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2核酸的結(jié)構(gòu)與功能_第2頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

第二章

核酸的結(jié)構(gòu)與功能structuresandfunctionsofnucleicacids1內(nèi)容2.1

核酸的種類與分布2.2

核苷酸2.3

dna的分子結(jié)構(gòu)2.6

核酸的理化性質(zhì)2.5rna的分子結(jié)構(gòu)2.4

核酸與蛋白質(zhì)的復(fù)合體22.1核酸(nucleicacid)的種類與分布3核酸:一種生物大分子;是活細(xì)胞中最關(guān)鍵的組分,它攜帶著遺傳信息,是遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ);決定蛋白質(zhì)和酶的結(jié)構(gòu),決定每一種生物體的代謝類型和形態(tài)。核酸的發(fā)現(xiàn):1868年f.

miescher從膿細(xì)胞中提取“核素”,鮭精頭部分離出“dna”;20年后r.altmann分離到不含蛋白質(zhì)的核酸,提出“核酸”這一名詞

;1910年a.kossel及其同事:鑒定核酸中的堿基(諾貝爾獎(jiǎng));1912年levene:鑒定核酸中的糖及闡明核苷酸的化學(xué)鍵,但其“四核苷酸”假說阻礙核酸研究達(dá)30年之久;1944年

avery等人證實(shí)dna是遺傳物質(zhì);1953年

watson和crick發(fā)現(xiàn)dna的雙螺旋結(jié)構(gòu);1966年nirenberg等發(fā)現(xiàn)遺傳密碼。2.1.1

概述42.1.2

核酸的種類脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,dna)核酸核糖核酸(rna,ribonucleicacid)轉(zhuǎn)運(yùn)核糖核酸(trna)10-15%信使核糖核酸(mrna)3~5%核糖體核糖核酸(rrna)75~85%dna:106~109

bp(人3.2×109

bp

)rna:幾十~幾千bp

52.1.3

核酸的分布幾乎所有的生物體(包括細(xì)菌、病毒)內(nèi)都含有核酸。大多數(shù)生物既含有dna又含有rna,在病毒分子中,只含有一種核酸(dna或rna)。真核生物原核生物dna細(xì)胞核98%細(xì)胞質(zhì)少量線粒體少量葉綠體少量類核區(qū)質(zhì)粒病毒dnarna細(xì)胞質(zhì)90%核仁少量細(xì)胞質(zhì)病毒rna62.2

核苷酸(nucleotide)核酸的化學(xué)組成thechemicalcomponentsofnucleicacid72.2.1核酸的基本組成基本元素:c、h、o、n、p(9~10%)基本單位:核苷酸核酸的酸解過程:核酸核苷酸核苷磷酸戊糖堿基82.2.2堿基嘌呤嘧啶堿基腺嘌呤(a)鳥嘌呤(g)胞嘧啶(c)胸腺嘧啶(t)尿嘧啶(u)dna、rna均有dna有(某些rna中有少量存在)rna有9嘌呤腺嘌呤(6-氨基嘌呤)鳥嘌呤(2-氨基-6-氧嘌呤)10嘧啶胸腺嘧啶(5-甲基-2,4-二氧嘧啶)胞嘧啶2-氧-4-氨基嘧啶尿嘧啶2,4-二氧嘧啶11稀有堿基大多甲基化堿基,trna含量豐富(高達(dá)10%)122.2.3戊糖β-d-核糖

β-d-脫氧核糖132.2.4核苷堿基和核糖(或脫氧核糖)通過c-n

糖苷鍵連接形成核苷(或脫氧核苷)。91′11′核糖核苷:ar,gr,cr,ur脫氧核苷:dar,dgr,dcr,dtr142.2.5核苷酸核苷(脫氧核苷)和磷酸以酯鍵連接形成核苷酸(脫氧核苷酸)。1.核苷一磷酸核苷酸:amp,gmp,ump,cmp

脫氧核苷酸:damp,dgmp,dtmp,dcmp

15

2.核苷多磷酸5′-核苷酸的磷酸基團(tuán)可與另一磷酸分子縮合形成核苷二磷酸(ndp),核苷二磷酸還可進(jìn)一步與磷酸縮合形成核苷三磷酸(ntp)。n=a/u/g/c腺嘌呤腺苷同樣,dndp、dntp,n=a/t/g/c16核苷多磷酸的生物學(xué)功能:§ntp和dntp分別是rna和dna的直接前體?!靉tp分子的最顯著特點(diǎn)是含有兩個(gè)高能磷酸鍵。水解時(shí),atp可以釋放出大量自由能,推動(dòng)生物體內(nèi)各種需能的生化反應(yīng)?!靧dp、adp、gdp在多糖合成中,可作為攜帶葡萄糖基的載體;cdp在磷脂合成中可作為攜帶膽堿的載體?!靏tp、ctp、utp在某些生化反應(yīng)中也具有傳遞能量的作用。173.環(huán)核苷酸(camp&cgmp)環(huán)核苷酸是由核苷酸分子中的磷酸與核糖的3’,5’-二羥基形成磷酸二酯鍵環(huán)化而成。18環(huán)核苷酸的生物學(xué)功能:§

camp和cgmp是重要的第二信使,許多激素(第一信使)是通過camp而發(fā)揮其功能的。camp屬于放大激素作用信號(hào),cgmp屬于縮小激素作用信號(hào)。§camp還參與大腸桿菌中dna轉(zhuǎn)錄的調(diào)控。192.3dna的分子結(jié)構(gòu)themolecularstructureofdna20一級(jí)結(jié)構(gòu)是指核酸分子中核苷酸的排列順序及連接方式。排列順序:不同的dna分子具有不同的核苷酸排列順序,因此攜帶不同的遺傳信息。連接方式:以3,5-磷酸二酯鍵連接形成多核苷酸鏈,即核酸。書寫方法:結(jié)構(gòu)式、線條式、文字式。5ˊ端→3ˊ端(由左至右)2.3.1dna的一級(jí)結(jié)構(gòu)21線條式文字式結(jié)構(gòu)式22經(jīng)典方法

maxam-gilbertdna化學(xué)降解法(maxam

和gilbert,1977)

sanger雙脫氧鏈終止法(sanger和coulson,1977)dna的一級(jí)結(jié)構(gòu)測(cè)序23

一個(gè)末端標(biāo)記的dna片段在4組互相獨(dú)立的化學(xué)反應(yīng)分別得到部分降解,其中每一組反應(yīng)特異地針對(duì)某一種或某一類堿基。因此生成4組放射性標(biāo)記的分子,從共同起點(diǎn)(放射性標(biāo)記末端)延續(xù)到發(fā)生化學(xué)降解的位點(diǎn)。每組混合物中均含有長(zhǎng)短不一的dna分子,其長(zhǎng)度取決于該組反應(yīng)所針對(duì)的堿基在原dna全片段上的位置。此后,通過聚丙烯酰胺凝膠電泳和放射自顯影得到測(cè)序圖譜。dna化學(xué)降解法24sanger雙脫氧鏈終止法在pcr時(shí)分別加入dda,ddt,ddc,ddg(相應(yīng)于4種堿基)ddx的兩個(gè)作用:可以當(dāng)作正常堿基參與復(fù)制一旦鏈入dna中,其后就不能再繼續(xù)連接電泳誰(shuí)終止,堿基就是誰(shuí)此方法獲1980年nobel化學(xué)獎(jiǎng)現(xiàn)有的自動(dòng)化測(cè)序儀基本按此原理設(shè)計(jì)25少一個(gè)-oh脫氧核甘酸雙脫氧核甘酸26制備單鏈模板

將單鏈模板與一小段引物退火

加入dna聚合酶(klenow)+4種dntp+引物(分別加入少量4種ddntp)

將4種反應(yīng)產(chǎn)物分別在4條泳道電泳

根據(jù)4個(gè)堿基在4條泳道的終止位置讀出基因序列

技術(shù)路線與要求27雙脫氧鏈末端終止法測(cè)序基本原理2829雙螺旋模型的主要依據(jù)雙螺旋模型的要點(diǎn)雙螺旋模型的穩(wěn)定因素雙螺旋結(jié)構(gòu)的多樣性三鏈dna2.3.2dna的二級(jí)結(jié)構(gòu)30雙螺旋(doublehelix)結(jié)構(gòu)

jameswatsonfranciscrick31dna的二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondarystructure)是指構(gòu)成dna的多聚脫氧核苷酸鏈之間通過鏈間氫鍵卷曲而成的構(gòu)象。1953年,watson-crick提出雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。32

dna的結(jié)構(gòu),發(fā)表于《自然》171卷(1953)737-738頁(yè)上的插圖

33dna雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)的故事jameswatson(生物)francis

crick(物理)mauricewilkins(物理)rosalindfranklin

(化學(xué))linus

pauling(生物化學(xué)):美國(guó)加州理工大學(xué)

劍橋cawendishlab倫敦皇家學(xué)院34dna的雙螺旋結(jié)構(gòu)

右手螺旋35右手性的定義示意圖。大姆指指向軸向,其他四指由掌根向指尖方向表示螺旋轉(zhuǎn)動(dòng)方向。36(一)dna雙螺旋結(jié)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)依據(jù)chargaff規(guī)則:不同物種的dna堿基組成不同,而同一生物的dna組成是一樣的,即有種屬特異性,無(wú)組織特異性;dna堿基組成不隨年齡、營(yíng)養(yǎng)狀況和環(huán)境因素而改變;在同一生物體中[a]=

[t],[g]=

[c],即a+g=t+c.2.norweger、furbug研究證實(shí),戊糖糖環(huán)與dna分子縱軸平行,而堿基平面與縱軸垂直。3.dna的x-線衍射圖譜分析(franklin)。37已知的核酸化學(xué)數(shù)據(jù):糖-磷酸基在外側(cè),堿基在內(nèi)側(cè)。38(二)dna雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(diǎn)

1.兩條鏈反向平行,圍繞同一中心軸構(gòu)成右手雙螺旋(doublehelix),表面有大溝和小溝。2.磷酸-脫氧核糖形成dna的骨架,位于雙螺旋外側(cè)與中軸平行,堿基垂直于螺旋軸而伸入內(nèi)側(cè)。39堿基平面與縱軸垂直,糖環(huán)平面與縱軸平行403.雙螺旋直徑2nm,順軸方向每隔0.34nm有一個(gè)核苷酸,每圈螺旋含10個(gè)核苷酸,相鄰兩個(gè)核苷酸間的夾角為36°,螺距為3.4nm。4.兩條鏈通過堿基間的氫鍵相連,a對(duì)t有兩個(gè)氫鍵,c對(duì)g有三個(gè)氫鍵,這種a-t、c-g配對(duì)的規(guī)律,稱為堿基互補(bǔ)規(guī)則。41堿基互補(bǔ)配對(duì)

tagc堿基對(duì)(basepair,bp

):是一對(duì)相互匹配的堿基(即a:t,g:c,a:u相互作用)被氫鍵連接起來(lái)。它常被用來(lái)衡量dna和rna的長(zhǎng)度(盡管rna是單鏈)。

42配對(duì)堿基的氫鍵43(三)雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定因素1.堿基堆積力2.配對(duì)堿基形成的氫鍵3.離子鍵堿基堆積力是最主要的穩(wěn)定因素。44堿基堆積力(basestackingforces):

嘌呤與嘧啶形狀扁平,成疏水性,分布于雙螺旋結(jié)構(gòu)的內(nèi)側(cè)。大量堿基層層堆積,兩相鄰堿基的平面十分貼近,于是使dna雙螺旋結(jié)構(gòu)內(nèi)部形成一個(gè)強(qiáng)大的疏水區(qū),與介質(zhì)中的水分隔開,在dna分子內(nèi)部形成疏水核心,核心內(nèi)幾乎沒有游離的水分子,免遭水溶性活性小分子的攻擊,保證堿基在化學(xué)上的穩(wěn)定性。

堿基堆積力是維持dna雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要作用力。45互補(bǔ)堿基之間的氫鍵:g-c間有3個(gè)氫鍵,a-t之間僅有2個(gè)氫鍵,故前者較穩(wěn)定。離子鍵:帶負(fù)電荷磷酸之間的靜電斥力——會(huì)造成不穩(wěn)定,但帶負(fù)電荷磷酸可與陽(yáng)離子結(jié)合有助于結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。na+、k+、mg2+、mn2+

是真核細(xì)胞內(nèi)的組蛋白之間形成的離子鍵,中和了負(fù)電荷,降低了dna鏈本身不同部位之間的斥力。46dna雙螺旋結(jié)構(gòu)提出的生物學(xué)意義該模型揭示了dna作為遺傳物質(zhì)的穩(wěn)定性特征,最有價(jià)值的是確認(rèn)了堿基配對(duì)原則,這是dna復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和反轉(zhuǎn)錄的分子基礎(chǔ),亦是遺傳信息傳遞和表達(dá)的分子基礎(chǔ)。該模型的提出是20世紀(jì)生命科學(xué)的重大突破之一,它奠定了生物化學(xué)和分子生物學(xué)乃至整個(gè)生命科學(xué)飛速發(fā)展的基石。47

如果人體有1014個(gè)細(xì)胞,每個(gè)體細(xì)胞的dna量為6.4×109對(duì)核苷酸。試計(jì)算人體dna的總長(zhǎng)度是多少?這個(gè)長(zhǎng)度與太陽(yáng)-地球之間的距離(1.5×108km)相比如何?①每個(gè)體細(xì)胞內(nèi)dna的總長(zhǎng)度:6.4×109×0.34=2.176×109nm②人體dna的總長(zhǎng)度:2.176×109×1014=2.176×1023nm=2.176×1011km③這個(gè)長(zhǎng)度與太陽(yáng)—地球之間的距離之比為2.176×1011/1.5×108≈1451(倍)48(四)dna雙螺旋結(jié)構(gòu)的多樣性49類型螺旋方向存在條件螺距堿基數(shù)/螺旋堿基傾角a-dna右手相對(duì)濕度75%2.53nm1119°b-dna右手相對(duì)濕度92%3.54nm10.41°z-dna左手嘌呤-嘧啶二核苷酸為重復(fù)單位如d(cgcgcg)4.56nm12-9°雙螺旋dna的類型及相關(guān)參數(shù)50dna的三股螺旋51

多聚嘧啶和多聚嘌呤組成的dna螺旋區(qū)段,其序列中有較長(zhǎng)的鏡像重復(fù)時(shí),形成局部三股配對(duì),并互相盤繞的三股螺旋,其中兩股的堿基按watson-crick方式配對(duì),第三股多聚嘧啶(鏡像重復(fù))通過tat和cgc配對(duì),而處于雙螺旋的大溝中。dna三股螺旋52dna三螺旋的堿基配對(duì)53回文結(jié)構(gòu)—雙鏈dna中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都是一樣的。

短的回文結(jié)構(gòu)可能是一種特別的信號(hào),如限制性內(nèi)切酶的識(shí)別位點(diǎn)。較長(zhǎng)的回文結(jié)構(gòu)能形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。5’3’3’5’dna的其它螺旋結(jié)構(gòu)54aattcaagggagaagtatagaagagggaaggatcttaagttccctcttcatatcttctcccttcctag鏡像重復(fù)—存在于同一股上的某些dna區(qū)段的反向重復(fù)序列。此序列各單股中沒有互補(bǔ)序列,不能形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。552.3.3dna的三級(jí)結(jié)構(gòu)dna的超螺旋結(jié)構(gòu)超螺旋結(jié)構(gòu)(superhelix

或supercoil)dna雙螺旋鏈再盤繞即形成超螺旋結(jié)構(gòu)

正超螺旋(positivesupercoil)盤繞方向與dna雙螺旋方同相同

負(fù)超螺旋(negativesupercoil)盤繞方向與dna雙螺旋方向相反

56意義:dna超螺旋結(jié)構(gòu)整體或局部的拓?fù)鋵W(xué)變化及其調(diào)控對(duì)于dna復(fù)制和rna轉(zhuǎn)錄過程具有關(guān)鍵作用。

572.4核酸與蛋白質(zhì)的復(fù)合體染色體(chromosome)病毒(virus)58染色體泛指病毒、細(xì)菌、真核細(xì)胞遺傳信息庫(kù)中的核酸分子。真核生物染色體由dna和蛋白質(zhì)構(gòu)成,其基本單位是核小體(nucleosome)。2.4.1染色體核小體的組成dna:

約200bp

組蛋白:h1h2a,h2bh3h4組蛋白核心八聚體×2=59真核核小體的結(jié)構(gòu)60串珠狀核小體結(jié)構(gòu)616263真核生物染色體dna組裝不同層次的結(jié)構(gòu)dna

(2nm)核小體鏈(11nm,每個(gè)核小體200bp)纖絲(30nm,每圈6個(gè)核小體)突環(huán)(150nm,每個(gè)突環(huán)大約75000bp)玫瑰花結(jié)(300nm,6個(gè)突環(huán))螺旋圈(700nm,每圈30個(gè)玫瑰花結(jié))染色體(1400nm,每個(gè)染色體含10個(gè)螺旋圈)64dna的生物學(xué)功能dna的基本功能是以基因的形式荷載遺傳信息,并作為基因復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的模板。它是生命遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),也是個(gè)體生命活動(dòng)的信息基礎(chǔ)。65s:感病r:抗病66dna分子中不同排列順序的dna區(qū)段構(gòu)成特定的功能單位,即基因(gene)。細(xì)胞內(nèi)遺傳信息的攜帶者---染色體所包含的dna總體稱為基因組(genome)。人類基因組含3.2×109bpdna,理論上可編碼200萬(wàn)以上的基因,但是資料表明編碼蛋白質(zhì)的這部分序列只占基因組的3%到5%,也就是說,人類基因組中多達(dá)95%到97%是非編碼區(qū)。

67病毒是由核酸和蛋白質(zhì)組成的非細(xì)胞生物,是裸露的染色體。從結(jié)構(gòu)上看,核酸在內(nèi),蛋白質(zhì)在外,包裹著核酸,這層蛋白叫做衣殼(capsid)。病毒通常只含有一種核酸,只含dna的叫dna病毒;只含rna的叫rna病毒;目前尚未發(fā)現(xiàn)既含有dna又含有rna的病毒。2.4.2病毒68病毒顆粒結(jié)構(gòu)示意圖69噬菌體t2結(jié)構(gòu)頭部頸圈尾部基板尾絲尖釘dna70hivvirus截面圖712.5

rna的分子結(jié)構(gòu)rna的特點(diǎn)rna的結(jié)構(gòu)

rna的主要類型與功能722.5.1rna的特點(diǎn)rna是單鏈分子,因此在rna分子中,嘌呤的總數(shù)不一定等于嘧啶的總數(shù)。rna分子中,部分區(qū)域也能形成雙螺旋結(jié)構(gòu),不能形成雙螺旋的部分,則形成單鏈突環(huán)。這種結(jié)構(gòu)稱為“發(fā)夾型”結(jié)構(gòu)。不同類型的rna,其二級(jí)結(jié)構(gòu)有明顯的差異。trna中除了常見的堿基外,還存在一些稀有堿基,這類堿基大部分位于突環(huán)部分。73

rna的一級(jí)結(jié)構(gòu):是由數(shù)量極其龐大的四種核糖核酸(amp、gmp、cmp、ump)按一定順序,通過3′,5′-磷酸二酯鍵連成的線形分子,其表示方法與dna相同。

rna的二級(jí)結(jié)構(gòu):是不完全螺旋的多核苷酸鏈。

rna的三級(jí)結(jié)構(gòu):是在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步扭曲折疊而成的復(fù)雜結(jié)構(gòu)。2.5.2

rna的結(jié)構(gòu)74rna的一級(jí)結(jié)構(gòu)75rna的二級(jí)結(jié)構(gòu)76rna的三級(jí)結(jié)構(gòu)772.5.3rna的主要類型與功能781.trna的一級(jí)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)

含稀有堿基較多

3′末端為—cca-oh5′末端大多數(shù)為g,也有的為c

由70~90個(gè)核苷酸組成(一)轉(zhuǎn)運(yùn)rna的結(jié)構(gòu)與功能792.trna的二級(jí)結(jié)構(gòu)

——三葉草形氨基酸臂額外環(huán)

在結(jié)構(gòu)上具有某些共同之處,一般可將其分為四臂四環(huán):包括氨基酸接受臂、反密碼(環(huán))臂、二氫尿嘧啶(環(huán))臂、tc(環(huán))臂和可變環(huán)。80(1)氨基酸接受區(qū)

包含有trna的3’-末端和5’-末端,3’-末端的最后3個(gè)核苷酸殘基都是cca,a為腺苷酸。氨基酸可與其成酯,該區(qū)在蛋白質(zhì)合成中起攜帶氨基酸的作用。

81

(2)

反密碼區(qū)

與氨基酸接受區(qū)相對(duì),一般環(huán)中含有7個(gè)核苷酸殘基,臂中含有5對(duì)堿基。其中環(huán)中正中的3個(gè)核苷酸殘基稱為反密碼子。82(3)

二氫尿嘧啶區(qū)

該區(qū)含有二氫尿嘧啶,環(huán)由8-12個(gè)核苷酸組成,臂由3-4對(duì)堿基組成。

83

(4)tc區(qū)

因含tc順序而得名,環(huán)由7個(gè)核苷酸組成,通過5對(duì)堿基組成的雙螺旋區(qū)(tc臂)與trna的其余部分相連。除個(gè)別例外,幾乎所有trna在此環(huán)中都含有tc。84

(5)可變區(qū)

位于反密碼區(qū)與tc區(qū)之間,不同的trna該區(qū)變化較大,一般有3-18個(gè)核苷酸組成。853.trna的三級(jí)結(jié)構(gòu)——

倒l形*

trna的功能:活化、搬運(yùn)氨基酸到核糖體,參與蛋白質(zhì)的翻譯。tc環(huán)dhu環(huán)*trna的生物學(xué)功能與其三級(jí)結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。86(二)核糖體rna的結(jié)構(gòu)與功能*

rrna的功能:占細(xì)胞總rna的75~85%,參與組成核蛋白體,作為蛋白質(zhì)生物合成的場(chǎng)所。87rrna的二級(jí)結(jié)構(gòu)—大腸桿菌5srrna的結(jié)構(gòu)

類似于三葉草型88rrna與蛋白質(zhì)組成核糖體原核生物(以大腸桿菌為例)真核生物(以小鼠肝為例)小亞基30s40srrna16s1542個(gè)核苷酸18s1874個(gè)核苷酸蛋白質(zhì)21種占總重量的40%33種占總重量的50%大亞基50s60srrna23s5s2940個(gè)核苷酸120個(gè)核苷酸28s5.8s5s4718個(gè)核苷酸160個(gè)核苷酸120個(gè)核苷酸蛋白質(zhì)36種占總重量的30%49種占總重量的35%89(三)信使rna的結(jié)構(gòu)與功能原核生物mrna的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):sd序列:原核生物mrna的5’端總有一段富含嘌呤堿基的序列,典型的是5’-aggaggu-3’,稱為shine-dalgarno序列(sd序列)。該序列與mrna對(duì)核糖體的識(shí)別有關(guān),有助于蛋白質(zhì)合成時(shí)的正確起始。mrna功能:作為蛋白質(zhì)合成的模板。90真核生物mrna的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):1.大多數(shù)真核mrna的5′末端均在轉(zhuǎn)錄后加上一個(gè)7-甲基鳥苷,同時(shí)第一個(gè)核苷酸的c2也常被甲基化,形成“帽子結(jié)構(gòu)”:m7gpppnm-。2.大多數(shù)真核mrna的3′末端有一個(gè)多聚腺苷酸(polya)結(jié)構(gòu),長(zhǎng)約20-250個(gè)腺苷酸,稱為多聚a尾巴。91

polya作用:

保護(hù)作用,抵抗核酸外切酶的降解;與mrna從細(xì)胞核向細(xì)胞質(zhì)的移動(dòng)有關(guān);與mrna壽命有關(guān)?!懊弊咏Y(jié)構(gòu)”作用:

保護(hù)作用,抵御5’-核酸外切酶的降解作用;是核糖體首先識(shí)別的位置,與蛋白質(zhì)合成的起始有關(guān)。922.6核酸的理化性質(zhì)核酸的一般性質(zhì)核酸的紫外吸收特性dna的變性復(fù)性與分子雜交核酸的顏色反應(yīng)93

dna為白色纖維狀固體,rna為白色粉末狀固體,都微溶于水,其鈉鹽在水中的溶解度較大,但不溶于乙醇、乙醚和氯仿等一般有機(jī)溶劑。(用乙醇從溶液中沉淀核酸)

dna和rna在細(xì)胞中常以核蛋白形式存在,兩種核蛋白在鹽溶液中的溶解度不同。

dna核蛋白rna核蛋白

0.14mol/lnacl

不溶溶

1-2mol/lnacl

溶不溶2.6.1

核酸的一般性質(zhì)94

dna溶液的黏度很大,而rna溶液的黏度小得多。核酸發(fā)生變性或降解后其黏度降低。

核酸受到強(qiáng)大離心力的作用時(shí),可從溶液中沉降下來(lái),其沉降速度與核酸的大小和密度有關(guān)。

核酸是兩性電解質(zhì)(含堿性基團(tuán)、磷酸基團(tuán)),因磷酸的酸性強(qiáng),常表現(xiàn)酸性。由于核酸分子在一定酸度的緩沖液中帶有電荷,因此可利用電泳進(jìn)行分離和研究其特性,最常用的是凝膠電泳。952.6.2

核酸的紫外吸收特性核酸在260nm波長(zhǎng)有最大吸收峰,是由堿基的共軛雙鍵決定的,常用作核酸的定性、定量分析。1.dna或rna的定量od260=1.0相當(dāng)于50μg/ml雙鏈dna37μg/ml單鏈dna40μg/mlrna2.判斷核酸樣品的純度dna純品:od260/od280=1.8rna純品:od260/od280=2.096dna的紫外吸收光譜1.天然dna2.變性dna3.核苷酸總吸收值2202402602800.10.20.30.4波長(zhǎng)(nm)光吸收123核酸的紫外光吸收值常比其各核苷酸成分的光吸收值之和少20-60%,這是在有規(guī)律的雙螺旋結(jié)構(gòu)中堿基緊密地堆積在一起造成的。972.6.3dna的變性復(fù)性與分子雜交

(一)dna的變性(denaturation)定義:核酸雙螺旋的氫鍵斷裂(不涉及共價(jià)鍵的斷裂)、變成單鏈,生物活性喪失的過程。變性因素:熱力、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)溶劑、變性劑、射線、機(jī)械力等。部分雙螺旋解開無(wú)規(guī)則線團(tuán)鏈內(nèi)堿基配對(duì)dna的變性過程98dna變性的本質(zhì)是雙鏈間氫鍵的斷裂99

變性后理化性質(zhì)變化:

dna溶液的粘度降低浮力密度增加旋光偏振光改變紫外吸收增加(增色效應(yīng))生物活性喪失但dna的一級(jí)結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變100增色效應(yīng):dna變性時(shí)其溶液od260增高的現(xiàn)象。101當(dāng)dna的稀鹽溶液加熱到80~100℃時(shí),雙螺旋結(jié)構(gòu)即發(fā)生解體,兩條鏈彼此分開,形成無(wú)規(guī)線團(tuán)。熔解溫度(meltingtemperature,tm):dna熱變性過程中,紫外吸收達(dá)到最大值的一半時(shí)溶液的溫度稱為熔解溫度(tm)或解鏈溫度、變性溫度。實(shí)驗(yàn)室常用的方法——熱變性

8090100100%50%od260

tm

變性溫度范圍①②③℃102影響tm值的因素(2)dna的性質(zhì)和組成(1)溶液的離子強(qiáng)度大腸桿菌dna在不同濃度kcl溶液下的熔融溫度曲線離子強(qiáng)度越高,tm值越高g≡c,3個(gè)氫鍵,打開所需能量較a=t大,gc%越高,tm越高103核酸的均一性愈高的樣品,變性過程的溫度范圍愈小。(3)dna的均一程度104(二)dna的復(fù)性

定義在適當(dāng)條件下,變性dna的兩條互補(bǔ)鏈可恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象,這一現(xiàn)象稱為復(fù)性。減色效應(yīng)dna復(fù)性時(shí),其溶液od260降

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