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文檔簡(jiǎn)介
ICS67.120.30
CCSB50
DB32
江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB32/T4234—2022
水產(chǎn)品中副溶血性弧菌檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光重組
酶介導(dǎo)鏈替換核酸擴(kuò)增法
DetectionmethodforVibrioparahaemolyticusinaquaticbyreal-timefluorescence
recombinase-aidamplification
2022-03-18發(fā)布2022-04-18實(shí)施
江蘇省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
DB32/T4234—2022
水產(chǎn)品中副溶血性弧菌檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光重組酶介導(dǎo)鏈替換核酸擴(kuò)增法
1范圍
本文件規(guī)定了水產(chǎn)品中副溶血性弧菌檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光重組酶介導(dǎo)鏈替換核酸擴(kuò)增(recombinase-aid
Amplification,RAA)法的試劑材料、儀器設(shè)備、檢測(cè)程序、操作步驟、結(jié)果判定和報(bào)告、檢出限及防
止污染措施。
本文件適用于水產(chǎn)品中副溶血性弧菌檢測(cè)。
本文件適用于水產(chǎn)品副溶血性弧菌的快檢初篩。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB4789.7食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)食品微生物學(xué)檢驗(yàn)副溶血性弧菌檢驗(yàn)
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
GB/T27403實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。
3.1
重組酶介導(dǎo)鏈替換核酸擴(kuò)增recombinase-aidAmplification,RAA
一種利用重組酶、單鏈結(jié)合蛋白和DNA聚合酶代替了傳統(tǒng)PCR的熱循環(huán)解鏈過(guò)程,在恒溫下(一般為
37℃~42℃),進(jìn)行核酸擴(kuò)增的技術(shù)。
4原理
RAA法利用重組酶、單鏈結(jié)合蛋白和DNA聚合酶代替了傳統(tǒng)PCR的熱循環(huán)解鏈過(guò)程。根據(jù)副溶血性弧
菌的特異性基因序列,結(jié)合熒光探針檢測(cè)法對(duì)水產(chǎn)養(yǎng)殖及水體中副溶血性弧菌進(jìn)行判定。經(jīng)實(shí)時(shí)熒光RAA
擴(kuò)增后,根據(jù)樣品在30min內(nèi)是否出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,可判定樣品結(jié)果。
5試劑材料
除另有規(guī)定外,試劑為分析純或生化試劑,實(shí)驗(yàn)用水符合GB/T6682的要求。所有試劑均用無(wú)DNA
酶污染的容器分裝。試劑材料有:
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a)探針和引物
根據(jù)副溶血性弧菌的特異性基因序列設(shè)計(jì)探針和引物。
表1副溶血性弧菌探針和引物
致病菌種類(lèi)引物探針名稱(chēng)序列(5'-3')目的基因
上游引物tlh-FTTAGATTTGGCGAACGAGAACGCAGACATTACGtlh
下游引物tlh-RAGATGTTGCCTGTATCAGACAAGCTGTCACCGA
副溶血性弧菌
exo探針tlh-PTTACGTTCTTCGCCGCTGACAATCGCTTC[FAM-dT][THF
]A[BHQ-dT]ACAACCACACGAT-SpacerC3
b)試劑
1)RAA反應(yīng)緩沖液:20%PEG,280mmol/L醋酸鎂(MgAc2)。也可采用等效的商品試劑盒。
2)凍干酶制劑:1mmol/LdNTP、90ng/μL單鏈結(jié)合蛋白、120ng/μLrecA重組酶、30ng/μLBsuDNA
聚合酶、30ng/μLExoIII、100mmol/LTricine、20%PEG、5mmol/L二硫蘇糖醇、100ng/μL肌酸激酶,
保存于200μL反應(yīng)管中。也可采用等效的商品試劑盒。
3)陽(yáng)性對(duì)照:副溶血性弧菌標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC17802,或含目的片段的DNA;陰性對(duì)照:非副溶血性弧
菌標(biāo)準(zhǔn)菌株,或不含目的片段的DNA;空白對(duì)照:無(wú)菌水。
6儀器和設(shè)備
包括以下幾種:
a)熒光檢測(cè)儀:帶有恒溫(39℃±1℃)擴(kuò)增功能的熒光檢測(cè)儀。
b)微量移液器:0.1μL~2.5μL,1μL~10μL,2μL~20μL,10μL~100μL,20μL~200μL,
100μL~1000μL,并配備與移液器匹配的吸頭。
c)高速臺(tái)式離心機(jī):離心力≥12000g。
d)恒溫水浴鍋或金屬?。?00℃±1℃。
e)天平:感量0.01g。
7檢測(cè)程序
副溶血性弧菌實(shí)時(shí)熒光RAA檢測(cè)程序見(jiàn)圖1。
2
DB32/T4234—2022
圖1副溶血性弧菌實(shí)時(shí)熒光RAA檢測(cè)程序
8操作步驟
8.1樣品處理和增菌
水產(chǎn)品參照GB4789.7執(zhí)行。
8.2細(xì)菌模板DNA的制備
8.2.1試劑盒法
使用商品化DNA提取試劑盒,吸取適量獲得的增菌液,按其說(shuō)明提取制備模板DNA。
8.2.2煮沸法
8.2.2.1吸取10.1獲得的增菌液1mL菌液加入1.5mL離心管中,10000g離心1min,棄上清。
8.2.2.2加入1mL無(wú)菌水,充分懸浮沉淀,10000g離心1min,棄上清;
8.2.2.3加入100μL無(wú)菌水混勻后沸水浴(或95℃金屬?。?0min,置冰上冷卻;
8.2.2.410000g離心1min,上清液即為模板DNA。
8.3實(shí)時(shí)熒光RAA擴(kuò)增
8.3.1實(shí)時(shí)熒光RAA反應(yīng)體系
副溶血性弧菌RAA檢測(cè),50μL反應(yīng)體系見(jiàn)表2。
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表2副溶血性弧菌熒光RAA反應(yīng)體系
組分名稱(chēng)體積(μL)
20%PEG12.5μL
tlh-F(10μmol/L)2.1μL
tlh-R(10μmol/L)2.1μL
tlh-P(10μmol/L)0.6μL
DNA模板(20ng/μL)4.0μL
ddH2O26.2μL
MgAc2(280mmol/L)2.5μL
總量50μL
注:(1)DNA模板量可根據(jù)不同樣品,具體情況進(jìn)行調(diào)整。
(2)將除MgAc2和模板DNA以外的所有成分渦旋混勻,分裝混合液至含有凍干酶制劑的200μL反應(yīng)管中,輕
柔手彈使凍干粉充分重溶均勻,短暫離心,打開(kāi)反應(yīng)單元,向每個(gè)反應(yīng)單元的管蓋上加入2.5μLMgAc2,然后
向各反應(yīng)單元加入適量模板DNA(≤100ng),充分混勻并離心。
(3)可使用等效的商品化熒光RAA試劑盒按照其說(shuō)明書(shū)進(jìn)行檢測(cè)。
8.4反應(yīng)條件
將反應(yīng)管置于熒光檢測(cè)儀中,39℃恒溫,30min。在反應(yīng)過(guò)程中實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)。
8.5實(shí)驗(yàn)對(duì)照
檢測(cè)過(guò)程中分別設(shè)陰性對(duì)照、空白對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照??瞻讓?duì)照以無(wú)菌水替代模板DNA;陰性對(duì)照
以非副溶血性弧菌標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA作為模板DNA;陽(yáng)性對(duì)照以副溶血性弧菌標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC17802DNA
作為模板DNA。
9結(jié)果判定和報(bào)告
9.1質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
空白對(duì)照在30min內(nèi)無(wú)擴(kuò)增曲線;陰性對(duì)照在30min內(nèi)無(wú)擴(kuò)增曲線;陽(yáng)性對(duì)照在10min內(nèi)出現(xiàn)典型
的擴(kuò)增曲線。
以上要求需在同一次實(shí)驗(yàn)中同時(shí)滿(mǎn)足,否則,本次實(shí)驗(yàn)無(wú)效,需重新進(jìn)行。
9.2結(jié)果判定
樣品在30min內(nèi)無(wú)擴(kuò)增曲線,可判定樣品結(jié)果為陰性,可直接報(bào)告未檢出副溶血性弧菌;樣品在30
min內(nèi)出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,則樣品結(jié)果為副溶血性弧菌初篩陽(yáng)性。對(duì)于初篩陽(yáng)性結(jié)果,應(yīng)參見(jiàn)GB4789.7進(jìn)行
確證后報(bào)告結(jié)果。
4
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