明確感染患者源快速鑒定血液

一、明確患者源快速鑒樣本和前應(yīng)做好相關(guān)記錄，記錄內(nèi)容包括：受檢者、、、臨床診斷、送檢標(biāo)本、檢驗(yàn)項(xiàng)目、標(biāo)本年月日時、申請醫(yī)生及采樣者簽名等。針對此類優(yōu)先血液樣本。耗材需要確保無DNaseRNase污染。在發(fā)熱初期或發(fā)熱期和使用或更換抗生素前標(biāo)本，對已使用抗生素者，應(yīng)在下次用藥前或血液藥物濃度最低峰時。時使用5mLEDTA采血管進(jìn)行。A、采用600g轉(zhuǎn)速離心10min后，分離上清轉(zhuǎn)移至新2mLEP管中立即置于-80度保B、將A離心后剩余下層樣本中加入10mL1XPBS，加入5mLFicollbuffer勻后，2000rpm離心20min，分離PBMC細(xì)胞后加入10mL1XPBS1000rpm離心10min洗脫2次，C、將分離后PBMC分離成為2份，一份加入等量Trizol保存，另外一份PBMC樣本直接肺泡液（編碼規(guī)則：yymmdd（日期）L（肺泡）001（編號，唯需取支氣管肺泡液，則將痰液收集器連于氣管鏡，緩慢注入10ml無菌生理鹽水于管腔中，經(jīng)過3-4次后，將痰液收集器中的標(biāo)本送檢，建議至少3-4mL肺泡液，分離后立即-80度保存。樣所有樣本將使用干冰至華大醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所進(jìn)行檢測樣本提取和準(zhǔn)RNA提RNARNA文庫構(gòu)DNA加入通用接頭后進(jìn)行PCR擴(kuò)PCRAgilent2100PCR樣本檢2Agilent2100使用BGISEQ-100儀器和進(jìn)行高通量，預(yù)計(jì)每個樣本數(shù)據(jù)產(chǎn)量樣本數(shù)據(jù)分分析結(jié)TotaldataMaptohumanMaptoBacteriaMaptoMaptoFungus病原名中文GenBank編覆蓋覆蓋百深ReadssputidaDOT-惡臭假單胞 未分類酵 黑粉 8eriumacnesATCC11828痤瘡丙酸桿 備注：GenBank編號表示參考病原組的編號；覆蓋度是指獲得的序列占整個組的比例深度是指得到的堿基總量(bp)與組大小(Genome)的比值，它是評價量的指標(biāo)之一；ReadsReads病原名GenBank編名變異位變異類功能變序微生物微生物亞型/株覆蓋豐12·檢測內(nèi)衣原體、支原體、立克次體等、110余種與人相關(guān)的（包括580余種亞型）以及14種人相關(guān)的真菌?？蓹z測出臨床樣本中各種微病原體關(guān)鍵變異分析：檢測微生物組的變異位點(diǎn)，根據(jù)變異對基檢測方法與局限低，而難以得到其全組序列，因