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文檔簡介
Chap.14Metabolismregulation
代謝途徑的相互聯(lián)系酶量的調(diào)節(jié)酶分子活性的調(diào)節(jié)代謝途徑的區(qū)域化Regulationofmetabolism是生物在長期進(jìn)化過程中,為適應(yīng)外界條件而形成的一種復(fù)雜的生理機(jī)能。通過調(diào)節(jié)作用細(xì)胞內(nèi)的各種物質(zhì)及能量代謝得到協(xié)調(diào)和統(tǒng)一,使生物體能更好地利用環(huán)境條件來完成復(fù)雜的生命活動。
代謝調(diào)節(jié)作用可在不同水平上進(jìn)行:低等的單細(xì)胞生物是通過細(xì)胞內(nèi)酶的調(diào)節(jié)而起作用的;多細(xì)胞生物則還有更復(fù)雜的激素調(diào)節(jié)和神經(jīng)調(diào)節(jié)。
1)Enzymelevel2)Celllevel3)
Hormonelevel4)
Nervelevel單細(xì)胞生物植物動物細(xì)胞內(nèi)酶的調(diào)節(jié)是最基本的調(diào)節(jié)方式
酶的調(diào)節(jié)是從酶的區(qū)域化、酶的數(shù)量和酶的活性三個方面對代謝進(jìn)行調(diào)節(jié)操縱子(元)(Operon)是在轉(zhuǎn)錄水平上控制基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,由啟動子(P)、操縱基因(O)和在功能上相關(guān)的幾個結(jié)構(gòu)基因組成
轉(zhuǎn)錄后的調(diào)節(jié)包括,真核生物mRNA轉(zhuǎn)錄后的加工,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的運(yùn)輸和在細(xì)胞中的定位等
翻譯水平上的調(diào)節(jié)包括,mRNA本身核苷酸組成和排列(如SD
Sequence),反義RNA的調(diào)節(jié),mRNA的穩(wěn)定性等方面
酶活性的調(diào)節(jié)是直接針對酶分子本身的催化活性所進(jìn)行的調(diào)節(jié),在代謝調(diào)節(jié)中是最靈敏、最迅速的調(diào)節(jié)方式。主要包括酶原激活、別構(gòu)酶調(diào)節(jié)、同工酶調(diào)節(jié)、酶的共價修飾、反饋調(diào)節(jié)、能荷調(diào)節(jié)及輔因子調(diào)節(jié)等Biologicalmetabolism:指生物活體與外界環(huán)境不斷進(jìn)行的物質(zhì)(包括氣體、液體和固體)、能量、信息交換過程。Cellularmetabolism:是一切生命活動的基礎(chǔ)。Anabolicmetabolism:一般是指將簡單的小分子物質(zhì)轉(zhuǎn)變成復(fù)雜的大分子物質(zhì)的過程。Catabolism:則是將復(fù)雜的大分子物質(zhì)轉(zhuǎn)變成小分子物質(zhì)的過程。Intermediarymetabolism:發(fā)生在細(xì)胞內(nèi)的一切化學(xué)反應(yīng)?;A(chǔ)代謝Basalmetabolism:指人體在清醒而又極端安靜的狀態(tài)下,不受肌肉活動、環(huán)境溫度、食物及精神緊張等影響時的能量代謝率?;A(chǔ)代謝經(jīng)隨著性別、年齡等不同而有生理變動。男子的基礎(chǔ)代謝率平均比女子高,幼年比成年高;年齡越大,代謝率越低...基礎(chǔ)代謝率Basalmetabolicrate,BMR:,即在上述條件下,單位時間內(nèi),每平方米人體表面所散發(fā)的熱量的千卡數(shù)。糖、脂、核酸和蛋白質(zhì)的代謝
合成途徑各不相同,分解代謝途徑則有共同之處,即糖、脂、核酸和蛋白質(zhì)經(jīng)過一系列分解反應(yīng)后都進(jìn)入了TCAcycle,最后被氧化成CO2和H2O。Section1
代謝途徑的相互聯(lián)系代謝網(wǎng)絡(luò)[Metabolicnetwork]代謝的單向性[unidirectivity]和多酶系統(tǒng)[multienzymesysteme]代謝與能量[metabolismand
energy]
物質(zhì)代謝---聯(lián)系---轉(zhuǎn)化—
TCAcycle則是Saccharide、Fat、Pro三大物質(zhì)互相轉(zhuǎn)化的樞紐一、Metabolicnetwork
糖代謝為蛋白質(zhì)的合成提供碳源和能源:如糖分解過程中可產(chǎn)生Pyr,Pyr經(jīng)TCA
cycle生
-KG和OAA,它們均可經(jīng)加氨基或氨基移換作用形成相應(yīng)的AA。糖分解過程中產(chǎn)生的能量可供AA和Pro的合成之用。蛋白質(zhì)分解產(chǎn)生的AA,在體內(nèi)可以轉(zhuǎn)變?yōu)镾ugar。如:多數(shù)AA在脫氨后轉(zhuǎn)變?yōu)镻yr,經(jīng)糖原異生作用可生成Sugar,這類氨基酸稱為生糖氨基酸。1、糖代謝與蛋白質(zhì)代謝的關(guān)系
脂類分解過程中產(chǎn)生較多的能量,可作為體內(nèi)貯藏能量的物質(zhì)。脂類與蛋白質(zhì)之間可以相互轉(zhuǎn)化:
脂類分子中的甘油
丙酮酸
FAOAA
-KGAaPro2、脂類代謝與蛋白質(zhì)代謝的關(guān)系A(chǔ)cCoA
-OxidationTCACycleOAA—KG
MalateAa琥珀酸乙醛酸循環(huán)甘油生酮氨基酸生糖氨基酸乙酰乙酸FA丙酮酸AcCoA丙二酸單酰輔酶A脂肪
糖與脂類物質(zhì)也能相互轉(zhuǎn)變:糖磷酸二羥丙酮丙酮酸甘油乙酰輔酶A脂肪酸脂類甘油
-甘油磷酸磷酸二羥丙酮糖脂肪酸AcCoA琥珀酸OAA丙酮酸
-氧化乙醛酸循環(huán)TCACO2+H2O3、糖代謝與脂類代謝的關(guān)系糖尿病:脂肪
ketonebody,acetonebody
(乙酰乙酸、丙酮、-羥丁酸)在血液中產(chǎn)生酸中毒或到達(dá)肌肉中提供能源在饑餓時也產(chǎn)生與糖尿病類似的情況NANtATPUTPCTPGTP能量和磷酸基團(tuán)的供應(yīng)單糖的轉(zhuǎn)變和多糖的合成參與卵磷脂的合成給蛋白質(zhì)合成提供能量AMP輔酶、組氨酸等Gly、Asp、GlnPu、PyrProteinase參加SynthesisofNt
and
nucleicacid(DNA,RNA)蛋白因子核苷酸、核酸的合成4、核酸代謝與糖、脂肪
及蛋白質(zhì)代謝的關(guān)系
1.相對立的單向反應(yīng)(opposingunidirectionalreaction):
糖代謝的例子:
G+ATP6-p-G+ADP(變構(gòu)抑制)6-p-G+H2OG+Pi
脂代謝的例子:乙酸+ATP+CoA乙酰
CoA+AMP+PPi
乙酰
CoA+H2O乙酸+CoA
硫激酶硫酯酶二、代謝的單向性和多酶系統(tǒng)HK6-p葡萄糖酶
2.細(xì)胞中的酶常常為了催化一系列連鎖反應(yīng)而聯(lián)系成多酶系統(tǒng),根據(jù)多酶系統(tǒng)結(jié)構(gòu)的復(fù)雜程度,可分三種類型:
酶分子呈溶解狀態(tài)(如EMP,PPP,β-氧化)
酶分子結(jié)構(gòu)比較緊密(如FA
synthetasecomplex,PyruvateDHasecomplex,α-KGDHasecomplex)
酶連接在膜上或核蛋白體上
ATPADP+Pi太陽能化學(xué)能生物合成細(xì)胞運(yùn)動膜運(yùn)輸能荷=ATP+0.5ADPATP+ADP+AMP三、
代謝與能量有機(jī)體從環(huán)境中獲得能量的方式各有不同,有的利用
太陽的輻射能,有利用氧化還原反應(yīng)釋放的化學(xué)能不
管哪種形式,細(xì)胞都能將它轉(zhuǎn)化成高能分子ATP。NADPH以還原力形式攜帶能量還原性有機(jī)物分解代謝氧化產(chǎn)物還原性生物合成產(chǎn)物還原性生物合成反應(yīng)氧化前體NADPH+H+NADP+代謝的基本要略在于形成ATP、還原力和構(gòu)造單元用于生物合成基因表達(dá)的調(diào)節(jié)
(酶含量的調(diào)節(jié))ABEX底物水平的調(diào)節(jié)酶水平的調(diào)節(jié)酶活性的調(diào)節(jié)酶含量的調(diào)節(jié)酶的定位調(diào)節(jié)輔助因子的調(diào)節(jié)產(chǎn)物調(diào)節(jié)酶是生物反應(yīng)的催化劑,酶的相對數(shù)量決定代謝反應(yīng)的進(jìn)程和方向。通過酶的合成和降解,細(xì)胞內(nèi)的酶含量和組分便發(fā)生變化,因而對代謝過程起調(diào)節(jié)作用。生物細(xì)胞的這種通過改變酶的合成和降解而調(diào)節(jié)酶的數(shù)量,被稱為“粗調(diào)”。
通過粗調(diào),細(xì)胞可以開動或完全關(guān)閉某種酶的合成,或適當(dāng)調(diào)整某種酶的合成和降解速度,以適應(yīng)對這種酶的需要。Section2
基因表達(dá)的調(diào)節(jié)生物體的每個活細(xì)胞都含有相同的一整套基因?;虮磉_(dá)具有高度的時空專一化:如肌紅蛋白基因(肌細(xì)胞)基因表達(dá)的調(diào)控:生物有機(jī)體對其基因表達(dá)的時空程序、表達(dá)速率等所進(jìn)行的調(diào)節(jié)和控制。本底水平表達(dá):調(diào)控處于關(guān)閉狀態(tài),只翻譯極少量的蛋白質(zhì)
off狀態(tài)亦有底物水平的基因表達(dá),每個世代細(xì)胞中只合成1~2mRNA分子,合成少量蛋白質(zhì),為方便起見,稱為off,關(guān)的意思及表達(dá)量很低,甚至無法檢測。Eukaryotegeneexpressionisregulatedatsixlevels:TranscriptionRNAprocessingmRNAtransportmRNAtranslationmRNAdegradationProteindegradationFig.17.1DNA
level
Transcriptionlevel
Translationlevel基因調(diào)控主要在3個水平上進(jìn)行:一、原核生物基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯調(diào)控原核生物的DNA:單個裸露的DNA
不編碼占5%
轉(zhuǎn)錄和翻譯同時間,同地點(diǎn)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控(主),兼有翻譯水平調(diào)控根據(jù)基因表達(dá)產(chǎn)物可劃分:
組成型蛋白:基因表達(dá)不受時期、部位、環(huán)境影響—組成型表達(dá)。
調(diào)節(jié)型蛋白/適應(yīng)型蛋白:基因表達(dá)受時期、部位、環(huán)境影響—非組成型表達(dá)。一種生物的整套遺傳密碼可以比作一本密碼字典,該種生物的每個細(xì)胞中都有這本字典。為什么基因只有在它應(yīng)該發(fā)揮作用的細(xì)胞內(nèi)和應(yīng)該發(fā)揮作用的時間才能呈現(xiàn)活化狀態(tài)?結(jié)論:必然有一個基因調(diào)控系統(tǒng)在發(fā)揮作用。酶的兩種類型:①組成酶(靜止型):合成不受營養(yǎng)條件的限制(基因產(chǎn)物表達(dá)時,速度穩(wěn)定,數(shù)量穩(wěn)定)如:TCA、EMP、HMS等途徑的酶②誘導(dǎo)酶(活化型、適應(yīng)型):基因表達(dá)受外界營養(yǎng)條件和細(xì)胞內(nèi)有關(guān)因子的顯著影響。如乳糖Lac分解酶系,色氨酸酶系。
突變子:突變的最小單位基因
重組子:交換的最小單位
順反子(作用子):功能單位(基因)
基因可進(jìn)一步分為不同類型:(1)結(jié)構(gòu)基因:可編碼RNA或蛋白質(zhì)的一段DNA序列
(2)調(diào)控基因:其產(chǎn)物參與調(diào)控其他結(jié)構(gòu)基因表達(dá)的基因
(3)重疊基因:指同一段DNA的編碼順序,由于閱讀框架(ORF)的不同或終止早晚的不同,同時編碼兩個或兩個以上多肽鏈的現(xiàn)象
(4)隔裂基因:指一個結(jié)構(gòu)基因內(nèi)部為一個或更多的不翻譯的編碼順序,如內(nèi)含子所隔裂的現(xiàn)象(5)跳躍基因:可作為插入因子和轉(zhuǎn)座因子移動的DNA序列,有人將它作為轉(zhuǎn)座因子的同義詞(6)假基因:同已知的基因相似,但位于不同位點(diǎn),因缺失或突變而不能轉(zhuǎn)錄或翻譯,是沒有功能的基因1、轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
→原核生物基因表達(dá)的調(diào)控主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平→當(dāng)細(xì)胞需要某一特定基因產(chǎn)物時,合成這種mRNA。當(dāng)不需要這種產(chǎn)物時,mRNA轉(zhuǎn)錄受到抑制
正調(diào)控:是經(jīng)誘導(dǎo)物誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄的調(diào)控機(jī)制,即誘導(dǎo)物與另一蛋白質(zhì)結(jié)合形成一種激活子復(fù)合物,與基因啟動子DNA序列結(jié)合,激活基因起始轉(zhuǎn)錄
負(fù)調(diào)控:阻遏物阻止轉(zhuǎn)錄過程的調(diào)控,即阻遏物與DNA分子結(jié)合,阻礙RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄,使基因處于關(guān)閉狀態(tài)。只有當(dāng)阻遏物被除去之后,轉(zhuǎn)錄才能起動,產(chǎn)生mRNA分子原核生物中基因表達(dá)以負(fù)調(diào)控為主。轉(zhuǎn)錄水平的負(fù)調(diào)控與正調(diào)控
2、乳糖操縱元(可誘導(dǎo)操縱子)
E.coli的乳糖降解代謝途徑:
負(fù)責(zé)乳糖代謝的3個酶:1、β-半乳糖苷酶2、半乳糖苷透性酶3、硫代半乳糖轉(zhuǎn)乙?;福ň唧w功能不詳)
Monod等發(fā)現(xiàn),當(dāng)E.coli生長在含有乳糖的培養(yǎng)基上時,Lactose代謝酶濃度急劇增加;當(dāng)培養(yǎng)基中沒有Lactose時,Lactose代謝基因不表達(dá),乳糖代謝酶合成停止。
Jacob和Monod(1961)提出了乳糖操縱元模型,用來闡述乳糖代謝中基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制Operonmodel大腸桿菌乳糖操縱子是第一個被發(fā)現(xiàn)的操縱元)1950s:JacquesMonodandFran?oisJacobstudiedE.colilactose-utilizationmutantsCameupwiththeOperonTheory
操縱元(Operon):轉(zhuǎn)錄的協(xié)同單位,由功能中相關(guān)的基因與他們的轉(zhuǎn)錄區(qū)組成。功能上相關(guān)的幾個結(jié)構(gòu)基因前后相連,再加上一個共同的調(diào)節(jié)基因和一組共同的控制位點(diǎn)即啟動子和操縱子在基因轉(zhuǎn)錄時協(xié)同作用。對基因表達(dá)過程實(shí)行原發(fā)調(diào)節(jié)控制也是最有效的一種調(diào)節(jié)控制方法。細(xì)菌基因表達(dá)調(diào)控的這樣一個完整的單元,稱為操縱元
OperonisasectionofDNAinwhichtwoormorerelatedgeneslieadjacentonetoanotherandaretranscribedfromasinglepromotorintopolycistronicmRNA.Commonlyinbacteria,rareorunknownineukaryotes.
Operon
isacompleteunitofbacterialgeneexpressionandregulation,includingstructuralgene,regulatorgeneandcontrolelementsinDNArecognizedbyregulatorgeneproducts.operonPromoter
gene1
gene2
gene3
gene4RNAPolymerase原核生物操縱元的結(jié)構(gòu)DNA:轉(zhuǎn)錄mRNA的信息區(qū)控制信息區(qū)能否轉(zhuǎn)錄的調(diào)控區(qū);Operor:調(diào)控區(qū)和信息區(qū)(結(jié)構(gòu)基因區(qū),
轉(zhuǎn)錄mRNA)。調(diào)節(jié)基因↓capsite結(jié)構(gòu)基因區(qū)
PO
操縱元模型操縱子及調(diào)節(jié)基因示意圖操縱元Operon:
基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,它們有共同的控制區(qū)和調(diào)節(jié)系統(tǒng)。包括在功能上彼此有關(guān)的結(jié)構(gòu)基因和控制部位.或指染色體上控制(酶)蛋白質(zhì)合成的功能單位,包括一個操縱子,一群功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因以及在調(diào)節(jié)基因和操縱基因之間專管轉(zhuǎn)錄起始的啟動基因(啟動子)。
調(diào)控區(qū)信息區(qū)
調(diào)節(jié)基因(i)啟動子(p)操縱子(o)結(jié)構(gòu)基因操縱元DNA控制蛋白質(zhì)合成的功能單位DNA控制蛋白質(zhì)合成的功能單位調(diào)節(jié)基因操縱子乳糖結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白
誘導(dǎo)劑(乳糖)
β-半乳糖苷酶半乳糖苷通透酶硫半乳糖苷轉(zhuǎn)乙?;竼幼樱ɑ颍┎倏v子—基因合成的開關(guān),結(jié)合阻遏蛋白關(guān)—阻遏蛋白阻擋操縱子,結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)開—誘導(dǎo)物阻止阻遏蛋白功能發(fā)揮調(diào)控區(qū):1.啟動子(promoter)
RNApolymerase結(jié)合區(qū)(在區(qū)中PI部位)2.CAPsite(CRPsite)降解物基因活化蛋白(catabolitegeneactivatorprotein),亦稱為cAMP受體蛋白(cAMPreceptorprotein);3.操縱子(operator)阻遏蛋白(repressor)的結(jié)合部位,起開關(guān)作用,控制基因的開放與關(guān)閉;4.衰減子(attenuator):有的調(diào)控區(qū)有。如色氨酸操縱元的調(diào)控區(qū),在調(diào)控區(qū)的下游可視為終止子;5.調(diào)節(jié)基因:I轉(zhuǎn)錄出阻遏蛋白結(jié)合在操縱子上進(jìn)行調(diào)控,關(guān)閉基因。有誘導(dǎo)物存在時,阻遏蛋白與之結(jié)合,構(gòu)象改變,不結(jié)合到O上,RNA聚合酶亦結(jié)合阻遏蛋白,轉(zhuǎn)錄起始。通過遺傳分析證明Lac操縱元的存在;分離出阻遏蛋白,測定了阻遏蛋白的結(jié)晶結(jié)構(gòu),以及阻遏蛋白與誘導(dǎo)物及操縱子序列結(jié)合的結(jié)構(gòu)
阻遏蛋白
LacⅠ基因表達(dá)效率低,其啟動子與RNA聚合酶親和性低,故轉(zhuǎn)錄水平低,為弱啟動子。一個細(xì)胞周期中只合成1~2個LacⅠmRNA,LacⅠ基因的轉(zhuǎn)錄是組成型的,不受任何阻遏蛋白控制,只受自身啟動子強(qiáng)度控制。當(dāng)Ⅰ基因啟動子成為強(qiáng)啟動子后,細(xì)胞內(nèi)不可能有足夠的誘導(dǎo)物來克服阻遏狀態(tài)。LacⅠ基因在此突變體中為不可誘導(dǎo)。(a)(b)(c)LacI阻遏蛋白是一個DNA結(jié)合蛋白LacRepressor
與DNA結(jié)合的晶體結(jié)構(gòu)大腸桿菌lac阻遏蛋白的晶體結(jié)構(gòu),分辨率為2.6A,由兩個平行的二價對稱的二聚體組成.Lac阻遏蛋白的DNA結(jié)合域均位于四聚體的同一側(cè),兩個二聚體之間形成一個U型的裂隙,每個單體貢獻(xiàn)一C端螺旋形成一個反平行的四螺旋束,組合一個四聚的結(jié)構(gòu)域..-結(jié)構(gòu)對應(yīng)結(jié)合一個DNA回文序列
阻遏蛋白與LacO(操縱子)的結(jié)合并非永久不變,半衰期為10~20分鐘,LacO可短時游離,RNA聚合酶可抓住這一時機(jī)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,即本底水平的永久型合成(Backgroundconstitutivesynthesis)。平均每個細(xì)胞周期有一個LacⅠmRNA依此方式產(chǎn)生,從而翻譯出幾分子的β-半乳糖苷透過酶和β-半乳糖苷轉(zhuǎn)乙酰酶。這樣,有幾個β-半乳糖苷透過酶在游離,一旦發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)基中有了β-半乳糖苷類物質(zhì),就允許進(jìn)入細(xì)胞成為誘導(dǎo)物。此為最初的誘導(dǎo)物進(jìn)入細(xì)胞的原因。乳糖這種誘導(dǎo)物并不能與阻遏蛋白結(jié)合,而是因?yàn)長ac進(jìn)入細(xì)胞后由于β-半乳糖苷酶催化變?yōu)閯e乳糖(allolactose),其為較強(qiáng)誘導(dǎo)物,結(jié)合阻遏蛋白,使之構(gòu)想發(fā)生變化,Lacoperon表達(dá)。當(dāng)Lac和allolactose被代謝完全后,阻遏蛋白又結(jié)合于操縱子,操縱元的結(jié)構(gòu)基因關(guān)閉。誘導(dǎo)類似物比誘導(dǎo)物更有效的另一個原因:它不是半乳糖苷酶的底物,不被降解,又稱安慰性誘導(dǎo)物(gratuitousinducer)
轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)5/
負(fù)(模)
3/
上游(—)下游(+)3/-1+1正(編)5/
mRNA
互補(bǔ)于負(fù)鏈
轉(zhuǎn)錄單位的起點(diǎn)核苷酸為+1,起點(diǎn)右邊為下游(轉(zhuǎn)錄區(qū)),轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)左側(cè)為上游,用負(fù)數(shù)表示:-1,-2,-3。
操縱元的雙重控制:1.在正常情況下,阻遏蛋白結(jié)合在O上,關(guān)閉基因。由于P與O有一定的重疊(7bp),妨礙了RNA聚合酶在-10序列形成開放性穩(wěn)定性啟動子。當(dāng)有高濃度誘導(dǎo)物(Lac等)時,可使阻遏蛋白鈍化,接觸阻遏作用,基因表達(dá)。2.要使P區(qū)中的PI部位結(jié)合RNA聚合酶,Capsite必須活化。Capsite不單獨(dú)結(jié)合Cap,只與Cap-cAMP復(fù)合物結(jié)合,結(jié)合后此位點(diǎn)被占領(lǐng),從而活化,為RNA聚合酶構(gòu)成一個入口位點(diǎn),使聚合酶結(jié)合在PI部位,移向下游起始密碼子處,轉(zhuǎn)錄出相應(yīng)的結(jié)構(gòu)基因產(chǎn)物。Cap位點(diǎn)調(diào)節(jié)基因LacⅠ產(chǎn)生的阻遏蛋白通過操縱子以及誘導(dǎo)物(Lac)相互作用而實(shí)現(xiàn)對基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控,這是負(fù)調(diào)控。相應(yīng)的還存在著正調(diào)控機(jī)制。如大腸桿菌在含Lac、Glucose的培養(yǎng)基生長時,只利用葡萄糖。缺少葡萄糖時,腺苷酸環(huán)化酶將ATP轉(zhuǎn)變?yōu)閏AMP,cAMP與其受體蛋白Cap結(jié)合為復(fù)合物,此復(fù)合物再與Cap位點(diǎn)結(jié)合。如此啟動子上的入口處分解,與RNA聚合酶結(jié)合。有葡萄糖時,cAMP不能形成,Cap不能與啟動子上的Cap位點(diǎn)結(jié)合,啟動子上的RNA聚合酶入口處不能結(jié)合RNA聚合酶。這樣正負(fù)調(diào)控雙重控制,即有不同調(diào)控蛋白進(jìn)行(而ara則由同一個調(diào)控蛋白進(jìn)行正負(fù)調(diào)控)。兩道開關(guān)同時打開,基因才能轉(zhuǎn)錄。乳糖操縱元的正調(diào)控
除了阻遏蛋白能抑制lac操縱元轉(zhuǎn)錄外,其它因子也能有效地抑制lacmRNA轉(zhuǎn)錄,這個因子的活性與Glc有關(guān):
Glc抑制腺苷酸環(huán)化酶的活性→腺苷酸環(huán)化酶催化ATP→cAMP→cAMP+代謝激活蛋白(CAP)→cAMP-CAP復(fù)合物,作為操縱元的正調(diào)控因子→當(dāng)cAMP-CAP復(fù)合物的二聚體插入到lac啟動子區(qū)域特異核苷酸序列時,使啟動子DNA彎曲形成新的構(gòu)象,RNA聚合酶與這種DNA新構(gòu)象的結(jié)合更加牢固,因而轉(zhuǎn)錄效率更高?!谟蠫lc存在時,不能形成cAMP,也就沒有操縱元的正調(diào)控因子cAMP-CAP復(fù)合物,因此基因不表達(dá)。乳糖操縱元的正調(diào)控RLacZLacYLacAmRNAmRNAZmRNAYmRNAA基因表達(dá)CAP基因結(jié)構(gòu)基因TCAPOCAP結(jié)合部位
RNA聚合酶TcAMP-CAPP葡萄糖分解代謝產(chǎn)物腺苷酸環(huán)化酶磷酸二酯酶ATPcAMP5'-AMP抑制激活葡萄糖降解物與cAMP的關(guān)系cAMPCAP:降解物基因活化蛋白(catabolicgeneactivationprotein)降低cAMP濃度使CAP呈失活狀態(tài)乳糖操縱元的正調(diào)控Glc當(dāng)缺乏Glc的環(huán)境中當(dāng)有Glc存在的環(huán)境中CAPcAMPCAP-cAMP
RNApol
mRNA
與乳糖代謝的3個酶CAP
RNApolZYAZYA葡萄糖效應(yīng)—分解代謝阻遏作用在大腸桿菌培養(yǎng)基中,加入葡萄糖和其他糖存在時,優(yōu)先利用葡萄糖的現(xiàn)象。原因:降低cAMP環(huán)化酶使磷酸二酯酶升高,cAMP轉(zhuǎn)變成5′AMP,從而使[cAMP]降低,CAP不能結(jié)合cAMP,不能形成cAMP-CAP復(fù)合物,即不能結(jié)合至DNA上的Capsite,DNA雙螺旋不能解開啊,不轉(zhuǎn)錄利用Lac的酶。當(dāng)葡萄糖被耗盡時,其他糖才利用。這也符合自然界的規(guī)律,葡萄糖為最普遍、最常用的能量來源,其他糖為應(yīng)急之用,也是自然選擇的結(jié)果。
乳糖操縱元的不同調(diào)控位點(diǎn)a:CAP結(jié)合位點(diǎn);b:RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn);R:形成抑制環(huán)的區(qū)域
Lacoperon及其調(diào)節(jié)基因,A、結(jié)構(gòu)基因區(qū)(順反子區(qū)):三個結(jié)構(gòu)基因:LacZ、LacY、LacA分別合成三個酶。Z:β-半乳糖苷酶、Y:β-半乳糖苷透過酶,A:β-半乳糖苷轉(zhuǎn)乙?;窧、操縱子(操縱位點(diǎn))區(qū):operator與Z有重疊,結(jié)合阻遏蛋白。結(jié)合阻遏蛋白的區(qū)域稱為阻遏蛋白保護(hù)區(qū),長為26bp(-5~+21),此位點(diǎn)為一個雙重對稱的回文序列。如圖所示,其中16bp以次級鍵與阻遏蛋白結(jié)合(多為氫鍵),易結(jié)合也亦解離。Thelacoperonoccupies~6000bpofDNA.AttheleftthelacIgenehasitsownpromoterandterminator.TheendofthelacIregionisadjacenttothepromoter,P.Theoperator,O,occupiesthefirst26bpofthetranscriptionunit.ThelonglacZgenestartsatbase39,andisfollowedbythelacYandlacAgenesandaterminator.5′↓對稱中心
3′TGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACA+1+10ACAACACACCTTAACACTCGCCTATTGTTAAAGTGTGT-10↑mRNA開始轉(zhuǎn)錄的第一個堿基(轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn))
阻遏蛋白結(jié)合位點(diǎn)是以第11對堿基為對稱軸,兩邊為兩段各六個bp的對稱序列(TGTGTG和AATTGT),即回文序列(palindrome)
C.啟動子區(qū)(P)分為RNA聚合酶結(jié)合區(qū)PI區(qū),與O有重疊;調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合區(qū),Capsite。在operon中,調(diào)節(jié)基因以下,mRNA開始轉(zhuǎn)錄位點(diǎn)以上(與O有部分重疊),均為啟動子序列,長度20~200bp。Lac的promoter為85bp,分為兩部分:上游為兩個Cap-cAMP結(jié)合位點(diǎn)區(qū)(Ⅰ,Ⅱ)40bp;下游為RNA聚合酶進(jìn)入位點(diǎn)結(jié)合區(qū),包括識別點(diǎn)和結(jié)合點(diǎn)RepressorandRNApolymerasebindatsitesthatoverlaparoundthetranscriptionstartpointofthelacoperon3、色氨酸操縱元(可阻遏操縱元)
E.coliTrp操縱元是合成代謝途徑中基因調(diào)控的典型例子:
Trp操縱元包括色氨酸合成中5種酶的結(jié)構(gòu)基因。
當(dāng)培養(yǎng)基中有Trp時,Trp操縱元5種酶的轉(zhuǎn)錄同時受到抑制;在Trp供應(yīng)不足時,發(fā)生轉(zhuǎn)錄
Trp直接作為共阻遏物或輔阻遏物(corepressor)
而不是誘導(dǎo)物參與調(diào)控TrpmRNA的轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白操縱基因結(jié)構(gòu)基因調(diào)節(jié)基因mRNA酶蛋白阻遏蛋白不能與操縱基因結(jié)合,所以結(jié)構(gòu)基因表達(dá)。酶代謝產(chǎn)物一旦大量積累阻遏蛋白被產(chǎn)物激活,結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)。
Trp阻遏物該阻遏物是Dimer,2個單體(灰色和淺藍(lán)色)以螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)域與DNA結(jié)合。結(jié)合的Trp為分子為紅色。+tryptophan=repression-tryptophan=expression阻遏物以同型二聚體發(fā)揮作用色氨酸操縱元的組成
L:140核苷酸,即Leadersequence,先導(dǎo)序列,為mRNA起始密碼子AUG之前的序列;a:衰減子(attenuator),可視為終止子及轉(zhuǎn)錄調(diào)控信號,為發(fā)揮衰減作用的DNA序列,是受翻譯控制的轉(zhuǎn)錄終止結(jié)構(gòu)衰減作用;attenuation:transcriptionalregulationactingtoaboutRNAsynthesisafterinititionbutbeforereadthroughofprotein-encodingsequences。衰減子控制與阻遏蛋白控制方向相同,色氨酸存在時,兩種系統(tǒng)均使轉(zhuǎn)錄處于低水平;無或低色氨酸時,RNA聚合酶可通過衰減子,有色氨酸存在時,部分RNA聚合酶可逃離阻遏蛋白的監(jiān)督而起始轉(zhuǎn)錄,但這些RNA聚合酶在衰減子處被迫停留(當(dāng)然也有部分逃離),通過這種雙重控制,使色氨酸的濃度保持恒定。高色氨酸時,由于a的作用,轉(zhuǎn)錄迅速減弱停止,只生成140個核苷酸的前導(dǎo)RNA,即前導(dǎo)肽。TrpleadermRNA-OperoniscontrolledbytheinternalconcentrationoftRNATrp
RibosomestranslatesmRNArapidlywhentryptophanisabundant,…Region1和Region3形成莖結(jié)構(gòu)環(huán).,阻止RNA多聚酶通過,終止轉(zhuǎn)錄Attenuation負(fù)調(diào)控正調(diào)控操縱子的調(diào)控模型誘導(dǎo)物誘導(dǎo)物輔阻遏物輔阻遏物
4、阿拉伯糖操縱元(araoperon)阿拉伯糖為5碳糖,參與其代謝的酶基因分為三個操縱元:araBAD、araE、araFG,由一個共同的arac基因(即調(diào)控基因)產(chǎn)物進(jìn)行調(diào)控。這是由一個調(diào)節(jié)基因控制幾個操縱元的系統(tǒng),稱為調(diào)控元(regulon)。araE、araFg編碼膜結(jié)合蛋白,與ara的轉(zhuǎn)運(yùn)結(jié)合有關(guān)。araBAD,其編碼三種酶:L-核酮糖激酶(B)、L-阿拉伯糖異構(gòu)酶(A)、L-核酮糖-5-磷酸-4-表異構(gòu)酶。
4、阿拉伯糖操縱元阿拉伯糖操縱元也是解釋代謝途徑的調(diào)控系統(tǒng),它具有一些與lac操縱元相似的特點(diǎn),但與前述兩種操縱元系統(tǒng)的顯著區(qū)別是它的同一種調(diào)控蛋白--AraC調(diào)控蛋白既可起正調(diào)控,也可起負(fù)調(diào)控作用
A、阿拉伯糖操縱元的組成。R:調(diào)控基因araC編碼AraC蛋白;O:操縱子位點(diǎn);I:誘導(dǎo)位點(diǎn),具有CAP結(jié)合位點(diǎn)。B、有ara時,AraC與I位點(diǎn)結(jié)合,CAP-cAmp與CAP位點(diǎn)結(jié)合,誘導(dǎo)表達(dá)結(jié)構(gòu)基因,為正調(diào)控C、無ara時,沒有CAP-cAmp復(fù)合體與CAP位點(diǎn)結(jié)合,AraC二聚體(D)與I及O2同時結(jié)合,形成抑制環(huán),抑制轉(zhuǎn)錄,表現(xiàn)為負(fù)調(diào)控??烧T導(dǎo)
可阻遏
誘導(dǎo)物
底物
產(chǎn)物
結(jié)果
基因開放
基因關(guān)閉阻遏蛋白
活化
鈍化功能
誘導(dǎo)物(作為底物)
輔阻遏物(作為產(chǎn)物)
途徑
分解代謝合成代謝
例子
LacArabTrp可誘導(dǎo)機(jī)制與可阻遏機(jī)制的比較5、翻譯水平的調(diào)控反饋調(diào)控機(jī)制:大腸桿菌有7個操縱元與核糖體蛋白質(zhì)合成有關(guān)。從這些操縱元轉(zhuǎn)錄的每一種mRNA,能夠被同一操縱元編碼的核糖體蛋白質(zhì)識別與結(jié)合。如果其中有一種核糖體蛋白質(zhì)過量積累,都將與其自身的mRNA結(jié)合,阻止進(jìn)一步翻譯。這種結(jié)合位點(diǎn)通常包括mRNA5'端非翻譯區(qū),也包括啟動子區(qū)域的Shine-Dalgarno序列。
反義RNA調(diào)控:反義RNA可與目的基因的5'互補(bǔ)配對,配對的區(qū)域通常也包括啟動子的Shine-Dalgarno序列,使mRNA不能與核糖體有效結(jié)合,從而阻止蛋白質(zhì)的合成。
反義RNA基因已被導(dǎo)入真核細(xì)胞,控制真核生物基因表達(dá)。例如,將乙烯形成酶基因的反義RNA導(dǎo)入蕃茄,大大延長了蕃茄常溫貯藏期。
作業(yè)題
原核生物中共阻遏物和誘導(dǎo)物如何對基因表達(dá)起調(diào)控作用。
1)高等真核生物的基因組遠(yuǎn)比細(xì)菌的基因組大得多2)很多重復(fù)序列與調(diào)控作用有關(guān)3)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化可以調(diào)控基因表達(dá)4)存在同一染色體上不同基因間的調(diào)控,也存在不同染色體之間的基因調(diào)控調(diào)控發(fā)生在DNA水平,轉(zhuǎn)錄水平,轉(zhuǎn)錄后修飾,翻譯水平和翻譯后修飾等多種層次。多數(shù)基因表達(dá)調(diào)控發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平二、真核生物的基因調(diào)控一、DNA的改變(1)基因劑量與基因擴(kuò)增
組蛋白基因是基因劑量效應(yīng)的一個典型例子。為了合成大量組蛋白用于形成染色質(zhì),多數(shù)細(xì)胞含有數(shù)百個組蛋白基因拷貝
基因劑量可經(jīng)基因擴(kuò)增臨時增加。人類癌細(xì)胞中的許多致癌基因,經(jīng)大量擴(kuò)增后高效表達(dá),導(dǎo)致細(xì)胞生長失控。有些致癌基因擴(kuò)增的速度與病癥的發(fā)展及癌細(xì)胞擴(kuò)散程度高度相關(guān)。(2)DNA重排
真核生物基因組中的DNA序列可發(fā)生重排,這種重排是由特定基因組的遺傳信息所決定的,是有些基因調(diào)控的重要機(jī)制。
動物抗體基因重排一個抗體分子包括兩條重鏈(H)和兩條輕(L)氨基端(N)是變異區(qū)(V),羧基端(C)是恒定區(qū)(C)(3)DNA甲基化
真核生物中,少數(shù)胞嘧啶第5碳上的氫被一個甲基取代(甲基化)。甲基化C在DNA復(fù)制中可整合到正常DNA序列中。C甲基化在CG雙核苷酸序列中發(fā)生頻率最高。許多真核生物基因5'端未翻譯區(qū)富含CG序列,易甲基化。甲基化可降低轉(zhuǎn)錄效率。二、轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控(1)順式調(diào)控元件(Cis-actingelement)指基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游與基因表達(dá)調(diào)節(jié)有關(guān)的特異序列真核生物基因(A)在5
端啟動子的順式調(diào)控元件原核生物基因(B)在5
端啟動子的順式調(diào)控元件
轉(zhuǎn)錄方向用箭頭表示,轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)用+1表示
TATA盒
CAAT盒
GC盒
增強(qiáng)子
順式作用元件結(jié)構(gòu)基因-GCGC---CAAT---TATA轉(zhuǎn)錄起始真核生物啟動子保守序列
強(qiáng)化子(增強(qiáng)子)
轉(zhuǎn)錄強(qiáng)化子是真核生物基因轉(zhuǎn)錄中的另一種順式調(diào)控元件,通常位于啟動子上游700-1000bp處,離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)較遠(yuǎn)
①與轉(zhuǎn)錄激活子結(jié)合,改變?nèi)旧|(zhì)的構(gòu)型②使DNA彎曲形成環(huán)狀結(jié)構(gòu),使強(qiáng)化子與啟動子直接接觸,以便通用轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)錄激活子、RNA聚合酶一起形成轉(zhuǎn)錄復(fù)合體,從而提高mRNA合成效率
強(qiáng)化子主要有兩個功能:DNA環(huán)化與轉(zhuǎn)錄活性
強(qiáng)化子競爭控制基因表達(dá)
激活子
激活子是一種與強(qiáng)化子結(jié)合的蛋白質(zhì),也屬于一種轉(zhuǎn)錄因子
正激活子真激活子(促進(jìn)轉(zhuǎn)錄)抗阻遏物激活子激活子負(fù)激活子:抑制轉(zhuǎn)錄
(2)轉(zhuǎn)錄因子或反式作用因子(Trans-actingfactor)指識別、結(jié)合順式調(diào)控元件的特異蛋白質(zhì),激活真核生物基因轉(zhuǎn)錄。
→真核生物基因轉(zhuǎn)錄與原核生物的一個重要區(qū)別是:真核生物基因的啟動子必須與一系列轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,才能在RNA聚合酶的作用下起始轉(zhuǎn)錄
轉(zhuǎn)錄因子基本轉(zhuǎn)錄因子-結(jié)合在TATA盒和轉(zhuǎn)錄起點(diǎn),與RNA聚合酶共同形成起始復(fù)合物。上游因子-結(jié)合在啟動子和增強(qiáng)子的上游控制位點(diǎn)。可誘導(dǎo)因子-與應(yīng)答元件相互作用反式作用因子(轉(zhuǎn)錄因子)
識別結(jié)合DNA的主要幾種基序結(jié)構(gòu)
ZincfingerLeucineziper
常見的DNA結(jié)合域:
①鋅指(zincfinger)由Cys-His與鋅離子形成的具有三個手指的鋅指構(gòu)型(a)模式圖(b)與DNA結(jié)合,一個手指與DNA大溝結(jié)合
②亮氨酸拉鏈(leucinezipper)
二聚體形成的拉鏈(a)模式圖(b)與DNA結(jié)合時的剪刀狀構(gòu)型
③螺旋-環(huán)-螺旋(helix-loop-helix)衰減子:
是DNA分子中的調(diào)控序列,首先發(fā)現(xiàn)在細(xì)菌Trp操縱子中,此類序列具有使轉(zhuǎn)錄終止的作用,即一種位于結(jié)構(gòu)基因上游前導(dǎo)區(qū)的終止子。增強(qiáng)子:是DNA分子中的調(diào)控序列,發(fā)現(xiàn)真核生物和病毒中,遠(yuǎn)距離作用于同一條DNA的啟動子,對轉(zhuǎn)錄起增強(qiáng)作用。衰減作用(attenuation)
衰減子作用
1、真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游與基因表達(dá)調(diào)控有關(guān)的主要順式作用(調(diào)控)元件有哪些?他們的主要功能是什么?
2、簡述原核細(xì)胞DNA復(fù)制與RNA的生物合成有何不同。
3.簡述原核細(xì)胞蛋白質(zhì)合成的過程。
4、真核細(xì)胞RNA聚合酶的細(xì)胞定位和合成RNA的類型如何。
5.蛋白質(zhì)合成體系需要哪些生物大分子參加?其功能分別是什么?
作業(yè)題:
復(fù)習(xí)思考題:
1.概念: (1)操縱子 (2)增強(qiáng)子 (3)順式作用元件 (4)反式作用因子 (5)基因組 (6)基因表達(dá)
2.簡述操縱子的結(jié)構(gòu)與功能。
3.簡述乳糖操縱子的調(diào)控原
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