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文檔簡介
分子遺傳學(xué)轉(zhuǎn)錄和翻譯2012年2月20日星期一1第一頁,共六十三頁,2022年,8月28日
E-mail:2012年2月20日星期一2Function:1.Qestion2.Idea3.HelpBlackBlue
Red開場白第二頁,共六十三頁,2022年,8月28日Why?What?How?Howtostudy?Howtostudythissubject?2012年2月20日星期一3第三頁,共六十三頁,2022年,8月28日核酸P19核苷酸P18核糖核苷酸和脫氧核糖核苷酸P17A、C、T、U、GH3PO4Review2012年2月20日星期一4
小大第四頁,共六十三頁,2022年,8月28日復(fù)制的方向半保留復(fù)制參與復(fù)制的酶和蛋白半不連續(xù)復(fù)制滾環(huán)復(fù)制2012年2月20日星期一5第五頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一6P32、33第六頁,共六十三頁,2022年,8月28日參與復(fù)制的酶和蛋白P33
半不連續(xù)復(fù)制P372012年2月20日星期一7第七頁,共六十三頁,2022年,8月28日滾環(huán)復(fù)制2012年2月20日星期一8第八頁,共六十三頁,2022年,8月28日
轉(zhuǎn)錄概述2012年2月20日星期一9Chapter3
基因的表達(dá)與調(diào)控第九頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一10轉(zhuǎn)錄的概念:中心法則為什么是DNARNA蛋白質(zhì)而不是DNA蛋白質(zhì)?第十頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一11遺傳信息要從DNA—蛋白質(zhì)還要經(jīng)過RNA的傳遞,其中包括攜帶編碼信息的mRNA、負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸的tRNA和構(gòu)成核糖體的rRNA,這三種RNA都是以DNA為摸板在依賴于DNA的RNA聚合酶的作用下合成的,包括RNA鏈的起始、延伸、終止以及轉(zhuǎn)錄后的加工過程,這一系列過程稱為轉(zhuǎn)錄。第十一頁,共六十三頁,2022年,8月28日一、RNA合成的特點(diǎn)2012年2月20日星期一12RNA的生長方向也是從5’---3’,核苷三磷酸加到新生鏈的3’---端,除去的焦磷酸分解為無機(jī)磷酸為反應(yīng)提供能量。2.RNA的四種前體是核糖核苷三磷酸(rNTP):ATP、GTP、CTP、UTP,每個NTP上有2個—OH。第十二頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一133.轉(zhuǎn)錄必須以一條DNA鏈為模板,轉(zhuǎn)錄的鏈都是雙鏈,按照堿基互補(bǔ)配對原則進(jìn)行。4.轉(zhuǎn)錄的過程實現(xiàn)了DNA雙螺旋中一條鏈的RNA鏈的合成。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA的堿基序列與DNA模板鏈互補(bǔ),同非模板鏈一致,只是把T換成了U。因此經(jīng)常把非模板鏈稱為有義鏈,模板鏈稱為反義鏈。第十三頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一14第十四頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一15RNA合成與DNA復(fù)制的相同點(diǎn)與不同點(diǎn):和DNA復(fù)制相似的是RNA的合成主要也包括四個環(huán)節(jié):RNA聚合酶的結(jié)合;起始;延伸;終止。異同點(diǎn):RNA轉(zhuǎn)錄:以雙鏈DNA中的一條單鏈為模板、4種核糖核酸為底物,在轉(zhuǎn)錄酶的作用下合成RNA的過程。DNA復(fù)制:以雙鏈DNA為模板、4種脫氧核糖核酸為底物,在DNA聚合酶的作用下合成新DNA的過程第十五頁,共六十三頁,2022年,8月28日二、原核生物的轉(zhuǎn)錄2012年2月20日星期一16原核生物與真核生物的區(qū)別:原核生物是沒有核膜包圍的細(xì)胞核,而真核生物有,這是最重要的區(qū)別;2.原核生物的細(xì)胞壁是由肽聚糖構(gòu)成,而真核生物的細(xì)胞壁是由纖維素或幾丁質(zhì)構(gòu)成第十六頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一173.原核生物是以二分裂形式進(jìn)行增殖,而真核生物幾乎都以有絲分裂方式進(jìn)行增殖;4.原核生物均為單細(xì)胞生物,而真核生物絕大多數(shù)是多細(xì)胞生物,極少數(shù)是單細(xì)胞生物;5.原核生物只有核糖體一種細(xì)胞器,而真核生物具有多種細(xì)胞器。第十七頁,共六十三頁,2022年,8月28日(一)、細(xì)菌的RNA聚合酶2012年2月20日星期一18E.Coli中RNA聚合酶是四聚體的核心酶2a、b、b’+
s亞基組成的一個全酶來發(fā)揮功能的。第十八頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一19第十九頁,共六十三頁,2022年,8月28日(二)、原核生物轉(zhuǎn)錄的起始和延伸2012年2月20日星期一20啟動子(promoter)啟動子就是指RNA聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。當(dāng)然轉(zhuǎn)錄的起始還需要一些輔助蛋白質(zhì)參與,這些輔助蛋白質(zhì)對于轉(zhuǎn)錄來說是非常重要的,根據(jù)他們的作用分為轉(zhuǎn)錄因子和輔助因子
第二十頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一21第二十一頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一22(1).-10序列(Pribnowsbox):
保守序列是TATAAT,位于-10bp左右;其功能是:a.與RNAPolymerase緊密結(jié)合;b.形成開放啟動復(fù)合體;c.使RNApolymerase定向轉(zhuǎn)錄(2).-35序列(Sextamabox):
保守序列是TTGACA,與-10序列相隔16-19bp。其功能是:a.為RNAPolymerase的識別為點(diǎn);b.與-10序列距離相當(dāng)穩(wěn)定第二十二頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一23(3).CAP位點(diǎn)
CAP是cAMP受體蛋白,只有CAP和啟動子上的特殊位點(diǎn)結(jié)合后才能使-35序列和-10序列很好的與RNA聚合酶結(jié)合,從而形成一個開放的起始復(fù)合物。-60-40-20+1-35序列-10序列RNA聚合酶CAPCAP乳糖啟動子的CAP結(jié)合位點(diǎn)第二十三頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一242.轉(zhuǎn)錄的起始和延伸第二十四頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一253.轉(zhuǎn)錄的終止原核生物的終止子可以分為兩類:(1)、強(qiáng)終止子(2)、弱終止子(依賴ρ因子終止子)第二十五頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一26(1).強(qiáng)終止子第二十六頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一27(2).依賴ρ因子終止子(多出現(xiàn)在噬菌體中)第二十七頁,共六十三頁,2022年,8月28日三、真核生物的轉(zhuǎn)錄2012年2月20日星期一28(一)、真核生物的RNA聚合酶酶位置產(chǎn)物RNA聚合酶IRNA聚合酶IIRNA聚合酶III核仁核質(zhì)核質(zhì)核糖體RNA核RNAtRNA第二十八頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一29RNA聚和酶I:轉(zhuǎn)錄45S前體RNA,然后加工成5.8S、18S、28S的rRNARNA聚合酶Ⅱ:轉(zhuǎn)錄所有編碼蛋白質(zhì)的基因(mRNA)、snRNA(核內(nèi)小RNA)及hnRNA(核內(nèi)不均一RNA)RNA聚合酶Ⅲ:轉(zhuǎn)錄小RNA基因包括tRNA、5SrRNA及某些snRNA第二十九頁,共六十三頁,2022年,8月28日(二)、真核生物的啟動子2012年2月20日星期一30真核生物的啟動子根據(jù)各自所需的RNA聚合酶分為三類,分別由RNA聚合酶I、Ⅱ、Ⅲ進(jìn)行轉(zhuǎn)錄
真核生物的啟動子由轉(zhuǎn)錄因子而不是RNA聚合酶所識別。第三十頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一311.RNA聚合酶I的啟動子結(jié)構(gòu)(轉(zhuǎn)錄rRNA)第三十一頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一322.RNA聚合酶III的啟動子結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄5SRNA、tRNA和核內(nèi)小RNA5SrRNA第三十二頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一33聚合酶III的內(nèi)部啟動子需要裝配因子TFIIIAandTFIIIC,起始因子TFIIIB,和RNApolymeraseIII.5SrRNA基因tRNA基因第三十三頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一343.RNA聚合酶II的啟動子結(jié)構(gòu)聚合酶Ⅱ的啟動子結(jié)構(gòu)包括多個可以被不同的轉(zhuǎn)錄因子和輔助因子識別的保守序列CAATboxGCbox八聚體上游啟動子元件核心元件第三十四頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一35核心元件:TATA框(Goldberg-Hogness):
位置:-25~-30一致序列:T82A97T93A85(A63/T37)A83(A50/T37)特點(diǎn):全部堿基是AT對。作用:和RNA聚合酶的定位有關(guān),決定轉(zhuǎn)錄的起始位點(diǎn)。起始子(Initiator,Inr):
位置:起始點(diǎn)位置一致序列:PyPyANPyPy
特點(diǎn):富含嘧啶堿基作用:和轉(zhuǎn)錄起始位置的精確性有關(guān)第三十五頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一36上游啟動子元件:CAAT框:-75附近,一致序列:GG(C/T)CAATCT。GC框:-90附近,富含GGGCGG的序列。八聚體應(yīng)答元件:位置和序列不定第三十六頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一37遠(yuǎn)端調(diào)控區(qū):增強(qiáng)子(Enhancer):真核生物啟動子中遠(yuǎn)端調(diào)控區(qū)域常見,可以增強(qiáng)啟動子轉(zhuǎn)錄活性的一段DNA序列。作用特點(diǎn):a.遠(yuǎn)距離效應(yīng);b.無方向性;c.順式調(diào)節(jié);d.無物種和基因的特異性;e.組織特異性;f.有相位性;g.有的增強(qiáng)子可以對外部信號產(chǎn)生反應(yīng)。第三十七頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一382.減弱子(Dehancer):在某些基因的上游遠(yuǎn)端和下游遠(yuǎn)端具有負(fù)調(diào)節(jié)序列,其作用不受距離和方向的影響。沉默子(Silences)上游激活序列(UASs)第三十八頁,共六十三頁,2022年,8月28日(三)、真核基因轉(zhuǎn)錄的終止2012年2月20日星期一39真核生物的轉(zhuǎn)錄終止信號和終止過程了解很少,困難在于很難確定原初轉(zhuǎn)錄物的3’末端,因為大多數(shù)基因在轉(zhuǎn)錄后會很快進(jìn)行加工。無論是mRNA、tRNA還是rRNA第三十九頁,共六十三頁,2022年,8月28日四、轉(zhuǎn)錄后加工2012年2月20日星期一40在細(xì)胞內(nèi),由RNA聚合酶合成的新的RNA稱為原初轉(zhuǎn)錄物(primarytranscript),原初轉(zhuǎn)錄物往往需要經(jīng)過一系列的變化包括鏈的裂解、5’和3’的加工、拼接和編輯等過程才能成為成熟的RNA分子,此過程稱為轉(zhuǎn)錄后加工(post-transcriptionprocessing)第四十頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一41(一)、原核生物RNA轉(zhuǎn)錄后的加工原核生物rRNA前體的加工16SRNaseⅢRNaseⅢRNaseEtRNA23S5StRNA16StRNA23S5StRNA第四十一頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一422.原核生物tRNA前體的加工前體加工大致分為四步:(1)、由核酸內(nèi)切酶在tRNA兩端切斷;(2)、由核酸外切酶從3’端切去附加的序列;(3)、在3’端加上CCA-OH(有的不用另外加因為自身帶有該序列);(4)、核苷酸的修飾。第四十二頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一43(二)、真核生物RNA轉(zhuǎn)錄后的加工真核生物tRNA前體的加工不被轉(zhuǎn)錄的序列tRNA基因轉(zhuǎn)錄加工切去多余的序列加上CCA、修飾第四十三頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一442.真核生物rRNA前體的加工真核生物rRNA前體的加工和原核的極為相似1、真核生物核糖體組成:小亞基:16~18SrRNA組成大亞基:5S、5.8S、26~28SrRNA組成2、基因結(jié)構(gòu)特點(diǎn):成簇排列,16~18、5.8和26~28SRNA組成一個轉(zhuǎn)錄單位,彼此由間隔序列隔開,將來轉(zhuǎn)錄為一個45S的前體RNA進(jìn)行加工,5S的單獨(dú)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。3、加工過程:以哺乳動物為例第四十四頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一45(三)、前體mRNA的加工原核生物前體mRNA的加工原核生物的mRNA很少經(jīng)過加工,由于轉(zhuǎn)錄和翻譯偶聯(lián),一般情況下一邊轉(zhuǎn)錄一邊就進(jìn)行翻譯,中間沒有可加工的間歇時間。2.真核生物前體mRNA的加工真核生物mRNA前體的加工是最為復(fù)雜的,對于生物體本身來說也是非常重要的,因為他是編碼蛋白質(zhì)的,結(jié)構(gòu)上包含內(nèi)含子結(jié)構(gòu),而且真核生物的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程被分開在不同的場所進(jìn)行,這些就決定了真核生物mRNA前體加工必然是一個復(fù)雜的過程。第四十五頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一46第四十六頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一47第四十七頁,共六十三頁,2022年,8月28日蛋白質(zhì)生物合成及合成后加工2012年2月20日星期一481954PaulZamecnik采用同位素標(biāo)記氨基酸體內(nèi)試驗證明體內(nèi)蛋白質(zhì)是由氨基酸合成的;1956氨基酰-tRNA合成酶1958M.B.Hoagland&Zamecnik又發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)生物合成需要可溶性RNA為中介;1961HowardDintzis證明血紅蛋白肽鏈合成方向是從N-末端向C-末端進(jìn)行;1961-1966Nirenberg、Matthaei&Khorana先后確定了64個遺傳密碼;1973-1976麥胚無細(xì)胞體系、兔網(wǎng)織無細(xì)胞體系分別建立,蛋白質(zhì)合成的具體過程終于確立第四十八頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一49mRNA20AminoAcids遺傳信息排列順序A、G、C、U翻譯(translation):mRNA轉(zhuǎn)譯成氨基酸序列的過程一、蛋白質(zhì)生物合成體系的組成(一)、mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板第四十九頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一50mRNA上有4種核苷酸A、C、U、G可構(gòu)建4×4×4=64個密碼子(也稱為三聯(lián)體密碼)第五十頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一51遺傳密碼特點(diǎn):通用性(universal):從原核生物到人類都是用同一套遺傳密碼mRNA密碼子的排列具有方向性三聯(lián)體密碼是連續(xù)的遺傳密碼具有簡并性(除Trp和Met)反密碼子與密碼子配對有擺動性第五十一頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一52每一種特異的tRNA只能轉(zhuǎn)載特異的氨基酸(二)、tRNA是氨基酸的轉(zhuǎn)運(yùn)工具第五十二頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一53第五十三頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一54原核:大亞基23S、5SrRNA+小亞基16SrRNA+數(shù)種核糖體蛋白真核:大亞基28S、5.8S、5SrRNA+小亞基18SrRNA+數(shù)種核糖體蛋白(三)、核糖體RNA是蛋白質(zhì)合成的場所第五十四頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一55核糖體在蛋白質(zhì)合成中有兩個主要作用:1.核糖體通過將mRNA、氨基酰-tRNA和相關(guān)的蛋白因子放置在正確的位置來調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的合成;2.核糖體的成分可催化翻譯過程的一部分化學(xué)反應(yīng)第五十五頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一56(四)、蛋白質(zhì)合成體系組成還需要
其他成分第五十六頁,共六十三頁,2022年,8月28日2012年2月20日星期一57氨基酰-tRNA合成酶催化氨基酸與tRNA的連接:
胞漿;氨基酰-tRNA合成酶催化tRNA的3’-末端與氨基酸的羧基形成酯鍵,生成氨基酰-tRNA2.氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性二、蛋白質(zhì)生物合成分5個
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