410ml20乙醇加入20乙醇,封口,4保存。3.透析材料:固體NaH2PO4,透析袋,OD280峰值處的洗脫液樣品(本組由于沒有得到目標(biāo)蛋白,用的是9-2組的。)實驗步驟:配制透析緩沖液:用NaH2PO4和Na2HPO4配置1L,pH7.0的透析液(兩組共用透析液)。準(zhǔn)備透析袋:將透析袋剪切成適當(dāng)
17、長度(1020厘米),在蒸餾水中煮10分鐘,冷卻后儲放在水中。(老師準(zhǔn)備好)透析:透析袋涼至室溫,中間打結(jié)或系皮筋,用滴管向透析袋中加入OD280值最高一管樣品約1ml,兩端封口,放入透析液中過夜。注意事項:透析袋中加入蛋白樣品的量最好為一半體積,因為透析時袋外液體受滲透壓進(jìn)入袋內(nèi),使透析袋膨脹;為避免透析袋漲破,不宜加入過多樣品,實際上加了約0.5ml。4.CrossLinking材料:經(jīng)透析的樣品設(shè)備:微量恒溫器試劑:Specialsamplebuffer(含4戊二醛,終濃度1),0.1MTrisHCl,pH7.0實驗步驟:取30l透析樣品,加入15lspecialsamplebuffer
18、,在室溫放置20min,再加5l0.1MTrisHCl停止交聯(lián)(stop),pH7。5.SDSPAGE材料:前面實驗所留的樣,包括破菌上清樣品,破菌沉淀樣品,掛柱穿過樣品,透析交聯(lián)樣品,不同濃度咪唑洗脫液洗脫蛋白回收樣品。蛋白電泳marker設(shè)備:蛋白電泳儀等電泳設(shè)備,Pipette,微量恒溫器(用于樣品處理),電磁攪拌器試劑:A液(Lowerbuffer):18.17gTris0.4gSDS,pH8.8(HCl)加H2O到100ml(1.5MTris-HClbuffer)B液(Upperbuffer):6.06gTris0.4gSDS,pH6.8(HCl)加H2O到100ml(0.5MTri
19、s-HClbuffer)C液(30%丙稀酰胺):30g丙稀酰胺(acrylamide)0.8gN,N-亞甲雙丙烯酰胺(Bisacrylamide)加水到100mlD液(10%過硫酸銨)(fresh):0.1gammoniumpersulfate,加H2O到1ml。樣品處理液1samplebuffer:50mMTris-HCl(pH6.8)100mMDTT(or5%Mercaptoethanol)2%SDS0.1%溴酚藍(lán)(Bromophenolblue)10%甘油(Glycerol)Tris-甘氨酸電泳緩沖液:0.025mol/LTris0.25mol/L甘氨酸(pH為8.3)0.1%SDS染色
20、液:0.25g考馬斯亮藍(lán)R-250溶于50ml甲醇中,加入8ml乙酸和42mlH2O定容至100ml。脫色液:30%乙醇,10%乙酸,加H2O定容至1000ml。實驗步驟:SDS聚丙烯酰胺凝膠的灌制:根據(jù)廠家說明書安裝玻璃板,在高玻璃上做好刻度線,玻璃板矮面朝外。確定所需凝膠溶液體積,按下表給出的數(shù)值在一小燒杯中按所需丙烯酰胺濃度配制定體積的分離膠溶液。依次混合各成分。一旦加入TEMED,馬上開始聚合,故應(yīng)立即快速旋動混合物并進(jìn)入下步操作。配制分離膠(15%runninggel):A4.5mlC9mlH2O7.4mlTEMED0.02mlD(fresh)0.07mlTotal18mlTEMED
21、orDwasaddedlast.迅速在兩玻璃板的間隙中灌注丙烯酰胺溶液,至刻度線高度,留出灌注積層膠所需空間(梳子的齒長,再加1cm)。用注射器小心地在丙烯酰胺溶液上覆蓋一層水(水封)。將凝膠垂直放置于室溫下。分離膠聚合完全后(1520min),傾出覆蓋層液體,用紙巾的邊線吸凈殘留液。按下法制備積層膠:按下表給出的數(shù)據(jù)在另一個小燒杯里制備一定體積及一定濃度的丙烯酰胺溶液,依次混合各成分。旦加入TEMED,馬上開始聚合,故應(yīng)立即快速旋動混合物并進(jìn)入下一步操作。在已聚合的分離膠上直接灌注積層膠,立即在積層膠溶液中插入干凈的Teflon梳子。小心避免混入氣泡,再加入積層膠溶液以充滿梳子之間的空隙,將
22、凝膠垂直放置于室溫下。配制積層膠(3%runninggel):B2.0mlC0.8mlH2O5.2mlTEMED0.01mlD(fresh)0.04mlTotal8.05mlTEMEDorDwasaddedlast.蛋白電泳樣品處理:將10l1samplebuffer加入10l洗脫蛋白樣品中,在100加熱5分鐘,以使蛋白變性。標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker也在100中加熱5min。電泳:積層膠聚合完全后,小心移出梳子,將玻璃板間的膠帶去掉,玻璃板高面朝外,固定于電泳裝置上,上、下槽各加入Tris甘氨酸電泳緩沖液。必須設(shè)法排出凝膠底部兩玻璃板之間的氣泡。按預(yù)定順序加樣,每樣品加20l,使用專用的上樣槍頭,
23、每加完一個樣品在下槽緩沖液中洗滌加樣注射器。將電泳裝置與電源相接(正極應(yīng)接下槽),調(diào)節(jié)電壓為200V。至溴酚藍(lán)到達(dá)分離膠底部,然后關(guān)閉電源。從電泳裝置上卸下玻璃板,放在紙巾上,用小鋼尺把膠刮下來。用考馬斯亮藍(lán)對SDS聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行染色:考馬斯亮藍(lán)R250是一種三苯甲烷紡織染料。可將凝膠放在這一染料的甲醇乙酸濃溶液中浸泡數(shù)小時,然后經(jīng)過長時間的脫色而使過量染料從凝膠上擴散出去。用至少5倍體積的染液浸泡凝膠,放在平緩搖動的平臺上于室溫染色2小時。脫色,觀察結(jié)果:倒出染色液,將凝膠浸泡于不加染料的甲醇乙酸溶液中,平緩搖動48小時,其間應(yīng)更換脫色液三四次。6.NativeGel材料:不同濃度咪唑洗
24、脫液洗脫蛋白回收樣品,透析樣品,標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker,BSA設(shè)備:蛋白電泳儀等電泳設(shè)備,Pipette,冰盒試劑:A液(Lowerbuffer):18.17gTris,pH8.8(HCl)加H2O到100ml(1.5MTris-HClbuffer)B液(Upperbuffer):6.06gTris,pH6.8(HCl)加H2O到100ml(0.5MTris-HClbuffer)C液(30%丙稀酰胺):30g丙稀酰胺(acrylamide)0.8gN,N-亞甲雙丙烯酰胺(Bisacrylamide)加水到100mlD液(10%過硫酸銨)(fresh):0.1gammoniumpersulfate
25、,加H2O到1ml。樣品處理液samplebuffer:0.1MTris-HCl(pH6.8)0.2%溴酚藍(lán)(Bromophenolblue),2mg20%甘油(Glycerol)Tris-甘氨酸電泳緩沖液:0.025mol/LTris0.25mol/L甘氨酸(pH為8.3)BSA牛血清白蛋白:1mgBSA溶于1ml去離子水中。*注:nativegel的試劑里不含任何的SDS或者DDT等還原性強的試劑。實驗步驟:基本和SDSPAGE操作一樣,但是有下列幾點不同:分離膠配制濃度為7.5,而不是15,濃縮膠配方一樣。配制分離膠(7.5%runninggel):A4.5mlC4.5mlH2O8.9m
26、lTEMED0.02mlD(fresh)0.07mlTotal18mlTEMEDorDwasaddedlast.蛋白樣品處理:取15l蛋白樣品加入5l的3samplebuffer,混勻,不用加熱,直接上樣。7.測活材料:目標(biāo)蛋白濃度最高的一管樣品設(shè)備:紫外分光光度計,pipette,微量恒溫器試劑:緩沖液(0.05MNa2HPO4,0.1MNaCl,pH7.0),1MDTT,2.5mg/ml胰島素(insulin)實驗步驟:按照下表設(shè)計,依次加入各種試劑(最后加insulin),每一個體系終體積為1ml。測活參比液:0.05MNa2HPO4760ul0.1MNaCl(pH7.0)1MDTT80
27、ulInsulin(2.5mg/ml)200ul2.以緩沖液(0.05mol/LNa2HPO4,0.1MNaCl,pH7.0)為空白,測反應(yīng)物在360nm處的濁度,以檢測胰島素的聚集。每組測14min,每10s記一個數(shù)據(jù)。3.按照下表加入試劑進(jìn)行測活。測活樣品液:0.05MNa2HPO4740ul0.1MNaCl(pH7.0)Proteinsample20ul1MDTT80ulInsulin(2.5mg/ml)200ul4.以緩沖液(0.05mol/LNa2HPO4,0.1MNaCl,pH7.0)為空白,測反應(yīng)物在360nm處的濁度,以檢測胰島素的聚集。每組測14min,每10s記一個數(shù)據(jù)。五
28、結(jié)果與討論1目的蛋白的洗脫曲線用BufferA+200mM咪唑(25mmol/LTrisHCl,0.15mol/LNaCl,200mmol/L咪唑,pH8.0)洗脫目標(biāo)蛋白收集組分,測OD280數(shù)據(jù),見表1。由此數(shù)據(jù)作圖,見圖2。表一、200mM咪唑洗脫的各管的OD280值管數(shù)OD28010.36520.66930.64340.53350.47360.38670.37680.326圖2、200mM咪唑洗脫的各管的OD280用緩沖液B(25mmol/LTrisHCl,0.15mol/LNaCl,200mmol/L咪唑,pH8.0)為空白對照,各管收集組分在紫外分光光度計上測定吸光度OD280,以
29、OD280為縱座標(biāo),收集組分按順序為橫座標(biāo)作圖,可以從圖中直接得出第2管蛋白洗脫量最多即蛋白濃度最高。從OD280的數(shù)據(jù)可以看出,各管的OD280都在0.7以內(nèi),并不太高。鑒于我們是直接取用的發(fā)酵罐的菌液,而且之前的實驗結(jié)果顯示我們的細(xì)菌濃度較高,所以我們測OD280前共對樣品稀釋了16倍。綜合考慮稀釋倍數(shù),我們的數(shù)據(jù)結(jié)果就和別組同學(xué)的數(shù)據(jù)結(jié)果差不多了。在洗脫的過程中我們遇到最大的問題就是洗脫的速度特別的慢,從一開始用水洗柱子的時候速度就比別組慢,后來助教說是因為我們的柱子裝的太緊。有時候慢到20多秒一滴,我們就不得不在助教的幫助下把柱子弄松。我們猜測柱子的問題不僅僅是影響了實驗進(jìn)度,對洗脫效果也會有一定影響,比如洗脫的各管的OD280峰就不突出,不過對后面的實驗還不至于產(chǎn)生大的影響。2SDSPAGE凝膠電泳結(jié)果第一塊膠孔號12345678樣品MarkerCross-link(ours)Cross-linkconrolboiledCross-link(別組的)Cross-lin
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