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動(dòng)物生物技術(shù)蛋白質(zhì)組學(xué)簡介目錄蛋白質(zhì)組研究的含義;蛋白質(zhì)組學(xué)研究的內(nèi)容;蛋白質(zhì)組學(xué)研究工具;蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用范圍及前景蛋白質(zhì)組學(xué)簡介中心法則示意圖一、蛋白質(zhì)組研究的開端開端:
1.人類基因組序列草圖的完成,宣告了“后基因組時(shí)代”的到來。2.人類基因組的所有基因及間隔序列已完全確定?3.基因組計(jì)劃不能確定哪些基因在何時(shí)、何地、以何種程度表達(dá);4.生物的基因組只表達(dá)部分基因(30~80%);5.蛋白質(zhì)是基因功能的執(zhí)行體;6.以往的蛋白質(zhì)研究難以系統(tǒng)透徹地闡釋生命活動(dòng)的基本機(jī)制;因此,無論是從基因組計(jì)劃的局限、還是蛋白質(zhì)研究的自身發(fā)展而言,大規(guī)模、全方位的蛋白質(zhì)研究均是勢在必行。蛋白質(zhì)組:
一種細(xì)胞/組織/生物體某個(gè)時(shí)間段所包含的所有蛋白質(zhì)的存在形式及其活動(dòng)方式。二、蛋白質(zhì)組及蛋白質(zhì)組學(xué)的含義蛋白質(zhì)組學(xué):
研究蛋白質(zhì)組的科學(xué),闡明生物體全部蛋白質(zhì)的表達(dá)模式及功能模式。研究內(nèi)容01結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)三、蛋白質(zhì)組學(xué)研究的內(nèi)容
主要研究蛋白質(zhì)的氨基酸序列、三維結(jié)構(gòu)的解析、種類分析、數(shù)量確定等。02功能蛋白質(zhì)組學(xué)
研究蛋白質(zhì)的功能,確定蛋白質(zhì)在亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中的定位,蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用等。四、蛋白質(zhì)組學(xué)的工具工具:
1.數(shù)據(jù)庫:蛋白質(zhì)、EST(expressedsequencetags)、和基因組序列數(shù)據(jù)庫2.質(zhì)譜(MS):質(zhì)譜數(shù)據(jù)為蛋白質(zhì)鑒定提供了最有力和最精確的方法。3.對數(shù)據(jù)庫中特定蛋白質(zhì)序列與質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行比對的各種軟件。4.蛋白質(zhì)的分析分離技術(shù),聚丙烯酰胺凝膠電泳(2D-SDS)是最廣泛用于蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)。
EST(ExpressedSequenceTag)表達(dá)序列標(biāo)簽,表達(dá)序列標(biāo)簽是cDNA克隆的末端序列,平均長度為300~500bp,稱為表達(dá)序列標(biāo)簽,通常是從已有的cDNA文庫中隨機(jī)取出幾百到幾千個(gè)克隆一次測序產(chǎn)生,一般使用載體多克隆位點(diǎn)互補(bǔ)序列作為通用引物。一個(gè)EST代表生物體某種組織在某一時(shí)期的一個(gè)表達(dá)基因。采用生物信息學(xué)方法延伸表達(dá)序列標(biāo)簽(ESTs)序列,獲得基因部分乃至全長序列,將為基因克隆和表達(dá)分析提供空前的動(dòng)力,并為生物信息學(xué)功能的充分發(fā)揮提供廣闊的空間。蛋白質(zhì)組學(xué)簡介02應(yīng)用范圍:五、蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用范圍及前景
1.蛋白質(zhì)表達(dá)譜:蛋白質(zhì)組圖、蛋白質(zhì)組成成分鑒定、新型蛋白質(zhì)發(fā)掘、蛋白質(zhì)差異顯示。2.蛋白質(zhì)修飾譜:許多蛋白質(zhì)翻譯后的修飾控制著蛋白質(zhì)的靶向、結(jié)構(gòu)、功能和轉(zhuǎn)換。3.蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)譜:
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