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文檔簡介
第一節(jié)蛋白質(zhì)的分子組成:一、氨基酸aminoacid的結(jié)構(gòu)
1、氨基酸的分子結(jié)構(gòu):2、氨基酸的連接方式:肽鍵
R1R2
H2NCCNCCOOH
HHH
Opeptidebond二、氨基酸的分類(P30)①中性neutral氨基酸
②酸性acidity氨基酸
③
堿性alka’lescence氨基酸三、氨基酸的理化性質(zhì):
1、茚三酮反應(yīng)
茚三酮(氧化型)茚三酮(還原型)藍(lán)紫色化合物(吸收峰:570nm)AA醛2NH3茚三酮(氧化型)
NH3+
NH3+
NH2
|
+OH-|
+OH-
|
R-CH-COOHR-CH-COO-
R-CH-COO-
+H+
+H+
陽離子兩性離子陰離子
pH<pI
pH=pI
pH>pI
2、是兩性電解質(zhì)ampholyte氨基酸的等電點
isoelectricpH(pI):
當(dāng)氨基酸帶相等的正、負(fù)電荷數(shù)時,溶液的pH值。
不同蛋白質(zhì)在生命活動中起不同作用,根本原因是它們具有不同的分子結(jié)構(gòu),包括共價鍵結(jié)構(gòu)與空間結(jié)構(gòu):一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、四級結(jié)構(gòu)第二節(jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)一、肽(一)肽的形成(二)蛋白質(zhì)是大分子肽(三)體內(nèi)重要的肽:GSH二、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)primarystructure
蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的氨基酸排列順序sequence,它決定蛋白質(zhì)分子的二級和三級等高級結(jié)構(gòu)。三、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)secondarystructure
多肽鏈中主鏈mainchain原子在各局部的空間排列spacialarrangement
分布狀況,不涉及各R側(cè)鏈sidechain的空間排布。
主要的二級結(jié)構(gòu):α-螺旋helix、
β-折疊pleatedsheet、
β-轉(zhuǎn)角bend/turna-螺旋:B-折疊:朊病毒Prion,PrpPrpc細(xì)胞朊蛋白,正常糖蛋白,功能與神經(jīng)系統(tǒng)、T淋巴細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、核酸代謝有關(guān),在神經(jīng)元表達(dá)最高,富集于突觸處,
α-螺旋,對蛋白酶敏感PrpSc朊病毒,β-折疊,不溶、具感染力:PrpSc與Prpc結(jié)合,Prpc變PrpScPrion?。函偱2?。傳染病,遺傳病,與分子生物學(xué)中心法則和蛋白質(zhì)折疊的Anfinsen原理抵觸。氨基酸排列一致但構(gòu)象卻不同,免疫不識別β-轉(zhuǎn)角蛋白質(zhì)分子中,肽鏈經(jīng)常會出現(xiàn)180°的回折,在這種回折角處的構(gòu)象就是β-轉(zhuǎn)角四、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)tertiarystructure
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)受側(cè)鏈和主鏈各構(gòu)象單元之間的相互作用,進(jìn)一步折疊成有規(guī)律的三維空間結(jié)構(gòu)threedimensionalstruture。蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu):五、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)quaternarystructure
兩條以上具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈通過非共價鍵non-covalentbond相互結(jié)合成一定空間的聚合體polymer亞基:具備四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)分子中的每個有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈單位稱為亞基。六、維持蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)的作用力:
主要是疏水鍵,鹽鍵、氫鍵、范德華力、二硫鍵等。蛋白質(zhì)(血紅蛋白)的四級結(jié)構(gòu):
蛋白質(zhì)的生理功能:
1、結(jié)構(gòu)功能——結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)
2、催化功能——酶
3、調(diào)節(jié)功能——某些激素、鈣調(diào)蛋白、受體
4、運動功能——肌蛋白
5、運輸功能——血紅蛋白
6、防御功能——抗體、補體、干擾素
7、血凝功能——纖維蛋白原
8、遺傳功能——核蛋白
9、營養(yǎng)功能——白蛋白第三節(jié)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系蛋白質(zhì)是動態(tài)彈性分子,構(gòu)象總是處于某種程度的彈性互變中。配體ligand:*蛋白質(zhì)可以與其他分子結(jié)合而在一定程度上改變構(gòu)象,從而改變功能與之結(jié)合的分子就稱為配體。*配體可以是蛋白質(zhì),也可以是其他分子蛋白質(zhì)-配體的結(jié)合具有專一性,這對維持生命系統(tǒng)的高度有序性至關(guān)重要一、一級結(jié)構(gòu)決定高級結(jié)構(gòu),空間結(jié)構(gòu)影響功能、活性*
蛋白質(zhì)與配體之間的結(jié)構(gòu)適應(yīng)稱為誘導(dǎo)契合*一種蛋白質(zhì)可能結(jié)合幾個相同或不同的配體,每一配體都有自己的結(jié)合位點。一個配體的結(jié)合改變了蛋白質(zhì)的構(gòu)象,改變了其余結(jié)合點的親和力,從而影響其他配體的結(jié)合。*與同一蛋白質(zhì)分子結(jié)合的幾個配體之間因變構(gòu)效應(yīng)而產(chǎn)生的相互影響稱為協(xié)同效應(yīng)。如果是促進(jìn)結(jié)合,稱為正協(xié)同效應(yīng),反之為負(fù)協(xié)同效應(yīng)。同類配體之間的協(xié)同效應(yīng)稱為同促效應(yīng)。異類配體之間的協(xié)同效應(yīng)稱為異促效應(yīng)。有些蛋白質(zhì)可以同時具有同促效應(yīng)與異促效應(yīng)二、氧合蛋白是研究蛋白質(zhì)功能的經(jīng)典模型氧合蛋白包括Mbmyoglobin與Hbhemoglobin。珠蛋白血紅素輔基Mb與Hb是最早確定構(gòu)象的蛋白質(zhì),氧合蛋白體現(xiàn)了生物化學(xué)的重要內(nèi)容:配體與蛋白質(zhì)的可逆結(jié)合。血紅蛋白存在R、T兩種構(gòu)象,兩者都可以結(jié)合氧,但R型結(jié)合力更強,氧合后也更穩(wěn)定,是氧合血紅蛋白的主要構(gòu)象。而不與氧結(jié)合時T型更穩(wěn)定,所以T型是脫氧血紅蛋白的主要構(gòu)象。兩種構(gòu)象的差別主要在四級結(jié)構(gòu),即亞基之間的排布,而每個亞基的構(gòu)象改變不大
第四節(jié)理化性質(zhì)
一、一般性質(zhì)1、紫外吸收特征:280nm強吸收
2、呈色反應(yīng):雙縮尿反應(yīng)(Lowry反應(yīng))
二、大分子特性1、是親水膠體hydrophiliccolloid
2、透析dialysis
3、沉降與沉降系數(shù)svedberg4、可沉淀deposit析出:
破壞其電荷及水化膜
(1)
鹽析saltout
(2)
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