確定化學(xué)結(jié)構(gòu)微機(jī)檢索系統(tǒng)課件

1、確定化學(xué)結(jié)構(gòu)微機(jī)檢索系統(tǒng)確定化學(xué)結(jié)構(gòu)微機(jī)檢索系統(tǒng)化學(xué)信息和化學(xué)結(jié)構(gòu)檢索重要性：分類：特點(diǎn)：化學(xué)物質(zhì)信息（名稱、分子式、結(jié)構(gòu)）中只有化學(xué)結(jié)構(gòu)與化學(xué)物質(zhì)一一對應(yīng)。根據(jù)結(jié)構(gòu)中是否帶有R基團(tuán)，可以分成確定化學(xué)結(jié)構(gòu)和族性化學(xué)結(jié)構(gòu)兩類。化學(xué)結(jié)構(gòu)是一種圖形信息，不可能象文字信息一樣直接檢索。非文字信息的檢索通常需要索引檢索和匹配兩步完成。化學(xué)信息和化學(xué)結(jié)構(gòu)檢索重要性：化學(xué)物質(zhì)信息（名稱、分子式、結(jié)化學(xué)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)表示環(huán)系識別歧義表示的規(guī)范結(jié)構(gòu)索引結(jié)構(gòu)匹配關(guān)系數(shù)據(jù)庫模型化學(xué)信息和化學(xué)結(jié)構(gòu)檢索化學(xué)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)表示化學(xué)信息和化學(xué)結(jié)構(gòu)檢索化學(xué)結(jié)構(gòu)表述線性代碼表示：Wisswiser Line Notation 用一

2、組文字和符號代表特定的結(jié)構(gòu)片段，以文字串表示化學(xué)結(jié)構(gòu)?？梢栽谄螌哟紊现苯訖z索無法實(shí)現(xiàn)對任意化學(xué)結(jié)構(gòu)的檢索和比較無法在原子級別上對化學(xué)結(jié)構(gòu)信息進(jìn)行加工連接表表示：CAS，MDL Mol，大多數(shù)系統(tǒng)按照圖論描述化學(xué)結(jié)構(gòu)信息可在原子級別上對化學(xué)結(jié)構(gòu)信息進(jìn)行任意加工化學(xué)結(jié)構(gòu)表述線性代碼表示：Wisswiser Line No化學(xué)結(jié)構(gòu)信息的連接表表示連接表的圖論定義S 和S 其中 N：原子B*：鍵和連接B：鍵：連接關(guān)系系統(tǒng)使用GCT連接表，支持MDL Mol連接表化學(xué)結(jié)構(gòu)信息的連接表表示連接表的圖論定義 Node Sentence Bond Group Substance Fragment Link

3、Fragment Structure Namespecifiedfragmentundetermined fragmentatomsuperatomundetermined substituentdelocalizedelectrontautomerrepeatingunitnodal stereo setring systemundetermined groupundetermined bondspecifiedbondspecifiedlinkundetermined linkbondingalternativebondingpointlinkingalternativelinkingpo

4、int2Ddata3Ddatadelocalizedchargebond stereoAxial stereoCmpFormCmpForm Node Sentence Bond Group 環(huán)系和最小環(huán)最小集識別環(huán)系統(tǒng)是化合物的重要結(jié)構(gòu)特征，SSSR與畫法無關(guān)，可以作為結(jié)構(gòu)索引無需事先環(huán)系識別，同時完成環(huán)系和SSSR識別只需搜索一次，快速算法環(huán)系和最小環(huán)最小集識別環(huán)系統(tǒng)是化合物的重要結(jié)構(gòu)特征，SSSR結(jié)構(gòu)表述歧義和互變異構(gòu)處理同一化學(xué)結(jié)構(gòu)存在多個合理表示（互變異構(gòu)、芳香鍵位置），需要進(jìn)行規(guī)范處理：結(jié)構(gòu)表述歧義和互變異構(gòu)處理同一化學(xué)結(jié)構(gòu)存在多個合理表示（互變化學(xué)結(jié)構(gòu)索引方法使用六種結(jié)構(gòu)特征：（充

5、分利用關(guān)系數(shù)據(jù)庫特點(diǎn)）原子特性非H結(jié)點(diǎn)總數(shù)、連接度為3，4，4的結(jié)點(diǎn)數(shù)目、氘?dāng)?shù)目、氚數(shù)目鍵特性雙鍵、三鍵、芳香鍵、互變鍵、電荷數(shù)目環(huán)系統(tǒng)特性環(huán)系統(tǒng)總數(shù)、每個環(huán)系統(tǒng)環(huán)結(jié)點(diǎn)數(shù)目、小環(huán)數(shù)目、最小環(huán)最小集（SSSR）立體化學(xué)特性結(jié)點(diǎn)立體中心數(shù)目、鍵立體中心數(shù)目重復(fù)單元特性重復(fù)單元、重復(fù)組的數(shù)目分子式化學(xué)結(jié)構(gòu)索引方法使用六種結(jié)構(gòu)特征：（充分利用關(guān)系數(shù)據(jù)庫特點(diǎn)）0R0A00000400600030818092560A334700000C25H26O20W0B20000100600030818092560A334700000C29H42N2O0X0D10000300600030818092560A33470

6、0000C30H39NOS0R0A00000400600030818092560A334700000C25H26O20a0A20000200602030818092560A334700000C33H45NO2節(jié)點(diǎn)鍵環(huán)系立體重復(fù)分子式化學(xué)結(jié)構(gòu)索引方法說明0R0A00000400600030818092560A33原子-原子匹配（確認(rèn)結(jié)構(gòu)相同）節(jié)點(diǎn)局部性質(zhì)分類（4）節(jié)點(diǎn)領(lǐng)域性質(zhì)分類（12）原子對原子匹配5111133131115535551111113311原子-原子匹配（確認(rèn)結(jié)構(gòu)相同）節(jié)點(diǎn)局部性質(zhì)分類（4）51數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)檢索實(shí)例（全結(jié)構(gòu)檢索）檢索與提問結(jié)構(gòu)完全一致的化學(xué)結(jié)構(gòu)：檢索實(shí)例（

7、全結(jié)構(gòu)檢索）檢索與提問結(jié)構(gòu)完全一致的化學(xué)結(jié)構(gòu)：檢索實(shí)例（模糊結(jié)構(gòu)檢索）指定提問結(jié)構(gòu)的某些性質(zhì)進(jìn)行結(jié)構(gòu)檢索：檢索實(shí)例（模糊結(jié)構(gòu)檢索）指定提問結(jié)構(gòu)的某些性質(zhì)進(jìn)行結(jié)構(gòu)檢索：檢索實(shí)例（結(jié)構(gòu)參數(shù)檢索）指定目標(biāo)化合物的結(jié)構(gòu)特征參數(shù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)檢索：檢索實(shí)例（結(jié)構(gòu)參數(shù)檢索）指定目標(biāo)化合物的結(jié)構(gòu)特征參數(shù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)相關(guān)應(yīng)用和發(fā)展化學(xué)結(jié)構(gòu)處理技術(shù)是化學(xué)信息技術(shù)的核心確定結(jié)構(gòu)處理系統(tǒng)族性結(jié)構(gòu)處理系統(tǒng)綜合化學(xué)信息系統(tǒng)化學(xué)知識管理系統(tǒng)相關(guān)應(yīng)用和發(fā)展化學(xué)結(jié)構(gòu)處理技術(shù)是化學(xué)信息技術(shù)的核心確定結(jié)構(gòu)族綜合化學(xué)信息系統(tǒng)紅外質(zhì)譜反應(yīng)配方產(chǎn)品中藥詞匯核磁熒光拉曼2D3D特種農(nóng)藥鑒定文獻(xiàn)活性化合物性質(zhì)藥物天然疾病植物綜合化學(xué)信息系統(tǒng)紅外質(zhì)譜反應(yīng)配方產(chǎn)品中藥詞匯核磁熒光拉曼2D取代基擴(kuò)展結(jié)構(gòu)文獻(xiàn)標(biāo)引文獻(xiàn)檢索報(bào)告候選結(jié)構(gòu)號專利結(jié)構(gòu)索引規(guī)范專利結(jié)構(gòu)取代基提問結(jié)構(gòu)索引規(guī)范結(jié)構(gòu)規(guī)范專利結(jié)構(gòu)規(guī)范提問結(jié)構(gòu)取代關(guān)系標(biāo)引結(jié)構(gòu)取代描述標(biāo)引輸入語義分析語法分析文獻(xiàn)加工規(guī)范歧義生成索引檢索匹配輸出取代基表索引表結(jié)構(gòu)文件結(jié)構(gòu)登錄文獻(xiàn)文件原始專利提問結(jié)構(gòu)標(biāo)引專利專利結(jié)構(gòu)索引命中結(jié)構(gòu)號文獻(xiàn)取代基族性化學(xué)結(jié)構(gòu)應(yīng)用系統(tǒng)數(shù)據(jù)流圖取代基擴(kuò)展結(jié)構(gòu)文獻(xiàn)標(biāo)引文獻(xiàn)檢索報(bào)告候選結(jié)構(gòu)號專利結(jié)構(gòu)索引