作業(yè)管理系統(tǒng)

作業(yè)管理系統(tǒng)內(nèi)容任務(wù)管理系統(tǒng)概述PBS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的使用2024/8/162機(jī)群使用中的問(wèn)題機(jī)群結(jié)構(gòu)的松散性（單一系統(tǒng)映象）節(jié)點(diǎn)類型的差別（CPU類型、內(nèi)存大小、數(shù)量等）系統(tǒng)資源豐富（節(jié)點(diǎn)/CPU）用戶不同類型的作業(yè)（串行/并行）用戶可以使用資源的限制2024/8/163任務(wù)管理系統(tǒng)的功能單一系統(tǒng)映象機(jī)群松散的結(jié)構(gòu)的整合系統(tǒng)資源整合異構(gòu)系統(tǒng)的整合多用戶的管理用戶提交的任務(wù)的統(tǒng)一安排，避免沖突用戶權(quán)限的管理非授權(quán)用戶的控制2024/8/164任務(wù)管理系統(tǒng)的簡(jiǎn)史2024/8/165任務(wù)管理系統(tǒng)的分類基于進(jìn)程級(jí)別的調(diào)度由機(jī)群中的操作系統(tǒng)或者運(yùn)行時(shí)Runtime內(nèi)部支持，對(duì)運(yùn)行的作業(yè)進(jìn)行監(jiān)控；以實(shí)現(xiàn)機(jī)群內(nèi)的透明調(diào)度、以及自動(dòng)優(yōu)化進(jìn)程的分配和平衡負(fù)載基于作業(yè)級(jí)別的調(diào)度這種方式由獨(dú)立的作業(yè)管理系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)。該系統(tǒng)通過(guò)專門的入口，接收用戶提交的任務(wù)，送入相應(yīng)的隊(duì)列等待調(diào)度；并在適當(dāng)?shù)臅r(shí)機(jī)分配資源，為任務(wù)創(chuàng)建作業(yè)，將作業(yè)提入運(yùn)行，在作業(yè)運(yùn)行結(jié)束后完成收尾工作，并提供記帳功能。管理員和用戶還可以在機(jī)群中查詢并預(yù)訂符合要求的資源，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)作業(yè)和資源的全程交互控制。2024/8/166任務(wù)管理系統(tǒng)的比較管理實(shí)現(xiàn)級(jí)別

進(jìn)程級(jí)作業(yè)級(jí)調(diào)度方式透明，基于最小負(fù)載可以基于網(wǎng)絡(luò)拓?fù)?程序特性/負(fù)載/自定義策略調(diào)度管理層次

低級(jí)，僅根據(jù)局部信息

高級(jí)，根據(jù)全局信息負(fù)載均衡方式支持動(dòng)態(tài)負(fù)載均衡支持靜態(tài)負(fù)載均衡；如有checkpoint功能，可支持動(dòng)態(tài)負(fù)載均衡

資源共享僅能夠共享硬件資源可以共享硬件、軟件和證書等資源服務(wù)質(zhì)量Qos可能造成大作業(yè)饑餓，無(wú)Qos只要策略適當(dāng)，可以保證Qos機(jī)群一致性的層次入口不一致，仍為多機(jī)系統(tǒng)；可以提供存儲(chǔ)一致性

提供單一系統(tǒng)入口和存儲(chǔ)一致性對(duì)用戶權(quán)限、資源和作業(yè)的高級(jí)管理策略無(wú)法實(shí)現(xiàn)能夠很好地實(shí)現(xiàn)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)規(guī)?？蓴U(kuò)展

如果規(guī)模過(guò)大，會(huì)遇到前述的O（㎡）的通訊問(wèn)題，難以擴(kuò)展

通訊量與系統(tǒng)規(guī)模成線形放縮，可以很好的擴(kuò)展對(duì)作業(yè)類型的限制如前述，不適合于系統(tǒng)調(diào)用較多的程序（如I/O密集型）

對(duì)程序類型無(wú)限制2024/8/167內(nèi)容任務(wù)管理系統(tǒng)概述PBS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的使用2024/8/168PBS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)PBS最初由NASA的Ames研究中心開發(fā)，為了提供一個(gè)能滿足異構(gòu)計(jì)算網(wǎng)絡(luò)需要的軟件包。它力求提供對(duì)批處理的初始化和調(diào)度執(zhí)行的控制，允許作業(yè)在不同主機(jī)間的路由。2024/8/169PBS的技術(shù)特色力求控制對(duì)批處理的初始化和調(diào)度執(zhí)行，允許作業(yè)在不同主機(jī)間的路由。獨(dú)立的調(diào)度模塊存有各個(gè)可用的排隊(duì)作業(yè)、運(yùn)行作業(yè)和系統(tǒng)資源使用信息，并且允許系統(tǒng)管理員定義資源和每個(gè)作業(yè)可使用的數(shù)量。在作業(yè)調(diào)度策略上，PBS提供了默認(rèn)的公平共享和獨(dú)占FIFO調(diào)度策略，還提供了TCL、BACL、C三種過(guò)程語(yǔ)言和調(diào)度類，并定義了一些調(diào)度需要的函數(shù)和完整的API，方便實(shí)現(xiàn)新的調(diào)度策略。提供文件傳送，F(xiàn)ileStage-in和Stage-out。滿足POSIX1003.2d標(biāo)準(zhǔn)，支持作業(yè)依賴，和完整的安全認(rèn)證。提供用戶映射功能，使PBS能用于用戶不一致的系統(tǒng)中。2024/8/1610PBS的結(jié)構(gòu)2024/8/1611PBS的組成服務(wù)器:pbs_server調(diào)度器:pbs_sched執(zhí)行器:pbs_mom命令行:用戶腳本，管理命令等2024/8/1612PBS的基本原理2024/8/1613PBS的優(yōu)缺點(diǎn)支持系統(tǒng)級(jí)檢查點(diǎn)功能（需底層操作系統(tǒng)支持）很好的大規(guī)模擴(kuò)展性獨(dú)立的調(diào)度模塊**支持作業(yè)依賴符合POSIX1003.2d標(biāo)準(zhǔn)--只支持Unix類操作系統(tǒng)--多集群協(xié)作功能有限--不支持用戶級(jí)檢查點(diǎn)功能2024/8/1614術(shù)語(yǔ)節(jié)點(diǎn)(node)

一個(gè)單一的操作系統(tǒng)映像，一個(gè)統(tǒng)一的虛擬內(nèi)存映像一個(gè)或多個(gè)cpu，一個(gè)或多個(gè)IP地址的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)被稱之為一個(gè)節(jié)點(diǎn)。通常執(zhí)行主機(jī)(executionhost)也被稱之為節(jié)點(diǎn)。節(jié)點(diǎn)屬性

隊(duì)列、服務(wù)器和節(jié)點(diǎn)都有與自己相關(guān)的屬性，這些屬性提供控制信息。與節(jié)點(diǎn)相關(guān)的屬性有：狀態(tài)、類型、虛擬處理器的個(gè)數(shù)、作業(yè)列表(本節(jié)點(diǎn)被分配給的作業(yè))以及節(jié)點(diǎn)的特性?！?/p>

節(jié)點(diǎn)特性

為了提供一組節(jié)點(diǎn)的分配的方法，零個(gè)或者多個(gè)特性被賦給每個(gè)節(jié)點(diǎn)。這個(gè)特性不過(guò)是一串對(duì)于PBS沒(méi)有含義的字母和數(shù)字的組合(第一個(gè)字符必須是字母)。2024/8/1615PBS安裝解壓源文件包

[root@node1/public]#tar-zxvfopenpbs-2.3.16.tar.gz編譯設(shè)置

[root@node1/public/OpenPBS_2.3.16]＃./configure--disable-gui--set-server_home=/var/spool/pbs--enable-docs--x-libraries=/usr/X11R6/lib64

其中，--x-libraries=/usr/X11R6/lib64是在X86_64(AMD64或EM64T)上安裝時(shí)，需要指明系統(tǒng)64位庫(kù)的位置。編譯安裝

[root@node1/public/OpenPBS_2.3.16]#make [root@node1/public/OpenPBS_2.3.16]#makeinstall2024/8/1616PBS在機(jī)群上安裝

由于節(jié)點(diǎn)系統(tǒng)相同，因而可以用如下SHELLscript在node2~node8上安裝；

#!/bin/bash foriin`seq28` do echo“node$i----------------------------------“rshnode$i“cd/public/openpbs;makeinstall” echo“-------------------------------------------“ echo“”done2024/8/1617服務(wù)進(jìn)程配置和啟動(dòng)文件系統(tǒng)配置文件/etc/pbs.conf #!/bin/sh pbs_home=/var/spool/pbs指定系統(tǒng)的pbs的設(shè)置的目錄位置 pbs_exec=/usr/local指定pbs可執(zhí)行程序的目錄位置 start_server=1 start_sched=1當(dāng)為1是表示守護(hù)進(jìn)程啟動(dòng)，0為守護(hù)進(jìn)程不啟動(dòng) start_mom=1

系統(tǒng)啟動(dòng)腳本/etc/init.d/openpbs

Server的系統(tǒng)啟動(dòng)腳本/etc/init.d/pbs_serverScheduler系統(tǒng)啟動(dòng)腳本/etc/init.d/pbs_schedMom系統(tǒng)啟動(dòng)腳本/etc/init.d/pbs_mom2024/8/1618Server端設(shè)置初始化server:(第一次運(yùn)行或者重新配置) /usr/local/sbin/pbs_server–tcreateServer配置目錄 /var/spool/pbs/server_priv/節(jié)點(diǎn)屬性聲明：/var/spool/pbs/server_priv/nodes

node2R220Anp=2 node3R220Anp=2 node4dualcorenp=4 node5dualcorenp=4 node6R4280Anp=4 node7R4280Anp=42024/8/1619mom端設(shè)置mom配置目錄：/var/spool/pbs/mom_priv/mom配置文件：/var/spool/pbs/mom_priv/config

#MOMserverconfigurationfile#ifmorethanonevalue,separateitbycomma.##ruleisdefinedbythename$ideal_load1.5$max_load2

##hostallowedtoconnecttoMomserveronunprivilegedport$restricted*.

##logevent:#0x1fflogallevents+debugevents#0x0ffjustallevents$logevent0x0ff

##hostallowedtoconnecttomomserveronprivilegedport$clienthostnode1

##alarmifthescripthangortakeverylongtimetoexecute$prologalarm30

2024/8/1620Server端的動(dòng)態(tài)設(shè)置PBS要能正常運(yùn)行還需要通過(guò)qmgr命令的server進(jìn)行配置，設(shè)置一些屬性。輸入qmgr命令進(jìn)入配置交互命令。下面是讓PBS可以正常運(yùn)行的一些步驟。創(chuàng)建隊(duì)列createqueue隊(duì)列名queue_type=Excuttion打開和啟動(dòng)隊(duì)列setqueue隊(duì)列名enable=t,started=t打開調(diào)度setserverscheduling=t設(shè)置默認(rèn)隊(duì)列setserverdefault_queue=隊(duì)列名2024/8/1621qmgr命令（管理員使用）輸入qmgr進(jìn)入交互式模式后即可輸入各種命令

qmgr動(dòng)作：對(duì)象類型和操作符

動(dòng)作對(duì)象類型對(duì)象名屬性操作符值（，屬性操作符值）……create創(chuàng)建一個(gè)對(duì)象delete刪除一個(gè)對(duì)象set設(shè)置對(duì)象的屬性u(píng)nset除去對(duì)象的屬性print打印對(duì)象的屬性list列出對(duì)象的屬性server服務(wù)器＝queue隊(duì)列＋＝node節(jié)點(diǎn)－＝2024/8/1622PBS隊(duì)列設(shè)置導(dǎo)入server配置文件： [root@node1root]#qmgr<queue.conf輸出配置文件： [root@node1root]#qmgr–c“printserver”>queue.conf配置文件例子：

createqueuedefault setqueuedefaultqueue_type=execution setqueuedefaultmax_running=20 setqueuedefaultenabled=True setqueuedefaultstarted=True setserverscheduling=True setservermax_user_run=20 setserverdefault_queue=defaultsetserverquery_other_jobs=True2024/8/1623Scheduler調(diào)度行為配置Scheduler的行為由配置目錄下的sched_priv/sched_config文件進(jìn)行控制Sort_by關(guān)鍵字控制調(diào)度算法可以選擇的選項(xiàng)為

no_sort，shortest_job_first，longest_job_first，smallest_memory_first，largest_memory_first，high_priority_first，low_priority_first，multi_sort，fair_share，large_walltime_first，short_walltime_first修改這個(gè)文件后重新啟動(dòng)scheduler即可。2024/8/1624內(nèi)容任務(wù)管理系統(tǒng)概述PBS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的使用2024/8/1625PBS的使用步驟準(zhǔn)備：編寫描述改作業(yè)的腳本，包括作業(yè)名，需要的資源等。提交：使用qsub命令將該作業(yè)提交給PBS服務(wù)器排隊(duì)：服務(wù)器將該任務(wù)排入適當(dāng)?shù)年?duì)列調(diào)度：服務(wù)器檢查各工作節(jié)點(diǎn)的狀態(tài)是否符合該作業(yè)的要求，并進(jìn)行調(diào)度。執(zhí)行：當(dāng)條件滿足時(shí)，作業(yè)被發(fā)給相應(yīng)的執(zhí)行服務(wù)器執(zhí)行。程序運(yùn)行時(shí)執(zhí)行服務(wù)器會(huì)收集程序的標(biāo)準(zhǔn)輸出和標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤流，等程序結(jié)束時(shí)，將這些信息返回給用戶。查詢和調(diào)整：當(dāng)作業(yè)在運(yùn)行時(shí)，用戶可以使用qstat進(jìn)行狀態(tài)查詢。用戶發(fā)現(xiàn)作業(yè)提交錯(cuò)誤時(shí)，可以使用qdel刪除正在運(yùn)行的作業(yè)。查看結(jié)果：使用文本編輯軟件vi或者系統(tǒng)命令cat,less等查看輸出及錯(cuò)誤信息顯示。2024/8/1626PBS的基本命令在PBS系統(tǒng)中，用戶使用qsub命令提交用戶程序。用戶運(yùn)行程序的命令及PBS環(huán)境變量設(shè)置組成PBS作業(yè)腳本，作業(yè)腳本使用如下格式提交到PBS系統(tǒng)運(yùn)行：[zhaocs@node1~]$qsub<PBS作業(yè)腳本>2024/8/1627qsub運(yùn)行參數(shù)運(yùn)行參數(shù)說(shuō)明-a<作業(yè)開始運(yùn)行的時(shí)間>向PBS系統(tǒng)指定作業(yè)運(yùn)行的開始時(shí)間。作業(yè)運(yùn)行時(shí)間格式為：[[[[CC]YY]MM]DD]hhmm[.SS]-A<用戶名>使用不同的用戶來(lái)提交作業(yè)，缺省使用當(dāng)前用戶名-o<標(biāo)準(zhǔn)輸出文件的路徑>-e<標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出的路徑>該參數(shù)指定標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出的位置，缺省的情況下，PBS系統(tǒng)把標(biāo)準(zhǔn)輸出和標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出放在用戶qsub命令提交作業(yè)的目錄下。標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出：<作業(yè)名>.o<作業(yè)號(hào)>標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出：<作業(yè)名>.e<作業(yè)號(hào)>路徑使用如下格式標(biāo)準(zhǔn)：[<節(jié)點(diǎn)名>:]<路徑名>-N<作業(yè)名>指定提交的作業(yè)名-q<目標(biāo)隊(duì)列>指定作業(yè)提交的目標(biāo)隊(duì)列，其中目標(biāo)隊(duì)列可以是目標(biāo)隊(duì)列、目標(biāo)節(jié)點(diǎn)名或者是目標(biāo)節(jié)點(diǎn)上的隊(duì)列。如果目標(biāo)隊(duì)列是一個(gè)路由隊(duì)列，那么服務(wù)器可能把作業(yè)路由到新的隊(duì)列中。如果該參數(shù)沒(méi)有指定，命令qsub會(huì)把作業(yè)腳本提交到缺省的隊(duì)列中。-l<申請(qǐng)資源列表>該參數(shù)指定作業(yè)腳本申請(qǐng)的PBS系統(tǒng)資源列表。申請(qǐng)資源列表使用如下格式：<資源名>[=[<數(shù)量>]][,資源名[=[<數(shù)量>]]，…..]例如作業(yè)希望申請(qǐng)?jiān)陔p路節(jié)點(diǎn)上申請(qǐng)5個(gè)CPU資源的情況，則可以在腳本中如下：#PBS–lnodes=2:ppn=2+:ppn=12024/8/1628PBS作業(yè)腳本注釋,以“#”開頭PBS指令,以“#PBS”開頭SHELL命令#PBS–Nvasp.Hg#PBS–lnodes=8:ppn=2echo"Thisjobsis"$PBS_JOBID@$PBS_QUEUEcd$PBS_O_WORKDIRmpirun-np16-machinefile$PBS_NODEFILE./vasp2024/8/1629PBS的環(huán)境變量變量名說(shuō)明登陸SHELL繼承來(lái)的變量包括$HOME，$LANG，$LOGNAME，$PATH，$MAIL，$SHELL和$TZ。$PBS_O_HOSTqsub提交的節(jié)點(diǎn)名稱$PBS_O_QUEUEqsub提交的作業(yè)的最初隊(duì)列名稱$PBS_O_WORKDIRqsub提交的作業(yè)的絕對(duì)路徑$PBS_JOBID作業(yè)被PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)號(hào)$PBS_JOBNAME用戶指定的作業(yè)名，可以在作業(yè)提交的時(shí)候用qsub–N<作業(yè)名>指定，或者在PBS腳本中加入#PBS–N<作業(yè)名>。$PBS_NODEFILEPBS系統(tǒng)指定的作業(yè)運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)名。該變量在并行機(jī)和機(jī)群中使用。當(dāng)在PBS腳本中用#PBS–lnodes=2:ppn=2指定程序運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)數(shù)時(shí)，可以使用$PBS_NODEFILE在腳本中引用PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)名。比如：#PBS–lnodes=2:ppn=2mpirun–np4–machinefile$PBS_NODEFILE<程序名>$PBS_QUEUEPBS腳本在執(zhí)行時(shí)的隊(duì)列名2024/8/1630PBS作業(yè)腳本注釋,以“#”開頭PBS指令,以“#PBS”開頭SHELL命令#PBS–Nvasp.Hg#PBS–lnodes=8:ppn=2#PBS–q@node1echo"Thisjobsis"$PBS_JOBID@$PBS_QUEUEcd$PBS_O_WORKDIRmpirun-np16-machinefile$PBS_NODEFILE./vasp2024/8/1631PBS作業(yè)腳本舉例#這是一個(gè)串行作業(yè)腳本的例子#PBS–NLoop.out#PBS–lnodes=1:ppn=1cd/public/home/zhaocs/test/./a.out>$HOME/result/a.result#這是一個(gè)并行作業(yè)腳本的例子#PBS–Nvasp.Hg#PBS–lnodes=8:ppn=2#PBS–q@node1echo"Thisjobsis"$PBS_JOBID@$PBS_QUEUEcd$PBS_O_WORKDIRmpirun-np16-machinefile$PBS_NODEFILE./vasp2024/8/1632詳細(xì)示例編輯PBS腳本內(nèi)容如下：（注意，#PBS行不是注釋，所有說(shuō)明行均以###開始，即紅色字體部分）###聲明作業(yè)名為mpi#PBS-Nmpi###申請(qǐng)資源數(shù)為10個(gè)節(jié)點(diǎn)，每個(gè)節(jié)點(diǎn)16個(gè)cpu

#PBS-lnodes=10:ppn=16###將標(biāo)準(zhǔn)輸出信息與標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤信息合并輸出到文件中#PBS-joe###指定作業(yè)提交到low隊(duì)列#PBS–qlow###估計(jì)最大運(yùn)算時(shí)間為1000小時(shí)，若沒(méi)有設(shè)置這項(xiàng)，系統(tǒng)為自動(dòng)按所在隊(duì)列默認(rèn)walltime處理#PBS-lwalltime=1000:00:002024/8/1633###在作業(yè)結(jié)束時(shí)，給用戶發(fā)郵件#PBS-me###聲明郵箱地址，如test@hpc.com#PBS-Mtest@hpc.com###進(jìn)入作業(yè)調(diào)度目錄cd$PBS_O_WORKDIR###計(jì)算申請(qǐng)的cpu數(shù)目NP=`cat$PBS_NODEFILE

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wc-l`###設(shè)置計(jì)算所需要的環(huán)境變量，如使用GNU版OpenMPI運(yùn)行程序source/public/software/mpi/openmpi1.4-gnu.sh###程序運(yùn)行部分，使用infiniband網(wǎng)運(yùn)行此程序mpirun-np$NP-machinefile$PBS_NODEFILE--mcabtlself,openibcpi-openmpi2024/8/1634一個(gè)復(fù)雜的PBS作業(yè)腳本#!/bin/bash#PBS-Njobname#PBS-lnodes=4:ppn=2cat`echo$PBS_NODEFILE`>$HOME/$PBS_JOBID.nodesfornodein`cat$HOME/$PBS_JOBID.nodes`dorsh$nodemkdir/tmp/$PBS_JOBIDrsh$nodecp-rf$PBS_O_WORKDIR/*/tmp/$PBS_JOBID/donecd/tmp/$PBS_JOBIDmpirun-np8-machinefile$PBS_NODEFILE$HOME/bin/vaspcp-rf/tmp/$PBS_JOBID/*$PBS_O_WORKDIR/fornodein`cat$HOME/$PBS_JOBID.nodes`dorsh$noderm-rf/tmp/$PBS_JOBIDdonerm$HOME/$PBS_JOBID.nodes2024/8/1635查詢和取消作業(yè)[dawning@node1~]$qstat@node1JobidNameUserTimeUseSQueue--------------------------------------------------------------93.node1test.pbszhaocs0Rdefault95.node1vasp.Hgvasp0Edefault111.node1structureamber0Qdefault[zhaocs@node1~]$qdel93.node12024/8/1636查詢作業(yè)運(yùn)行的位置[zhaocs@node1~]$pbsnode-a[zhaocs@node1~]$qstat–f[zhaocs@node1~]$qstat-r2024/8/1637ansys單節(jié)點(diǎn)計(jì)算ansys110-np4-iwing.inp跨節(jié)點(diǎn)計(jì)算：ansys110-dis-machinesnode22:4:node23:4-iwing.inp2024/8/1638ansys.pbs#!/bin/bash#PBS-Nansys_wing#PBS-lnodes=1:ppn=8#PBS-joermhost.list-rffornodein`cat$PBS_NODEFILE`doecho"-eMPI_REMSH=/usr/bin/rsh-h$node-np1/home/demo/fluent/bin/ansys_inc/v110/ansys/bin/ansysdis110-dis-mpiHPMPI"done>host.listansys110-mpifile./host.list-iwing.inp2024/8/1639創(chuàng)建ma-----------------------------------node22node23------------------------------------需要注意最后有一個(gè)空行。fluent3d–t16–cnf=./ma–p-g–ifluent.jou2024/8/1640fluent.pbs#!/bin/bash#PBS-Nfluent_8cpu#PBS-lnodes=2:ppn=4#PBS-joeNPROCS=`wc-l<$PBS_NODEFILE`cd$PBS_O_WORKDIRfluent3d-t$NPROCS-pib.ibv-cnf=$PBS_NODEFILE-g-im1>&m1_n2p8.out2024/8/1641cfxcfx5solve-defBenchmark.def-par-dist-start-method“HPMPIdistributedParallel”‘node1*2,node2*2’2024/8/1642cfx.pbs#!/bin/bash#PBS-NCFX_8cpu#PBS-lnodes=4:ppn=2CFX_DEF_FILE=Benchmark.def########################################################################Youdon'tneedtomodifythelinesbelow########################################################################PeHostfile2MachineFile(){cat$1|whilereadline;do#echo$linehost=`echo$line`2024/8/1643#addherecodetomapregularhostnamesintoATMhostnamesif[-z$mList];thenmList=$host"*1"elsemList=$mList,$host"*1"fiecho$mListdone}CFX_PBS_NODEFILE="/tmp/cfx_`whoami`_$PBS_JOBID"PeHostfile2MachineFile$PBS_NODEFILE>$CFX_PBS_NODEFILENPROCS=`wc-l$PBS_NODEFILE`cd$PBS_O_WORKDIR/public/software/ansys_inc/v110/CFX/bin/cfx5solve-def$CFX_DEF_FILE-par-dist`tail-n1$CFX_PBS_NODEFILE`-start-method"HPMPIDistributedParallel"2024/8/1644abaqus/public/software/ABAQUS/6.8-PF3/site/abaqus_v6.env-----------------------------------mp_mpi_implementation=HPhpmpipath=driverUtils.locateFile(os.environ.get('ABA_PATH',''),'External/mpi/hpmpi-/bin','mpirun')mp_mpirun_path={HP:hpmpipath}mp_rsh_command='rsh-n-l%U%H%C'mp_host_list=[[‘node1’,8],[‘node2’,8]]-----------------------------------abq68pf3-jexamplecpus=162024/8/1645abaqus.pbs#!/bin/sh#PBS-NABAQUS_4cpu#PBS-lnodes=2:ppn=2#PBS-joeINPUT_FILE="circuit.inp"OUTPUT_FILE="abaqus.log"ABAQUS_EXEC="/public/software/abaqus/Commands/abaqus"ABAQUS_ENV="/public/software/abaqus/6.5-6/site/abaqus_v6.env"#forabaqus/standardABAQUS_STANDARD_MEMORY="4096mb"ABAQUS_PRE_MEMORY="4096mb"ABAQUS_SCRATCH="/tmp"ABAQUS_MP_MODE="THREADS"2024/8/1646#forabaqus/explictABAQUS_MP_MODE="MPI"########################################################################Youdon'tneedtomodifythelinesbelow########################################################################GetNodeList(){np=1whilereadline;dohost=$lineif[!-z$lasthost];thenif[$host=$lasthost];thennp=`expr$np+1`2024/8/1647elseif[-z$mList];thenmList=[\'$lasthost\',$np]elsemList=$mList,[\'$lasthost\',$np]