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文檔簡介
腫瘤登記工具軟件IARC-CHECK的使用2011年4月南京工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第1頁!軟件的獲得軟件可從如下網址
./web/detail.aspx?nodeID=507
腫瘤登記工具軟件(IARC/IACRToolsforCancerRegistries)可以免費使用工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第2頁!工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第3頁!IARC/IACRCancerRegistriesTools有關技術文檔,《CheckandConversionProgramsforCancerRegistries》,可從如下網址下載電子文件:
.iacr..fr/TR42.htm工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第4頁!軟件的運行程序安裝完畢后,在windows開始菜單,點擊:IARCcrgTools運行程序。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第5頁!腫瘤分類編碼歷史發(fā)展ICD-61946ICD-71955ICD-81965ICD-91975ICD-101992ICD-O-32000ICD-O-21990ICD-O-11976MOTNAC1968SNOP1965SNDO1951,1961以解剖學為主以形態(tài)學為主解剖學和形態(tài)學MOTNAC1951STATCODE1956第二章腫瘤第二章腫瘤第二章腫瘤工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第6頁!IARC/IACRCancerRegistriesTools提供了如下編碼轉換ICD-O-1(1976)toICD-O-2(1990)ICD-OFieldTrialEdition(1988)toICD-O-2(1990)ICD-O-2(1990)toICD-O-3(2000)ICD-O-2(1990)toICD-9(1975)ICD-O-2(1990)toICD-10(1992)ICD-O-3(2000)toICD-10(1992)工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第7頁!編碼轉換——需注意的問題男性陰莖癌ICD-9編碼三位為187,四位編碼為187.1-9,而無187.0編碼,若編碼為187.0,則會在編碼轉換時報錯。ThefollowingcasescannotbeconvertedtoICD-O-220010571187.011964-07-06372001-08-256?20011875187.011937-05-19642001-05-196?20021877187.011942-02-17602002-02-076?
工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第8頁!Tools——工具工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第9頁!IARCcrgTools軟件工具Multipleprimariescheck
程序按照IARC/IACR多原發(fā)腫瘤定義規(guī)則,檢查多原發(fā)腫瘤。FileTransfer程序若在使用編碼轉換(Conversions)或數(shù)據(jù)審核(Check)程序時,提示數(shù)據(jù)文件格式不對,可以用FileTransfer程序修正數(shù)據(jù)格式;FileTransfer可將逗號、制表鍵、分號等分隔各字段的文本文件,轉換成程序可用的固定格式文件。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第10頁!Check
程序—變量的有效性審核解剖學部位編碼:必須是有效的ICD-O-3編碼,如氣管編碼為C33,或C33.9,不能編碼為C33.0、C33.8;
形態(tài)學編碼:必須是有效的ICD-O-3編碼,如沒有8006/3這個編碼;行為編碼:必須是0,1,2,3(或特殊編碼6或9);分級編碼:必須是有效的ICD-O-3編碼。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第11頁!Check
程序—變量的一致性審核Sex/Histology(ICD-O-3)性別/組織學Behaviour/Site(ICD-O-3)行為/部位Behaviour/Histology(ICD-O-3)行為/組織學Grade/Histology(ICD-O-3)分級/組織學Basisofdiagnosis/Histology(ICD-O-3)診斷依據(jù)/組織學工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第12頁!數(shù)據(jù)格式舉例20030100127019321022200304052003072270C20.C209801039C20980103920030100213919630911200302052003081120C22.9C220800039C22080003920030100316419380413200301062003070820C34.9C349800039C34980003920030100424419590530200310022004052570C66.C669801039C66980103920030100526519380714200307232004020520C20.C209800039C20980003920030100617619261025200305092004012420C34.0C340800039C34080003920030100715919431003200304102003052120C22.9C220800039C22080003920030100827819241125200301222003080520C22.9C220800039C22080003920030100918319191119200305062003080720C16.9C169800039C16980003920030101017219310209200310052005081870C22.9C220801039C22080103920030101928419180511200302252004020870C53.9C539807039C53980703920030102017419290116200308192004041970C16.1C161801039C161801039…Filespecification:1-9YearandID 11-11Sex 13-15Age17-24Dateofbirth 26-33Dateofdiagnosis 35-42Dateofdeath44-44Basis 46-46DCO 48-52ICD-1054-57ICD-O2 59-62ICD-O2-morphology 64-65ICD-O2Behaviorandgrade67-70ICD-O3 72-75ICD-O3-morphology 77-78ICD-O3Behaviorandgrade工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第13頁!編碼轉換示例—ICD-O-3到ICD10定義字段RegistrationNumberSex(male1,female0)TopographyHistologyBehaviourGrade工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第14頁!編碼轉換示例—ICD-O-3到ICD10程序生成3個文件:結果輸出文件:fbie03_o3to10.txt錯誤的記錄文件:fbie03.eo3to10需要注意的記錄文件:fbie03.wo3to10工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第15頁!編碼轉換示例—ICD-O-3到ICD10
有5條錯誤的編碼無法進行轉換,程序在轉換過程中,實際上也是對原編碼進行了一次檢查.程序可對錯誤信息做出提示工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第16頁!使用crgTools——Check示例打開IARCcrgTools—Tools—IARC/IACRCheck點擊InputFile欄下的Browse…按鈕,選取Input文件(以文本格式存放,固定列寬)在OutputFile欄中鍵入輸出文件名下一步工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第17頁!使用crgTools——Check示例定義性別編碼定義年齡不明編碼定義診斷依據(jù)形態(tài)學編碼定義日期格式工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第18頁!使用crgTools——Check示例程序生成3個文件:結果輸出文件:fb03_chk.txt錯誤的記錄文件:fbie03.err需要注意的記錄文件:fbie03.chk工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第19頁!使用crgTools——Check示例.txt結果輸出文件中的記錄是通過審核的合格記錄。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第20頁!使用crgTools——Check示例.chk文件中的記錄是未通過審核,需要再核的記錄。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第21頁!軟件的安裝目前最新版本為2.05:iarccrgtools_205.zip,將下載的文件,解壓縮到一個臨時文件夾中,點擊setup安裝,一路Next下去,完成安裝。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第22頁!Conversions——編碼轉換工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第23頁!IARC/IACRCancerRegistriesTools提供了如下編碼轉換ICD-9(1975)toICD-O-2(1990)ICD-9(1975)andICD-O-1morphology(1976)toICD-O-2(1990)ICD-10(1992)toICD-O-2(1990)ICD-10(1992)andICD-O-2morphology(1990)toICD-O-2(1990)工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第24頁!編碼轉換——需注意的問題編碼必須準確和完整對解剖學部位要求使用ICD四位數(shù)編碼,要編到小數(shù)點后一位;對形態(tài)學編碼,要求有第5位行為編碼,否則會造成編碼轉換過程中的錯誤和匯總統(tǒng)計分析錯誤。編碼轉換軟件不能將所有編碼全部轉換,有一部分編碼,需要由人工轉換。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第25頁!編碼轉換——需注意的問題女性卵巢和其他子宮附件癌的ICD-9編碼為183,卵巢癌的編碼為183.0;若在編碼時編僅編三位碼183,則會在ICD-9轉ICD-10時,轉換成C57.9(女性生殖器官,未特指),而非卵巢癌的C56
。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第26頁!IARCcrgTools軟件工具IARCCHECK程序
Check程序對登記的病例記錄的變量分二步進行審核,一是檢查變量是否完整并在編碼范圍內的有效性檢查,二是對不同變量之間是否合乎邏輯的一致性進行檢查。IARCCHECK程序最早是為了審核《五大洲發(fā)病率》第六卷數(shù)據(jù),由Dr.Parkin等人編寫的。先前的版本對解剖學部位和形態(tài)學編碼的審核是基于ICD-O-1和ICD-O-2,當前版本是基于ICD-O-3。工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第27頁!Check
程序—變量的有效性審核出生日期:必須是按照指定格式的有效日期,如1968/07/01;發(fā)病日期:必須是按照指定格式的有效日期,如2006/03/08;發(fā)病年齡:必須是數(shù)字格式,不大于105歲;如果出生日期和發(fā)病日期完整,年齡可以通過計算獲得;如果出生日期不詳,則年齡字段必須是空白或是999(年齡不詳);性別:必須是有效編碼,如1、2或9(不詳),不能有其它;工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第28頁!Check
程序—變量的一致性審核Age/Incidenceandbirthdates年齡/出生日期與發(fā)病日期Age/Site/Histology(ICD-O-3)年齡/部位/組織學Site/Histology(ICD-O-3)部位/組織學Sex/Site性別/部位工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第29頁!IARC/IACRCancerRegistriesTools使用對數(shù)據(jù)格式的要求數(shù)據(jù)庫文件必須以文本格式存放,變量以間固定格式分隔;每一病例用一行,要求必須包括以下變量:(1)登記號; (2)性別;(3)年齡; (4)出生日期;(5)發(fā)病日期; (6)解剖學部位編碼(ICD-O-3);(7)組織學編碼(ICD-O-3);(8)腫瘤行為編碼(ICD-O-3);(9)腫瘤分級編碼(ICD-O-3);(10)診斷依據(jù)編碼;工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第30頁!使用crgTools——編碼轉換打開IARCcrgTools—Conversions—ICD-0-3->ICD10點擊InputFile欄下的Browse…按鈕,選取Input文件(以文本格式存放,固定列寬)在OutputFile欄中鍵入輸出文件名下一步工具軟件IARC-CHECK的使用共39頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第31頁!編碼轉換示例—ICD-O-3到ICD10工
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