化學手冊網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫Beilst課件

CrossfireBeilstein/Gmelin化學手冊網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫

中科院文獻情報中心信息服務(wù)部姚丹丹2005內(nèi)容提要背景資料客戶端軟件安裝CrossFireBeilstein/Gmelin基本檢索背景資料——LeopoldGmelin

1788–1853

Germanchemist1822discovererofpotassiumferricyanide1817–1819wrotetheHandbuchderChemiefirstedition,4thed.1843-1855)1848-1850translatedintoEnglishfortheCavendishSocietybyH.Watts.背景資料——CrossfireBeilstein/Gmelin

由Beilstein和Gmelin兩個數(shù)據(jù)庫組成。分別由德國BeilsteinInstitute和GmelinInstitute進行。前者收集有機化合物的資料，后者收集有機金屬與無機化合物的資料。是傳統(tǒng)貝爾斯坦有機化學手冊(BeilsteinHandbuchderOrganischeChemie)及蓋墨林無機與有機金屬化學手冊(GmelinHandbookofInorganicandOrganometallicChemistry)的電子化。背景資料——CrossfireBeilstein/Gmelin

Theworld’slargestelectronicscollectionoforganicreactionsandchemicalfactsTheonlycomprehensive,electronicallysearchablesourceofstructures,properties,andcitationsininorganicandorganometallicchemistry背景資料——CrossfireBeilstein/Gmelin物質(zhì)信息：化合物化學性質(zhì)化合物物理性質(zhì)化合物化合物結(jié)構(gòu)信息化合物生物活性信息化合物參考文獻信息反應(yīng)信息：化學反應(yīng)信息制備物質(zhì)的詳細資料反應(yīng)途徑引用文獻信息：參考文獻根據(jù)1980年-的重要有機化學文獻索引整理的摘要900萬種化合物50萬個/年增1000萬個有機化學反應(yīng)CrossfireBeilstein1771-200萬篇參考文獻80萬篇摘要背景資料——CrossfireBeilstein/Gmelin

化學結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)化學反應(yīng)（制備）物理性質(zhì)化學性質(zhì)參考文獻

200萬種無機和有機金屬化合物14000種玻璃和陶瓷3200種礦物55000種合金110萬篇文獻15萬篇摘要160萬個反應(yīng)CrossfireGmelin1772-

地質(zhì)學/礦物學/冶金學信息資源材料科學/電子學/催化學信息資源背景資料——CrossfireBeilstein/Gmelin62Journals1772年——背景資料——Elsevier-MDL

Crossfire等化學信息管理、藥物研究開發(fā)等軟件供應(yīng)商探索生命科學、材料科學、化學工業(yè)信息學的領(lǐng)導者國際性公司，總部社在美國加州SanLeandro,在全球設(shè)有分公司內(nèi)容提要背景資料客戶端軟件安裝CrossFireBeilstein/Gmelin基本檢索方法客戶端程序安裝網(wǎng)絡(luò)檢索CrossFireBeilstein/Gmelin需要安裝客戶端程序CrossFireCommander6.0CrossFireCommander7.0新版本客戶端具有更清晰的使用界面和頁面HELP提示客戶端軟件安裝—步驟（適用中科院用戶）

升級程序的下載地址為：進入地址后，將Crossfire.rar下載并解壓縮后，雙InstallShell.exe，按提示安裝，建議使用默認配置。

CrossFireCommander6.0需要卸載客戶端軟件安裝—安裝信息

MDLISISDraw

是Crossfire平臺上的特定產(chǎn)品，在這個平臺上使用起來有時會比ISISDraw方便，但不能脫離此平臺使用。

安裝中需要選擇畫圖軟件是使用最廣泛的一種，除了在Crossfire，還可以在MDL公司的其他各種產(chǎn)品中使用。

MDLDrawISISDraw的換代產(chǎn)品，操作起來更簡單，相對于ISISDraw有很多改進，會逐漸取代ISISDraw，目前對于非MDL用戶不是免費的。

MDLCrossfireStructureEditor內(nèi)容提要背景資料客戶端軟件安裝CrossFireBeilstein/Gmelin基本檢索方法CrossFireBeilstein檢索—

CrossFireCommander7.0界面結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)表格檢索結(jié)構(gòu)檢索關(guān)鍵詞檢索CrossFireBeilstein檢索—

CrossFireCommander7.0的界面結(jié)構(gòu)QueryHistory提問記錄SelectDatabase選擇數(shù)據(jù)庫OpenQuery打開保存的檢索提問DrawStructure繪制化學結(jié)構(gòu)SaveQuery保存檢索提問ModifyAlert修改跟蹤檢索信息PrintQuery打印檢索提問CreateAlert創(chuàng)建跟蹤檢索服務(wù)ClearQuery清除檢索提問StartSearch提交檢索提問菜單與功能快捷鍵CrossFireBeilstein檢索—選擇數(shù)據(jù)庫選擇數(shù)據(jù)庫CrossFireBeilstein檢索—選擇化學結(jié)構(gòu)畫圖工具確認選用的畫圖工具與安裝的畫圖工具一致CrossFireBeilstein檢索—關(guān)鍵詞檢索蘭色的“Bar”提示關(guān)鍵詞出現(xiàn)的頻次選擇檢索內(nèi)容：SubstancesReactionsCitationsCrossFireBeilstein檢索—關(guān)鍵詞檢索View檢索結(jié)果命中記錄Hits的數(shù)量CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)和事實的超鏈接

鏈接Reaction詳細數(shù)據(jù)CrossFireBeilstein檢索—訪問參考文獻超鏈接獲取參考文獻記錄超鏈接獲取MDL-LitLink文獻提供服務(wù)CrossFireBeilstein檢索—訪問參考文獻超鏈接參考文獻詳細內(nèi)容部分參考文獻提供經(jīng)過整理的摘要CrossFireBeilstein檢索—訪問參考文獻超鏈接獲取MDL-LitLink文獻提供服務(wù)注冊服務(wù)CrossFireBeilstein檢索—結(jié)果顯示方式

選取檢索結(jié)果記錄的顯示方式CrossFireBeilstein檢索—結(jié)果顯示方式利用快捷鍵選取顯示的數(shù)據(jù)內(nèi)容“HitOnly”只顯示與檢索條件匹配的數(shù)據(jù)直接查詢相關(guān)記錄，不用重新提問CrossFireBeilstein檢索—相關(guān)記錄檢索CrossFireBeilstein檢索—檢索歷史顯示特定日期的檢索內(nèi)容選取并復制檢索內(nèi)容到“Query”CrossFireBeilstein檢索—保存/打開提問式

點擊“SaveQuery”保存提問式點擊“OpenQuey”單擊文件名預覽保存提問式點擊“OpenQuey”雙擊文件名copy檢索提問CrossFireBeilstein檢索—提問集“Querties”顯示“Today”“Yesterday’s”,“Previous”的檢索提問“Queries”直接“Copy”檢索提問CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索數(shù)據(jù)表格索引區(qū)包括6種索引查詢內(nèi)容填充區(qū)CrossFireBeilstein—數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索單擊數(shù)據(jù)索引名稱瀏覽索引詳細內(nèi)容選擇數(shù)據(jù)域名稱CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索點擊“Selectforsearch”，查詢內(nèi)容自動添入“SearchField”

對索引內(nèi)容的描述與檢索樣例可以locate索引內(nèi)容在“tree”中的位置CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索輸入查詢數(shù)據(jù)的名稱點擊“Find”雙擊顯示的數(shù)據(jù)域名稱，該名稱自動填充到數(shù)據(jù)表格檢索區(qū)CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索例：檢索CASno.122-01-0化合物的相關(guān)信息輸入數(shù)據(jù)域，填充檢索內(nèi)容“List”提供相應(yīng)內(nèi)容的選擇與自動填充，如果相應(yīng)內(nèi)容，則檢索無結(jié)果CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索“List”提供相應(yīng)內(nèi)容的選擇、自動填充和預檢。CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索檢索結(jié)果顯示CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索輸入查詢詞點擊“Find”,在“Tree”中以背景顏色顯示結(jié)果雙擊查詢結(jié)果，數(shù)據(jù)域名自動進入“FieldName”“Enlarge”可以獨立顯示數(shù)據(jù)檢索表格例：查詢在760毫米汞柱下沸點<120c,不含氯元素的溶劑，同時查詢其“Density”“Viscosity”信息CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索“Enlarge”填充完畢的數(shù)據(jù)表格CrossFireBeilstein檢索—數(shù)據(jù)表格檢索檢索結(jié)果中符合定義條件的數(shù)據(jù)一背景顏色顯示CrossFireBeilstein檢索—預定義檢索表格利用“PredefinedSearchforms”簡化檢索條件的填充和予檢索如果予檢為零，則檢索結(jié)構(gòu)為零。9種預定義檢索表格CrossFireBeilstein檢索—預定義檢索表格填充需檢索內(nèi)容利用List預檢索定義的檢索內(nèi)容將自動進入“SearchField”“SubstanceIndentificationData”PredefinedSearchformsCrossFireBeilstein檢索—預定義檢索表格輸入檢索內(nèi)容，利用“List”進行預檢索例——查詢化合物信息：CAS=610-96-6,MolecularFormula=C8H7ClO2CrossFireBeilstein檢索—預定義檢索表格預檢索顯示可以檢索到相關(guān)數(shù)據(jù)CrossFireBeilstein檢索—預定義檢索表格填充檢索條件提交檢索CrossFireBeilstein檢索—預定義檢索表格檢索數(shù)據(jù)記錄顯示CrossFireBeilstein檢索——二次檢索“Hitsets”對各命中集以列表顯示在“Hitsets”中選擇不同的命中集組合進行二次檢索CrossFireBeilstein檢索—結(jié)構(gòu)檢索

用“DrawStructure”打開畫圖工具或在“Structure/Reactionsearch”中雙擊打開畫圖工具CrossFireBeilstein檢索—結(jié)構(gòu)檢索如果無法打開畫圖工具，請確認是否正確的選擇了畫圖工具在菜單“Option”中點擊“SelectStructureEditor”CrossFireBeilstein檢索—結(jié)構(gòu)檢索選項立體化學檢索條件選項區(qū)結(jié)構(gòu)檢索半反應(yīng)檢索子結(jié)構(gòu)檢索選項取代基位置其他檢索條件選項CrossFireBeilstein檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索旋轉(zhuǎn)、刪除、畫筆原子、鍵、環(huán)化合物精確結(jié)構(gòu)CrossFireBeilstein檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索化合物結(jié)構(gòu)自動進入結(jié)構(gòu)將化合物結(jié)構(gòu)Copy到“Querybuilder”CrossFireBeilstein檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索

將化合物結(jié)構(gòu)Copy到“Querybuilder”后開始檢索CrossFireBeilstein檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索結(jié)果顯示選擇“Viewall”查看該化合物全部信息CrossFireBeilstein檢索—子結(jié)構(gòu)檢索畫出子結(jié)構(gòu)在“Generics”中選取

Beilstein

定義的廣義基團定義取代基的位置CrossFireBeilstein檢索—子結(jié)構(gòu)檢索進行子結(jié)構(gòu)檢索CrossFireBeilstein檢索—子結(jié)構(gòu)檢索結(jié)果顯示顯示紅色的部分為檢索的子結(jié)構(gòu)CrossFireBeilstein檢索—保存/打開結(jié)構(gòu)提問用“SaveQuery”保存提問結(jié)構(gòu)用“OpenQuery”復制提問結(jié)構(gòu)CrossFireBeilstein檢索—反應(yīng)檢索

例：檢索亞胺生成唑烷的反應(yīng)途徑

利用結(jié)構(gòu)檢索建立檢索條件CrossFireBeilstein檢索—反應(yīng)檢索

選取反應(yīng)模式繪制結(jié)構(gòu)分別選中化合物分子結(jié)構(gòu),點擊“Reactant”,”Product”CrossFireBeilstein檢索—反應(yīng)檢索

命中176Reactions

CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索

利用結(jié)構(gòu)/預定義表格建立聯(lián)合檢索條件例：檢索亞胺生成唑烷的反應(yīng)，產(chǎn)率>80%CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索

命中21ReactionsCrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)的聯(lián)合檢索檢索對氯苯甲酰氯的合成方法及NMR數(shù)據(jù)CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)聯(lián)合檢索結(jié)果CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索選擇“substanceasProductonly”CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索超鏈接化合物的合成反應(yīng)反應(yīng)數(shù)據(jù)CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索超鏈接反應(yīng)物的信息超鏈接反應(yīng)物的合成反應(yīng)CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索超鏈接反應(yīng)物的信息CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索

超鏈接至起始反應(yīng)物CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索

選擇“ShowHitsetHistory”查看歷史記錄CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索歷史記錄了反應(yīng)的反合成路線CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索對氯苯甲酰氯的NMR數(shù)據(jù)以高亮背景顯示CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索輸入化合物關(guān)鍵詞選擇需要檢索的內(nèi)容可以限定選項的具體數(shù)值例：查詢PE的“MeltingPoint”,”Density”信息關(guān)鍵詞和數(shù)據(jù)的聯(lián)合檢索CrossFireBeilstein檢索—聯(lián)合檢索選擇“ViewHit”，檢索結(jié)果只顯示符合查詢條件的數(shù)據(jù)內(nèi)容符合查詢條件的內(nèi)容以背景顏色顯示CrossFireBeilstein檢索—檢索結(jié)果導出

選擇以不同的格式導出全部檢索記錄CrossFireBeilstein檢索—檢索結(jié)果導出

選擇“CompoundIDtoExcellasTable”的導出格式CrossFireBeilstein檢索—檢索結(jié)果導出

在Report中打開導出的檢索結(jié)果CrossFireBeilstein檢索—檢索結(jié)果報告生成

選中檢索記錄內(nèi)容用“CopytoReport”,以不同格式導出CrossFireBeilstein檢索—檢索結(jié)果報告生成

在Report中打開部分導出的檢索記錄CrossFireBeilstein檢索—定制跟蹤服務(wù)

建立檢索條件后點擊“CrearAlert”CrossFireBeilstein檢索—定制跟蹤服務(wù)

填寫電子郵件地址等信息CrossFireBeilstein檢索—結(jié)構(gòu)式的自動標準命名

點擊“AutoNom”給出化學結(jié)構(gòu)在“Option”中選擇命名時參考的環(huán)系點擊“GenerateName”,產(chǎn)生自動結(jié)構(gòu)命名CrossFireGmelin檢索——選擇數(shù)據(jù)庫選擇數(shù)據(jù)庫CrossFireGmelin檢索——數(shù)據(jù)域數(shù)據(jù)域——SearchFieldCrossFireGmelin檢索——數(shù)據(jù)域CrossFireGmelin檢索——預定義表格

預定義的檢索表格——PredefinedSearchFormCrossFireGmelin檢索

在SearchFieldName中查詢合金的數(shù)據(jù)域名稱例1：查詢Cr的重量百分比在15-31%的鎳鉻合金數(shù)據(jù)，檢索結(jié)果含有熱膨脹的相關(guān)數(shù)據(jù)CrossFireGmelin檢索

在SearchFieldName中查詢熱膨脹數(shù)據(jù)域名稱CrossFireGmelin檢索

以“HitOnly”顯示與檢索條件匹配的數(shù)據(jù)CrossFireGmelin檢索Drawstructure利用結(jié)構(gòu)進行反應(yīng)檢索例2：查詢Cp2ZrCl2(茂金屬催化劑）的合成信息及催化作用信息、相關(guān)文獻（結(jié)構(gòu)已知）CrossFireGmelin檢索

檢索結(jié)果CrossFireGmelin檢索

ReactionDetails化合物(Products)信息的超鏈接Ref提供數(shù)據(jù)依