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關(guān)于蛋白質(zhì)合成及轉(zhuǎn)運(yùn)王鏡巖生物化學(xué)全第一頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日第一節(jié)
蛋白質(zhì)合成的分子基礎(chǔ)
(要件)第二頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日一、mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板
mRNA以核苷酸序列的方式攜帶遺傳信息,通過(guò)這些信息來(lái)指導(dǎo)合成多肽鏈中的氨基酸的序列。每一個(gè)氨基酸可通過(guò)mRNA上3個(gè)核苷酸序列組成的遺傳密碼來(lái)決定,這些密碼以連續(xù)的方式連接,組成讀碼框架。mRNA第三頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日原核細(xì)胞mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)5′3′順?lè)醋禹樂(lè)醋禹樂(lè)醋硬迦腠樞虿迦腠樞蛳葘?dǎo)區(qū)末端順序AGGAGGUSD區(qū)半衰期短許多原核生物mRNA以多順?lè)醋有问酱嬖贏UG作為起始密碼;AUG上游7~12個(gè)核苷酸處有一被稱(chēng)為SD序列的保守區(qū),16SrRNA3’-端反向互補(bǔ)而使mRNA與核糖體結(jié)合。第四頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日真核細(xì)胞mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)5′
“帽子”P(pán)olyA
3′
順?lè)醋觤7G-5′ppp-N-3′p帽子結(jié)構(gòu)功能使mRNA免遭核酸酶的破壞使mRNA能與核糖體小亞基結(jié)合并開(kāi)始合成蛋白質(zhì)被蛋白質(zhì)合成的起始因子所識(shí)別,從而促進(jìn)蛋白質(zhì)的合成。Poly(A)尾巴的功能是mRNA由細(xì)胞核進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)所必需的形式它大大提高了mRNA在細(xì)胞質(zhì)中的穩(wěn)定性AAAAAAA-OH第五頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日
tRNA在蛋白質(zhì)合成中處于關(guān)鍵地位,它不但為每個(gè)三聯(lián)體密碼子譯成氨基酸提供接合體,還為準(zhǔn)確無(wú)誤地將所需氨基酸運(yùn)送到核糖體上提供運(yùn)送載體。1、tRNA的結(jié)構(gòu)特征—三葉草型二級(jí)結(jié)構(gòu)2、tRNA的功能:(1)被特定的氨酰-tRNA合成酶識(shí)別,使tRNA接受正確的活化氨基酸。(2)識(shí)別mRNA鏈上的密碼子。(3)在蛋白質(zhì)合成過(guò)程中,tRNA起著連接生長(zhǎng)的多肽鏈與核糖體的作用。
tRNA第六頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日tRNA含有兩個(gè)關(guān)鍵的部位:一個(gè)是氨基酸結(jié)合部位,另一個(gè)是與mRNA的結(jié)合部位。對(duì)于組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸來(lái)說(shuō),每一種至少有一種tRNA來(lái)負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)運(yùn)。第七頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日氨酰-tRNA合成酶特點(diǎn)a、專(zhuān)一性:對(duì)氨基酸有極高的專(zhuān)一性,每種氨基酸都有專(zhuān)一的酶,只作用于L-氨基酸,不作用于D-氨基酸。對(duì)tRNA具有極高專(zhuān)一性。含同義密碼子的tRNA由相同的氨酰-tRNA合成酶識(shí)別.b、校對(duì)作用:氨酰-tRNA合成酶的水解部位可以水解錯(cuò)誤活化的氨基酸。
第八頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日tRNA分子攜帶氨基酸的分子機(jī)制tRNA分子上與多肽合成有關(guān)的位點(diǎn)至少有4個(gè),分別為:3’端CCA上的氨基酸接受位點(diǎn)氨酰-tRNA合成酶識(shí)別的位點(diǎn)核糖體識(shí)別位點(diǎn)反密碼子位點(diǎn)。第九頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日氨基酸的活化EEAAEAAtRNAAAEtRNAAAEtRNAAA氨基酸ATP+氨酰腺苷酸E-AMPPPi第一步AMP第二步E氨基酸的活化3-氨酰-tRNA第十頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日第十一頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日密碼子與反密碼子的配對(duì)關(guān)系反密碼子tRNA53AUC5mRNA3密碼子123第十二頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日核糖體核糖體是由rRNA和多種蛋白質(zhì)結(jié)合而成的一種大的核糖核蛋白顆粒,蛋白質(zhì)肽鍵的合成就是在這種核糖體上進(jìn)行的。1、核糖體的結(jié)構(gòu)和組成2、核糖體的功能第十三頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日核糖體的組成原核生物核糖體的組成原核生物核糖體結(jié)構(gòu)示意圖第十四頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日第十五頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日原核細(xì)胞70S核糖體的A位、P位及mRNA結(jié)合部位示意圖anticodoncodon30S與mRNA結(jié)合部位P位(結(jié)合或接受肽基的部位)A位(結(jié)合或接受AA-tRNA的部位)50S53mRNA第十六頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日第二節(jié)蛋白質(zhì)合成的機(jī)理
(原核生物)第十七頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日氨基酸的活化EEAAEAAtRNAAAEtRNAAAEtRNAAA氨基酸ATP+氨酰腺苷酸E-AMPPPi第一步AMP第二步E氨基酸的活化3-氨酰-tRNA第十八頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日N-甲酰甲硫氨酰-tRNAtMet的形成CHO-HN-CH-COO-tRNACH2CH2SCH3
+H2N-CH-COO-tRNACH2CH2SCH3Met-tRNAtMetfMet-tRNAtMetN10-甲酰FH4FH4轉(zhuǎn)甲酰酶第十九頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日原核生物多肽鏈的合成過(guò)程
原核生物多肽鏈的合成分為三個(gè)階段:肽鏈合成的起始、肽鏈的延伸、肽鏈合成的終止和釋放。1、肽鏈合成的起始2、肽鏈的延長(zhǎng)3、肽鏈合成的終止及釋放第二十頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日翻譯開(kāi)始于mRNA與核糖體的結(jié)合.在原核細(xì)生物中一個(gè)mRNA上可以有多個(gè)起始位點(diǎn),為多個(gè)蛋白質(zhì)編碼。原核細(xì)胞中的核糖體是如何對(duì)mRNA分子內(nèi)如此眾多的AUG起始位點(diǎn)進(jìn)行識(shí)別?第二十一頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日細(xì)菌的mRNA通常含有一段富含嘌呤堿基的序列,稱(chēng)作SD序列,它們通常在起始AUG序列上游10個(gè)堿基左右的位置,能與細(xì)菌16SrRNA3’端的7個(gè)嘧啶堿基進(jìn)行堿基互補(bǔ)性的識(shí)別,以幫助從起始AUG處開(kāi)始翻譯。第二十二頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日
在真核生物的mRNA中,最靠近5’端的AUG序列通常是起始密碼。核糖體小亞基首先結(jié)合在mRNA的5’端,然后向3’端移動(dòng),直到AUG序列被tRNAiMet上的反密碼子識(shí)別。這種識(shí)別被類(lèi)似GCCGCCpuCCAUGG這樣的序列所加強(qiáng),核糖體與它怎樣進(jìn)行的識(shí)別過(guò)程目前尚不清楚。無(wú)此序列,小亞基將不能識(shí)別AUG.第二十三頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日階段原核真核功能
IF1
IF2
eIF2參與起始復(fù)合物的形成
IF3
eIF3、eIF4C起始CBPI與mRNA帽子結(jié)合
eIF4ABF參與尋找第一個(gè)AUG
eIF5協(xié)助eIF2、eIF3、eIF4C的釋放
eIF6協(xié)助60S亞基從無(wú)活性的核糖體上解離
EF-Tu
eEF1協(xié)助氨酰-tRNA進(jìn)入核糖體延長(zhǎng)EF-Ts
eEF1幫助EF-Tu、eEF1周轉(zhuǎn)
EF-G
eEF2移位因子
RF-1終止eRF釋放完整的肽鏈
RF-2第二十四頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日肽鏈合成的起始30S亞基?mRNAIF3-IF1復(fù)合物30S?mRNA?GTP-fMet–tRNA-IF2-IF1復(fù)合物70S起始復(fù)合物codonanticodonP位A位
mRNA
+30S亞基-IF3A位IF-353IF2GTPP位IF3IF2IF1IF2-GTP-fMet-tRNAIF350S亞基IF2+IF1+GDP+PiIF-1IF170S起始復(fù)合物第二十五頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日肽鏈的延長(zhǎng)12122323進(jìn)位肽鍵形成移位進(jìn)位(Tu\Ts)GTPGTPN-端235′3′C-端肽鍵形成15′3′(EF-G)
第二十六頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日肽鏈合成的終止及釋放(1)釋放因子RF1或RF2進(jìn)入核糖體A位。(2)多肽鏈的釋放(3)70S核糖體解離53UAG30S亞基50S亞基53UAGtRNARF第二十七頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日肽鍵的形成第二十八頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日Tu\Ts循環(huán)第二十九頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日多核糖體與核糖體循環(huán)合成完畢的肽鏈多核糖體3ˊmRNA延伸中的肽鏈5ˊ核糖體循環(huán)第三十頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日多核糖體第一個(gè)編碼區(qū)第一個(gè)編碼區(qū)第二個(gè)編碼區(qū)第二個(gè)編碼區(qū)終止\起始終止起始mRNAmRNA5′5′3′3′第三十一頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日真核生物多肽鏈的合成1、真核細(xì)胞核糖體比原核細(xì)胞核糖體更大更復(fù)雜;2、起始氨基酸為Met,不是fMet;3、肽鏈合成的起始:由40S核糖體亞基首先識(shí)別mRNA的5’端-帽子,然后沿mRNA移動(dòng)尋找AUG;4、起始因子有12種,但只有2種延長(zhǎng)因子和1種終止因子;5、真核細(xì)胞種線粒體、葉綠體的核糖體大小、組成及蛋白質(zhì)合成過(guò)程都類(lèi)似于原核細(xì)胞。第三十二頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日第三節(jié)
蛋白質(zhì)的運(yùn)輸及翻譯后修飾
第三十三頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日在核糖體上新合成的多肽被送往細(xì)胞的各個(gè)部分,以行使各自的生物功能,所以新合成的多肽的輸送是有目的、定向地進(jìn)行的。
對(duì)真核生物來(lái)說(shuō),游離狀態(tài)的核糖體停留在胞漿中,只合成供裝配線粒體及葉綠體膜的蛋白質(zhì)。結(jié)合于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的核糖體新合成的多肽進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)進(jìn)行后加工。
第三十四頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日一、蛋白質(zhì)通過(guò)其信號(hào)肽引導(dǎo)到目的地
每需要運(yùn)輸?shù)亩嚯亩己幸欢伟被嵝蛄?,稱(chēng)為信號(hào)肽序列(signalleadersequence),引導(dǎo)多肽至不同的運(yùn)系統(tǒng)。在真核細(xì)胞中,當(dāng)某一種多肽的N端剛開(kāi)始合成不久,這種多肽合成后的去向就已被決定。
疏水性的氨基酸區(qū)
信號(hào)肽酶識(shí)別位點(diǎn)
第三十五頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日SRP:信號(hào)識(shí)別體;2個(gè)功能(1)識(shí)別信號(hào)肽,(2)暫時(shí)阻止肽鏈延伸。
SRP受體停泊蛋白第三十六頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日分泌蛋白質(zhì)的合成和胞吐作用內(nèi)質(zhì)網(wǎng)高爾基體泡泡泡融入質(zhì)膜核糖體芽泡第三十七頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日線粒體外膜線粒體內(nèi)膜帶有導(dǎo)肽的線粒體蛋白質(zhì)前體跨膜運(yùn)送過(guò)程示意圖內(nèi)外膜接觸位點(diǎn)的蛋白質(zhì)通道線粒體hsp70受體蛋白hsp70導(dǎo)肽蛋白酶切除導(dǎo)肽第三十八頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日1、肽鏈末端的修飾:
N-端fMet或Met的切除2、信號(hào)序列的切除3、二硫鍵的形成4、部分肽段的切除5、個(gè)別氨基酸的修飾6、糖基側(cè)鏈的添加7、輔基的加入蛋白質(zhì)的加工修飾第三十九頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日胰島素原的加工A鏈區(qū)B鏈區(qū)間插序列(C肽區(qū))HSSHSHSHHSHS信號(hào)肽NC核糖體上合成出無(wú)規(guī)則卷曲的前胰島素原切除C肽后,形成成熟的胰島素分子切除信號(hào)肽后折疊成穩(wěn)定構(gòu)象的胰島素原SSSSNNCCA鏈B鏈胰島素CNS-SSS胰島素原SS第四十頁(yè),共四十二頁(yè),2022年,8月28日
肽鏈折疊是指從多肽鏈的氨基酸序列形成具有正確三維空間結(jié)構(gòu)
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