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文檔簡介
1、佛山市科技創(chuàng)新項目可行性一、立項依據(jù)慢性代謝性疾?。╟hronic metabolic disease, CMD)是一組以(diabetesmellitus, DM)、肥胖、高血壓、血脂異常、骨質(zhì)疏松、冠心病、腦卒中等疾病為主的代謝性臨床癥候群。CMD 在人群中患病率較高,常超過 1%,某些接近 10%,如 DM、肥胖等;同時,慢性代謝病的并發(fā)癥對人類健康及社會帶來非常嚴重的,是全球及各個國家或地區(qū)致殘、致死及高額醫(yī)療費用的主要原因。據(jù),慢性代謝病的并發(fā)癥的發(fā)病機制復雜,是由多個、一個的多個突變及環(huán)境相互作用下發(fā)生的,各個相互作用的模式也非常復雜,其預后與、肥胖、吸煙、飲食、家庭狀況、表達等多
2、相關(guān)。CMD 并發(fā)癥的防治包括生活方式的干預、藥物及手術(shù)等多種綜合治療方法。伴隨高通量分型及大數(shù)據(jù)分析技術(shù)的發(fā)展、分子、相關(guān)分子標記物及藥物遺傳學的臨床深入研究,CMD 及其并發(fā)癥的防治將進入精準醫(yī)療時代。DM 是 CMD 的最常見形式,其主要特征為慢性高血糖,可以導致其它 CMD 如冠心病、腦中風、骨質(zhì)疏松癥等發(fā)生與發(fā)展,同時也與許多 CMD 合并存在,具有共同的生長土壤。目前我國現(xiàn)有9240 萬成人患有 DM,人群患病率達 9.7%。長期存在的高血糖可以導致大和微并發(fā)癥,大主要是心腦病變,而微主要為眼及腎臟病變,且為 DM 特征性并發(fā)癥。在 DM 及其并發(fā)癥的防治領(lǐng)域,通過檢測相關(guān)代謝的多
3、態(tài)性,可以精確監(jiān)測疾病發(fā)展,對藥物的反應,帶動了化防治的熱潮,推動個性化、精準化醫(yī)療體系和模式形成。大數(shù)據(jù)技術(shù)已經(jīng)應用在電信、金融、教育、醫(yī)療、軍事、電子商務甚至決策等幾乎所有的領(lǐng)域,現(xiàn)在醫(yī)療領(lǐng)域的應用越來越廣泛,大數(shù)據(jù)技術(shù)在醫(yī)療領(lǐng)域的應用已逐漸引起人們的重視。通過大數(shù)據(jù)分析技術(shù)可以整合及群體、間、環(huán)境以及其它未知的隨機信息進行深入挖掘,找出對疾病的發(fā)生發(fā)展啟關(guān)鍵作用的靶點,為臨床設(shè)施化的診療方案提供依據(jù),為制定區(qū)域化、化防治策略提供指導,從而大大減少醫(yī)療防治的副反應及費用。本項目針對慢性代謝性疾病的嚴峻防治形勢,擬聯(lián)合產(chǎn)、學、研、醫(yī),以 DM 為切入點,以 DR及 DN 為研究方向,綜合應用
4、示范精準醫(yī)學技術(shù)、運程醫(yī)療服務模式、大數(shù)據(jù)和云技術(shù),整合患者的臨床數(shù)據(jù)、因檢測新產(chǎn)品及防治數(shù)據(jù)、免散瞳眼底閱片數(shù)據(jù)以及隨訪數(shù)據(jù),創(chuàng)新性開發(fā) DM 基;通過示范應用與各級醫(yī)療機構(gòu)聯(lián)動,針對我國慢性代謝性疾病一、二、三級預防策略所確定的目標人群,建立可持續(xù)發(fā)展的共享型慢性代謝性疾病精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)云,構(gòu)建分級協(xié)同的 DM 防治體系;探索建立的 CMD 的“預防-治療”分級協(xié)同精準醫(yī)療服務新模式,為 CMD 的精準預防提供新思路。項目的建設(shè)有利于制定 CMD 一級、二級、三級預防的工作策略,建立覆蓋佛山市各級衛(wèi)生機構(gòu)的 CMD 篩查與防治體系,推動基層首診,上下聯(lián)動的分級診療模式,有效預防及減少 CM
5、D 及并發(fā)癥的發(fā)生,降低醫(yī)療費用支出,真正實現(xiàn)科技惠民、醫(yī)療惠民。同時項目的建設(shè)能直接促進佛山市 CMD 臨床各??频陌l(fā)展,拉動佛山與互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療相關(guān)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,產(chǎn)業(yè)規(guī)模。二、研究開發(fā)內(nèi)容、方法、技術(shù)路線(一)具體研究開發(fā)內(nèi)容和重點解決的技術(shù)關(guān)鍵問題本項目主要研究思路、研究內(nèi)容和重點解決的技術(shù)關(guān)鍵問題如下:1、項目思路:項目總體思路:項目基于慢性代謝性疾病,以 DR 及 DN 為研究方向,綜合應用示范精準醫(yī)學技術(shù)、運程醫(yī)療服務模式、大數(shù)據(jù)和云技術(shù),整合患者的臨床數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)、免散瞳眼底閱片;通過示范應用與各級醫(yī)數(shù)據(jù)以及隨訪數(shù)據(jù),創(chuàng)新性開發(fā) DM新產(chǎn)品及防治療機構(gòu)聯(lián)動,針對我國慢性代謝性疾病一、二、
6、三級預防策略所確定的目標人群,建立可持續(xù)發(fā)展的共享型慢性代謝性疾病精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)云,構(gòu)建分級協(xié)同的 DM 防治體系;探索建立的 CMD 的“預防-治療”分級協(xié)同精準醫(yī)療服務新模式,為 CMD 的精準預防提供新思路。2、研究方案精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)科技創(chuàng)新示范建設(shè)主要包括幾大模塊的建設(shè),建設(shè)任務如下:2.1 搭建精準醫(yī)學技術(shù)研發(fā)(區(qū)人民醫(yī)院、南方醫(yī)學附屬第三醫(yī)院)項目擬圍繞等慢性代謝性疾病的預防、治療等環(huán)節(jié)建立疾病全流程的技術(shù)研發(fā),前期主要進行以下內(nèi)容的研發(fā):2.1.1 預測(如 FGF21:2 型減肥效應)請和補充2.1.2檢測(如KCNJll:對新生兒的具有重要意義)請和補充2.1.3 治療檢測(
7、如并發(fā)癥檢測:CPVL/CHN2、ZNRF1 及 COLEC12:變異與視網(wǎng)膜病變及其嚴重程度相關(guān);HNFlB:對合并腎損害具有價值)請和補充2.2. 臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學(區(qū)人民醫(yī)院、南方醫(yī)學附屬第三醫(yī)院)臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學主要基于技術(shù)研發(fā)的研發(fā)結(jié)果,進行臨床應用研究,開展病例隨訪,并開展相應的試劑或醫(yī)療器械研發(fā):2.2.1 以 DM 為切入點,建立大規(guī)模 CMD 臨床和分子分型及疾病隨訪管理a.建立轄區(qū)中心不少于 300 例的 DM 患者隊列,收集患者相關(guān)臨床指息,包括HbA1c 數(shù)值、血壓等,同時收集患者的相關(guān)樣本,例如 DNA、和尿液等樣本。b.針對 DM 人群,建立 DM 臨床大數(shù)據(jù),對接 DR
8、的免散瞳眼底閱片數(shù)據(jù)和 DR及 DN 易感分子分型。c.建立起追蹤隨訪的機制和信息管理醫(yī)學支持建設(shè)臨床檢驗(廣州臨床檢驗中心);請達宜根據(jù)區(qū)域中心的方案補充病理(廣州臨床檢驗中心);請達宜根據(jù)區(qū)域中心的方案補充醫(yī)學物流(廣州臨床檢驗中心);請達宜根據(jù)區(qū)域中心的方案補充醫(yī)學大數(shù)據(jù)(廣州臨床檢驗中心多,多源異構(gòu)大數(shù)據(jù))請達宜根據(jù)糖網(wǎng)方案補充衛(wèi)生政策(廣州臨床檢驗中心):基于大數(shù)據(jù)分析的衛(wèi)生經(jīng)濟研究、臨床醫(yī)學決策、公共衛(wèi)生決策;請達宜根據(jù)中心方案補充2.4 創(chuàng)新示范應用項目將在佛山地區(qū)開展基于免散瞳眼底照相、尿微量白蛋白及相關(guān)的并發(fā)癥(視網(wǎng)膜病變及腎?。┚C合防治。試點擬覆蓋 300 個,并進行臨床隨
9、訪。請和補充3、重點解決的技術(shù)關(guān)鍵問題DR 及 DN 社區(qū)篩查和監(jiān)測技術(shù):基于 DR 分級標準的社區(qū)篩查指南和應用規(guī)范:ETDRS 的 DR 分級標準重復性好,在醫(yī)學界被公認為分級的“金標準”。但對于視網(wǎng)膜、普通眼科醫(yī)生、內(nèi)床 DR 和國際臨床醫(yī)生和全科醫(yī)生來于復雜,亦無法用于大規(guī)模的社區(qū)篩查。國際臨黃斑水腫(diabetic macular edema,DME)嚴重程,或眼底鏡檢查,難度分級,需要以 45 度角眼底照相機拍攝 ETDRS 制定的 7以在社區(qū)推廣。的眼底本項目采用免散瞳眼底照相技術(shù),參考國際臨床 DR 和國際 DME 分級標準,將 ETDRS 的 DR 分級轉(zhuǎn)化為簡單易懂、容易
10、掌握的分級標準,以最大程度地滿足內(nèi)篩查的需求。科醫(yī)生和社區(qū)全科醫(yī)生 DR3.1.2 適合社區(qū)全科醫(yī)生的免散瞳照相設(shè)備開發(fā)和操作規(guī)范:檢查者在進行眼睛局部成像檢查操作時,需要手動對檢查裝置關(guān)鍵部分在四個水平方向進行大調(diào)和微調(diào);本項目擬針對免散瞳照相機開發(fā)一種輔助受力機構(gòu)及含有該輔助受力機構(gòu)的檢查裝置,將大調(diào)和微調(diào)分開,以便操作者快速掌握操作技巧,操作起來省時省力;同時針對免散瞳照相機進行可視化開發(fā),嵌入全科培訓和閱片質(zhì)控,設(shè)計可視化操作的“照相-閱片”;進一步針對社區(qū)全科醫(yī)生開發(fā)相關(guān)的操作規(guī)范。3.1.3 DR 第采用專業(yè)第片社區(qū)眼底影像眼底影像體系、質(zhì)控體系和培訓體系和三級閱片服務支持體系:本
11、項目服務的方式進行眼底影像的閱片,建立“社區(qū)照相中心閱”的體系,同時將臨床檢驗質(zhì)量控制的方法和應用到影像體系:能力認證、抽樣復檢等;進一步針對第體系開發(fā)眼底照相師、閱片醫(yī)生等培訓體系。三級閱片服務支持體系:包括一級、二級、三級閱片流程和工作規(guī)范、閱片標準,眼底影像云技術(shù):基于互聯(lián)網(wǎng)的眼底影像資料的處理、傳輸和閱片。3.1.4 眼底影像人工智能輔助自動和質(zhì)量控制技術(shù):以影像分類為基礎(chǔ),進一步開發(fā)眼底影像人工智能輔助自動和質(zhì)量控制技術(shù):預處理由強化圖像灰度和圖像分割兩部分組成:有效信息的灰度均衡處理和無效信息的分割提取;病變特征的要根據(jù)不同的病變提取出相應的樣本組成樣本庫,然后用合適的方法來提取病
12、變特征(檢測、硬性滲出檢測、微瘤檢測等),開發(fā)經(jīng)典樣本庫模型;運用支持向量機(SVM)方法或改進的 Back Propagati(BP)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法訓練樣本,從而得到分類方案,建立輸入與輸出的關(guān)系。3.1.5 基層臨床標準和規(guī)范。質(zhì)量和能力評價指標體系,DM 監(jiān)測指標:血糖、HbA1C 等指標的檢測3.1.6 DN 社區(qū)篩查和監(jiān)測技術(shù):為了方便患者對 DN 篩查和監(jiān)測,酐比值進行檢測,同時建立自我監(jiān)測系統(tǒng)。即時尿微量白蛋白肌3.2 醫(yī)療大數(shù)據(jù)構(gòu)建及應用技術(shù):3.2.1 多源異構(gòu)醫(yī)學大數(shù)據(jù)接口標準與技術(shù),醫(yī)療大數(shù)據(jù)分布式、分布式和高效索引:采用 Hadoop 在市衛(wèi)生局現(xiàn)有區(qū)域醫(yī)療基礎(chǔ)上,應用
13、IHE、HL7、部門、等國際標準,通過 IH大型醫(yī)院、基層醫(yī)院和企X 跨域居民 ID 交叉索引和服務接口,分布式并整合上的各層次醫(yī)療健康信息;綜合 Hadoop 的特點和醫(yī)學影像檢驗云層。的需求,采用 FC SAN 和 HDFS 相結(jié)合的“歸檔”二級架構(gòu)設(shè)計數(shù)據(jù)3.2.2 基于 MapReduce 框架的分布式計算和智能分析技術(shù):針對醫(yī)療數(shù)據(jù)異構(gòu)性、性、數(shù)據(jù)存海量性、性、數(shù)學表征不顯著及持續(xù)增長等特點,設(shè)計適合醫(yī)療大數(shù)據(jù)挖掘的儲架構(gòu)、數(shù)據(jù)挖掘算法和并行化技術(shù)。采用抽樣、劃分集成、并行化,數(shù)據(jù)挖掘、降維和智能分析等處理技術(shù),為慢分類與、傳染病趨勢分析和爆發(fā)、臨床輔助、醫(yī)院和區(qū)域衛(wèi)生決策提供支持。
14、3.2.3 基于醫(yī)學本體的領(lǐng)域知識表達和分析推理研究及應用:以 EHR 為主線,研發(fā)基于醫(yī)學本體的信息表達和語義分析技術(shù)。通過醫(yī)學、衛(wèi)生管理、等領(lǐng)域本體(知識),構(gòu)建智能庫系統(tǒng),創(chuàng)建規(guī)則和推理知識及向?qū)В糜谂R床決策構(gòu)建。3.2.4 面向區(qū)域影像和檢驗的疾病輔助算法和自動分析系統(tǒng):綜合醫(yī)學知識庫及其在臨床和治療中的應用,研究基于區(qū)域影像和檢驗信息的智能分析和算法。3.2.5醫(yī)療大數(shù)據(jù)可視化展示技術(shù):結(jié)合 GIS進行公共衛(wèi)生機構(gòu)的標識圖層數(shù)據(jù)的標注。利用大數(shù)據(jù)中的醫(yī)療衛(wèi)生數(shù)據(jù),在各個地理信息標識的機構(gòu)和地點,將 DR 及 DN 等數(shù)據(jù)進行直觀的圖形化信息展現(xiàn),以交互式視覺表現(xiàn)的方式,快速準確地提
15、供報表。3.33.3.13.3.23.3.3DM 社區(qū)互聯(lián)網(wǎng)健康管理技術(shù)和模式基于健康的 DM 雙向轉(zhuǎn)診、會診、慢病管理等移動醫(yī)療服務應用技術(shù);基于大數(shù)據(jù)的 DM 臨床決策支持系統(tǒng)、防控決策支持系統(tǒng)、衛(wèi)生政策支持系統(tǒng);基于“互聯(lián)網(wǎng)+”社區(qū)健康管理模式中利益相關(guān)者的利益機制設(shè)計。3.43.4.1DR 關(guān)聯(lián)DR 及 DN 易感DR 及 DN 易感分子分型的液相分子分型的液相試劑盒開發(fā)。針對已有的 DR 及 DN 研究文獻,對CPVL/CHN2、ZNRF1、COLEC12、SCYL1BP1 和 API5 等位點進行檢測產(chǎn)品開發(fā),對本CDC42EP3 及 HNFlB 等位點進行檢測產(chǎn)品開發(fā)。應用 lu
16、minex位點的引物和探針,并結(jié)合相關(guān)配套試劑進行實驗條件的探索。團隊前期研究發(fā)現(xiàn)的 DN 關(guān)聯(lián)液相,設(shè)計出對應3.4.2 DR 及 DN 易感分子分型的風險評估分析算法開發(fā)。針對相關(guān)文獻提及的優(yōu)勢比和人群等位子分型頻率等數(shù)值,結(jié)合上。-定律等,開發(fā)出風險評估的分析算法,并整合在分(二)項目的特色和創(chuàng)新之處1、構(gòu)建 DM通過構(gòu)建開發(fā)以及的隨訪布局,整合患者的臨床信息,對 DM 患者進行管理。以及進行的隨訪信息收集,同時與基層醫(yī)院聯(lián)動,整合患者的臨床信息,對 DM 患者進行管理。2、面向 DM 特征性并發(fā)癥的產(chǎn)品開發(fā)以及信息收集。DM 引起的并發(fā)癥對患者影響大,本項目將開發(fā)相關(guān)的產(chǎn)品,針對 DM
17、 引起的視網(wǎng)膜病變和腎臟病變等并發(fā)癥,高風險的患者將被建議接受免散瞳照相及尿微量白蛋白檢測確診,對接 DR 及 DN 的。3、基于和免散瞳照相的 DR 及 DN,打造 DM 并發(fā)癥診療的新路徑、新模式。,結(jié)合相關(guān)的患者臨床信息,可探通過 DM 人的并發(fā)癥易感和 DR 及 DN索不同風險類型的 DM 患者的并發(fā)癥管理模式。對并發(fā)癥高風險的血糖實行嚴格管理,減少并發(fā)癥的發(fā)生率與并發(fā)癥的危害。進行定期篩查,并對其(三)要達到的技術(shù)、經(jīng)濟指標及社會、經(jīng)濟效益CMD 精準醫(yī)療建設(shè)將改變 CMD 防治模式,實現(xiàn) CMD 精準的防治策略。本研究項目將產(chǎn)生巨大的社會效益和一定的經(jīng)濟效益,項目將達到國內(nèi)領(lǐng)先水平
18、。1、預期成果指標(1)通過研究開發(fā) DM 并發(fā)癥風險評估算法和相關(guān),同時構(gòu)建相關(guān)大數(shù)據(jù),從而促進相關(guān)檢測的算法優(yōu)化和數(shù)據(jù)共享,實現(xiàn) CMD 精準的防治。(2)完成轄區(qū)內(nèi) 300 例以上中老年人的 DM 并發(fā)癥風險篩查,并構(gòu)建 DM 并發(fā)癥和疾病管理系統(tǒng),實現(xiàn) DM 的雙向轉(zhuǎn)診協(xié)作、高?;姆漳J剑唬?)通過建設(shè)面向 DM 醫(yī)療人群的健康教育、醫(yī)療、精準醫(yī)療和集干預評價功能一體,及時、高效地將各類信息推送給用戶,在轄區(qū)范圍內(nèi)開展慢性 DM 防治的宣傳教育和培訓;(4)通過大數(shù)據(jù)技術(shù)與 DM 并發(fā)癥風險評估算法,進行 DM 醫(yī)療數(shù)據(jù)的分析處理,為疾病的進一步治療提供參考依據(jù)或?qū)崿F(xiàn)疾病的以上,降
19、低相關(guān)的醫(yī)療支出 20%以上。,將 DM降低 10%以上,并發(fā)癥發(fā)率下降 20%(5)通過項目的建設(shè),將申請發(fā)明專利 1 項、科技5 篇,被收錄3篇,其中 SCI(著)3 篇;培養(yǎng)和引進專門10 人以上;服務企業(yè)數(shù)(或社區(qū)醫(yī)院)10 家以上,進行培訓、講座、及其他社會服務共計 1000 次以上,通過項目的建設(shè),還將建成 1 個 CMD 示范點,以便更好地為佛山市的居民服務。2、預期經(jīng)濟效益項目實施期內(nèi)預計向 10 家以上的基層醫(yī)院提供服務,預計產(chǎn)值超過 250 萬元以上。項目完成后 CMD 服務產(chǎn)品推廣至全省甚至以上增長。多數(shù)城市,產(chǎn)品銷售及技術(shù)服務合同將實現(xiàn) 50%3、預期社會效益的建設(shè)明顯
20、提高 DM 的診療效果,大大減少其診療副作用,大幅度地節(jié)省醫(yī)療資源??偨Y(jié)臨床研究成果,對推動適合我市具體情況的規(guī)范化診治共識或指南的制定及發(fā)展;通過與衛(wèi)生行政主管部門等合作,為衛(wèi)生政策提供數(shù)據(jù)分析。(四)采用的方法、技術(shù)路線以及工藝流程本項目將綜合應用多學科方法:1、理論基礎(chǔ)及方法學:(1)臨床醫(yī)學:DM計。、治療,眼科、治療;全科醫(yī)學,影像學,臨床醫(yī)學試驗設(shè)預防醫(yī)學:慢病篩查與監(jiān)測,慢病健康管理:健康教育與健康促進。臨床檢驗:臨床檢驗質(zhì)量控制,臨床檢驗一致性和溯源性。(4)流行病學:疾病、患病率,社區(qū)干預前后對照研究。衛(wèi)生統(tǒng)計學:矯正的t-test 檢驗、秩和檢驗、方差分析,Logistic
21、 回歸分析,廣義線性回歸分析,多水平線性回歸分析和結(jié)構(gòu)方程模型。衛(wèi)生經(jīng)濟學:衛(wèi)生服務評價研究,政策干預效果評價,成本效益、成本效率、成本效果分析。計算機科學:圖形學和可視化計算、智能系統(tǒng)、人機交互、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和機器學習,信息管理、工程、網(wǎng)絡(luò)計算和科學計算。(8)互聯(lián)網(wǎng)技術(shù):數(shù)據(jù)、處理和傳輸?shù)闹鳈C和網(wǎng)絡(luò)通信設(shè)備,醫(yī)學信息搜集、檢索、分析、應用、評估信息,決策分析模型或 DW/DM 等技術(shù)。2、相關(guān)技術(shù):(1)基于核酸雜交熒光反應的液相探針。技術(shù)和引物設(shè)計原則,針對相關(guān)位點設(shè)計引物和(2)醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)安全技術(shù)研究a)研究醫(yī)療健康中動態(tài)信任鏈的構(gòu)建和實體行為的追蹤和分析;b)研究面向多層次數(shù)據(jù)服務模
22、式的虛擬化安全機理、高效安全共享機制等;c)以學為基礎(chǔ),結(jié)合醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)特點,基于學的大數(shù)據(jù)加密、控制、檢索、更新、完整性保護和可追蹤性。3、醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)管理技術(shù)研究(1)海量醫(yī)療健康數(shù)據(jù)的分布式技術(shù)研究:研發(fā)設(shè)計適合海量醫(yī)學數(shù)據(jù)的分布式架構(gòu),滿足其快速讀寫需求,并具備良好的彈性,可動態(tài)擴展容量及 I/O 傳輸能力。綜合局域網(wǎng)絡(luò)(Fiber ChannelHadoop 的特點和醫(yī)學影像檢驗云的需求,采用光纖Storage Area Network,F(xiàn)CSAN)和 Hadoop 分布式文件系統(tǒng)(Hadoop Distributed FileSystem,HDFS)相結(jié)合的“歸檔”二級架構(gòu)設(shè)計
23、數(shù)據(jù)層。(2)設(shè)計實現(xiàn)醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)分布式:研究參考健康和區(qū)域衛(wèi)生信息化,建立標準、全數(shù)據(jù)、可共享的電子健康,據(jù)此應用并改進符合國情實際的共享標準。結(jié)合醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)開放標準,采用 Hadoop,在市衛(wèi)生局現(xiàn)有區(qū)域醫(yī)療基礎(chǔ)上,應用醫(yī)療信息系統(tǒng)集成(egrating the HealthcareEntrise,IHE)、HL7 臨床文檔結(jié)構(gòu)(Health Level SevenClinicalArchitecture,HL7CDA)、醫(yī)學數(shù)字成像和通信(DigitalImaging and Communicationsedicine,)等國際標準,通過 IHE標識交叉索引(IHE Patient
24、 Identifier Cross Referencing,IHX)跨域居民 ID 交叉索引和服務接口,分布式并整合基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)、醫(yī)療衛(wèi)生主管部門、大型醫(yī)院和健康企上的各層次醫(yī)療健康信息,以 CA 認證管理系統(tǒng)為基礎(chǔ),安全管理體系,建立具備良好安全保障的區(qū)域醫(yī)療健康多源異構(gòu)混合大數(shù)據(jù),依托構(gòu)建區(qū)域影像中心和檢驗中心,開展的醫(yī)療協(xié)同服務及應用。三、工作基礎(chǔ)和支撐條件(一)承擔概況(、資產(chǎn)、業(yè)務與管理狀況)1、區(qū)人民醫(yī)院承擔本研究的佛山市區(qū)人民醫(yī)院是南方醫(yī)學的附屬醫(yī)院,是一所集預防、醫(yī)療、康復以及醫(yī)學教育和科研任務的大型綜合性三級甲等醫(yī)院,年門診量達 200 萬人次,出院人數(shù)近 5 萬人次。內(nèi)
25、科綜合實力強大,現(xiàn)為區(qū)高水平重點??疲瑸榉鹕绞行l(wèi)生局醫(yī)學“特色??啤薄⒋参?58 張,年門診量達 10 萬人次。團隊現(xiàn)有高級7 人,博士 3 人,6 人,承擔省市各級課題數(shù)十項,已本項目相關(guān)的 SCI8 篇,累積 IF 約 26 及中文核大數(shù)據(jù)分析,并于 2016.4 月-心數(shù)十篇。本課題及主要成員近 2 年一直從事 CMD 的10 月在大學留學半年,已SCI2 篇,累積 IF 達 5.1,發(fā)現(xiàn)了 DR 的關(guān)鍵。建立了與本項目相關(guān)的病例收集及數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),擁有全自動生化儀、動態(tài)血糖儀等保證臨床信息收集的基本設(shè)備。2、南方醫(yī)合作礎(chǔ),其學第三附屬醫(yī)院南方醫(yī)學第三附屬醫(yī)院團隊在慢性代謝恬疾病大數(shù)據(jù)分
26、析方面已有良好的基人現(xiàn)為教育部,國家杰出青年基金獲得者,兼任大學首席教授。包括 NEJM 及 nature 在主要從事復雜疾病大數(shù)據(jù)分析和生物信息學等多學科的綜合研究,內(nèi) SCI500 多篇。從事了進化生物學、分子進化遺傳學、群體及數(shù)量遺傳學、生態(tài)遺傳學、骨醫(yī)學、骨質(zhì)分子遺傳學、計算和統(tǒng)計遺傳學等跨學科和交叉學科的研究取得下列成就:發(fā)展了“鄧-”(Deng-Lynch)法來測定突變的突變率、突變對機體的危害及其遺傳效應;第一次發(fā)現(xiàn)并證實維生素-D 的受體和雌的受體在一定程度上決定人類骨質(zhì)密度的自然變化及藥理調(diào)控;承擔和主持過國家級課題 7 項,獲得國際和各種杰出青年科學家獎 9 項,7 次應邀
27、在國際重要學術(shù)會議上作專題金組織擔任評審。,為 13 個國際一流雜志和NSF 等基3、廣州合作臨床檢驗中心廣州臨床檢驗中心為中山大學醫(yī)學科技服務體系的成員和執(zhí)行。依托中山大學的基礎(chǔ)科研和學研服”于一體、國內(nèi)最為齊全的,體系。臨檢在醫(yī)學檢驗與臨檢擁有國際領(lǐng)域構(gòu)建了集“產(chǎn)標準的醫(yī)學(獲得 ISO15189 認證及 CAP 認證)和頂尖的病理技術(shù)(擁有兩家以病理為主通過 CAP 認可的檢驗中心,檢測唯一)。臨檢是國內(nèi)規(guī)模最大、技術(shù)水平最高、管理和運營最規(guī)范的醫(yī)學之一,在、分子等代表醫(yī)學未來趨勢的尖端技術(shù)領(lǐng)域始終保內(nèi)領(lǐng)先地位。(二)本項目現(xiàn)有的研究工作基礎(chǔ)(包括與本項目相關(guān)的前期科研成果、團隊建設(shè)、設(shè)
28、備購置等)1. 本項目相關(guān)的前期科研成果本研究團隊在 CMD 的精準醫(yī)療研究方面有較好的基礎(chǔ),已相關(guān) SCI6 篇,具體如下:1.11.1.1性腎病結(jié)合組學和轉(zhuǎn)錄組學利用A 方法分析性腎臟疾病(diabetickidney disease,DKD),新發(fā)現(xiàn) CDC42EP3 及 HNFlB在 DKD 的病理生理機制中起到重要作用,可能通過影響母細胞參與 DKD 特征的病理改變腎小球硬化。1.1.21 型結(jié)合組學和轉(zhuǎn)錄組學利用網(wǎng)絡(luò)共表達分析(weighted gene co-expresnetworkysis,A)1 型,新發(fā)現(xiàn) G3BP1、ZNF207、RRP12、NAAA在 1 型的病理生理
29、機制中起到重要作用,可能通過 Wnt 信號通路影響胰島B 細胞的炎癥破壞。應用PCFDR 分析來自歐洲人群的 T1DM 和支氣管哮喘 GWAS 獲得兩種疾病發(fā)病的共同單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)位點 12 個。共效果中參與糖代謝有關(guān)的有 MUC22、FHIT、TAP2 和 DLC1,同時發(fā)現(xiàn) LOC100294145和 LOC101929006 可能參與 T1DM 和支氣管哮喘發(fā)病過程中的自身免疫的調(diào)節(jié)。該研究從分子水平表明支氣管哮喘和 T1DM 發(fā)病的共同機制,對進一步的研究具有重要的指導意義。1.2.3 2 型本項目團隊利用多效性
30、已知條件錯誤發(fā)現(xiàn)率(pleiotropy-informed conditionalfalse discovery rate,PCFDR)方法,對 2 型和出生體重的全組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide assotion study, GWAS)數(shù)據(jù)進行雙變量整合分析,鑒定出 120 個 2型新的位點、12 個出生體重新的位點及 9 個兩者共效的位點,為探索兩者新的共同的干預靶點提供新的依據(jù),為 2 型的早期易感人群的篩查提供了方向。(本研究成果已在國際雜志 J diabetes IF 2.5)。另外也用同樣方法對 2 型和兒童肥胖的 GWAS 數(shù)據(jù)進行雙變量整合分析,鑒定出 125 個 2 型
31、新的位點、25 個出生體重新的位點及 10 個兩者共效的位點,為探索 2 型和肥胖新的共同的干預靶點提供新的依據(jù),為 2 型糖尿病及肥胖的早期預防提供了方向。1.2病本項目團隊利用批 PCFDR 的方法,在病發(fā)現(xiàn) 66 個與 2 型相關(guān)的 SNPs 位點。其中,有 23 個 SNPs 及其對應的在既往的研究中已被證實;新發(fā)現(xiàn) 43 個 SNPs 中,有 32 個 SNPs 所對應的在既往研究中已被,有 11 個 SNPs 及其對應是本研究新發(fā)現(xiàn)的變異位點。有意思的是,其中新發(fā)現(xiàn)的 SNPrs9267576 對應的 NEU1,對于調(diào)節(jié)能量代謝及血糖有著重要意義。在中,發(fā)現(xiàn) 78 個與病相關(guān)的 S
32、NPs 位點。其中,有 19 個 SNPs 及其對應在既往研究中已被;新發(fā)現(xiàn) 59 個與病相關(guān)的 SNPs,有 31 個 SNPs 對應的在以往研究中已被,有 28 個 SNPs 及其對應的是新發(fā)現(xiàn)的易感區(qū)域。在 Conjuction-cFDR發(fā)現(xiàn) 8 個 SNPs( rs896854, rs6982393, rs4734295, rs7812465, rs10510109,rs2421016, rs6859, rs2075650)是 2 型及病共同相關(guān)的遺傳多態(tài)性位點。其中,TP53INP1(rs896854,rs6982393, rs4734295)、TOMM40(rs2075650)、C
33、8orf38(rs7812465)與氧化應激或者線粒體功能有一定的關(guān)聯(lián),而這兩個在 2 型糖尿病及病的發(fā)病機制上有重要作用。1.3 心疾病本團隊發(fā)現(xiàn) miR-30a 下調(diào)引起自噬相關(guān)Beclin-1 誘導的心肌自噬過度激活介導了 AngII 引起的心肌肥厚,即可能存在參與心肌肥厚的通路:AngIImiR-30aBeclin-1 表達心肌自噬增強心肌肥厚。研究結(jié)果提示血漿 miR-30a 可以作為心臟肥厚的潛在標志物。本研究結(jié)果對揭示心臟肥厚的新機制有重要意義,將為心臟肥厚的防治提供嶄新的科學思路。(本研究成果已在國際雜志 PLOSONE IF 3.0 及J Cardiovascpharmaco
34、l IF 2.5,并被 2016 國際自噬檢測指南采納,發(fā)表在 Autophagy IF 11.753 )。本團隊發(fā)現(xiàn)的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),(1)番茄紅素通過抑制膽固醇吸收轉(zhuǎn)運蛋白1L1的表達,從而降低膽固醇在腸道細胞中吸收;(2)番茄紅素通過抑制巨噬細胞內(nèi)活性氧的生成,抑制下游炎癥信號通路 NF-B 的激活和巨噬細胞的炎癥反應,從而具有抑制炎癥反應的作用。本研究將為心疾病的防治提供一個新的膳食途徑,也將為番茄紅素抗炎和心疾病的一級預防提供新的科學依據(jù)。(本研究成果已在國際雜志J Nutr Biochem IF 4.6 及 Mol. Nutr. Food Res IF 4.6 )。1.4 骨質(zhì)疏松結(jié)
35、合組學和轉(zhuǎn)錄組學利用A 方法分析骨質(zhì)疏松,新發(fā)現(xiàn) HOMER1可能是骨質(zhì)疏松的風險。(本研究成果已在國際雜志 JBMR IF 6.8)。2、本項目在數(shù)據(jù)收集、臨床檢測及型方面的前期工作基礎(chǔ)本項目協(xié)作臨檢搭建了熒光定量 PCR、毛細管電泳、飛行時間質(zhì)譜等檢擁有測技術(shù),在代謝病易感等疾病領(lǐng)域具備檢測服務和運營基礎(chǔ);同時申報集“產(chǎn)-學-研-服”于一體的全體系,與國內(nèi)外標準化組織建立合作關(guān)系;在、分子領(lǐng)域擁有完備的臨床應用試點資質(zhì),并初步具備大規(guī)模實施高端檢測技術(shù)應用和運營推廣支持能力,在復雜代謝病等領(lǐng)域服務達 25-30 萬人次/年。2015 年,東省國家臨檢獲批成為國家第一批技術(shù)應用示范中心牽頭建
36、設(shè),承擔廣技術(shù)應用示范中心項目。同年還承擔了廣州市工信委、財?shù)摹盎ヂ?lián)網(wǎng)+分級協(xié)同創(chuàng)新服務模式構(gòu)建與應用”項目,立足“互聯(lián)網(wǎng)+”布局,采用產(chǎn)學研服協(xié)同,搭建“互聯(lián)網(wǎng)+”同”創(chuàng)新服務模式。分級協(xié)同服務體系,探索“互聯(lián)網(wǎng)+”“采診分離,分級協(xié)新醫(yī)改以來,臨檢積極探索高端資源支持基層衛(wèi)生能力的協(xié)同服務模式,承擔和參與廣州市發(fā)改委“基層醫(yī)學及健康信息服務應用示范”和省科技計劃 “醫(yī)療大數(shù)據(jù)健康已完成研究與社會服務示范”研究項目。以的 IT 數(shù)據(jù)為支撐,目前省內(nèi) 120 家社區(qū)衛(wèi)生服務中心和醫(yī)院的醫(yī)學技術(shù)支持網(wǎng)絡(luò)覆蓋并開展了智慧分級診療試點應用示范,在建立醫(yī)療大數(shù)據(jù)方面累積了許多實踐經(jīng)驗。在 DR 防治的
37、探索中,本項目團隊初步形成了一整套以“照診分離,分級協(xié)同”為特點的DR 防治解決方案,建設(shè)了收集患者基本醫(yī)療信息、生化檢測、醫(yī)學影像數(shù)據(jù)等醫(yī)學數(shù)據(jù)的 DR互聯(lián)網(wǎng)防治,并開展了一系列應用實踐。已在十多家社區(qū)醫(yī)療衛(wèi)生服務機構(gòu)和區(qū)域醫(yī)院開展 DR 的篩查,新增有效 DM 患者并完成 DR 篩查 2000 多例。3、本項目的團隊建設(shè)本項目團隊具有包括臨床醫(yī)學、生物信息學,衛(wèi)生經(jīng)濟學,分子生物學,藥劑學,流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學,檢驗醫(yī)學及 IT 研發(fā)專業(yè)等多學科背景,其中 1/2 成員具有海外背景,其中教育部,國家杰出青年基金獲得者,兼任大學首席教授一名、博士生導師 2 名,博士 8 名,地方名師 2 名,
38、高級9 名。4、設(shè)備購置本項目負責已建立了與本項目相關(guān)的病例收集及數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),擁有全自動生化儀、動態(tài)血糖儀等保證臨床信息收集的基本設(shè)備。本項目協(xié)作臨檢搭建了熒光定量 PCR、毛細管電泳、飛行時間質(zhì)譜等檢擁有測技術(shù),在代謝病易感等疾病領(lǐng)域具備檢測服務和運營基礎(chǔ);同時申報集“產(chǎn)-學-研-服”于一體的全體系,與國內(nèi)外標準化組織建立合作關(guān)系;在、分子領(lǐng)域擁有完備的臨床應用試點資質(zhì),并初步具備大規(guī)模實施高端檢測技術(shù)應用和運營推廣支持能力,在復雜代謝病等領(lǐng)域服務達 25-30 萬人次/年。(三)本項目相關(guān)技術(shù)已獲得的財政支持情況1、佛山市區(qū)人民醫(yī)院獲得的財政支持情況1) 2014 年申請成為佛山市區(qū)市級
39、潛力??婆嘤壐偁幮苑峙漤椖浚@得40 萬元。2) 2016-2020 年成為佛山市區(qū)高水平重點專科及佛山市特色???,獲得100 萬元。2、南方醫(yī)學第三附屬醫(yī)院1)2014.8-2018.7NIH 科研基金(5R01MH104680)egration of Brain Imaging with Genomic andgenomic Data,$2,058,492。3、廣州臨床檢驗中心序號項目/課題類別、等級項目/課題名稱承擔/參與1國家發(fā)改委重大新興產(chǎn)業(yè)工應用示范中心廣州臨床檢驗中心有限公司2國家重點研發(fā)計劃“精準醫(yī)學”重點專項建立高尿酸血癥與痛風大樣本庫及隊列管理平臺,繪制分子分型多組學圖
40、譜廣州臨床檢驗中心有限公司險分析1、風險(1)技術(shù)風險:主要來自于國內(nèi)外同類技術(shù)帶來的和知識壁壘,以及異構(gòu)系統(tǒng)集成帶來的技術(shù)問題。如果使用造成系統(tǒng)不可靠現(xiàn)象。技術(shù)可能帶來知識糾紛,而使用不完全兼容的新技術(shù)可能(2)管理風險:基于大數(shù)據(jù)的醫(yī)療的導致技術(shù)流失的可能。形成時間不長,行業(yè)競爭不規(guī)范,也存在技術(shù)(3)風險:項目能否按照使用計劃到位,是否有科學、合理的分配機制,是項目成功實施的關(guān)鍵。(4)市場風險:主要體現(xiàn)在如何去推廣、試點應用,迅速占領(lǐng)市場,讓的醫(yī)療機構(gòu)享受項目的成果,并在試點的帶動下形成規(guī)模,為醫(yī)療衛(wèi)生行業(yè)提供豐富的應用服務及解決方案。(5)政策風險:醫(yī)療衛(wèi)生信息化是國家醫(yī)改工作的基礎(chǔ)
41、和技術(shù)支撐,醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)的社會服務已經(jīng)成為我國性新興產(chǎn)業(yè)。醫(yī)療衛(wèi)生服務體系規(guī)劃綱要(2015-2020 年)提出建立專業(yè)公共衛(wèi)生機構(gòu)與公立醫(yī)院、基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)和非公立醫(yī)療機構(gòu)之間的信息共享與互聯(lián)互通機制,建立并完善分級診療模式。自 2014 年 6 月起,國家衛(wèi)計委醫(yī)政醫(yī)管局逐步批準多個高通量的臨床應用。2015 年 3 月,科技部召開國家首次精準醫(yī)學會議,并決定在 2030 年前在精準醫(yī)學領(lǐng)域投入 600 億元。因此,本項目政策風險很小。2、規(guī)避措施(1)技術(shù)風險規(guī)避措施:團隊成立知識小組,建立專利保護制度,避免了知識的風險。同時,項目研發(fā)小組由多年來一直從事相關(guān)領(lǐng)域研發(fā)工作的技術(shù)隊伍組
42、成,具有豐富的經(jīng)驗,充分掌握項目相關(guān)開發(fā)技術(shù)、方法和工具,完全能夠設(shè)計出滿足應用需求的系統(tǒng),為項目的攻關(guān)及方案設(shè)計提供了有效的技術(shù)保障。(2)管理風險規(guī)避措施:建立項目管理小組,協(xié)調(diào)和銜接項目間的研究方案、內(nèi)容、進度等。項目擔任組長,統(tǒng)管財務管理小組,保證項目運行期間各項工作的正常有序,同時保護研發(fā)成果。項目采用合理的管理模式和保障措施,加強項目管理,強化隊伍的穩(wěn)定性、積極性,3省科技計劃項目醫(yī)療大數(shù)據(jù)健康服務平臺研究與社會服務示范廣州臨床檢驗中心有限公司4廣州市扶持新業(yè)態(tài)發(fā)展專項項目互聯(lián)網(wǎng)+分級協(xié)同創(chuàng)新服務模式構(gòu)建與應用廣州臨床檢驗中心有限公司5廣州市科技計劃產(chǎn)學研協(xié)同創(chuàng)新 專項面向臨床高通
43、量數(shù)據(jù)的高性能計算分析應用研究廣州臨床檢驗中心有限公司6廣州市健康醫(yī)療協(xié)同創(chuàng)新項目基于視網(wǎng)膜監(jiān)測體系的DM 社區(qū)互聯(lián)網(wǎng)健康管理構(gòu)建及示范研究廣州臨床檢驗中心有限公司7廣州市信息惠家試點城市示范工程項目基層醫(yī)學及健康信息服務應用示范廣州臨床檢驗中心有限公司以細致的組織實施方案,使管理風險降到最低。(3)風險規(guī)避措施:項目承擔擁有雄厚的實力,為項目研發(fā)的順利進行提供有力的保障。承擔做好調(diào)度,并制訂詳細的分任務實施計劃和實施前的各項準備工作;待到位后,立即投入到建設(shè)中去。聯(lián)合組成專業(yè)的財務管理團隊,貫穿整個項目的研發(fā)過程,保證的分配科學、合理。(4)市場風險規(guī)避措施:項目研制的具有較好的市場前景,項
44、目團隊通過政產(chǎn)學研的大力支持,合作伙伴的品牌效應以及潛在的巨大市緊密合作,擁有良好的推廣,有場,將本項目的市場風險大幅度的降低。五、本項目各參加工作分工及經(jīng)費投入、支出情況2、經(jīng)費投入、支出情況本項目由佛山市區(qū)人民醫(yī)院聯(lián)合南方醫(yī)學第三附屬醫(yī)院及廣州臨床檢驗中心共同完成。共同完成項目開發(fā)、建設(shè)和、以及病例數(shù)據(jù)庫工作。病例的收集主要來自佛山本地各大醫(yī)院,并將將加強同珠三角乃至省內(nèi)外各醫(yī)主承擔佛山市區(qū)人民醫(yī)院工作分工負責的建設(shè)、測試和整體實施等工作;負責的指標;負責項目的申報和驗收工作。經(jīng)費分配情況總經(jīng)費(萬元)75基金經(jīng)費(萬元)25參與南方醫(yī)學第三附屬醫(yī)院工作分工協(xié)助的攻關(guān);協(xié)助甲方完成的建設(shè)、
45、測試和實施;協(xié)助甲方完成項目的申報和驗收工作。經(jīng)費分配情況總經(jīng)費(萬元)25基金經(jīng)費(萬元)12.5參與2廣州臨床檢驗中心工作分工負責精準醫(yī)療云、臨床信息和隨訪管理的搭建;協(xié)助項目的應用實施及推廣應用示范;配合承擔完成項目的申報、結(jié)題驗收工作。經(jīng)費分配情況總經(jīng)費(萬元)50基金經(jīng)費(萬元)12.5院的合作。醫(yī)院已經(jīng)先期投入項目500 多萬元用于購入設(shè)備、培訓及科室的建設(shè),醫(yī)院還將進一步加大投入完善建設(shè)。項目經(jīng)費根據(jù)項目建設(shè)任務進行規(guī)劃,符合佛山市科技局和佛山市財關(guān)于項目專項的相關(guān)使用規(guī)定。經(jīng)費使用情況如下新增經(jīng)費(:萬元)總經(jīng)費其中本專項支出經(jīng)費經(jīng)費額用途說明經(jīng)費額用途說明六、以往承擔項目完成
46、情況及主要成果(近五年內(nèi))(一)承擔國家1)2014.8-2018.7有關(guān)課題完成情況NIH 科研基金(5R01MH104680)egration of Brain Imaging with Genomic and完成良好,準備結(jié)題。genomic Data。國家發(fā)改委進展良好國家重點研發(fā)計劃“精準醫(yī)學”重點專項,建立高尿酸血癥與痛風大樣本庫及隊列新興產(chǎn)業(yè)工,應用示范中心管理進展良好,繪制分子分型多組學圖譜。(二)以往科技成果轉(zhuǎn)化情況1、佛山市區(qū)人民醫(yī)院糖代謝對結(jié)直腸癌防的臨床價值的研究4 篇,應用臨床 3 年,總共應用例數(shù)達1000 例,具有顯著的經(jīng)濟效益及社會效益,明顯增加了患者結(jié)直腸癌早
47、發(fā)率,降低了并結(jié)直腸癌圍手術(shù)期并發(fā)癥發(fā)生率,減少了患者醫(yī)療費用。1、基建費0基建費0基建費2、設(shè)備費25購置儀器、設(shè)備2購置儀器、設(shè)備3、材料費36購置材料12購置材料4、測試化驗加工費檢驗、測試、化驗及加工檢驗、測試、化驗及加工、動力費儀器及設(shè)備及消耗儀器及設(shè)備及消耗、差旅費業(yè)務調(diào)研等業(yè)務調(diào)研等、培訓會議費學術(shù)研討、會議4學術(shù)研討、會議8、國際合作與交流費5國際合作與交流費用0國際合作與交流費用9、/文獻/知識事務費5.5用于專利申請、4.5用于專利申請、10、租賃費10大數(shù)據(jù)云服務器租賃5大數(shù)據(jù)云服務器租賃11、費20用于項目組成員的人員(、博士、IT 開發(fā))10用于項目組成員的人員(、博
48、士、IT 開發(fā))12、費6413、項目管理費7.5項目管理2.5項目管理14、其它(具體說明)5用于培養(yǎng)及勞務支出1用于培養(yǎng)及勞務支出合計15050基建費2、南方醫(yī)學第三附屬醫(yī)院發(fā)展了“鄧-”(Deng-Lynch)法來測定突變的突變率、突變對機體的危害及其遺傳效應;第一次發(fā)現(xiàn)并證實維生素-D 的受體和雌的受體在一定程度上決定人類骨質(zhì)密度的自然變化及藥理調(diào)控;獲得國際和各種杰出青年科學家獎 9 項。(三)項目獲獎及已1、佛山市的與本課題研究有關(guān)的主要區(qū)人民醫(yī)院、專著情況1)Zeng C, ChenYC, Lin X, et al. Increased Identification of Nov
49、elVariantsype2 Diabetes, Birth Weight and Their PleiotropicLoci.Journal of diabetes. J diabetes, 2016,11.29 online (IF2.5).2)Sun W,Zeng C, Liao L,et al. Comparison of acare andmetformherapy in newlydiagnosed type 2 diabetic patients withoverweightand/or obesity.Curr Med Res Opin. 2016;32(8):1389-96.
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