呼吸道感染的病原學診斷新技術(shù) 中日友好醫(yī)院

山東淄博呼吸道感染的病原學診斷新技術(shù)中日友好醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學科二部臨床微生物與感染實驗室魯炳懷2019-06-222臨床微生物學方法35一、隱球菌診斷n墨汁染色n隱球菌莢膜多糧抗原實驗n呼吸道樣本真菌培養(yǎng)n肺組織穿刺的真菌瓶培養(yǎng)6隱球菌莢膜多糖抗原（乳膠凝集試驗/膠體金）u

樣本包括血清、腦脊液、尿液、Balfu

抗原滴度會隨著時間下降，但是過慢，不能判斷療效u

特異性＞90%7二、真菌感染診斷8表7除血液外用于GM的樣本人群目的干預(yù)SoRQoE評價參考文獻BAL中檢測GM可作為輔助診斷的優(yōu)秀項目。

[86,88,411-所有人群為診斷肺侵襲性曲霉菌病用BAL進行GM試驗AII理想的陽性界值為0.5-1.0。414]所有人群所有人群為診斷腦侵襲性曲霉菌病用腦脊液進行GM試驗

BIIII尚無經(jīng)驗證的界值[415,416]用0.5作為界值時敏感性可達90%，特異性可達

；樣本需要切成薄片，目的在于可

[61,417]95%得到足夠的材料；在等滲鹽水中稀釋。用肺活檢組織進行GM為檢測組織中的半乳甘露聚糖B試驗縮略詞：BAL，支氣管肺泡灌洗液；GM，半乳甘露聚糖；IA,

侵襲性曲霉菌病；QoE，證據(jù)質(zhì)量；SoR，推薦強度?

血GM正文：l

敏感性大于培養(yǎng)；l

連續(xù)粒缺，建議系列篩選監(jiān)測（serialscreeningfor

serumGM）l

對癌癥，治療2周GM下降，是良好治療反應(yīng)的可信預(yù)測9種屬G試驗GM試驗?zāi)钪榫鷮夔牭毒鷮貾CP＋＋＋－±－隱球菌屬曲霉菌屬－＋-（偶有+）＋青霉屬、紅色毛癬菌、支孢霉屬和地絲菌屬＋－±－接合菌綱G

+

GM試驗利于早期診斷侵襲性真菌感染！10From:Boehme,et.al.

NEJM363:1005.Sept.9,2010配合培養(yǎng)和涂片使用效果最佳.Smearmicroscopy4098100%SmearpositiveSmearnegative4014842.05%97.95%culturepositive1684.19%culturepositiveculturenegativeculturenegative38466476.19%2023.81%95.81%Smear+-168total232culture+-6420843846401438664098totalsensitivityspecificityPPVNPVLR+LR-kappa27.59%99.48%76.19%

95.81%53.060.73

0.3871516MALDI-TOF質(zhì)譜快速鑒定樣品制備質(zhì)譜測量待測菌商業(yè)化分子診斷平臺:

>200項檢測Biofire/bioMérieux

filmarrayCepheid

GeneXpertBDMAXAlere

ibioMérieux

NucliSensEasyQNanosphere

VerigeneRoche

LightCycler20Viral

pneumonia21中日醫(yī)院的評估數(shù)據(jù)Table3XpertXpressFlu/RSVperformanceversusCFDA-approvedRT-PCRmethodaNo.ofresultsbyAccuracy(%[95%CI])typeaSensitivityPPAb

(%[95%Speci?cityNPAc

(%[95%AssayXpertTarget

TP

FPFluA147

7FluBTNFN

?CI])?CI])?100.0504

0(97.5~100)100.0(97.2~100)98.6(97.2~99.4)

98.9(98.1~99.7)99.2(98.1~99.8)

99.4(98.8~100)130

4RSV524

0635

219290.5(69.6~98.8)

99.7(98.9~100)99.4(98.8~100)FluACFDA-PCR

FluBRSV132

13124

2498

15526

6636

389.8(83.7~94.2)

97.5(95.7~98.6)

95.7(94.2~97.3)95.3(90.1~98.3)

99.3(98.1~99.8)

98.8(97.9~99.6)?85.7(63.7~97.0)

?99.8(99.1~100)

?99.4(98.8~100)?181aTP,truepositive;FP,falsepositive;TN,truenegative;FN,falsenegative;bPPA,positivepercentagreement;PPA=TP/(TP+FN);cNPA,negativepercentagreement;NPA=TN/(TN+FP)Zou

XH,

et

al.

IJID膠體金法不能作為流感陰性確診標準n

膠體金法的準確性一般在70%左右，在病毒載量較低時無法檢測到目標病毒，不能作為病毒陰性的診斷標準。Aron

C.

et

al.

J

Clin

Virol.

2007;39(132)Baas

C,

et

al.

Euro

Surveill.

2013;18(21)分子診斷是流感病毒診斷的標準n

分子診斷是指應(yīng)用分子生物學方法檢測流感病毒基因組（RNA）或表達水平（mRNA）的變化而做出診斷的技術(shù)。?

特異性高：檢測目標是核酸/基因，具有遺傳穩(wěn)定性。?

靈敏度高：檢測下限可達單拷貝水平。?

適用范圍廣：適用于各種類型的樣本。?

操作簡單：容易標準化，自動化。n

分子診斷是當前流感臨床診斷技術(shù)常用技術(shù)，是病原診斷技術(shù)的發(fā)展方向。24流感即時分子技術(shù)診斷技術(shù)n

同時報告甲流，乙流，或者還包括其他呼吸道病毒。n

高度敏感性及特異性n

隨來隨做，20分鐘報告陽性結(jié)果，30分鐘報告陰性結(jié)果n

采用無創(chuàng)的咽拭子檢測，可用于床旁檢測。n

樣本使用量少，僅需要300ul樣本。NextGenerationSequencingTimeline

of

sequencing

technology26l

NGS

in

clinical

microbiologyl

Outbreak

managementl

Molecular

case

findingl

Targeted

NGS

of

the

16S-23S

rRNA

cluster

regionfor

rapid

bacterial

identification

in

clinical

specimenl

WGS

and

taxonomyl

Metagenomics

in

clinical

microbiologyl…..27R.H.Deurenbergetal./JournalofBiotechnology243(2017)16–24Case

Chlamydia

psittaci10.91：6410.221：10241：12810.241：10241：256IgGIgMNegative中日友好醫(yī)院準確、快速、全面的病原學診斷平臺肺部感染標本快速診斷方法傳統(tǒng)的病原體檢測方法各種呼吸道病原體抗原的快速檢測血清學診斷方法培養(yǎng)涂片形態(tài)學檢測感染的生物標志物：G、GM、PCT、T-SPOT等分子診斷方法普

分真

通

枝菌

細

桿菌

菌厭氧菌熒光定量非常規(guī)檢基因芯片法LAMPPCRPCR測方法結(jié)病結(jié)數(shù)核未種及

原核種十病原體基分種耐非非知病原體深度測序療

體效

絕監(jiān)

對測

定鑒

分定

枝呼種枝常藥結(jié)典建立多方法的檢測平125項檢測吸呼桿見基核型桿臺，開展道定吸菌耐因分病菌常道鑒項目，覆蓋細菌、病毒、非典型病原體、寄生蟲全面的、準確、快速的病原學檢測藥檢枝原量

因測見病定基測桿體細毒及個因菌菌及序鑒中日友好醫(yī)院2019年1~4月少見菌培養(yǎng)結(jié)果統(tǒng)計?菌種流感嗜血桿菌肺炎鏈球菌1月11141312月63月1374月12125總計42412241238卡他莫拉菌225沙門菌0126志賀菌000007新型隱球菌010018淋病奈瑟菌