高通量基因測序系統(tǒng)及配套試劑需求一覽表及技術(shù)規(guī)格

1、高通量基因測序系統(tǒng)及配套試劑需求一覽表及技術(shù)規(guī)格、功能要求序號貨物名稱數(shù)量主要技術(shù)規(guī)格交貨期目的地1基因測序儀1臺一臺儀器可以實現(xiàn)目標 片段測序，人類全轉(zhuǎn)錄組 測序，人類全外顯子組測 序，未知基因組序列的全 新測序，已知基因組序列 的再測序，mRNA測序分 析，染色質(zhì)免疫共沉淀 （ChIP-seq）研究，轉(zhuǎn)錄 組測序，表達譜分析，擴 增子測序，拷貝數(shù)分析， 甲基化，雙端配對測序等 應(yīng)用和研究目標。合同簽定后 三個月內(nèi)浙江二、機器設(shè)備性能序號招標規(guī)格投標響應(yīng)1技術(shù)參數(shù)1.1測序原理：系統(tǒng)采用最先進的半導(dǎo)體芯片測序，直接將化學(xué)信號 轉(zhuǎn)化為電信號，實時檢測測序時產(chǎn)生的氫離子濃度;無激發(fā)光源， 無需熒

2、光標記，無需照相系統(tǒng)。1.2N5種通量的測序芯片靈活可選，可產(chǎn)出0.3-1 Gb數(shù)據(jù)、可產(chǎn)出2 Gb數(shù)據(jù)、可產(chǎn)出7.2 Gb數(shù)據(jù)、可產(chǎn)出15 Gb數(shù)據(jù)、可產(chǎn)出25 Gb數(shù) 據(jù)，并有進一步擴展的空間，適合不同通量需求的應(yīng)用1.2.1高通量測序Read s通量大于120M,同時可以擴展到其他方向的應(yīng) 用。1.2.2具有最小通量在2 Mb左右read s的芯片，能夠?qū)崿F(xiàn)最少1-2個病例 樣本的上機分析。1.3讀長:單端測序長度N600 bp，并有繼續(xù)延伸讀長的空間1.4測序周期（測序運行及分析時間）:可在5.5小時內(nèi)完成單端讀長600 bp的測序及分析任務(wù);可在3小時內(nèi)完成單端讀長200 bp的測序

3、及 分析任務(wù);對于讀長小于200 bp的測序及分析任務(wù)，則運行時間需 更短。其中，所有通量芯片均可在2.5小時內(nèi)完成單端讀長200 bp 的測序任務(wù)。1.5擁有單獨分離式的自動化加樣系統(tǒng)以及測序系統(tǒng)?？刹⑿刑幚恚?并且可以分步質(zhì)控，保證高效測序。1.6儀器設(shè)置時間:提供WRFID標簽的即裝即用試劑盒，裝配設(shè)置 時間少于15分鐘。1.7可在1張芯片上完成多樣本和多位點的同時測序。1.8讀取精度:原始數(shù)據(jù)準確性N99.0%。1.9支持384個樣本平行分析。1.10廠家支持腫瘤與疾病的檢測1.10.1廠家有能力提供能夠同時檢測基因單堿基突變、拷貝數(shù)變異以及 融合突變的檢測試劑盒。具有資助專利技術(shù)開發(fā)

4、相關(guān)建庫試劑盒1.10.2廠家提供的試劑盒獲得NMPA批準，能夠進行多個腫瘤基因的檢 測并能在NMPA批準的高通量測序平臺檢測。1.10.3廠家提供的腫瘤相關(guān)基因檢測及研究試劑盒超過5個。1.11配備全自動加樣系統(tǒng)1.11.1平臺兼容性:兼容支持科研型及臨床型測序平臺、兼容支持所有 通量測序芯片的模板制備1.11.2通量兼容性：可以操作配套不同測序平臺芯片，可以制備滿足0.3Gb-25Gb測序通量的微珠1.11.3自動化設(shè)計:平臺采取自動化設(shè)計，能夠自動化完成自動化完成 油包水PCR中的乳化、混合物制備和擴增以及最終芯片上樣的所 有步驟。從核酸樣本輸入到完成測序芯片上樣全過程的手動操作 時間M

5、 30分鐘三、配套試劑序號招標規(guī)格投標響應(yīng)1建庫及檢測試劑盒1.1用途：一個通過DNA片段化、末端修飾、A尾添加、PCR富集等 操作步驟，使基因組樣本達到可上機測序的條件的建庫試劑盒， 建庫試劑盒應(yīng)包含上述操作的大部分試劑組分。1.2主要性能1.2.1能在短時間（ 2h）內(nèi)完成文庫構(gòu)建，無需復(fù)雜操作且易形成標 準化的操作，交叉污染的風(fēng)險低。1.2.2樣本需求量低，DNA最低需求量為20ng，如檢測需求，也可增加 RNA樣本，但需求量不能低于為50ng1.2.3覆蓋目前NCCN指南推薦的大部分基因1.2.4可以檢測多種臨床意義明確的變異，如，突變、插入、缺失 融合1.2.5獲得國家藥品監(jiān)督管理局

6、的認證1.2.6有配套的分析軟件，可以在醫(yī)院端進行安裝并能展示相應(yīng)的分析 檢測結(jié)果1.2.7可以提供科研版報告，包含檢測結(jié)果目前的臨床研究進展及靶藥 匹配信息1.2.8有相應(yīng)的技術(shù)培訓(xùn)團隊可提供后續(xù)服務(wù)2核酸提取試劑2.1用途:用于核酸的提取、富集、純化等步驟。其處理后的產(chǎn)物用 于臨床體外檢測使用。2.2主要性能2.2.1同時提取組織樣本中的DNA和RNA2.2.2獲得國家藥品監(jiān)督管理局的認證3Agencourt AMPure XP Kit3.1用途：純化磁珠，用于文庫純3.2主要性能：滿足200-300bp文庫片段的純化性能四、詳細配置清單序號招標規(guī)格投標響應(yīng)1硬件配置及軟件1.1測序儀主機配置：Intel Motherboard； Intel E5-2680 V4 CPU； 256GB DDR4； NVIDIA P5000 GPU； 4X2 TB SSD； 4X8 TB HDD。1.2預(yù)裝了中文分析軟件，可將儀器測序數(shù)據(jù)進行堿基響應(yīng)比對 (base call alignment)，輸出符合行業(yè)標準的數(shù)據(jù)格式。1.3可提供50多個數(shù)據(jù)分析插件供用戶對數(shù)據(jù)進行后續(xù)分析2其他條款2.1服務(wù)響應(yīng)：廠家直接提供技術(shù)服務(wù)，設(shè)備出現(xiàn)故障時保證24小 時內(nèi)服務(wù)維修響應(yīng)，并于48小時以內(nèi)派技術(shù)人員到達現(xiàn)場維修設(shè) 備。2.2