pubmed基于臨床方法學的文獻檢索特點

1、的文獻檢索循證醫(yī)學基于臨床方法學 (methodology-based retrieval)特點中國醫(yī)學科學院 中國協(xié)和醫(yī)科大學精品課程建設一、傳統(tǒng)的基于內容的文獻檢索方法 (content-based retrieval)醫(yī)學信息最常用的是 MEDLIN序口 EMBAS兩大數(shù)據(jù)庫，人們在使用這兩個數(shù)據(jù)庫時，通常是根據(jù)主題，也就是以內容為基礎來進行檢索，通過主題檢索一般是輸入藥物、 疾病、 癥狀等， 再用布爾邏輯算符將各個概念組配進行檢索。 人們在進行這些檢索時， 無法區(qū)分證據(jù)級別， 從而檢出大量不相關或低質量文獻。 以內容為基礎的檢索往往只能滿足一般的檢索需求(舉例來說，要求檢索關于AIDS

2、患者體內CD4鈿胞數(shù)預測患者死亡率的文獻，以內容為基礎的檢索較容易滿足這一要求) ，但難以解決有針對，性的臨床需求(如，檢索有關CD4鈿胞數(shù)目較低的AIDS患者開始 Zidovudine 與其它藥物復合使用的高質量文獻，此時以內容為基礎的檢索很難滿足這一要求) 。而事實上，只要我們掌握了臨床試驗的研究方法， 有效地運用方法學檢索詞來控制檢索策略， 就可以走出過去那種泛泛的主題檢索或內容檢索模式， 才能真正為循證醫(yī)學提供準確、專指度高的臨床證據(jù)。二、循證醫(yī)學的基于臨床方法學 (methodology-based retrieval) 的文獻檢索特點(一)檢索過濾器檢索過濾器用于濾過無效或不適用信

3、息， 只保留有助于解決臨床問題的信息。 檢索過濾器包括內置式檢索過濾器和外置式檢索過濾器， 內置式檢索過濾器有較穩(wěn)定的用戶友好檢索界面， 用戶不需掌握復雜的檢索策略， 就可直接檢索到所需的臨床研究文獻， 但用戶不能修改過濾器，如美國國立醫(yī)學圖書館通過 PubMed界面提供的“ clinical query ”檢索策略模型。 外置式檢索過濾器較靈活， 但對用戶要求較高， 用戶需要自己制定具體的檢索策略，選擇相應的檢索詞作為過濾器。(二)的“ clinical queries ”的檢索方法美國國立醫(yī)學圖書館(National Library of Medicine , NLM)!過PubMed的界

4、面提供“clinical queries ”檢索,這是專門為臨床醫(yī)生研究設計的內置的臨床方法學“過濾器” ( Clinical MethodologyFilters ) ， 這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學和生物統(tǒng)計學研究人員Haynes RB等人在1994年提出來的，并進行了查全率和查準率分析。 用戶通過這一臨床方法學檢索過濾器， 不需掌握復雜的檢索策略，即可檢索所需的臨床研究文獻。檢索方法是進入 PubMed 后，點擊界面左邊輔助檢索區(qū)中的“ Clinical Queries ”超鏈接進入（見圖 1 ） 。 Clinical Queries 可以實現(xiàn)兩項功能： 選擇 “ Clinic

5、al Queries using Research MethodologyFilters ”，只需在檢索框中輸入某一疾病名稱（如 Hepatitis B ） ，然后從 “ Category ” 中選擇所要檢索的臨床研究類別， 包括治療 （ therapy ） 、診斷 （diagnosis） 、 病因 （etiology） 和預后 （prognosis） 四方面， 再根據(jù)需要選擇保證查全率的檢索 （檢出的文獻量較多， 但有些文獻可能不相關）或保證查準率的檢索（檢出的文獻量較少，但相關文獻多，不過可能會有一些漏檢文獻），即從“ Emphasis”中選擇 sensitivity （查全率 ） 或“

6、specificity ” （ 查準率 ） 。選擇“ systematic Reviews ”可檢索臨床研究的系統(tǒng)評價文獻，這些文獻中包括PubMed所收錄的期刊上按 Meta 分析方法進行研究的系統(tǒng)評價文獻，還包括Cochrane 協(xié)作網(wǎng)提供的部分系統(tǒng)評價的文摘。圖 1 PubMed 的 Clinical Queriesl 界面（三）用基于臨床方法學（ clinical Methodology ）的檢索策略檢索MEDLINE和 EMBASE我們結合臨床治療、 診斷、 病因學、 預后以及系統(tǒng)評價的關鍵方法學特點和關鍵評價指標來理解clinical queries 中提供的檢索策略，同時也是為推

7、薦將這28組策略作為基本檢索模板應用于MEDLINE的其它檢索界面或EMBAS等其它數(shù)據(jù)庫。下文均以hepatitis 為例作 為內容主題詞，其后組配的方法學策略是相對穩(wěn)定的。1 有關治療方案的檢索模式(1)檢索MEDLINES據(jù)庫保證較高的查全率(sensitivity) 檢索策略(hepatitis ) AND (randomized controlled trial PTYP OR drug therapy SH OR therapeutic use SH:NOEXP OR random* WORD)保證較高查準率(specificity) 的檢索策略(hepatitis) AND (d

8、ouble WORD AND blind* WORD) OR placebo WORD)查全與查準均衡時的檢索策略hepatitis and randomized controlled trialPTYP(2)檢索EMBAS數(shù)據(jù)庫保證較高的查全率(sensitivity) 檢索策略Shepatitis! And (randomized controlled trial or drug therapy orrandom?)保證較高查準率(specificity) 的檢索策略S hepatitis! And (double(w)blind? Or placebo?)查全與查準均衡時的檢索策略She

9、patitis! And controlled study!2 有關診斷方案的檢索模式(1)檢索MEDLIN敵據(jù)庫保證較高的查全率(sensitivity) 檢索策略(hepatitis b) AND (sensitivity and specificity MESH OR sensitivity WORD OR (diagnosis SH OR diagnostic use SH ORspecificity WORD)保證較高查準率(specificity) 的檢索策略(hepatitis b) AND (sensitivity and specificity MESH OR(predict

10、ive WORD AND value* WORD)查全與查準均衡時的檢索策略hepatitis and sensitivity檢索EMBAS數(shù)據(jù)庫保證較高的查全率(sensitivity) 檢索策略S hepatitis and diagnostic accuracy or sensitivity or specificityor diagnosis/de保證較高查準率(specificity) 的檢索策略Shepatitis and diagnostic accuracy or predictive(w)value?查全與查準均衡時的檢索策略Shepatitis and sensitivit

11、y3 有關病因的檢索模式(1)檢索MEDLIN敵據(jù)庫保證較高的查全率(sensitivity) 檢索策略hepatitis AND(cohort studies MESH ORrisk MESH OR(odds WORD ANDratio* WORD) OR(relativeWORDANDrisk WORD) OR(casecontrol* WORD OR case-control studies MESH)保證較高查準率(specificity) 的檢索策略hepatitis AND(case-control studies MH:NOEXPORcohort studies MH:NOEXP

12、)查全與查準均衡時的檢索策略hepatitis and risktw(2)檢索EMBAS數(shù)據(jù)庫保證較高的查全率(sensitivity) 檢索策略Shepatitis and cohort analysis or risk! Or odds(w)ratio? Or relative(w)risk or case(w) control?保證較高查準率(specificity) 的檢索策略Shepatitis and case control study or cohort查全與查準均衡時的檢索策略Shepatitis and risk4 有關預后的檢索模式(1)檢索MEDLIN敵據(jù)庫保證較高的查

13、全率(sensitivity) 檢索策略hepatitis AND(incidence MESH ORmortality MESH ORfollow-up studies MESH OR mortality SH OR prognos* WORD OR predict* WORD OR course WORD)hepatitisAND (prognosis MH:NOEXP OR survival analysisMH:NOEXP)查全與查準均衡時的檢索策略hepatitis and prognosis檢索EMBAS數(shù)據(jù)庫保證較高查全率的 (sensitivity) 檢索策略Shepatiti

14、s AND (incidence! OR mortality! OR prognos? ORcourse)保證較高查準率(specificity) 的檢索策略Shepatitis AND (prognosis OR survival! )查全與查準均衡時的檢索策略Shepatitis AND prognosis5 有關系統(tǒng)評價和指南的檢索模式(1)檢索MEDLIN敵據(jù)庫系統(tǒng)評價的檢索策略hepatitis and (meta-analysisPTYP OR meta-analysismh)指南的檢索策略hepatitis AND (GuidelinesMH OR consensus devel

15、opment conferencesMH) OR GuidelinePTYP OR consensus development conferencesPTYP)(2)檢索EMBAS數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)評價的檢索策略hepatitis and meta-analysis指南的檢索策略hepatitis and practice guideline!(四)用基于臨床方法學(clinicalMethodology )的檢索策略檢索中文生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(CBMdisc)近年來，循證醫(yī)學已成為國際臨床醫(yī)學界倡導的學科發(fā)展趨勢, 我國正逐步引入循證醫(yī)學的思想、理念以及研究和實踐方法。 循證實踐的一個重要前提是要有

16、充分的臨床研究證據(jù)， 盡管外文臨床研究證據(jù)日益豐富， 且可以通過許多便捷的檢索途徑獲取， 但由于人種因素、 經(jīng)濟因素、 地域因素等多種因素的影響， 不是所有的外文證據(jù)都可直接用于中國人群， 因而如何查找和獲取適合于中國人群的國內臨床研究證據(jù)成為國內循證實踐面臨的一個新問題。中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(CBMdisc) 是目前國內臨床界常用的一個綜合型的生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫, 雖然 CBMdisc 收錄了自 1978 年至2003 年以來 1000 多種中國生物醫(yī)學期刊 , 以及匯編、會議論文的文獻題錄 , 總計 2,570,528 條記錄， 但其中只有少量的文章可以作為直接指導臨床實踐的證據(jù), 那么，臨床醫(yī)生如何能省時省力地檢索和利用這些文章呢？由于CBMdisc數(shù)據(jù)庫在其建立之初，循證醫(yī)學的理念還沒有引入我國， 因而迄今為止， 標引人員還沒有對該庫所收錄的數(shù)據(jù)進行循證醫(yī)學臨床方法學的專門標引，即使是CBMdisc 的主要參考模板MED