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第一節(jié)細(xì)菌和病毒結(jié)構(gòu)第二節(jié)細(xì)菌遺傳分析第三節(jié)噬菌體遺傳分析細(xì)菌和病毒的遺傳第1頁(yè)
第一節(jié)細(xì)菌和病毒結(jié)構(gòu)細(xì)菌和病毒結(jié)構(gòu)及其遺傳特點(diǎn),使它們成為遺傳學(xué)研究好材料。轉(zhuǎn)化試驗(yàn)、一個(gè)基因一個(gè)酶假說、基因精細(xì)結(jié)構(gòu)、基因表示調(diào)控、基因工程等遺傳學(xué)重大發(fā)覺和技術(shù)發(fā)展都與細(xì)菌和病毒相關(guān)。細(xì)菌和病毒的遺傳第2頁(yè)一、細(xì)菌結(jié)構(gòu)單細(xì)胞生物,大小不一,普通長(zhǎng)1-2μm,寬0.5μm,為一層或多層膜或細(xì)胞壁所包圍。部分細(xì)菌還有一些特殊結(jié)構(gòu),如鞭毛、傘毛、莢膜等。細(xì)菌細(xì)胞核沒有核膜,其中染色體是一個(gè)很長(zhǎng)共價(jià)閉合環(huán)狀雙鏈DNA分子,長(zhǎng)度從250-3500μm不等,普通不與蛋白質(zhì)結(jié)合。多數(shù)細(xì)菌細(xì)胞在細(xì)胞核外還有一個(gè)或多個(gè)能自主復(fù)制小型環(huán)狀DNA。這些DNA分子對(duì)細(xì)菌生長(zhǎng)并非必需,但可賦予細(xì)菌一些特征,如抗藥性、抗鹽性、抗噬菌體侵染等。這些小分子DNA稱為質(zhì)粒(plasmid)。細(xì)菌能在成份十分簡(jiǎn)單培養(yǎng)基上生長(zhǎng),這種培養(yǎng)基叫基本培養(yǎng)基。細(xì)菌在這種培養(yǎng)基上能合成生長(zhǎng)所必須各種有機(jī)物。單一細(xì)胞經(jīng)過分裂而增殖,大致20分鐘繁殖一代,逐步形成肉眼可見菌落。細(xì)菌和病毒的遺傳第3頁(yè)二、病毒結(jié)構(gòu)病毒為非細(xì)胞結(jié)構(gòu),沒有本身代謝機(jī)能,不能獨(dú)立地生長(zhǎng)和繁殖,必須寄生在活細(xì)胞中,利用活細(xì)胞營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)合成新病毒后代。繁殖快速,每小時(shí)可增殖百倍。病毒個(gè)體微小,形態(tài)多樣,結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,僅含一個(gè)核酸(DNA或RNA)和一個(gè)蛋白質(zhì)外殼。依其遺傳物質(zhì)性質(zhì),能夠分單鏈DNA、單鏈RNA、雙鏈DNA和雙鏈RNA病毒等四種類型。按照它們所感染細(xì)胞類型可分為感染細(xì)菌、真菌及藻類菌類病毒,以及感染動(dòng)植物動(dòng)物病毒和植物病毒。遺傳學(xué)研究中應(yīng)用最廣泛是感染細(xì)菌病毒,又稱為噬菌體(bacteriophage)。依其與宿主細(xì)胞相互關(guān)系,能夠分為烈性噬菌體(virulentphage)和溫和噬菌體(temperatephage)兩大類型。細(xì)菌和病毒的遺傳第4頁(yè)1.世代周期短:
大腸桿菌(E.Coli)20分鐘可繁殖一代。2.便于管理和生化分析:
個(gè)體小,普通在1μm至幾μm之間(1μm=1/1000mm),操作管理方便。3.便于研究基因突變:裸露DNA分子(有病毒為RNA分子),易受環(huán)境條件影響而發(fā)生突變;單倍體生物,不存在顯性掩蓋隱性問題,突變均能表現(xiàn)出來。三、細(xì)菌和病毒在遺傳學(xué)研究?jī)?yōu)越性細(xì)菌和病毒的遺傳第5頁(yè)
4.便于研究基因作用:影印培養(yǎng),易檢出營(yíng)養(yǎng)缺點(diǎn)型突變,有利于從生化角度來研究基因作用。5.便于基因重組研究:細(xì)菌含有轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)和接合作用,利用這些特征能夠進(jìn)行精密遺傳學(xué)分析6.便于研究基因結(jié)構(gòu)、功效及調(diào)控機(jī)制:細(xì)菌和病毒遺傳物質(zhì)簡(jiǎn)單,基因定位、結(jié)構(gòu)分析及其分離易于進(jìn)行,基因表示調(diào)控也適于用生理生化方法進(jìn)行深入研究。7.便于進(jìn)行遺傳操作:染色體結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,沒有組蛋白和其它蛋白結(jié)合,更宜于進(jìn)行遺傳工程操作。細(xì)菌和病毒的遺傳第6頁(yè)四、細(xì)菌和病毒研究方法1.單細(xì)胞分離
菌液→稀釋→涂布在固體培基→單個(gè)細(xì)胞分離→形成肉眼可見菌落。細(xì)菌研究方法:細(xì)菌和病毒的遺傳第7頁(yè)2.影印法測(cè)定變異采取影印法測(cè)定細(xì)菌是否發(fā)生變異以及發(fā)生何種變異。細(xì)菌變異主要有形態(tài)特征變異和生理特征變異。
形態(tài)特征變異:菌落大小、形狀、顏色
生理特征變異:(1)營(yíng)養(yǎng)缺點(diǎn)型:?jiǎn)适Ш铣赡撤N營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)能力,在基本培養(yǎng)基上不能生長(zhǎng)。原養(yǎng)型(野生型):能夠在基本培養(yǎng)基上生長(zhǎng)。
(2)抗性突變:抗藥性和抗感染型。細(xì)菌和病毒的遺傳第8頁(yè)細(xì)菌影印培養(yǎng)方法(Lederberg,1952)細(xì)菌和病毒的遺傳第9頁(yè)病毒研究方法:1.取得變異亞硝酸、羥胺、乙基黃酸乙酯(EES)等化學(xué)藥劑誘導(dǎo)發(fā)生變異。
常見變異:
寄主范圍變異:野生型(h+):感染B菌株,產(chǎn)生半透明斑;突變型(h):感染B和B/2菌株,產(chǎn)生透明斑。
噬菌斑突變:野生型(r+):產(chǎn)生正常斑,小而邊緣含糊;突變型(r):產(chǎn)生突變斑,大而邊緣清楚。所以:h+r感染B菌株產(chǎn)生半透明大斑;hr+感染B和B/2菌株,產(chǎn)生透明小斑。2.雜交試驗(yàn)雙重感染分析子代噬菌體中重組型頻率。細(xì)菌和病毒的遺傳第10頁(yè)1.轉(zhuǎn)化(transformation):裸露非病毒DNA導(dǎo)入細(xì)菌細(xì)胞過程。2.轉(zhuǎn)染(transfection):裸露病毒(噬菌體)DNA導(dǎo)入細(xì)菌過程。是一個(gè)特殊轉(zhuǎn)化形式。3.轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction):以噬菌體為媒介將細(xì)菌DNA從供體菌轉(zhuǎn)移到受體菌過程。4.接合(conjugation):細(xì)菌經(jīng)過細(xì)胞之間直接接觸方式傳遞遺傳物質(zhì)過程。一、細(xì)菌遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移形式第二節(jié)細(xì)菌遺傳分析細(xì)菌和病毒的遺傳第11頁(yè)經(jīng)過接合作用,部分供體基因組DNA轉(zhuǎn)移到受體菌中經(jīng)過接合作用,質(zhì)粒轉(zhuǎn)移到受體菌中細(xì)菌和病毒的遺傳第12頁(yè)1.單方向轉(zhuǎn)移2.都產(chǎn)生部分二倍體3.轉(zhuǎn)入基因只有整合到環(huán)狀染色體上才能穩(wěn)定遺傳二、細(xì)菌遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移共同特點(diǎn)細(xì)菌和病毒的遺傳第13頁(yè)三、細(xì)菌轉(zhuǎn)化(transformation)1.轉(zhuǎn)化發(fā)覺1928年F.Griffith首先發(fā)覺。1944年O.Avery研究小組證實(shí)引發(fā)轉(zhuǎn)化因子是細(xì)菌DNA。轉(zhuǎn)化(transformation):細(xì)菌細(xì)胞經(jīng)過其細(xì)胞膜攝取周圍供體DNA片段,并經(jīng)過重組整合到自己染色體中過程。細(xì)菌和病毒的遺傳第14頁(yè)2.轉(zhuǎn)化類型(1)自然轉(zhuǎn)化(naturaltransformation)細(xì)菌能夠自由吸收DNA,并轉(zhuǎn)化。如:枯草桿菌轉(zhuǎn)化。(2)工程轉(zhuǎn)化(engineeredtransformation)人工轉(zhuǎn)化(artificialtransformation)細(xì)菌發(fā)生改變(感受態(tài)細(xì)胞制備),使其能攝入外源DNA,并轉(zhuǎn)化。如:大腸桿菌轉(zhuǎn)化。細(xì)菌和病毒的遺傳第15頁(yè)3.轉(zhuǎn)化過程(1)外源DNA與受體細(xì)菌細(xì)胞結(jié)合
影響原因:
供體DNA片段大?。翰灰粯蛹?xì)菌要求轉(zhuǎn)化片段大小不一樣。肺炎雙球菌要求800核苷酸對(duì)以上;枯草桿菌要求1600核苷酸對(duì)以上;大腸桿菌轉(zhuǎn)化DNA片段長(zhǎng)度為10000-0bp(占E.coli染色體1/200)。
供體DNA片段形態(tài):供體DNA必需是雙鏈。
供體DNA片段濃度:供體DNA片段數(shù)目越多越輕易發(fā)生轉(zhuǎn)化,但不一樣細(xì)菌只能與特定數(shù)量DNA片段結(jié)合。取決于細(xì)胞上接收座位數(shù)。一個(gè)細(xì)菌表面大約有50個(gè)吸附位點(diǎn)。
受體細(xì)胞生理狀態(tài):感受狀態(tài)細(xì)胞(DNA合成剛結(jié)束,蛋白質(zhì)合成仍在進(jìn)行時(shí)細(xì)胞)才能發(fā)生轉(zhuǎn)化。感受態(tài)出現(xiàn)主要受一類小分子蛋白質(zhì)(感受態(tài)因子)影響,感受態(tài)因子能夠使細(xì)胞出現(xiàn)感受態(tài),并能從感受態(tài)細(xì)菌傳遞到非感受態(tài)細(xì)菌,使其出現(xiàn)感受態(tài)。普通認(rèn)為感受態(tài)出現(xiàn)在細(xì)菌對(duì)數(shù)生長(zhǎng)后期。高Ca2+、溫度以及電激處理等,也能夠改變膜對(duì)DNA通透性,從而誘導(dǎo)或加強(qiáng)感受態(tài)。
細(xì)菌和病毒的遺傳第16頁(yè)細(xì)菌和病毒的遺傳第17頁(yè)
b)DNA經(jīng)過細(xì)胞壁和細(xì)胞膜是一個(gè)主動(dòng)運(yùn)輸過程,需要膜上轉(zhuǎn)運(yùn)分子,并消耗能量。(2)DNA穿入a)在細(xì)胞膜上核酸外切酶作用下,將吸附雙鏈DNA中一條鏈降解,另一條單鏈則利用降解后釋放能量,穿入受體細(xì)胞內(nèi)。
細(xì)菌和病毒的遺傳第18頁(yè)外源DNA穿入受體細(xì)胞示意圖單鏈DNA細(xì)胞膜供體DNADNA結(jié)合復(fù)合蛋白體能量核酸外切酶細(xì)胞壁細(xì)菌和病毒的遺傳第19頁(yè)(3)聯(lián)會(huì)(synapsis),與外源DNA片段整合
聯(lián)會(huì):外源單鏈DNA與受體細(xì)菌染色體DNA同源區(qū)段發(fā)生聯(lián)會(huì),形成部分二倍體。部分二倍體:細(xì)菌擬有性生殖過程中,外源DNA與受體DNA同源區(qū)段聯(lián)會(huì),使受體細(xì)胞部分DNA形成二倍體。供體外基因子:部分二倍體中外源DNA。受體內(nèi)基因子:部分二倍體中受體細(xì)胞DNA。整合(重組):部分二倍體發(fā)生交換,將外源DNA置換到受體染色體中。細(xì)菌和病毒的遺傳第20頁(yè)部分二倍體發(fā)生交換只有偶數(shù)(雙交換、四交換)交換才有意義,既不破壞受體DNA環(huán)狀結(jié)構(gòu),又將外源DNA置換到受體染色體中。而奇數(shù)交換將受體環(huán)狀DNA打開成線性DNA,重組轉(zhuǎn)化子不能成活。細(xì)菌和病毒的遺傳第21頁(yè)
經(jīng)過一次染色體復(fù)制和細(xì)胞分裂,形成一個(gè)轉(zhuǎn)化了細(xì)胞和一個(gè)未被轉(zhuǎn)化細(xì)胞。(4)轉(zhuǎn)化細(xì)胞形成細(xì)菌和病毒的遺傳第22頁(yè)細(xì)菌轉(zhuǎn)化過程整合外源DNA結(jié)合在受體位點(diǎn)DNA穿入感受態(tài)細(xì)胞聯(lián)會(huì)形成轉(zhuǎn)化細(xì)胞細(xì)菌和病毒的遺傳第23頁(yè)4.轉(zhuǎn)化作圖
DNA是以小片段形式進(jìn)入受體,所以距離很遠(yuǎn)兩個(gè)基因極難同時(shí)存在于一個(gè)片段中同時(shí)轉(zhuǎn)化,除非分別包含這兩個(gè)基因兩個(gè)片段同時(shí)進(jìn)入受體。兩個(gè)片段同時(shí)轉(zhuǎn)化概率應(yīng)為它們單獨(dú)轉(zhuǎn)化概率乘積。不過當(dāng)兩個(gè)基因緊密連鎖時(shí),它們就有較多機(jī)會(huì)包含在同一個(gè)DNA片段中,并同時(shí)整合到受體染色體中,所以,緊密連鎖基因能夠經(jīng)過轉(zhuǎn)化進(jìn)行作圖。經(jīng)過轉(zhuǎn)化試驗(yàn),利用轉(zhuǎn)化發(fā)生重組計(jì)算它們之間重組率,將細(xì)菌不一樣基因定位在它染色體DNA上,組成它遺傳圖譜。細(xì)菌和病毒的遺傳第24頁(yè)
用一野生型細(xì)菌菌株提取出來DNA轉(zhuǎn)化一個(gè)不能合成丙氨酸(ala-)、脯氨酸(pro-)、精氨酸(arg-)突變菌株,取得以下結(jié)果:
ala+pro+arg+8400ala+pro-arg+2100ala+pro-arg-
840ala+pro+
arg-
420ala-pro+arg+
1400ala-pro-arg+
840ala-pro+
arg-840
細(xì)菌和病毒的遺傳第25頁(yè)任意兩基因發(fā)生共同轉(zhuǎn)化前提下:ala-pro:親型轉(zhuǎn)化子:ala+pro+重組型轉(zhuǎn)化子:ala+pro-
ala-pro+ala-arg:親型轉(zhuǎn)化子:ala+arg+重組型轉(zhuǎn)化子:ala+arg-ala-arg+pro-arg:親型轉(zhuǎn)化子:pro+arg+重組型轉(zhuǎn)化子:pro+arg-pro-arg+arg+arg-arg+arg-arg+arg-arg+arg-arg+arg-arg+arg-arg+arg-arg+arg-arg+arg-細(xì)菌和病毒的遺傳第26頁(yè)重組率=重組型轉(zhuǎn)化子/轉(zhuǎn)化子總數(shù)×100%
ala-pro間重組率=(2100+840+1400+840)/(2100+840+1400+840+8400+420)=37%
ala-arg間重組率=(840+420+1400+840)/(840+420+1400+840+8400+2100)=25%
pro-arg間重組率=(2100+420+840+840)/(2100+420+840+840+8400+1400)=30%
所以,三基因間距離和次序?yàn)椋篴la←25→arg←30→pro
細(xì)菌和病毒的遺傳第27頁(yè)四、細(xì)菌接合(conjugation)E.coli接合發(fā)覺
1946年JoshuaLederberg(黎德伯格)和EdwardTatum發(fā)覺了細(xì)菌之間經(jīng)過直接接觸傳遞遺傳信息。
Lederberg因?yàn)檠芯考?xì)菌重組而取得1958年NobelMedicineorphysiologyPrize。
Tatum和G.W.Beable提出“一個(gè)基因一個(gè)酶”也在此獎(jiǎng)中。細(xì)菌和病毒的遺傳第28頁(yè)
1.Lederberg-Tatum試驗(yàn)Lederberg創(chuàng)造用基本培養(yǎng)基(minimalmedium)篩選原養(yǎng)型(prototroph)方法。對(duì)照(control)細(xì)菌和病毒的遺傳第29頁(yè)試驗(yàn)解釋:基因突變;營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)互補(bǔ);遺傳物質(zhì)重組?細(xì)菌和病毒的遺傳第30頁(yè)對(duì)試驗(yàn)結(jié)果解釋Lederberg和Tatum從概率上和對(duì)照試驗(yàn)上排除了細(xì)菌發(fā)生恢復(fù)突變可能性:a)單一性狀恢復(fù)突變率是10-7,雙性狀恢復(fù)突變概率是10-14。結(jié)論:在A菌株與B菌株之間發(fā)生了遺傳物質(zhì)交換。營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)互補(bǔ):營(yíng)養(yǎng)缺點(diǎn)型細(xì)菌經(jīng)過培養(yǎng)交換營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),相互補(bǔ)充了對(duì)方不足而得以在基本培養(yǎng)基上生長(zhǎng)。b)對(duì)照培養(yǎng)A、B菌株都沒有生長(zhǎng)出菌落。細(xì)菌和病毒的遺傳第31頁(yè)對(duì)Lederberg-Tatum試驗(yàn)解釋質(zhì)疑
(1)試驗(yàn)取得原養(yǎng)型重組菌可能是轉(zhuǎn)化結(jié)果。(2)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)互補(bǔ):培養(yǎng)基中含有一些代謝產(chǎn)物,混合后相互補(bǔ)充了對(duì)方缺點(diǎn)而得以生長(zhǎng)。Lederberg和Tatum補(bǔ)充試驗(yàn)A(或B)菌株基本培養(yǎng)基中培養(yǎng)細(xì)菌濾器過濾濾液B(或A)菌株基本培養(yǎng)基中培養(yǎng)不能生長(zhǎng)細(xì)菌和病毒的遺傳第32頁(yè)BernardDavis試驗(yàn)支持:是遺傳重組,而不是營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)互補(bǔ),但需要親本細(xì)胞接觸。細(xì)菌和病毒的遺傳第33頁(yè)Hayes(海斯)試驗(yàn)strainA鏈霉素處理strainBstrainA×在基本培養(yǎng)基中有菌落
接合:指兩菌體細(xì)胞直接接觸,遺傳物質(zhì)從一個(gè)菌體轉(zhuǎn)移到另外一個(gè)菌體,并造成遺傳重組過程。2.接合
1952年Hayes用鏈霉素處理菌株A,然后和菌株B雜交,有遺傳重組發(fā)生,反之,則無重組產(chǎn)生,說明細(xì)菌遺傳物質(zhì)交換不是交互,而是單向---F因子細(xì)菌和病毒的遺傳第34頁(yè)試驗(yàn)推論strainB鏈霉素處理strainAstrainB×在基本培養(yǎng)基中沒有菌落鏈霉素只阻止細(xì)菌分裂,但允許接觸雜交。①供體:strainA即使被阻止分裂,但依然能完成雜交(給出DNA),結(jié)果產(chǎn)生分裂形成原養(yǎng)型菌落。細(xì)菌和病毒的遺傳第35頁(yè)結(jié)論:strainB被阻止分裂,也能完成雜交(接收DNA),但不能分裂形成原養(yǎng)型菌落。②受體:兩個(gè)菌株在雜交過程中作用不是交互,而是單向,DNA只能從供體轉(zhuǎn)移到受體。細(xì)菌和病毒的遺傳第36頁(yè)Hayes等對(duì)“雄性”細(xì)菌和“雌性”細(xì)菌解釋(1)供體(donor)菌株:(2)受體(recipient)菌株:“雄性”菌株:細(xì)胞內(nèi)含有一個(gè)致育因子(fertilityfactor),表示為F+?!按菩浴本辏喝狈因子,表示為F-。從邏輯上預(yù)言了F因子(Ffactor)存在。細(xì)菌和病毒的遺傳第37頁(yè)F因子實(shí)質(zhì)
Ffactor:是一個(gè)質(zhì)粒,有獨(dú)立自主復(fù)制和能夠轉(zhuǎn)移到其它細(xì)胞中去能力。是一個(gè)共價(jià)閉合環(huán)狀DNA,全長(zhǎng)94.5kb。
質(zhì)粒(plasmid):存在于細(xì)菌染色體以外DNA。對(duì)細(xì)菌生存并非必須,但能給細(xì)菌帶來一些額外功效(如抗菌素抗性等)。F因子結(jié)構(gòu)細(xì)菌和病毒的遺傳第38頁(yè)大腸桿菌接合過程(F+×F-):F因子轉(zhuǎn)移頻率高,而細(xì)菌DNA轉(zhuǎn)移頻率極低。F+×F-(1)F+與F-混合培養(yǎng)相互接觸,F(xiàn)+供體菌上性傘毛形成兩細(xì)胞之間接合管(2)核酸內(nèi)切酶在F因子轉(zhuǎn)移起點(diǎn)(oriT)一條鏈上產(chǎn)生一個(gè)缺口,然后5’末端單鏈經(jīng)過接合管進(jìn)入受體細(xì)胞(3)F因子上單鏈DNA和正在轉(zhuǎn)移單鏈DNA,各自為模板,在DNA聚合酶作用下合成雙鏈DNA(4)完成F因子向受體細(xì)胞轉(zhuǎn)移以及DNA合成(5)在DNA連接酶作用下完成接合,形成兩個(gè)F+細(xì)胞細(xì)菌和病毒的遺傳第39頁(yè)3.高頻重組菌株(Hfr)1950年LucaCavalli-Sforza(卡瓦里-斯弗所)用氮芥(nitrogenmustard)處理A菌株,從存活下來菌中分離到一株能與B菌株以10-4頻率雜交菌株,稱之為Hfr(highfrequencyrecombination)。F+
×F-F+Hfr×F-F-低頻率重組,10-7高頻率重組,10-4細(xì)菌和病毒的遺傳第40頁(yè)高頻重組與F因子關(guān)系(1)Hfr與Ffactor異同處:①都能與F-雜交②雜交時(shí)都要經(jīng)過接合形式③高劑量鏈霉素處理不影響雜交①產(chǎn)生重組菌落頻率不一樣②F+
×F-后代是F+
;
Hfr×F-后代是F-
③F+經(jīng)吖啶橙處理變成F-;而Hfr經(jīng)丫啶橙處理仍為Hfr,能與
F-雜交相同點(diǎn)不一樣點(diǎn)細(xì)菌和病毒的遺傳第41頁(yè)部分二倍體F因子整合到染色體上,形成Hfr,因?yàn)镕因子整合在細(xì)菌染色體位置和方向是隨機(jī),所以存在許多不一樣Hfr菌株。Hfr×F-:細(xì)菌DNA轉(zhuǎn)移率很高,F(xiàn)因子轉(zhuǎn)移率很低。Hfr染色體上F因子轉(zhuǎn)移起點(diǎn)被核實(shí)內(nèi)切酶切開,以一小段FDNA首先進(jìn)入受體細(xì)胞,然后是染色體DNA細(xì)菌和病毒的遺傳第42頁(yè)1.兩細(xì)胞接觸,供體性傘毛形成接合管,整合F因子產(chǎn)生缺口。單鏈經(jīng)過接合管轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞(F因子轉(zhuǎn)移原點(diǎn)及附近供體基因);2.轉(zhuǎn)移部分Hfr染色體與完整F-染色體,形成部分二倍體;3.經(jīng)過雙交換,供體基因整合在受體基因組上。假如部分二倍體中發(fā)生單交換或奇數(shù)交換,則受體內(nèi)基因子由環(huán)狀變?yōu)榫€狀,造成細(xì)菌死亡。Hfr×F-部分二倍體:轉(zhuǎn)移供體染色體稱為供體外基因子,而受體完整染色體稱為受體內(nèi)基因子。轉(zhuǎn)移染色體長(zhǎng)度普通限制在供體染色體總長(zhǎng)1/2以內(nèi)。線性DNA片段被降解細(xì)菌和病毒的遺傳第43頁(yè)細(xì)菌和病毒的遺傳第44頁(yè)4.F’因子和性導(dǎo)(sexduction)F’因子形成在Hfr細(xì)胞中,染色體上F因子是相當(dāng)穩(wěn)定,但F因子也能夠低頻率地從細(xì)菌染色體上切除,偶然會(huì)形成攜帶部分細(xì)菌染色體基因F因子,阿代爾伯格和伯恩斯(Adelberg和Burns,1959年)稱該因子為F’因子。細(xì)菌和病毒的遺傳第45頁(yè)性導(dǎo)(sexduction):指F’因子所攜帶細(xì)菌染色體DNA,經(jīng)過接合作用轉(zhuǎn)移到受體細(xì)菌染色體中,從而改變受體遺傳性狀過程。性導(dǎo)在受體細(xì)菌中可形成部分二倍體。細(xì)菌和病毒的遺傳第46頁(yè)基因AE形成部分二倍體經(jīng)過接合作用轉(zhuǎn)移到受體細(xì)菌染色體F’因子攜帶細(xì)菌染色體DNA細(xì)菌和病毒的遺傳第47頁(yè)形成部分二倍體可發(fā)生一下幾個(gè)情況:2、若發(fā)生重組,即F′因子所攜帶供體細(xì)菌染色體同受體細(xì)菌染色體之間發(fā)生了同源重組,
1、這種部分二倍體若不發(fā)生重組,那么F′因子可在細(xì)菌細(xì)胞中自主延續(xù)下去;1)假如發(fā)生單交換,會(huì)造成F′因子整合到受體染色體上而形成Hfr品系,同時(shí)F′因子上所攜帶供體基因也發(fā)生重組;2)假如發(fā)生雙交換,使F′因子上細(xì)菌基因與受體染色體上等位基因之間發(fā)生交換,形成F′品系和重組細(xì)菌染色體。
細(xì)菌和病毒的遺傳第48頁(yè)5.F因子與F-、F+、Hfr、F′關(guān)系
1)F+與F-關(guān)系:當(dāng)F+和F-接合過程中,它們之間形成接合管,使受體取得了F因子而成為F+菌。F因子以高頻率從F+菌向F-菌轉(zhuǎn)移,而染色體基因轉(zhuǎn)移則極少發(fā)覺,重組頻率大約只有10-7,所以F+菌稱為低頻重組型(lowfrequencyrecombination,Lfr)。2)Hfr與F-關(guān)系:當(dāng)Hfr與F-接合過程中,首先形成接合管,使供體染色體轉(zhuǎn)移給受體,形成高重組頻率(10-4),所以Hfr菌稱為高頻重組型(highfrequencyrecombinationstrain,Hfr)。3)Hfr與F+、
F′關(guān)系:Hfr與F+菌株能夠相互轉(zhuǎn)變,F(xiàn)因子既能夠插入到染色體中去(Hfr),又能夠經(jīng)過規(guī)則交換和剪切,從染色體上完整地游離下來(F+)。F因子在從染色體上剪切時(shí)偶然也會(huì)出現(xiàn)不規(guī)則分離結(jié)果,使F因子攜帶一段相鄰細(xì)菌染色體,這種帶有插入細(xì)菌基因環(huán)狀F因子稱為F′因子。F′因子即能高頻地轉(zhuǎn)移質(zhì)粒DNA,也能高頻地轉(zhuǎn)移細(xì)菌DNA。
細(xì)菌和病毒的遺傳第49頁(yè)1.中止雜交法作圖中止雜交(interruptedmatingtechnique):1957年,EllieWollman(沃爾曼)和FrancoisJacob(雅各布)建立了一個(gè)繪制E.coli遺傳圖方法:1)Hfr與F-雜交,在混合后不一樣時(shí)間進(jìn)行攪拌,使接合管斷裂,終止染色體向F-細(xì)胞移動(dòng);2)稀釋后接種到含有鏈霉素培養(yǎng)基上,殺死Hfr;3)影印到各種選擇性培養(yǎng)基(selectivemedia)上,以某供體基因作為選擇標(biāo)識(shí),測(cè)定其進(jìn)入受體后其它非選擇性標(biāo)識(shí)基因進(jìn)入F-細(xì)菌次序和時(shí)間。五、細(xì)菌重組頻率和遺傳作圖細(xì)菌和病毒的遺傳第50頁(yè)作圖原理越是靠近轉(zhuǎn)移起點(diǎn)(原點(diǎn))基因越早發(fā)生轉(zhuǎn)移,混合培養(yǎng)時(shí)間越少。在不一樣時(shí)間中止雜交,依據(jù)不一樣基因轉(zhuǎn)移時(shí)間就能推斷出基因次序。細(xì)菌和病毒的遺傳第51頁(yè)Hfr與F-混合培養(yǎng)不一樣時(shí)間取樣攪拌中止雜交
稀釋
含鏈霉素完全培養(yǎng)基
殺死Hfr
抗str菌落影印培養(yǎng)判定azi+ton+gal+lac+各基因轉(zhuǎn)移時(shí)間?;旌吓囵B(yǎng)9分鐘,出現(xiàn)azi+;混合培養(yǎng)11分鐘,出現(xiàn)azi+和ton+;混合培養(yǎng)18分鐘,出現(xiàn)azi+、ton+和lac+;混合培養(yǎng)24分鐘,4種原養(yǎng)型都出現(xiàn)。oazitonlacgalF
9
11
18
24Hfr:strs(抗鏈霉素)、azi+(抗疊N化合物)、ton+(抗T1噬菌體)、gal+(半乳糖原養(yǎng)型)、lac+(乳糖原養(yǎng)型)F-:strr(鏈霉素敏感型)、azi-(疊N化合物敏感型)、ton-(T1噬菌體敏感型)、gal-(半乳糖缺點(diǎn)型)、lac-(乳糖缺點(diǎn)型)細(xì)菌和病毒的遺傳第52頁(yè)E.coli染色體是環(huán)狀
Wollman和Jacob用4個(gè)不一樣Hfr菌株同F(xiàn)-進(jìn)行中止雜交,得到基因排列次序相同,不過進(jìn)入時(shí)間早晚(重組率)不一樣。細(xì)菌和病毒的遺傳第53頁(yè)解釋Hfr染色體上F因子整合位點(diǎn)不一樣,整合方向也不一樣;傳遞起始點(diǎn)不一樣。E.coli染色體是環(huán)狀。細(xì)菌和病毒的遺傳第54頁(yè)細(xì)菌和病毒的遺傳第55頁(yè)2.重組作圖部分二倍體,只有偶數(shù)交換才能產(chǎn)生平衡重組配子,相反重組子不出現(xiàn)。部分二倍體細(xì)菌和病毒的遺傳第56頁(yè)重組作圖
(recombinationmapping)——是依據(jù)基因間重組率進(jìn)行基因定位。
下面經(jīng)過實(shí)例來加以說明:
比如依據(jù)中止雜交試驗(yàn),已知大腸桿菌甲硫氨酸缺點(diǎn)型(met-)、精氨酸缺點(diǎn)型(arg-)、亮氨酸缺點(diǎn)型(leu-)這三個(gè)基因是緊密連鎖,而且就某特定Hfr菌株來說,基因轉(zhuǎn)移次序是met+、arg+、leu+
Hfrmet+
arg+
leu+
strs×F-
met-
arg-leu-strr
含鏈霉素并添加精氨酸以及甲硫氨酸培養(yǎng)基上(在這種培養(yǎng)基中,殺死全部Hfr細(xì)胞和未雜交F-細(xì)胞)。在這種培養(yǎng)基中形成菌落重組子基因型應(yīng)該是leu+strr。細(xì)菌和病毒的遺傳第57頁(yè)
已經(jīng)篩選出leu+重組子,用影印法測(cè)定其余兩個(gè)非選擇標(biāo)識(shí)基因以及他們菌落數(shù)。測(cè)定結(jié)果以下:
基因型
菌落數(shù)基因型
菌落數(shù)leu+arg-met-
16
leu+arg+met-
36leu+arg+met+
348
leu+arg-met+
0
基因型leu+arg-met+是四交換結(jié)果,與雙交換相比,其交換頻率非常低,在此次試驗(yàn)中未能檢測(cè)到該重組基因型。細(xì)菌和病毒的遺傳第58頁(yè)16363480細(xì)菌和病毒的遺傳第59頁(yè)
依據(jù)上述接合結(jié)果,基因間重組率可用下式計(jì)算:
leu-arg重組率=[(leu+arg-met-)+(leu+arg-met+)]/[(leu+arg-met-)+(leu+arg+met-)+(leu+arg+met+)+(leu+arg-met+)]×100%=16/16+36+348=4%arg-met重組率=[(leu+arg+met-)+(leu+arg-met+)]/[(leu+arg-met-)+(leu+arg+met)+(leu+arg+met+)+(leu+arg-met+)]×100%=36/16+36+348=9%leu-met重組率=[(leu+arg+met-)+(leu+arg-met-)+(leu+arg-met+)]/[(leu+arg-met-)+(leu+arg+met-)
+(leu+arg+met+)+(leu+arg-met+)]×100%=16+36/16+36+348=13%細(xì)菌和病毒的遺傳第60頁(yè)重組作圖重組頻率(RF)所測(cè)得基因間距離與中止雜交以時(shí)間(T)為單位取得基因間距離基本上相一致;1個(gè)時(shí)間單位(1分鐘)相當(dāng)于20%重組值(或20cM)。
大腸桿菌遺傳圖譜和物理圖譜比較圖a表示1990年繪制遺傳圖譜中近60分鐘到61分鐘標(biāo)識(shí)基因;圖b表示每個(gè)基因在大腸桿菌完整基因組序列中準(zhǔn)確位置。細(xì)菌和病毒的遺傳第61頁(yè)中止雜交法和重組作圖繪制大腸桿菌遺傳圖(1963)mapunitsinminutes細(xì)菌和病毒的遺傳第62頁(yè)
第三節(jié)噬菌體遺傳分析細(xì)菌和病毒的遺傳第63頁(yè)一、噬菌體生活周期(一)烈性噬菌體細(xì)菌和病毒的遺傳第64頁(yè)1.噬菌體吸附到宿主細(xì)胞上2.尾絲鞘收縮,中軸刺穿宿主細(xì)胞3.頭部DNA被送入宿主細(xì)胞4.在數(shù)分鐘內(nèi),全部細(xì)菌核酸和蛋白質(zhì)合成都被抑制。細(xì)菌和病毒的遺傳第65頁(yè)5.噬菌體大分子合成,細(xì)菌核酸被降解。(1)噬菌體DNA復(fù)制。(2)噬菌體外殼蛋白合成。細(xì)菌和病毒的遺傳第66頁(yè)(1)DNA被包到頭部(2)組裝尾部(3)裝上尾絲6.噬菌體組裝細(xì)菌和病毒的遺傳第67頁(yè)約200個(gè)噬菌體造成細(xì)菌被噬菌體基因編碼溶菌酶(lysozyme)溶解。7.宿主細(xì)胞破裂細(xì)菌和病毒的遺傳第68頁(yè)烈性噬菌體(二)溫和性噬菌體侵染細(xì)菌原噬菌體(λ噬菌體)溶源路徑進(jìn)入溶菌階段理化原因作用,原噬菌體脫離宿主染色體而進(jìn)入裂解路徑。裂解寄主而釋放溶源細(xì)菌細(xì)胞分裂,溶源性穩(wěn)定遺傳
噬菌體吸附在細(xì)菌上,將染色體注入宿主細(xì)胞內(nèi)溶源路徑溶菌路徑細(xì)菌和病毒的遺傳第69頁(yè)二、噬菌體基因重組1.噬菌體表型區(qū)分
噬菌體突變影響生活周期,會(huì)產(chǎn)生不一樣噬菌斑。噬菌斑是噬菌體感染宿主細(xì)菌后,在細(xì)菌涂布平板培養(yǎng)基中形成,肉眼可見透明圈。1個(gè)噬菌斑大約含有107個(gè)噬菌體,它們起源于同一個(gè)噬菌體,是噬菌體重復(fù)侵染、裂解細(xì)菌后產(chǎn)生噬菌體后代,所以有著相同基因型。經(jīng)過觀察噬菌斑形態(tài)來判別噬菌體基因型。細(xì)菌和病毒的遺傳第70頁(yè)①噬菌斑形態(tài):(T2噬菌體)②宿主范圍:h(突變型):噬菌體能在E.coliB和B/2品系上生長(zhǎng)h+(野生型):只能在E.coliB品系上生長(zhǎng)。能在B和B/2混合菌苔上產(chǎn)生透明斑。感染B菌株,產(chǎn)生半透明斑。r(突變型):快速溶菌,噬菌斑大,邊緣清楚。r+(野生型):噬菌斑小,邊緣含糊。細(xì)菌和病毒的遺傳第71頁(yè)2、噬菌體雜交親本噬菌體(T2)基因型hr+:透明,小斑,邊緣含糊h+r:半透明,大斑,邊緣清楚,雜交過程——混合感染試驗(yàn)兩個(gè)親本噬菌體混合感染E.coliB和B/2,觀察菌苔上出現(xiàn)噬菌斑特征,用以推斷噬菌體基因型。細(xì)菌和病毒的遺傳第72頁(yè)hr+×h+rhr+和h+r噬菌體同時(shí)感染E.coliB噬菌體DNA復(fù)制、重組產(chǎn)生親本型和重組型子代噬菌體細(xì)菌和病毒的遺傳第73頁(yè)半大半小透小透大上述子代噬菌體接種在同時(shí)長(zhǎng)滿大腸桿菌B和B/2混合培養(yǎng)物中依據(jù)噬菌斑點(diǎn)形態(tài)識(shí)別噬菌體基因型細(xì)菌和病毒的遺傳第74頁(yè)
hr+×h+r中在B和B/2混合菌苔上出現(xiàn)了4種噬菌斑。噬菌斑表型推測(cè)基因型親本型透明小hr+半透明大h+r重組型半透明小h+r+透明大hr細(xì)菌和病毒的遺傳第75頁(yè)3、噬菌體重組值與基因作圖重組值計(jì)算重組噬菌體噬菌斑數(shù)總噬菌斑數(shù)×100%基因圖距用兩個(gè)基因重組值表示基因間距離。(h+r++hr)totalplaques×100%細(xì)菌和病毒的遺傳第76頁(yè)Hershey和Rotman1949年T2雜交結(jié)果基因型噬菌斑百分率hr+4276%h+r34h+r+1224%hr12rh24細(xì)菌和病毒的遺傳第77頁(yè)4.重組機(jī)理h+rh+rh+rhr+hr+hr+h+rh+rh+rhr+hr+hr+噬菌體染色體在細(xì)菌體內(nèi)復(fù)制不一樣噬菌體染色體在細(xì)菌體內(nèi)交換重組h+rh+r細(xì)菌和病毒的遺傳第78頁(yè)h+r+h+rh+rhr+hr+hrh+rh+r+h+rhr+hrh+r釋放出4種子代噬菌體部分噬菌體DNA重組細(xì)菌和病毒的遺傳第79頁(yè)細(xì)菌和病毒的遺傳第80頁(yè)噬菌體也能夠經(jīng)過類似于高等生物三點(diǎn)測(cè)驗(yàn)進(jìn)行基因定位。如用T4噬菌體兩個(gè)品系混合感染大腸桿菌。一個(gè)品系是:小噬菌斑(m)、快速溶菌(r)、混濁噬菌斑(tu);另一品系對(duì)這三個(gè)性狀都是野生型(+++),混合感染大腸桿菌類型基因型噬菌斑數(shù)百分比%重組發(fā)生在m—rr—tum—tu親本型mrtu346769.6+++3929單交換型m++5209.6√√+rtu474單交換型mr+85317.5√√++tu965雙交換型m+tu1623.3√√+r+172合計(jì)1034212.9%20.8%27.1%細(xì)菌和病毒的遺傳第81頁(yè)與真核生物不一樣,病毒只含有一條染色體,親本組合與重組合可直接從后代中反應(yīng)出來。所得后代8種類型中數(shù)目最少兩個(gè)就是雙交換結(jié)果,頻率最高兩個(gè)是親本類型,其余為單交換類型。依據(jù)表中結(jié)果,我們就能計(jì)算這三個(gè)基因間重組以及符合系數(shù)。表中結(jié)果可知:m-r重組率為12.9%,r-tu重組率為20.8%,m-tu重組率為27.1%,所以,m、r及tu基因排列次序?yàn)椋簃——r——tu。
由此可見,利用混合感染試驗(yàn)結(jié)果,能夠?qū)⑹删w基因定位在染色體上,制作噬菌體連鎖遺傳圖。Streisinger和Edgar依據(jù)許多基因重組資料,在1964年確定噬菌體染色體是環(huán)狀。細(xì)菌和病毒的遺傳第82頁(yè)噬菌體遺傳圖細(xì)菌和病毒的遺傳第83頁(yè)1.轉(zhuǎn)導(dǎo)發(fā)覺1952年,J.Lederberg和他學(xué)生N.Zinder(津德)在鼠傷寒沙門氏菌(salmonellatyphimurium)中作重組試驗(yàn):菌株StrainLA-2:phe+trp+met-his-StrainLA-22:phe-trp-met+his+三、轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)
Transduction:以噬菌體為媒介,將細(xì)菌供體DNA轉(zhuǎn)移到受體,使受體發(fā)生遺傳變異過程。細(xì)菌和病毒的遺傳第84頁(yè)雜交結(jié)果StrainLA-2:StrainLA-22:×10-5Prototrophsphe+trp+met+his+DavisU-tube試驗(yàn)將兩個(gè)親本分別放在U形管兩臂中,結(jié)果一樣能取得原養(yǎng)型重組菌!而且只在LA-22中!細(xì)菌和病毒的遺傳第85頁(yè)加壓或吸壓菌株LA-22菌株LA-2涂布在固體平板基本培養(yǎng)基上微孔濾片涂布在固體平板基本培養(yǎng)基上沒有菌落原養(yǎng)型菌落(phe+trp+met+his+),頻率為10-5細(xì)菌和病毒的遺傳第86頁(yè)依據(jù)以上結(jié)果推斷,一個(gè)能夠經(jīng)過細(xì)菌濾片因子將遺傳信息從LA-2傳遞給了LA-22。稱之為過濾因子(FA)。另一些試驗(yàn)又證實(shí)了:FA不是裸露DNA,加入DNA酶并不能減弱FA效力(同時(shí)也排除了轉(zhuǎn)化);LA-2產(chǎn)生FA需要LA-22存在,F(xiàn)A能穿過微孔濾片;FA與從溶源性細(xì)菌中分離得到溫和噬菌體P22質(zhì)量大小相同;用抗P22血清或加熱處理,P22感染性和FA功效失活速率相同;抗噬菌體P22在鼠傷寒沙門氏菌對(duì)FA也表現(xiàn)為抗性。這些結(jié)果證實(shí),F(xiàn)A就是溫和噬菌體P22。細(xì)菌和病毒的遺傳第87頁(yè)推論LA-22菌株是溶源性,LA-2是非溶源性。在培養(yǎng)過程中,LA-22中原噬菌體P22偶然裂解,穿過濾片后感染并裂解LA-2,包裝了LA-2基因,返回濾片感染LA-22并溶源化。給LA-22帶入phe+trp+。形成原養(yǎng)型菌落。細(xì)菌和病毒的遺傳第88頁(yè)穿過濾片原養(yǎng)型LA-22(+P22)P22偶然溶菌P22感染LA-22LA-22重組感染LA-2偶然包裝LA-2基因P22P22細(xì)菌和病毒的遺傳第89頁(yè)2.普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransduction)比如:鼠傷寒沙門氏菌P22噬菌體、大腸桿菌P1噬菌體
普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo):供體細(xì)菌染色體DNA任何基因或任何片段都有可能被噬菌體轉(zhuǎn)入受體菌過程。
通常能夠進(jìn)行普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體是烈性噬菌體,他們感染細(xì)菌細(xì)胞后,在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制,最終造成細(xì)胞裂解。在裂解過程中,供體細(xì)胞DNA降解。噬菌體包裝時(shí)可能以很低頻率發(fā)生錯(cuò)誤而將供體細(xì)胞DNA誤為噬菌體本身DNA進(jìn)行包裝。當(dāng)這個(gè)噬菌體(轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體或轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒)感染另一個(gè)細(xì)胞(受體)時(shí),能夠?qū)⒐wDNA轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞中,形成部分二倍體,并經(jīng)過同源區(qū)段交換整合到受體細(xì)菌染色體DNA中,形成一個(gè)穩(wěn)定轉(zhuǎn)導(dǎo)子。細(xì)菌和病毒的遺傳第90頁(yè)1)因?yàn)槭删w錯(cuò)誤包裝及注入受體菌供體DNA片段是隨機(jī),因而對(duì)所轉(zhuǎn)導(dǎo)基因沒有限制。
2)轉(zhuǎn)入受體菌供體DNA片段在受體菌中不能復(fù)制,但能夠經(jīng)過DNA重組整合到受體染色體基因組,與受體菌染色體一起復(fù)制。特點(diǎn):細(xì)菌和病毒的遺傳第91頁(yè)噬菌體吸附并注入DNA噬菌體DNA復(fù)制、蛋白質(zhì)合成,宿主染色體降解成小片段錯(cuò)誤包裝,形成轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體吸附并將細(xì)菌DNA注入
形
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