醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索與利用a 第2講pubmed檢索-交大醫(yī)2014版新教材

第二講

文摘型生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)信息資源中心醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索教研室1精選課件主講內(nèi)容MEDLINE&PubMed檢索系統(tǒng)SinoMed中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)服務(wù)系統(tǒng)EM&EMB荷蘭醫(yī)學(xué)文摘BA&BIOSISPreviews美國(guó)生物學(xué)文摘

(基于OVID/ISIWebofKnowledge系統(tǒng)平臺(tái))CA&SciFinderScholar美國(guó)化學(xué)文摘CINAHL美國(guó)護(hù)理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)2精選課件數(shù)據(jù)庫(kù)檢索

AP153精選課件一、PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)下屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開(kāi)發(fā)的、基于WWW的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢系統(tǒng)。網(wǎng)址：http://www.

/pubmed4精選課件PUBMED免費(fèi)5000種左右來(lái)源期刊,其中英文期刊約占85%2000萬(wàn)余條高質(zhì)量的文獻(xiàn)題錄/摘要每日完成來(lái)自全球的檢索>200萬(wàn)次醫(yī)學(xué)\護(hù)理\牙科\獸醫(yī)\保健\臨床前生命科學(xué)的期刊全文鏈接超過(guò)3000+種數(shù)據(jù)更新迅速:每日更新（星期二—星期六）特點(diǎn)：收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備，可部分獲取原文。5精選課件二、通過(guò)PubMed可檢索如下信息

oldMedlineMEDLINEPreMedline

出版商提供的書目信息

NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄6精選課件oldMedline1950-1965年間發(fā)表的200多萬(wàn)篇文獻(xiàn)沒(méi)有MeSH字段和摘要記錄中用[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]標(biāo)記表示。7精選課件MEDLINE

是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館MEDLARS系統(tǒng)中最大的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄1966年以來(lái)70多個(gè)國(guó)家4000種左右生物醫(yī)學(xué)期刊的書目信息和著者文摘，每周更新。每條記錄均帶有[PubMed--IndexedforMEDLINE]標(biāo)志。8精選課件收集未正式給予MeSH詞、出版類型等深度標(biāo)引信息的一個(gè)臨時(shí)庫(kù)。NLM每天把最新記錄加入到PreMedline庫(kù)中，每條記錄均帶有[PubMed--inProcess]標(biāo)志。工作人員在一周內(nèi)將這些記錄標(biāo)引，然后轉(zhuǎn)入MEDLINE，同時(shí)從PreMedline中刪去。PreMedline9精選課件Pre-MedlineMedlineNewDataCollectPubMedProcess10精選課件出版商提供的書目信息出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分沒(méi)有被MEDLINE收錄，PubMed仍保存，在記錄中做如下標(biāo)記：[PubMed--assuppliedbypublisher]

。11精選課件PubMed建立了與NCBI其他數(shù)據(jù)庫(kù)之間聯(lián)系。它們是雙向網(wǎng)絡(luò)互連的關(guān)系（見(jiàn)下頁(yè)圖）。NCBI其它數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)記錄12精選課件13精選課件Affiliation[AD]ArticleIdentifier[AID]AllFields[ALL]Author[AU]Book[book]CommentCorrectionsCorporateAuthor[CN]CreateDate[CRDT]CompletionDate[DCOM]EC/RNNumber[RN]Editor[ED]EntrezDate[EDAT]Filter[FILTER]FirstAuthorName[1AU]FullAuthorName[FAU]FullInvestigatorName[FIR]GrantNumber[GR]Investigator[IR]ISBN[ISBN]Issue[IP]Journal[TA]Language[LA]LastAuthor[LASTAU]LocationID[LID]MeSHDate[MHDA]MeSHMajorTopic[MAJR]MeSHSubheadings[SH]MeSHTerms[MH]ModificationDate[LR]NLMUniqueID[JID]OtherTerm[OT]OwnerPagination[PG]PersonalNameasSubject[PS]PharamcologicalAction[PA]PlaceofPublication[PL]PMID[PMID]Publisher[PUBN]PublicationDate[DP]PublicationType[PT]SecondarySourceID[SI]Subset[SB]SupplementaryConcept[NM]TextWords[TW]Title[TI]Title/Abstract[TIAB]TransliteratedTitle[TT]UID[PMID]Volume[VI]三、PubMed記錄字段說(shuō)明精選課件四、PubMed基本檢索自由詞檢索組合檢索字段限制檢索著者檢索刊名檢索日期或日期范圍檢索

……截詞檢索強(qiáng)制檢索15精選課件PubMed基本檢索

在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)英文單詞（大寫或小寫均可），點(diǎn)擊檢索按鈕，PubMed系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在主題詞表，期刊名表，短語(yǔ)表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動(dòng)詞匯匹配功能”。自由詞檢索16精選課件PubMed對(duì)輸入檢索框中的檢索詞進(jìn)行智能化地校對(duì)，將其逐步地與其數(shù)據(jù)庫(kù)中的各類術(shù)語(yǔ)匹配的原則。MeSHTranslationTable主題詞注釋表JournalsTranslationTable期刊注釋表CommonPhraseList常用詞組表AuthorIndex作者索引表NoMapping檢索詞拆分AND自動(dòng)詞匯匹配17精選課件備注：

如果在上述4個(gè)表或索引中仍找不到相匹配的詞時(shí)，PubMed就將短語(yǔ)劈開(kāi)，再重復(fù)以上順序單獨(dú)分別查找，直到找到相匹配的詞。如果仍找不到匹配詞，則用AND將短語(yǔ)中的單個(gè)詞連接起來(lái)在全部字段中查找。例：檢索h1n1influenza轉(zhuǎn)換為:

h1n1[AllFields]AND("influenza,human"[MeSHTerms]OR("influenza"[AllFields]AND"human"[AllFields])OR"humaninfluenza"[AllFields]OR"influenza"[AllFields])18精選課件PubMed主頁(yè):h1n1influenza19精選課件結(jié)果篩選檢索表達(dá)式結(jié)果處理結(jié)果顯示20精選課件21精選課件Medline顯示格式22精選課件PubMed基本檢索組合檢索，常用的邏輯關(guān)系詞有AND,OR,NOT等。ABAB

邏輯與（AND）--檢出記錄中同時(shí)含有檢索詞A和檢索詞B.

如：AANDB

邏輯非（NOT）--在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。如：ANOTB

邏輯或（OR）--檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時(shí)含有檢索詞A和B的文獻(xiàn)。如：AORBAB23精選課件PubMed基本檢索

采用字段限制方式進(jìn)行檢索，檢索規(guī)則：檢索詞[字段標(biāo)識(shí)]或“檢索詞組”[字段標(biāo)識(shí)]字段限制檢索24精選課件例：查找作者為crick在1993年發(fā)表有關(guān)DNA方面的文獻(xiàn).

檢索式：DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]25精選課件PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識(shí)(1)Title[ti]：篇名字段Abstract[ab]：摘要字段Affiliation[ad]：著者地址字段。Authorname[au]：文章的作者，檢索格式：姓+名。如："smithja"[au]Journaltitle[ta]：期刊名稱。如：cell[ta]Language[la]：論文出版語(yǔ)種。語(yǔ)種檢索時(shí)可只輸入前3個(gè)字母，如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)檢索式:hypertension[ti]ANDchi[la]26精選課件例：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)檢索式：hypertension[ti]ANDchi[la]27精選課件PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識(shí)(2)Publicationdate[dp]:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為：YYYY/MM/DD[DP]要檢索一段時(shí)期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號(hào)，如：1993/01:1995/06[DP]Publicationtype[pt]:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗(yàn)等。如：review[pt]MeSHterms[mh]：主題詞字段。如：hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主題詞。與主題詞組配檢索.28精選課件PubMed基本檢索

按照姓氏+空格+名首字母縮寫（不用標(biāo)點(diǎn)）的格式鍵入作者姓名，如：smithja或jonesk,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。姓名第一個(gè)字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫?？紤]到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行作者姓名檢索，如：smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索：可以用雙引號(hào)將作者名引起來(lái)，再加作者字段限定[AU]，如："smithj"[au]，這樣可避免PubMed自動(dòng)轉(zhuǎn)換，實(shí)現(xiàn)精確查找。作者姓名檢索29精選課件PubMed基本檢索作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫)，之間不用標(biāo)點(diǎn)鍵入作者姓名smithj30精選課件PubMed基本檢索精確檢索避免PubMed自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換，實(shí)現(xiàn)精確查找"smithj"[au]31精選課件PubMed基本檢索在檢索框中鍵入期刊名，如：Europeanjournalofimmunology，系統(tǒng)的“自動(dòng)詞語(yǔ)匹配”功能會(huì)將它轉(zhuǎn)換成“EurJImmunol[journal]”進(jìn)行檢索。也可直接輸入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式EurJImmunol，或輸入該刊的ISSN號(hào)（國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版物代碼）檢索，即：1521-4141。如果一個(gè)雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞，如：cancer，science，cell等，PubMed會(huì)首先將這些詞轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中的主題詞進(jìn)行檢索。因此，需要將檢索請(qǐng)求進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理，即

：“cell”[journal]或“cell”[ta]。期刊檢索32精選課件PubMed基本檢索期刊的一般檢索，是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號(hào)EurJImmunol33精選課件PubMed基本檢索

截詞檢索的作用：擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率。截詞符：

*

----代表零到多個(gè)字符，只可用于詞尾。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria，bacteriophage，bacterium等單詞。截詞檢索34精選課件PubMed基本檢索截詞檢索可以擴(kuò)大檢索范圍提高查全率。bacter*[TI]35精選課件PubMed基本檢索PubMed允許使用雙引號(hào)來(lái)強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語(yǔ)檢索。如：在PubMed主頁(yè)的檢索提問(wèn)框中鍵入“singlecell”，并用雙引號(hào)引起來(lái)。點(diǎn)擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會(huì)將其作為一個(gè)不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫(kù)的全部字段中進(jìn)行檢索。如果不使用雙引號(hào)進(jìn)行強(qiáng)制檢索，系統(tǒng)就會(huì)將其分成2個(gè)詞：single和cell檢索，其檢索表達(dá)式為：singleANDcell.很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號(hào)要求的。強(qiáng)制檢索36精選課件PubMed基本檢索強(qiáng)制檢索普通檢索"singlecell"singlecell37精選課件MeSHDatabase五、MeSH檢索例：請(qǐng)檢索有關(guān)中草藥治療胃癌方面的文獻(xiàn)。38精選課件通過(guò)Herbal,plantdrugs,Chinesedrugs,Chineseplant,Chineseherbal等均可檢索到中草藥的MESH詞。39精選課件("Drugs,ChineseHerbal/therapeuticuse"[Mes