Reflex模塊的應(yīng)用XRD精修

Reflex模塊的應(yīng)用XRD精修演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有92頁\編輯于星期一a.輸入結(jié)構(gòu)，產(chǎn)生衍射圖譜現(xiàn)在是2頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是3頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是4頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是5頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是6頁\一共有92頁\編輯于星期一操作：對(duì)比上述不同設(shè)置對(duì)衍射圖的影響。熟悉圖形的放大，移動(dòng)，還原操作鼠標(biāo)左鍵現(xiàn)在是7頁\一共有92頁\編輯于星期一輸入實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)：ImportExamples/Reflex/ExperimentalData/MaterialsStudio不能識(shí)別中文目錄和文件現(xiàn)在是8頁\一共有92頁\編輯于星期一注意自己的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)格式必須是Reflex能識(shí)別的格式，可以按照樣式來修改.3cam格式1-methylfluoreneCuKalpha8.000054.98000.0200544.000552.000545.000541.000539.000579.000562.000說明行角度范圍和步長(zhǎng)強(qiáng)度現(xiàn)在是9頁\一共有92頁\編輯于星期一實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與模擬數(shù)據(jù)的比較：現(xiàn)在是10頁\一共有92頁\編輯于星期一刪除曲線現(xiàn)在是11頁\一共有92頁\編輯于星期一影響峰位和峰型的各種因素原子對(duì)x射線吸收矯正：比如用Mo靶時(shí)Cr的吸收.極化矯正現(xiàn)在是12頁\一共有92頁\編輯于星期一Lineshiftcorrection:CustomBragg-BrentanoDebye-Scherrer現(xiàn)在是13頁\一共有92頁\編輯于星期一峰型（展寬）=儀器展寬+樣品展寬GaussianLorentzMod.Lorentz#1Mod.Lorentz#2Pseudo-VoigtPearsonVIIThompson-Cox-HastingsDavidVoigtApprox.Tomandlpseudo-Voigt現(xiàn)在是14頁\一共有92頁\編輯于星期一各種峰型的可變參數(shù)列表現(xiàn)在是15頁\一共有92頁\編輯于星期一Stressd值變化Crystallintesize倒點(diǎn)陣陣點(diǎn)大小的變化現(xiàn)在是16頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是17頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是18頁\一共有92頁\編輯于星期一只考慮儀器展寬現(xiàn)在是19頁\一共有92頁\編輯于星期一參數(shù)具有隨意性現(xiàn)在是20頁\一共有92頁\編輯于星期一參數(shù)具有確定性現(xiàn)在是21頁\一共有92頁\編輯于星期一參數(shù)具有確定性現(xiàn)在是22頁\一共有92頁\編輯于星期一參數(shù)具有隨意性現(xiàn)在是23頁\一共有92頁\編輯于星期一操作：對(duì)比不同的峰型現(xiàn)在是24頁\一共有92頁\編輯于星期一樣品對(duì)峰型的影響現(xiàn)在是25頁\一共有92頁\編輯于星期一各衍射峰的相對(duì)峰強(qiáng)度現(xiàn)在是26頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是27頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是28頁\一共有92頁\編輯于星期一Finger,Cox,andJephcoatcorrectionh=H/Lands=S/Laretherefinableparametersdependontheratiosofthesampleanddetectorheights,2Sand2H,andthedistancebetweenthesampleandthedetector,L.可以用Origin畫出各種矯正圖形，以增加理解現(xiàn)在是29頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是30頁\一共有92頁\編輯于星期一溫度的影響現(xiàn)在是31頁\一共有92頁\編輯于星期一實(shí)時(shí)查看結(jié)構(gòu)變化對(duì)衍射的影響打開fin31.xsd產(chǎn)生衍射，并選上monitordiffractionwindowcloseall現(xiàn)在是32頁\一共有92頁\編輯于星期一選取某個(gè)原子，Alt+Shift+右鍵進(jìn)行移動(dòng)，觀察衍射圖變化。也可右鍵選取fragment，同樣進(jìn)行操作，觀察衍射峰與結(jié)構(gòu)的關(guān)系?，F(xiàn)在是33頁\一共有92頁\編輯于星期一輸入另一種材料比如indigo_a，可以切換材料進(jìn)行衍射圖的切換現(xiàn)在是34頁\一共有92頁\編輯于星期一操作：熟悉各種參數(shù)對(duì)峰型，強(qiáng)度等的影響?，F(xiàn)在是35頁\一共有92頁\編輯于星期一實(shí)驗(yàn)曲線的處理：現(xiàn)在是36頁\一共有92頁\編輯于星期一解析重疊峰通常取半高寬/2數(shù)據(jù)點(diǎn)很稀疏時(shí)需要現(xiàn)在是37頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是38頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是39頁\一共有92頁\編輯于星期一輸入Examples\Reflex\ExperimentalData\Philips\Mixture.rd輸入Examples\Reflex\ExperimentalData\fin31.xcd練習(xí)操作，并比較各種參數(shù)設(shè)置對(duì)處理后的衍射譜的影響現(xiàn)在是40頁\一共有92頁\編輯于星期一c、XRD圖的指標(biāo)化(indexing)現(xiàn)在是41頁\一共有92頁\編輯于星期一確定真實(shí)峰位Simple:某一點(diǎn)的強(qiáng)度與近鄰強(qiáng)度的對(duì)比。SG:某一點(diǎn)的強(qiáng)度與近鄰強(qiáng)度的對(duì)比，并且該點(diǎn)處的二次微分為負(fù)值現(xiàn)在是42頁\一共有92頁\編輯于星期一可手動(dòng)刪除某些峰標(biāo)示現(xiàn)在是43頁\一共有92頁\編輯于星期一確定材料所屬的晶系現(xiàn)在是44頁\一共有92頁\編輯于星期一FOM越大表示越符合，但是只是個(gè)相對(duì)數(shù)值，沒有絕對(duì)意義?，F(xiàn)在是45頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是46頁\一共有92頁\編輯于星期一輸入一張XRD圖譜，練習(xí)操作現(xiàn)在是47頁\一共有92頁\編輯于星期一XRD圖的指標(biāo)化(續(xù))Fin31現(xiàn)在是48頁\一共有92頁\編輯于星期一輸入fin31的衍射數(shù)據(jù)并扣除背底噪音現(xiàn)在是49頁\一共有92頁\編輯于星期一建立空表格以手動(dòng)輸入峰位現(xiàn)在是50頁\一共有92頁\編輯于星期一手動(dòng)輸入峰位右鍵拷貝黏貼到譜上16.8221.8422.8925.8128.0829.0431.8632.2033.0434.0835.5839.2639.9842.1643.8446.8248.2249.52現(xiàn)在是51頁\一共有92頁\編輯于星期一放大操作：R+鼠標(biāo)左鍵選擇放大區(qū)域練習(xí)操作并輸入數(shù)據(jù)現(xiàn)在是52頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是53頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是54頁\一共有92頁\編輯于星期一導(dǎo)入fin31的結(jié)構(gòu)，并與index得到的結(jié)構(gòu)對(duì)比現(xiàn)在是55頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是56頁\一共有92頁\編輯于星期一用X-Cell來進(jìn)行指標(biāo)化X-Cellusesanextinction-specificdichotomyproceduretoperformanexhaustivesearchofparameterspace,toestablishacompletelistofallpossibleindexingsolutions.UnlikeDICVOL91,X-Cellallowsforacertainnumberofimpuritypeaksamongtheexperimentallyobservedreflections.Thezeropointshiftofthediffractionpatternisdeterminedaspartofthesearchprocedure.Systematicabsencesareexplicitlytakenintoaccountandparameterspaceissearchedinsuchawaythatthenumberofobserveddiffractionpeakswithintheangularrangebeingconsideredisgraduallyincreased.Thisapproachguaranteesthatthecorrectsolutionisfoundquicklyifahighqualitypowderdiffractionpatternisavailable.Regardlessofwhetherornotapromisingunitcellhasalreadybeenfound,thealgorithmcontinuestosearchlargerandlargerportionsofparameterspaceuntilthesearchiscompleteoruntilitisinterruptedbytheuser.Demandingproblemscanbesolvedbyrunningthealgorithmforanextendedperiodoftimeonafastserver.X-CellhasasignificantlyhighersuccessratethanDICVOL91,TREOR90andITO15combined.現(xiàn)在是57頁\一共有92頁\編輯于星期一選擇用于指標(biāo)化的衍射峰：盡量低角度衍射峰：峰強(qiáng)，重疊少避免用可疑峰（雜峰會(huì)大大提高運(yùn)算量），弱峰原則上選取20-25個(gè)衍射峰即可輸入NPHU的衍射扣除背底（it=300）放大8.2o處的峰，估計(jì)半高全寬FWHM~0.2o平滑現(xiàn)在是58頁\一共有92頁\編輯于星期一X-Cell指標(biāo)化Maximumnumberofcalculatedpeaks=Numberofobservedpeaks/detectionlevel.現(xiàn)在是59頁\一共有92頁\編輯于星期一0Noimpuritypeaksallowed.11impuritypeak/thefirst20,2impuritypeaks/thefirst40,3impuritypeaks/thefirst60,etc.22impuritypeaksamongthefirst10,3impuritypeaksamongthefirst20,4impuritypeaksamongthefirst30,etc.32impuritypeaksamongthefirst5,3impuritypeaksamongthefirst10,4impuritypeaksamongthefirst15,etc.42impuritypeaksamongthefirst3.5,3impuritypeaksamongthefirst7,4impuritypeaksamongthefirst10.5,etc.52impuritypeaksamongthefirst2,3impuritypeaksamongthefirst4,4impuritypeaksamongthefirst6,etc.6LikeLevel4,but2additionalimpuritypeaksallowedatlow2-theta7LikeLevel5,but4additionalimpuritypeaksallowedatlow2-theta現(xiàn)在是60頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是61頁\一共有92頁\編輯于星期一CreateCell然后重命名現(xiàn)在是62頁\一共有92頁\編輯于星期一通過Refine對(duì)比結(jié)果：現(xiàn)在是63頁\一共有92頁\編輯于星期一針對(duì)儀器相關(guān)的精修現(xiàn)在是64頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是65頁\一共有92頁\編輯于星期一選上零點(diǎn)優(yōu)化現(xiàn)在是66頁\一共有92頁\編輯于星期一對(duì)C2重做優(yōu)化練習(xí)指標(biāo)化及精修過程現(xiàn)在是67頁\一共有92頁\編輯于星期一D.-Y.Lu,M.Sugano,W.-H.Su,andT.Koda,X-raydiffractionstructuralcharacterizationofBa1-xEuxTiO3ternaryoxides,Crys.Res.Technol.,2005,40,No.7,703-708.應(yīng)用舉例：現(xiàn)在是68頁\一共有92頁\編輯于星期一無機(jī)物的精修輸入ak100的結(jié)構(gòu)和衍射圖ReflexpowderrefineSetupNumberofcycles=2ReflextypeRietveld現(xiàn)在是69頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是70頁\一共有92頁\編輯于星期一練習(xí)精修操作，改變精修方案重復(fù)精修現(xiàn)在是71頁\一共有92頁\編輯于星期一Rietveld精修中的結(jié)構(gòu)自由度可以刪除所定義的group現(xiàn)在是72頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是73頁\一共有92頁\編輯于星期一Tipsforsuccessfulrefinement經(jīng)常保存你用于精修的參數(shù)。如果精修結(jié)果很差，請(qǐng)確認(rèn)選擇了正確的衍射波長(zhǎng)和精修數(shù)據(jù)（Exp.Data）.不同的參數(shù)組合有可能得到近似的精修結(jié)果。特別是有關(guān)峰型和峰寬的參數(shù)。因此結(jié)果不具有唯一性。改變精修的初始參數(shù)，有可能得到更低的Rwp.Rwp

的值不具有絕對(duì)意義.如果只需確定晶格常數(shù)(lattice)和峰型(profile)，Pawley精修相對(duì)簡(jiǎn)單.通常情況下，背底的精修可以用缺省值.一般的，建議同時(shí)精修峰型(profile)和晶格常數(shù)(lattice)，有時(shí)候精修晶格常數(shù)前須精修lineshift。

晶格常數(shù)和lineshiftcorrections對(duì)峰位置的影響方式類似，所以不建議同時(shí)精修兩者。

現(xiàn)在是74頁\一共有92頁\編輯于星期一如果起始嘗試的晶格產(chǎn)生的衍射與實(shí)驗(yàn)圖相差很遠(yuǎn)，則晶格常數(shù)或零點(diǎn)需要比較大的改動(dòng)，但這只是在模擬峰型與實(shí)驗(yàn)峰型相近的時(shí)候可行。如果上述方法精修失敗，可以考慮增加W，直到峰型相近，然后再選擇U,V,W進(jìn)行精修。如果實(shí)驗(yàn)圖的峰非常銳（比如同步輻射上得到的衍射譜），減小峰寬參數(shù)的初始值是比較有效的方法，前提是晶格常數(shù)已經(jīng)知道得比較準(zhǔn)確。

樣品展寬（尺寸和應(yīng)變）和儀器展寬對(duì)峰寬的影響相似，所以不建議同時(shí)精修兩者，否則結(jié)果會(huì)難預(yù)料。

要避免儀器展寬的影響，可以設(shè)U=V=0,W很小（比如10-6）。如果精修過程中參數(shù)沒什么變化，可以嘗試改變初始值再作精修，如果回到原來的值，就可以認(rèn)為是比較合適的參數(shù)。

操作：任選一張衍射圖，進(jìn)行指標(biāo)化，并精修現(xiàn)在是75頁\一共有92頁\編輯于星期一確定結(jié)晶性不同的晶相混合，晶體+非晶,混合晶相+非晶比例？衍射譜的來源：晶體,非晶,背底噪音精確的相分析需要預(yù)先知道各純相的衍射兩種方法：背底扣除方法相分析方法現(xiàn)在是76頁\一共有92頁\編輯于星期一輸入所有的lactose保存項(xiàng)目，關(guān)閉所有窗口現(xiàn)在是77頁\一共有92頁\編輯于星期一背底扣除方法現(xiàn)在是78頁\一共有92頁\編輯于星期一20%？？背底校正現(xiàn)在是79頁\一共有92頁\編輯于星期一現(xiàn)在是80頁\一共有92頁\編輯于星期一相分析方法現(xiàn)在是81頁\一共有92頁\編輯于星期一選擇某一組分，進(jìn)行操作，放大譜圖，對(duì)比不同方法的差別現(xiàn)在是82頁\一共有92頁\編輯于星期一定量相分析(QPA):建立空文件夾，重命名為QPA，輸入混合物衍射譜和Acetohexamide_FormA、Acetohexamide_FormB、A