蛋白質(zhì)組學(xué)的研究策略與應(yīng)用(1)

1、編輯ppt1 食品分子生物學(xué)進(jìn)展食品分子生物學(xué)進(jìn)展- 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究策略與應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)的研究策略與應(yīng)用 蛋白質(zhì)組（蛋白質(zhì)組（proteomeproteome）：）： 一個(gè)基因組在一種細(xì)胞、組織或生物體表達(dá)的所一個(gè)基因組在一種細(xì)胞、組織或生物體表達(dá)的所 有蛋白質(zhì)構(gòu)成的整體。有蛋白質(zhì)構(gòu)成的整體。 蛋白質(zhì)組學(xué)（蛋白質(zhì)組學(xué)（proteomics)proteomics)： 研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組組成、定位、研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組組成、定位、 變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。 共享99基因 30000-40000個(gè)基因 30000個(gè)基因 蠶和蠶蛾的基因組相同

2、， 但表型卻完全不同 蛋白質(zhì)組的差異所致。 100 ug E. coli lysate. IEF, pH 5-8; 250 V, 升壓, 20 min; 8000 V 線性 升壓, 2.5 hrs; 8000 V, 25,000 Vhrs. SDS PAGE 4-20% 線性梯度, 200V, 1 hr. Bio-Safe Coomassie 染色. 50 mM Tris 100 mM Tris 合適的離子強(qiáng)度 E.coli cell lysates spiked with 1% SDS 采用TCA/丙酮沉淀法處理 未處理 線線 特定或目標(biāo)蛋白質(zhì)組分離分析技術(shù) 生物質(zhì)譜生物質(zhì)譜 基質(zhì)輔助激光解

3、吸電離基質(zhì)輔助激光解吸電離 飛行時(shí)間質(zhì)譜飛行時(shí)間質(zhì)譜 電噴霧電離質(zhì)譜電噴霧電離質(zhì)譜 串聯(lián)質(zhì)譜串聯(lián)質(zhì)譜 生物質(zhì)譜的分類生物質(zhì)譜的分類 Nebulizer Gas Heat Heat Solution Make up Gas High V oltage Power Supply Ions Sampling Orifice3) 4) 3) Field Evaporation 4) Coulomb Explosion 1) Desolvation 2) Charge Accumulation 120 Barrier Gas Flow (Differential Pumping) ESIESI源示意圖源

4、示意圖 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)主要有兩大類方法：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)主要有兩大類方法： 1、理論分析方法或從頭算方法（Abinitio）： 2、統(tǒng)計(jì)方法：該類方法對(duì)已知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析， 建立序列到結(jié)構(gòu)的映射 模型，進(jìn)而對(duì)未知結(jié)構(gòu) 的蛋白質(zhì)根據(jù)映射模型 直接從氨基酸序列預(yù)測(cè) 結(jié)構(gòu)。 經(jīng)驗(yàn)性方法 結(jié)構(gòu)規(guī)律提取方法 同源模型化方法同源模型化方法 25-30%同源序列， 相似的空間結(jié)構(gòu) 通過相似序列的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)確定功能 確定序列特性：疏水性、跨膜螺旋等 通過序列模體數(shù)據(jù)庫(kù)等的比對(duì)確定功能 規(guī)模化發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)相互作用技術(shù)規(guī)?；l(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)相互作用技術(shù) 酵母雙雜交 基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)復(fù)合體研究 蛋白質(zhì)芯片 蛋白質(zhì)相互