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重組DNA技術(shù)1第八章基因工程
23456基因工程的應(yīng)用7
首字母:大寫:細(xì)菌屬名2-3字母:小寫:細(xì)菌種名如EcoR14:大寫:菌株1,2…:分離到的次序第一節(jié)、工具酶一、限制酶(restrictionenzyme):限制性內(nèi)切酶1類:限制和修飾作用
*2類:識別DNA內(nèi)部位點(diǎn)、切割雙鏈3類:同類.根據(jù)酶結(jié)構(gòu)、作用及DNA結(jié)合和裂解的特性1、分類2、命名89(2)產(chǎn)生平末端(bluntend):3.酶的識別和切割位點(diǎn):通常4-6bp,具有回文結(jié)構(gòu)(palindrom)(1)產(chǎn)生粘性末端(stickingend)5'-末端:EcoR1:5'-G
AATTC-3'3'-CTTAA
G-5’3'-末端:Pst1:5'-CTGCA
G-3'3'-G
ACGTC-5'
Sma1:5'-CCC
GGG-3'3'-GGG
CCC-5'105.同尾酶(isoaudamers):識別序列不同,但產(chǎn)生相同的粘性末端BamH1:G
GATCCSau3A1:N
GATCN4.同功異源酶(isochizomers):來源不同,識別和切割位點(diǎn)相同
如:BamH1
和Bst1111、DNA聚合酶
大腸桿菌中第一個(gè)發(fā)現(xiàn),MW109KD方向:5'
3'還具有5‘
3’及3‘
5’外切酶活性.缺口平移法標(biāo)記DNA時(shí)常用二修飾酶對DNA或RNA末端進(jìn)行剪切、補(bǔ)平、連接及化學(xué)修飾的酶。12兩類:禽類成骨細(xì)胞性白血病病毒逆轉(zhuǎn)錄酶(AMV)moloney小鼠白血病病毒逆轉(zhuǎn)錄酶(MMLV)
方向:5‘
3’作用:以RNA為模板合成DNA,構(gòu)建cDNA文庫2、逆轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase)將3'-OH與5'-P連接形成3',5'-磷酸二酯鍵3、T4DNA連接酶(T4DNAligase)134、堿性磷酸酶(alkalinephosphatase)6、TaqDNA聚合酶和其它耐熱DNA聚合酶去除DNAorRNA5'-P,制備載體時(shí)可防止載體自身連接,提高重組效率。5、末端脫氧核苷酰轉(zhuǎn)移酶:末端轉(zhuǎn)移酶作用:在DNA的3'-OH上,加上dNTPPCR時(shí)14內(nèi)切酶、堿性磷酸酶、連接酶的作用15*分類:克隆載體 質(zhì)粒入噬菌體粘性質(zhì)粒M13噬菌體表達(dá)載體 大腸桿菌表達(dá)載體哺乳動物表達(dá)載體第二節(jié)載體*本質(zhì):DNA攜帶外源DNA進(jìn)入受體細(xì)胞的運(yùn)載工具。16質(zhì)粒載體 大腸桿菌質(zhì)粒載體PBR322枯草桿菌質(zhì)粒載體PNC3酵母菌質(zhì)粒載體農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒載體Ti噬菌體載體
噬菌體載體Cos噬菌體載體病毒載體SV40病毒載體乳頭瘤病毒載體17⑴分子量相對較小,在細(xì)菌中穩(wěn)定存在,拷貝指數(shù)高。⑵具有遺傳標(biāo)記:如抗生素性基因
—半乳糖酶基因(LacZ)⑶具有多個(gè)酶的單一切點(diǎn)。稱多克隆位點(diǎn)(multiplecloningsites,MCS)如PBR322(人工合成)4.3Kb:含AmP
(氨卞青霉素)、Tet
(四環(huán)素)24個(gè)單一切點(diǎn)一常用的克隆載體1. 質(zhì)粒(plasmid):種類很多,但作為克隆載體須具備。18PBR32219質(zhì)粒的構(gòu)建20質(zhì)粒攜帶外源基因21溶菌性(Lytic):在細(xì)菌中連續(xù)增殖直到細(xì)菌裂時(shí),釋放噬菌體。溶原性(Lysogenic):將其DNA整入細(xì)菌中。**只有雙鏈DNA的噬菌體才具有溶原周期。2.
噬菌體:最大容量:9—23kb感染細(xì)菌的病毒根據(jù)生活周期分⑴特點(diǎn)① 雙鏈DNA分子(線性或環(huán)形)② 兩端具有12個(gè)nt單鏈互補(bǔ)粘性末端③具非必需區(qū)(中間區(qū)約1/3長度)④可在E.Coli中大量繁殖⑤可克隆15Kb左右的外源基因22噬菌體的溶原周期和溶菌周期2324插入型載體:外源DNA克隆到
分子上,使噬菌體的某種生物功能喪失效力,即插入失活效應(yīng)。
如:
—半乳糖酶失活的插入型載體(藍(lán)白篩選)編碼
⑵載體類型(兩種)A:載體中含一個(gè)LacZ基因
半乳糖苷酶
X-gal(無色)X(藍(lán)色)+gal(半乳糖)*其中X為有色基因:(4-溴-5-氯吲哚)與gal結(jié)合成無色的X-galB:在含X-gal的培養(yǎng)基中,在Lac操縱子誘導(dǎo)物IPTG(異丙硫半乳糖苷)作用下,細(xì)菌合成半乳糖苷酶,分解X-gal,此菌落為藍(lán)色。25C.若LacZ基因被外源DNA插入而破壞,則不能制造半乳糖苷酶,菌落為無色(白色)。26②取代型載體(又叫替換型載體)圖8-4基因工程原理P258在
DNA分子的中央,插入一段DNA片段:具有多克隆位點(diǎn)的反向重復(fù)序列當(dāng)外源DNA插入時(shí)其可被置換掉作用:提高了克隆外源DNA的能力。27*由
DNA的Cos區(qū)與質(zhì)粒構(gòu)建*環(huán)狀雙鏈DNA特點(diǎn);①含質(zhì)粒的抗性標(biāo)記如Amp
,Tet
②帶Cos區(qū),可進(jìn)行體外包裝③一個(gè)或多個(gè)酶切位點(diǎn)④分子量小,容量大/篩選AP平板2、 粘性質(zhì)粒(Cosmid):容量40-50kb282930(1)大腸桿菌噬菌體(2)基因組DNA全長6.5kb(單鏈)(3)感染后,可復(fù)制成雙鏈DNA(RF,DNA)(4)當(dāng)RF→100—200后,只有(+)鏈復(fù)制4種常用載體的比較P146表8—2篩選:藍(lán)白篩選3、 M13噬菌體(M13phage)3132在受體細(xì)胞中表達(dá)(轉(zhuǎn)錄和翻譯)外源基因的載體。二. 表達(dá)載體(expressingvector)㈠大腸桿菌表達(dá)載體除克隆載體的特性外還含有:表達(dá)系統(tǒng)元件啟動子核糖體結(jié)合位點(diǎn)克隆位點(diǎn)轉(zhuǎn)錄終止信號啟動子:常用的有trp-lac啟動子(ortac啟動子)
噬菌體Pc啟動子T7噬菌體啟動子33除含有原核序列:在E-Coli中的復(fù)制起始點(diǎn)、便于篩選的抗性基因還包括真核表達(dá)元件啟動子/增強(qiáng)子克隆位點(diǎn)終止信號和加poly(A)信號㈡哺乳動物表達(dá)載體原核受體E-Coli受體系統(tǒng)外源基因復(fù)制、擴(kuò)增場所鏈霉菌受體系統(tǒng)外源基因表達(dá)場所
酵母菌受體系統(tǒng)真核受體動物(哺乳)細(xì)胞受體系統(tǒng)一般只作基因表植物/昆蟲細(xì)胞受體系統(tǒng)達(dá)場所基因工程的受體系統(tǒng)341.特點(diǎn):①遺傳背景清楚——利于研究②繁殖快——易獲得大量基因產(chǎn)物(20’一代)③含質(zhì)?!诨蜣D(zhuǎn)移④表達(dá)非E-Coli基因,其潛力幾乎是無限的—.E-Coli受體系統(tǒng)2.缺點(diǎn):①高水平表達(dá)基因產(chǎn)物易沉淀、凝集、不易折疊②基因產(chǎn)物純化工藝復(fù)雜③基因產(chǎn)物易受污染(內(nèi)毒素)④基因產(chǎn)物對受體菌有毒害作用⑤基因產(chǎn)物易被水解⑥從安全角度——并不理想⑦缺乏基因產(chǎn)物表達(dá)后加工機(jī)制35特點(diǎn):①安全性大②遺傳信息和生理狀況更適合于真核基因表達(dá)③基因產(chǎn)物外分泌遺傳背景較清楚具基因表達(dá)后加工機(jī)制二.酵母菌受體系統(tǒng)36⑴目的基因的獲得⑵載體的選擇與制備⑶目的基因與載體的結(jié)合(DNA分子的體外連接)⑷重組DNA導(dǎo)入受體⑸重組體篩選和鑒定⑹目的基因表達(dá)⑺基因產(chǎn)物的分離純化第三節(jié)重組DNA技術(shù)的基本過程七步:37—.目的基因的制備方法:1.內(nèi)切酶法2.機(jī)械力降解3.化學(xué)合成4.cDNA合成5.PCR制備法6.從基因文庫中提取1.限制性內(nèi)切酶法(鳥槍法或散彈法)用酶降解染色體DNA(esp原核生物),將降解的DNA克隆到載體上,從而得到目的基因優(yōu)點(diǎn):原理簡單,操作簡便,具有一定的應(yīng)用范圍。缺點(diǎn):隨機(jī)性有限,盲目性大,篩選麻煩,應(yīng)用范圍有限(只適用于原核生物)382、機(jī)械降解法優(yōu)點(diǎn):隨機(jī)性大缺點(diǎn):所得基因片段不能直接連接,需加工修飾。用超聲波震蕩等機(jī)械法使DNA斷裂。3.cDNA合成cDNA文庫(Cdnalibrary):將一個(gè)細(xì)胞中,所有cDNA都與載體連接成重組DNA,并列入宿主細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)
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