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文檔簡介
Medline與PubMed
山西醫(yī)科大學(xué)信息檢索教研室第四章外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索工具M(jìn)edline&PubMedIndexMedcus(1879-2006)印刷版Medline(1969-)國際聯(lián)機(jī)DIALOGMedline(1983-)光盤版PubMed(1997-)網(wǎng)絡(luò)版
第一節(jié)
MEDLINE
一、概況收錄范圍:1950年至今美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)世界權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫70多個國家的3700多種期刊(中國50種)內(nèi)容涉及生物醫(yī)學(xué)各個領(lǐng)域網(wǎng)絡(luò)檢索入口多
一、概況3種索引:IndexMedicus
(醫(yī)學(xué)索引)IndextoDentalLiterature(牙科索引)InternationalNursingIndex(國際護(hù)理索引)除了不能進(jìn)行分類和中文主題詞途徑檢索外,其他與CBM(中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫)相似。
二、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)(數(shù)據(jù)庫常用字段)TI:Title篇名AU:Authors著者姓名AD:Address著者地址SO:Source文獻(xiàn)出處(刊名,年卷期頁)PY:PublicationYear出版年AB:Abstract文摘PT:Publication
Type出版類型MeSH:MedicalSubjectHeadings醫(yī)學(xué)主題詞MJME:主要主題詞MIME:次要主題詞ISSN:InternationalStandardSerialNumber國際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版號LA:LanguageofArticle文獻(xiàn)語種CP:CountryofPublication出版國AN:AccessionNumber登錄號UD:UpdateCode更新號二、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)(數(shù)據(jù)庫常用字段)三、檢索途徑與方法自由詞檢索(Searches)索引詞檢索(Index)主題詞檢索(Thesaurus)字段檢索(SpecificFields)指定詞檢索(AddtoSearch)主題詞提示檢索(Suggest)基本檢索索引檢索工具按鈕欄檢索區(qū)檢索歷史區(qū)結(jié)果顯示區(qū)主題詞檢索主題詞提示檢索界面指定詞檢索其它功能四、醫(yī)學(xué)主題詞表---MeSHMedicalSubjectHeadings使用CBM、Medline、PubMed的指南用于醫(yī)學(xué)主題詞的規(guī)范由字順表和樹狀結(jié)構(gòu)表組成主題詞約2萬個,副主題詞83個動態(tài)性字順表(AlphabeticList)按字順排列提供主題詞、副主題詞、分類號注釋及相關(guān)詞樹狀結(jié)構(gòu)部分詞倒置,如KIDNEYFAILURE,ACUTE幫助用戶規(guī)范和了解主題詞主題詞樹狀結(jié)構(gòu)號注釋與說明相關(guān)檢索詞副主題詞歷史注釋樹狀結(jié)構(gòu)樹狀結(jié)構(gòu)表(TreeStructrue)根據(jù)詞義范疇和學(xué)科屬性排列16類(解剖學(xué)、生物、疾病…)較好的體現(xiàn)了詞間的隸屬、平行、派生關(guān)系一個主題詞可有多個樹狀結(jié)構(gòu)號幫助用戶查找規(guī)范主題詞第二節(jié)PubMed1、主辦單位美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)2、收錄學(xué)科內(nèi)容主要收錄生物醫(yī)學(xué)和健康科學(xué)以及生命科學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的文獻(xiàn)。包括行為科學(xué)、健康專業(yè)所需要的化學(xué)、生物工藝學(xué),基礎(chǔ)研究和臨床、護(hù)理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策發(fā)展或相關(guān)教育活動的內(nèi)容。2000年起增加了生物、環(huán)境科學(xué)、海洋生物、植物和動物學(xué)、生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究內(nèi)容。2023/1/12153、文獻(xiàn)來源
全球70多個國家和地區(qū)近5000種生物醫(yī)學(xué)期刊涉及40多個語種47%為美國本土出版文獻(xiàn),90%為英文文獻(xiàn),79%的文獻(xiàn)有著者撰寫的英文文摘2023/1/1216一、數(shù)據(jù)庫概況4、PubMed收錄數(shù)據(jù)
MEDLINEIndexed
1966toprensent的MEDLINE已標(biāo)引數(shù)據(jù),有MeSH字段和摘要,每條記錄標(biāo)有[PubMed-indexedforMEDLINE]
OldMDENLINE
1949-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù),沒有MeSH字段和摘要,每條記錄標(biāo)有[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]
2023/1/1217一、數(shù)據(jù)庫概況4、PubMed收錄數(shù)據(jù)
MEDLINEInprocess最新的MDENLINE尚未標(biāo)引的處理中數(shù)據(jù)。每條記錄標(biāo)有[PubMed-inprocess]。NotMEDLINE是出版商提供的電子文獻(xiàn),PubMed收錄,而MDENLINE不收錄的數(shù)據(jù)。每條記錄標(biāo)有[PubMed-assuppliedbypublisher]。2023/1/1218一、數(shù)據(jù)庫概況2023/1/1219基本檢索輸入框工具與資源:提供期刊數(shù)據(jù)庫檢索、規(guī)范詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻(xiàn)檢索等高級檢索5、主頁介紹數(shù)據(jù)庫選擇2023/1/1220可以在檢索欄中輸入一個或多個檢索詞(空格=AND)如:placentagrowthoxygen可以在檢索欄中輸入布爾邏輯運算式(運算符大寫)如:asthmaAND(therapyORtreatment)二、基本檢索規(guī)則二、PubMed基本檢索規(guī)則字段限定符:[],按詞組匹配如:Stemcelltransplantation[ti]截詞符:treat*強(qiáng)迫短語檢索符:“interleukin2”
嚴(yán)格按輸入形式匹配,不再自動轉(zhuǎn)換匹配和擴(kuò)展檢索,常用于詞組和專有名詞檢索。2023/1/1221二、PubMed基本檢索規(guī)則自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞: 對常用醫(yī)學(xué)名詞進(jìn)行自動在規(guī)范詞索引、文本詞及所有記錄字段中轉(zhuǎn)換匹配。
renalfailurekidneyfailure[MESH]ORkidney[AllField]ORrenalfailure[AllField]……2023/1/1222二、PubMed基本檢索規(guī)則自動擴(kuò)展檢索: 系統(tǒng)自動對主題詞、副主題詞擴(kuò)展檢索。 如:輸入hypertensiontherapy,系統(tǒng)自動檢索高血壓的藥物治療(drugtherapy)、飲食療法(diettherapy)2023/1/1223二、PubMed基本檢索規(guī)則著者檢索(authors):姓全稱在前,名縮寫在后加字段限定符 如:genbacev
o[au]
moore
am[au]2002年以后的文章可以查著者全名 如:joshua
lederberg[au]2023/1/1224二、PubMed基本檢索規(guī)則期刊檢索(journals):刊名全稱檢索
newenglandjournalofmedicine[so]MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)刊名縮寫檢索 例:NEnglJMed[so]國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號檢索 例:0028-4793[so]2023/1/1225PubMed記錄字段說明2023/1/1226文摘第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻(xiàn)合著者文獻(xiàn)參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期2023/1/1227電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱2023/1/1228最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)編號2023/1/1229作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式(紙張或電子)參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻(xiàn)標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻(xiàn)文獻(xiàn)正在更新期刊卷號1、基本檢索
2、高級檢索3、MeSH數(shù)據(jù)庫檢索4、期刊檢索5、臨床咨詢2023/1/1230三、檢索方法2023/1/1231綜述免費全文輸入多個檢索詞placentagrowthoxygen2023/1/1232字段限定
stemcelltransplantation[ti]2023/1/1233stemcell[ti]ANDtransplantation[ti]比空格多檢出400篇2023/1/1234輸入renalfailure自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞2023/1/1235自動擴(kuò)展檢索2023/1/1236著者檢索mooream[au]2023/1/1237期刊檢索:Newenglandjournalofmedicine[so]
2、高級檢索在一個網(wǎng)頁中集基本檢索、檢索歷史、多欄復(fù)合檢索、索引查詢、邏輯算符選擇、檢索限制于一體檢索史中顯示歷次檢索式、時間和檢出篇數(shù)多欄復(fù)合檢索時,檢索框中只能輸入檢索詞,不能輸入檢索式利用字段限制和邏輯算符,構(gòu)建復(fù)雜檢索式2023/1/1239檢索歷史(SearchHistory)以列表形式顯示歷次檢索式、檢索時間和檢出篇數(shù)Preview:系統(tǒng)不顯示命中文獻(xiàn)信息,而在History中直接顯示檢索式和檢出篇數(shù)。2023/1/12復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室40檢索式檢索時間檢出篇數(shù)檢索式編號可替代檢索式進(jìn)行輸入檢索如:#17ANDtherapy2023/1/1241索引查詢欄間邏輯組配查找PatrickConcannon于2009年發(fā)表在TheNewEnglandJournalofMedicine上的綜述。多欄復(fù)合檢索concannonp欄內(nèi)不能輸算符,檢索詞間空格默認(rèn)AND運算檢索限制(Limit)全文、免費全文、摘要限定研究對象人/動物限制性別限制文獻(xiàn)類型限制語種限制子文檔限制年齡限制2023/1/12422023/1/1243全文、免費全文、摘要限定Limit—檢索限制研究對象人/動物限定語種限定子文檔限定性別限定年齡限定文獻(xiàn)類型限定構(gòu)建檢索式索引查詢(Index)2023/1/1245Details(檢索的詳細(xì)匹配過程)顯示檢索詞轉(zhuǎn)換匹配運算詳細(xì)過程用途:轉(zhuǎn)換、確定規(guī)范詞如:livercancer
liverneoplasms修改檢索策略2023/1/12462023/1/1247檢索明細(xì)數(shù)據(jù)庫匹配過程檢索詞轉(zhuǎn)換顯示用戶輸入的檢索式
3、MeshDatabase
確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞擴(kuò)展主題詞確定主要主題詞檢索(加權(quán)檢索)2023/1/1248進(jìn)入MeSH檢索實例1:2006-09年有關(guān)舌根癌的治療進(jìn)展。要求:用MeSHDatabse(主題詞表選詞)檢索PubMed數(shù)據(jù)庫,并用自由詞檢索09年以來發(fā)表的最新文獻(xiàn)。2023/1/1250課題:提示舌根癌的不同表達(dá)形式:
tonguebasecancer、cancer/carcinoma/tumoroftonguebase、cancerofthebaseoftongue…治療包括:drugtherapy、therapy、surgery、radiotherapy、rehabilitation2023/1/12512023/1/12522023/1/1253輸入舌根的自由詞檢索式,與舌腫瘤治療的檢索式進(jìn)行AND運算。2023/1/1254初步結(jié)果,未限定年份進(jìn)入高級檢索進(jìn)一步限定2023/1/12552023/1/1256檢索結(jié)果4、Journaldatabase檢索
通過輸入刊名全稱或縮寫等了解該刊基本情況瀏覽期刊上發(fā)表的文獻(xiàn)獲得相關(guān)期刊信息提供電子全文的超鏈按鈕2023/1/12572023/1/1258期刊數(shù)據(jù)庫檢索2023/1/1259輸入待檢期刊名獲得期刊詳細(xì)信息相關(guān)期刊鏈接
5、臨床咨詢(ClinicalQueries)專門檢索臨床研究方面文獻(xiàn),可進(jìn)行治療、診斷、病因、預(yù)后及臨床實踐指南五個類目限制,并選擇強(qiáng)調(diào)查全還是強(qiáng)調(diào)查準(zhǔn)2023/1/12602023/1/1261查找系統(tǒng)評價(SystematicReviews)五、其它服務(wù)PubMedCentral(PMC)SingleCitationMatcher生物信息數(shù)據(jù)庫OMIMGeneBLASTGenome3DDomains2023/1/1262StructureTaxonomyNucleotideProteinBookshelf進(jìn)入PubMedCentre下拉主頁滾動條至低PMC首頁進(jìn)入高級檢索2023/1/1264查找腎衰竭的藥物療法2023/1/1265全文鏈接六、檢索結(jié)果輸出顯示檢索結(jié)果全文獲取保存檢索結(jié)果保存檢索策略2023/1/1266顯示字段選擇(Display)Summary:標(biāo)題、著者、出處、ID號Abstract:來源期刊、標(biāo)題、著者、著者地址、記錄性質(zhì)、文獻(xiàn)類型、勘誤、評論、PMID或UI、摘要、MeSH詞等。MEDLINE:(最完整,有標(biāo)識符)2023/1/12672023/1/1268顯示格式選擇顯示格式(DisplaySettings)點擊標(biāo)題顯示文摘增強(qiáng)格式排序方式選擇6篇有免費全文2023/1/1269文摘增強(qiáng)格式相關(guān)論文論文涉及的MeSH詞,文獻(xiàn)類型等信息LinkOut外部資源鏈接收費全文鏈接,我校訂購的數(shù)據(jù)庫可鏈出全文其他相關(guān)的網(wǎng)上免費醫(yī)學(xué)指南信息下載全文2023/1/1271輸出方式(Sendto)輸出方式選擇輸出方式選擇(sendto)File:保存檢索結(jié)果Clipboard:剪貼板,多次檢索,可暫存每次檢索需下載的記錄,最后一起保存。最多允許存儲500條,保留8小時Email:通過郵件發(fā)送Collections:將檢索結(jié)果送至MyNCBI中Order:全文傳遞服務(wù),需帳號、收費2023/1/1272Medline與PubMed的區(qū)別收錄范圍不同數(shù)據(jù)更新周期不同檢索功能的區(qū)別Pubmed帶有網(wǎng)絡(luò)鏈接功能檢索結(jié)果輸出方式的區(qū)別Pubmed部分帶有全文鏈接其它外文檢索工具IM(IndexMedicus)—Medline,PubMedBA(BiologicalAbstracts)—BiosisPreviewsCA(CemicalAbstracts)—SciFinderScholarEM(ExcerptaMedica)—EMBaseSCI(ScienceCitationInd
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