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文檔簡介
1、Good is good, but better carries it.精益求精,善益求善。fenzi-PART:重要過程和名詞解釋常識(shí):Cvalue(C值):某一物種單倍體基因組中DNA的總量。epi-genetics:Thestudyofepigeneticinheritanceisknownasepigenetics.Epigeneticinheritanceisthetransmissionofinformationfromacellormulticellularorganismtoitsdescendantswithoutthatinformationbeingencodedinth
2、enucleotidesequenceofthegenes.Epigeneticchangesinfluencethephenotypewithoutalteringthegenotype.Theyconsistofchangesinthepropertiesofacellthatareinheritedbutthatdonotrepresentachangeingeneticinformation.可以表述為,親代與子代間不依賴核酸的(遺傳)信息傳遞。R-loopingexperiment:將mRNA與單鏈DNA雜交,雜交后的分子中,部分DNA序列無法與mRNA配對,形成了單股DNA的loo
3、p。R-looping這個(gè)技術(shù)中所謂的R-loops就是在DNA-RNAduplex當(dāng)中無法和mRNA互補(bǔ)的DNA片段所形成的單股DNA的loop.該實(shí)驗(yàn)證實(shí)了intron的存在。Histone:組蛋白帶正電荷,含Arg,Lys,屬堿性蛋白,其含量恒定,在真核細(xì)胞中組蛋白共有5種,分為兩類:一類是高度保守的核心組蛋白(corehistone)包括H2A、H2B、H3、H4四種;另一類是可變的連接組蛋白(linkerhistone)即H1。核心組蛋白的結(jié)構(gòu)是非常保守,特別是H4。核心組蛋白高度保守的原因可能有兩個(gè):其一是核心組蛋白中絕大多數(shù)氨基酸都與DNA或其它組蛋白相互作用,可置換而不引起致命
4、變異的氨基酸殘基很少;其二是在所有的生物中與組蛋白相互作用的DNA磷酸二酯骨架都是一樣的。四種核心組蛋白均由球形部和尾部構(gòu)成,球形部借Arg殘基與磷酸二酯骨架間的靜電作用使DNA分子纏繞在組蛋白核心周圍,形成核小體。尾部則含有大量賴氨酸和精氨酸殘基,為組蛋白翻譯后進(jìn)行修飾的部位,如乙?;⒓谆?、磷酸化等。H1不僅具有屬特異性,而且還有組織特異性,所以H1是多樣性的。Non-histone:與組蛋白不同,非組蛋白是染色體上與特異DNA序列結(jié)合的蛋白質(zhì),所以又稱序列特異性DNA結(jié)合蛋白,非組蛋白的特性是:含有較多的天冬氨酸、谷氨酸,帶負(fù)電荷,屬酸性蛋白質(zhì);整個(gè)細(xì)胞周期都進(jìn)行合成,不象組蛋白只在S
5、期合成,并與DNA復(fù)制同步進(jìn)行;能識(shí)別特異的DNA序列,識(shí)別信息存在于DNA本身,位點(diǎn)在大溝部分,識(shí)別與結(jié)合借助氫鍵和離子鍵。非組蛋白的功能是:幫助DNA分子折疊,以形成不同的結(jié)構(gòu)域,從而有利于DNA的復(fù)制和基因的轉(zhuǎn)錄;協(xié)助啟動(dòng)DNA復(fù)制;控制基因轉(zhuǎn)錄,調(diào)節(jié)基因表達(dá)。Non-histonescaffolding:多線染色體中基本染色質(zhì)纖維構(gòu)成染色粒的部位存在著染色粒骨架(chromomericscaffold),染色粒骨架由非組蛋白構(gòu)成,它可能在染色粒形成和染色粒聚集成帶等過程中發(fā)揮作用。染色體支架chromosomescaffold也稱染色體骨架,是細(xì)胞中期染色體經(jīng)2mol/LNaCl或硫酸
6、葡聚糖加肝素處理后,除去組蛋白和大部分非組蛋白后所留下的由非組蛋白構(gòu)成的染色體的骨架結(jié)構(gòu)。Domainswappingexperiment:基因組DNA序列的分類1基因序列和非基因序列:(1)基因序列是指基因組里決定蛋白質(zhì)(或RNA產(chǎn)物)的DNA序列。ATG開始,終止密碼子結(jié)束。(2)非基因序列是基音組中除基因以外的所有DNA序列,主要是兩個(gè)基因間的插序列。2編碼序列和非編碼序列:(1)編碼序列是指編碼RNA和蛋白質(zhì)的DNA序列(不含內(nèi)含子)。(2)非編碼序列包括內(nèi)含子序列(introns)及居間序列(spacersequences)的總和。3單一序列和重復(fù)序列(1)單一序列(unique)是
7、基因組里只出現(xiàn)一次的DNA序列。(非基因序列中也有單一序列),復(fù)性時(shí)間很慢。(2)重復(fù)序列(repetitive)是在基因組中重復(fù)出現(xiàn)的DNA序列?;蚪M內(nèi)的重復(fù)序列有的是散在分布,有的是成簇存在。重復(fù)序列又可分為:Tandemlyrepeatedsequences,dispersedrepeatedsequences.Tandemlyrepeatedsequences又分為:A低度重復(fù)序列:一般指個(gè)基因組內(nèi)有幾個(gè)到幾百個(gè)拷貝。如某些物種的組蛋白基因和rRNA、tRNA基因。B高度重復(fù)序列:真核生物的端粒和中心粒。Dispersedrepeatedsequences:基因序列:低拷貝數(shù)(5%的
8、人基因可在不同的組織或生理狀態(tài)下,通過選擇性剪接產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)異構(gòu)體,這是造成真接生物高度異質(zhì)性的基礎(chǔ)。rRNAselfsplicing:不需要其他酶參與,由rRNA(核酶)自身催化發(fā)生的RNA剪接反應(yīng)。四膜蟲pre-rRNA的自剪接:(groupintron)5端斷開,在暴露的intron5端添加一個(gè)G;3端斷開;外顯子連接;lariatintron(套索狀內(nèi)含子)斷開,生成一個(gè)線性片段和一個(gè)環(huán)狀片段。pre-rRNA自剪接的特點(diǎn):需要鳥苷酸(G)的3-OH;歷經(jīng)3次二酯鍵的轉(zhuǎn)移自剪接反應(yīng)的進(jìn)行與pre-rRNA的濃度無關(guān)。RNAediting:轉(zhuǎn)錄之后RNA水平上序列的改變。是一種與mR
9、NA剪接不同的加工方式,指mRNA在轉(zhuǎn)錄后因插入、刪除或替換核苷酸,改變了DNA模板來源的遺傳信息,從而翻譯出氨基酸序列不同的多種蛋白質(zhì),RNA編輯的例子:堿基替換CU;插入或刪除UMP反密碼子5端堿基密碼子3端堿基GUorCCGAUUAorGI(inosine)A,UorC翻譯Codondegeneracy(密碼子簡并性):多個(gè)密碼子可以編碼同一種氨基酸。密碼子的第三個(gè)堿基上的變化往往不會(huì)改變它所代表的氨基酸。Wobblehypothesis(擺動(dòng)假說):1966年,Crick根據(jù)立體化學(xué)原理提出擺動(dòng)假說(wobblehypothesis),解釋了遺傳密碼的簡并性以及反密碼子中某些稀有成分如
10、I。一個(gè)tRNA的5末端通過與密碼子第三個(gè)堿基非尋常配對(不是G:C,A:T)而識(shí)別不止一個(gè)密碼子。C和A的配對比較專一Translationinitiationprocess:mRNA中的密碼子由帶有反密碼子的氨酰tRNA識(shí)別。一種特別的起始tRNA(在原核生物中為fMet-tRNAf,在真核生物中為Met-tRNAi)識(shí)別AUG密碼子。只有UAA,UAG和UGA這些終止密碼子不被氨酰tRNA識(shí)別。核糖體在自由態(tài)(分離的大、小亞基)與結(jié)合態(tài)間處于平衡。小亞基與mRNA結(jié)合,然后與大亞基結(jié)合生成完整的核糖體進(jìn)行蛋白質(zhì)的合成。翻譯起始位點(diǎn)的識(shí)別:在原核生物中,16SrRNA3端的一段序列識(shí)別出位
11、于mRNA起始密碼子上游的Shine-Dalgarno序列(5-AGGAGG-3)。在真核生物中,真核生物的40S核糖體亞基先與mRNA的5端帽子結(jié)合,然后搜索mRNA直到遇到起始位點(diǎn),再與大亞基結(jié)合。原核生物的翻譯起始涉及3種IFs(initiationfactors啟動(dòng)因子)的作用。IF-1使tRNA不能進(jìn)入Asite.IF-2是fMet-tRNA與30S亞基結(jié)合所必需的,并使其進(jìn)入Psite。IF-3是30S亞基與mRNA結(jié)合所必需的,防止與大亞基的結(jié)合。先形成IF-2/fMet-tRNA和IF3/mRNA/30S亞基這兩個(gè)復(fù)合物。兩個(gè)復(fù)合物和IF1、GTP形成30S啟動(dòng)復(fù)合體。IF-3
12、被釋放,50S亞基結(jié)合上來,GTP水解使IF-1和IF-2釋放。Met-tRNA-fMet進(jìn)入Psite與AUG起始密碼子結(jié)合。ProkaryoticinitiationfactorsEukaryoticinitiationfactorsfunctionIF-1eIF1ABlocksribosomeAsiteIF-2eIF2eIF5bFacilitateinitiatortRNAbindingtotheP-siteofsmallsubunitIF-3eIF3PreventsribosomesubunitassociationeIF1eIF4AeIF4BeIF4GeIF4EPreparemRNA
13、templateforribosomebinding啟動(dòng)階段的具體步驟如下:(1)30S亞基在IF3與IF1的促進(jìn)下與mRNA的啟動(dòng)部位結(jié)合,在IF2的促進(jìn)與IF1輔助下與fMet-tRNA以及GTP結(jié)合,形成30S啟動(dòng)復(fù)合體。30S啟動(dòng)復(fù)合體由30S亞基、mRNA、fMet-tRNAfMet及IF1、IF2、IF3與GTP共同構(gòu)成。(2)30S啟動(dòng)復(fù)合體一經(jīng)形成,IF3即行脫落,50S亞基隨之與其結(jié)合,形成了大、小亞基,mRNA,fMettRNAfMet及IF1、IF2與GTP共同構(gòu)成的70S啟動(dòng)前復(fù)合體。(3)70S啟動(dòng)前復(fù)合體的GTP水解釋放出GDP與無機(jī)磷酸的同時(shí),IF2和IF1隨之脫
14、落,形成了啟動(dòng)復(fù)合體。至此,已為肽鏈延長作好了準(zhǔn)備。啟動(dòng)復(fù)合體由大、小亞基,mRNA與fMettRNAfMet共同構(gòu)成eIF4E,eIF4G,eIF4A,eIF4B與mRNA的5端的帽子結(jié)合。HelicaseactivityofeIF4Bhelps40Ssubunitsseatonthestartcodon.ThentheinitiatortRNAisboundbyanothergroupoffactors.Afterthisinitialbinding,thesmallsubunitscansthemRNAuntilitrecognizesthecorrectAUGcodon.Atthisp
15、oint,initiationfactorsarereleasedandthe60Ssubunitjoinsthecomplex.Translationelongationprocess:Psite:多肽-tRNAAsite:氨酰-tRNAPsite的多肽鏈被轉(zhuǎn)移到位于Asite的氨酰-tRNA上,在Psite產(chǎn)生去?;膖RNA,在Asite產(chǎn)生多肽-tRNA。然后EF-G-GTP與核糖體結(jié)合,GTP水解的能量使多肽-tRNA從Asite移動(dòng)到Psite,同時(shí)核糖體移位到mRNA的下一個(gè)密碼子。ProkaryoticEFfactorsareinvolvedinelongation.EF-Tu
16、bindsaminoacyl-tRNAtothe70Sribosome.GTPishydrolyzedwhenEF-Tuisreleased,andEF-TsisrequiredtoregeneratetheactiveformofEF-Tu.EF-Gisrequiredfortranslocation.BindingoftheEF-TuandEF-Gfactorstoribosomesismutuallyexclusive,whichensuresthateachstepmustbecompletedbeforethenextcanbestarted.Signalpeptide:蛋白質(zhì)上負(fù)責(zé)
17、共轉(zhuǎn)移進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的區(qū)域(通常是N-端)。調(diào)控:house-keepinggenes:是維持細(xì)胞最低限度功能所不可少的基因,如編碼組蛋白基因、編碼核糖體蛋白基因、線粒體蛋白基因、糖酵解酶的基因等。這類基因在所有類型的細(xì)胞中都進(jìn)行組成性表達(dá),因?yàn)檫@些基因的產(chǎn)物對于維持細(xì)胞的基本結(jié)構(gòu)和代謝功能是必不可少的。PolycistronicmRNA多順反子:在原核生物中一個(gè)mRNA分子可能為幾條多肽鏈編碼。如果只為一條肽鏈編碼則這種mRNA稱為單順反子mRNA(monocistronicmRNA);為兩條以上的不同肽鏈編碼的mRNA稱為多順反子mRNA(polycistronicmRNA)。Inducer
18、(誘導(dǎo)物):通過與調(diào)控蛋白結(jié)合激活基因轉(zhuǎn)錄的小分子。Operon(操縱子):是原核生物基因表達(dá)和調(diào)控的一個(gè)完整單位,包括結(jié)構(gòu)基因,調(diào)節(jié)基因,operator和promoter等結(jié)構(gòu)。Inducibleoperon:Aninducibleoperonisexpressedonlyinthepresenceofaspecificsmallmolecule(theinducer).只有在誘導(dǎo)物存在的情況下才進(jìn)行表達(dá)的操縱子。Gene8repressibleoperon:Arepressibleoperonisexpressedunlessthesmallmoleculeco-repressorisp
19、resent.只有在小分子co-repressor存在下才不表達(dá)的操縱子。Aco-repressorisasmallmoleculethattriggersrepressionoftranscriptionbybindingtoaregulatorprotein.Gene8Cataboliterepression(分解代謝物阻遏):由于葡萄糖增加引起細(xì)菌的一些操縱子表達(dá)降低。是cAMP水平降低使CAP調(diào)控蛋白質(zhì)失活所導(dǎo)致。Polareffectoflacoperonexpression:lacoperon的上游基因(如lacZ)發(fā)生無義突變(nonsensemutation),使下游的基因無法
20、得到表達(dá)。polarmutation(極性突變):在一個(gè)操縱的上游發(fā)生突變,致使下游所有基因均不能表達(dá).Attenuation:Attenuationdescribestheregulationofbacterialoperonsbycontrollingterminationoftranscriptionatasitelocatedbeforethefirststructuralgene.一種細(xì)菌操縱子的調(diào)控方式,在位于第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因之前的位點(diǎn)控制轉(zhuǎn)錄的終止。Gene8Basaltranscription(基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄):是由一般轉(zhuǎn)錄起始因子的內(nèi)在能力形成活性的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物前體所引發(fā)的轉(zhuǎn)錄。不
21、涉及與enhancer、silencer之類元件的相互作用。Basaltranscriptionfactor(基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子):真核基因轉(zhuǎn)錄除RNA聚合酶外還需要許多蛋白轉(zhuǎn)錄因子參加,其中一些轉(zhuǎn)錄因子是RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄起始必需的,并且可以維持基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄,因此稱為基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子。RNA聚合酶II的普通轉(zhuǎn)錄因子(TFII):包括TFIID,TFB,TFIIF,TFIIE,TFIIH,TFIIA等TFIID是由TATA盒結(jié)合蛋白(TATAbindingprotein,TBP)和8種TBP協(xié)同因子(TBPassociatedfactor,TAF)組成的復(fù)合物,TFIID可識(shí)別和結(jié)合核心啟動(dòng)子(TATA
22、盒和啟動(dòng)元件Inr);TFB的C端與TFIID和DNA的復(fù)合物結(jié)合,N-端與TFF協(xié)同作用募集RNA聚合酶II,再加上TFIIE,TFIIH形成完整的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物。TFIIH有蛋白激酶活性,可使RNAPol最大亞基CTD磷酸化,使轉(zhuǎn)錄起始過渡到轉(zhuǎn)錄延伸TFIIA有助于TFIID與TATA盒核心啟動(dòng)子結(jié)合TAF的作用:TFIID中包括至少8種TBP協(xié)同因子,分子量為30250kD,分別命名為TAF-30250TAF150識(shí)別起始子(1nr)序列TAF是基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的輔助因子,它的作用是通過與多種轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子(激活物或阻遏物)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控結(jié)構(gòu)域結(jié)合,而介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄激活或抑制。Feedbackinhibit
23、ion:Feedbackinhibitiondescribestheabilityofasmallmoleculeproductofametabolicpathwaytoinhibittheactivityofanenzymethatcatalyzesanearlierstepinthepathway.代謝產(chǎn)物對代謝途徑上游的酶活性產(chǎn)生抑制。Enhancer(增強(qiáng)子):是一個(gè)順式作用序列,能夠提高一些真核生物啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄效率。Silencer:AsilencerisashortsequenceofDNAthatcaninactivateexpressionofageneinitsvicinit
24、y.Gene8的定義。Silencer是能夠抑制它附近的基因表達(dá)的一小段DNA。PromotersregionoffourdifferentRNAs(prokaryoteandeukaryote):Prokaryotes:-35:CATbox5-TTGACA-3-10:TATAbox5-TATAAT-3Eukaryotes:mRNA:含有TATAbox,可以與TFD的TBP(TATAbindingprotein)結(jié)合。其他調(diào)控元件:GCbox,CAATbox等。轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)Py2CAPy5,第一個(gè)被轉(zhuǎn)錄的堿基幾乎總是嘌呤,多數(shù)情況下是A。tRNA&5SrRNA:promoter位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)下
25、游、基因內(nèi)部,稱為internalcontrolregion(ICR)。ICR有2個(gè)功能域:BoxA,BoxC。轉(zhuǎn)錄因子有TFA,TFB,TFC。TFB不與DNA結(jié)合。RNApolymerase在boxA上游約50bp處啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄。rRNA(18S,5.8S,28S):在corepromoter的上游有控制元件(upstreamcontrolelement)Trans-dominance:AgeneorDNAsequencecancontrolgenesondifferent,noncontiguouspieceofDNA.一個(gè)基因或DNA序列可以對與它處在不同的、不毗連的DNA上的基因起到調(diào)控
26、作用。Cis-dominance:AgeneorDNAsequencecontrollingonlygenesthatareonthesamecontiguouspieceofDNA.一個(gè)基因或DNA序列只對與它處于同一條毗連的DNA上的基因起到調(diào)控作用。Coordinateregulation(協(xié)同調(diào)控):在一條代謝途徑中依次起作用的一組酶一同受到調(diào)控,要么全表達(dá),要么全不表達(dá)。如LacZ,LacY,LacADeadenylation-dependentdecay:mRNA通過脫腺苷化作用,使3端的poly-A尾巴不斷縮短,直到poly-A尾巴不能再與PAB(poly-Abindingpro
27、tein)結(jié)合。爾后5端的帽子被除去,mRNA從5-3的方向被外切酶降解。N-endrule:泛素(ubiquitin)識(shí)別蛋白質(zhì)的N端氨基酸序列。每一種蛋白質(zhì)都有壽命特征,稱為半衰期(half-life)。蛋白質(zhì)的半衰期與多肽鏈N-端特異的氨基酸有關(guān),它們對蛋白質(zhì)的壽命有控制作用。蛋白質(zhì)N-末端與半衰期的關(guān)系,稱為N端規(guī)則。Temperatephage:有些噬菌體感染細(xì)菌后不增殖,不裂解細(xì)菌,其核酸整合到細(xì)菌染色體DNA上,成為細(xì)菌DNA的一部分,并能與細(xì)菌染色體一起復(fù)制,當(dāng)細(xì)菌分裂時(shí)又能傳至子代細(xì)菌。這種狀態(tài)稱為溶原狀態(tài)(lysogeny)。這類噬菌體稱為溫和噬菌體(temperateph
28、age)。整合在細(xì)菌染色體上的噬菌體核酸又稱為前噬菌體(prophage)。染色體上帶有前噬菌體的細(xì)菌稱為溶原性細(xì)菌(lysogenicbacteria)。phageNanti-termination:E.coli噬菌體則采用依賴于因子的終止以及通過抗終止因子的抗終止作用來控制不同階段的基因的表達(dá)。噬菌體共有四個(gè)操縱子:阻遏蛋白操縱子;左向早期操縱子;右向早期操縱子;(右向)晚期操縱子;阻遏蛋白操縱子只含有一個(gè)基因即c基因,其產(chǎn)物為阻遏蛋白。左向早期操縱子主要編碼與重組有關(guān)的蛋白質(zhì)。右向早期操縱子主要編碼與DNA復(fù)制有關(guān)的蛋白質(zhì)。晚期操縱子編碼裂解周期所需的蛋白質(zhì),主要為噬菌體頭部的結(jié)構(gòu)蛋白,
29、還有溶菌酶等裂解寄主細(xì)胞的酶類。晚期操縱子是十分龐大的操縱子,包含20多個(gè)基因。在兩個(gè)早期操縱子內(nèi),并非各產(chǎn)生一個(gè)mRNA。左向早期操縱子可以轉(zhuǎn)錄出兩種mRNA;右向早期操縱子則可以轉(zhuǎn)錄出三種mRNA。這是由于依賴于因子的終止作用以及早期基因所編碼的抗終止蛋白的抗終止作用而造成的。在左向早期操縱子中有一個(gè)依賴于因子的終止子tL1,E.coliRNA聚合酶從PL轉(zhuǎn)錄至此產(chǎn)生mRNAL1。在右向早期操縱子中,有兩個(gè)依賴于因子的終止子tR1、tR2。和一個(gè)對于抗終止作用不敏感的終止子tR3。寄主RNA聚合酶從PR開始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生mRNAR1。L1為immediateearlyphase基因N的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物;
30、R1為immediateearlyphase基因cro的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。兩個(gè)早期操縱子的其余基因稱為lateearlyphase基因。由于immediateearlyphase基因N的表達(dá),其產(chǎn)物蛋白質(zhì)N(以下寫作pN)能夠阻礙tR1、tR2、tR3的終止作用,才能夠使早期操縱子中的lateearlyphase基因得以表達(dá)。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物分別為L2、R2、R3。晚期操縱子從PR,開始轉(zhuǎn)錄,在一個(gè)依賴于因子的tR處終止轉(zhuǎn)錄。由于mRNAR3中Q基因的表達(dá),使轉(zhuǎn)錄在tR4處不再終止,以使整個(gè)晚期基因得以轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生mRNAR5。蛋白質(zhì)N和Q即為抗終止因子,又稱為抗終止蛋白。pN和pQ這兩個(gè)抗終止因子的作用具有離度
31、的特異性。pN主要作用于tL1和tR1這兩個(gè)依賴于因子的終止子,然而pN對寄主的依賴于因子的終止子卻不起作用。如果用寄主的依賴于因子的終止子取代噬菌體的tL1或tR1,pN則又能產(chǎn)生抗終止作用。這說明pN的抗終止信號不在終止子上,而是在終止子的上游某段序列上?,F(xiàn)已證明,pN有兩個(gè)抗終止信號,一個(gè)是nutL,緊接著PL;另一個(gè)是nutR,緊靠tR1。其中nut即為蛋白質(zhì)N利用位點(diǎn)的意思(pNutilization)。也就是說,兩mut位點(diǎn)對于pN所控制轉(zhuǎn)錄的基因(N和cro)的相對位置是極不相同的。mutL位于N基因開頭,而mutR則位于cro基因末尾。兩個(gè)nut位點(diǎn)均為17bp的序列。左右兩個(gè)
32、nut的序列只相差一個(gè)堿基對,每個(gè)序列中都包含5bp的反向重復(fù)序列AGCCCTGAAPuAAGGGCATCGGGACTTPyTTCCCGTpN生成以后,首先結(jié)合于nut位點(diǎn)。當(dāng)RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄通過nut位點(diǎn)時(shí),pN便與RNA聚合酶結(jié)合而修飾了RNA聚合酶的構(gòu)象,使之不再識(shí)別終止子tL1或tRlswitchfromlysogenictolyticgrowth:Cro蛋白取代C占據(jù)了主導(dǎo)地位,占據(jù)了PRM和PR中的operators。Cro蛋白和C蛋白對OR1,OR2,和OR3的親和力順序相反。噬菌體的操縱基因OR和OL各有3個(gè)能和阻遏物結(jié)合的位點(diǎn)OR1,OR2,OR3,OL1,OL2,OL3。每
33、個(gè)位點(diǎn)由17bp組成。C的N端以H-T-H的形式與DNA的大溝結(jié)合。Cro蛋白也是一種阻遏蛋白,以二聚體的形式與操縱基因結(jié)合,但Cro最易和OR3結(jié)合,而CI最容易與OR1,OR2結(jié)合,Cro無協(xié)同效應(yīng)。C蛋白對Cro基因的轉(zhuǎn)錄起負(fù)控制的作用,而對C基因本力的轉(zhuǎn)錄起著正負(fù)控制雙重作用。這是由于C的維持啟動(dòng)子PRM和PR部分重迭,當(dāng)C蛋白濃度高時(shí)與OR1,OR2,OR33個(gè)位點(diǎn)結(jié)合,同時(shí)也抑制了PRM轉(zhuǎn)錄,起負(fù)調(diào)節(jié)作用;當(dāng)CI蛋白濃度低時(shí)只和OR1,OR2結(jié)合,空出了OR3,促進(jìn)RNA聚合酶與PRM結(jié)合,起正調(diào)節(jié)的作用。Cro蛋白最易和OR3結(jié)合,所以對C基因和cro基因只起負(fù)控制作用。C蛋白能
34、激活C的建立溶原化啟動(dòng)子PRE,整合酶啟動(dòng)子PI以及反終止蛋白Q的反義RNA動(dòng)子PAQ,這些啟動(dòng)子的激活卻對溶原化有利。噬菌體也具有反義的mRNA調(diào)節(jié)的機(jī)制。一是PRE啟動(dòng)子,其轉(zhuǎn)錄方向與cro基因的轉(zhuǎn)錄方向相反,其5端和cro基因的mRNA重疊,可進(jìn)行反義抑制cro的表達(dá);二是PaQ啟動(dòng)子,轉(zhuǎn)錄一段長約200b的RNA,不編碼蛋白,而和抗終止蛋白Q的mRNA5端互補(bǔ),起到反義抑制的作用。噬菌體有2個(gè)抗終止基因N和Q,它們的產(chǎn)物可在一定的位置和RNA聚合酶結(jié)合,使其順利通過immediateearlyphase和lateearlyphase轉(zhuǎn)錄的終止子,有利于宿主的裂解。C蛋白:affinit
35、yOR3OR2OR2OR1Cro蛋白先與OR3和OL3結(jié)合,阻斷了C基因的進(jìn)一步表達(dá),使Cro蛋白的作用占主導(dǎo)。同時(shí)引發(fā)從PR和PL的基因表達(dá),產(chǎn)生N,Cro,Q等蛋白,進(jìn)入裂解途徑。同源框(homeobox):同源異型基因中一段高度保守的DNA序列,最初是通過對果蠅的同源異型突變和體節(jié)突變體的雜交分析發(fā)現(xiàn)的。同源框由180個(gè)堿基對組成的序列,可編碼60個(gè)氨基酸。同源框普遍存在于果蠅、鼠、人、蛙等生物中。Thehomeoboxcodesfora60aminoacidproteindomainthatisaDNA-bindingmotif.同源異型基因(homeoticgene):一類含有同源框
36、的基因。在胚胎發(fā)育中的表達(dá)水平對于組織和器官的形成具有重要的調(diào)控作用。該類基因的突變,就會(huì)在胚胎發(fā)育過程中導(dǎo)致某一器官異位生長,即本來應(yīng)該形成的正常結(jié)構(gòu)被其他器官取代了。例如,果蠅的同源異型基因Antp(觸角基因)的突變,導(dǎo)致果蠅的一對觸角被兩條腿所取代。同源基因不僅存在於果蠅,也存在其他動(dòng)物,包括哺乳類。這些基因的產(chǎn)物皆為基因調(diào)控蛋白質(zhì)。他們彼此相近似,皆包含一段在演化上相當(dāng)保守的順序,稱為同源框(homeobox)順序,它們規(guī)范一段約60個(gè)氨基酸,可以與DNA相結(jié)合的同源結(jié)構(gòu)區(qū)(homeodomain)(簡稱HOM。在哺乳類則稱為Hox)。已發(fā)現(xiàn)的Hox基因的產(chǎn)物基本上都是轉(zhuǎn)錄因子,同源框
37、的蛋白產(chǎn)物呈螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(helix-turn-helix)的立體構(gòu)型,可以和DNA雙螺旋的主溝吻合,附著于鄰近于TAAT的堿基,由于它能識(shí)別所控制的基因啟動(dòng)子的特異序列,從而在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá)。homeodomain:ThehomeodomainisaDNA-bindingmotifthattypifiesaclassoftranscriptionfactors.一類轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合域(helix-turn-helix)。TheDNAsequencethatcodesforitiscalledthehomeobox.Steriodhormoneresponseelements(H
38、REs):能夠與類固醇激素受體(steroidhormonereceptorSHR)結(jié)合的DNA序列,能夠啟動(dòng)特定基因的轉(zhuǎn)錄。Generegulationbysteroidhormone:細(xì)胞內(nèi)受體的本質(zhì)是激素激活的基因調(diào)控蛋白。細(xì)胞內(nèi)受體與抑制性蛋白(如Hsp90)結(jié)合形成復(fù)合物,處于非活化狀態(tài)。配體(如皮質(zhì)醇)與受體結(jié)合,將導(dǎo)致抑制性蛋白從復(fù)合物上解離下來,從而受體通過暴露它的DNA結(jié)合位點(diǎn)而被激活。因此,這類受體一般都有3個(gè)結(jié)構(gòu)域:位于C端的激素結(jié)合位點(diǎn);位于中部富含Cys、具有鋅指結(jié)構(gòu)的DNA結(jié)合位點(diǎn);位于N端的轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域。膽固醇類激素是親脂類小分子,可以通過簡單擴(kuò)散跨越質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)
39、胞內(nèi)。膽固醇類激素與胞內(nèi)蛋白受體結(jié)合,形成激素受體復(fù)合物,并能穿過核孔進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi)。激素和受體的結(jié)合導(dǎo)致受體蛋白構(gòu)象的改變,提高了受體與DNA的結(jié)合能力,激活的受體通過結(jié)合于特異的DNA調(diào)節(jié)序列調(diào)節(jié)基因表達(dá)。受體與DNA結(jié)合的序列是受體依賴的enhancer,這種結(jié)合可增加某些相鄰序列的轉(zhuǎn)錄水平。RNAinterference:是指與內(nèi)源性mRNA編碼區(qū)某段序列同源的雙鏈RNA分子(double-strandedRNA,dsRNA)導(dǎo)入細(xì)胞時(shí),該mRNA發(fā)生特異性的降解,導(dǎo)致基因表達(dá)的沉默antisenseRNA:與被調(diào)控的RNA或DNA的序列互補(bǔ)的RNA。轉(zhuǎn)座子:Transpossiblee
40、lements:在基因組中的位置可以移動(dòng)的元件。Replicativetransposition:指復(fù)制型轉(zhuǎn)座子的移動(dòng),其機(jī)制是首先它被復(fù)制,然后其一個(gè)拷貝轉(zhuǎn)移到新位點(diǎn)。Nonreplicativetransposition(非復(fù)制型轉(zhuǎn)座):指轉(zhuǎn)座子將供體部位序列直接移到新的位點(diǎn)(通常產(chǎn)生一個(gè)雙鏈斷口)。Compositetransposons是一類帶有某些抗藥性(或其他宿主基因)的轉(zhuǎn)座子,兩個(gè)插入序列(IS)包圍著一段中央?yún)^(qū)域。轉(zhuǎn)座酶由1個(gè)或2個(gè)IS序列編碼。Noncompsitetransposons(非復(fù)合轉(zhuǎn)座子):兩端沒有IS序列,只有較短的重復(fù)序列。轉(zhuǎn)座酶由中心區(qū)域(centralr
41、egion)編碼。Retrotransposon(反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子):真核細(xì)胞的可移動(dòng)DNA元件,它在基因組的移動(dòng)由RNA中間體介導(dǎo),并涉及反向轉(zhuǎn)錄步驟。復(fù)制型轉(zhuǎn)座:轉(zhuǎn)座元件在轉(zhuǎn)座反應(yīng)過程中先復(fù)制一份拷貝,然后拷貝轉(zhuǎn)座到新的位置,而在原先的位置上仍然保留原來的轉(zhuǎn)座元件。因此這種類型的轉(zhuǎn)座過程伴隨著轉(zhuǎn)座元件拷貝數(shù)的增加。在復(fù)制轉(zhuǎn)座過程中,轉(zhuǎn)座和切離是兩個(gè)獨(dú)立事件,先由轉(zhuǎn)座酶分別切割轉(zhuǎn)座子的供體和受體DNA分子,轉(zhuǎn)座子的末端與受體DNA分子連接,并將轉(zhuǎn)座子復(fù)制一份拷貝,由此生成的共整合體(cointegrate)有兩份轉(zhuǎn)座子拷貝。然后在這兩份轉(zhuǎn)座子拷貝間發(fā)生類似同源重組的反應(yīng),在解離酶(resolva
42、se)的作用下,供體分子同受體分子分開,并且各帶一份轉(zhuǎn)座子拷貝。非復(fù)制型轉(zhuǎn)座:這類轉(zhuǎn)座元件作為一個(gè)物理整體直接從一個(gè)位點(diǎn)轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn),其轉(zhuǎn)座只需轉(zhuǎn)座酶的作用。非復(fù)制型轉(zhuǎn)座的方式有兩種:一種是切割黏接方式(cutandpaste),在供體分子的轉(zhuǎn)座子兩端產(chǎn)生雙鏈斷裂,使整個(gè)轉(zhuǎn)座子釋放出來,然后在受體分子上產(chǎn)生的交錯(cuò)接口處插入;另一種方式是在轉(zhuǎn)座子分子同受體分子之間形成一種交換結(jié)構(gòu)(crossoverstructure)受體分子上的交錯(cuò)單鏈缺口與酶切后產(chǎn)生的轉(zhuǎn)座元件單鏈游離末端連接,并在插入位點(diǎn)產(chǎn)生正向重復(fù)序列,最后通過交換使轉(zhuǎn)座元件轉(zhuǎn)座到受體分子。非復(fù)制型轉(zhuǎn)座的結(jié)果是原來位置上的轉(zhuǎn)座因子丟失
43、,而在新的位置上增加了轉(zhuǎn)座因子。非復(fù)制型轉(zhuǎn)座發(fā)生后,供體分子可能被破壞消失了(這大概可以被具有多個(gè)染色體拷貝的細(xì)菌所耐受),另一種可能是宿主修復(fù)系統(tǒng)識(shí)別供體的斷裂雙鏈并對它進(jìn)行修復(fù)。Conservativetransposition:保守型轉(zhuǎn)座屬于另一類非復(fù)制型轉(zhuǎn)座,在該過程中轉(zhuǎn)座元件從供體部位被切除并通過一系列過程插入到靶部位,在該過程中供體上轉(zhuǎn)座元件兩側(cè)的每個(gè)核苷鍵都被保留。這和噬菌體的整合機(jī)制十分相似。并且此類轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座酶與整合酶家族有關(guān)。采用這種機(jī)制的轉(zhuǎn)座子都比較大,而且轉(zhuǎn)座的往往不只是轉(zhuǎn)座因子本身,而是連同供體的一部分DNA一起轉(zhuǎn)座。癌和突變:Tumorvirus:RNATumor
44、virus:包含可以促使細(xì)胞增殖的癌基因DNATumorvirus:不包含癌基因。DNAtumorvirus會(huì)以一定幾率插入宿主染色體組,合成促使病毒DNA復(fù)制的活化蛋白,可能改變細(xì)胞中調(diào)控細(xì)胞生長和分裂的蛋白的水平。Retrovirus(反轉(zhuǎn)錄病毒):一種真核細(xì)胞病毒,所含RNA基因組在細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制首先是從RNA反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生DNA。這種前病毒DNA被插入細(xì)胞的染色體DNA,并引發(fā)出更多基因組RNA以及病毒蛋白的信使RNA。Transducingretrovirus:含有原癌基因,能夠轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞的逆轉(zhuǎn)錄病毒Changefromproto-oncogenetooncogene:proto-onc
45、ogene轉(zhuǎn)化為c-oncDNAchangescanrelaxthetightcontrolcantransformtheproto-oncogenetocellularoncogene.啟動(dòng)子或編碼區(qū)域出現(xiàn)了點(diǎn)突變起負(fù)調(diào)控作用的DNA序列被刪除基因的擴(kuò)增引起基因產(chǎn)物的過量表達(dá)染色體易位將強(qiáng)啟動(dòng)子加到某些基因的上游,引起產(chǎn)物的過量表達(dá)。TumorSuppressorGenesandTwo-hitmutationmodel:腫瘤抑制基因是一種保護(hù)基因,通常能抑制其他基因的突變,控制腫瘤的生長。當(dāng)一條染色體上的腫瘤抑制基因發(fā)生突變時(shí),由于另一條染色體上還有一個(gè)正常的等位基因,細(xì)胞并不癌變。當(dāng)一對同
46、源染色體上的等位的腫瘤抑制基因都發(fā)生突變時(shí),將不能抑制細(xì)胞的癌變和腫瘤的生長。BRCA1和p53就是典型的腫瘤抑制基因。SOSbox(SOS框):能被LexA抑制蛋白質(zhì)所識(shí)別的20bpDNA序列(啟動(dòng)子)。SOSresponse(SOS反應(yīng)):指大腸桿菌對放射性或其它DNA損傷反應(yīng)而誘導(dǎo)許多酶,包括激活修復(fù)活性。其原因是RecA激活蛋白酶活性,從而切割LexA抑制因子。non-sensemutation:無義突變,指某個(gè)氨基酸的密碼子突變?yōu)榻K止密碼子。Transversionmutation:PutoPy;PytoPuneutralmutation:基因中堿基的改變使得mRNA中的密碼子改變,
47、但產(chǎn)生的氨基酸替換不引起翻譯出的蛋白質(zhì)功能的改變。Reversemutation:使突變體的基因型部分或全部恢復(fù)野生型的突變。Suppressormutation:amutationthatpartiallyorcompletelyrestoresthefunctionimpairedbyanothermutationatadifferentsiteinthesamegene(intragenicsuppression)orinadifferentgene(intergenicsuppression)。Glycosylase:糖基化酶RepairByGlycosylases:糖基化酶將被損壞的
48、堿基從脫氧核糖上除去APendonucleasecutat5-sideofAPsiteDNAPolIremoveAPsiteandfillinthegap,ligasesealnickMismatchRepair:錯(cuò)配修復(fù)(Mismatchrepair)負(fù)責(zé)修復(fù)DNA復(fù)制過程中由于錯(cuò)誤摻入而產(chǎn)生的錯(cuò)配。Ecoli中的MMR途徑需要mutS,mutH,mutL和uvrD基因產(chǎn)物和特異性核酸外切酶、DNA聚合酶和DNA連接酶等。MutS與錯(cuò)配堿基的上游序列結(jié)合,隨后mutH,mutL與錯(cuò)配堿基結(jié)合,mutS,mutH,mutL形成復(fù)合物,將錯(cuò)配部分的一條單鏈DNA切除。此后DNAPol合成新的堿基
49、,DNAligase負(fù)責(zé)連接。PART:往年考卷解析FinalTestSpring2002是非題:在酵母中,并不是所有的ARS(autonomouslyreplicatingsequences自主復(fù)制序列)都被用作復(fù)制起點(diǎn)Sigma因子是E.coliDNA轉(zhuǎn)錄的promoterrecognitionfactor。Rho-dependentterminator不形成hairpin結(jié)構(gòu)。5-TATAAT-3序列是真核生物TFIID的特異保守識(shí)別序列真核生物的RNApolymerase識(shí)別Poly-A信號AAUAAA并隨后終止轉(zhuǎn)錄FalsePoly-A信號AAUAAA的識(shí)別有賴于CPSFSnRNP參
50、與pre-mRNA的splicingBranchPoint不是pre-mRNA3端的剪切位點(diǎn),pre-mRNA3端的剪切位點(diǎn)是AG-3質(zhì)粒與E.coli染色體的整合是不受基因調(diào)控的。GAL4形成二聚體,但還需要GAL80的協(xié)同作用才能產(chǎn)生調(diào)控功能。SteroidHormone識(shí)別細(xì)胞內(nèi)的受體,形成復(fù)合物并直接參與基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。填空題:噬菌體的染色體在成熟顆粒中是以兩頭帶有粘端的線性雙鏈DNA的形式存在的,在進(jìn)入宿主細(xì)胞后發(fā)生了環(huán)化。在lyticpathway,染色體復(fù)制產(chǎn)生一個(gè)很長的重復(fù)序列(concatamers),該分子中的多個(gè)cos序列被特有的terenzyme識(shí)別并內(nèi)切,釋放出有粘性
51、末端的單個(gè)染色體用于顆粒的裝配。Nuleosomecore包含大約0.18kbDNA和8個(gè)組蛋白分子,其中H2A,H2B,H3,H4各2個(gè)組成一個(gè)復(fù)合體。Histone與DNA分子有很高的親和力,這是因?yàn)樵诤藘?nèi)環(huán)境它所含的大量Arg和Lys氨基酸使其帶正電荷。Histone可被磷酸化和/或乙?;揎棧渲幸阴;揎椏赡芘c基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)有關(guān),與轉(zhuǎn)錄活躍的基因復(fù)合的histone的去乙?;潭认鄬^低。相關(guān)知識(shí):DNA是與組蛋白結(jié)合在一起的,組蛋白的賴氨酸殘基可接受乙?;揎?啟動(dòng)子區(qū)域的組蛋白在組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(histoneacetyltransferase,HAT)的作用下,發(fā)生乙酰化導(dǎo)致
52、DNA空間結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,處于松弛狀態(tài),利于轉(zhuǎn)錄因子與之結(jié)合,使轉(zhuǎn)錄效率大幅度提高,即啟動(dòng)子區(qū)域的組蛋白乙?;杉せ?導(dǎo)致啟動(dòng))基因的轉(zhuǎn)錄.相反,在組蛋白脫乙?;?histonedeacetylase,HDAC)作用下,組蛋白去乙?;?引起染色質(zhì)DNA變緊,高度濃縮,轉(zhuǎn)錄因子難于與之相應(yīng)的順式元件結(jié)合,使轉(zhuǎn)錄受到抑制.一個(gè)體外DNA合成系統(tǒng)(如PCR)必須具備的組分是:DNA聚合酶(taq,pfu);dNTP;模板DNA;含有Mg2+的buffer;引物真核生物RNA主要為:mRNA;snRNA;tRNA;rRNA;其中snRNA主要參與核內(nèi)hnRNA的剪接。選擇性地在不同的位點(diǎn)加poly-A
53、尾巴是真核生物RNAprocessingcontrol的一種方式,IgM的重鏈基因在B細(xì)胞發(fā)育的不同時(shí)期有不同的加尾位點(diǎn)。Poly-Aaddition需要的一個(gè)功能蛋白因子是CPSF,它是由3個(gè)多肽組成的復(fù)合物。Thereare3repressor(cIgeneproduct)bindingsitesintherightoperator(OR).其中親和力最高的位點(diǎn)是OR1,Repressor在該位點(diǎn)的結(jié)合導(dǎo)致了阻斷了PRpromoter,使Cro基因不被轉(zhuǎn)錄;增加了repressor與OR2的親和力;促使從PRM啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄,合成更多的repressor。選擇題:DNAhelicase的生物學(xué)功
54、能是解開雙螺旋DNA雙鏈的配對。真核生物染色體包含:DNA,RNA,histone,andnonhistoneproteins原核生物沒有Telomere人類遺傳學(xué)分析常用到的染色體標(biāo)記(Marker):RFLP(RestrictedFragmentLengthPolymorphism限制片段長度多態(tài)性)ShortTandemRepeatsSinglenucleotidepolymorphismAluFamily用于證明真核生物基因有Intron的實(shí)驗(yàn)是R-loopingexperiment。識(shí)別Shine-Dalgarno序列(5-AGGAGG-3)的是16SrRNA的3端。autonomo
55、ustransposon編碼自己的轉(zhuǎn)座酶,引起的突變是不穩(wěn)定的。Attenuationregulation:是一種轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)方式,通過翻譯來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄,調(diào)控依賴于基因產(chǎn)物合成的終產(chǎn)物的濃度。TranscriptionfactorsmaycauseDNAbendingbybindingtoDNA.切記:轉(zhuǎn)錄因子并不都直接與DNA結(jié)合。比如TFB就不直接與DNA結(jié)合。問答題:遺傳物質(zhì)必須具備哪些基本條件?能將比較穩(wěn)定的遺傳信息傳遞給子代能進(jìn)行自我復(fù)制,將遺傳信息平均分配到2個(gè)子代細(xì)胞能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄、翻譯,編碼有功能的蛋白質(zhì)。能產(chǎn)生一定量的突變,維持物種的進(jìn)化有一實(shí)驗(yàn),細(xì)胞先在含3HThymidine的培養(yǎng)
56、基中短暫培養(yǎng),然后將細(xì)胞轉(zhuǎn)到只含不標(biāo)記的Thymidine的培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)一定時(shí)間,然后提取DNA并取少量稀釋到膜上。這種實(shí)驗(yàn)方法叫什么?DNA的復(fù)制方法是什么?為什么?Answer:這種實(shí)驗(yàn)方法叫做Pulse-Chaselabeling。DNA的復(fù)制方法叫多起點(diǎn)半保留復(fù)制。因?yàn)樵诤?HThymidine的培養(yǎng)基中短暫培養(yǎng)時(shí),新合成的連續(xù)的一段DNA有放射性。轉(zhuǎn)到只含不標(biāo)記的Thymidine的培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)一定時(shí)間之后,新合成的DNA鏈中3HThymidine的濃度逐漸下降。DNA酶DNase是一種DNA內(nèi)切酶,它只能切開沒有被與DNA結(jié)合的蛋白質(zhì)所覆蓋的DNA的磷酸二酯鍵。如果用這個(gè)方
57、法來分析基因表達(dá)活躍程度的高低,請比較:A,不表達(dá);B,低表達(dá);C,高表達(dá)時(shí)被DNase酶切的難易程度。Answer:在不表達(dá)的基因中,DNA與去乙?;膆istone和non-histone緊密結(jié)合,DNA被覆蓋,很難被酶切。在低表達(dá)的基因中,由于histone被乙酰化,histone與DNA結(jié)合得不緊密,使DNA的酶切位點(diǎn)暴露在外。另外,與DNA結(jié)合的轉(zhuǎn)錄酶,轉(zhuǎn)錄因子及轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白不多。因此低表達(dá)的基因比較容易被酶切。在高表達(dá)的基因中,與DNA鏈結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)錄酶和轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白,使DNA鏈不容易被酶切。不表達(dá)高表達(dá)低表達(dá)最難次難最容易Enhancer與Promoter都是一段DNA序列
58、,比較兩者的生物學(xué)功能。假設(shè)幾個(gè)不同的基因都含有同樣的Promoter和Enhancerelement,并且?guī)讉€(gè)轉(zhuǎn)錄因子都有同樣的結(jié)構(gòu)特征,這幾個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄特異性是怎樣達(dá)成的?Enhancer與Promoter的比較:EnhancerPromoterEnhanceexpressionBasicexpressionPositionnotbefixedisolatedregionBi-directionalelementMono-directionalelementPromoter是DNA序列上與RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的區(qū)域Enhancer是遠(yuǎn)距離調(diào)節(jié)啟動(dòng)子以增加轉(zhuǎn)錄速率的DNA序列
59、,其增強(qiáng)作用與序列的方向無關(guān),有強(qiáng)烈的細(xì)胞類型依賴性。Anenhanceractivatesthenearestpromotertoit,andcanbeanydistanceeitherupstreamordownstreamofthepromoter.Enhancersaremadeofthesameshortsequenceelementsthatarefoundinpromoters.Thedensityofsequencecomponentsisgreaterintheenhancerthaninthepromoter.比較真核生物mRNA合成的basaltranscription和
60、non-basaltranscription所牽涉到的各種蛋白因子和DNAelements,以及它們在promoter區(qū)的相互作用方式。Answer:basaltranscription涉及的蛋白質(zhì):轉(zhuǎn)錄因子,RNApolymeraseDNAelements:promoter;non-basaltranscription涉及的蛋白質(zhì):轉(zhuǎn)錄因子,RNApolymerase,activator,DNAelements:promoter,enhancer/silencerEnhancers能夠使activators形成直接或間接與promoter作用的復(fù)合體。Enhancer可以改變模板的整體結(jié)構(gòu),
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