代謝總論課件

第十九章代謝總論Ametabolicmap,ByD.E.Nicholson,UniversityofLeeds,U.K.新陳代謝圖示主要內(nèi)容分解代謝與合成代謝高能化合物在新陳代謝中的重要作用新陳代謝的調(diào)節(jié)代謝中常見的有機反應(yīng)機制代謝的研究方法幾個概念新陳代謝

營養(yǎng)物質(zhì)在生物體內(nèi)所經(jīng)歷的一切化學(xué)變化總稱為新陳代謝代謝中間產(chǎn)物

代謝過程中連續(xù)轉(zhuǎn)變的酶促產(chǎn)物中間代謝

新陳代謝途徑中的個別環(huán)節(jié)、個別步驟主要代謝途徑

代謝網(wǎng)絡(luò)中一些具有共同規(guī)律的途徑Themetabolicmapasasetofdotsandlines,ByB.Alberts1.分解代謝與合成代謝分解代謝catabolism

有機營養(yǎng)物通過一系列反應(yīng)步驟轉(zhuǎn)變成小的，簡單的物質(zhì)的過程，總體來看，分解代謝的終產(chǎn)物是CO2、NH3、和水，同時伴隨著大量化學(xué)能被釋放出來，所以分解代謝又叫產(chǎn)能代謝。合成代謝anabolismorbiosynthesis是生物體利用小分子或大分子的結(jié)構(gòu)元件建造成自身大分子的過程，屬于耗能代謝Parallelpathwaysofcatabolismandanabolismmustdifferinatleastonemetabolicstepinorderthattheycanberegulatedindependently.同一種物質(zhì)其分解代謝與合成代謝的途徑一般是不相同的，這使得生物機體增加了體內(nèi)化學(xué)反應(yīng)的數(shù)量并使代謝調(diào)控具有更大的靈活性與應(yīng)變性。分解代謝與合成代謝生物機體的分解代謝與合成代謝是同時發(fā)生的，但在細胞的不同部位進行。這稱為區(qū)室化-----compartmentation區(qū)室化通過幾種方式影響代謝反應(yīng)。在真核生物中，區(qū)室化將整個代謝途徑完全分隔在特定的亞細胞區(qū)域。將降解和合成途徑分開有許多優(yōu)越性，最主要的是可以避免兩個方向相反的反應(yīng)彼此會部分或完全抵消。

區(qū)室化通過區(qū)室的通透特性也可以調(diào)節(jié)酶促反應(yīng)，通過區(qū)室膜有選擇的通透（或轉(zhuǎn)運）可以調(diào)控底物進入?yún)^(qū)室和從區(qū)室輸出產(chǎn)物，因為區(qū)室內(nèi)底物和產(chǎn)物的相對濃度轉(zhuǎn)而影響酶促反應(yīng)。另外區(qū)室化與影響代謝物跨細胞膜或亞細胞膜轉(zhuǎn)運的激素的作用緊密相連。在哺乳動物中，不同的區(qū)室之間都是通過復(fù)雜的方式聯(lián)系在一起的。分解代謝與合成代謝分解代謝與合成代謝區(qū)室化的實驗驗證分解代謝與合成代謝Compartmentalizationofglycolysis,thecitricacidcycle,andoxidativephosphorylation2.高能化合物在新陳代謝中的重要作用熱力學(xué)原理是代謝研究的基礎(chǔ)，吉布斯自由能是生物化學(xué)中的主要熱力學(xué)函數(shù)偶聯(lián)化學(xué)反應(yīng)標準自由能變化是可加和的。其意義在于一個熱力學(xué)上不利的反應(yīng)可以被熱力學(xué)有利的反應(yīng)所驅(qū)動。AB+CΔGo’=+5Kcal/molBDΔGo’=-8Kcal/molAC+DΔGo’=-3Kcal/mol高能化合物：水解后可釋放出大量能量的化合物，△G<-5Kcal/mol。1、高能磷酸化合物：將高能量儲存在磷酯鍵中的化合物，其磷酯鍵用“～”表示，區(qū)別于“－”。

2、其它高能化合物：乙酰CoA、NADH、NADPH、FADH2高能化合物在新陳代謝中的重要作用高能化合物在新陳代謝中的重要作用在分解代謝中起捕獲和貯藏能量的是ATP（腺嘌呤核苷三磷酸或腺苷三磷酸）ATP中有二個高能磷酸鍵高能化合物在新陳代謝中的重要作用由谷氨酸和氨合成谷氨酰胺的反應(yīng)是ATP的自由能驅(qū)動的能夠直接供能的核苷酸類分子除ATP外還有GTP（鳥苷三磷酸）UTP（尿苷三磷酸）和CTP（胞苷三磷酸）高能化合物在新陳代謝中的重要作用高能化合物在新陳代謝中的重要作用儲備高能磷酸的分子稱之磷酸原(phosphagens)，例如在動物肌肉細胞中發(fā)現(xiàn)的磷酸肌酸和磷酸精氨酸，在脊椎動物的肌肉中，大量的磷酸肌酸是在ATP供應(yīng)充足時生成的。在靜止的肌肉中，磷酸肌酸的濃度大約是ATP的5倍。當需要ATP時，肌酸激酶催化激活的磷?；鶊F從磷酸肌酸轉(zhuǎn)移給ADP，快速地補充ATP。在許多無脊椎動物（例如軟體動物和節(jié)肢動物）中，磷酸精氨酸是激活的磷酰基團的來源。輔酶I（NAD）和輔酶II（NADP）以氫原子和電子的形式將自由能轉(zhuǎn)移給生物合成需能反應(yīng)。在標準條件下，NADH氧化所釋放出的能量是-220KJ/mol，足可以驅(qū)動幾個ATP分子的形成。尼克酰胺腺嘌呤核苷高能化合物在新陳代謝中的重要作用高能化合物在新陳代謝中的重要作用FMN（黃素腺嘌呤單核苷酸）和FAD（黃素腺嘌呤二核苷酸）在呼吸鏈中起傳遞H和電子的作用。FAD高能化合物在新陳代謝中的重要作用FAD+-CH2-CH2-FADH2+-CH=CH-高能化合物在新陳代謝中的重要作用輔酶A（coenzymeA）它由腺嘌呤、D-核糖、磷酸、焦磷酸、泛酸和巰基乙胺組成。巰基是CoA的活性基團。它在酶促反應(yīng)中主要起接受乙?；淖饔?，生成乙酰輔酶A（CH3COSCoA）CH3COSCoA是一高能化合物高能化合物在新陳代謝中的重要作用新陳代謝的調(diào)節(jié)分子水平調(diào)節(jié)包括反應(yīng)物和產(chǎn)物的調(diào)節(jié)，主要是濃度和酶的調(diào)節(jié)，酶的調(diào)節(jié)主要是酶濃度和酶活性調(diào)節(jié)（變構(gòu)調(diào)節(jié)、共價修飾調(diào)節(jié)）。細胞水平調(diào)節(jié)細胞的分隔作用(Compartmentation)。整體水平調(diào)節(jié)多細胞生物的調(diào)節(jié)。主要有激素調(diào)節(jié)、神經(jīng)調(diào)節(jié)。除此之外還有基因表達調(diào)控代謝中常見的有機反應(yīng)機制基團轉(zhuǎn)移反應(yīng)氧化-還原反應(yīng)消除、異構(gòu)化和重排反應(yīng)碳-碳鍵的形成或斷裂反應(yīng)代謝中常見的有機反應(yīng)機制代謝中常見的有機反應(yīng)機制代謝中常見的有機反應(yīng)機制基團轉(zhuǎn)移反應(yīng)

親電子基團從一個親核體轉(zhuǎn)移到另一處親核體上，如酰基、磷酸基、葡糖基的轉(zhuǎn)移等。酰基化合物-X四面體中間產(chǎn)物?；衔?Y胰蛋白酶水解肽鍵就是一個典型例子代謝中常見的有機反應(yīng)機制磷?；D(zhuǎn)移反應(yīng)在代謝中具有特殊意義：活化代謝中間物代謝中常見的有機反應(yīng)機制氧化-還原反應(yīng)

即電子的得失反應(yīng)，在代謝中非常多，如NAD+形成NADH，F(xiàn)AD形成FADH2。電子受體電子供體代謝中常見的有機反應(yīng)機制多數(shù)生物氧化中，化合物失去2個質(zhì)子和2個電子，這些反應(yīng)統(tǒng)稱為脫氫反應(yīng)，對應(yīng)的酶稱為脫氫酶。代謝中常見的有機反應(yīng)機制消除、異構(gòu)化和重排反應(yīng)消除反應(yīng)如C=C的形成；異構(gòu)化反應(yīng)如醛糖與酮糖的異構(gòu)反應(yīng)；分子重排反應(yīng)如L-甲基丙二酰單酰輔酶A經(jīng)甲基丙二酰單酰輔酶A變位酶作用變成琥珀酰輔酶A。代謝中常見的有機反應(yīng)機制消除、異構(gòu)化和重排反應(yīng)消除反應(yīng)如C=C的形成；三種可能的機制：協(xié)同機制、正碳離子機制、負碳離子機制。經(jīng)過碳正離子的機制的醇消除反應(yīng)代謝中常見的有機反應(yīng)機制消除、異構(gòu)化和重排反應(yīng)2.異構(gòu)化反應(yīng)如醛糖與酮糖的異構(gòu)反應(yīng)；代謝中常見的有機反應(yīng)機制消除、異構(gòu)化和重排反應(yīng)3.分子重排反應(yīng)如L-甲基丙二酰單酰輔酶A經(jīng)甲基丙二酰單酰輔酶A變位酶作用變成琥珀酰輔酶A。代謝中常見的有機反應(yīng)機制碳-碳鍵的形成或斷裂反應(yīng)

這類反應(yīng)主要有羥醛縮合反應(yīng)（糖代謝中）、克萊森酯縮合反應(yīng)（合成檸檬酸反應(yīng)）、-酮酸的氧化脫羧（異檸檬酸脫氫酶催化的脫羧）反應(yīng)代謝中常見的有機反應(yīng)機制克萊森酯縮合反應(yīng)——合成檸檬酸反應(yīng)+E-His烯醇式負碳離子草酰乙酸Si