病原體分子分型實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)傳輸和分析系統(tǒng)

1、病原體分子分型實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)傳輸和分析系統(tǒng)一、系統(tǒng)簡介“病原體分子分型實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)傳輸和分析系統(tǒng)”是基于國家十二 五重大科技專項(xiàng)開發(fā)的專業(yè)軟件系統(tǒng)。PFGE脈沖場凝膠電泳圖譜分析（官微），留 言進(jìn)行相關(guān)事宜咨詢。系統(tǒng)主要功能是PFGE圖譜分子分型在線識(shí)別和處理，提供二叉層級聚樹， MLVA、MLST字符類型的最小生成樹，SEQUENCE基因片段類型的親緣樹計(jì)算和圖 形繪制，用于分析菌株之間的相關(guān)性，協(xié)助追蹤感染來源以及有效控制疫情。系統(tǒng)結(jié)合了計(jì)算機(jī)技術(shù)、分子生物學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、圖像識(shí)別技術(shù)、地理信息技 術(shù)，能夠?qū)ξ⑸锏姆肿臃中蛿?shù)據(jù)進(jìn)行專業(yè)處理和分析，準(zhǔn)確識(shí)別出相似性。系統(tǒng)于2015年6

2、月通過由國家疾控中心、解放軍疾病預(yù)防控制所、軍事醫(yī) 學(xué)科學(xué)院、清華大學(xué)以及國內(nèi)著名醫(yī)院等單位組成的專家組驗(yàn)收。專家組認(rèn)為本 系統(tǒng)在疾控行業(yè)、食品衛(wèi)生行業(yè)、醫(yī)院以及科研部門均有較強(qiáng)的易用性和穩(wěn)定性， 業(yè)務(wù)邏輯清晰，功能齊全，且具自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)，安全可控；系統(tǒng)申報(bào)2項(xiàng)發(fā)明專 利，并已獲得12個(gè)軟件著作權(quán)。二、系統(tǒng)解決的主要問題1、疾控行業(yè)：送檢樣本細(xì)菌的相似性判定和帶型編碼、疾病暴發(fā)的溯源分 析、疾病分布特征分析和預(yù)警分析。在發(fā)生感染和疫情時(shí)，可以幫助業(yè)務(wù) 人員盡早定位感染來源，提高疫情調(diào)查、追蹤和控制的效率。2、醫(yī)療機(jī)構(gòu)：院內(nèi)感染問題、醫(yī)學(xué)研究。3、食品檢疫：對食品中常見致病微生物進(jìn)行分子分型分析

3、、食源性疾病微 生物的溯源。4、農(nóng)業(yè)和林業(yè)：家畜和動(dòng)物攜帶治病菌的溯源、引發(fā)動(dòng)物流行性感冒的研 究和監(jiān)控、動(dòng)物、環(huán)境和飼養(yǎng)員耐藥菌的研究。三、系統(tǒng)特點(diǎn)1、優(yōu)秀的成本控制：采用B/S模式，一次性部署即可搭建成功，在采購成本、升級成本、維護(hù)成本上，具有壓倒性優(yōu)勢。2、高效的計(jì)算能力：擁有計(jì)算功能強(qiáng)大的分析計(jì)算服務(wù)，可以一次性聚類 1000株菌，并在15秒內(nèi)完成。3、強(qiáng)大的客戶端繪圖能力：客戶端提供直觀的圖形展示和良好的交互體驗(yàn)， 操作簡便，分析結(jié)果一目了然。4、良好的易用性：全中文操作界面，簡單易用，確保用戶可以快速上手。5、可靠的用戶信息安全保障：自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)軟件，為用戶的信息安全提供 可靠的保

4、障。6、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的積累：系統(tǒng)在使用過程中會(huì)積累下多樣化的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù) 積累的數(shù)量越多、年份跨度越廣，則分析結(jié)果的準(zhǔn)確性越高。四、系統(tǒng)使用效果對比1、使用前（1）細(xì)菌的識(shí)別定性采用傳統(tǒng)的物理和化學(xué)檢測，識(shí)別準(zhǔn)確度相對差。（2）細(xì)菌的識(shí)別分型結(jié)果，不能在相關(guān)機(jī)構(gòu)中統(tǒng)一認(rèn)可。（3）疾病暴發(fā)、食品中毒、院內(nèi)感染發(fā)生時(shí)，不能及時(shí)應(yīng)對情況，造成診 斷延遲，失去了最佳的處置時(shí)機(jī)。（4）沒有相關(guān)的分子分型數(shù)據(jù)留存，不利于醫(yī)療研究和診斷經(jīng)驗(yàn)數(shù)據(jù)積累。2、使用后（1）細(xì)菌的識(shí)別定性與國際接軌，識(shí)別準(zhǔn)確度高。（2）識(shí)別結(jié)果可以在不同機(jī)構(gòu)之間比較，識(shí)別結(jié)果權(quán)威性高。（3）當(dāng)疾病暴發(fā)、食品中毒、院內(nèi)感染發(fā)生時(shí)，機(jī)構(gòu)可以直接采集樣本， 分析識(shí)別定性。（4）能夠積累大量的細(xì)菌分子分型數(shù)據(jù)，提高機(jī)構(gòu)在重大疫情中的溯源成 功率，提高機(jī)構(gòu)的知名度。五、