標(biāo)準(zhǔn)解讀
《GB/T 30989-2014 高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程》是一項(xiàng)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn),旨在規(guī)范高通量基因測(cè)序過(guò)程中涉及到的技術(shù)要求、操作流程以及質(zhì)量控制等方面的內(nèi)容。該標(biāo)準(zhǔn)適用于利用高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行人類(lèi)基因組研究及相關(guān)應(yīng)用的實(shí)驗(yàn)室或機(jī)構(gòu)。
標(biāo)準(zhǔn)中首先定義了與高通量基因測(cè)序相關(guān)的術(shù)語(yǔ)和定義,包括但不限于“高通量測(cè)序”、“文庫(kù)制備”等專(zhuān)業(yè)詞匯,為后續(xù)內(nèi)容的理解奠定了基礎(chǔ)。接著,對(duì)于整個(gè)測(cè)序過(guò)程從樣本收集到數(shù)據(jù)分析的每個(gè)環(huán)節(jié)都給出了詳細(xì)的操作指南。例如,在樣本準(zhǔn)備階段,強(qiáng)調(diào)了正確處理不同類(lèi)型生物樣本(如血液、組織)的重要性,并提供了推薦的方法來(lái)保證DNA/RNA的質(zhì)量;在文庫(kù)構(gòu)建部分,則介紹了如何根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇合適的建庫(kù)策略及試劑盒,并對(duì)關(guān)鍵步驟如片段化、末端修復(fù)、接頭連接等進(jìn)行了說(shuō)明;此外,還特別關(guān)注到了測(cè)序前的質(zhì)量檢查環(huán)節(jié),指出了使用哪些工具可以有效評(píng)估文庫(kù)的質(zhì)量狀態(tài),確保其符合上機(jī)測(cè)序的要求。
除了具體操作指導(dǎo)外,《GB/T 30989-2014》也十分重視數(shù)據(jù)管理與分析方面的問(wèn)題。它建議建立完善的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)體系以保障信息安全,并提出了基于不同應(yīng)用場(chǎng)景下對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行初步過(guò)濾、比對(duì)、變異檢測(cè)等一系列處理的基本原則。同時(shí),為了保證結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性,標(biāo)準(zhǔn)中還規(guī)定了一系列內(nèi)部質(zhì)控措施,比如定期校準(zhǔn)儀器設(shè)備、實(shí)施雙盲測(cè)試驗(yàn)證等。
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....
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- 現(xiàn)行
- 正在執(zhí)行有效
- 2014-07-24 頒布
- 2015-03-01 實(shí)施
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GB/T 30989-2014高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程-免費(fèi)下載試讀頁(yè)文檔簡(jiǎn)介
ICS07080
G04.
中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)
GB/T30989—2014
高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程
Technicalregulationofhigh-throughputgenesequencing
2014-07-24發(fā)布2015-03-01實(shí)施
中華人民共和國(guó)國(guó)家質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)檢疫總局發(fā)布
中國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)
GB/T30989—2014
前言
本標(biāo)準(zhǔn)按照給出的規(guī)則起草
GB/T1.1—2009。
本標(biāo)準(zhǔn)由深圳華因康基因科技有限公司提出
。
本標(biāo)準(zhǔn)由全國(guó)生化檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)歸口
(SAC/TC387)。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位深圳華因康基因科技有限公司深圳華因康高通量生物技術(shù)研究院天津康昕瑞
:、、
基因科技有限公司國(guó)家人類(lèi)基因組南方研究中心中國(guó)科學(xué)院北京生物物理研究所深圳市標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)
、、、
研究院上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院
、。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人盛司潼譚輝彪金虹趙國(guó)屏王升躍陳潤(rùn)生周文張俊
:、、、、、、、。
Ⅰ
GB/T30989—2014
高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了高通量基因測(cè)序技術(shù)的術(shù)語(yǔ)與定義測(cè)序的原理技術(shù)指標(biāo)相關(guān)主要儀器測(cè)序試劑
,、、、
及配制和測(cè)序方法的要求
。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于對(duì)動(dòng)物組織血液糞便口腔黏膜毛發(fā)植物組織土壤微生物等生物樣品進(jìn)行高
、、、、、、、
通量基因測(cè)序
。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于單向測(cè)序雙向測(cè)序混合樣品測(cè)序三種類(lèi)型的測(cè)序也適用于表達(dá)譜測(cè)序測(cè)
、、,、ChIP
序癌癥研究和分型測(cè)序微生物元基因組病菌種類(lèi)的檢測(cè)免疫學(xué)和免疫疾病工作甲基化
、、miRNA、、、、
測(cè)序序列多態(tài)性檢測(cè)臨床基因診斷個(gè)性化測(cè)序和基因組測(cè)序
、、、。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的凡是注日期的引用文件僅注日期的版本適用于本文
。,
件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于本文件
。,()。
分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB/T6682
檢測(cè)和校準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室能力的通用要求
GB/T27025—2008
紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)
JB/T6777
電泳裝置
YY/T0087
級(jí)生物安全柜
YY0569Ⅱ
醫(yī)用離心機(jī)
YY/T0657
電熱恒溫水浴鍋
YY91037
用冷凍冷凍干燥和低溫養(yǎng)護(hù)法保存細(xì)菌真菌原生生物病毒遺傳要素
ASTME1342—1997、、、、、
以及動(dòng)物和植物組織的標(biāo)準(zhǔn)實(shí)施規(guī)程
(StandardPracticeforPreservationbyFreezing,Freeze-Drying,
andLowTemperatureMaintenanceofBacteria,Fungi,Protista,Viruses,GeneticElements,andAn-
imalandPlantTissues)
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件
。
31
.
基因gene
位于染色體上編碼一個(gè)特定功能產(chǎn)物如蛋白質(zhì)或分子的一段核苷酸序列是遺傳信息的
(RNA),
基本單位
。
32
.
基因組genome
一種生物體具有的所有遺傳信息的總和
。
33
.
核苷酸nucleotide
構(gòu)成核酸的基
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