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文檔簡介

醫(yī)院科研檢索平臺建設(shè)需求系統(tǒng)概述系統(tǒng)可以根據(jù)不同專科和疾病的特點,規(guī)范化、標準化的收集到大量結(jié)構(gòu)化病例,包括:診療、隨訪、實驗室檢驗、檢查、用藥、社會屬性等方面的數(shù)據(jù),從而形成具有極大臨床及科研價值的患者數(shù)據(jù)庫。系統(tǒng)功能專病臨床科研數(shù)據(jù)中心全量數(shù)據(jù)接入數(shù)據(jù)源分析支持對院內(nèi)業(yè)務(wù)系統(tǒng)數(shù)據(jù)進行分析管理,通過對院內(nèi)各業(yè)務(wù)系統(tǒng)數(shù)據(jù)源進行分析,準確地查找和定位到所需的源數(shù)據(jù)表、視圖及數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系。支持對科研關(guān)注的紙質(zhì)文檔、圖片等多模態(tài)數(shù)據(jù)進行集中管理,結(jié)合該類數(shù)據(jù)的實際應(yīng)用需求,按需分類并以人工處理的方式優(yōu)化成電子數(shù)據(jù),方便后續(xù)導(dǎo)入??茢?shù)據(jù)庫。支持對其他相關(guān)數(shù)據(jù)源進行管理,比如單機版設(shè)備儀器數(shù)據(jù)、院外系統(tǒng)及第三方數(shù)據(jù)等。ETL采集引擎支持具備從多種不同的數(shù)據(jù)源(ORACLE、SQLSERVER、MySQL、VIEW、消息、HL7、WS)中進行指定規(guī)則的數(shù)據(jù)提取作業(yè)。支持具備數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換功能,在數(shù)據(jù)提取的過程中將不同數(shù)據(jù)源、不同數(shù)據(jù)類型的數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)換。支持具備數(shù)據(jù)裝載功能,平臺默認以1000條緩存數(shù)據(jù)為限,每達到限制數(shù)量后執(zhí)行一次數(shù)據(jù)裝載,并可根據(jù)單條數(shù)據(jù)量大小來修改單次裝載量,支持動態(tài)配置。支持全量數(shù)據(jù)/增量數(shù)據(jù)采集同步。支持指定時間間隔或指定時間點進行自動采集。支持對數(shù)據(jù)采集過程實施監(jiān)控預(yù)警。如采集任務(wù)異常中斷,支持一定時效內(nèi)的自動重啟恢復(fù),如多次重啟失敗,則支持記錄同步狀態(tài),提交給數(shù)據(jù)監(jiān)控預(yù)警并生成后端日志文件保存。ODS數(shù)據(jù)預(yù)處理支持在數(shù)據(jù)采集過程中對數(shù)據(jù)中的作廢標識進行處理。支持在數(shù)據(jù)采集過程中對數(shù)據(jù)中的重復(fù)數(shù)據(jù)做去重處理。支持在數(shù)據(jù)采集過程中對數(shù)據(jù)中臟數(shù)據(jù)(空值、異常值等)進行統(tǒng)一清洗。支持數(shù)據(jù)回收站功能,用于存儲作廢數(shù)據(jù)、重復(fù)數(shù)據(jù)和垃圾數(shù)據(jù)。全量數(shù)據(jù)治理患者主索引構(gòu)建系統(tǒng)將充分利用患者身份信息建立患者主索引數(shù)據(jù)模型,包括患者的個人信息比如性名,性別,出生日期,證件類別,證件編號,婚姻狀況,住址以及親屬信息等。同時也可基于院內(nèi)現(xiàn)有信息化體系中的患者EMPI體系,完成增量患者的主索引識別與綁定,并可支持臨床科研人員進行人工審核確認,從而完成增量患者數(shù)據(jù)與系統(tǒng)歷史沉淀數(shù)據(jù)的統(tǒng)一融合匹配,基于唯一的患者主索引標識,完成所有患者數(shù)據(jù)的識別和關(guān)聯(lián)。數(shù)據(jù)質(zhì)控管理支持準確性分析,對具有規(guī)范性的字段進行準確性校驗,例如身份證號碼,通過正則校驗,或者本來應(yīng)該填寫數(shù)值類型的,查看是否存在其他類型。支持完整性分析,包括數(shù)據(jù)是否完整,內(nèi)容是否齊全等數(shù)據(jù)完整性校驗。支持一致性分析,包括判斷數(shù)據(jù)字典值域是否一致等數(shù)據(jù)一致性校驗。支持及時性分析,能夠判斷數(shù)據(jù)的時間邏輯性是否合乎常理的數(shù)據(jù)及時性校驗。支持關(guān)聯(lián)性分析,實現(xiàn)對數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)中的各表關(guān)聯(lián)字段進行校驗,比如索引表和明細表之間是否正確關(guān)聯(lián)等。支持在完成數(shù)據(jù)準確性、完整性、一致性、及時性和關(guān)聯(lián)性五大維度的數(shù)據(jù)分析后,輸出整體數(shù)據(jù)質(zhì)量分析報告。數(shù)據(jù)歸一處理支持提供數(shù)據(jù)歸一化工具,實現(xiàn)源數(shù)據(jù)生產(chǎn)系統(tǒng)標準字典和重點專病標準數(shù)據(jù)模型之間的歸一規(guī)則的維護和管理,確保數(shù)據(jù)來源的準確性,歸一范圍需覆蓋手術(shù)名稱、檢查名稱、檢驗名稱和藥品名稱。國內(nèi)外標準映射支持與ICD-10等國內(nèi)外標準醫(yī)學(xué)術(shù)語體系進行關(guān)聯(lián)映射,以實現(xiàn)重點專病數(shù)據(jù)模型與國內(nèi)外標準醫(yī)學(xué)術(shù)語的互聯(lián)互通,保障重點專病數(shù)據(jù)模型的前瞻性和可用性。專病知識圖譜構(gòu)建支持在數(shù)據(jù)治理的過程中,對收集、整理、標準化的專病醫(yī)學(xué)術(shù)語和術(shù)語之間的邏輯關(guān)系進行關(guān)聯(lián),實現(xiàn)專病知識圖譜體系的構(gòu)建,并能對后續(xù)的增量術(shù)語進行統(tǒng)一關(guān)聯(lián)及維護,為后續(xù)專病輔助診療模型構(gòu)建、醫(yī)療創(chuàng)新應(yīng)用提供寶貴的專病知識管理體系。醫(yī)學(xué)術(shù)語詞庫構(gòu)建圍繞重點專病患者所涉及的相關(guān)癥狀、病歷表述內(nèi)容進行梳理,囊括具有疾病特色的醫(yī)療同義詞、反義詞等醫(yī)療術(shù)語,構(gòu)建符合重點專病科研應(yīng)用的術(shù)語詞庫并支持統(tǒng)一集中列表管理與展示。支持基于醫(yī)學(xué)術(shù)語詞庫生成對應(yīng)的可視化知識圖譜體系,展示術(shù)語之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系。數(shù)據(jù)后結(jié)構(gòu)化醫(yī)療數(shù)據(jù)標注引擎支持導(dǎo)入重點專病數(shù)據(jù)標注所需的患者的就診病歷和所需要標注的數(shù)據(jù)元并發(fā)布任務(wù)。支持按主訴、現(xiàn)病史等病歷節(jié)點進行標注原文展示,通過鼠標框選分詞提取原文內(nèi)容,實現(xiàn)該病歷原文所對應(yīng)的數(shù)據(jù)元的關(guān)聯(lián)標注。支持通過上傳JSON格式的疾病數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù),創(chuàng)建疾病同義詞標注庫,實現(xiàn)疾病數(shù)據(jù)元的同義詞二元屬性標注,并支持手工添加到相關(guān)數(shù)據(jù)元的同義詞術(shù)語庫。支持對已標注的疾病數(shù)據(jù)元及其同義詞進行列表展示,并可自動生成對應(yīng)的可視化知識圖譜體系,展示術(shù)語之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系。自然語言處理引擎支持原始病歷訓(xùn)練醫(yī)療領(lǐng)域的BERT語言模型。支持導(dǎo)入醫(yī)學(xué)術(shù)語詞庫,進行病歷文本命名實體識別及自動分詞。支持基于BERT語言模型及醫(yī)學(xué)術(shù)語詞庫的醫(yī)療文本的后結(jié)構(gòu)化處理。支持跨病種的語言模型遷移學(xué)習。病歷文本后結(jié)構(gòu)化支持基于自然語言處理引擎,實現(xiàn)重點專病患者的病歷內(nèi)容的后結(jié)構(gòu)化處理,實現(xiàn)一訴五史、入院記錄、手術(shù)記錄等醫(yī)療病歷文本進行自動化NLP治理,并支持將提取到的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)進行標識和存儲。檢查報告后結(jié)構(gòu)化支持基于自然語言處理引擎,實現(xiàn)重點專病患者的檢查報告的后結(jié)構(gòu)化處理,實現(xiàn)包括超聲檢查、X線檢查、CT檢查、MR檢查等檢查結(jié)果中的醫(yī)療文本進行自動化NLP治理,并支持將提取到的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)進行標識和存儲。科研數(shù)據(jù)中心專病數(shù)據(jù)建模專病數(shù)據(jù)模型需包含以重點??苾?yōu)勢病種為主線收集和整合的所有相關(guān)臨床數(shù)據(jù)術(shù)語,其范圍需覆蓋該疾病在診療過程中的各個領(lǐng)域,包括基本信息、就診信息、病歷文書、診斷、檢驗檢查、隨訪表單等。在此過程中,需要參考相應(yīng)單病種專病庫的行業(yè)最佳實踐,進行細粒度的定制化擴展處理,深入調(diào)研和總結(jié)針對單病種數(shù)據(jù)庫所需字段,以及字段之間的邏輯關(guān)系,并基于臨床指南、共識、文獻以及專家經(jīng)驗,定義每一個字段的含義、單位、值域等內(nèi)容,構(gòu)建完整的專病數(shù)據(jù)模型?;颊邤?shù)據(jù)接入系統(tǒng)支持多種數(shù)據(jù)接入方式,科研數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)可分歷史數(shù)據(jù)接入、增量數(shù)據(jù)接入兩個步驟進行。歷史數(shù)據(jù)接入可根據(jù)醫(yī)院應(yīng)用實際,通過備份庫、備份文件等多種方式接入,增量數(shù)據(jù)接入支持消息隊列等多種接入方式。所有需要對接的歷史數(shù)據(jù)均采取一次性主動ETL抽取的方式接入,數(shù)據(jù)內(nèi)容可見下表所示:表STYLEREF1\s3SEQ表\*ARABIC\s125數(shù)據(jù)對接范圍列表序號所需對接系統(tǒng)基礎(chǔ)對接數(shù)據(jù)范圍1HIS系統(tǒng)人口學(xué)信息、就診信息、藥品信息。2EMR系統(tǒng)門急診病歷、入院記錄、出院記錄、首次病程記錄、日常病程記錄、手術(shù)記錄、會診記錄、待產(chǎn)記錄、轉(zhuǎn)科記錄、死亡記錄、護理記錄。3LIS系統(tǒng)一般檢驗(檢驗申請單、檢驗報告明細表等)、微生物檢驗。4影像信息管理系統(tǒng)檢查報告(超聲檢查、X線檢查、CT檢查、DR檢查、MR檢查、心電圖、腦電圖、內(nèi)鏡檢查、其他檢查)。5病案首頁診斷信息、手術(shù)及操作信息。6病理系統(tǒng)病理診斷、病理報告等。7護理系統(tǒng)生命體征、評估量表。如存在院內(nèi)業(yè)務(wù)系統(tǒng)更換等引起的數(shù)據(jù)源重新接入問題,均在完成舊系統(tǒng)歷史數(shù)據(jù)全量抽取的情況下,再開展與新系統(tǒng)的數(shù)據(jù)對接,獲取后續(xù)增量數(shù)據(jù)并與歷史數(shù)據(jù)相匹配、關(guān)聯(lián),完成新系統(tǒng)對接后可采取定期增量更新的方式接入。具體數(shù)據(jù)接入流程如下:(1)確定入庫規(guī)則確定入庫規(guī)則是指確定專病專病數(shù)據(jù)多中心采集與管理平臺中擬納入的患者人群范圍,即設(shè)置一定的篩選與排除條件,定義數(shù)據(jù)倉庫中的人群范圍。(2)歷史數(shù)據(jù)接入歷史數(shù)據(jù)指系統(tǒng)實施之前所產(chǎn)生的業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)。系統(tǒng)需支持通過ETL工具進行一次性批量接入,并在此過程中,支持構(gòu)建患者主索引(EMPI)服務(wù),完成入庫人群的所有診療記錄關(guān)聯(lián)。(3)增量數(shù)據(jù)接入增量數(shù)據(jù)接入指系統(tǒng)部署實施之后,新增加的診療數(shù)據(jù)。系統(tǒng)需內(nèi)置定制化的數(shù)據(jù)治理工具實現(xiàn)自動異步更新。(4)離線設(shè)備數(shù)據(jù)接入離線設(shè)備數(shù)據(jù)接入指單機系統(tǒng)數(shù)據(jù)的接入,例如:呼吸機數(shù)據(jù)的接入。系統(tǒng)原則上需支持采用周期性人工導(dǎo)入的方法實現(xiàn)。(5)缺失數(shù)據(jù)補錄缺失數(shù)據(jù)補錄指業(yè)務(wù)系統(tǒng)中未記錄的,需要補充采集的相關(guān)數(shù)據(jù),缺失數(shù)據(jù)一般通過系統(tǒng)補錄操作界面或數(shù)據(jù)后臺手動實現(xiàn)數(shù)據(jù)接入。(6)其他相關(guān)的第三方數(shù)據(jù)接入其他相關(guān)的第三方數(shù)據(jù)接入,根據(jù)實際情況進行數(shù)據(jù)手工錄入或?qū)雽崿F(xiàn)數(shù)據(jù)接入。數(shù)據(jù)安全管理數(shù)據(jù)容災(zāi)管理支持數(shù)據(jù)備份機制,默認按照一月一次進行增量備份;數(shù)據(jù)恢復(fù)時長需控制在2小時以內(nèi);支持采用ES分布式分片存儲,每個分片數(shù)據(jù)都字段的副本存于其他的節(jié)點上,保證數(shù)據(jù)的安全。數(shù)據(jù)脫敏管理支持針對患者姓名,身份證,聯(lián)系方式,住址等隱私數(shù)據(jù)進行脫敏提?。恢С謱?shù)據(jù)字段內(nèi)容進行關(guān)鍵詞替換操作,如將某數(shù)據(jù)字段內(nèi)容轉(zhuǎn)換成“*”號展示。專病臨床科研應(yīng)用平臺平臺首頁概覽數(shù)據(jù)中心概覽支持對專病數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)情況進行概覽展示,包括納入患者總數(shù)、門診人數(shù)、住院人數(shù)、門診人次、住院人次、門診/住院就診人次趨勢、就診患者地域來源、性別占比、年齡分布基礎(chǔ)數(shù)據(jù)統(tǒng)計圖表在內(nèi);支持對專病臨床科研所關(guān)心的重要數(shù)據(jù)指標進行定制化展示,如手術(shù)藥品使用頻數(shù)詞云圖、手術(shù)分級數(shù)量分布等;支持對專科科室管理人員所關(guān)心管理指標數(shù)據(jù)進行定制化展示,如科室運營、專病質(zhì)控數(shù)據(jù)指標等;數(shù)據(jù)治理概覽支持查看數(shù)據(jù)來源情況,包含數(shù)據(jù)來源系統(tǒng)總數(shù)、數(shù)據(jù)來源系統(tǒng)表總數(shù)、數(shù)據(jù)來源系統(tǒng)表字段總數(shù);支持查看原始數(shù)據(jù)處理情況,包含數(shù)據(jù)抽取總數(shù)、數(shù)據(jù)作廢處理總數(shù)、數(shù)據(jù)重復(fù)處理總數(shù)、數(shù)據(jù)清洗處理總數(shù);支持查看數(shù)據(jù)元處理情況,包含數(shù)據(jù)元總數(shù)并按照處理方式分類展示,數(shù)據(jù)元結(jié)果總數(shù)并按照處理方式分類展示;支持查看數(shù)據(jù)元血緣關(guān)系查看,包含數(shù)據(jù)元流入節(jié)點和流出節(jié)點;支持查看從業(yè)務(wù)系統(tǒng)抽取數(shù)據(jù)至ODS庫歷史抽數(shù)結(jié)果,包含各業(yè)務(wù)域數(shù)據(jù)增量統(tǒng)計,增量總行數(shù)統(tǒng)計,抽數(shù)時間統(tǒng)計,抽數(shù)狀態(tài)統(tǒng)計;支持按照用戶個人維護,統(tǒng)計用戶登錄次數(shù)、檢索次數(shù)、納入隊列次數(shù)、導(dǎo)出次數(shù)、曲線圖統(tǒng)計;病例檢索中心數(shù)據(jù)檢索域基于專病專病標準數(shù)據(jù)模型,以患者人口學(xué)信息、就診信息、診斷信息、費用信息、一般檢驗、微生物檢驗、檢查報告、醫(yī)囑記錄、門急診病歷、住院病歷、入院記錄、出院記錄、病案手術(shù)、會診記錄、搶救記錄等醫(yī)療場景構(gòu)建檢查業(yè)務(wù)域構(gòu)建,結(jié)合操作簡易、高通用化和高效使用的原則完成產(chǎn)品頁面的設(shè)計,全面賦能臨床科室開展所需數(shù)據(jù)查詢和提取。數(shù)據(jù)元定位支持通過輸入任意文字內(nèi)容進行檢索域數(shù)據(jù)元模糊搜索,定位并展示與檢索內(nèi)容具有相關(guān)性的數(shù)據(jù)元所在業(yè)務(wù)域,方便用戶快捷點選開展隊列篩選和創(chuàng)建。事件檢索支持基于事件檢索出相應(yīng)的患者,如手術(shù)后白細胞>9.5的患者。字典選擇新增指標項可下拉選擇對應(yīng)的字典進行檢索。實時完整度統(tǒng)計支持基于條件樹檢索的患者實時統(tǒng)計出各數(shù)據(jù)元的完整度。數(shù)據(jù)對齊支持基于某個業(yè)務(wù)域的數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)對齊,對齊后其他業(yè)務(wù)域數(shù)據(jù)同步對齊與所選中的業(yè)務(wù)域診次一一對應(yīng)。二次檢索匯總支持查看全部二次檢索條件,并支持一鍵全清除。隊列檢索維度系統(tǒng)提供患者維度和就診維度兩大檢索維度供臨床科研人員使用?;颊呔S度:當患者的任意一條就診記錄符合對應(yīng)檢索條件的要求,則將該患者的所有就診記錄的數(shù)據(jù)進行查詢和展示。就診維度:將符合對應(yīng)檢索條件的所有患者對應(yīng)的就診記錄的數(shù)據(jù)進行查詢和展示。基于上述兩種檢索維度,各科室臨床科研人員在開展隊列檢索和創(chuàng)建時可以按照自己的課題需求,自行納入符合要求的患者對應(yīng)數(shù)據(jù),減少無效就診數(shù)據(jù)納入和采集,助力精細化數(shù)據(jù)入組??蒲腥耙晥D科研360全息視圖支持按照患者的門診、住院就診時序,逐個展示單個就診次序下的患者全量診療信息,內(nèi)容包括基本概覽信息、病歷信息、醫(yī)囑信息、檢驗信息、檢查信息、量表信息(如有)、護理信息等?;靖庞[信息:內(nèi)容包括單個就診時序下的患者疾病情況(包含診斷、確診年齡、就診時間)、隨訪量表評估情況(如有)、用藥情況、檢查報告異常情況和檢驗異常數(shù)據(jù)在內(nèi)。病歷信息:包括該次就診時序下的相關(guān)病歷文書記錄,如入院記錄、出院小結(jié)等,支持提供原始文書內(nèi)容查看。醫(yī)囑信息:包括該次就診時序下的所有患者的醫(yī)囑信息,包含藥品(西藥、中草藥)、治療、護理、耗材、手術(shù)等在內(nèi),支持按醫(yī)囑類型和醫(yī)囑項目兩大類進行篩選查看。檢驗信息:展示該次就診時序下的所有患者的檢驗項目,支持調(diào)閱原始檢驗報告進行查看。檢查信息:展示該次就診時序下的所有患者的檢查項目,支持調(diào)閱原始檢驗報告進行查看。量表信息:支持展示患者在該次就診時序范圍所填寫的量表數(shù)據(jù)記錄,展示的內(nèi)容包括量表題目和答案。護理信息:支持對該次就診時序下患者的血壓情況、呼吸情況、體溫情況、體重情況、脈搏情況等生命體征數(shù)據(jù)進行圖表可視化展示。科研360全息視圖-升級迭代新增手術(shù)信息和病理信息展示,新增按照子業(yè)務(wù)域區(qū)分展示,新增展示后結(jié)構(gòu)化指標。后結(jié)構(gòu)化視圖支持展示每次診次的后結(jié)構(gòu)化指標項結(jié)果及其溯源信息。CRF表單視圖支持展示患者的CRF表單,并支持新建CRF表單進行數(shù)據(jù)錄入,并支持依據(jù)規(guī)則自動填充,如按最新數(shù)據(jù)填充,或按照特定事件填充,或按照模板規(guī)則填充?;颊逿imeline視圖將患者的所有門診、住院就診記錄、檢驗記錄、用藥記錄、檢查記錄、生命體征記錄等數(shù)據(jù)內(nèi)容按統(tǒng)一時間線進行可視化展示。用戶可按時間進行篩選,支持用戶鼠標移動到對應(yīng)的時間線標識上自動顯示該項標識的代表含義內(nèi)容。診療時間軸標識會將該次患者的就診類型、就診科室、就診時間、診斷、就診醫(yī)生等信息進行展示。檢驗時間軸標識會將檢驗項目名稱、檢驗時間、具體數(shù)值等信息進行展示,如該時間節(jié)點上的檢驗數(shù)據(jù)異常(高于或低于正常值),則對應(yīng)標識的顏色會將被標記為紅色進行凸顯展示。用藥數(shù)據(jù)時間軸標識會將醫(yī)囑類別、藥品名稱、規(guī)格、每次用量、頻次、用法、開始用藥時間和結(jié)束用藥時間等信息進行展示。檢查項目時間軸標識會將該項檢測項目的名稱、報告時間、影像所見、影像診斷/結(jié)論等信息進行展示。生命體征時間軸標識會將該患者的所有體征數(shù)據(jù)進行趨勢圖展示,用戶鼠標移動上去可查看該標識下所記錄的具體體征項目名稱和數(shù)值,此外用戶還可通過勾選的方式添加或取消相應(yīng)生命體征的趨勢圖展示??蒲许椖恐行目蒲许椖抗芾砀骺剖遗R床科研人員可通過創(chuàng)建符合自己科研需求方向的科研項目并進行同一管理,系統(tǒng)支持以卡片的形式對所有項目進行集中展示,展示的內(nèi)容包括項目名稱、納入病例數(shù)、創(chuàng)建人和創(chuàng)建時間。用戶可對自己創(chuàng)建的項目的狀態(tài)進行維護,包含進行中和結(jié)題兩個狀態(tài),當項目處于結(jié)題狀態(tài)時,項目中的任何信息都不可修改,任何操作都不可進行,所有消息都不再通知。具備相應(yīng)權(quán)限的用戶可以對項目視圖中的項目進行刪除操作。用戶可通過創(chuàng)建時間、項目名稱和創(chuàng)建人進行項目查找操作。支持用戶創(chuàng)建科研項目,通過輸入項目名稱和項目概況資料信息即可完成科研項目創(chuàng)建,后續(xù)可通過檢索納入相應(yīng)患者開展課題研究。項目成員管理項目管理員可對科研項目的成員進行統(tǒng)一管理,包括添加新成員、編輯成員信息、刪除成員、設(shè)置成員所屬科研隊列、設(shè)置成員角色等操作。項目角色管理具備權(quán)限的管理員用戶可對科研項目中的功能權(quán)限進行設(shè)置,自定義功能項目對應(yīng)的用戶角色并保存。具備權(quán)限的管理員用戶可對用戶角色的數(shù)據(jù)權(quán)限進行設(shè)置,實現(xiàn)用戶角色與科研隊列之間的關(guān)聯(lián)與管理。項目病例管理支持在科研項目中按隊列的形式展示該隊列下的全量病例數(shù)據(jù),展示的格式與檢索中心保持一致,同時用戶可在此頁面中對病例進行納入隊列、科研全息、刪除病例等操作。支持用戶在項目病例列表中將符合自身科研課題需求的患者納入科研隊列中進行管理,支持納入患者單次和所有就診病例信息。用戶可執(zhí)行刪除患者操作,在刪除的同時,還可設(shè)置是否刪除存在于科研隊列中的患者就診信息。項目數(shù)據(jù)事件導(dǎo)出新增項目數(shù)據(jù)基于事件對比導(dǎo)出,可分別導(dǎo)出事件前、事件中、事件后對應(yīng)指標結(jié)果值。項目病例管理-導(dǎo)出次數(shù)選擇新增可選擇導(dǎo)出次數(shù),包含導(dǎo)出第一次、第二次、最后一次。項目病例管理-導(dǎo)出模板新增導(dǎo)出模板存儲,并支持調(diào)用導(dǎo)出模板自動勾選模板內(nèi)的數(shù)據(jù)元。項目病例管理-標簽可配置患者標簽,并可基于患者標簽篩選過濾。項目信息維護用戶在此模塊中可以查看該項目下屬的所有隊列情況,并支持對項目基本信息、科研隊列進行維護操作,方便管理人員開展相應(yīng)追溯事宜。支持用戶對項目的基本信息進行維護,內(nèi)容包括項目名稱和項目概況描述在內(nèi)。此外,用戶還可在此創(chuàng)建相應(yīng)的科研隊列賦能臨床課題研究,支持在原有科研隊列的基礎(chǔ)上創(chuàng)建亞隊列,并相應(yīng)的設(shè)置亞隊列的團隊以及刪除現(xiàn)有隊列等操作??蒲须S訪中心隨訪空間概覽支持展示我的隨訪項目總數(shù)/已隨訪人數(shù)/累計隨訪次數(shù)等數(shù)據(jù)以及最近的隨訪項目和基本信息。對全部隨訪計劃中的問卷數(shù)據(jù)分布情況進行概覽式探查。隨訪項目管理支持新建項目,對隨訪項目進行重命名/結(jié)題/終止/刪除等操作,可生成供患者掃碼入組的二維碼。支持對課題基本信息進行錄入和修改。支持課題相關(guān)文檔的上傳/搜索/預(yù)覽/下載/刪除。支持對項目成員進行管理以及功能權(quán)限菜單配置。支持查看數(shù)據(jù)下載/隱私數(shù)據(jù)查看的申請進度和詳情。支持查看待審批任務(wù),并進行審批管理。對項目內(nèi)成員的操作記錄進行查詢。支持對共享隊列審批設(shè)置。支持問卷未提交超過n天進行微信消息提醒的自動提醒設(shè)置。隨訪多級隊列管理支持項目成員可創(chuàng)建子隊列,并對其他項目成員進行“可見/不可見”的隱私設(shè)置。支持對整個隊列的病例添加計劃,隊列的新增入組病例自動綁定該計劃。支持子隊列中數(shù)據(jù)下載和隱私數(shù)據(jù)查看的審批流程設(shè)置。支持創(chuàng)建者邀請項目成員管理隊列,并可刪除。支持多種病例入組方式/對病例進行刪除。支持以單個/多個病例為隨訪對象進行計劃添加。支持即時/定時對用戶進行微信消息推送,可選擇內(nèi)容:問卷/科普/文本/報告和圖片上傳入口。支持對接專病庫數(shù)據(jù),支持將檢索后的病例導(dǎo)入到隨訪隊列中。支持將病例從科研隊列導(dǎo)入到隨訪隊列。支持以列表形式批量錄入病例信息,或以excel模版形式導(dǎo)入病例。支持將隨訪隊列中的病例入組至科研隊列。支持將隨訪隊列中的病例入組至同項目內(nèi)其他隊列中。匯總病例基本信息和隨訪信息,支持展示全部隨訪計劃時間軸。支持醫(yī)生人工錄入問卷數(shù)據(jù),可錄入至計劃內(nèi)或臨時隨訪內(nèi)。隨訪進度管理支持為項目內(nèi)病例添加隨訪計劃,并可對計劃時間節(jié)點和問卷進行修改。支持對計劃進行“啟動/終止/暫?!钡臓顟B(tài)管理。支持為計劃內(nèi)每個隊列設(shè)置智能入組條件,自動識別專病庫新增的匹配病例,并將其抓取到“待入組”頁面。支持“手動/入組后自動啟動/入組后間隔時間后自動啟動”等設(shè)置。支持對項目內(nèi)全部計劃推送記錄的查看和管理。支持展示各計劃在不同進度節(jié)點下的人數(shù)匯總列表。支持展示各隨訪進度(待推送/已推送/已完成/已結(jié)束/已終止/已暫時)下的病例匯總列表。支持對病例隨訪狀態(tài)進行“啟動/暫停/終止”等管理。自動填充問卷新增問卷數(shù)據(jù)基于數(shù)據(jù)庫患者數(shù)據(jù)自動填充,并支持特定事件抓取數(shù)據(jù),如出院后第一次,出院后最后一次。智能入組新增隨訪入組基于數(shù)據(jù)庫條件樹智能入組,定時通過所設(shè)定的條件自動抓取符合條件的患者入組,并且支持基于特定事件開啟隨訪,如出院后第N天,門診后第N天。隨訪數(shù)據(jù)質(zhì)量管理支持對“失訪”進行次數(shù)定義,并將失訪病例推送給醫(yī)生,進行及時跟蹤管理。支持對“逾期”進行時間定義,并將逾期病例推送給醫(yī)生,進行及時跟蹤管理。支持展示不同計劃/隊列內(nèi)病例的人口學(xué)信息分布統(tǒng)計圖。支持展示不同計劃內(nèi)問卷的隨訪選項與數(shù)值分布統(tǒng)計圖。支持對連續(xù)型變量類型的問卷數(shù)據(jù)以箱線圖展示,并對離群值點進行個體探查。支持對“總分過高/過低、預(yù)警選項、數(shù)值范圍超出”等類型的問卷數(shù)據(jù)進行預(yù)警提醒。支持以列表形式全覽問卷內(nèi)全部題目的數(shù)據(jù),支持對多種題型的展示,如單選題/多選題/填空題/表格題/卡尺題等。支持對問卷數(shù)據(jù)進行修改和審核。支持對問卷數(shù)據(jù)以excel格式進行下載,可進行問卷/題目/隊列/病例等維度的篩選。隨訪知識庫管理支持提供多種題型模版進行問卷編輯,如單選題/填空題/多選題/表格題/卡尺題/總分設(shè)置等。支持對問卷添加多個總分,分別進行計算邏輯設(shè)置,可累加全部題目分值支持在題目間設(shè)置跳轉(zhuǎn)/顯示關(guān)系,根據(jù)患者已選選項進行題目跳轉(zhuǎn)。支持對問卷總分范圍/高危選項進行預(yù)警提醒設(shè)置,獲取到預(yù)警數(shù)據(jù)時推送給醫(yī)生進行處理。支持對個人問卷的展示/搜索/修改/預(yù)覽。支持將個人創(chuàng)建的問卷共享至項目/本院。支持查看項目/本院成員共享的問卷,進行搜索、預(yù)覽,并導(dǎo)入個人空間。展示全部隨訪計劃,包含計劃名稱/計劃詳情/計劃類型等信息。支持對隨訪計劃進行命名/修改和循環(huán)類型設(shè)置。支持設(shè)置不同的推送時間節(jié)點,并添加相應(yīng)的問卷/科普,系統(tǒng)將在對應(yīng)節(jié)點推送微信隨訪消息給患者。支持根據(jù)隨訪需求,對知情同意書簽名環(huán)節(jié)進行開啟或關(guān)閉。支持上傳科普文檔,并進行預(yù)覽、刪除操作。隨訪移動端支持醫(yī)生通過移動端查看已創(chuàng)建或已加入的項目的基本信息并生成二維碼圖片,查看患者列表與患者計劃和問卷列表,以及填寫問卷內(nèi)容。支持患者通過移動端掃描二維碼并登記入組,簽署知情同意書,以及查看所參與的項目列表和問卷列表并支持填寫問卷。統(tǒng)計分析中心統(tǒng)計分析首頁支持本地數(shù)據(jù)上傳功能,通過選擇相應(yīng)目錄下的excel數(shù)據(jù)文件(.xlsx)即可完成上傳,若上后在數(shù)據(jù)表中未見相應(yīng)數(shù)據(jù)文件,可執(zhí)行數(shù)據(jù)刷新。支持數(shù)據(jù)預(yù)覽功能,可預(yù)覽100行數(shù)據(jù)。點擊數(shù)據(jù)清洗功能,可進入數(shù)據(jù)清洗頁面,進行數(shù)據(jù)清洗。若數(shù)據(jù)之前已完成清洗,可直接進行數(shù)據(jù)探查和統(tǒng)計建模分析,若對數(shù)據(jù)的清洗結(jié)果不滿意,可重新對數(shù)據(jù)進行清洗。若數(shù)據(jù)表中的數(shù)據(jù)不再使用,可直接進行刪除。智能數(shù)據(jù)清洗支持在數(shù)據(jù)清洗的過程中設(shè)置變量類型,變量類型主要分為兩部分:變量名稱和類型、目標變量。在變量名稱和類型設(shè)置過程中,支持用戶修改變量名稱和數(shù)據(jù)變量類型選擇設(shè)置。標記為無效變量的變量,系統(tǒng)將會自動刪除該變量,在后續(xù)清洗和統(tǒng)計分析中不再使用。在目標變量設(shè)置過程中,右側(cè)為可選變量列表,右側(cè)為已選擇的目標變量,用戶可在左側(cè)勾選相應(yīng)變量,再點擊中間“到右邊”按鈕,選擇要分析的變量。系統(tǒng)支持將把前面標記為無效標量類型的變量自動剔除,并進行展示。系統(tǒng)支持進行異常記錄檢測,當檢測到異常記錄,系統(tǒng)將進行相應(yīng)提示,用戶可點擊“修改”進行異常記錄修改。在異常記錄修改頁面,用戶可點擊“修改”進入相應(yīng)變量的界面,對具體的異常記錄進行修改,也可以在左側(cè)勾選相應(yīng)變量,點擊右上角“批量刪除”按鈕,直接對變量進行剔除。進入修改界面,用戶可在右側(cè)填寫修正值,或勾選相應(yīng)的記錄,對記錄進行刪除為缺失值。完成全部異常記錄修改后,用戶方可進入校正變量類型模塊。由于異常記錄存在將使后續(xù)分析程序發(fā)生錯誤,因此必須對所有異常記錄進行修改。在校正變量類型模塊中,系統(tǒng)將比較標記變量類型與系統(tǒng)自動檢測變量類型的一致性,若存在不一致的變量類型,則提示進行校正,用戶可點擊修改按鈕進入相應(yīng)界面,若變量類型全部一致,則用戶可直接進入處理極端分布變量模塊。進入修改界面,用戶可點擊右側(cè)修改按鈕進入相應(yīng)變量的修改界面。在修改界面中,用戶可觀察變量的數(shù)據(jù)分布情況。用戶可在界面中對系統(tǒng)檢測統(tǒng)計的變量的具體值進行修改,使變量具體值的類型數(shù)量與標記類型相對應(yīng);若用戶認為之前標記的變量類型錯誤,可點擊左上角下拉菜單,修改標記變量類型,并修改變量值。完成修改后可保存并繼續(xù)修改其他變量。完成全部變量類型校正后,用戶可進入處理極端分布變量模塊。由于變量類型不正確將使后續(xù)分析程序發(fā)生錯誤,因此必須對所有變量類型進行校正。在處理極端分布變量模塊中,系統(tǒng)將檢測二分類變量的極端分布情況,若存在極端分布情況,則提示進行處理,若不存在極端分布情況,則可直接進入處理異常數(shù)值模塊。在處理極端分布變量界面,用戶可查看變量分布情況。用戶可根據(jù)分析所需,對變量選擇刪除或保留操作,若選擇刪除(系統(tǒng)默認選擇刪除按鈕),則對變量進行剔除,若選擇保留,則不對變量做任何處理,即不刪除。在處理異常數(shù)值模塊,系統(tǒng)將基于箱線圖法檢測各連續(xù)變量異常值,若有連續(xù)變量存在異常數(shù)值,則提示進行處理,若沒有連續(xù)變量存在異常數(shù)值,則進入填補缺失值模塊。進入處理異常數(shù)值界面,用戶可見系統(tǒng)基于箱線圖法檢測的連續(xù)變量異常值上下界。由于上下界的檢測是基于連續(xù)變量的數(shù)據(jù),當數(shù)據(jù)中有較多不符合實際的異常值時,檢測的上下界可能出現(xiàn)不準確或不合理的情況,需要用戶進行修改操作。當用戶可以選擇“默認上下界”,表示使用系統(tǒng)檢測的上下界,當用戶選擇修改上下界,可在彈窗界面修改檢測異常值的上下界。當用戶點擊下一步時,系統(tǒng)將自動對各連續(xù)變量超過上下界范圍的數(shù)值進行刪除(后續(xù)會進行缺失值填補)。當用戶選擇保留異常值,則不再對異常值進行刪除,即保留所有系統(tǒng)檢測的異常數(shù)值。在填補缺失值模塊界面中,系統(tǒng)將自動執(zhí)行,用戶無需操作。在填補缺失值模塊中,系統(tǒng)將保存一份經(jīng)過前面數(shù)據(jù)清洗但未填補缺失值的數(shù)據(jù),用于數(shù)據(jù)探查模塊和統(tǒng)計建模中的統(tǒng)計分析方法。隨后,系統(tǒng)將自動對缺失值數(shù)據(jù)進行填補,并保存填補后的數(shù)據(jù),用于后續(xù)建模分析簡易數(shù)據(jù)探查數(shù)據(jù)探查模塊分為數(shù)據(jù)完整度和變量分布兩部分,在數(shù)據(jù)完整度部分,用戶可查看各個變量在數(shù)據(jù)清洗前后的缺失情況,在變量分布部分,用戶可選擇變量,查看單個變量的分布情況以及變量分組后的分布情況。在數(shù)據(jù)完整度模塊中,左側(cè)部分為變量列表,用戶可勾選相應(yīng)變量或全選,將其移至已選變量欄進行數(shù)據(jù)探查,即可在右側(cè)查看對應(yīng)變量的缺失情況及圖表展示情況。用戶還可對相應(yīng)圖表數(shù)據(jù)的結(jié)果進行導(dǎo)出。在變量分布模塊中,用戶可選擇分析變量開始進行數(shù)據(jù)探查,除單一變量外還支持雙變量探查或是選擇變量作為分組變量和分析變量,系統(tǒng)將按分組變量對分析變量進行分層分組,同樣,可在右側(cè)查看變量分組后的分布情況。統(tǒng)計建模分析在統(tǒng)計建模模塊中,可選分析方法包括統(tǒng)計分析、回歸、分類、全流程建模,其中統(tǒng)計分析、回歸、分類方法中,每次只能選擇其中一種方法進行分析,而全流程建模則可選擇多個機器學(xué)習模型進行建模。用戶選擇分析方法后,可選擇相應(yīng)變量進入分析,點擊“開始統(tǒng)計”即可在右側(cè)查看相應(yīng)分析結(jié)果。用戶可選擇全流程建模分析,系統(tǒng)將自動對數(shù)據(jù)進行:①自變量與目標變量的單因素統(tǒng)計檢驗,其中連續(xù)變量使用T檢驗或Mann-WhitneyU檢驗,分類變量使用卡方檢驗,選擇顯著變量(P<0.05)進入后續(xù)建模分析;②使用顯著的變量集和目標變量數(shù)據(jù)按7:3進行訓(xùn)練集和測試集劃分,并對連續(xù)變量進行標準差標準化處理;③使用RFECV算法對變量進一步篩選,選出使基線模型AUC最優(yōu)的變量集;④使用訓(xùn)練集對用戶選擇的機器學(xué)習模型建模,并使用測試集對模型進行性能測試,并使用bootstrap方法對模型進行1000次測試;⑤最后建立SHAP解釋器,SHAP將基于博弈論知識,實現(xiàn)各變量對模型預(yù)測結(jié)果的正負相關(guān)性及重要程度進行解釋。系統(tǒng)支持7種基礎(chǔ)統(tǒng)計分析算法:一般線性相關(guān)系數(shù)、卡方檢驗、單因素方差分析、兩獨立樣本T檢驗、兩獨立樣本秩和檢驗、配對樣本T檢驗、正態(tài)檢驗。系統(tǒng)支持9種回歸分析算法:一元線性回歸、多元線性回歸、COX回歸、決策樹回歸、SVM回歸、深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)回歸、隨機森林回歸、XGBoost回歸、lgb回歸。系統(tǒng)支持8種分類統(tǒng)計算法:一元logistic回歸、多元logistic回歸、決策樹分類、SVM分類、深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類、隨機森林分類、XGBoost分類、lgb分類。系統(tǒng)支持7種建模流程:LR、SVM、GNB、RF、GBM、ANN、ADA?;A(chǔ)管理中心資源管理支持管理所有模塊的菜單、頁面、按鈕和接口,包括新增,修改,刪除;支持對專病庫中的功能菜單、業(yè)務(wù)域、科室進行資源配置。組織管理支持對醫(yī)院基本信息維護;支持對醫(yī)院科室基本信息維護,并支持科室多級層級結(jié)構(gòu)關(guān)系,科室可維護多個子科室;支持對醫(yī)院的專病庫基本信息維護;支持對用戶基本信息維護,并支持設(shè)置用戶賬號有效時長;支持對用戶分配角色,并支持用戶擁有多個角色。權(quán)限管理支持自定義角色,并支持對角色的功能權(quán)限進行配置,包含可訪問頁面、可使用按鈕以及可使用的接口;支持對用戶的數(shù)據(jù)權(quán)限進行配置,包含科室來源、業(yè)務(wù)域是否可見、數(shù)據(jù)元是否可見是否脫敏等進行設(shè)置。審批流程配置支持對各個審批流程的審批者和審批方式進行設(shè)置管理,并支持設(shè)定多個審批節(jié)點;支持會簽和或簽兩種審方式,其中會簽方式支持在同一審批節(jié)點所有審批者均審批通過方可進入下個節(jié)點,或簽方式支持在同一審批節(jié)點任意審批者審批通過即可進入下個節(jié)點;支持按角色添加審批者或按指定用戶添加審批

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