演示文稿蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

（優(yōu)選）蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)當(dāng)前1頁(yè)，總共28頁(yè)。3.4蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)164預(yù)測(cè)目的：看一看所提交的蛋白質(zhì)序列在哪里會(huì)形成α-螺旋和β-折疊？現(xiàn)階段：準(zhǔn)確率不高。當(dāng)前2頁(yè)，總共28頁(yè)。3.4.1SOPMA網(wǎng)址：

2)Clickhere.1)Pasteyoursequencehere.當(dāng)前3頁(yè)，總共28頁(yè)。Example3-23對(duì)下面的蛋白質(zhì)序列做二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGPEGERPARFTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ當(dāng)前4頁(yè)，總共28頁(yè)。ResultofSOPMA(1/2)當(dāng)前5頁(yè)，總共28頁(yè)。ResultofSOPMA(2/2)當(dāng)前6頁(yè)，總共28頁(yè)。3.4.2PredictProtein(1/6)166網(wǎng)址：

Clickhere當(dāng)前7頁(yè)，總共28頁(yè)。PredictProtein(2/6)8879705988797059ShengwuJishuThenclickhere當(dāng)前8頁(yè)，總共28頁(yè)。PredictProtein(3/6)Clickhere當(dāng)前9頁(yè)，總共28頁(yè)。PredictProtein(4/6)88797059Thenclickhere當(dāng)前10頁(yè)，總共28頁(yè)。PredictProtein(5/6)Clickhere當(dāng)前11頁(yè)，總共28頁(yè)。PredictProtein(6/6)Study1Thenclickhere.Pasteyoursequencehere.當(dāng)前12頁(yè)，總共28頁(yè)。Example3-24165對(duì)下面的序列進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析。MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGPEGERPARFTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ當(dāng)前13頁(yè)，總共28頁(yè)。Wait...(about5minutes)Clickhere當(dāng)前14頁(yè)，總共28頁(yè)。Toreceiveyouremail將該網(wǎng)址復(fù)制后粘貼到網(wǎng)頁(yè)瀏覽器中打開當(dāng)前15頁(yè)，總共28頁(yè)。預(yù)測(cè)結(jié)果目錄當(dāng)前16頁(yè)，總共28頁(yè)。圖3.87對(duì)序列進(jìn)行PROSITE搜索蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn)S/T-R/K酪蛋白激酶II磷酸化位點(diǎn)S/T--D/E酪氨酸激酶磷酸化位點(diǎn)十四烷?；稽c(diǎn)當(dāng)前17頁(yè)，總共28頁(yè)。圖3.88SEG搜索的低復(fù)雜度序列是指編碼這些氨基酸的DNA序列為低復(fù)雜度序列當(dāng)前18頁(yè)，總共28頁(yè)。圖3.89ProDom搜索結(jié)果當(dāng)前19頁(yè)，總共28頁(yè)。PSI-BLAST搜索結(jié)果當(dāng)前20頁(yè)，總共28頁(yè)。圖3.90以MSF格式顯示比對(duì)(1/2)當(dāng)前21頁(yè)，總共28頁(yè)。圖3.90以MSF格式顯示比對(duì)(2/2)當(dāng)前22頁(yè)，總共28頁(yè)。圖3.91PROF預(yù)測(cè)結(jié)果（普通）

AA:

氨基酸OBS_sec:

二級(jí)結(jié)構(gòu)的觀測(cè)值PROF_sec:

預(yù)測(cè)的二級(jí)結(jié)構(gòu)Rel_sec:

預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)的可信度SUB_sec:

預(yù)測(cè)的二級(jí)結(jié)構(gòu)的集合H:

螺旋E:

折疊L:

隨機(jī)卷曲O_3_acc:

相對(duì)親水表面的觀測(cè)值P_3_acc:

預(yù)測(cè)的相對(duì)親水表面(b

=0~9%,

i=9%~36%,

e=36%~100%)Rel_acc:

預(yù)測(cè)親水表面的可信度SUB_sec:

預(yù)測(cè)的親水表面的集合當(dāng)前23頁(yè)，總共28頁(yè)。PROF預(yù)測(cè)結(jié)果（詳細(xì)）

當(dāng)前24頁(yè)，總共28頁(yè)。圖3.92球蛋白預(yù)測(cè)當(dāng)前25頁(yè)，總共28頁(yè)。Practice把剛才課堂上講的內(nèi)容練習(xí)一遍。當(dāng)前26頁(yè)，總共28頁(yè)。SummarySOPM