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文檔簡介
“未來的世界:方向比努力重要,能力比知識重要,健康比成績重要,生活比文憑重要,情商比智商重要!”
——清華大學(xué)校長留給畢業(yè)生的一段話第四章
核酸化學(xué)NucleicAcidchemistry核酸是一類以核苷酸為基本組成單位的重要的生物大分子,擔(dān)負著生命信息的儲存與傳遞。核酸是現(xiàn)代生物化學(xué)、分子生物學(xué)的重要研究領(lǐng)域,是基因工程操作的核心分子。第一節(jié)核酸概述一、核酸的研究發(fā)現(xiàn)史1869年Miescher博士論文工作中測定淋巴細胞蛋白質(zhì)組成時,發(fā)現(xiàn)了不溶于稀酸和鹽溶液的沉淀物,并在所有細胞的核里都找到了此物質(zhì),故命名核質(zhì)(Nuclein)。1879年Kossel經(jīng)過10年的努力,搞清楚核質(zhì)中有四種不同的組成部分:A,T,C和G。1889年Altman建議將核質(zhì)改名為“核酸”,并且已經(jīng)認識到“核質(zhì)”乃“核酸”與蛋白質(zhì)的復(fù)合體。
1909年Levene發(fā)現(xiàn)酵母的核酸含有核糖。
1930年Levene發(fā)現(xiàn)動物細胞的核酸含有一種特殊的核糖即脫氧核糖,得出了一個錯誤概念:植物核酸含核糖,動物核酸含脫氧核糖。這個錯誤概念一直延續(xù)到1938年,這時方清楚RNA和DNA的區(qū)別。Levene還提出了核酸的“磷酸-核糖(堿基)-磷酸”的骨架結(jié)構(gòu),解決了DNA分子的線性問題,還在1935年提出“四核苷酸”學(xué)說,認為這四種核苷酸的聚合體是構(gòu)成核酸的基本單位。1944年Avery重做1928年Griffith的細菌轉(zhuǎn)化實驗,證明DNA是遺傳物質(zhì)。1928年Griffith的細菌轉(zhuǎn)化實驗1944年Avery重做1928年Griffith的細菌轉(zhuǎn)化實驗,證明DNA是遺傳物質(zhì)。但人們對此持懷疑態(tài)度,理由是:(1)因認為蛋白相對分子質(zhì)量大,結(jié)構(gòu)復(fù)雜,二十種氨基酸的排列組合將是個天文數(shù)字,可作為一種遺傳信息。而DNA相對分子質(zhì)量小,只含4種不同的堿基,人們一度認為不同種的有機體的核酸只有微小的差異。(2)認為轉(zhuǎn)化實驗中DNA并未能提得很純,還附有其它物質(zhì)。(3)即使轉(zhuǎn)化因子確實是DNA,但也可能DNA只是對莢膜形成起著直接的化學(xué)效應(yīng),而不是充當(dāng)遺傳信息的載體。
1952年Hershey&Chase的噬菌體感染實驗進一步證明DNA是遺傳物質(zhì)。1952年HersheyandChase的實驗進一步證明DNA是遺傳物質(zhì)
1933年諾貝爾物理學(xué)獎獲得者、奧地利物理學(xué)家薛定諤是量子力學(xué)理論的創(chuàng)建人之一。第二次世界大戰(zhàn)期間,薛定諤逃離了德國納粹統(tǒng)治下的祖國,來到愛爾蘭首都都柏林從事教學(xué)和研究工作。他經(jīng)常到各高等學(xué)府舉辦講座,內(nèi)容并不局限于學(xué)術(shù)領(lǐng)域,更多的是具有科普性質(zhì)的內(nèi)容。其中,生命科學(xué)系列講座特別受到的聽眾的歡迎。1944年,薛定諤把講稿整理成一本不到100頁的小冊子《生命是什么──活細胞的物理學(xué)觀》。書中,他預(yù)言了生命科學(xué)的理論與方法正面臨著重大的突破,生命科學(xué)的研究深度將從生命的表面現(xiàn)象和細胞的層次,深入到分子的水平。他還提出將物理學(xué)、化學(xué)的理論與方法引進生命科學(xué)的研究之中。發(fā)動生物學(xué)革命的物理學(xué)家
一大批年輕的物理學(xué)家或物理學(xué)專業(yè)的大學(xué)生被它吸引到生命科學(xué)的學(xué)習(xí)與研究之中,其中就有因建立DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型榮獲1962年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎的沃森、克里克和威爾金斯,因發(fā)現(xiàn)噬菌體在細胞內(nèi)增殖過程中的作用榮獲1969年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎的盧里亞,因完成世界首次分子水平上的基因重組、創(chuàng)立現(xiàn)代基因工程技術(shù)而榮獲1980年諾貝爾化學(xué)獎的伯格,因發(fā)現(xiàn)核糖核酸(RNA)的細胞催化功能而榮獲1989年諾貝爾化學(xué)獎的奧爾特曼等人。因而,這本書被人們稱為從思想上“喚起生物學(xué)革命的小冊子”。喚起生物學(xué)革命的小冊子探索DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的競賽50年代初,人們已普遍承認DNA是最重要的遺傳物質(zhì),遺傳信息就存儲在DNA分子多核苷酸鏈上的4種堿基的特定序列上,進一步闡明其結(jié)構(gòu)和功能已成為迫切的任務(wù)。這時,有三組科學(xué)家在進行DNA結(jié)構(gòu)的研究,他們是:美國加州理工學(xué)院的鮑林,英國劍橋大學(xué)國王學(xué)院的富蘭克琳與威爾金斯,劍橋大學(xué)卡文迪什實驗室的沃森與克里克。實力與智慧的科學(xué)競賽鮑林(1901-1994)是美國著名化學(xué)家,1931年就將量子力學(xué)用于化學(xué)領(lǐng)域,闡明了化學(xué)鍵的本質(zhì),這使他后來獲得了1954年諾貝爾化學(xué)獎。1950年,他首先闡明并發(fā)現(xiàn)了氨基酸鏈的α螺旋狀結(jié)構(gòu)。此后,鮑林又投入了DNA結(jié)構(gòu)的研究。他是最早認定DNA分子具有與氨基酸鏈類似的螺旋結(jié)構(gòu)的科學(xué)家,而且研究的環(huán)境最優(yōu)越,但他錯誤地認為DNA分子是由三股螺旋組成的,這使他誤入歧途。倫敦國王大學(xué)莫里斯?威爾金斯教授
英國女生物學(xué)家富蘭克琳(1920~1958)是最早認定DNA具有雙螺旋結(jié)構(gòu)的科學(xué)家,并且運用X射線衍射技術(shù)拍攝到了清晰而優(yōu)美的DNA照片,為探明其結(jié)構(gòu)提供了重要依據(jù),她還精確地計算出DNA分子內(nèi)部結(jié)構(gòu)的軸向與距離。而英國生物物理學(xué)家威爾金斯(1916~)則計算出DNA分子螺旋的直徑與長度。他們二人還對DNA分子的結(jié)構(gòu)作出了確切而關(guān)鍵性的描述:磷酸根在螺旋的外側(cè),堿基在螺旋內(nèi)側(cè)。英國劍橋大學(xué)國王學(xué)院1946年就設(shè)立了DNA結(jié)構(gòu)研究室,富蘭克琳與威爾金斯擁有充足的經(jīng)費和先進的技術(shù)設(shè)備,他們與成功地建立DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型只有咫尺之遙,但卻未能跨出最后也是最關(guān)鍵的一步。這一方面是因為他們認為探索DNA結(jié)構(gòu)的惟一途徑是使用晶體學(xué)和數(shù)學(xué)計算的方法,拒絕采用建立結(jié)構(gòu)模型的方法;另一方面是由于人際關(guān)系等方面的因素。在英國劍橋大學(xué)國王學(xué)院的實驗室中,富蘭克琳雖然是惟一適合運用X射線衍射技術(shù)研究DNA結(jié)構(gòu)的科學(xué)家,但她發(fā)現(xiàn)自己是處于一種對女科學(xué)家充滿敵意的環(huán)境中,很難與同行們進行討論與交流,并且她與后來派來做她上司的威爾金斯關(guān)系不融洽。富蘭克林對DNA的研究工作取得了重要進展,卻被有關(guān)方面要求停止這方面的進一步研究。1951年她離開了國王學(xué)院,到倫敦大學(xué)伯克貝克學(xué)院從事病毒結(jié)構(gòu)的研究。雖然威爾金斯還邀請她繼續(xù)參與DNA的研究,但這些因素還是對他們二人的工作產(chǎn)生了不利的影響。在很長一段時期,富蘭克林的工作沒有得到應(yīng)有的承認。到1951年9月,富蘭克琳與威爾金斯在DNA結(jié)構(gòu)的研究上已經(jīng)非常接近勝利的終點了。就在這時,出現(xiàn)了兩個年輕的競爭者??死锟耍?916~)在大學(xué)學(xué)的是物理專業(yè),畢業(yè)后攻讀物理學(xué)研究生。第二次世界大戰(zhàn)爆發(fā)后,他中斷學(xué)業(yè)參軍。戰(zhàn)后,受薛定諤的《生命是什么?》一書的影響,轉(zhuǎn)而學(xué)習(xí)生物學(xué),1949年進入劍橋大學(xué)卡文迪什實驗室?guī)煆挠肿由飳W(xué)家佩魯茨(1914~)攻讀研究生。1951年,沃森(1928~)在美國獲得博士學(xué)位后,5月份在一次國際大分子結(jié)構(gòu)研討會上聆聽了威爾金斯關(guān)于DNA的X射線衍射研究的報告,引發(fā)了他對這一研究的興趣。9月,他也來到卡文迪什實驗室,在英國著名分子生物學(xué)家肯德魯(1917~1997)的手下進行博士后研究佩魯茨與肯德魯正在合作運用X射線衍射技術(shù)研究血紅蛋白和肌紅蛋白的分子結(jié)構(gòu)。作為他們的學(xué)生和助手,克里克與沃森被安排共用一間辦公室。兩個年輕人都是《生命是什么?》的忠實讀者,又都對從分子生物學(xué)的角度研究遺傳基因感興趣,于是結(jié)成了事業(yè)上的合作伙伴。他們決定進行DNA結(jié)構(gòu)的研究在三組DNA結(jié)構(gòu)研究人員中,沃森和克里克資歷最淺,知識與經(jīng)驗最缺乏,也沒有進行過相關(guān)的實驗,而且DNA結(jié)構(gòu)不是他們的本職研究課題,但他們卻在這場科學(xué)競賽中贏得了勝利克里克與沃森認為:當(dāng)時的X射線晶體衍射技術(shù)水平尚不足以清晰顯示生物大分子較為復(fù)雜的三維圖像,僅靠數(shù)學(xué)計算,難以確定大分子中所有原子的準確位置。如果設(shè)想DNA分子呈螺旋狀,則不妨依據(jù)X射線衍射圖上的幾組數(shù)據(jù),先構(gòu)建出分子模型的大模樣,再不斷調(diào)整其中原子排列的細節(jié),直到其與真實分子的衍射圖十分接近為止,此時得到的即應(yīng)是DNA的實際立體結(jié)構(gòu)。不久,克里克、沃森得知美國化學(xué)家鮑林正是依據(jù)結(jié)構(gòu)化學(xué)的簡單原理,通過構(gòu)建分子模型的途徑,發(fā)現(xiàn)了蛋白質(zhì)多肽鏈的α螺旋結(jié)構(gòu)。這更使他們確信:解決DNA分子結(jié)構(gòu)之路在于構(gòu)建模型。1951年11月,沃森聽了富蘭克琳關(guān)于DNA結(jié)構(gòu)的學(xué)術(shù)報告。沃森和克里克認識到他們要從事DNA的結(jié)構(gòu)分析研究,由于并非他們份內(nèi)的工作,沒有研究經(jīng)費,也沒有從實驗中直接得到數(shù)據(jù)的條件,只能利用別人的數(shù)據(jù)進行分析,從而建立自己分子結(jié)構(gòu)模型。他們很快就提出了一個三股螺旋的DNA結(jié)構(gòu)的設(shè)想。但當(dāng)他們請威爾金斯和富蘭克琳來討論這個模型時,富蘭克琳當(dāng)即指出DNA結(jié)構(gòu)應(yīng)是雙螺旋,而且他們把DNA的含水量少算了一半。這是由于沃森在聽富蘭克琳的報告時沒有做記錄,富蘭克琳估算出DNA分子中每個核苷酸是由8個水分子環(huán)繞著的,而沃森卻用腦子記成了每一段的DNA分子含有8個水分子。于是第一個模型宣告失敗。1952年12月,鮑林宣布建立了DNA分子的結(jié)構(gòu)模型。但他也犯了與沃森、克里克同樣的錯誤,是一個三螺旋模型。沃森、克里克在他們的辦公室里興高采烈地用鐵皮和鐵絲搭建著模型。1953年2月28日,第一個DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的分子模型終于誕生了。雙螺旋模型的意義,不僅意味著探明了DNA分子的結(jié)構(gòu),更重要的是它還提示了DNA的復(fù)制機制:由于腺膘呤總是與胸腺嘧啶配對、鳥膘呤總是與胞嘧啶配對,這說明兩條鏈的堿基順序是彼此互補的,只要確定了其中一條鏈的堿基順序,另一條鏈的堿基順序也就確定了。因此,只需以其中的一條鏈為模版,即可合成復(fù)制出另一條鏈。1953年4月25日,英國著名的科學(xué)期刊《自然》雜志發(fā)表了沃森、克里克的一篇優(yōu)美精煉的短文,宣告了DNA分子雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的誕生。這一期雜志還發(fā)表了富蘭克琳和威爾金斯的兩篇論文,以實驗報告和數(shù)據(jù)分析支持了沃森、克里克的論文。這一年,沃森年僅25歲,克里克也只有37歲,尚未獲得博士學(xué)位。這兩個年輕人之所以超越了其他看似更具實力的競爭者,贏得了這場科學(xué)賽跑的勝利,是由于他們具有清醒的宏觀洞察力、非凡的科學(xué)想像力和嚴密的邏輯思維能力,選擇了正確的研究路線,廣泛借鑒他人的研究成果并加以綜合性的科學(xué)思考。1962年,沃森、克里克與威爾金斯因研究DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的成果,共同榮獲了諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。與諾貝爾獎擦肩而過的女科學(xué)家
1956年富蘭克琳被診斷出患有患癌癥,手術(shù)后她仍堅持研究工作。她于1958年逝世,年僅38歲。4年后,沃森、克里克和威爾金斯因?qū)NA雙螺旋結(jié)構(gòu)的研究成果獲得了諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎,而富蘭克琳榜上無名。因為諾貝爾獎不授予已逝世的科學(xué)家98%核中(染色體中)真核線粒體(mtDNA)核外葉綠體(ctDNA)DNA擬核原核核外:質(zhì)粒(plasmid)病毒:DNA病毒二、核酸的種類和分布
核酸分為兩大類:脫氧核糖核酸(DNA)核糖核酸(RNA)RNA主要存在于細胞質(zhì)中mRNA(信使RNA)MessengerRNA約占總RNA的5%。不同細胞的mRNA的鏈長和分子量差異很大。它的功能是將DNA的遺傳信息傳遞到蛋白質(zhì)合成基地–核糖核蛋白體。主要存在于細胞質(zhì)中RNA
tRNA(轉(zhuǎn)移RNA)TransferRNA約占總RNA的10-15%。它在蛋白質(zhì)生物合成中起翻譯氨基酸信息,并將相應(yīng)的氨基酸轉(zhuǎn)運到核糖核蛋白體的作用。已知每一個氨基酸至少有一個相應(yīng)的tRNA。RNA分子的大小很相似,鏈長一般在73-78個核苷酸之間。rRNA(核糖體RNA)RibosomeRNA約占全部RNA的80%,是核糖核蛋白體的主要組成部分。rRNA
的功能與蛋白質(zhì)生物合成相關(guān)。三、分子生物學(xué)的中心法則第二節(jié)核酸的基本化學(xué)組成
核酸完全水解產(chǎn)生嘌呤和嘧啶等堿性物質(zhì)、戊糖(核糖或脫氧核糖)和磷酸的混合物。核酸部分水解則產(chǎn)生核苷和核苷酸。每個核苷分子含一分子堿基和一分子戊糖,一分子核苷酸部分水解后除產(chǎn)生核苷外,還有一分子磷酸。核酸的各種水解產(chǎn)物可用層析或電泳等方法分離鑒定。主要元素組成:C、H、O、N、P(9~11%)與蛋白質(zhì)比較,核酸一般不含S,而P的含量較為穩(wěn)定,占9-11%。
一、核糖和脫氧核糖OHOH2COHOHOH12OHOH2COHOH12β-D-核糖β-D-2-脫氧核糖O核糖+H+糠醛甲基間苯二酚FeCl3綠色產(chǎn)物Δ脫氧核糖+H+
Δω-羥基-γ-酮戊醛二苯胺藍色產(chǎn)物RNA和DNA定性、定量測定組成核酸的戊糖有兩種。DNA所含的糖為β-D-2-脫氧核糖;RNA所含的糖則為β-D-核糖。二、嘌呤堿和嘧啶堿NNNNHHHHNNNNHHHH123456789嘌呤NH2腺嘌呤adenine(A)NNNNHHHHOH2N鳥嘌呤guanine(G)NNHHHH嘧啶123456NNHHHHNH2OH胞嘧啶Cytosine(C)NNHHHHOOHH尿嘧啶uracil(U)NNHHHHOOHHCH3胸腺嘧啶thymine(T)NNOOHHH酮式HNNOOHHH酮式HHH烯醇式三、核苷(nucleoside)核苷戊糖+堿基
糖與堿基之間的C-N鍵,稱為C-N糖苷鍵1’2’3’4’5’(OH)1’2’3’4’5’(OH)磷酸核苷堿基戊糖核酸→核苷酸(三)核苷OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖NNNNHHHH9OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖OHOH2COHOH1′2′3′4′5′核糖NNOOHHH尿嘧啶H1尿苷NCOONHHH51OH假尿苷(ψ)修飾核苷(modifiednucleoside):也稱稀有核苷(minornucleoside)
修飾核苷包括三種情況:(1)由修飾堿基和糖組成的核苷(2)由非修飾堿基和2-O-甲基核糖組成的核苷(3)由堿基與糖連接方式特殊的核苷四、核苷酸(nucleotide)
核苷酸核苷+磷酸
戊糖+堿基+磷酸
HHHHHHHHH磷酸核苷堿基戊糖核酸→核苷酸(1)一般物理性質(zhì)
無色粉末或結(jié)晶,易溶于水,不溶于有機溶,具旋光性,在酸性溶液當(dāng)中不穩(wěn)定。(2)互變異構(gòu)現(xiàn)象酮式烯醇式
(3)紫外吸收五、核苷酸的性質(zhì)胞嘧啶核苷酸的解離(4)核苷酸的兩性解離和等電點4種核苷酸的解離曲線六、核苷酸衍生物1.ATP類的高能磷酸化合物AMPADPATPATP的性質(zhì)ATP分子的最顯著特點是含有兩個高能磷酸鍵。ATP水解時,可以釋放出大量自由能。ATP是生物體內(nèi)最重要的能量轉(zhuǎn)換中間體。ATP水解釋放出來的能量用于推動生物體內(nèi)各種需能的生化反應(yīng)。ATP也是一種很好的磷?;瘎?。磷?;磻?yīng)的底物可以是普通的有機分子,也可以是酶。磷?;牡孜锓肿泳哂休^高的能量(活化分子),是許多生物化學(xué)反應(yīng)的激活步驟。2.環(huán)化核苷酸
cAMP
cGMPcAMP和cGMPcAMP(3’,5’-環(huán)化腺苷酸)和cGMP(3’,5’-環(huán)化鳥苷酸)的主要功能是作為細胞的第二信使。cAMP和cGMP的環(huán)狀磷酯鍵是一個高能鍵。在pH7.4,cAMP和cGMP的水解能約為43.9KJ/mol,比ATP水解能高得多。3.核苷多磷酸類
DNA分子中各脫氧核苷酸之間的連接方式(3′-5′磷酸二酯鍵)和排列順序叫做DNA的一級結(jié)構(gòu),簡稱為堿基序列。一級結(jié)構(gòu)的走向的規(guī)定為5′→3′。不同的DNA分子具有不同的核苷酸排列順序,因此攜帶有不同的遺傳信息。
一級結(jié)構(gòu)的表示法結(jié)構(gòu)式,線條式,文字式
一級結(jié)構(gòu)測定5′3′第三節(jié)DNA的結(jié)構(gòu)一、DNA的一級結(jié)構(gòu)磷酸核苷堿基戊糖核酸→核苷酸3',5'-磷酸二酯鍵的形成OHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-OO—CH2GO=P—O-3′5′OHOO—CH2OHOHAO=P—OO-3′5′3′5′1′PPPOHATGpGpTpAOHpG-T-ApGTADNA、RNA的一級結(jié)構(gòu)
DNA一級結(jié)構(gòu)5′3′OHOHOH5′3′RNA一級結(jié)構(gòu)DNA酶法序列分析的原理酶反應(yīng)電泳方向模板CCGGTAGCAACT3′5′GG5′3′引物dATPdCTPdGTPdTTP+ddATPdATPdCTPdGTPdTTP+ddTTPdATPdCTPdGTPdTTP+ddGTPdATPdCTPdGTPdTTP+ddCTPGGCCAGGCCATCGTTGAGGCGGCCGGCCATCGGCCATCGTTGGGCCATCGGGCCATGGCCATCGTGGCCATCGTTACGTAGTTGCTACC3′5′TCAACGATGG5′3′讀出模板互補序列讀出模板序列二、DNA的二級結(jié)構(gòu)
DNA的雙螺旋模型1953年,J.Watson和F.Crick在前人研究工作的基礎(chǔ)上,根據(jù)DNA結(jié)晶的X-衍射圖譜和分子模型,提出了著名的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型,并對模型的生物學(xué)意義作出了科學(xué)的解釋和預(yù)測。DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模式圖DNA分子由兩條DNA單鏈組成。DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)是分子中兩條DNA單鏈之間基團相互識別和作用的結(jié)果。雙螺旋結(jié)構(gòu)是DNA二級結(jié)構(gòu)的最基本形式。
DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的特點doublehelixmodelDNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的要點(1)DNA分子由兩條多聚脫氧核糖核苷酸鏈(簡稱DNA單鏈)組成。兩條鏈沿著同一根軸平行盤繞,形成右手雙螺旋結(jié)構(gòu)。螺旋中的兩條鏈方向相反,即其中一條鏈的方向為5′端→3′端,而另一條鏈的方向為3′端→5′端。(2)嘌呤和嘧啶堿基位于螺旋的內(nèi)側(cè),磷酸和脫氧核糖基位于螺旋外側(cè)。堿基環(huán)平面與螺旋軸垂直,糖基環(huán)平面與堿基環(huán)平面成90°角。(3)螺旋橫截面的直徑約為2nm,每條鏈相鄰兩個堿基平面之間的距離為0.34nm,每10個核苷酸形成一個螺旋,其螺矩(即螺旋旋轉(zhuǎn)一圈的高度)為3.4nm。(4)維持兩條DNA鏈相互結(jié)合的力是鏈間堿基對形成的氫鍵。堿基結(jié)合具有嚴格的配對規(guī)律:A與T結(jié)合,G與C結(jié)合,這種配對關(guān)系,稱為堿基互補。A和T之間形成兩個氫鍵,G與C之間形成三個氫鍵。在DNA分子中,嘌呤堿基的總數(shù)與嘧啶堿基的總數(shù)相等。(5)螺旋表面形成大溝(majorgroove)及小溝(minorgroove),彼此相間排列。小溝較淺;大溝較深,是蛋白質(zhì)識別DNA堿基序列的基礎(chǔ)。(6)氫鍵維持雙鏈橫向穩(wěn)定性,堿基堆積力維持雙鏈縱向穩(wěn)定性。小溝大溝DNA的雙螺旋模型特點
兩條反向平行的多聚核苷酸鏈沿一個假設(shè)的中心軸右旋相互盤繞而形成。
磷酸和脫氧核糖單位作為不變的骨架組成位于外側(cè),作為可變成分的堿基位于內(nèi)側(cè),鏈間堿基按A—T,G—C配對(堿基配對原則,Chargaff定律)
螺旋直徑2nm,相鄰堿基平面垂直距離0.34nm,螺旋結(jié)構(gòu)每隔10個堿基對(bp)重復(fù)一次,間隔為3.4nm堿基組成規(guī)則(Chargaff規(guī)則)[A]=[T],[G]=[C];
[A]+[G]=[T]+[C有種屬特異性無組織、器官特異性不受年齡、營養(yǎng)、性別及其他環(huán)境等影響
DNA雙螺旋的穩(wěn)定性DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)在生理條件下很穩(wěn)定。維持這種穩(wěn)定性的因素包括:兩條DNA鏈之間形成的氫鍵,堿基堆積力。雙螺旋結(jié)構(gòu)內(nèi)部形成的疏水區(qū),消除了介質(zhì)中水分子對堿基之間氫鍵的影響;介質(zhì)中的陽離子(如Na+、K+和Mg2+)中和了磷酸基團的負電荷,降低了DNA鏈之間的排斥力等。改變介質(zhì)條件和環(huán)境溫度,將影響雙螺旋的穩(wěn)定性。DNA雙螺旋的種類B型結(jié)構(gòu)兩條鏈反向平行,右手螺旋堿基在內(nèi)(A=T,G≡C)堿基平面垂直于螺旋軸戊糖在外,雙螺旋每轉(zhuǎn)一周為10堿基對(bp)A型結(jié)構(gòu)螺旋變粗變短,螺距2~3nm。Z型結(jié)構(gòu)左手螺旋,只有小溝2.0nm小溝大溝B型雙螺旋DNA的結(jié)構(gòu)特征
三種DNA雙螺旋構(gòu)象比較A-DNAZ-DNAB-DNAABZ外型粗短適中細長螺旋方向右手右手左手螺旋直徑2.55nm2.37nm1.84nm堿基直升0.23nm0.34nm0.38nm堿基夾角32.7034.6060.00每圈堿基數(shù)1110.412軸心與堿基對關(guān)系2.46nm3.32nm4.56nm堿基傾角1901090糖苷鍵構(gòu)象反式反式C、T反式,G順式大溝很窄很深很寬較深平坦小溝很寬、淺窄、深較窄很深螺距不穿過穿過不穿過DNA三鏈間的堿基配對DNA分子內(nèi)的三鏈結(jié)構(gòu)多聚嘌呤多聚嘧啶DNA分子間的三鏈結(jié)構(gòu)三螺旋DNA
三螺旋DNA
TAT
三股螺旋的堿基配對(二)DNA的三級結(jié)構(gòu)雙螺旋進一步扭曲,形成一種比雙螺旋更高層次的空間構(gòu)象。包括:線狀DNA形成的紐結(jié)、超螺旋和多重螺旋、環(huán)狀DNA形成的結(jié)、超螺旋和連環(huán)等大多數(shù)原核生物:1)共價封閉的環(huán)狀雙螺旋分子2)超螺旋結(jié)構(gòu):雙螺旋基礎(chǔ)上的螺旋化正超螺旋(positivesupercoil):盤繞方向與雙螺旋方同相同負超螺旋(negativesupercoil):盤繞方向與雙螺旋方向相反螺旋和超螺旋電話線螺旋超螺旋DNA超螺旋結(jié)構(gòu)的形成
核小體、染色質(zhì)與染色體第四節(jié)RNA的結(jié)構(gòu)與功能一、結(jié)構(gòu)特點RNA是單鏈分子,因此在RNA分子中,嘌呤的總數(shù)不一定等于嘧啶的總數(shù)稀有堿基較多,且穩(wěn)定性較差,易水解RNA分子中,部分區(qū)域也能形成雙螺旋結(jié)構(gòu),不能形成雙螺旋的部分,則形成單鏈突環(huán)。這種結(jié)構(gòu)稱
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