ChemDraw簡單使用說明實(shí)用

會計(jì)學(xué)1ChemDraw簡單使用說明實(shí)用2美國CambridgeSoft公司的重要產(chǎn)品之一專業(yè)的集成化學(xué)桌面辦公軟件標(biāo)準(zhǔn)界面的菜單簡明，易于操作；方便快捷具有化學(xué)計(jì)算、化學(xué)分析和化學(xué)建模等實(shí)用功能二.ChemOffice第1頁/共135頁3(1)ChemDraw是一個(gè)化學(xué)結(jié)構(gòu)繪圖軟件，可繪制和編輯高質(zhì)量的化學(xué)結(jié)構(gòu)圖，識別和顯示立體結(jié)構(gòu)、部分物性，將結(jié)構(gòu)和名稱進(jìn)行轉(zhuǎn)換。(2)chem3D是一個(gè)用于設(shè)計(jì)化學(xué)模型的應(yīng)用軟件，可將二維平面的有機(jī)分子結(jié)構(gòu)圖形轉(zhuǎn)化成三維的空間結(jié)構(gòu)，可輔助計(jì)算分子半徑的幾何構(gòu)象和單個(gè)點(diǎn)的能量以及相關(guān)的性質(zhì)，例如優(yōu)化模型、構(gòu)象搜索、分子動(dòng)力學(xué)和計(jì)算分子的單點(diǎn)能量等。(3)ChemInfo是基于國際互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)開發(fā)的智能型數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)。可以建立分子結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫。(4)chemFinder是一個(gè)化學(xué)信息管理系統(tǒng)，可以用它來管理化學(xué)信息。組成第2頁/共135頁4ChemOffiee的安裝

第3頁/共135頁5第4頁/共135頁6Chemdraw簡介Chemdraw是一個(gè)方便快捷的化學(xué)繪圖工具，可以迅速畫出各種各樣的化學(xué)結(jié)構(gòu)及化學(xué)反應(yīng)式，以及與化學(xué)有關(guān)的其它圖形表示。具有多種輸入輸出功能，可以直接將所繪制的圖片等以常見的格式輸出,可由word等文字處理器識別的，便于一般的文檔處理第5頁/共135頁7Chemdraw簡介具有預(yù)測1HNMR和13CNMR(核磁共振)譜圖的功能，不僅可以生成圖譜，還可以直接計(jì)算出各個(gè)峰的位置和面積(高度)，為化學(xué)研究帶來了極大的方便。CheroDraw已經(jīng)成為化學(xué)工作者撰稿和進(jìn)行學(xué)術(shù)交流公認(rèn)的化學(xué)結(jié)構(gòu)輸入軟件?；瘜W(xué)軟件的泰斗第6頁/共135頁8ChemDrawUltra8．0(超級版)ChemDrawPro8．0(標(biāo)準(zhǔn)版)ChemDrawStd8．0(專業(yè)版)ChemDrawLtd8.0（受限版）四種版本功能由強(qiáng)到弱。第7頁/共135頁9ChemDraw起始界面第8頁/共135頁10圖形工具板狀態(tài)/信息欄編輯區(qū)滾動(dòng)欄菜單欄工具欄第9頁/共135頁11第10頁/共135頁12套索實(shí)鍵雙鍵虛鍵切割鍵切割楔鍵黑體鍵黑體楔鍵空心楔鍵波浪鍵表格長鏈環(huán)丙烷環(huán)環(huán)戊烷環(huán)環(huán)庚烷環(huán)環(huán)己烷椅式環(huán)戊二烯環(huán)蓬罩橡皮文本筆箭頭軌道繪圖元素基元化學(xué)符號弧形原子反應(yīng)模板環(huán)丁烷環(huán)環(huán)己烷環(huán)環(huán)辛烷環(huán)環(huán)己烷椅式苯環(huán)第11頁/共135頁13鍵工具模板工具箭頭工具軌道工具畫圖工具基元工具符號工具弧形工具原子反應(yīng)工具第12頁/共135頁14第13頁/共135頁15具體用法為：用鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)中所選擇的工具箱中的工具，然后在右邊用鼠標(biāo)拖動(dòng)，至到畫出你所需要的碳鏈畫碳鏈第14頁/共135頁16便捷地畫出各種各樣的環(huán)狀結(jié)構(gòu)第15頁/共135頁17模板按鈕氨基酸(AminoAcids)，芳族(Aromatics)，雙環(huán)(Bicyclics)，生物與膠體(Bioart)，儀器1(Clipware,part1)儀器2(Clipaware,part2)構(gòu)型(Conformers)，五元環(huán)(CpRings)，環(huán)烴(Cycloalkanes)，DNA(Templates)，功能團(tuán)(FunctionalGroups)，雜環(huán)(Hexoses)，苯環(huán)(PhRings)，多方體(Polyhedra)，RNA(Templates)，立體異構(gòu)體(Stereocenters)，超分子(Supramolecules)第16頁/共135頁18模板工具氨基酸模板工具17類第17頁/共135頁19模板工具芳香化合物模板工具第18頁/共135頁20模板工具雙環(huán)模板工具第19頁/共135頁21模板工具生物模板工具第20頁/共135頁22模板工具玻璃儀器模板工具(I)第21頁/共135頁23模板工具玻璃儀器模板工具(II)第22頁/共135頁24模板工具構(gòu)象異構(gòu)體模板工具第23頁/共135頁25模板工具環(huán)戊二烯模板工具第24頁/共135頁26模板工具脂環(huán)模板工具第25頁/共135頁27模板工具DNA模板工具第26頁/共135頁28模板工具官能團(tuán)模板工具第27頁/共135頁29模板工具己糖模板工具第28頁/共135頁30模板工具苯環(huán)模板工具第29頁/共135頁31模板工具多面體模板工具第30頁/共135頁32模板工具RNA模板工具第31頁/共135頁33模板工具特殊符號模板工具立體中心模板工具第32頁/共135頁34第33頁/共135頁35第34頁/共135頁36第35頁/共135頁37第36頁/共135頁38第37頁/共135頁39第38頁/共135頁40第39頁/共135頁41快捷鍵命令灰色表示命令未激活小三角表示子菜單省略號表示新對話框工具欄第40頁/共135頁42文檔設(shè)置頁面規(guī)劃第41頁/共135頁43頁眉頁腳第42頁/共135頁44繪圖第43頁/共135頁45字體第44頁/共135頁46原子格式第45頁/共135頁47顏色設(shè)置背景顏色第46頁/共135頁48國外化學(xué)刊物默認(rèn)文檔格式第47頁/共135頁49優(yōu)選項(xiàng)第48頁/共135頁50優(yōu)選項(xiàng)顯示設(shè)置錯(cuò)誤警告第49頁/共135頁51優(yōu)選項(xiàng)打開/存盤默認(rèn)路徑默認(rèn)打開文件格式默認(rèn)存盤文件格式第50頁/共135頁52元素周期表第51頁/共135頁53第52頁/共135頁54符號窗口第53頁/共135頁55符號窗口第54頁/共135頁56打開文件不同文件格式第55頁/共135頁57文件格式介紹1CDTemplate(*.ctp,*.ctr)——用于保存模板文檔2ChemDraw(*.cdx)——ChemDraw原本格式，是一個(gè)公共標(biāo)記的文件格式，易被其它程序建立和解釋。常用格式3ChemDrawSteylSheet(*.cds)——用于存儲文件設(shè)置和其它物體4ConnectionTable(*.ct)——一種實(shí)例格式，存儲關(guān)于原子與元素、系列編號、X和Y軸、鍵序、鍵類型等的連接和聯(lián)系的列表。是用于多類應(yīng)用程序間互換信息的通用格式第56頁/共135頁585DARC-F1(*.fld)——QuestelDARC系統(tǒng)中存儲結(jié)構(gòu)的原本文件格式7ISISReaction(*.rxn)——MDL開發(fā)的格式，用于存儲元素反應(yīng)信息8ISISSketch(*.skc)——在Windows或Macintosh環(huán)境下，存儲并傳輸?shù)搅硗獾腎SIS應(yīng)用程序中6DARC-F1Query(*.flq)——QuestelDARC系統(tǒng)中存儲查詢的原本文件格式第57頁/共135頁599MDLMolFile(*.mol)——MDL(分子設(shè)計(jì)有限公司)MolFile文件格式用于其它一些在Windows、Macintosh和Unix環(huán)境下的化學(xué)數(shù)據(jù)庫和繪畫應(yīng)用軟件11JcampSpectra(*.jdx，*.dx)——圖譜文件格式，可讀入紫外、質(zhì)譜、紅外、核磁等數(shù)據(jù)文件12MSIChemNote(*.msm)——一種ASCII文本文件，可以用于像

ChemNote一類的應(yīng)用程序10GalacticSpectra(*.spc)——銀河圖譜文件格式第58頁/共135頁6013SMD4.2(*.smd)——ASCII文本文件，一般用于檢索化學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫14WindowsMetafile(*.wmf)——圖片文件格式，可以將ChemDraw

圖片傳輸?shù)狡渌鼞?yīng)用程序中，如Word。WMF文件格式含有中

ChemDraw的結(jié)構(gòu)信息，可被ChemDraw早期版本編輯第59頁/共135頁61點(diǎn)位：移動(dòng)鼠標(biāo)直到鼠標(biāo)的光標(biāo)放到所要進(jìn)行操作的位置，如果選擇的位置在圖形結(jié)構(gòu)中的鍵、原子、線等的上面，一般出現(xiàn)黑方塊，稱之為光標(biāo)塊，選擇塊或操作塊。光標(biāo)塊常用術(shù)語第60頁/共135頁62單擊：快速按下鼠標(biāo)鍵(左或右鍵)，然后快速抬起；雙擊：快速操作兩次單擊；拖動(dòng)：由三部分動(dòng)作組成——按下鼠標(biāo)左鍵選擇對象，移動(dòng)鼠標(biāo)，將被選的對象移動(dòng)到指定位置后抬起鼠標(biāo)；選擇：用鼠標(biāo)的光標(biāo)選中某種選擇，使對象產(chǎn)生光標(biāo)。選擇對象并不意味著動(dòng)作，只是標(biāo)記要操作的對象和點(diǎn)位；第61頁/共135頁63“鍵＋單擊”：按下特殊的鍵和單擊鼠標(biāo)鍵同時(shí)進(jìn)行。如，“Shift＋單擊”意思是按下”Shift”鍵和單擊鼠標(biāo)鍵；“鍵＋拖動(dòng)”：按下特殊的鍵和鼠標(biāo)鍵，移動(dòng)鼠標(biāo)。如，“Shift＋拖動(dòng)”意思是按下”Shift”鍵和拖動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)。第62頁/共135頁64示例1：阿司匹林的結(jié)構(gòu)第63頁/共135頁65優(yōu)化結(jié)構(gòu)[CleanUpStructure]；旋轉(zhuǎn)和縮放；圖形存盤；粘貼至word或ppt；檢查結(jié)構(gòu)錯(cuò)誤[CheckStructure]第64頁/共135頁66示例2：根據(jù)化合物名稱得到結(jié)構(gòu)式[Structure]/[ConvertNametoStructure]-----[InsertStructure]輸入：阿司匹林可輸入2-acetoxybenzoicacid或aspirinEDTA;嗎啡morphine第65頁/共135頁67示例3：根據(jù)結(jié)構(gòu)得出化合物命名

繪制腎上腺素的結(jié)構(gòu)式，選中結(jié)構(gòu)，執(zhí)行【sturucture】/【convertstructuretoname】第66頁/共135頁68將名稱轉(zhuǎn)化成結(jié)構(gòu)第67頁/共135頁69示例：三肽分子的繪制第68頁/共135頁70示例4：預(yù)測核磁共振化學(xué)位移心得安結(jié)構(gòu)式第69頁/共135頁711HNMR預(yù)測1HNMR位移第70頁/共135頁721HNMR預(yù)測結(jié)果第71頁/共135頁73預(yù)測結(jié)果第72頁/共135頁7413CNMR預(yù)測13CNMR位移第73頁/共135頁7513CNMR預(yù)測結(jié)果第74頁/共135頁76部分預(yù)測結(jié)果第75頁/共135頁77H-NMRC-NMR第76頁/共135頁78示例5：分析結(jié)構(gòu)估計(jì)性質(zhì)第77頁/共135頁79第78頁/共135頁80分析結(jié)果窗口分子式精確質(zhì)量分子量質(zhì)譜分析元素分析結(jié)果粘貼兩位小數(shù)質(zhì)譜圖第79頁/共135頁81示例6：顯示分子化學(xué)性質(zhì)第80頁/共135頁82第81頁/共135頁83“View/ShowChemicalPropertiesWindow”菜單第82頁/共135頁84示例6：反應(yīng)方程式第83頁/共135頁85選擇點(diǎn)位拖動(dòng)定位單擊單擊定位單擊生成雙鍵拖動(dòng)生成雙鍵反應(yīng)方程式第84頁/共135頁86雙擊生成文本框輸入字母按Ctrl鍵拖動(dòng)復(fù)制反應(yīng)方程式第85頁/共135頁87反應(yīng)方程式定位單擊生成一單鍵再定位連續(xù)單擊生成三單鍵定位雙擊后輸入OH第86頁/共135頁88反應(yīng)方程式用套索或蓬罩進(jìn)行部分選擇第87頁/共135頁89反應(yīng)方程式按Ctrl鍵拖動(dòng)復(fù)制生成獨(dú)立的兩個(gè)分子第88頁/共135頁90反應(yīng)方程式選擇反應(yīng)箭頭在兩個(gè)分子中單擊生成一反應(yīng)箭頭第89頁/共135頁91反應(yīng)方程式箭頭上方建立文本框輸入反應(yīng)條件第90頁/共135頁92反應(yīng)方程式選擇電荷定位添加負(fù)電荷第91頁/共135頁93反應(yīng)方程式選擇居中分子下方建立文本框第92頁/共135頁94反應(yīng)方程式依次輸入文本信息第93頁/共135頁95反應(yīng)方程式選擇陰影框?qū)⒎磻?yīng)方程式全部罩上第94頁/共135頁96練習(xí)：繪制化學(xué)反應(yīng)式第95頁/共135頁97示例7：繪制中間體結(jié)構(gòu)第96頁/共135頁98繪制中間體結(jié)構(gòu)選擇環(huán)己烷以建立六員環(huán)模型選擇橡皮，擦去六員環(huán)一部第97頁/共135頁99繪制中間體結(jié)構(gòu)選擇單鍵定位連續(xù)單擊生成新的單鍵單擊單鍵中央，生成雙鍵第98頁/共135頁100繪制中間體結(jié)構(gòu)在原子上定位建立標(biāo)記第99頁/共135頁101繪制中間體結(jié)構(gòu)選擇筆工具在曲線菜單中選擇箭頭位于末端第100頁/共135頁102繪制中間體結(jié)構(gòu)定位拖動(dòng)鼠標(biāo)左鍵定位單擊生成曲線箭按Esc鍵退出繪制模式第101頁/共135頁103單擊箭頭繪制中間體結(jié)構(gòu)用小手形光標(biāo)移動(dòng)造另一虛線第102頁/共135頁104小手形光標(biāo)選中虛線柄繪制中間體結(jié)構(gòu)拖動(dòng)改變虛線箭形狀按Esc鍵第103頁/共135頁105示例8：復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu)第104頁/共135頁106示例8：復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu)選擇環(huán)己烷；并添加第一個(gè)環(huán)添加第二個(gè)環(huán)第105頁/共135頁107復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu)橡皮擦去多余部分第106頁/共135頁108復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu)選擇鍵工具；單擊生成新的單雙鍵第107頁/共135頁109復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu)在原子上定位建立標(biāo)記第108頁/共135頁110示例9：Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖第109頁/共135頁111Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖選擇鍵工具；連續(xù)單擊生成五連鍵第110頁/共135頁112Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖建立與五連鍵垂直的水平鍵第111頁/共135頁113Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖在原子上定位建立標(biāo)記第112頁/共135頁114示例10：透視圖形第113頁/共135頁115透視圖形選擇環(huán)己烷旋轉(zhuǎn)環(huán)己烷在原子上定位建立標(biāo)記旋轉(zhuǎn)指示箭頭第114頁/共135頁116透視圖形添加垂直鍵按Alt鍵，任意鍵長第115頁/共135頁117透視圖形選擇套索工具，陰影右下腳按Shift鍵向上按動(dòng)，垂直壓縮50％第116頁/共135頁118透視圖形在原子上定位建立標(biāo)記第117頁/共135頁119透視圖形選擇黑體楔鍵單擊下部兩側(cè)鍵的中央第118頁/共135頁120透視圖形選擇黑體鍵單擊底鍵的中