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1、實(shí)驗(yàn)質(zhì)粒DNA的提取及電泳檢測一實(shí)驗(yàn)?zāi)康耐ㄟ^本實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)掌握堿裂解法提取細(xì)菌質(zhì)粒DNA二實(shí)驗(yàn)原理1 .細(xì)菌中有兩種DNA即染色體DNAF口質(zhì)粒DNA2 .質(zhì)粒DNA的提取方法有三種:堿裂解法,煮沸法,去污劑(如 Triton和 SDS裂解法。3 .堿裂解法比較劇烈,可破壞堿基配對,使宿主細(xì)胞DNAS性,共價(jià)閉合環(huán)狀DNAi于空間纏繞,兩條鏈不會徹底分開。當(dāng)外界條件到達(dá)復(fù)性條件時(shí),質(zhì) 粒DNA勺雙鏈又迅速恢復(fù)原狀,而較大的線性染色體DNA®以復(fù)性。三實(shí)驗(yàn)材料:轉(zhuǎn)化后的細(xì)菌(含有質(zhì)粒的大腸桿菌)四、實(shí)驗(yàn)用具和藥品1 .實(shí)驗(yàn)用具:搖床,離心機(jī),移液器及槍頭,玻璃試管(15mD及塞子,離心管(
2、1.5mL)2 .實(shí)驗(yàn)試劑:(1)溶液I50 mmol/L葡萄糖25 mmol/L三羥甲基氨基甲烷(Tris ) Tris - HCl ( pH8.0)10 mmol/L乙二胺四乙酸(EDTA (pH8.0)(2)溶液II0.4mol/L NaOH , 2%SDS用前等體積混合(3)溶液 III 5 mol/L乙酸鉀 60ml冰乙酸 11.5ml水28.5ml(4) TE緩沖液10 mmol/L Tris - HCl (pH8.0)1 mmol/L EDTA (pH8.0)(5) 70%S醇(放-20C冰箱中,用后即放回)(6)加樣緩沖液(6X): 40姍糖、0.25%澳酚蘭(7)電泳緩沖液:
3、0.045mol/L Tris- 硼酸 0.001mol/L EDTA (0.5X TBE精品buffer )精品電泳緩沖液貯存液:5X: 54g Tris 堿、27.5g 硼酸、20ml 0.5mol/L EDTApH8.0)五實(shí)驗(yàn)步驟(一)細(xì)菌繁殖挑取白色的單菌落若干,轉(zhuǎn)移到3mL液體LB培養(yǎng)基(附加100mg/mlAmp ),37 C過夜振蕩(200r/min ) 培養(yǎng)0(二)菌體收集將過夜培養(yǎng)的菌體轉(zhuǎn)入1.5mL離心管,離心30sec 5000r/min ;棄上清提取質(zhì)粒 (三)質(zhì)粒提取方法一:堿裂解法提取質(zhì)粒 DNA1 .將上述沉淀重懸于250仙L冰預(yù)冷的溶液I中,劇烈震蕩;2 .加
4、入250仙1溶液11,蓋緊管口,快速顛倒離心管 510次;3 .加入350 pL冰預(yù)冷的溶液田,蓋緊管口,溫和地顛倒離心管510次;9000r/min 離心5min上清轉(zhuǎn)移到另一新1.5mL離心管中;4 .加等體積氯仿,振蕩混合,靜置,9000r/min離心5min,上清轉(zhuǎn)移到另一新1.5mL離心管中;5 .加入1/10體積3mol/L的醋酸鈉和2倍體積的乙醇,充分混勻,靜置 5min; 9000r/min 離心 5min;6 .棄上清,用70% ethanol洗滌;7 .力口 30仙LTE溶解,-20 C保存。方法二:試劑盒提取方法1 .離心收集的菌體中加入含 RNAase的溶液I 250仙
5、L,重懸菌體,不應(yīng)留有小的 菌塊;2 .加溶液11 250 H L,輕輕顛傕J離心管4-6次,使菌體充分裂解,至溶液澄清;3 .加入350 pL冰預(yù)冷的溶液加,溫和并充分地上下翻轉(zhuǎn)混合6-8次;4 . 12000r/min 離心 10min;5 .將上清轉(zhuǎn)移到 DNAg合管(置于2 ml離心管中),12000r/min離心1min, 棄濾液;6 .將制備管置回離心管,加入去蛋白試劑 500仙L, 12000r/min離心1min,棄 濾液精品7 .將制備管置回離心管,加洗滌液 700 L, 12000r/min離心1min,棄濾液; 以同樣的方法再用700洗滌液洗滌一次,棄濾液。8 .將制備管置回2 ml離心管中,12,000 xg離心1 min ,去除殘余的洗滌液; 10將DNA吉合柱放入另一個(gè)新的1.5mL離心管中,在制備管膜中央加60-80 洗脫液或去離子水,室溫靜置 1 min o 12,000 Xg離心1 min。(四)檢測提取DNA&量的電泳檢測。取4ul質(zhì)粒DNA+2ul力口樣緩沖液+6ul ddH2O;配制1%勺瓊脂糖凝膠電泳30min, EB染色,拍照。注意事項(xiàng):氯仿對眼睛、皮膚、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌劑并可 損傷肝臟和腎臟,操作時(shí)需戴手
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