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文檔簡介
基因工程課程習題 選擇題 001 基因工程操作的三大基本元件是【】I 供體 II 受體 III 載體 IV 抗體 V 配體 I + II + III I + III + IV II + III + IV II + IV + V III + IV + V 002 根據(jù)當今生命科學理論,基因工程的用途是【E】 I 分離純化基因 II 大量生產(chǎn)生物分子 III 構建新型物種 IV 提高基因重組效率 I + II + III I + II + IV I + III + IV II + III + IV I + II + III + IV 003 根據(jù)基因工程的定義,下列各名詞中不能替代基因工程的是【A】 基因誘變 分子克隆 DNA重組 遺傳工程 基因無性繁殖 004 基因工程的單元操作順序是【B】 增,轉,檢,切,接 切,接,轉,增,檢 接,轉,增,檢,切 檢,切,接,增,轉 切,接,增,轉,檢 005 下列有關基因的敘述,錯誤的是【A】 蛋白質(zhì)是基因表達的唯一產(chǎn)物 基因是 DNA 鏈上具有編碼功能的片段 基因也可以是 RNA 基因突變不一定導致其表達產(chǎn)物改變結構 基因具有方向性006 限制性核酸內(nèi)切酶是由細菌產(chǎn)生的,其生理意義是 【D】 修復自身的遺傳缺陷 促進自身的基因重組 強化自身的核酸代謝 提高自身的防御能力 補充自身的核苷酸消耗 007 天然 PstI 限制性內(nèi)切酶的來源是 【D】 Bacillus amyloliquefaciens Escherichia coli Haemophilus influenzae Providencia stuartii Streptomyces lividans 008 T 4 -DNA 連接酶是通過形成磷酸二酯鍵將兩段 DNA 片段連接在一起,其底物的關鍵基團是 【D】 2 -OH 和 5 -P 2 -OH 和 3 -P 3 -OH 和 2 -P 3 -OH 和 5 -P 5 -OH 和 3 -P 009若載體 DNA 用 M 酶切開,則下列五種帶有 N 酶粘性末端的外源 DNA 片段中,能直接與載體拼接的是 【D】M N A/AGCTT T/TCGAA C/CATGG ACATG/T CCC/GGG G/GGCCC G/GATCC A/GATCT GAGCT/C G/AGCTC 010下列有關質(zhì)粒分子生物學的敘述,錯誤的是 【B】 質(zhì)粒是共價環(huán)狀的雙鏈 DNA 分子 天然質(zhì)粒一般不含有限制性內(nèi)切酶的識別序列 質(zhì)粒在宿主細胞內(nèi)能獨立于染色體 DNA 自主復制 松弛復制型的質(zhì)??捎寐让顾財U增 質(zhì)粒并非其宿主細胞生長所必需 011帶有多個不同種復制起始區(qū)的質(zhì)粒是 【A】 穿梭質(zhì)粒 表達質(zhì)粒 探針質(zhì)粒 整合質(zhì)粒 多拷貝質(zhì)粒 012 下列各常用載體的裝載量排列順序,正確的是 【A】 Cosmid -DNA Plasmid -DNA Cosmid Plasmid Plasmid -DNA Cosmid Cosmid Plasmid -DNA -DNA Plasmid Cosmid 013 目前在高等動物基因工程中廣泛使用的載體是 【C】 質(zhì)粒 DNA 噬菌體 DNA 病毒 DNA 線粒體 DNA 葉綠體 DNA014 若某質(zhì)粒帶有 lacZ 標記基因,那么與之相匹配的篩選方法是在篩選培養(yǎng)基中加入 【D】 半乳糖 葡萄糖 蔗糖 5- 溴 -4- 氯 -3- 吲哚基 - b -D- 半乳糖苷( X-gal ) 異丙基巰基 - b - 半乳糖苷( IPTG ) 015質(zhì)粒是基因工程中最常用的運載體,它的主要特點是【C】 能自主復制 不能自主復制 結構很小 蛋白質(zhì) 環(huán)狀RNA 環(huán)狀DNA 能“友好”地“借居”A B C D 016 雙脫氧末端終止法測定 DNA 序列是基于 【A】 DNA 的聚合反應 DNA 的連接反應 DNA 的降解反應 特殊的 DNA 連接酶 聚合單體 2 和 5 位的脫氧 017 下列三種方法中,能有效區(qū)分重組子與非重組子的是 【E】 I 限制性酶切 II PCR 擴增 III 抗藥性篩選 I I + II I + III II + III I + II + III 018鳥槍法克隆目的基因的戰(zhàn)略適用于 【A】 原核細菌 酵母菌 絲狀真菌 植物 人類 019 cDNA 第一鏈合成所需的引物是 【D】 Poly A Poly C Poly G Poly T 發(fā)夾結構 020 Taq DNA 聚合酶的發(fā)現(xiàn)使得 PCR 技術的廣泛運用成為可能,這是因為 【D】 Taq DNA 聚合酶能有效地變性基因擴增產(chǎn)物 Taq DNA 聚合酶催化的聚和反應不需要引物 Taq DNA 聚合酶具有極強的聚和活性 Taq DNA 聚合酶能使多輪擴增反應連續(xù)化 Taq DNA 聚合酶能使擴增反應在 DNA 變性條件下進行 021 為了利用 PCR 技術擴增下列染色體 DNA 片段上的虛線部分,應選用的引物順序是 【D】 I + II I + III I + IV II + III II + IV 022 構建基因文庫一般使用的載體是 【E】 I 質(zhì)粒 II-DNA III Cosmid I II III II + III I + II + III 023 強化基因轉錄的元件是 【C】 密碼子 復制子 啟動子 內(nèi)含子 外顯子 024 啟動子的特征之一是 【B】 GC 富積區(qū) TATA Box 轉錄起始位點 長度平均 1 kb 含有某些稀有堿基 025 下列基因調(diào)控元件中屬于反式調(diào)控元件的是 【A】 阻遏蛋白 啟動子 操作子 終止子 增強子 026包涵體是一種 【E】 受體細胞中難溶于水的蛋白顆粒 大腸桿菌的亞細胞結構 噬菌體或病毒 DNA 的體外包裝顆粒 用于轉化動物細胞的脂質(zhì)體 外源基因表達產(chǎn)物的混合物 027 外源基因在大腸桿菌中以融合蛋白的形式表達的優(yōu)點是 【】 I 融合基因能穩(wěn)定擴增 II 融合蛋白能抗蛋白酶的降解 III 表達產(chǎn)物易于親和層析分離 III I + II I + III II + III I + II + III 028 第二代基因工程是指 【C】 途徑工程 代謝工程 蛋白質(zhì)工程 RNA 基因工程 細胞器基因工程 029 基因工程菌中重組質(zhì)粒的丟失機制是 【】 重組質(zhì)粒滲透至細胞外 重組質(zhì)粒被細胞內(nèi)核酸酶降解 重組質(zhì)粒在細胞分裂時不均勻分配 重組質(zhì)粒殺死受體細胞 重組質(zhì)粒刺激受體細胞提高其通透性 030利用毛細管作用原理,將凝膠電泳分離后的DNA片段轉移至硝酸纖維素膜上并根據(jù)核酸雜交原理進行分析的技術是【】 Western 印跡轉移技術 Northern 印跡轉移技術 基因的表現(xiàn)型分析法 Southern 印跡轉移技術031在翻譯過程中mRNA必需首先與核糖體相結合才能進行蛋白質(zhì)合成。在原核生物中,mRNA分子上有兩個核糖體結合位點,一個是起始密碼AUG,另一個是【】 啟動子 調(diào)節(jié)基因 SD序列 終止子二、填空題答案1、型限制性內(nèi)切酶可特異性地識別 呈雙重螺旋對稱結構的特定雙鏈DNA序列 并進行切割。如Bst B(TT CGAA)消化可產(chǎn)生 含5 CG 3的5磷?;损ば阅┒?末端,Pst (CTGCA G)消化可產(chǎn)生5TGCA 3的3OH端黏性末端,而Sma(CCC GGG)消化產(chǎn)生 平 末端。2、識別順序相同但切割位點不同者稱 同位 酶,識別順序與切割方式均相同者稱 同裂 酶,來源與識別順序均不同,但切割后形成的限制性片段有相同的粘性末端,稱 同尾 酶。3、受體細胞經(jīng)過一些特殊方法(如:CaCl2等化學試劑法)的處理后,細胞膜的通透性發(fā)生變化,成為能容許有外源DNA的載體分子通過,這種細胞稱為 感受態(tài)細胞 。4、在翻譯過程中,mRNA必需首先與核糖體相結合才能進行蛋白質(zhì)合成。在原核生物中,mRNA分子上有兩個核糖體結合位點,一個是 起始密碼AUG ,另一個是 SD序列 。5、在提取分離DNA的過程中,加入酚-氯仿、去垢劑或酶的目的是 使蛋白質(zhì)變性或水解,除去蛋白質(zhì) ,使用金屬離子螯合劑如EDTA等的原因 是細胞內(nèi)有金屬離子,如Mg2+,是酶活性的輔助因子,會使DNA被DNase分解,故除去使DNase活性的Mg2+以保護DNA不被變性或降解 。在小批量堿變性提取質(zhì)粒過程中加入醇溶液的目的是 是DNA變性沉淀,并除去蛋白質(zhì)、糖類等其他水溶性雜質(zhì),使之分離 ,加入Rnase的目的是 除去DNA沉淀中的RNA,是凝膠電泳檢測時條帶更明顯 。6、PCR的全稱是 聚合酶鏈式反應 ,它是一種在體外模擬DNA復制方式選擇性地擴增DNA特殊區(qū)域的技術。它是在四種 脫氧核苷三磷酸 存在下,以寡聚核苷酸為引物及 單鏈DNA 為模板,經(jīng)DNA聚合酶催化合成DNA互補鏈的過程,其基本反應步驟為 高溫變性 、 低溫退火 和 適溫延伸 ,并循環(huán)n次,達到擴增目的。7、采用光導原位合成或微量點樣等方法,將大量生物大分子或其他生物樣品有序地固化于支持物表面,然后與已標記的待測生物樣品中靶分子雜交,通過特定儀器對雜交信號的強度進行快速、并行、高效地檢測分析,從而判斷樣品中靶分子的數(shù)量的技術稱為 生物芯片技術 ,根據(jù)固定的探針不同,可分為 基因芯片 、 蛋白芯片 、 細胞芯片 和組織芯片。該技術具有高通量、快速高效、高度靈敏等特點。8、根據(jù)Southern blot的結果可以說明 被檢測樣品中的DNA及其含量,了解基因的狀態(tài), 如是否有點突變、擴增重排等 ,Northern blot 則用于 檢測樣品中是否含有基因的轉錄產(chǎn)物(mRNA)及其含量 ,而Western blot的結果可以明 被檢測基因在蛋白質(zhì)水平上的表達狀況 。9、基因工程中用來獲得有功能的異源蛋白質(zhì)的體系稱為 表達系統(tǒng) 。10、用火藥爆炸或者高壓氣體加速將包裹了DNA的球狀金粉或者鎢粉顆粒直接送入完整的植物組織或者細胞中,這一方法稱為 基因槍法 。基因工程課程習題 問答題1、 基因工程的操作過程的主要步驟包括哪些?切、接、轉、增、篩(檢)(1)切獲得DNA片段,取得目的基因;載體的選擇與制備。方法:從生物基因組中分離得到基因組DNA 酶切產(chǎn)物 從總RNA中分離得到mRNA ,再逆轉錄得到cDNA 人工合成化學合成;PCR(聚合酶鏈式反應)(2) 接DNA片段和載體DNA在體外連接,形成重組子。(3) 轉將重組的DNA引入宿主細胞方式:轉化某一基因型細胞從周圍介質(zhì)中吸收另一基因型細胞的DNA,而使其基因型和表型發(fā)生相應變化的現(xiàn)象;轉染除去蛋白質(zhì)外殼的病毒核酸感染細胞或原生質(zhì)體的過程;轉導用噬菌體做載體,將一個細胞的基因傳遞給另一個細胞的過程。還有顯微注射等。(4)增培養(yǎng)已轉化細胞,使目的基因在其中進行復制、擴增,并將其整合到受體細胞的基因組中。(5)篩、檢重組子的篩選與鑒定。篩選和鑒定轉化細胞,獲得使外源基因高效表達的基因工程菌或細胞。2、什么是限制性核酸內(nèi)切酶?第二型限制酶有何特點?限制性核酸內(nèi)切酶(限制酶,restriction endonuclease)是一類能夠識別雙鏈DNA分子中的某些特定核苷酸序列,并對DNA分子進行切割的核酸內(nèi)切酶。第二型限制酶特點:2亞基,單輔因子;識別序列是由4、5、6或7個核苷酸組成的特定核苷酸序列,識別位點雙重旋轉對稱結構,切割與識別位點相同或相近。分子量較小,僅需Mg2+作為催化反應的輔助因子,不需ATP。3、分析影響限制性內(nèi)切酶酶切的因素有哪些?(1)溫度:大部分限制性內(nèi)切酶最適反應溫度為37,少數(shù)酶高于或低于這個溫度。(2)時間:合適,大多為1 h,可過夜反應。(3)溶液體系:要求有穩(wěn)定的pH環(huán)境。標準的緩沖溶液中含有氯化鈣、氯化鎂或氯化鉀、Tris-HCl、-巰基乙醇或二硫蘇糖醇(DTT)以及牛血清蛋白質(zhì)(BSA)和Mg2+,具有一定的酸堿值即pH值。(4)鹽離子濃度:不同的限制性內(nèi)切酶對鹽離子強度(Na+)有不同的要求,一般按離子強度不同分為低(0mmol/L)、中(50mmol/L)、高鹽(100mmol/L)三類。Mg2+也是限制性內(nèi)切酶酶切反應所需。(5)反應體積和甘油濃度:在進行酶切反應時,加酶的體積一般不超過總反應的10%,若加酶體積太大,甘油濃度過高,則會影響酶切反應。(6)DNA的純度和結構:DNA樣品中所含的蛋白質(zhì)、有機溶劑及RNA等雜質(zhì)均會影響酶切反應速度和酶切的完全度,酶切的底物一般是雙鏈DNA,DNA的甲基化位置會影響酶切反應。4、一個典型的原核表達質(zhì)粒的主要元件有哪些?基因工程P53能在宿主細胞中自主復制的序列即復制子;控制轉錄的啟動子如lac、trp等;選擇標記的編碼序列如各種抗生素抗性基因;多克隆位點(MCS);轉錄調(diào)控序列,如一個合適的核糖體結合位點和起始密碼子ATG等。5、以人工構建的pBR322質(zhì)粒為例說明基因工程載體的特點。v 有多個限制性內(nèi)切酶單一位點(EcoR,Hind等) v 四環(huán)素抗性基因Tetr和氨芐青霉素抗性基因Ampr ,且Tetr中有BamH I(GGATCC)切點,Ampr中有Pst切點(CTGCAG)和Sal I切點(GTCGAC)。 可以通過Ampr Tets來篩選重組體。插入失活篩選原理。v 在細胞中是多拷貝的,是松弛型復制子。v 具有復制起始點(ori)。v 分子量較小,安全。6、小批量堿變性提取質(zhì)粒DNA的原理與基本過程如何?堿變性法是常用的質(zhì)粒抽提方法,其原理是基于染色體DNA與質(zhì)粒DNA的變性與復性的差異而達到分離目的。在pH值高達12.6的堿性條件下,染色體DNA的氫鍵斷裂,雙螺旋結構解開而變性。質(zhì)粒DNA的大部分氫鍵也斷裂,但超螺旋共價閉合環(huán)狀的兩條互補鏈不會完全分離,當以pH4.8的NaAc高鹽緩沖液去調(diào)節(jié)其pH值至中性時,變性的質(zhì)粒DNA又恢復原來的構型,保存在溶液中,而染色體DNA不能復性而形成纏連的網(wǎng)狀結構,通過離心,染色體DNA與不穩(wěn)定的大分子RNA、蛋白質(zhì)SDS復合物等一起沉淀下來而被除去。 小批量堿變性提取質(zhì)粒DNA的基本過程為 (1)酶或機械法等方法破壞細胞,釋放出胞內(nèi)物質(zhì); (2)加堿使DNA與蛋白質(zhì)變性,加中和液復性。因為質(zhì)粒DNA分子量小易復性,從而使得其與基因組DNA分離; (3)在上清液中通過酚氯仿抽提、去垢劑或酶使剩余蛋白質(zhì)變性或水解,除去蛋白質(zhì); (4)再加入醇溶液使質(zhì)粒DNA變性沉淀而與其他水溶性物質(zhì)分離; (5)將沉淀溶解于有RNase的TE溶液中,溫育降解RNA后電泳檢測、-20 保存。7、什么是基因文庫?基因組文庫與cDNA文庫制備方法有何區(qū)別?通過克隆技術將大分子DNA編碼的全部或者絕大多數(shù)基因或基因組進行擴增后的DNA片段混合物,稱為基因文庫或DNA文庫、克隆庫。分為基因組文庫和cDNA文庫兩種。基因組DNA文庫的制備:從生物組織細胞提取出全部DNA,用物理方法(超聲波、攪拌剪力等)或酶法(限制性核酸內(nèi)切酶的不完全酶解)將DNA降解成預期大小的片段,然后將這些片段與適當?shù)妮d體(常用噬菌體、粘?;験AC載體)連接,轉入受體細菌或細胞,這樣每一個細胞接受了含有一個基因組DNA片段與載體連接的重組DNA分子,而且可以繁殖擴增,許多細胞一起組成一個含有基因組各DNA片段克隆的集合體,就是基因組文庫。cDNA文庫的制備:提取出組織細胞的全部mRNA,在體外反轉錄成cDNA,與適當?shù)妮d體(常用噬菌體或質(zhì)粒載體)連接后轉化受體菌,則每個細菌含有一段cDNA,并能繁殖擴增,許多細胞一起組成包含著某細胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合稱為該組織細胞的cDNA文庫。8、PCR的定義、原理、方法?在生命科學領域有何具體用途? 一種在體外模擬DNA復制方式選擇性的擴增DNA特殊區(qū)域的技術,又稱為無細胞克隆系統(tǒng)或特異性DNA序列體外引物定向酶促擴增法。是在四種脫氧核苷三磷酸(dNTP)存在下,以寡聚核苷酸為引物及單鏈DNA為模板,經(jīng)DNA聚合酶催化合成DNA互補鏈的過程。原理與方法:1. 高溫變性 雙鏈DNA在高溫下解鏈(變性)變成單鏈的過程;2. 低溫退火 降溫后變性的單鏈DNA可按照A=T, C三G 特異性配對的原則重新結合恢復雙鏈結構; 同模板DNA特異性互補結合的引物的結合3. 適溫延伸 DNA聚合酶的酶促作用, 即可沿引物DNA的5向3末端合成、延長與模板互補的核苷酸鏈;4.循環(huán)n次。用途: 1. 特異性擴增目的(模板)DNA。 2. 特異性檢測目的RNA(如表達水平)(通過反轉錄酶反應) 3. 用于基因重組(擴增特定DNA片段) 4. 制備特異性探針 5. 用于DNA測序 6. 用于基因定位分析 7. 通過誘變寡核苷酸引物產(chǎn)生各種突變體 8. 用于分析基因組DNA的多態(tài)性(Random Amplified Poly-morphic DNA = RAPD) 9. 構建cDNA或基因組DNA文庫 (從mRNA或基因組DNA中) 10.實時熒光定量PCR:DNA或RNA的絕對定量分析 9、瓊脂糖凝膠電泳分離DNA的原理是什么?瓊脂糖是從瓊脂中提取的一種多糖,具親水性,但不帶電荷,是一種很好的電泳支持物。 DNA分子在瓊脂糖凝膠中時有電荷效應和分子篩效應。 DNA分子在高于等電點的溶液中帶負電荷,在電場中向正極移動。在一定的電場強度下, DNA分子的遷移速度取決于分子篩效應。 具有不同的相對分子質(zhì)量的DNA片段泳動速度不一樣,可進行分離。 相對分子質(zhì)量相同,但構型不同的DNA分子泳動速度不一樣。10、什么是原位雜交技術?其基本過程如何?根據(jù)核酸雜交原理,利用基因探針檢出培養(yǎng)板上重組轉化體菌落位置的技術。基本過程:(1)將硝酸纖維素濾膜鋪放在生長著轉化菌落的平板表面,使其中的質(zhì)粒DNA轉移到濾膜上。 (2)取出濾膜,作溶菌、堿變性(0.5mol/L NaOH), 酸中和(Tris.Cl pH7.4)等處理后,轉移到一張干的濾紙上,置于室溫2030min,使濾膜干燥。將濾膜夾在兩張干的濾紙之間,在真空烤箱中于80烘烤2h,固定DNA。 (3)帶有DNA印跡的濾膜同32P標記的適當探針雜交、以檢測帶有重組質(zhì)粒(含有被研究的DNA插入片段)的陽性菌落。(4)將放射自顯影的X光底片同保留下來的原菌落平板對照,從中挑出陽性菌落供作進一步的分析研究。11、什么是啟動子?什么是SD序列?啟動子(promoter,P):是指能被RNA聚合酶識別、結合并啟動基因轉錄的一段DNA序列(40bp-60bp) 。富含A-T堿基對,具有保守序列:-10區(qū)(pribnow box):TATAAT;-35區(qū): 不同的啟動子的效率不同,強啟動子指導產(chǎn)生較多量的mRNA,弱啟動子指導下轉錄合成的mRNA很少。啟動子的強度主要決定于啟動子的結構。原核生物RNA聚合酶不能識別真核細胞啟動子,因此真核基因在原核生物表達時,應將真核基因置于原核生物強啟動子下,以實現(xiàn)高效轉錄。 在原核生物中,mRNA起始密碼子AUG上游3-11bp處一段能與16SrRNA3端序列互補的富含嘌呤的堿基序列稱為SD序列(SD sequence)。mRNA分子上有兩個核糖體結合位點,一個是起始密碼AUG,另一個是起始密碼AUG上游處的一段的序列后者稱為SD序列。 12、什么是操縱子?請用簡圖表示操縱子的基本結構并以乳糖操縱子負調(diào)控系統(tǒng)(阻遏蛋白調(diào)控作用)為例說明其功能。 操縱子是原核生物轉錄單位。操縱子組成為結構基因連同其上游的調(diào)控序列(啟動子 promotor P、操縱基因operator O、其他調(diào)節(jié)序列)共同構成一個操縱子。無誘導物(乳糖)時,阻遏物基因I產(chǎn)生的阻遏蛋白與操縱基因結合,位點關閉, RNA多聚酶通不過,轉錄不進行,基因關閉;有誘導物(乳糖)時,誘導物與阻遏蛋白結合,阻遏蛋白失活,從o點脫離,o位點打開,RNA多聚酶通過,Z、Y、A轉錄。即基因表達。13、為什么用原核表達系統(tǒng)表達真核生物的蛋白質(zhì)時,克隆的真核基因不能來自基因組文庫?真核基因應如何獲得? 對真核細胞來說,從基因組DNA文庫獲得的基因與從cDNA文庫獲得的不同,基因組DNA文庫所含的是帶有含子和外顯子的基因組基因,而從cDNA文庫中獲得的是已經(jīng)過剪接、去除了內(nèi)含子的cDNA。因為原核細胞不具有mRNA轉錄后加工系統(tǒng),不能進行剪接、去除內(nèi)含子等操作,所以 用原核表達系統(tǒng)表達真核生物的蛋白質(zhì)時,克隆的真核基因不能來自基因組文庫,應從cDNA文庫中獲得,或者通過提取mRNA后RT-PCR方法獲得。 14、如何提高真核基因在原核宿主中的表達效率?(1)選擇合適載體,提高翻譯水平 n 強啟動子提高轉錄水平n 核糖體結合位點(ATG-SD)距離合適 在基因重組過程中應將結構基因接于SD序列之后以便為mRNA提供核糖體結合位點,提高真核基因表達效率。n 避免產(chǎn)物降解 :分泌/融合表達;(融合蛋白表達后再去除原核肽段)(2)選擇合適宿主(如 Lac 啟動子LacI菌;PL/PRCI857溶源菌)(3)調(diào)節(jié)宿主細胞代謝 為保持宿主正常生長速度及重組轉化體穩(wěn)定性,維持產(chǎn)物的高效表達,必需采用適當方法,調(diào)節(jié)細胞代謝。目前,調(diào)節(jié)細胞代謝方法很多。如營養(yǎng)物濃度控制、產(chǎn)物誘導表達、載體誘導復制及促進產(chǎn)物分泌等。15、什么是基因診斷?基因診斷中常用的方法有哪些?試簡述其中一種方法的原理?;蛟\斷是指用分子生物學的技術對引起疾病的原因遺傳基因、致病微生物和寄生蟲,以及某些惡性腫瘤在基因水平上進行病原學和細胞遺傳基因的檢測和分析?;蛟\斷中常用的方法有核酸分子雜交、PCR、DNA芯片技術、限制酶酶譜分析和DNA序列測定等。 核酸分子雜交是基因診斷的最基本的方法之一。它的基本原理是:互補的核酸單鏈能夠在一定條件下結合成雙鏈,即能夠進行雜交。它不僅能在DNA和DNA之間進行,也能在DNA和RNA之間進行。因此,當用一段已知基因的核酸序列作探針,與變性后的單鏈基因組DNA接觸時,如果兩者的堿基完全配對,它們即互補地結合成雙鏈,從而表明被測基因組DNA中含有已知的基因序列。16、名詞解釋:基因探針 基因芯片 蛋白質(zhì)工程基因探針(probe):就是一段與目的基因DNA互補的帶有能檢測標記物的特異核苷酸序列,它可以包括整個基因,也可以僅僅是基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之轉錄而來的RNA?;蛐酒?gene chip):又稱DNA芯片,是指將許多特定的寡核苷酸片段或基因片段有規(guī)律地排列固定于支持物上,樣品DNA/ RNA通過PCR擴增、體外轉錄等技術摻入熒光標記分子,然后按堿基配對原理進行雜交,再通過熒光檢測系統(tǒng)等對芯片進行掃描,并配以計算機系統(tǒng)對每一探針上的熒光信號作出比較和檢測,從而迅速得出所要的信息。 蛋白質(zhì)工程:是指在蛋白質(zhì)空間結構和結構與功能研究的基礎上,借助計算機等輔助設計來確定某一蛋白質(zhì)分子的改造方案。然后通過基因改造和基因工程技術獲得新的蛋白質(zhì)分子。17、簡述包含體形成的原因和包含體蛋白復性的主要步驟。重組蛋白在細菌中表達時,尤其當表達目的蛋白量超過細菌體總蛋白量10%時,會在細胞內(nèi)與細菌雜蛋白、核酸等成分聚集成沒有生物活性的直徑0.1-0.3m的固體顆粒,這種不溶性聚合體即包含體(inclusion body)。生成包含體的原因可能有是蛋白質(zhì)合成速度太快,多肽鏈相互纏繞,影響了多肽鏈的正確折疊,導致疏水基團外露等。 (包含體的形成有利于防止蛋白酶對表達蛋白的降解,并且非常有利于分離表達產(chǎn)物。但包含體形成后,表達蛋白不具有生物活性,因此必須溶解包含體并對表達蛋白進行復性。)包含體復性即從伸展態(tài)中間體后期中間體天然態(tài)的過程,操作步驟一般為用超聲波、勻漿等使菌體破碎后,離心得到包含體加入強蛋白質(zhì)變性劑如6 8molL鹽酸胍或910molL尿素溶解包含體用透析、稀釋和超濾復性法等等方法使之正確折疊。18、列表比較大腸桿菌、酵母、昆蟲細胞、哺乳動物細胞表達系統(tǒng)的優(yōu)缺點。以下為某同學作業(yè)答案,供參考表達系統(tǒng)優(yōu)點缺點大腸桿菌表達系統(tǒng)(1)對大腸桿菌的背景知識,特別是基因表達調(diào)控的分子機理有深刻了解;(2)是一種安全的基因工程實驗體系,擁有各類適用的寄主菌株和不同類型的載體;(3)許多克隆的真核基因都可以在大腸桿菌細胞中實現(xiàn)有效、高水平的表達;(4)大腸桿菌培養(yǎng)方便、操作簡單、成本低廉,易用于批量生產(chǎn)。(1)缺乏轉錄后加工機制,只能表達克隆的cDNA,不宜表達真核基因組DNA;(2)缺乏翻譯后加工機制,許多真核基因的蛋白質(zhì)產(chǎn)物,都要經(jīng)過轉譯后的加工修飾(正確折疊和組裝),而大多數(shù)的這類修飾作用在細菌細胞中并不存在;(3)表達的蛋白質(zhì)常形成不溶性包含體,需作復性處理;(4)難于表達大量可溶性蛋白。酵母表達系統(tǒng)(1)基因背景了解清楚,上游操作簡單,生長迅速,非常適于大規(guī)模發(fā)酵。(2)具有一定的加工及修飾能力:如二硫鍵的正確形成,前體蛋白的水解加工。表達產(chǎn)物與天然蛋白相同或類似。(3)可將異源蛋白基因與N-末端前導肽等信號肽融合,指導新生肽的分泌,在分泌中可對表達的蛋白進行糖基化修飾,但其修飾糖鏈與高等真核細胞并不相同。(4)可移去起始甲硫氨酸,避免了作為藥物使用可能引起的免疫反應問題。 (1)產(chǎn)糖量過多因而損壞蛋白質(zhì)的生物活性、安全性等;(2)糖基化修飾與高等真核細胞并不相同。 昆蟲細胞表達系統(tǒng)(1)表達效率高。重組蛋白的表達水平最高可達到細胞總蛋白的50。(2)屬于真核表達系統(tǒng)。有糖基化作用、脂肪酸?;饔?、氨基末端乙?;饔靡约傲姿峄?,有利于表達產(chǎn)物形成天然的高級結構,保持原有的生物活性與功能。(3)桿狀病毒能容納較大的外源基因而不影響其本身的增殖。(4)桿狀病毒屬于昆蟲病毒。具有高度特異的宿主范圍,對脊椎動物和植物均無致病性。病毒重組因失去多角體保護,在自然界的生存能力很弱,因此比較安全。(5)應用晚期多角體蛋白基因啟動子表達外源基因可表達毒性蛋白。(6)桿狀病毒表達載體通用性廣??杀磉_來自病毒、細菌、真菌、植物和動物幾乎所有的蛋白,并且能表達帶有內(nèi)含子的外源基因。(7)重組桿狀病毒除在體外昆蟲培養(yǎng)細胞表達外源基因外,還能感染昆蟲活體,在體內(nèi)高效表達外源蛋白。(1)宿主細胞生長慢、 培養(yǎng)基昂貴、 含有免疫宿主蛋白、 桿狀病毒感染會導致宿主死亡、因此每一輪蛋白合成均需重新感染。(2)昆蟲細胞內(nèi)的糖基化方式與脊椎動物細胞內(nèi)的糖基化方式有一定的差異,其糖蛋白的糖鏈結構多為簡單的不分支結構。 哺乳動物細胞表達系統(tǒng) (1)產(chǎn)物的抗原性、免疫原性和功能與天然蛋白質(zhì)最接近,糖基化等后加工最精確。(2)一般會產(chǎn)生正確加工的、有活性的蛋白。該表達系統(tǒng)的表達水平較低、培養(yǎng)基昂貴、生長緩慢、含有過敏物質(zhì)等缺點在實際應用過程中較難避免。19、利用基因工程菌生產(chǎn)有哪些特點?有什么優(yōu)勢?常用的宿主菌有哪些?基因工程菌帶有外源基因,這些基因可能不穩(wěn)定。丟失外源基因的菌往往比未丟失的菌生長快得多,這樣就會大大降低產(chǎn)物的表達。為了抑制基因丟失的菌的生長,一般在培養(yǎng)中加入選擇壓力,如抗生素?;蚬こ叹呐囵B(yǎng)一般分兩段。前期是菌體生長,生長到某一階段,加入誘導因子,誘發(fā)產(chǎn)物表達。利用基因工程菌生產(chǎn)的優(yōu)勢主要體現(xiàn)在目的產(chǎn)物產(chǎn)量高,表達調(diào)控性好,可根據(jù)目的產(chǎn)物特點構建各種表達系統(tǒng),等等。常用宿主菌有大腸桿菌(如BL21(DE3)plysS菌株)、酵母菌(如Pichia pastoris、Saccharomyces cerevisiae等)、枯草芽孢桿菌等。20、在基因工程菌培養(yǎng)過程中為什么質(zhì)粒會丟失?(1)分離的不穩(wěn)定性:細胞分裂過程中,有一個子細胞沒有獲得質(zhì)粒 DNA拷貝,并最終增殖成為無質(zhì)粒的優(yōu)勢群體。即在細胞分裂過程中發(fā)生的質(zhì)粒不平均的分配,導致質(zhì)粒丟失,亦叫做質(zhì)粒分離的不穩(wěn)定性。 (2)培養(yǎng)體系中因為各種原
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