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第四章DNA重組和基因轉(zhuǎn)移第一節(jié)目的基因與載體的連接一粘末端DNA片段的連接(一)具有相同粘末端的DNA分子之間的連接
使用堿性磷酸酶處理載體DNA,去掉其5’末端的磷酸基,以防質(zhì)粒DNA的自身環(huán)化。(二)具有不同粘性末端的DNA分子之間的連接
用兩種不同的限制性內(nèi)切酶對(duì)載體和外源DNA進(jìn)行切割后,在它們兩端會(huì)產(chǎn)生非互補(bǔ)的突出端,經(jīng)DNA連接酶連接后即產(chǎn)生定向重組體。
HindIIIEcoRIHindIIIEcoRI對(duì)載體酶切HindIIIEcoRI對(duì)基因酶切質(zhì)粒載體的定向重組二平末端DNA片段的連接1直接用T4連接酶連接2同聚物加尾法3銜接物連接法銜接物是指用化學(xué)方法合成的一段由10~12個(gè)核苷酸組成,具有一個(gè)或數(shù)個(gè)限制酶識(shí)別位點(diǎn)的平末端的雙鏈寡核苷酸片段。所謂載體與DNA片段酶切位點(diǎn)不匹配,指載體與待克隆的DNA片段上的酶切位點(diǎn)不相同,因而用一種或兩種酶切制造不出可互補(bǔ)的粘性末端。
1按照平末端連接方法加上接頭2將凹端變?yōu)槠蕉耍?)使用Klenow酶在4種dNTP存在下,將3′凹端完全補(bǔ)平。(2)用S1核酸酶去除3′突出末端產(chǎn)生平端DNA分子
三載體與DNA片段酶切位點(diǎn)不匹配的連接3使用大腸桿菌DNA聚合酶IKlenow片段部分補(bǔ)平3′凹端轉(zhuǎn)變成粘端。載體經(jīng)XhoI酶切形成:外源基因用San3A酶切形成:用Klenow酶部分補(bǔ)平二者的3′凹端,形成:TCGAAGCTGATCCTAGCTTCAGGA這樣,就可以實(shí)現(xiàn)有效重組。TCGAAGCT3′3′5′5′GATCCTAG3′3′5′5′四cDNA與載體的連接通過依次加入、連接合成的DNA接頭進(jìn)行cDNA克隆第二節(jié)重組DNA分子的篩選與鑒定外源基因與載體連接后轉(zhuǎn)化大腸桿菌可能的三種情況:(2)(3)(1)轉(zhuǎn)化E.coli一遺傳檢測(cè)法(一)根據(jù)載體表型特征選擇重組體分子1抗藥性標(biāo)記插入失活篩選法例:pBR322如果外源基因插入到tetr基因內(nèi)部,tetr抗性消失,表型為不抗四環(huán)素(tets)、而仍抗氨芐青霉素(ampr),這樣的轉(zhuǎn)化細(xì)胞在含有
amp的培養(yǎng)基仍可生長(zhǎng),但在含有四環(huán)素的培養(yǎng)基上不能再生長(zhǎng);反之,如果ampr基因由于外源基因插入其內(nèi)部而失活,帶有重組DNA分子的轉(zhuǎn)化細(xì)胞在含有tet的培養(yǎng)基平板上生長(zhǎng),在含有
amp的培養(yǎng)基不能生長(zhǎng)。
例:pUC質(zhì)粒在LacZ—的大腸桿菌中,在平板培養(yǎng)中,菌落是白色的。若在該細(xì)胞中引入pUC質(zhì)粒,其上有LacZ′,質(zhì)粒和大腸桿菌DNA可實(shí)現(xiàn)α—互補(bǔ),菌落呈藍(lán)色。如果在質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)的某個(gè)酶切點(diǎn)上克隆了外源基因,則LacZ′基因受到破壞,便不能再和缺陷型受體菌中生成有活性的β-半乳糖苷酶,因此,菌落呈白色。
(二)根據(jù)插入序列的表型特征選擇重組體
進(jìn)入受體細(xì)胞的重組DNA分子中的外源基因如果在宿主細(xì)胞中能實(shí)現(xiàn)功能表達(dá),產(chǎn)生出有功能活性的基因產(chǎn)物,那么鑒定此種重組體最簡(jiǎn)便的方法就是表型特征的直接選擇法。
2α—互補(bǔ)二物理檢測(cè)法凝膠電泳檢測(cè)法三核酸雜交檢測(cè)法
例:原位雜交篩選重組體菌落(或噬菌斑)四免疫化學(xué)檢測(cè)法
免疫化學(xué)檢測(cè)法是利用抗體與抗原結(jié)合的高度特異性來鑒別基因的。如果某個(gè)重組克隆中的外源基因能夠表達(dá),在這個(gè)克隆中就存在著這個(gè)基因的特定蛋白,即可用特異性抗體來檢測(cè)。常用的有標(biāo)記抗體測(cè)定法和免疫沉淀測(cè)定法兩種。標(biāo)記抗體測(cè)定法的步驟:轉(zhuǎn)化菌落影印平板置于含氯仿飽合氣體的容器細(xì)菌裂解,抗原釋放覆蓋吸附有未經(jīng)標(biāo)記的抗體的NC膜形成抗原抗體復(fù)合物將NC膜與I125標(biāo)記的抗體溫育
放射自顯影與母板對(duì)照,挑取所需的重組克隆
用免疫化學(xué)法檢測(cè)克隆在表達(dá)載體pUC8上的基因第三節(jié)基因轉(zhuǎn)移方法一重組DNA導(dǎo)入大腸桿菌
(一)轉(zhuǎn)化
將外源DNA分子導(dǎo)入某一宿主細(xì)菌細(xì)胞的過程都叫轉(zhuǎn)化。
為了有效地使細(xì)菌吸收外源的DNA分子,我們通常要對(duì)它們進(jìn)行一些物理或化學(xué)的處理,處理后的細(xì)胞吸收外源DNA的能力大大提高,被稱為感受態(tài)細(xì)胞。對(duì)于大腸桿菌細(xì)胞,一般采用50mmol/L的CaCl2溶液來制備感受態(tài)細(xì)胞。(1)吸附階段:完整的雙鏈DNA分子吸附于感受態(tài)細(xì)胞表面(2)轉(zhuǎn)入階段:雙鏈DNA分子解鏈,以單鏈形式進(jìn)入細(xì)胞,而另一鏈則被降解
(3)自身穩(wěn)定階段:外源質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)又復(fù)制成雙鏈環(huán)型DNA(4)表達(dá)階段:即目的基因隨質(zhì)粒的復(fù)制子一起復(fù)制
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