免疫球蛋白基因組

免疫球蛋白基因組第一頁，共十九頁，2022年，8月28日ImmunoglobulinStructuresHeavychainandlightchain(λandκ)ConstantregionClass:IgA,IgD,IgE,IgGandIgMVariableregion–Antigenbindingsite第二頁，共十九頁，2022年，8月28日GenerationofdiversitiesAIDN-Regions第三頁，共十九頁，2022年，8月28日Part1Immunoglobulingermlinegenerepertoirestudy第四頁，共十九頁，2022年，8月28日IGHVgenerepertoireHighlypolymorphic226reportedgenesandallelicvariants104wasreportedinerror12putativenewpolymorphisms,3havebeensequencedConclusion:TheexistingIGHVgenerepertoireisfullofincorrectlyreportedsequences.第五頁，共十九頁，2022年，8月28日IGKVgenerepertoireanalysisCompilationofDatabase1863rearrangedIGKVsequencesfromtheEMBL66germlinegenesfromtheIMGTAlignmentsusingSmith-Watermanalgorithm.UnreportedIGKVallelesIGKValleleswithlownumberofunmutatedsequenceswerecollectedMultiplealignmentSharedmismatchesSequencingfromgenomicDNA第六頁，共十九頁，2022年，8月28日J(rèn)unctionanalysisofIGKgenes435lowmutationsequences(<3IGKVmutations)wererealignedtodetermineIGKJgenesusingV-QUESTVJgeneuseageN-Region第七頁，共十九頁，2022年，8月28日第八頁，共十九頁，2022年，8月28日Results5reportedgenesmaybetheresultofsequencingerrorsIGKV1D-13*01andIGKV1-37*01maybefunctionalinsomeindividualsUnreportedpolymorphisms:IGKV1-16*02andIGKV2-30*02.TheexistingIGKVrepertoireisrelativelycompleteandaccurate第九頁，共十九頁，2022年，8月28日第十頁，共十九頁，2022年，8月28日ConclusionsNotonlyistherelittlediversityinthegermlinegenesofthekappalocus,butlittlejunctionaldiversityisgeneratedduringtheprocessofgenerearrangement.Theimmunoglobulingenerepertoirecanthereforebecharacterisedashavingextraordinarydiversityintheheavychain,andlimiteddiversityinthelightchain.第十一頁，共十九頁，2022年，8月28日Part2Sequencingimmunoglobulingenesfromallergicandparasitisedindividuals第十二頁，共十九頁，2022年，8月28日IgEandAllergyNaturalfunctionofIgE–ParasiteinfectionsIgEandAllergicdiseaseAntigenselectioninIgETherelationshipbetweenIgEandIgG4第十三頁，共十九頁，2022年，8月28日UnderstandingIgEmutationsinPNGPNGIgEvsPNGIgGOtherFactorsExposuretopathogensAge第十四頁，共十九頁，2022年，8月28日TwoQuestionsIsthereahigherlevelofmutationinantibodiesofPNGvillagers,comparedtoAustraliaurbanindividuals?Arehighernumbersofmutationsseeninolderindividuals?第十五頁，共十九頁，2022年，8月28日第十六頁，共十九頁，2022年，8月28日SampleNameIgEIgGNo.ofIgAverageMutationNo.No.ofIgAverageMutationNo.Australia1812.85217.6A000001019.5A0021102418.8A006910.61815.1A007815.600PNG2017.76619.8P002(Old)423620.3P008(Old)1417.11423.1P011(young)211.54618.8第十七頁，共十九頁，2022年，8月28日AcknowledgementsAndrewCollinsWilliamSewellKatherineJacksonVivekaSingh