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1、1會(huì)計(jì)學(xué)Chaper生物體內(nèi)的有機(jī)反應(yīng)生物體內(nèi)的有機(jī)反應(yīng)(1 1)非共價(jià)鍵)非共價(jià)鍵 氫鍵氫鍵 離子鍵離子鍵 范德瓦爾力范德瓦爾力 疏水作用疏水作用(2 2) S-SS-S鍵鍵 維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)中重要的化學(xué)鍵OHONHOOHN氫給體氫受體血紅素(鐵卟啉)NHHCR1CHNOHCR2COO+H2ONHHCR1C+H3NOHCR2COOO-酶(水解)+酶(縮合)C6H12O66O26H2O6CO2酶酶,光重要的有機(jī)代謝反應(yīng)H3CCSACPOH2CCOO-COSACPH2CCCCH3SOOACPACP+酶CO2ACPacyl carrier protein酰基載體蛋白ATP + D葡萄糖酶HOOH
2、HOHHOHCH2HOPOO-O+ADP-OPO-OOPOOO-PO-OOCH2HHOHOHHHONNNNNH2焦磷酸鍵磷酸酯鍵腺嘌呤核苷AMPADPATPHCHHCCOO-COHSCoA甲基丙二酸單酰 CoA激酶HCCHCCOO-HHSOCoAL甲基丙二酸單酰CoA琥珀酸單酰CoAOCO-COHHCOHHPO32-OCO-COHCOHHHPO32-酶酶H2OOCO-COCPO32-HHOCO-COCH3酶3磷酸甘油酸2磷酸甘油酸磷酸烯醇丙酮酸丙酮酸OHOHOHOOHOCHOOOHOHOHOOHOHCOOHOHH2O+鄰羧基苯基D葡萄糖苷o-carboxyphenyl-D-glucosideD
3、葡萄糖鄰羥基苯甲酸K1OHOHOHOOHOCOOHOHCOOHOHOHOHOOHOHH2O+對(duì)羧基苯基D葡萄糖苷p-carboxyphenyl-D-glucosideD葡萄糖對(duì)羥基苯甲酸K2HCH3COre面CHH3COsi面H3CCOHDHS(pro-S)OCCH3HDDre面si面D從si面加成D從re面加成H3CCOHHR(pro-R)D還原氧化NRCONH2NRCONH2HRHS44NAD+NADH在一些酶催化的氧化還原反應(yīng)中,質(zhì)子的加入和消除,都有嚴(yán)格的立體選擇性。CH2HNHOHOHHHOCH2HHOHORHHOOPO-OOPOOO-CONH2NNNNNH2R=H,即NAD+R=P
4、O32-,即NADP+NRCONH2NAD+簡(jiǎn)式是一種重要的電子和質(zhì)子載體NRCONH2NRCONH2DHYADH+CH3CD2OH+H3CCOD+H+NRCONH2DHH3CCOH+H+YADHH3CCOHDH+NAD+NRCONH2HHH3CCOD+H+YADHH3CCOHHD+NAD+(I) R構(gòu)型(II) S構(gòu)型HCH3Ore-面NAD-DOHH3CDHDCH3Ore-面NAD-HOHH3CHDR構(gòu)型S構(gòu)型1、模板效應(yīng)5 3 A T G C G T A T G T A C G C A T A C3 5根據(jù)堿基互補(bǔ)原理發(fā)展起來(lái)的模板分子探針技術(shù),是核酸分析鑒定的重要方法之一。:例如:抗體
5、抗原 酶底物 RNADNA遺傳信息:空間匹配 締合力:氫鍵 靜電引力 堆積作用 疏水作用CCO-OCCHHHHO-OCHCO-OCHCO-O+SDHHH+SDH+CO-OCCHO-O+SDHH琥珀酸脫氫酶琥珀酸復(fù)合體脫氫酶(還原態(tài))富馬酸不發(fā)生脫氫反應(yīng)琥珀酸脫氫酶丙二酸復(fù)合體反應(yīng)1反應(yīng)1反應(yīng)2超分子是生物分子相互識(shí)別和作用的一種特殊中間過(guò)程,幾乎是一切生命現(xiàn)象和過(guò)程的必需階段。如,琥珀酸脫氫酶催化琥珀酸脫氫過(guò)程中,關(guān)鍵是形成脫氫酶琥珀酸“超分子”Yu Liu, Bao-Hang Han, Yun-Ti Chen;Coordination Chemistry Reviews 200202 (20
6、00) 53第四節(jié) 主要的有機(jī)代謝反應(yīng)糖代謝脂代謝蛋白質(zhì)代謝2+Mg ATP -6- ADP 己糖激酶葡萄糖 葡萄糖磷酸 OHOHOHHHOHHOHCH2OPO3HOHCH2OHHCH2OPO3OHHHHOO葡萄糖-6-磷酸果糖-6-磷酸磷酸葡萄糖異構(gòu)酶Mg2+2-2-第一階段 葡萄糖(6C)斷裂變?yōu)?個(gè)磷酸丙糖(3C) 注意,這個(gè)過(guò)程消耗了2個(gè)ATP分子不可逆反應(yīng)一、糖代謝OHCH2OHHCH2OPO3OHHHHOO果糖-6-磷酸OHCH2OPO3HCH2OPO3OHHHHOO果糖-1,6-二磷酸ATP+磷酸果糖激酶Mg2+2-2-2-OHCH2OPO3HCH2OPO3OHHHHOO果糖-1
7、,6-二磷酸CCH2OPO32-CH2OHOHCCCH2OPO32-OHHO二羥丙酮磷酸甘油醛-3-磷酸+醛縮酶2-2-不可逆反應(yīng)反應(yīng)傾向生成磷酸甘油醛,往下以2分子甘油醛-3-P作為底物進(jìn)行HCCCH2OPO32-OHHO甘油醛-3-磷酸NAD+PiHCCCH2OPO32-OHOPO32-O+甘油醛-3-磷酸脫氫酶1,3-二磷酸甘油酸NADH+ H+HCCCH2OPO32-OHOPO32-O1,3-二磷酸甘油酸ADPHCCOOCH2OPO32-OH3-磷酸甘油酸ATP+磷酸甘油激酶Mg2+HCCOOCH2OPO32-OHHCCOOCH2OHOPO32-Mg2+磷酸甘油酸變位酶3-磷酸甘油酸2
8、-磷酸甘油酸HCCOOCH2OHOPO32-2-磷酸甘油酸CCOOCH2OPO32-烯醇化酶磷酸烯醇式丙酮酸CCOOCH2OPO32-ADPCCOOCH3OATP+丙酮酸激酶Mg2+K+,磷酸烯醇式丙酮酸丙酮酸接著,烯醇化酶催化的反應(yīng)使分子內(nèi)部基團(tuán)重排能量重新分布,形成了第二個(gè)高能鍵,共生成2個(gè)ATP分子不可逆反應(yīng) 在無(wú)氧的條件下,丙酮酸在乳酸脫氫酶的催化下,加氫還原生成乳酸,所需的NADH 來(lái)自第二階段的反應(yīng)。CCOOCH3O+NADH H+HCCOOCH3OHNAD+乳酸脫氫酶+丙酮酸乳酸葡萄糖6-磷酸葡萄糖6-磷酸果糖1,6-二磷酸果糖3-磷酸甘油醛1,3- 二磷酸甘油酸3-磷酸甘油酸2
9、-磷酸甘油酸磷酸烯醇式丙酮酸丙酮酸磷酸二羥丙酮乙醛乳酸乙醇己糖激酶磷酸己糖異構(gòu)酶磷酸果糖激酶醛縮酶脫氫酶磷酸甘油酸激酶變位酶烯醇化酶丙酮酸激酶乳酸脫氫酶-ATP-ATP+ATP+ATP糖原1-P-G糖酵解途徑匯總由1分子G在無(wú)氧條件下氧化解,最終產(chǎn)生2分子ATP。如果從糖原開(kāi)始,則可得到3分子ATP注意酵解途徑中的3個(gè)關(guān)鍵酶催化的不可逆反應(yīng).他們是:1. 己糖激酶2. 磷酸果糖激酶3. 丙酮酸激酶RCCHCH2CH2O CROO COROHO CHCH2CH2OHOHRCOHOO3+激素敏感脂肪酶H2O3+脂肪甘油脂肪酸二、脂代謝按糖代謝途徑進(jìn)行分解注意,甘油必須從脂肪組織中轉(zhuǎn)運(yùn)到肝臟分解,因
10、為催化甘油磷酸化的甘油激酶為肝臟、腎中特有上述反應(yīng)過(guò)程中,實(shí)線(xiàn)為甘油的分解, 虛線(xiàn)為甘油的合成。 甘油的分解蛋白質(zhì)的一般分解代謝三、蛋白質(zhì)代謝1、氧化脫氨基作用2、轉(zhuǎn)氨作用3、氨基酸的脫羧作用(decarboxylation)COOCNH2RHHHRCH N+ CO222 脫羧酶磷酸吡哆醛 ATP + D葡萄糖酶HOOHHOHHOHCH2HOPOO-O+ADPH3CCOHDHS(pro-S)OCCH3HDDre面si面D從si面加成D從re面加成H3CCOHHR(pro-R)D還原氧化NRCONH2NRCONH2HRHS44NAD+NADH在一些酶催化的氧化還原反應(yīng)中,質(zhì)子的加入和消除,都有嚴(yán)格的立體選擇性。NRCONH2DHH3CCOH+H+YADHH3CCOHDH+NAD+NRCONH2HHH3CCOD+H+YADHH3CCOHHD+NAD+(I) R構(gòu)型(II) S構(gòu)型第四節(jié) 主要的有機(jī)代謝反應(yīng)糖代謝脂代謝蛋白質(zhì)代謝HCCCH2OPO32-OHHO甘油醛-3-磷酸NAD+PiHCCCH2OPO32-OHOPO32-O+甘油醛-3-磷酸脫氫酶1,3-二磷酸甘
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