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文檔簡介

1、英 文 名 詞中 文 名 詞解 釋A ( Adenine )腺嘌呤作為堿基的兩種嘌呤中的一種。active site活化位點蛋白質(zhì)三維表面催化作用發(fā)生的區(qū)域。alignment比對為了確定兩個同源核酸或蛋白質(zhì)序列的累計差異而進行的配對稱為比對。alignment of alignments比對的比對即比對的對象不是簡單的序列,而是序列的比對。alleles等位基因一個基因的不同版本。 alpha carbon 碳在氨基酸中與側鏈( R- 基團)相連的中心碳原子。alternative splicing可變剪接從一個單獨的 hnRNA 生成兩個或多個 mRNA 分子的過程。 amino term

2、inus (N-terminal)氨基端( N 端)在一個多肽中,具有自由氨基的分子端,對應于基因的 5- 端。anti-parallel反向平行表示相反的方向;在雙鏈DNA中,這意味著如果一條鏈是 5 到 3 的,則其互補鏈 方向 是 3 到 5 的。 Bbase pair堿基對(1)在雙鏈DNA中嘌呤和嘧啶之間的相互作用(特別指A和T之間,G和C之間);(2)雙鏈DNA序列長度的基本單位。beta turns轉角在反向平行的折疊片中,當鏈反轉方向的時候蛋白質(zhì)內(nèi)部形成的U型結構Bioinformatics生物信息學應用信息科學的理論、方法和技術,管理、分析和利用生物分子數(shù)據(jù)。Biocompu

3、ting生物計算本書中特指用計算機技術分析和處理生物分子數(shù)據(jù)。Basic Local Alignment Search Tool ( Blast)基本的局部比對搜索工具( Blast)一種常用的序列數(shù)據(jù)庫搜索工具。blotting and hybridization印跡和雜交將分子(通常是核酸分子)從 凝膠轉移到膜上,接著用綁定有特定感興趣的分子的標記探針進行洗脫的過程。bootstrap test自舉檢驗對 置信程度進行量化的檢驗。branch and bound method分支約束法一種空間搜索方法,通過約束條件減少搜索空間,提高搜索效率。branches分支在 系統(tǒng)發(fā)生樹中,通過分支連

4、接兩個節(jié)點。CC ( Cytosine)胞嘧啶作為堿基的兩種嘧啶中的一種。 CAAT boxCAAT 盒大多數(shù)真核啟動子具有的一段短序列,其片段模式為 C-A-A-T , 通常出現(xiàn)在 轉錄起始位點上游 80 個 核苷酸的地方。許多因子可以與CAAT盒結合 。carboxy terminus羧基端在多肽鏈中,含有羧酸基團 ( COOH) 的分子端,對應于基因的 3 - 端。cDNA (Complementary DNA )cDNA ( 互補 DNA)通過逆轉錄酶從 RNA 模板合成的 DNA 。cDNA librarycDNA 文庫從 mRNA 序列中產(chǎn)生的所有 DNA 序列的集合。這種類型的文

5、庫只包含編碼蛋白質(zhì)的 DNA (基因)。central dogma中心法則從基因的核酸序列中提取信息并以此合成蛋白質(zhì)的過程( DNA ? RNA ? protein ) 。character特征在 系統(tǒng)發(fā)生樹中 , 具有有限狀態(tài)數(shù)的特征。 charged amino acid帶電氨基酸在一定的生物 pH 值下,帶有正電或負電的氨基酸。chromatin染色質(zhì)在真核生物細胞核內(nèi)部由大量 DNA 以及與此相關的組蛋白組成的近似均勻混合物。chromosome染色體在原核生物,包含一個細胞基因組的DNA分子稱為染色體。在真核生物中,與蛋白質(zhì)復合在一起、包含大量遺傳信息的線型DNA分子。clone克隆

6、無性繁殖,如生物體克隆、基因克隆等。cloning克隆在類染色體載體中插入特定的 DNA 一段,使得它們可以在活細胞中得以保存并復制。Coding sequence編碼序列DNA 序列中為蛋白質(zhì)編碼的部分。Codon密碼子基因編碼部分的三核苷酸組合,對應于一個特定的氨基酸。 Complementary互補的( 1 )通過氫鍵連接的核苷酸對( G 和 C; A 和 T; A 和 U ) ;( 2 )核苷酸鏈的反向平行對。 Computational Molecular Biology計算分子生物學主要研究分子生物學數(shù)據(jù)的分析方法,開發(fā)分析工具。conformation構象蛋白質(zhì)的空間構象。con

7、sensus sequence一致序列在兩個或多個同源序列的每一個位置上多數(shù)出現(xiàn)的核苷酸或氨基酸組成的序列conserved sequence保守序列在進化過程中基本保持不變的核酸與蛋白質(zhì)序列,它們往往與特定的功能相對應。Contig連續(xù)交疊群基因組測序過程中將許多短的序列片段鏈接成很長的連續(xù)片段。convergent evolution趨同進化指相似基因型或表型性狀的獨立進化。例如 , 眼睛在各種生物體 ( 如哺乳動物、軟體動物以及昆蟲 ) 中獨立進化 , 結構各異。core fold核心折疊構成蛋白質(zhì)空間形狀的基本模式。CpG islandCpG 島在 哺乳類動物基因組中的一個 500bp

8、 到 3000bp 的區(qū)域 , 該區(qū)域中的二核苷酸 CpG 的含量比其他區(qū)域的正常水平要高。通常,與此相關的是真核生物管家基因的啟動子區(qū)域。crystal晶體由分子的規(guī)則排列組成的固體結構。Ddegeneracy簡并性指某些氨基酸可以被一個以上的三聯(lián)密碼子編碼的特性。 denatured protein變性蛋白質(zhì)指蛋白質(zhì)因為受熱作用或者去污劑或尿素等化學作用而失去了正常的三級結構和四級結構的結果。deoxyribonucleic acid (DNA)脫氧核糖核酸 ( DNA )由相連的核苷酸組成的雙鏈生物二聚體 , 其核苷酸含有脫氧糖基。DNA是遺傳的分子基礎。 dipeptide二肽由一個肽

9、鍵連成的兩個氨基酸。disulfide bond二硫鍵二硫鍵是蛋白質(zhì)中兩個半胱氨酸側鏈之間形成的化學鍵 。DNADNA參見 脫氧核糖核酸。domain域(結構域)指蛋白質(zhì)結構中相對獨立的、具有特定功能的空間區(qū)域。dot plot點陣圖對兩條序列進行圖形化比較的方法。圖形中的一系列的斜線對應于序列相似的區(qū)域。dynamic programming動態(tài)規(guī)劃一種可以有效地探求一定復雜問題的各種可能的解決方案的程序;它將一個問題合理分解成一些小的子問題,然后利用部分計算解得到最終答案。Eenhancer增強子可以與真核轉錄因子特異性結合的 DNA 序列片段。增強子序列可以在任何一個方向上起到逐漸增加轉

10、錄水平的作用。enzyme酶一種生物催化劑(通常是 蛋白質(zhì)),能通過降低活化能使特定的化學反應可以更快地進行。EST ( Expressed sequence tags )EST 表達序列標簽從 cDNA 的 5 或 3 端獲取的短的 DNA 片段。euchromatin常染色質(zhì)指真核生物中組蛋白高度甲基化( 乙酰 化?)并且 DNA 低度甲基化的開放染色質(zhì)。exhaustive search窮舉搜索對問題所有可能的解進行評估。exon外顯子一個 hnRNA 分子的各個部分,它們被剪接后連在一起形成 mRNA 。 expression profile表達譜 基因在不同時空的表達模式。Ffami

11、ly家族在整個長度范圍內(nèi)有多于 50 的氨基酸序列相同的蛋白質(zhì)稱為一個家族。fold折疊通常和術語“結構模體”有近似的含義,但是特別暗示在兩個或更多的蛋白質(zhì)中具有相似二級結構的大區(qū)域。fourfold degenerate site四重簡并位點指那些改變一個核苷酸為任何其它三個中的一個都對核糖體將氨基酸插入到蛋白質(zhì)沒有影響的密碼子位點。GG ( Guanine )G ( 鳥嘌呤)兩種嘌呤中的一種。gap penalty空位罰分為了減少序列比對中出現(xiàn)的空位,對空位進行減分的操作。gaps空位在兩個具有共同祖先序列的比對中,為了反映插入或刪除所引入的一個或一些破折號。GC contentGC 含量

12、在 DNA 序列中,核苷酸 G 、 C 的組成 相對于 A 、 T 的比例 。gel electrophoresis凝膠電泳指在電場的作用下,使帶電分子穿過聚丙烯酰胺、淀粉或者瓊脂糖凝膠,從而根據(jù)其大小和帶電性進行分離的過程。gene基因DNA 或 RNA 中,代表特定功能的某一段核苷酸序列;一種遺傳的功能單元,它控制著一個或多個性狀的傳遞和表達。gene content基因內(nèi)容一個基因組所包含的所有基因稱為該基因組的基因內(nèi)容。gene expression基因表達利用存儲在 DNA 中的信息來合成 RNA 分子,進而生成相應蛋白質(zhì)的過程。gene identification基因識別利用各種

13、方法識別基因組中的基因序列。gene ontology基因本體論關于基因和蛋白質(zhì)知識的標準詞匯,是今后實現(xiàn)各種與基因相關數(shù)據(jù)的統(tǒng)一、進行數(shù)據(jù)轉換、開展數(shù)據(jù)挖掘的基礎。gene order基因次序基因在染色體上的排列順序。gene tree基因樹基于同源基因分析得到的系統(tǒng)發(fā)生樹。genetic map遺傳圖譜以具有多態(tài)性的遺傳標記為“路標”,以遺傳學距離為圖距的基因組圖譜。genome基因組一個生物體全部遺傳物質(zhì)的總和。genomics基因組學研究基因組序列,研究序列與功能的關系,研究基因組中所包含的遺傳信息。genomic library基因文庫包含有基因組 DNA 插入的克隆片段集合。gen

14、otype基因型一個個體或群體全部或部分的基因組成。global alignment全局比對在全局范圍內(nèi)對兩條序列進行比對打分的方法。GU-AG ruleGU AG 規(guī)則這是一條與真核生物蛋白質(zhì)編碼基因相關的規(guī)則,說的是 RNA 內(nèi)含子序列 5 端 的起始兩個核苷酸總是 5-GU-3 ,并且其 3 端 的最后兩個核苷酸總是 5-AG-3 。Hhairpin turn發(fā)夾環(huán)在 RNA 鏈中自身反轉允許形成分子內(nèi)堿基配對的位置。Hash tableHash 表一種數(shù)據(jù)結構,可以存儲多個數(shù)值;不像矩陣要用整型索引獲取存在其中的數(shù), hash 表可以用任何類型的值(包括字符串)作為索引。Hidden

15、Markov Models (HMM)隱馬爾柯夫模型( HMM )在序列分析中常用的一種數(shù)學模型。heterochromatin異染色質(zhì)指轉錄停滯、緊密包裹著的染色質(zhì) ; 和高度 DNA 甲基化以及低度的組蛋白乙?;嘘P。heuristic methods啟發(fā)式方法反復試驗 , 利用經(jīng)驗解決問題的一種方法。homologs同源 序列具有公共祖先的序列。horizontal genetransfer基因水平轉移基因從一個物種傳遞到另一個物種的過程。雖然病原體和轉座子通常被疑似為導致它的原因,但是基因這種運動的機制仍然未知。Human Genome Project, HGP 人類基因組計劃通過全球

16、合作,繪制人類基因組的全部序列圖譜。housekeeping gene管家基因發(fā)育過程中在任何時間、在任何器官都高度表達的基因。H-P (hydrophobic-polar) modelH-P (疏水極性)模型以固定半徑的單個原子表示蛋白質(zhì)中的一個氨基酸殘基的簡單網(wǎng)格模型。hydrogen bonding氫鍵由于極性共價鍵的作用,使得電荷作用發(fā)生輕微分離而形成的分子相互作用。hydrophilic親水的很容易在水性溶劑中溶解;字面上理解,就是和水易處的。hydrophobic疏水的難以和 水分子相互作用,字面上就是厭水的。hydrophobic amino acid疏水氨基酸含有一個全部由碳和

17、氫組成的 R 基團 的氨基酸;它不可能和水分子形成氫鍵hydrophobic collapse疏水折疊將一個多肽鏈折疊成一個壓縮的構象,從而使疏水殘基遠離溶劑的過程,簡單的說,是由疏水作用而引起的肽鏈折疊。Iindel插入或刪除插入或刪除。inferred ancestor 25推斷祖先通過 系統(tǒng)發(fā)生樹推斷而得到的祖先。inferred tree推斷樹對三個或三個以上的同源序列的系統(tǒng)發(fā)生關系的描述,是它們真正關系的一個近似。informative有信息 ( 位點 )在簡約性分析中的提供有用信息位點 ; 與此對應的是無信息位點。ingroup內(nèi)群(或內(nèi)部物種)一個物種或一個分歧不大的物種系列;與

18、此相對應的是外群。Inhibitor抑制劑任何可以降低酶促反應速度的物質(zhì)。initiation complex起始復合物一系列自身相互作用的轉錄因子形成復合體 , 作用與一個基因的啟動子區(qū)域 , 從而促進基因的轉錄啟動。initiator (Inr) sequence起始序列真核基因中與 轉錄起始位點密切相關的核苷酸 ; 在人類中 , 該一致序列是 5-YYCARR-3 。insertion sequence插入序列指除了自身轉座需要外不再包含有任何信息的 轉座子元件 ; 當被插入到一個基因中 , 它將破壞其正常的結構以及基因的功能。internal node內(nèi)部節(jié)點在一棵 系統(tǒng)發(fā)生樹中 ,

19、不對應真正數(shù)據(jù)的節(jié)點 , 這樣的節(jié)點代表兩個或多個獨立家系的公共祖先。intrinsic terminator固有終止子在原核生物中終止轉錄的特殊信號 ; 指在新轉錄的 RNA 中可以形成二級結構的核苷酸序列 , 其后跟隨一串尿嘧啶。intron內(nèi)含子在剪切時被切除的內(nèi)部序列;出現(xiàn)在真核基因的 初級轉錄物 (hnRNAs) 中, 而不是在 mRNA 中。isochores等值區(qū)在真核基因組中具有相似堿基比例的區(qū)域。Jjunk DNA垃圾 DNA沒有意義的 DNA 序列;也指那些目前還不知道其作用的序列。Kkilobase(kb)千堿基DNA 序列的長度單位 , 1000 個堿基為 1kb 。L

20、lead compound先導化合物指在藥物設計中一個可行的候選分子。LINELINE長散布(核)元件。linkage map連鎖圖譜見“遺傳圖譜”。local alignment局部比對一種尋找匹配子序列的序列比對方法。lock and key approach鎖 - 鑰方法兩個對接分子的構象被固定的對接方法。log odds matrix對數(shù)幾率矩陣矩陣元素是每一個字符替換概率的對數(shù)的矩陣。Mmatch score匹配得分序列比較算法對相同字符匹配設置的得分。maximum likelihood approach最大似然法指在一系列的序列比對中,考慮每一個字符被替代的概率的一種系統(tǒng)發(fā)生學方

21、法;也是一種基于純統(tǒng)計的系統(tǒng)發(fā)生重建方法。methylation甲基化一個甲基 ( CH 3 ) 附著在一個核苷酸的 含氮堿基或者蛋白質(zhì)上。microarray微陣列在一個固體基片上的已知位置固定了 DNA 探針的有序陣列。microsatellite微衛(wèi)星在基因組中很多非常短的核酸序列出現(xiàn)的區(qū)域,例如串接出現(xiàn) 5-CA-3 的重復序列;通常在個體間變化很大。MIAME(the minimum information about a microarray experiment)微陣列實驗的最小信息為了實現(xiàn)微陣列數(shù)據(jù)共享和交流而制定的數(shù)據(jù)存儲標準。minisatellite小衛(wèi)星指在基因組中長度

22、從5個堿基對到幾十個堿基對重復序列串連出現(xiàn)的區(qū)域; 在個體間變化可能很大。mismatch score失配打分在一個比對算法中,對于不相同的字符被比對時所賦予的罰分。molecular clock分子鐘這是一個有爭議性的假設,指對于所有的進化譜系,任何一段給定的 DNA 序列以相同的速率突變。molecular clones分子克隆指一段 DNA 序列的多數(shù)相同拷貝,一般地在例如 質(zhì)?;虿《镜容d體中進行,使得 它們可以在細菌培養(yǎng)物中生存并傳播。molecular graphics分子圖形學分子圖形學是進行分子模型化的一項重要技術,由于分子圖形學和其它計算化學方法的相互結合,使得分子模型化方法取

23、得成功。molecular modeling分子模型化分子模型化是利用計算機模擬分子結構、研究分子之間相互作用的一種技術。Monte CarloalgorithmMonte Carlo 算法一種嘗試復雜問題的各種可能解的方法,例如將能量最小作為評價一般解的方法。motif序列模式指核酸或者蛋白質(zhì)序列中具有保守性的序列片段。multiple sequence alignment多重序列比對三個或更多條序列的比對。mutation突變由于 DNA 復制或者修復錯誤導致核苷酸序列發(fā)生的變化;嚴格地講,通過選擇性過濾在物種代間發(fā)生的變化。Nnative structure天然結構在一個活細胞內(nèi),特定的

24、蛋白質(zhì)通常折疊成的唯一結構。natural selection (selection)自然選擇個體間由于適應性的差異而形成的基因傳給子代的差異現(xiàn)象;導致 等位基因頻率改變的進化。nearest neighbor classifier最近鄰分類法一種根據(jù)物體特征相似性對它們進行分類的一種統(tǒng)計學方法。negative regulation負調(diào)控可以阻止基因轉錄發(fā)生的調(diào)控neighbor-joining method鄰近歸并法一種聚類方法 ,在聚類之前,所有對象以單個節(jié)點表示,然后逐步合并相鄰節(jié)點 。nucleotide核苷酸核酸分子的基本單位,其組成方式為堿基 - 戊糖 - 磷酸。neural n

25、etwork神經(jīng)網(wǎng)絡一種可以通過學習來仿效一些神經(jīng)元的功能計算機程序;能夠用來根據(jù)統(tǒng)計相似性預測數(shù)據(jù)集的特定屬性。neutral mutation中性突變不影響生物適應性的突變。NMRNMR 核磁共振用于解析蛋白質(zhì)結構的技術。nodes節(jié)點在一棵系統(tǒng)發(fā)生樹中,以節(jié)點代表一個分類單元(物種、序列)。nondegenerate site非簡并位點突變總是導致蛋白質(zhì)氨基酸序列發(fā)生替換的密碼子位置。nonsynonymous substitution異義替換可以使氨基酸發(fā)生變化的密碼子中核苷酸的替換。Oopen reading frame (ORF)開放閱讀框(ORF )一段由密碼子組成的核苷酸序列,

26、在 相同閱讀框中沒有終止密碼子出現(xiàn)。operator sequence操縱子序列原核生物調(diào)控蛋白結合的 與基因啟動子相關的一段核苷酸序列。operon操縱子包含有結構基因和調(diào)控元件、在轉錄中產(chǎn)生mRNA分子的一組相關的基因。origination penalty起始罰分用來評估一系列新空位的罰分;序列比對中空位罰分的一部分。orthologs直向(直系)同源物那些具有相似性的序列, 由于物種形成事件而使得它們從一個祖先序列獨立進化。outgroup外群(外部參考物種)指與一組生物體很少相關的一個物種或一組物種。PPAM unitPAM 單位一種進化單位;特別地,指被觀察的對象中每 100 個殘

27、基發(fā)生一個替換所需要的平均進化時間。Pairwise Sequence Alignment序列兩兩比對對兩條序列進行編輯操作,通過字符匹配和替換,或者插入和刪除字符,使得兩條序列達到一樣的長度,并使兩條序列中相同的字符盡可能地一一對應。paralogs共生(旁系)同源物那些具有相似性的序列, 它們都是被復制的祖先基因的后裔。parsimony簡約性指只需少量突變事件激發(fā)就可以使一條進化路徑比其他路徑更有優(yōu)先權的過程pattern discrimination analysis模式判別分析是一種統(tǒng)計方法,主要根據(jù)觀察到的一個或多個序列模式來對序列進行分類。physical map物理圖譜關于基因

28、組中特異性序列排列和間距的信息,建立物理圖譜實際上是為全基因組測序建立“路標”,是測序的前一步工作。peptide肽一條含有多個氨基酸的鏈。peptide bond肽鍵在肽連接中碳氮之間的共價鍵。pharmacogenomics藥物基因組學一門利用個體的遺傳信息獲取最好的藥物療效 , 同時具有最小副作用的研究領域phenotype表型生物體由于和其基因型和環(huán)境相互作用而產(chǎn)生的可見屬性。phosphodiester bond磷酸二酯鍵連接一個核苷酸的磷酸基團和另外一個的 脫氧核糖的共價鍵。phylogenetic tree系統(tǒng)發(fā)生樹對三個或三個以上基因或生物體之間的進化關系的圖形化表示。poin

29、t accepted mutation (PAM)點接受突變(PAM )指被自然選擇接受的突變。polar amino acid極性氨基酸通常指側鏈上包含氧和(或)氮并且很容易和水形成氫鍵的氨基酸。polar bond極性鍵在一個帶全正電的分子和另一個帶全負電的分子之間發(fā)生的相互作用。polyadenylation多聚腺苷酸化指用一個基因核苷酸序列中不被讀出的一段長約 250 個堿基 A 組成 的序列替代真核 hnRNA3 端的過程。polycistronic多順反子包含多個基因的遺傳信息(順反子)。polymerase chain reaction聚合酶鏈反應一種在體外快速、大量地合成給定D

30、NA片段的技術,首先將雙鏈DNA分離成兩個互補的單鏈,再用DNA聚合酶將每一個單鏈合成雙鏈,如此重復下去。Polynucleotide多核苷酸一條核苷酸的聚合鏈 ; DNA 或 RNA 分子。polypeptide多肽一條氨基酸的聚合鏈 ; 蛋白質(zhì)。position-specific scoring matrix位置特異性打分矩陣一個矩陣,矩陣中的每一個數(shù)表示某個特定的氨基酸占據(jù)多序列比對中某個位置的頻率。positive regulation正調(diào)控一個調(diào)控蛋白的結合使得 RNA 聚合酶更容易啟動轉錄的情況。primary structure一級結構組裝成蛋白質(zhì)的氨基酸序列。Principal

31、 Component Analysis , PCA主成分分析是一種掌握事物主要矛盾的統(tǒng)計分析方法,它可以從多元事物中解析出主要影響因素,揭示事物的本質(zhì),簡化復雜的問題。probe探針一塊被標記的可以特異性和感興趣的分子發(fā)生相互作用的 DNA (或 RNA 或抗體)。promoter sequence啟動子序列指和一個基因相關聯(lián)的可以被 RNA 聚合酶識別的序列。protein backbone蛋白質(zhì) 骨架多肽鏈中的非側鏈原子。protein electrophoresis蛋白質(zhì)電泳根據(jù)蛋白質(zhì)的基本特征(如大小、帶電性)在電場下分離并比較蛋白質(zhì)的方法protein sequencing蛋白質(zhì)測序

32、對給定蛋白質(zhì)的氨基酸進行測序的過程;通常根據(jù) Edman 方法,每次從多肽的羧基端移走一個氨基酸。protein threading蛋白質(zhì)結構預測線索法首先假設多肽的構象,然后根據(jù)得到的結構計算出其能量的方法。通過計算各種已知結構的能量,可以得出與給定蛋白質(zhì)序列最符合的構象。因為該結構是假設的而不是計算出來的,所以線索法有時指的就是“反向蛋白質(zhì)折疊”。proteome蛋白質(zhì)組一個生物體的所有蛋白質(zhì)總和。Proteomics蛋白質(zhì)組學蛋白質(zhì)組學是研究細胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)及其動態(tài)變化規(guī)律的科學。pseudogene偽基因發(fā)生突變之后失去功能以及轉錄活性的基因。pseudoknot偽結當環(huán)內(nèi)的堿基和環(huán)外

33、的堿基形成配對的時候就是一個假結體;RNA結構中最難預測的類型。purine嘌呤堿基具有雙環(huán)結構的核苷酸;通常指鳥嘌呤和腺嘌呤。pyrimidine嘧啶堿基具有單環(huán)結構的核苷酸;通常指胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶。Qquaternary structure四級結構當若干個多肽相互結合時分子內(nèi)部發(fā)生的相互作用 ; 相互作用的蛋白質(zhì)形成的整體結構。Rreading frame閱讀框在蛋白質(zhì)編碼基因中,以起始密碼子開始、終止密碼子結束的一段線性密碼子序列。regulatory調(diào)控在特定的條件下允許或阻止一個基因的表達;對應于 結構蛋白。residue殘基作為多肽鏈一部分的氨基酸;在關于蛋白質(zhì)或肽的語境中

34、,殘基通常指氨基酸restriction enzymes限制性 ( 內(nèi)切 )酶指在它們遇到特定的核苷酸序列的時候在 DNA 分子中引入雙鏈缺口的蛋白質(zhì)restriction mapping限制性酶切圖譜用兩個或多個限制性酶進行同步消化來決定 DNA 分子中的限制性酶識別序列的相對位置。restriction site限制性 ( 酶切 )位點被限制性酶識別的核苷酸序列 ; 限制性酶識別位點。retroposon逆轉錄轉座子一個被 RNA 媒介傳輸?shù)霓D座元件。retrotransposition逆 轉錄 轉座包含一個 RNA 媒介的轉座。reverse transcriptase逆轉錄酶一種用來將

35、 RNA 變成 DNA 的特殊的酶。ribosome核糖體指負責催化翻譯過程的蛋白質(zhì)和 rRNA 的復合體。ribozyme核酶指可以加速特定化學反應 ( 例如自切割 ) 的 RNA 分子。RNA ( Ribonucleic Acid )核糖核酸RNA 是單鏈的核酸分子 。RNA polymeraseRNA 聚合酶負責轉錄的酶;將 DNA 分子中的信息轉移到 RNA 分子中。rooted tree有根樹含有一個被認為是公共祖先的節(jié)點、并且該節(jié)點到其他節(jié)點只存在唯一路徑的一棵系統(tǒng)發(fā)生樹。Ssatellite DNA衛(wèi)星 DNA指相對于其他的基因組數(shù)據(jù)而言,重復性很大、存儲的信息量很少的真核 DN

36、A 片段。scaled tree標度樹指分支長度和相鄰節(jié)點對之間的差異成比例的系統(tǒng)發(fā)生樹。scoring matrix打分矩陣在序列比對中,用來對每一個非空位置進行打分的矩陣。secondary structure二級結構指源自蛋白質(zhì)一級結構的 螺旋、 折疊等局部結構特征。Self-Organizing Map, SOM自組織映射神經(jīng)網(wǎng)絡自組織特征映射是類似大腦思維的一種人工神經(jīng)網(wǎng)絡模型,它是一種競爭學習算法。semiglobal alignment準全局比對指出現(xiàn)在序列頭尾的空位不影響比對得分的序列比對。sequence序列( 1 ) DNA 或 RNA 分子核苷酸的線性排列或者蛋白質(zhì)中氨基

37、酸的排列;( 2 )對分子中的核苷酸或者氨基酸的線性排列進行定序的操作。sequencing測序測定生物分子序列的過程稱為測序。serial analysis of gene expression (SAGE)基因表達的系列分析 (SAGE)用來評估基因表達水平的實驗方法。side chain側鏈附著在氨基酸中心碳原子的短鏈或者原子基團。silencer沉默子通過沉默子可以抑制基因的表達,或對基因進行有選擇性的表達。SINESINE短散布(核)元件。SNPs ( Single nucleotide polymorphisms )SNPs ( 單核苷酸多態(tài)性 )SNPs 對人類遺傳學研究和醫(yī)學應

38、用具有重要的意義,如 人類種群遺傳學的研究,疾病易感性分析,藥物基因組研究,個體化醫(yī)療。SOM(Self organization map)自組織映射神經(jīng)網(wǎng)絡一種無監(jiān)督學習方法,可以完成對物體的聚類。species tree物種樹表示物種之間關系的系統(tǒng)發(fā)生樹。spliceosomes剪接體真核生物中負責剪接的酶復合體。splicing剪接指剪掉真核 hnRNA 內(nèi)部序列(內(nèi)含子)再將與之相鄰的外顯子連接起來的過程。start codon起始密碼子引導 原核和真核生物核糖體開始翻譯 mRNA 的三聯(lián)密碼子(特別是 AUG )。stem莖干一個 RNA 分子內(nèi)部堿基配對的區(qū)域。stop codon

39、終止密碼子不再使核糖體插入氨基酸而使 mRNA 翻譯終止的密碼子(特別是 UGA, UAG 和 UAA ) 。structural protein結構蛋白通常指可以維持細胞或組織形狀的蛋白質(zhì),它們可以為骨骼或連接組織提供支撐的硬骨架。STS ( sequence tagged site )序列標記位點這些位點所對應的序列在基因組中可以作為特定的標記。substitution替換在一定水平上通過選擇過濾的突變。Sum-of-Pairs ( SP )逐對加和( SP )是一種多重序列比對的評價模型。superfamily超家族在一定程度上具有序列相似性,可以反映遠古進化關系的蛋白質(zhì)家族的集合。su

40、per-secondary structure超二級結構若干二級結構可能以特殊的幾何組合出現(xiàn)在蛋白質(zhì)結構中,這些組合起來的結構單元稱為超二級結構。support vector machine , SVM支持向量機是一種從少量樣本中提取分類信息的機器學習方法。synonymous substitution同義替換指在編碼序列水平上不影響蛋白質(zhì)氨基酸序列發(fā)生改變的核苷酸替換。Systems biology系統(tǒng)生物學在系統(tǒng)水平研究生物學過程和網(wǎng)絡 , 例如遺傳和代謝路徑。TT ( Thymine )T ( 胸腺嘧啶 )在 DNA 分子中作為堿基的一種嘧啶。target identification靶

41、標識別一個特定的病原體尋找賴以生存和繁衍的生物分子的過程。terminal node外部(葉)節(jié)點指 系統(tǒng)發(fā)生樹中在分支的末端代表分類單元的節(jié)點。tertiary structure三級結構折疊多肽鏈的整體三維形狀。topology拓撲結構一個分子的拓撲特征 , 即它的構型。transcription轉錄基因表達的第一步,即基因的 RNA 拷貝。transcriptome轉錄組生物體 RNA 序列的全部集合。Transformed distance method距離變換法一種基于距離的系統(tǒng)發(fā)生學重建的方法,它可以考慮不同譜系中的不同進化率transition轉換一種嘌呤( A 或 G )代替另

42、一種嘌呤,或者一種嘧啶( C 或 T )代替另一種嘧啶。translation翻譯將 RNA 核苷酸序列中的信息轉化為蛋白質(zhì) 氨基酸序列的過程。transversion顛換用嘌呤( G 或 A )代替嘧啶( C 或 T )的突變,反之亦然。triplet code三聯(lián)密碼在核糖體進行翻譯的過程中用來產(chǎn)生一個氨基酸的 三核苷酸組 。twofold degenerate site雙重簡并位點密碼子位置,在這一點上,兩種不同的核苷酸翻譯成同一種氨基酸,但是如果替換成另外兩個核苷酸,則會導致翻譯成不同的氨基酸。Uuninformative非信息(位點)在簡約性分析中,序列比對中的一個位點所對應的樹在這

43、個點上引起的突變數(shù)目都相同,則稱此位點是無信息的,與此對應的是“ 信息(位點)”。unrooted tree無根樹一類指定了節(jié)點之間的相互關系,但沒有指明進化發(fā)生方向的系統(tǒng)發(fā)生樹。unscaled tree非標度樹一類指明了葉結點的相對的親緣關系,但是沒有表達分離他們的相對變化次數(shù)的系統(tǒng)發(fā)生樹。unweighted-pair-group method with arithmetic mean(UPGMA)非加權分組平均法( UPGMA)系統(tǒng)發(fā)生樹重建中的一種方法,它采用連續(xù)聚類算法逐步建立樹。upstream promoter element上游啟動子元件與蛋白質(zhì)而不是 RNA 聚合酶相結合的

44、真核基因啟動子相關的核苷酸序列。VVector Alignment Search Tool(VAST)向量比對搜索工具(VAST)一種結構比較搜索工具。Wword單詞在序列搜索中,一段固定長度的序列稱為一個單詞。一些數(shù)據(jù)庫搜索算法將一段查詢序列分成幾段固定長度的單詞,然后根據(jù)這些單詞在序列數(shù)據(jù)庫中進行搜索。專業(yè): 請 輸 入 專 業(yè) 班級: 請 輸 入 班 級 學生姓名: 請 輸 入 姓 名 指導教師:完成時間: Time yyyy年M月d日2012年10月25日 請輸入論文標題 淺析中小企業(yè)融資困難問題姓名: 班級:摘要:中小企業(yè)是我國國民經(jīng)濟的重要組成部分,發(fā)展中小企業(yè)對于完善我國市場經(jīng)濟

45、體制,實現(xiàn)整個社會的現(xiàn)代化,為國有大中型企業(yè)改革創(chuàng)造良好的外部環(huán)境,發(fā)揮著不可替代的作用。目前,中小企業(yè)已成為我國社會經(jīng)濟體系的重要組成部分,是培育新的經(jīng)濟增長點、吸納眾多勞動力就業(yè)的主要載體。已成為拉動國民經(jīng)濟的新的增長點,是推動我國經(jīng)濟景氣上行的主要動力之一。但就其整體發(fā)展狀況而言,中小企業(yè)又是社會經(jīng)濟中的弱勢群體,在其日益發(fā)展壯大過程中,受許多因素制約,使其面臨著許多困難,受制于我國當前獨特的體制、機制和政策等,中小企業(yè)發(fā)展面臨著許多企業(yè)自身難以克服的經(jīng)濟、制度以及法律等方面的矛盾和問題。其中,其中尤為突出的是融資難的問題,資金緊張、融資問題更是首當其沖,成為人們高度關注的一個問題。關鍵

46、字:中小企業(yè) 金融 融資困難 信用擔保一、中小企業(yè)融資特點: 中小企業(yè)由于資產(chǎn)規(guī)模小、財務信息不透明、經(jīng)營上的不確定性大、承受外部經(jīng)濟沖擊的能力弱等制約因素,加上自身經(jīng)濟靈活性的要求,其融資與大企業(yè)相比存在很大特殊性。中小企業(yè)特別是小企業(yè)在融資渠道的選擇上,比大企業(yè)更多的依賴內(nèi)源融資。在融資方式的選擇上,中小企業(yè)更加依賴債務融資,在債務融資中又主要依賴來自銀行等金融中介機構的貸款。中小企業(yè)的債務融資表現(xiàn)出規(guī)模小、頻率高和更加依賴流動性強的短期貸款的特征。與大企業(yè)相比,中小企業(yè)更加依賴企業(yè)之間的商業(yè)信用、設備租賃等來自非金融機構的融資渠道以及民間的各種非正規(guī)融資渠道。 二、我國中小企業(yè)的融資渠道

47、現(xiàn)狀(一)融資需求旺盛 目前,我國工業(yè)總值的60、利稅的40、就業(yè)機會的75、出口的60,都是由占我國企業(yè)總數(shù)90的中小企業(yè)創(chuàng)造的。這些中小企業(yè)目前正面臨激烈的競爭,如果不謀求發(fā)展,提高質(zhì)量,改善服務,企業(yè)就很有可能在激烈的市場競爭中被淘汰。所以,這些企業(yè)要發(fā)展,必然會有巨大的融資需求。在我國,融資需求旺盛的中小企業(yè)有兩種類型:第一,勞動密集型的中小企業(yè)是最具有活力的企業(yè)組織形態(tài),這類企業(yè)數(shù)量眾多,它們以低成本、低風險、快速地進行技術模仿和引進為特征,產(chǎn)品由于市場穩(wěn)定、技術成熟,其技術和市場風險很小,主要的風險是企業(yè)經(jīng)營風險;第二,知識、智力密集的創(chuàng)新型中小企業(yè),它們數(shù)量相對較小,除了經(jīng)營風險

48、之外,由于投資回收期較長等因素,這類企業(yè)的技術、市場風險也相對較高,其融資需求十分迫切。 (二)融資中的信息不對稱張維迎教授在“首屆投資銀行與中國民營經(jīng)濟發(fā)展高級研討會”上指出,我國中小企業(yè)融資的信息不對稱主要有以下三個方面:一是中小企業(yè)“投資項目預期和實際有關的成本收益狀況”銀行無法得到可靠的信息。中小企業(yè)作為借款者,當然要對即將上馬的項目進行規(guī)劃、評估、論證和測算。因此,項目的潛在回報中小企業(yè)大致知道而投資者并不知道;二是中小企業(yè)“融資后的選擇行為信息不對稱”。借錢后賺了錢是自己的,虧了本是別人的,這時中小企業(yè)更容易傾向于投資風險大的項目。三是中小企業(yè)的“實際盈利能力不對稱”。正是由于以上

49、三個方面的信息不對稱才限制了中小企業(yè)在資本市場上的融資活動,企業(yè)融資問題就等價于企業(yè)與投資者之間存在的信息不對稱問題。 (三)融資體系中的信用構建缺失由于我國中小企業(yè)融資體系中的信用構建缺失和企業(yè)發(fā)展的外部競爭環(huán)境惡化,使得初步建立起來的信用擔保、創(chuàng)業(yè)投資體系和中小企業(yè)板在近幾年的運行效果與當初的設計初衷存在相當背離。據(jù)不完全統(tǒng)計,截止2010年底,擔保公司運營的實踐表明,公司貸款擔保的的風險一般在第三年以后開始出現(xiàn)。我國中小企業(yè)信用擔保體系從2000年開始建立,大部分公司的歷史在3-4年,目前已經(jīng)到了風險的高發(fā)期,根據(jù)我們對一些擔保公司的調(diào)查,許多擔保公司的代償率在第三年超過15%,由于經(jīng)營

50、和財務上的困難,擔保公司不得不涉足多種業(yè)務,如進入股市投資,或更多集中在非中小企業(yè)融資領域,部分擔保公司的擔?;鸨淮蠊蓶|移用等等。中小企業(yè)信用擔保公司運營方向與設計初衷出現(xiàn)了較大的偏離。(四)外部融資都是在尋求非正式債權和非正式股票市場融資 從實際運營看,我國中小企業(yè)融資體系建立的時間較短,要有效地實現(xiàn)對中小企業(yè)的融資支持還需要相當長的一段時間。因此,我們有必要對參照西方中小企業(yè)融資體系搭建的中國中小企業(yè)融資平臺建立和初步運營3-5年后的實際效果,并對我國中小企業(yè)融資體系和融資政策進行再思考,為解決我國中小企業(yè)融資問題找到更加有效和現(xiàn)實的途徑。國人應當清醒地認識到,由于目前我國的許多中小企業(yè)

51、是通過所謂的”國退民進”轉改制,即通過“官造民營企業(yè)家”運動演變而來的,這幫“官造的民營企業(yè)家”既無真本事又無信譽,所以,造成社會大眾對這類企業(yè)不信任是十分正常的現(xiàn)象。此外,我國現(xiàn)有情況是,大部分私營中小企業(yè)外部融資都是在尋求非正式債權和非正式股票市場融資。事實表明中國現(xiàn)有的非正式市場融資程序相對便捷,民間借貸利率大致相當于銀行利率加上中間費用,民間的股權市場效率也很高,成本比上市低得多。此外,民間市場有自己的信譽制度、自己的中間業(yè)務,甚至還有自己的處罰制度安排。因此,多層次資本市場建立的一個前提條件就是上市成本和交易成本一定要低于民間市場。三、我國中小企業(yè)融資困難的原因分析(一)中小企業(yè)自身

52、原因 1.中小企業(yè)運作不規(guī)范,經(jīng)營風險較大 我國中小企業(yè)多屬民營或私營企業(yè),其經(jīng)營權和所有權一般都集中在企業(yè)主手里,經(jīng)營運作缺乏長期發(fā)展戰(zhàn)略,企業(yè)壽命不長。這樣企業(yè)就具有較大的經(jīng)營風險,而金融機構出于風險考慮,也不愿對其輕易放貸。2.財務制度不健全,信用度低 許多中小企業(yè)的財務管理制度不健全,加上其管理層缺乏必要的財務管理素養(yǎng),導致企業(yè)財務管理水平不規(guī)范,提供的財務信息不準確,缺乏外部認可的財務報表。這種不規(guī)范由此產(chǎn)生的信息不透明和信息失真,使金融機構對企業(yè)的風險承受能力無法真實辨認,對貸款的監(jiān)督也無法順利進行,從而嚴重影響金融機構的信貸決策抑制了金融機構的放貸積極性。 (二)社會金融環(huán)境因素

53、 1.缺乏專門為中小企業(yè)服務的金融機構和政策 目前我國金融體制中處于主導地位的仍是國有金融機構,其主要服務對象是國有大中型企業(yè),而專門為中小企業(yè)服務的中小金融機構極為匱乏。同時,制度化的扶持中小企業(yè)發(fā)展的金融政策體系尚未真正建立起來,政府在制定金融政策時出于提高資源配置效率和資金趨利性方面考慮,會把有限的資金投入到效益好、安全性高的企業(yè),在資金和政策方面對中小企業(yè)支持力度不足。 2.直接融資門檻高,多層次的資本市場尚未形成 我國資本市場雖已初具規(guī)模,但發(fā)展還不成熟,資本市場進入壁壘較高,國家對股票和債券發(fā)行的許多硬性規(guī)定使中小企業(yè)很難通過資本市場實現(xiàn)融資目的,專門為中小型企業(yè)服務的中小企業(yè)板還

54、不完善。另外,多層次的資本市場尚未形成,使得資本市場幾乎只有交易所一個層次,無法發(fā)揮市場資源配置的功能。 3.金融機構和中小企業(yè)之間信息不對稱 信息不對稱導致的后果主要表現(xiàn)為“逆向選擇”與“道德風險”,即中小企業(yè)獲得信貸資金后,可能會改變原來的承諾,從事偏離銀行利益的活動,使投資者面臨的風險和不確定性增大,投資者就會謹慎考慮其投資項目。在給中小企業(yè)放貸前, 金融機構會非常謹慎地對待其融資要求,采取種種限制和防范措施,盡可能降低逆向選擇風險,此外還要加大監(jiān)管力度防范道德風險。潛在的“逆向選擇”與“道德風險”會使金融機構產(chǎn)生“惜貸”或“懼貸”心理。 4.中小企業(yè)獲得擔保和抵押貸款比較困難 金融機構

55、在為中小企業(yè)提供貸款時普遍采用抵押和擔保等方式,而中小企業(yè)普遍資金匱乏、資產(chǎn)流動性較差,加上資信和管理水平較低,使其擔保條件達不到金融機構的標準,很難保證金融機構的信貸資金安全,所以很少有擔保機構愿為其提供擔保。 (三)從金融業(yè)的特殊性來看 1.金融業(yè)實行的謹慎原則,不利于風險性較高的中小企業(yè)的融資。 金融業(yè)是特殊產(chǎn)業(yè),經(jīng)營的是資金這樣一種特殊的產(chǎn)品。由于資金或貨幣在經(jīng)濟生活中的重要性、涉及面的廣泛性以及其對國民經(jīng)濟影響的全局性,各國都對金融業(yè)制定了較為嚴格的經(jīng)營規(guī)則,保證其安全性、有效性及流動性,以有效避免金融危機給整個國民經(jīng)濟及社會帶來的不利后果。事實上,這也是廣大從事金融服務業(yè)的人員和機

56、構自身的要求。謹慎原則對國民經(jīng)濟的健康發(fā)展非常重要,但在客觀上也給風險性較高的中小企業(yè)的融資帶來極為不利的影響,往往會使一些非常有前途的中小企業(yè)喪失極好的發(fā)展機會。 2.金融企業(yè)融資手續(xù)繁瑣,耗時耗精力,影響了中小企業(yè)的融資積極性。 如前所述,中小企業(yè)融資量少、頻率高,需要簡單快捷的服務。然而,金融部門為安全起見,必須有一套完整的融資手續(xù),這就難以滿足中小企業(yè)融資簡單快捷的要求。繁瑣耗時耗力的融資手續(xù),無數(shù)有意融資的中小企業(yè)望而卻步。 3.金融企業(yè)“嫌貧愛富”,喜歡“批發(fā)”,不喜歡“零售”,使中小企業(yè)融資處于不利地位。大企業(yè)信譽好、融資量大,深得金融機構的喜歡,往往是信用資金追著貸,而且常常用

57、不完;相反,中小企業(yè)缺乏良好的信譽,融資額度有限,常常捉襟見肘。 四、剖析我國中小企業(yè)融資困難采取的對策和措施(一)從中小企業(yè)自身的角度看,應該不斷完善中小企業(yè)制度,健全治理結構 1建立規(guī)范的現(xiàn)代企業(yè)制度和不斷進行產(chǎn)業(yè)結構調(diào)整 建立規(guī)范的現(xiàn)代企業(yè)制度:沒有規(guī)范的現(xiàn)代企業(yè)制度,中小企業(yè)就很難找到高水平的管理者。而沒有高水平的管理者,企業(yè)的資金籌集渠道也就很難暢通。只有建立規(guī)范的現(xiàn)代企業(yè)制度,中小企業(yè)的產(chǎn)權交易、資產(chǎn)重組等需要新增資金的渠道才能暢通,才能在資本市場是進行融資活動。不斷進行產(chǎn)業(yè)結構調(diào)整:在激烈的市場競爭中,要想得到廣泛的資金支持,中小企業(yè)必須不斷地優(yōu)化自己的產(chǎn)業(yè)結構,增強自己的市場競

58、爭力。國家在資金支持方面的重點,是那些產(chǎn)品科技含量高,市場潛力大的中小企業(yè)。中小企業(yè)應當注意產(chǎn)業(yè)升級和轉化問題,找準自己的位置,注意專業(yè)化分工,必要是可以向中西部地區(qū)、向不發(fā)達地區(qū)、向國外轉移。2提高企業(yè)經(jīng)營管理水平,樹立良好形象,強化信用觀念 首先,中小企業(yè)必須樹立自身良好形象,規(guī)范自身的金融行為,同時及時將企業(yè)的生產(chǎn)、經(jīng)營、財務狀況信息反饋給銀行,實現(xiàn)信息的暢通,建立一種相互信賴的合作關系。強化信用觀念,構筑互利合作的銀企關系中小企業(yè)必須強化信用意識,保全銀行債權,盡量按時還本付息,有困難時與銀行協(xié)商解決,建立良好的銀企關系,為企業(yè)融資創(chuàng)造條件。其次,規(guī)范公司治理結構,健全企業(yè)財務管理制度

59、,這一點尤為重要。公司治理結構在一定程度上影響企業(yè)的融資能力,中小企業(yè)需進一步規(guī)范公司治理結構。另外還要健全企業(yè)財務管理制度,特別是資金管理。健全的企業(yè)財務管理制度不僅是提高企業(yè)融資能力的重要前提,也是加強企業(yè)管理的核心。 中小企業(yè)要贏得銀行的信任和支持,就必須提供準確、真實、有效的會計報表,如實反映企業(yè)的經(jīng)營狀況,確保自身的各項經(jīng)濟活動和財務收支的真實性和合法性。再次,加大技術投入,提高管理水平,規(guī)范公司結構?,F(xiàn)在商業(yè)銀行紛紛將扶持高科技中小企業(yè)作為工作的重點,要想獲得貸款支持,就必須進行技術改造,增加產(chǎn)品的技術含量。3.充分挖掘內(nèi)部融資潛力 中小企業(yè)要想徹底擺脫融資困境,單靠利用外部資源是

60、不夠的,還必須挖掘內(nèi)部潛力。由于外部融資成本比較高,企業(yè)可以通過內(nèi)部資金即留存收益進行融資,也可以通過內(nèi)部人員集資,以達到融資目的。 (二)銀行以及各金融機構應從各個方面采取有利于中小企業(yè)融資的措施1.完善企業(yè)資信評級制度。企業(yè)資信評級是資信評級機構對企業(yè)的資金實力、償債能力、履約意愿等各方面狀況做出評定和預測,從而確定企業(yè)資信等級的過程??陀^、公正的資信評級結果可以為商業(yè)銀行貸款決策提供可靠依據(jù),減少信貸市場中的信息不對稱現(xiàn)象。2.金融機構建立數(shù)據(jù)庫,采用信息識別技術。金融機構需要建立自己的數(shù)據(jù)庫,采用信息識別技術,完善信用記錄以供同行查詢,這樣可以使同行在選擇貸款客戶時更加果斷,更加充滿信

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