遺傳學(xué)第三章 第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)課件_第1頁(yè)
遺傳學(xué)第三章 第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)課件_第2頁(yè)
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遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)處理遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)處理

ApplicationofStatisticsinGenetics(問(wèn)題的提出)一、概率原理與應(yīng)用二、二項(xiàng)式展開(kāi)與應(yīng)用三、Χ2測(cè)驗(yàn)(Chi平方測(cè)驗(yàn))與應(yīng)用3遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)為什么要應(yīng)用統(tǒng)計(jì)方法分析數(shù)據(jù)?孟德?tīng)枌?duì)數(shù)據(jù)的處理:歸類(lèi)統(tǒng)計(jì)(歸類(lèi)記載)與描述統(tǒng)計(jì)。實(shí)際結(jié)果與理論比例波動(dòng)的解釋:孟德?tīng)栯s交試驗(yàn)結(jié)果與理論比例的差異;試驗(yàn)誤差的來(lái)源:隨機(jī)誤差:N(0,σ2);系統(tǒng)誤差。本節(jié)中概率定理及二項(xiàng)式公式是用于推算理論比例,而Χ2測(cè)驗(yàn)則是用于測(cè)定試驗(yàn)結(jié)果是否符合理論比例。4遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)一、概率原理與應(yīng)用(一)、概率(probability):概率(機(jī)率/幾率/或然率):指一定事件總體中某一事件發(fā)生的可能性(幾率)。例:雜種F1產(chǎn)生的配子中,帶有顯性基因和隱性基因的概率均為50%。在遺傳研究時(shí),可以采用概率及概率原理對(duì)各個(gè)世代尤其是分離世代(如F2)的表現(xiàn)型或基因型種類(lèi)和比率(各種類(lèi)型出現(xiàn)的概率)進(jìn)行算,從而分析、判斷該比率的真實(shí)性與可靠性;并進(jìn)而研究其遺傳規(guī)律。5遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(二)概率基本定理(乘法定理與加法定理)1.乘法定理:

兩個(gè)獨(dú)立事件同時(shí)發(fā)生的概率等于各個(gè)事件發(fā)生的概率的乘積。例:雙雜合體(YyRr)中,Yy的分離與Rr的分離是相互獨(dú)立的,在F1的配子中:具有Y的概率是1/2,y的概率也1/2;具有R的概率是1/2,r的概率是1/2。而同時(shí)具有Y和R的概率是兩個(gè)獨(dú)立事件(具有Y和R)概率的乘積:1/2×1/2=1/4。6遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

兩個(gè)互斥事件的和事件發(fā)生的概率是各個(gè)事件各自發(fā)生的概率之和?;コ馐录谝淮卧囼?yàn)中,某一件出現(xiàn),另一事件即被排斥;也就是互相排斥的事件。

如:拋硬幣。

又如:雜種F1(Cc)自交F2基因型為CC與Cc是互斥事件,兩者的概率分別為1/4和2/4,因此F2表現(xiàn)為顯性性狀(開(kāi)紅花)的概率為兩者概率之和3/4——基因型為CC或Cc。2.加法定理:7遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(三)、概率定理的應(yīng)用示例1.用乘法定理推算F2表現(xiàn)型種類(lèi)與比例.如前所述,根據(jù)分離規(guī)律,F(xiàn)1(YyRr)自交得到的F2代中:子葉色呈黃色的概率為3/4,綠色的概率為1/4;種子形態(tài)圓粒的概率為3/4,皺粒的概率為1/4。因此根據(jù)乘法定理:8遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(三)、概率定理的應(yīng)用示例2.用乘法定理推算F2基因型種類(lèi)與比例.F1雌雄配子均有四種,且每種的概率為1/4;并且各種雌雄配子結(jié)合的機(jī)會(huì)是均等的。根據(jù)乘法定理,F(xiàn)2產(chǎn)生的16種組合方式;再根據(jù)加法定理。其中基因型YYRr出現(xiàn)的概率是1/16+1/16。9遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)二、二項(xiàng)式展開(kāi)式與應(yīng)用(一)、二項(xiàng)式公式與通式(二)、雜種自交后代群體的基因型結(jié)構(gòu)(三)、測(cè)交后代群體的表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)(四)、雜種自交后代群體表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)(五)、雜種自交后代某種表現(xiàn)型出現(xiàn)的概率11遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)2個(gè)子代:(p+q)2=1p2+2pq+1q2(Aa+aa)2=1Aa2+2Aa*aa+1aa2

=(1/2+1/2)2=1/4+2/4+1/43個(gè)子代:(p+q)3=1p3+3p2q+3pq2+1q3(Aa+aa)3=1Aa3+3Aa2*aa+3Aa*aa2+1aa3

=1/8+3/8+3/8+1/812遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(一)、二項(xiàng)式公式與通式用于分析兩對(duì)立事件(非此即彼)在多次試驗(yàn)中每種事件組合發(fā)生的概率。設(shè)A、B為對(duì)立事件,P(A)=p,P(B)=q,n為估測(cè)其事件出現(xiàn)概率的事件數(shù)(幾個(gè)子代?)。顯然P(A+B)=p+q=1。r:在n次事件中A事件出現(xiàn)的次數(shù);n-r:在n次事件中B事件出現(xiàn)的次數(shù);13遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)例:AaXaa,如產(chǎn)生4個(gè)子代,問(wèn)子代中Aa的機(jī)會(huì)有多少?因AaXaa產(chǎn)生配子時(shí)分離,子代中出現(xiàn)Aa和aa的概率各為1/2,即:p=?,q=1/2,s=1,n=4求出概率為1/1614遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(二)、雜種自交后代群體的基因型結(jié)構(gòu)以兩對(duì)基因雜合體(YyRr)自交為例,分析其自交后代群體基因型結(jié)構(gòu)時(shí):A事件為一個(gè)F2中出現(xiàn)顯性基因(Y或R),P(A)=p=1/2;B事件為一個(gè)F2中出現(xiàn)隱性基因(y或r),P(B)=q=1/2。n=4為(雜合)基因個(gè)數(shù),有p+q=1.代入二項(xiàng)公式,得到F2個(gè)體中,具有:4個(gè)顯性基因的概率為1/16(一種基因型);3個(gè)顯性、1個(gè)隱性基因的概率為4/16(多種基因型);2個(gè)顯性、2個(gè)隱性基因的概率為6/16(多種基因型);1個(gè)顯性、3個(gè)隱性基因的概率為4/16(多種基因型);4個(gè)隱性基因的概率為1/16(一種基因型)。15遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(三)、測(cè)交后代群體的表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)以兩對(duì)基因雜合體(YyRr)測(cè)交為例,分析其自交后代群體表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)時(shí):A事件:Ft表現(xiàn)為顯性(黃子葉或圓粒),P(A)=p=1/2;B事件:Ft表現(xiàn)為隱性(綠子葉或皺粒),P(B)=q=1/2。n=2為相對(duì)性狀(雜合基因)對(duì)數(shù),有p+q=1.代入二項(xiàng)公式,得到Ft中,表現(xiàn):2個(gè)顯性性狀的概率為1/4(黃圓);1個(gè)顯性、1個(gè)隱性性狀的概率為2/4(黃皺、綠圓);2個(gè)隱性基因的概率為1/4(綠皺)。16遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(四)、雜種自交后代群體表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)以兩對(duì)基因雜合體(YyRr)自交為例,分析其自交后代群體表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)時(shí):A事件:F2表現(xiàn)為顯性(黃子葉或圓粒),P(A)=p=3/4;B事件:F2表現(xiàn)為隱性(綠子葉或皺粒),P(B)=q=1/4。n=2為相對(duì)性狀(雜合基因)對(duì)數(shù),有p+q=1.代入二項(xiàng)公式,得到F2中,表現(xiàn):2個(gè)顯性性狀的概率為9/16(黃圓);1個(gè)顯性、1個(gè)隱性性狀的概率為6/16(黃皺、綠圓);2個(gè)隱性基因的概率為1/16(綠皺)。17遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(四)、雜種自交后代群體表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)當(dāng)有三對(duì)基因雜合體(YyRrCc)自交時(shí),其自交后代群體表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)分析時(shí):A事件:F2表現(xiàn)為顯性(黃子葉、圓?;蚣t花),P(A)=p=3/4;B事件:F2表現(xiàn)為隱性(綠子葉、皺?;虬谆?,P(B)=q=1/4。n=3為相對(duì)性狀(雜合基因)對(duì)數(shù),有p+q=1.同樣代入二項(xiàng)式公式,得到27:27:9:1的表現(xiàn)型結(jié)構(gòu)。遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(五)、雜種自交后代某種表現(xiàn)型出現(xiàn)的概率關(guān)鍵在于首先根據(jù)給定條件確定p、q、n以及要求推算項(xiàng)的r值。遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)三、Х2平方測(cè)驗(yàn)及應(yīng)用Χ2測(cè)驗(yàn)是一種統(tǒng)計(jì)假設(shè)測(cè)驗(yàn):先作統(tǒng)計(jì)假設(shè)(一個(gè)無(wú)效假設(shè)和一個(gè)備擇假設(shè)),然后根據(jù)估計(jì)的參數(shù)(Χ2)來(lái)判斷應(yīng)該接受其中哪一個(gè)。20遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(一)、Χ2測(cè)驗(yàn)的兩種應(yīng)用1.樣本方差的同質(zhì)性檢驗(yàn);2.次數(shù)分布資料的適合性測(cè)驗(yàn)。在檢驗(yàn)雜交試驗(yàn)得到的k種表現(xiàn)型的數(shù)目(次數(shù)分布資料)是否符合一個(gè)預(yù)期的理論比例時(shí),采用下述公式計(jì)算統(tǒng)計(jì)參數(shù)Χ2值,該參數(shù)符合以k-1為自由度的一個(gè)Χ2理論分布。21遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(二)、Χ2測(cè)驗(yàn)應(yīng)用方法統(tǒng)計(jì)假設(shè):無(wú)效假設(shè)H0:試驗(yàn)結(jié)果與理論比例相符合;備擇假設(shè)HA:試驗(yàn)結(jié)果與理論比例不相符。參數(shù)估計(jì)與檢驗(yàn):1.按公式計(jì)算Χ2值;2.用統(tǒng)計(jì)參數(shù)Χ2與查表得到的Χ2α,k-1比較;α為臨界概率值,為0.05或0.01,通常用0.05;當(dāng)Χ2<Χ20.05,k-1時(shí)接受無(wú)效假設(shè),反之接受備擇假設(shè)?;颍簭谋碇兄苯訌谋碇胁榈忙?對(duì)應(yīng)用概率值P(Χ2),當(dāng)P(Χ2)>0.05時(shí),接受無(wú)效假設(shè)(差異不顯著)。22遺傳學(xué)第三章第四節(jié)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)X2檢驗(yàn)應(yīng)用實(shí)例k=4,df=k-1=3;Χ20.05,3=7.815;Χ2=0.47,P(Χ2)~(0.90-0.95)結(jié)論:YyRr個(gè)體自交后代四種表現(xiàn)型的比例與9:3:3:1的理論比例間差異不顯著。23遺傳學(xué)第三章第四節(jié)

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