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文檔簡介
1、 第 十五 章蛋白質(zhì) 的生物合成 Protein Biosynthesis 生物化學(xué)教研室 劉群良 基因的遺傳信息在轉(zhuǎn)錄過程中從DNA轉(zhuǎn)移到RNA,再由mRNA將這種遺傳信息翻譯為蛋白質(zhì)中氨基酸的排列順序。 蛋白質(zhì)的生物合成過程即為翻譯(translation)。引入:本章節(jié)內(nèi)容第一節(jié)參與蛋白質(zhì)生物合成的主要物質(zhì)第二節(jié)蛋白質(zhì)生物合成過程第三節(jié)翻譯后的加工與靶向輸送 第四節(jié)蛋白質(zhì)生物合成的抑制劑第一節(jié)參與蛋白質(zhì)生物合成的主要物質(zhì) 蛋白質(zhì)合成體系:20種氨基酸,mRNA、tRNA、核蛋白體、酶和蛋白因子、無機離子、ATP 、GTP 等。一、mRNA:合成蛋白質(zhì)的模板 (一) mRNA是遺傳信息的攜
2、帶者 遺傳學(xué)將編碼一個多肽的遺傳單位稱為順反子(cistron)。 原核細胞中數(shù)個結(jié)構(gòu)基因常串聯(lián)為一個轉(zhuǎn)錄單位,轉(zhuǎn)錄生成的mRNA可編碼幾種功能相關(guān)的蛋白質(zhì),為多順反子(polycistron)。 真核mRNA只編碼一種蛋白質(zhì),為單順反子(single cistron) 。(二) mRNA上存在遺傳密碼 mRNA分子中的每3個相鄰的堿基組成1個密碼子,稱為三聯(lián)體。 4種堿基一共可以組成64個密碼子。 AUG代表甲硫氨酸,在5 -端時代表啟動信號,稱為起始密碼子。 UAA、UAG和UGA:稱為終止密碼子。 代表氨基酸的密碼子只有61個。 載脂蛋白B-100的一段mRNA的密碼子序列 (三)遺傳密
3、碼的特點 1.通用性(universal): 蛋白質(zhì)生物合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用。 已發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動物細胞的線粒體、植物細胞的葉綠體。2.方向性: 533.連續(xù)性(commaless): 密碼間連續(xù)閱讀,無間斷。 基因損傷引起mRNA閱讀框架內(nèi)的堿基發(fā)生插入或缺失(不是3的整倍數(shù)) ,可導(dǎo)致框移突變。4.簡并性(degeneracy) 遺傳密碼中,除色氨酸和甲硫氨酸僅有一個密碼子外,其余氨基酸有2-6個密碼。 同一種氨基酸可以有多個密碼子,或不同的密碼子可以代表同一種氨基酸,稱為遺傳密碼的簡并性。 簡并性密碼子的第一和第二位堿基大多相同,只是第三位堿基不同。因此,第三位堿基的
4、改變并不影響氨基酸的翻譯。 二、tRNA:氨基酸的搬運工具(一)tRNA的特點 結(jié)合氨基酸: tRNA的3 -CCA端與AA結(jié)合而搬運,一種氨基酸有幾種tRNA攜帶。 反密碼子:每種tRNA的反密碼子,決定了所帶氨基酸能準確的在mRNA上對號入座 。 密碼子與反密碼子“對號入座”密碼子與反密碼子的方向是相反 5 -U-U-C- 3 密碼 1 2 3 3-A-A-G- 5 反密碼 3 2 1 密碼子與反密碼子除通過堿基互補結(jié)合外,還具有擺動性,即密碼子的第3位堿基與反密碼子的第1位堿基配對不嚴格,稱為擺動配對。密碼子、反密碼子配對的擺動現(xiàn)象tRNA反密碼子第1位堿基IUGACmRNA密碼子第3位
5、堿基U, C, AA, GU, CUG 密碼子的第3位堿基發(fā)生突變時,并不影響tRNA帶入正確的氨基酸。 同工tRNA:攜帶相同氨基酸而反密碼子不同的一組tRNA稱為同工tRNA。 (二)氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase)氨基酸 + tRNA氨基酰- tRNAATP AMPPPi氨基酰-tRNA合成酶 1. 氨基酰-tRNA合成酶對底物氨基酸和tRNA都有高度特異性:每種氨基酸都只有1種氨基酰-tRNA合成酶,生成特定的氨基酰-tRNA(aa-tRNA) 2.氨基酰-tRNA的表示方法: Ser-tRNASer Met-tRNAMet 真核生物起始因子
6、辨認的Met-tRNAiMet 延長因子辨認Met-tRNAeMet 右上角字母可略 三、核糖體:合成蛋白質(zhì)的場所 核糖體(ribosome)也叫核蛋白體。 數(shù)種rRNA和數(shù)十種蛋白質(zhì)(包括酶和各種蛋白因子)組成的復(fù)合體。 核糖體分為2類: 1、附著于粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng),主要合成分泌性蛋白質(zhì),如清蛋白、胰島素等。 2、游離于胞漿,主要合成細胞固有蛋白質(zhì)。 核糖體由大、小兩個亞基組成 原核生物真核生物核蛋白體小亞基大亞基核蛋白體小亞基大亞基S70S30S50S80S40S60SrRNA16S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5S-rRNA5.8S-rRNA蛋白質(zhì)21
7、種34種33種49種 核蛋白體的組成 核蛋白體的組成SD序列 核糖體小亞基:有與SD序列結(jié)合的 互補堿基大亞基:有轉(zhuǎn)肽酶; P位(肽酰位) 、 A位(氨基酰位)。第二節(jié)蛋白質(zhì)生物合成過程 第一步:氨基酸必須在氨基酰-tRNA合成酶的作用下先活化成氨基酰-tRNA。 氨基酸+ tRNA + ATP 氨基酰-tRNA + AMP + PPi 第二步:肽鏈的合成過程,即mRNA的翻譯過程。整個過程分為分為起始、延長和終止3個階段。以原核生物為例說明翻譯全過程一、起始階段 參入肽鏈起始階段的物質(zhì): 核糖體大、小亞基; mRNA; fMet-tRNA; 起始因子(initiation factor,IF
8、); GTP 等。 1.三元復(fù)合物的形成 2. 30S前起始復(fù)合物的形成 3. 70S起始復(fù)合物形成真核生物的起始階段 真核生物的起始階段需要的起始因子更多,有eIF1(e表示真核細胞,eukaryote)、eIF2、eIF3、eIF4(A-E)、eIF5等, 真核生物的mRNA有帽子結(jié)構(gòu)和polyA尾,還需要帽子結(jié)合蛋白(cap binding protein,CBP)參與,形成80S起始復(fù)合物。 二、肽鏈延長階段 包括進位、成肽和轉(zhuǎn)位3個步驟。 肽鏈延長需要2種延長因子(elongation factor,EF)參與 。 EF-G EF EF-Tu EF-T EF-Ts 進位:進位又稱注冊
9、 此步需GTP、EF-T及Mg2+的參與。 EF-T構(gòu)成EF-TuEF-Ts循環(huán),使aa-tRNA進入A位。 三、終止階段 肽鏈合成終止的相關(guān)的蛋白因子稱為釋放因子 (release factor,RF) 。 RF有3種:RF-1、RF-2和RF-3。RF-1和RF-2能辨認終止密碼子: RF-1可識別UAA和UAG RF-2可識別UAA和UGARF-3能激活核糖體上的轉(zhuǎn)肽酶,表現(xiàn)出酯酶活性,將蛋白質(zhì)多肽鏈水解下來。多核糖體循環(huán) 蛋白質(zhì)的生物合成耗能 AA活化消耗2ATP,肽鏈延長進位和轉(zhuǎn)位各消耗1GTP,所以,蛋白質(zhì)的生物合成啟動以后,每形成1個肽鍵,需要消耗4ATP。 合成一條n個肽鍵組成
10、的多肽鏈所需能量為4n1 ATP 蛋白質(zhì)合成過程小結(jié)以mRNA的5 3方向閱讀遺傳密碼肽鏈合成方向N C(同位素證明)該合成過程是一個耗能過程第三節(jié)翻譯后的加工 核糖體循環(huán)合成的多肽鏈還不具備生物活性,它需要在細胞內(nèi)經(jīng)過加工修飾以后,才能成為有活性的蛋白質(zhì)。 一、一級結(jié)構(gòu)的修飾 (一)N-末端的修飾 去掉N-甲?;蚣琢虬彼?(二)個別氨基酸的修飾 脯氨酸和賴氨酸的羥化 絲、蘇氨酸等的磷酸化 2個半胱氨酸形成二硫鍵 (三)水解剪裁修飾 胰島素原去C肽,形成A、B 2條鏈二、高級結(jié)構(gòu)的修飾(一) 輔基的連接 結(jié)合蛋白質(zhì)需要與輔基結(jié)合,才能發(fā)揮生物活性 。(二) 亞基的聚合 具有四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)分子的聚合,如血紅蛋白是一個四聚體(22),RNA聚合酶是一個五聚體(2)。三、靶向輸送 蛋白質(zhì)在胞漿的核糖體上合成以后的去向: 仍然保留在胞漿; 進入其他的亞細胞結(jié)構(gòu)中,如細胞核、線粒體、細胞膜、溶酶體等; 分泌到細胞外,然后運輸?shù)皆摰鞍踪|(zhì)發(fā)揮作用的靶器官或靶細胞。 靶向輸送:即是指蛋白質(zhì)在合成以后,定向地到達其功能部位的過程。 信號肽 分泌性蛋白質(zhì)mRNA的5-端常常編碼一段富含疏水氨基酸的短肽(長約1540個氨基酸殘基),這一短肽稱為信號肽(signal peptide)。 信號肽的作用是引導(dǎo)合成的蛋白質(zhì)到達功能部位。第四節(jié)蛋白質(zhì)生物合成的抑制劑 1、嘌呤霉素(pur
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