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文檔簡介
核酸代謝專業(yè)知識講座核酸代謝專業(yè)知識講座第1頁一、核酸酶促降解
細胞內(nèi)核酸在核酸酶作用下逐步分解;
體內(nèi)DNA分解極為遲緩,RNA分解較快,二者終產(chǎn)物
一致。
磷酸
核酸→核苷酸戊糖(核糖或脫氧核糖)
核苷
堿基(嘌呤或嘧啶)
核酸代謝專業(yè)知識講座第2頁
水解產(chǎn)物除個別作為新核苷酸合成原料外,大部
分被深入分解。
◆
戊糖――HMS氧化分解;
◆
磷酸――磷酸代謝;
◆
堿基――分別降解。
核酸代謝專業(yè)知識講座第3頁二、嘌呤、嘧啶代謝
(一)嘌呤分解
◆
反應(yīng)部位:主要肝、腎、小腸
◆
過程:①水解脫氨②氧化
◆
主要酶:黃嘌呤氧化酶
◆
不一樣生物嘌呤分解終產(chǎn)物有差異。
人體嘌呤分解終產(chǎn)物為尿酸,尿酸微溶于水,如體內(nèi)
產(chǎn)生過多,不能及時排出,則沉積在體內(nèi)。
如:沉積在關(guān)節(jié)——痛風(fēng)癥
沉積在腎——腎結(jié)石核酸代謝專業(yè)知識講座第4頁核酸代謝專業(yè)知識講座第5頁(二)嘧啶分解
終產(chǎn)物:
NH3,CO2,
β-脲基異丁酸。
β-丙AA
NH3,+CO2+乙酸
核酸代謝專業(yè)知識講座第6頁三、核苷酸合成
1.核酸降解產(chǎn)物:核苷酸、核苷、堿基,被吸收或重新利用。
2.生物體利用其它物質(zhì)合成核苷酸→核酸。
不一定需要膳食供給。
(一)嘌呤核苷酸合成
用同位素示蹤試驗,證實嘌呤核苷酸中各原子起源:
AMP
原料--→IMP
GMP
GTPATP核酸代謝專業(yè)知識講座第7頁(二)嘧啶核苷酸合成
同位素示蹤試驗證實:嘧啶核苷酸元素起源:
從頭合成――主要路徑
原料:(Gln,CO2)
氨甲酰磷酸,Asp
方式:原料嘧啶環(huán)UMP
CMP
TMP核糖、PCO2,Gln組裝核酸代謝專業(yè)知識講座第8頁四、核酸生物合成
核酸是細胞基礎(chǔ)成份,DNA是主要遺傳物
質(zhì),是遺傳物質(zhì)載體。
DNA功效:
①貯存遺傳信息。
②傳遞遺傳信息(復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯)。
③接收遺傳信息(經(jīng)過反轉(zhuǎn)錄)。核酸代謝專業(yè)知識講座第9頁1953年,F(xiàn).Crick在總結(jié)DNA與RNA和蛋白質(zhì)關(guān)系基礎(chǔ)上,提出了分子生物學(xué)中心法則,、1957年修改:
核酸代謝專業(yè)知識講座第10頁復(fù)制:以親代DNA分子為模板合成新子代DNA分子
過程,新合成子代DNA分子與親代DNA分
子完全一樣。DNA→DNA
RNA也能夠復(fù)制(病毒)RNA→RNA
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,合成RNA過程。DNA→RNA
反轉(zhuǎn)錄:在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,以RNA為模板合成DNA
過程。
翻譯:以RNA為模板,依據(jù)RNA鏈上每三個核苷酸
(堿基)決定一個AA規(guī)則,合成出含有特定
AA次序蛋白質(zhì)肽鏈過程。RNA→Pr核酸代謝專業(yè)知識講座第11頁核酸代謝專業(yè)知識講座第12頁DNA復(fù)制。
DNA生物合成方式DNA反轉(zhuǎn)錄合成。(病毒)
DNA損傷修復(fù)。
核酸代謝專業(yè)知識講座第13頁(一)DNA生物合成
A.DNA復(fù)制1.參加DNA復(fù)制酶和蛋白質(zhì)(原核生物)
(1)DNA聚合酶(DNApolymerase,DNApol)
DNA聚合酶:以DNA為模板、dNTP為底物催化合成
DNA一類酶。
DNApolⅠ
原核生物有三種DNA聚合酶DNApolⅡ
DNApolⅢ核酸代謝專業(yè)知識講座第14頁
DNA聚合酶作用條件:
◆
需模板:DNA
◆
需引物:具3′-OHDNAorRNA
◆
底物:4種dNTP
◆
需Mg2+
,Mn2+
◆
使dNTP以3′,5′磷酸二酯鍵相連,按5′→3′方向
聚合成與模板互補DNA鏈。
核酸代謝專業(yè)知識講座第15頁DNA聚合酶Ⅰ(DNApolⅠ)催化特點
DNApolⅠ是一個多功效酶
◆5′→3′聚合催化特征:
使dNTP按模板要求逐一加到含有3′-OH端
多核苷酸鏈上。
核酸代謝專業(yè)知識講座第16頁
◆
3′→5′外切酶活性:從3′-OH端水解DNA。
出現(xiàn)與模板錯配核苷酸時,DNApolⅠ先切去錯
配堿基(核苷酸)然后再繼續(xù)進行聚合。
功效:識別、消除錯配堿基。對聚合起校正作用。核酸代謝專業(yè)知識講座第17頁
◆
5′→3′外切酶活性:從5′端水解DNA鏈,
也可距5′端12個左右堿基處水解DNA鏈。
(只作用于雙鏈DNA)。
功效:切除引物,切除變異損傷核苷酸—修復(fù)
作用。核酸代謝專業(yè)知識講座第18頁原核生物有三種DNA聚合酶比較:
核酸代謝專業(yè)知識講座第19頁(2)DNA連接酶(DNALigase)
雙鏈DNA一條鏈上有切口,3′-OH與5′-P相鄰;
不能連接兩條游離單鏈。
(切口處兩核苷酸必須相鄰不能缺乏核苷酸。)
作用:在DNA不連續(xù)合成時起連接作用。
3′5′核酸代謝專業(yè)知識講座第20頁(3)解鏈酶(Helicase解螺旋酶,復(fù)制蛋白——rep
蛋白)
作用:解開DNA雙螺旋,使其成單鏈。
(4)旋轉(zhuǎn)酶
作用:消除DNA超螺旋酶。核酸代謝專業(yè)知識講座第21頁(5)引發(fā)酶
引發(fā)酶:催化RNA引物合成RNA聚合酶。
作用:合成引物
DNA聚合酶不能從頭起始DNA合成,需要引物
(primer),只能在引物(3′-OH)端逐步加上
脫氧核苷酸,延長DNA鏈。
DNA合成引物有三種:RNA片段;
DNA片段;
tRNA片段。核酸代謝專業(yè)知識講座第22頁
(6)單鏈結(jié)合蛋白
(Singlestrandbindingprotein——SSB蛋白)
作用:與單鏈DNA特異結(jié)合蛋白質(zhì)。
◆
SSB與解開單股DNA結(jié)合,使兩條單鏈不再形
成雙鏈,保持單鏈區(qū)穩(wěn)定。
◆
預(yù)防核酸酶降解DNA。
核酸代謝專業(yè)知識講座第23頁2.復(fù)制方式和特點
(1)半保留復(fù)制:
Watson和Crick1953年提出,DNA兩條鏈都能作為模板,分別合成出兩條互補新鏈。核酸代謝專業(yè)知識講座第24頁機制:DNA復(fù)制時,兩條互補連解開;兩條鏈都可做模板,然后在每條模板鏈上按堿基配正確標準形成互補新鏈,組成子代DNA分子。
新產(chǎn)生兩子代DNA分子與親代DNA分子完全相同,且子代DNA中一條鏈來自親代,另一條鏈是新合成——半保留復(fù)制。
DNA半保留復(fù)制方式,確保了DNA在代謝上穩(wěn)定性,從而確保了生物遺傳穩(wěn)定性和準確性。
(穩(wěn)定是相正確)。核酸代謝專業(yè)知識講座第25頁(2)DNA半不連續(xù)復(fù)制:
問題提出????:
DNA分子兩條鏈都能做模板,幾乎同時、齊頭并進
合成為兩條新互補鏈。
DNA模板兩條鏈反向平行,一條5′→3′
;
另一條3′→5′
。
DNA聚合酶要求:模板方向3′→5′
。
合成新鏈方向5′→3′
。
怎樣解釋在同一個復(fù)制叉中兩條新鏈合成是同時,齊
頭并?
日本學(xué)者岡崎——DNA半不連續(xù)復(fù)制模型:核酸代謝專業(yè)知識講座第26頁DNA半不連續(xù)復(fù)制模型:
◆DNA復(fù)制時兩條親代單鏈DNA都做為模板。
◆復(fù)制叉:DNA復(fù)制時,雙螺旋局部解開,在復(fù)制區(qū)
形成Y形結(jié)構(gòu)——復(fù)制叉;
伴隨復(fù)制叉移動DNA雙螺旋逐步解開。
核酸代謝專業(yè)知識講座第27頁
◆
以復(fù)制叉移動方向為準;
3′→5′走向模板鏈,DNA新鏈合成方向5′→3′,與
復(fù)制叉方向一致,連續(xù)合成——前導(dǎo)鏈。
◆
5′→3′走向模板鏈,DNA新鏈合成方向也是5′→3′,
與復(fù)制叉移動方向相反,先照模板按5′→3′合成若
干短片斷——岡崎片斷,然后由連接酶將短片斷
連接,成一條完整DNA鏈。不連續(xù)合成——滯后
鏈(后隨鏈)。核酸代謝專業(yè)知識講座第28頁結(jié)論:
DNA半不連續(xù)復(fù)制:一條新鏈連續(xù)合成;
另一條新鏈不連續(xù)合成。核酸代謝專業(yè)知識講座第29頁
岡崎片斷長度:原核生物1000-個Nt。
真核生物200個左右Nt。核酸代謝專業(yè)知識講座第30頁3.DNA復(fù)制過程
合成起始;
DNA鏈延伸;
合成終止。
核酸代謝專業(yè)知識講座第31頁3.DNA復(fù)制過程
(1)合成起始:
◆
引發(fā)酶識別、結(jié)合在模板DNA起始位點;
◆
DNA雙螺旋及超螺旋解開(邊合成邊解開);
◆
RNA引物合成。核酸代謝專業(yè)知識講座第32頁(2)DNA鏈延伸
◆
在DNApolⅢ催化下,按照模板鏈3′→5′次序
在RNA引物3′-OH末端逐一按上對應(yīng)核苷酸,
合成互補新鏈。
◆前導(dǎo)鏈合成方向5′→3′,連續(xù)合成。
◆滯后鏈合成方向5′→3′,不連續(xù)合成。核酸代謝專業(yè)知識講座第33頁(3)合成終止
DNA復(fù)制合成終止包含:
①RNA引物切除和缺口填補。
經(jīng)過DNApolⅠ5′→3′外切酶活性,或RNaseH
酶切除引物,然后由polⅠ5′→3′聚合活性補齊
缺口。
②DNA片段連接——DNA連接酶。核酸代謝專業(yè)知識講座第34頁核酸代謝專業(yè)知識講座第35頁核酸代謝專業(yè)知識講座第36頁核酸代謝專業(yè)知識講座第37頁B、DNA反(逆)轉(zhuǎn)錄合成——RNA指導(dǎo)DNA合成
反轉(zhuǎn)錄:在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,以RNA為模板合成DNA
過程。
反轉(zhuǎn)錄發(fā)覺:
◆
1964年Temin提出反轉(zhuǎn)錄假設(shè)。
◆
1970年Temin和Batimore,同時分別從致癌RNA
病毒中發(fā)覺反轉(zhuǎn)錄酶。
以后在正常動物胚胎細胞也發(fā)覺反轉(zhuǎn)錄酶。
◆
反轉(zhuǎn)錄酶又稱為:依賴RNADNA聚合酶
RNA指導(dǎo)DNA聚合酶核酸代謝專業(yè)知識講座第38頁
反轉(zhuǎn)錄條件:酶:反轉(zhuǎn)錄酶。
底物:4種dNTP為。
模板:病毒單鏈RNA為。
引物:宿主細胞tRNA。
核酸代謝專業(yè)知識講座第39頁合成方式:
致癌DNA
整合到宿主DNA
病毒RNA
cDNA
(模板)mRNA
蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)化蛋白)
以病毒RNA為模板合成cDNA(complementaryDNA)經(jīng)過復(fù)制合成致癌DNA,后者可整合到宿主DNA中,并隨宿主細胞分裂而遺傳下去,碰到適當條件便進行復(fù)制產(chǎn)生致癌DNA分子,引發(fā)癌變。
轉(zhuǎn)錄、翻譯產(chǎn)生蛋白(轉(zhuǎn)化蛋白、病毒蛋白)也引發(fā)癌變。反轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)錄翻譯復(fù)制核酸代謝專業(yè)知識講座第40頁反轉(zhuǎn)錄酶含有三種酶活性:
①逆轉(zhuǎn)錄功效:利用病毒RNA為模板合成互補
cDNA,形成RNA-DNA雜合子。
②復(fù)制功效:以新合成(逆轉(zhuǎn)錄)cDNA為模板,
合成另一條DNA成DNA-DNA雙鏈。
③RNaseH活性:水解RNA-DNA雜交分子中RNA。核酸代謝專業(yè)知識講座第41頁核酸代謝專業(yè)知識講座第42頁逆轉(zhuǎn)錄病毒生活史核酸代謝專業(yè)知識講座第43頁C、DNA損傷與修復(fù)
(1)DNA損傷
DNA分子不是絕對穩(wěn)定,可受各種原因作用而
改變或受破壞.
◆
生物原因:復(fù)制及基因重組過程出現(xiàn)差錯而改變。
◆
物理原因:紫外線、電離輻射、X-射線等。
◆化學(xué)原因:烷化劑,氧化劑等化學(xué)誘變劑。核酸代謝專業(yè)知識講座第44頁UV引發(fā)輻射損傷:形成嘧啶二聚體,C和C之間,
T和T之間形成共價鍵。核酸代謝專業(yè)知識講座第45頁(2)DNA損傷修復(fù)
◆
光復(fù)活作用
利用光能,光復(fù)活酶催化下切除由紫外線照射引發(fā)
DNA嘧啶二聚體。
DNA復(fù)制、DNA轉(zhuǎn)錄時,到嘧啶二聚體處,復(fù)制、
轉(zhuǎn)錄均受阻。
修復(fù)過程:核酸代謝專業(yè)知識講座第46頁◆
光復(fù)活酶能在暗處識別損傷DNA部位,并結(jié)合在受
損部位。
◆
可見光激活光復(fù)活酶,分解由UV照射而形成DNA中
嘧啶二聚體。
◆
光復(fù)活作用高度專一,只能修復(fù)UV照射引發(fā)DNA嘧
啶二聚體。
光復(fù)活酶只存在于低等單細胞(如微生物)→鳥類;
高等哺乳動物無此酶。
核酸代謝專業(yè)知識講座第47頁2.切除修復(fù)——(復(fù)制前修復(fù))
在幾個酶作用下,將DNA分子中錯配或受損部位切除,然后以完好鏈為模板合成出切除部位。
該機制普遍存在,作用于各種損傷。
三種:堿基切除修復(fù):修復(fù)DNA中改變堿基。
核苷酸切除修復(fù):修復(fù)DNA中巨大損傷。
堿基錯配修復(fù)(前述)。核酸代謝專業(yè)知識講座第48頁◆
堿基切除修復(fù)核酸代謝專業(yè)知識講座第49頁◆
核苷酸切除修復(fù):
過程:識別、切斷→修復(fù)→切除→連接(原核生物)
核酸代謝專業(yè)知識講座第50頁◆
識別及切斷:UvrA,UvrB識別并結(jié)合在DNA損傷處,
UvrC(相當于核酸內(nèi)切酶)在損傷處
靠近5′→3′一側(cè)切斷,產(chǎn)生切口。
◆
修復(fù):以另一條完好單鏈為模板,由DNApolⅠ在切
口處修復(fù)合成,補齊缺口;方向5′→3′
。
◆
切除:UvrC在受損傷部位3′一側(cè)切斷,去除受損
傷片段。
◆
連接:連接酶將新合成DNA片斷與原鏈連接。
此修復(fù)發(fā)生在DNA復(fù)制前——復(fù)制前修復(fù)。核酸代謝專業(yè)知識講座第51頁3.重組修復(fù)——(復(fù)制后修復(fù))
先復(fù)制再修復(fù):含有錯誤或損傷DNA仍可進行復(fù)制,但子代DNA鏈在對應(yīng)于損傷部位出現(xiàn)缺口,經(jīng)過分子間重組使缺口補齊。
核酸代謝專業(yè)知識講座第52頁重組修復(fù)中,二聚體(或其它損傷)并未除去,第二輪復(fù)制時,留在母鏈中損傷仍會給復(fù)制造成困難,仍須以重組修復(fù)來填補。
伴隨復(fù)制不停進行,若干代以后,損傷個別雖未從分子中除去,但損傷DNA鏈卻逐步稀釋,以至無礙DNA正常生理功效。
核酸代謝專業(yè)知識講座第53頁(二)RNA合成
兩種方式:轉(zhuǎn)錄(主要):以DNA為模板合成RNA
復(fù)制:以RNA為模板合成RNA。
1.轉(zhuǎn)錄
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板合成RNA過程。
(1)轉(zhuǎn)錄基礎(chǔ)特征
◆
底物:4種NTP。
◆
模板:DNA
◆
不需引物:合成RNA時第一個NTP普通是嘌呤核苷
酸,大多是G(80%)。核酸代謝專業(yè)知識講座第54頁
◆
通常為不對稱轉(zhuǎn)錄:
體內(nèi)轉(zhuǎn)錄通常只以DNA分子雙鏈一條鏈為模板;
體外轉(zhuǎn)錄失去鏈選擇性。
作為模板鏈稱——模板鏈,
反義鏈,
轉(zhuǎn)錄鏈。
核酸代謝專業(yè)知識講座第55頁
不作為模板鏈稱——編碼鏈,
正義鏈,
非轉(zhuǎn)錄鏈,
信息鏈。
(或一些區(qū)域以這條鏈為模板轉(zhuǎn)錄,
另一些區(qū)域以另一條鏈為模板)核酸代謝專業(yè)知識講座第56頁
◆
RNA聚合酶與DNA模板結(jié)合,沿DNA反義鏈
3′→5′方向移動。
轉(zhuǎn)錄方向:RNA鏈由5′→3′延伸。
◆
RNA聚合酶——依賴DNARNA聚合酶
以DNA為模板;
以四種核苷三磷酸(NTP)為底物;
在Mn2+或Mg2+參加下催化RNA合成。核酸代謝專業(yè)知識講座第57頁
組成:(E.ColiRNA聚合酶)
全酶由5個亞基組成,有時含有ω鏈;
表示為:α2ββ′σ(ω)
關(guān)鍵酶:α2ββ′
起始因子:σ亞基。
核酸代謝專業(yè)知識講座第58頁
功效:
σ亞基:識別DNA模板上特殊轉(zhuǎn)錄起始信號,在
RNA合成中起發(fā)動作用;
關(guān)鍵酶:含有催化RNA聚合活性,但不能開啟一條
新鏈合成。
ω鏈:功效不詳。
◆
新鏈RNA與模板DNA鏈堿基配對:
dT-A,dG-C,
dC-G,dA-U。核酸代謝專業(yè)知識講座第59頁(2)轉(zhuǎn)錄過程
四步:RNA聚合酶與模板DNA起始部位識別、結(jié)合;
轉(zhuǎn)錄起始;
RNA鏈延長;
RNA鏈合成終止。核酸代謝專業(yè)知識講座第60頁
核酸代謝專業(yè)知識講座第61頁◆
RNA聚合酶與模板識別與結(jié)合
RNA聚合酶首先識別DNA模板上特異起始部位
——開啟子,并與之結(jié)合。
開啟子(promoter):
DNA上能被RNA聚合酶識別、結(jié)合,與轉(zhuǎn)錄起始有
關(guān)一段DNA序列。核酸代謝專業(yè)知識講座第62頁RNA聚合酶σ因子能識別開啟子,使全酶與開啟
子結(jié)合,并使雙螺旋局部解鏈。
關(guān)鍵酶也能與DNA模板結(jié)合,但對DNA各部位親和
力相同。核酸代謝專業(yè)知識講座第63頁◆
轉(zhuǎn)錄起始
第1個NTP(多為
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