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第三十四章DNA的損傷、修復(fù)和突變提綱DNA的損傷DNA的修復(fù)直接修復(fù)切除修復(fù)雙鏈斷裂修復(fù)損傷跨越DNA的突變突變的類型與后果突變的原因回復(fù)突變與突變的校正突變原與致癌物之間的關(guān)系及致癌物的檢測哪些因素能影響到DNA的完整性?細胞內(nèi)源的因素環(huán)境因素

-例如化學(xué)試劑、污染物和UV線細胞內(nèi)源因素復(fù)制錯誤例如四種dNTP量的不平衡導(dǎo)致錯配DNA本身的不穩(wěn)定堿基的自發(fā)脫氨基DNA的脫嘌呤/脫嘧啶導(dǎo)致堿基脫落活性氧的作用DNA,蛋白質(zhì)和脂質(zhì)的氧化DNA分子上的自發(fā)脫嘌呤作用和自發(fā)脫氨基作用環(huán)境(外源)因素化學(xué)試劑

(1)

天然化合物黃曲霉素

(2)

人造化合物苯并芘-香煙順鉑-化療藥物物理因素

(1)UV

(2)

離子輻射

γ-射線x-射線DNA損傷的因素和損傷的主要類型損傷類型實例/原因堿基丟失自發(fā)脫堿基(熱、酸),脫嘌呤>脫嘧啶,104嘌呤脫落/天/細胞(恒溫動物)堿基修飾形成堿基加合物,例如,8-羥基脫氧鳥嘌呤(離子輻射或活性氧),6-烷基鳥嘌呤(烷基化試劑)堿基交聯(lián)嘧啶二聚體和6-4光產(chǎn)物(UV)堿基轉(zhuǎn)換C→U,A→I(自發(fā)脫氨基),100堿基脫氨基/天/細胞堿基錯配GT(4種dNTP濃度不平衡、堿基的互變異構(gòu)或堿基之間的差別不足)DNA鏈斷裂因磷酸二酯鍵被破壞引起單鏈斷裂或雙鏈斷裂(離子輻射或特殊的化學(xué)試劑),因脫氧核糖環(huán)3號位發(fā)生斷裂引起的DNA鏈斷裂(博來霉素)DNA鏈間交聯(lián)互補雙鏈之間產(chǎn)生交聯(lián)(雙功能試劑的作用)DNA與蛋白質(zhì)的交聯(lián)UVDNA損傷的因素和損傷的主要類型損傷類型實例/原因堿基丟失自發(fā)脫堿基(熱、酸),脫嘌呤>脫嘧啶,104嘌呤脫落/天/細胞(恒溫動物)堿基修飾形成堿基加合物,例如,8-羥基脫氧鳥嘌呤(離子輻射或活性氧),6-烷基鳥嘌呤(烷基化試劑)堿基交聯(lián)嘧啶二聚體和6-4光產(chǎn)物(UV)堿基轉(zhuǎn)換C→U,A→I(自發(fā)脫氨基),100堿基脫氨基/天/細胞堿基錯配GT(4種dNTP濃度不平衡、堿基的互變異構(gòu)或堿基之間的差別不足)DNA鏈斷裂因磷酸二酯鍵被破壞引起單鏈斷裂或雙鏈斷裂(離子輻射或特殊的化學(xué)試劑),因脫氧核糖環(huán)3號位發(fā)生斷裂引起的DNA鏈斷裂(博來霉素)DNA鏈間交聯(lián)互補雙鏈之間產(chǎn)生交聯(lián)(雙功能試劑的作用)DNA與蛋白質(zhì)的交聯(lián)UV活性氧的堿基修飾作用

鳥嘌呤的甲基化導(dǎo)致堿基錯配

DNA損傷的因素和損傷的主要類型損傷類型實例/原因堿基丟失自發(fā)脫堿基(熱、酸),脫嘌呤>脫嘧啶,104嘌呤脫落/天/細胞(恒溫動物)堿基修飾形成堿基加合物,例如,8-羥基脫氧鳥嘌呤(離子輻射或活性氧),6-烷基鳥嘌呤(烷基化試劑)堿基交聯(lián)嘧啶二聚體和6-4光產(chǎn)物(UV)堿基轉(zhuǎn)換C→U,A→I(自發(fā)脫氨基),100堿基脫氨基/天/細胞堿基錯配GT(4種dNTP濃度不平衡、堿基的互變異構(gòu)或堿基之間的差別不足)DNA鏈斷裂因磷酸二酯鍵被破壞引起單鏈斷裂或雙鏈斷裂(離子輻射或特殊的化學(xué)試劑),因脫氧核糖環(huán)3號位發(fā)生斷裂引起的DNA鏈斷裂(博來霉素)DNA鏈間交聯(lián)互補雙鏈之間產(chǎn)生交聯(lián)(雙功能試劑的作用)DNA與蛋白質(zhì)的交聯(lián)UV紫外線引起的堿基損傷

DNA損傷的因素和損傷的主要類型損傷類型實例/原因堿基丟失自發(fā)脫堿基(熱、酸),脫嘌呤>脫嘧啶,104嘌呤脫落/天/細胞(恒溫動物)堿基修飾形成堿基加合物,例如,8-羥基脫氧鳥嘌呤(離子輻射或活性氧),6-烷基鳥嘌呤(烷基化試劑)堿基交聯(lián)嘧啶二聚體和6-4光產(chǎn)物(UV)堿基轉(zhuǎn)換C→U,A→I(自發(fā)脫氨基),100堿基脫氨基/天/細胞堿基錯配GT(4種dNTP濃度不平衡、堿基的互變異構(gòu)或堿基之間的差別不足)DNA鏈斷裂因磷酸二酯鍵被破壞引起單鏈斷裂或雙鏈斷裂(離子輻射或特殊的化學(xué)試劑),因脫氧核糖環(huán)3號位發(fā)生斷裂引起的DNA鏈斷裂(博來霉素)DNA鏈間交聯(lián)互補雙鏈之間產(chǎn)生交聯(lián)(雙功能試劑的作用)DNA與蛋白質(zhì)的交聯(lián)UV離子輻射引起的DNA鏈斷裂

DNA修復(fù)DNA是唯一一種在發(fā)生損傷以后可以被完全修復(fù)的分子,而其他生物大分子在受到損傷以后要么被降解,要么被取代。當(dāng)然,并不是發(fā)生在DNA分子上的所有損傷都能修復(fù)。如果受到的損傷不能及時被修復(fù),可導(dǎo)致細胞的癌變和早衰。細胞之所以在DNA受到損傷以后,選擇的處理方法是盡量將其修復(fù)而不是將其降解,這一是因為作為遺傳物質(zhì)的DNA分子在細胞內(nèi)只有一個拷貝,如果將其水解的話,細胞也就失去了存在的根基;二是DNA的互補雙螺旋結(jié)構(gòu)使得修復(fù)一個受損傷的DNA分子變得很容易。DNA修復(fù)機制直接修復(fù):嘧啶二聚體直接修復(fù)、烷基化直接修復(fù)切除修復(fù):堿基切除修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)、錯配修復(fù)雙鏈斷裂修復(fù):損傷跨越:重組跨越、跨越合成直接修復(fù)嘧啶二聚體的直接修復(fù)——由DNA光裂合酶催化。此酶直接識別和結(jié)合嘧啶二聚體。然后,利用輔基捕捉到的光能,將嘧啶二聚體打開,最后再與DNA解離。但是胎盤類哺乳動物卻沒有這種酶。烷基化堿基的直接修復(fù)——由特定的烷基轉(zhuǎn)移酶催化DNA鏈斷裂的直接修復(fù)——由DNA連接酶催化。光裂合酶的三維結(jié)構(gòu)嘧啶二聚體的直接修復(fù)

直接修復(fù)嘧啶二聚體的直接修復(fù)——由DNA光裂合酶催化。此酶直接識別和結(jié)合嘧啶二聚體。然后,利用輔基捕捉到的光能,將嘧啶二聚體打開,最后再與DNA解離。但是胎盤類哺乳動物卻沒有這種酶。烷基化堿基的直接修復(fù)——由特定的烷基轉(zhuǎn)移酶催化DNA鏈斷裂的直接修復(fù)——由DNA連接酶催化。烷基化堿基的直接修復(fù)切除修復(fù)切除修復(fù)先切除損傷的堿基或核苷酸,然后,重新合成正常的核苷酸,最后,再經(jīng)連接酶重新連接,將原來的切口縫合。整個切除修復(fù)過程包括識別、切除、重新合成和重新連接。切除修復(fù)又分為堿基切除修復(fù)(BER)和核苷酸切除修復(fù)(NER),兩者的主要差別在于識別損傷的機制上,前者是直接識別具體的受損傷的堿基,而后者并不識別具體的損傷,而是識別損傷對DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)造成的扭曲。錯配修復(fù)(MMR)堿基切除修復(fù)DNA糖苷酶切除受損傷的堿基短修補——是主要途徑,約占80%~90%,只需合成屬于AP位點的1個正常的核苷酸長修補——是次要途徑,約占10%~20%,為短修補途徑的備用途徑,要合成1小段寡聚核苷酸尿嘧啶的切除修復(fù)核苷酸切除修復(fù)NER最初的切點是損傷部位附近的3′,5′-磷酸二酯鍵,主要用來修復(fù)因UV、絲裂霉素C和順鉑等因素造成的比較大的損傷,如嘧啶二聚體、體積較大的堿基加合物以及鏈間交聯(lián)等導(dǎo)致DNA結(jié)構(gòu)發(fā)生扭曲并影響到DNA復(fù)制的損傷,此外,約20%堿基的氧化性損傷也由它修復(fù)。在修復(fù)過程中,損傷以寡聚核苷酸的形式被切除。由于NER識別損傷的機制并非針對損傷本身,而是損傷對DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)造成的扭曲,因此,NER能夠使用相同的機制和幾乎同一套修復(fù)蛋白去修復(fù)一系列性質(zhì)并不相同的損傷。NER在所有的生物具有相同的步驟:識別損傷—由特殊的蛋白質(zhì)完成,并由此引發(fā)一系列的蛋白質(zhì)與受損傷DNA的有序結(jié)合;切除損傷—特殊的內(nèi)切酶在損傷部位的兩側(cè)切開DNA鏈,隨后兩個切口之間帶有損傷的DNA片段被去除;修復(fù)合成—DNA聚合酶以另外一條鏈為模板,合成已被切除的序列;縫合切口—由DNA連接酶催化。損傷跨越

重組跨越使用同源重組的方法將DNA模板進行交換以避免損傷對復(fù)制的抑制,從而使復(fù)制能夠繼續(xù)下

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