分子遺傳學(xué)期末整理-研究生課程

浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院分子遺傳學(xué)PAGE7綠龍期末考試資料整理名詞解釋：lossofheterozygoteity(LOH)雜合性丟失：出現(xiàn)于某一特定基因正常的兩個對等位基因不同的基因組變化，常反映為喪失該基因的一個等位基因的部分或全部基因組部分。SNP:單核苷酸多態(tài)性，不同個體基因組DNA同一位置上單個核苷酸的差別，在一個群體中的頻率不低于1%。SNP被認(rèn)為是疾病臨床表現(xiàn)的遺傳基礎(chǔ)，是疾病發(fā)生的本質(zhì)。因此，SNP成為第三代遺傳標(biāo)志，人體許多表型差異、對藥物或疾病的易感性等等都可能與SNP有關(guān)。人類基因組中約每1000個堿基就有一個SNP。anticipation遺傳早現(xiàn)：指一些遺傳?。ㄍǔ轱@性遺傳?。┰谶B續(xù)幾代的遺傳中，發(fā)病年齡提前而且病情嚴(yán)重程度增加。即某種遺傳病的癥狀一代比一代嚴(yán)重，而發(fā)病時間一代早于一代的現(xiàn)象。如HD，常父親遺傳突變等位基因，遺傳早現(xiàn)的現(xiàn)象是增加了CAG的重復(fù)數(shù)，并且提前了發(fā)病年齡；4epigenetics表觀遺傳學(xué)：研究不涉及DNA序列改變的基因表達和調(diào)控的可遺傳變化的學(xué)科，或者說是研究從基因演繹為表型的過程和機制的一門新興的遺傳學(xué)分支。它研究在沒有細胞核DNA序列改變的情況時，基因功能的可逆的、可遺傳的改變。也指生物發(fā)育過程中包含的程序的研究。Heritablechangeinpatternsofgeneexpressionmediatedbymechanismsotherthanalterationsinprimarynucleotidesequencegain-of-function在不太多的情況下，突變也可能因增強了突變蛋白的活性而改變了機體的生化表型，這種現(xiàn)象稱為功能加強突變。導(dǎo)致突變蛋白活性增加的原因有二：（1）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的改變使該蛋白質(zhì)活性增強；（2）調(diào)節(jié)區(qū)域突變，使該蛋白質(zhì)合成的數(shù)量增加，活性也相應(yīng)增強；但活性增強同樣可導(dǎo)致疾病的發(fā)生，主要有兩種形式：（1）基因拷貝數(shù)增加；（2）突變蛋白某種活性增強。loss-of-function功能丟失突變是一種最常見的突變形式。不論是編碼區(qū)域的突變，還是調(diào)節(jié)區(qū)域的突變，多數(shù)發(fā)生了突變的蛋白質(zhì)都失去了正常功能。由于突變蛋白往往穩(wěn)定性差，所以在細胞內(nèi)的含量也相應(yīng)下降。主要有下面兩種方式：（1）基因缺失，基因雜合缺失是使該基因編碼的蛋白質(zhì)減少一半；純合缺失則導(dǎo)致該基因編碼蛋白質(zhì)完全缺失；（2）基因突變。Wholegenomescanning(Genome-widescanning)由于人類基因組多態(tài)性的研究以及SNP分型技術(shù)的發(fā)展，目前全基因組連鎖分析和關(guān)聯(lián)研究亦變得切實可行。根據(jù)研究規(guī)模的大小，可以將疾病遺傳分析分為定位克隆、連鎖不平衡基因定位、全基因組候選基因分析、候選基因關(guān)聯(lián)研究和定位候選基因克隆，其中定位克隆、連鎖不平衡基因定位和全基因組候選基因分析均屬于全基因組掃描。Genomicimprinting基因組印記：又稱為遺傳印記；個個體的同源染色體（或相應(yīng)的一對等位基因）因分別來自父方或母方而表現(xiàn)出功能上的差異，控制某一表型的一對等位基因由于親源不同而差異性表達，而當(dāng)其一發(fā)生變化，機體只表達來自親本一方的等位基因，所形成的表型也有不同。而與其自身性別無關(guān)，或當(dāng)它們其一發(fā)生改變時，所形成的表型也有不同，屬于非孟德爾遺傳學(xué)的表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域。基因組印記是一正常過程，印記的基因只占人類基因組中的少數(shù)，可能不超過5%，但在胎兒的生長和行為發(fā)育中起著至關(guān)重要的作用。基因組印記病主要表現(xiàn)為過度生長、生長遲緩、智力障礙、行為異常。8.Haplotype：位于一條染色體特定區(qū)域的一組SNPs，并傾向于以整體遺傳給后代的單核苷酸多態(tài)的組合，又稱單倍型或單體型。它是一系列存在于一個染色單體上的SNPs，它們在統(tǒng)計學(xué)上相關(guān)；通過這些相關(guān)的SNPs組成的單體型可以明確地確定這一區(qū)域其它多態(tài)性位點。Agroupofallelesincouplingatcloselylinkedloci,usuallyinheritedasaunit.Geneticheterogeneity遺傳異質(zhì)性：不同基因型決定相同表型的現(xiàn)象，即一種性狀可以由多個不同的基因控制。表現(xiàn)型一致的個體或同種疾病臨床表現(xiàn)相同，但可能具有不同的基因型。由于遺傳基礎(chǔ)不同，它們的遺傳方式、發(fā)病年齡、病程進展、病情嚴(yán)重程度、預(yù)后以及復(fù)發(fā)風(fēng)險等都可能不同。Locusheterogeneity(Theproductionofidenticalphenotypesbymutationsattwoormoredifferentloci.）pleiotropy基因的多效性：指一個基因可以決定或影響多個相關(guān)或不相關(guān)的性狀，因此，若突變發(fā)生在多效性基因上時，就可能導(dǎo)致影響幾個或全部的性狀。expressivity表現(xiàn)度：是特定的基因在個體中的表達程度或者說是具有同一基因型的不同個體或同一個體的不同部位，基因所表達的程度可有顯著的差異。penetrance外顯率：是突變的基因或特定基因型在群體中表達相關(guān)性狀個體所占的比例；它是基因表達的另一變異方式。在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)中，疾病相關(guān)突變外顯率是帶有突變基因的個體表現(xiàn)臨床癥狀時的比例。如，某個基因突變對特定常染色體疾病有95%的外顯率，則95%帶有這個突變的個體會發(fā)病，只有5%不會發(fā)病。phenocopy擬表型：由于環(huán)境因素的作用使個體的表型恰好與某一特定基因所產(chǎn)生的表型相同或相似，或一個個體在特定條件下的表現(xiàn)型相同或相似于另外個體由基因決定的表型；換句話說，就是環(huán)境條件產(chǎn)生的擬表型模擬了由基因產(chǎn)生的表型。sex-conditionedinheritance從性遺傳：位于常染色體上的基因，由于性別的差異而顯示出男女分布比例或基因表達程度上的差異。sex-limitedinheritance限性遺傳：指常染色體上的基因，由于基因表達的性別限制，只在一種性別表現(xiàn)，而在另一種性別則完全不能表現(xiàn)。incompletedominance不完全顯性遺傳：也稱為半顯性遺傳，指雜合子的表現(xiàn)度介于顯性純合子和隱性純合子的表現(xiàn)型之間，即在雜合子中顯性基因和隱性基因均得到一定程度的表現(xiàn)。delayeddominance延遲顯性：雜合子在生命的早期，因致病基因并不表達或雖表達但尚不足以引起明顯的臨床表現(xiàn)，只在一定年齡后才表現(xiàn)出疾病，這一顯性形式稱為延遲表達。irregulardominance不規(guī)則顯性遺傳：是指雜合子的顯性基因由于某種原因而不表現(xiàn)出相應(yīng)的性狀，因此在系譜中可以出現(xiàn)隔代遺傳的現(xiàn)象。也就是說在具有某一顯性基因的雜合體中，并不是每個個體都能表現(xiàn)出該顯性基因所控制的性狀。但是帶有顯性基因的某些個體，本身雖然不表現(xiàn)出顯性性狀，但他們卻可以生出具有該性狀的后代。codominance共顯性，是指一對等位基因之間沒有顯性和隱性的區(qū)別，在雜合子時兩種基因的作用都完全表現(xiàn)出來。susceptibility易感性：在多基因遺傳病中，若干作用微小但有累積效應(yīng)的致病基因構(gòu)成了個體患某種病的遺傳因素。這種由遺傳基礎(chǔ)決定一個個體患病的風(fēng)險稱為易感性。也可以理解為在相同環(huán)境下，不同個體患病的風(fēng)險。Aninheritedpredispositiontoadiseasewhichisnotduetoasingle-genecauseandisusuallytheresultofacomplexinteractionoftheeffectsofmultipledifferentgenes,i.e.polygenicinheritance.liability易患性：由遺傳因素和環(huán)境因素等多種因素共同決定一個個體是否易患某種遺傳病的可能性稱為易患性。Aconceptusedindisorderswhicharemultifactoriallydeterminedtotakeintoaccountallpossiblecausativefactors.haploinsufficiency單倍劑量不足：指一個等位基因突變后，另一個等位基因能正常表達，但正常表達的等位基因不能夠產(chǎn)生基因產(chǎn)物（如蛋白質(zhì)）來維持野生型條件，從而導(dǎo)致異常或疾病狀態(tài)；一般是導(dǎo)致一些常染色體顯性遺傳病。linkagedisequilibrium連鎖不平衡：由于兩個位點在同一條染色體上的距離近，從而導(dǎo)致兩個位點上的對應(yīng)特定等位基因經(jīng)常同時出現(xiàn)在同一染色體上，即在某一群體中，不同座位上某兩個等位基因出現(xiàn)在同一條染色體上的頻率高于預(yù)期的隨機頻率的現(xiàn)象，稱連鎖不平衡(linkagedisequilibrium)。藥物基因組學(xué)：研究基因變異所致的不同疾病對藥物的不同反應(yīng)，并在此基礎(chǔ)上研制出新藥或新的用藥方法，這一新概念被稱為藥物基因組學(xué)。Thestudyofthegenomeanditsproducts(includingRNAandprotein)asitrelatestodrugdiscoveryanddevelopment.藥物基因組學(xué)可以說是基因功能學(xué)與分子藥理學(xué)的有機結(jié)合，在很多方面這種結(jié)合是非常必要的。藥物基因組學(xué)區(qū)別于一般意義上的基因?qū)W，它不是以發(fā)現(xiàn)人體基因組基因為主要目的，而是相對簡單地運用已知的基因理論改善病人的治療。也可以這么說，藥物基因組學(xué)以藥物效應(yīng)及安全性為目標(biāo)，研究各種基因突變與藥效及安全性的關(guān)系。Insituhybridization原位雜交：原位雜交是指將特定標(biāo)記的已知順序核酸為探針與細胞或組織切片中核酸進行雜交，從而對特定核酸順序進行精確定量定位的過程。原位雜交可以在細胞標(biāo)本或組織標(biāo)本上進行。如在利用放射性或非放射性標(biāo)記的已知核酸探針雜交后，通過放射自顯影或非放射性檢測體系來檢測染色體上特異DNA或RNA序列，可用放射性顆粒在某條染色體的區(qū)帶出現(xiàn)的最高頻率或熒光的強弱來確定探針的位置，從而進行準(zhǔn)確的基因定位。25.Humangenome:Thesumoftotalhumangenes,consistingofnuclear&mitochondrialgenomes.26.RNAi：即“RNA干擾”。小的雙鏈RNA（siRNA）可以高效、特異地阻斷體內(nèi)特定基因的表達，促使mRNA降解，誘使細胞表現(xiàn)出特定基因缺失的表型。29.OMIM：為“OnlineMendelianInheritanceinMan”的簡稱，意即“在線《人類孟德爾遺傳》”或“網(wǎng)上《人類孟德爾遺傳》”。美國JohnsHopkins大學(xué)醫(yī)學(xué)院VictorAMcKusick教授被尊稱為“醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)之父”，由他主編的《人類孟德爾遺傳》（MendelianInheritanceinMan：CatologsofHumanGenesandGeneticDisorders，簡稱MIM）一書，一直是醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)最權(quán)威的百科全書和數(shù)據(jù)庫。Candidategeneapproach:基于疾病的生理和生化作用的發(fā)展，基因結(jié)構(gòu)或影響性狀的調(diào)節(jié)或生化通路上的基因，在其它物種有相似的功能，即動物模型；強調(diào)基因突變與表現(xiàn)型或疾病的關(guān)聯(lián)，這不同于GWAS，GWAS是全基因組的所有常見突變；侯選基因的方法是基于以前基因生物功能影響性狀或疾病的知識。31.Polymorphism:是指在一個生物群體中，同時或經(jīng)常存在兩種或多種不連續(xù)的變異型或基因型（genotype）或等位基因（allele）。Multiplefunctionalallelesatafrequencyof>1%inapopulation。33.Carriergenetictesting:若疾病需要2個拷貝的基因才能表現(xiàn)性狀，則攜帶一個拷貝基因的個體就是攜帶者，利用實驗篩選攜帶者。34.Nullmutation:deletionofthewholegene35.UniparentalDisomy單親二倍體:thetwoallelescamefromonlyoneparent(paternalormaternal)。36.Mutablenormalallele:Expansionsof27-35CAGrepeatsneverbeenassociatedwithclinicalsymptomsofHD;however,hischildrenareatsomerisktoinheritanallelewithalargerallelesizewhichcouldresultinsymptomaticHD.37.heritability遺傳度：在多基因遺傳病中，易患性的高低受到遺傳因素和環(huán)境因素的雙重影響，其中遺傳因素所起作用的大小稱為遺傳度或遺傳率，一般用百分率表示。38.遺傳病:遺傳病是指由遺傳物質(zhì)發(fā)生改變而引起的或者是由致病基因所控制的疾病。遺傳病是指完全或部分由遺傳因素決定的疾病，常為先天性的，也可后天發(fā)病。如先天愚型、多指（趾）、先天性聾啞、血友病等。39.基因定位：將基因或有價值的DNA片段確定于染色體的某一具體位置，在此基礎(chǔ)上便可繪制出人類基因圖。40.微衛(wèi)星標(biāo)記（microsatellite）：又稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(STRs)，是均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復(fù)序列，由2～6個核苷酸的串聯(lián)重復(fù)片段構(gòu)成，由于重復(fù)單位的重復(fù)次數(shù)在個體間呈高度變異性且數(shù)量豐富，因此微衛(wèi)星標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛。41.LOD值：確定兩個基因座是否在染色體上距離很近，因此可能一起遺傳的統(tǒng)計學(xué)評估，以確定兩個基因座或是按一定的重組率而相互連鎖的可能性或是互不連鎖的可能性；這兩種可能性之比，是基因座實際上為連鎖的可能性。42.癌基因oncogene：，癌基因是一類會引起細胞癌變的基因。其實，癌基因有其正常的生物學(xué)功能，主要是刺激細胞正常的生長，以滿足細胞更新的要求。只是當(dāng)癌基因發(fā)生突變后，才會在沒有接收到生長信號的情況下仍然不斷地促使細胞生長或使細胞免于死亡，最后導(dǎo)致細胞癌變。43.抑癌基因TSG：正常時起抑制細胞增殖和腫瘤發(fā)生的作用，它們的丟失、突變或失去功能，使激活的癌基因發(fā)揮作用而致癌。抑癌基因的產(chǎn)物是抑制細胞增殖，促進細胞分化，和抑制細胞遷移，因此起負調(diào)控作用，通常認(rèn)為抑癌基因的突變是隱性的。44.細胞遺傳學(xué)(cytogenetics)：是從細胞學(xué)的角度,特別是從染色體的結(jié)構(gòu)和功能,以及染色體和其他細胞器的關(guān)系來研究遺傳現(xiàn)象,闡明遺傳和變異的機制。45.移碼突變（frameshift）：在正常的DNA分子中,堿基缺失或增加非3的倍數(shù),造成這位置之后的一系列編碼發(fā)生移位錯誤的改變，這種現(xiàn)象稱移碼突變。46.藥物遺傳學(xué)pharmacogenetics：研究遺傳因素對藥物代謝的影響，特別是遺傳因素引起的異常藥物反應(yīng)。47.寡基因oligogenic：一小部分基因共同作用所決定的性狀。Acharacterthatisdeterminedbyasmallnumberofgenesactingtogether.48.先天性代謝缺陷（inbornerrorsofmetabolism）也稱遺傳性酶?。╤ereditaryenzymopathy），指由于遺傳上的原因（通常是基因突變）而造成的蛋白質(zhì)分子（一般指酶蛋白）結(jié)構(gòu)或數(shù)量的異常所引起的疾病。49.嵌合體chimera：遺傳學(xué)上有2個或多個基因型不同合子衍生出來的不同遺傳性狀嵌合或混雜表現(xiàn)的個體或器官；即一種含有兩種以上基因型組織的機體，可能是基因突變、染色體異常分離或移植的結(jié)果。Anindividualwhoisamixtureofcellsfromtwoormoregeneticallydistinctpopulationsofcellswhichhavebeenderivedfrommorethanonezygote。50.鑲嵌性mosaicism：體內(nèi)有從同一合子衍生出來的兩個或更多的不同基因型或核型的細胞系。Anindividualcomprisedoftwoormoregeneticallydistinctpopulationsofcellsderivedfromasinglezygote受精卵。51.germlinemosaicism種系鑲嵌性：兩個或更多細胞系Twoormoregeneticorcytogeneticcelllinesconfinedtotheprecursor(germline)cellsoftheeggorsperm;formerlycalledgonadalmosaicism.52.微小嵌合現(xiàn)象Microchimerism：體內(nèi)存在少量來自另一個體的細胞。Thepresenceofasmallnumberofcellsderivedfromanotherindividual(transfusion,transplantation,twin,etc.)53.Dominantnegativeeffect(Amutatedgeneencodinganalteredprotein)某些信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白突變后不僅自身無功能，還能抑制或阻斷同一細胞內(nèi)的野生型信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白的作用，這種作用被稱為顯性負效應(yīng)。機理是突變型蛋白和相關(guān)蛋白形成無功能的二聚體，野生型蛋白功能被抑制。54.Malformation(畸形)-isamorphologicdefectofanorgan,partofanorgan,oralargerregionofthebodyfromanabnormaldevelopmentalprocess.55.Disruption(破裂)-isamorphologicdefectofanorgan,partofanorgan,oralargerregionofthebodyresultingfrombreakdownof,oraninterferencewith,anoriginallynormaldevelopmentprocess.56.Deformation(變形)-isanabnormalform,shape,orpositionofapartofthebodycausedbymechanicalforces.57.Dysplasia(發(fā)育異常)-abnormalgrowthofaparticulartissue.58.Epistaticeffect（上位效應(yīng)):影響同一性狀的兩對非等位基因，其中一對基因(顯性或隱性的)抑制(或掩蓋)另一對顯性基因的作用時所表現(xiàn)的遺傳效應(yīng)。即一對基因顯性基因的表現(xiàn)受到另一對非等位基因的作用，這種非等位基因間的抑制或遮掩作用叫上位效應(yīng)。起抑制作用的基因稱為上位基因，被抑制的基因稱為下位基因。（1）顯性上位：一對基因中的顯性基因阻礙了其他對基因的作用。（2）隱性上位：一對隱性基因?qū)α硪粚蚱鹱璧K作用時叫隱性上位。59.TagSNPs：指能夠代表某一基因組區(qū)域的所有SNPs的最小子集，它們在群體內(nèi)相互連鎖。TagSNPs非常有用,因為最小子集的SNPs的等位基因組成的單倍體能夠代表這一區(qū)域內(nèi)所有的單倍型。60.HapMap:Asetofhaplotypes,definedbytagSNPs,distributedthroughoutthegenome,usedforassociationstudies.61.二代測序技術(shù)massivelyparallelsequencing(MPS)technologyORnext-generationsequencingORsecond-generationsequencingORhigh-throughputsequencing62.Translationalmedicine:Anefforttocarryscientificknowledge"frombenchtobedside,"translationalmedicinebuildsonbasicresearchadvances-studiesofbiologicalprocessesusingcellcultures,forexample,oranimalmodels-andusesthemtodevelopnewtherapiesormedicalprocedures.Ⅱ．Answerquestions(60points)(注意任選5題，請勿多選)：1.Whataretheeffectsofdisease-causingmutationsonfunctionofgeneproduct?LossoffunctionGainoffunctionAcquisitionofnovelpropertyAbnormalexpression:heterochronic(wrongtime)orectopic(wrongplace)2.Howtoidentifyandconfirmadisease-causinggene?a)Diseasegenecanbeidentifiedby2majorapproaches:positionalcloningandcandidategeneb)Diseasegenecanbeconfirmedbysegregationanalysis,functionalassayandanimalstudy.3.WhatarethemajortypesofGeneticDefects?Somaticcellgeneticdefects體細胞Multifactorialandpolygenicdefects多因素和多基因=compl