生物化學-氨基酸的結(jié)構(gòu)課件

(AminoAcid,AA,Aa,aa)第3章氨基酸——蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子ProteinArchitecture一、氨基酸（一）蛋白質(zhì)水解蛋白質(zhì)和多肽的肽鍵可被催化水解酸/堿能將蛋白完全水解

酶水解一般是部分水解得到各種AA的混合物得到多肽片段和AA的混合物氨基酸是蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單元蛋白質(zhì)——月示——胨——多肽——肽——AA1*1045*1032*1031000200100-500什么是氨基酸？----C-C-C-C-COOHγβα----C-C-C-C(NH2)-COOHα-氨基酸----C-C-C(NH2)-C-COOHβ-氨基酸----C-C(NH2)-C-C-COOHγ-氨基酸什么是α-氨基酸？二、氨基酸的分類（一）常見的蛋白質(zhì)氨基酸按Ｒ基的化學結(jié)構(gòu)分類：１、脂肪族aa（１）中性aa（2）含羥基或硫aa（３）酸性aa及其酰胺（４）堿性aa２、芳香族aa按Ｒ基的極性性質(zhì)分類：１、非極性Ｒ基aa２、不帶電荷的極性Ｒ基aa3、帶正電荷的Ｒ基aa（二）不常見的蛋白質(zhì)氨基酸由常見aa經(jīng)修飾而來。鳥氨酸瓜氨酸三、氨基酸的酸堿性質(zhì)（一）兼性離子（三）氨基酸的等電點當溶液為某一pH值時，AA主要以兼性離子的形式存在，分子中所含的正負電荷數(shù)目相等，凈電荷為0。這一pH值即為AA的等電點（pI）。在pI時，AA在電場中既不向正極也不向負極移動，即處于兩性離子狀態(tài)。Ka1*Ka2=……側(cè)鏈不含離解基團的中性AApI=(pK’1+pK’2)/2甘氨酸滴定曲線對于側(cè)鏈含有可解離基團的AApI取決于兩性離子兩邊pK’值的算術(shù)平均值酸性AA：pI=(pK’1+pK’R-COO-

)/2堿性AA：pI=(pK’2+pK’R-NH2)/2四、氨基酸的化學反應（一）α-氨基參加的反應1.與亞硝酸反應2.與?；噭┓磻?.烴基化反應4.形成Schiff’s堿反應5.脫氨基反應

NH2OHRCHCOOH+HNO2RCHCOOH+H2O+N2VanSlyke

法測氨基氮（體積）的基礎。N2中的1/2為氨基氮。

氨基酸定量和蛋白質(zhì)水解程度的測定。NO2FO2N+H2N—CH—COOHRNO2O2NHN—CH—COOHR+HF弱堿性DNP-氨基酸（黃色）DNFBSanger法測定N末端氨基酸基礎—N=C=S+N—CH—COOHHHRPITC—N—C—N—CH—COOHHHRSPTC-氨基酸—N—CHRSNCCOPTH-氨基酸pH8.3無水HF苯異硫氰酸酯PITC苯氨基硫甲酰衍生物苯乙內(nèi)硫脲衍生物Edman降解法基礎

R’COOHR’COOC=O+H2NCHC=NCHHRHR醛氨基酸Schiff’s堿-H20+H20在生物體內(nèi)經(jīng)AA氧化酶催化即脫去α-氨基而轉(zhuǎn)變?yōu)橥?。（二）?羧基參加的反應1.成鹽或成酯反應2.成酰氯反應3.脫羧基反應4.疊氮反應（2）成酯

NH2

干燥，HCl

RCHCOOH+C2H5OH

回流

RCHCOOC2H5+H2ONH3·Cl

保護羧基（1）與NaOH等形成鹽

HN-保護基R—CH-COOH+PCl5

HN-保護基R—CH-COOCl+POCl3+HCl保護氨基活化羧基

NH2脫羧酶R—CH-COOHR-CH2-NH2+CO2

YNHONH2NH2

R—CH—C—OCH3

YNHOHNO2

R—CH—C—NHNH2

YNHO

R—CH—C—N-—N+N+2H2O

?；被峒柞ル迈；被ｋ迈；被／B氮肽的人工合成（三）α-羧基和α-氨基都參加的反應1、與茚三酮反應

2、成肽反應弱酸加熱（四）側(cè)鏈R基參加的反應1、Tyr2、堿性AA2、堿性AA3、帶硫AATyr酚基在3和5位上易發(fā)生親電取代反應，如碘化和硝化黃色反應Pauly反應His側(cè)鏈咪唑基與重氮苯磺酸生成棕紅色化合物Pauly反應Arg側(cè)鏈胍基與環(huán)己二酮生成縮合物Trp側(cè)鏈吲哚基能被N-溴代琥珀酰亞胺氧化——分光光度法測定Trp含量Cys中的二硫鍵可被氧化劑（過甲酸）以及還原劑（巰基化合物）打開?；腔彼嵛濉A的光學活性和光譜性質(zhì)（一）AA的光學活性和立體化學（二）氨基酸的光譜性質(zhì)可見光區(qū)：無吸收遠紫外和紅外區(qū)：都吸收近紫外區(qū)（200—400nm）：Tyr/Trp/Phe原因：-C=C-C=C-C=C-C=C-1、紫外吸收光譜Trp280nmTyr275nmPhe257nm蛋白質(zhì)含量測定280nm２、核磁共振波譜六、氨基酸混合物的分析分離——利用AA成分分配系數(shù)的差異（一）分配層析法的一般原理{層析系統(tǒng)固定相{流動相附著在固相上的液體固體

按兩相所處狀態(tài)分：

按操作形式分：