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文檔簡(jiǎn)介
LightCycler480熒光定量PCR儀操作規(guī)程
1.開機(jī)前請(qǐng)注意確保室溫在15-32℃,每次反應(yīng)最后一步都建議做降溫,降至37度維持
10秒(請(qǐng)不要更改默認(rèn)的升降溫速率),維持至少30秒。
2.為保持實(shí)驗(yàn)穩(wěn)定,在系統(tǒng)運(yùn)行過(guò)程中,尤其是HRM熔解曲線信號(hào)采集時(shí)請(qǐng)不要在連接
儀器的計(jì)算機(jī)上進(jìn)行其他操作或同時(shí)打開超過(guò)10個(gè)實(shí)驗(yàn)文件進(jìn)行分析;HRM的實(shí)驗(yàn)采集
數(shù)據(jù)點(diǎn)每。C不要超過(guò)25個(gè),溫度區(qū)間不要超過(guò)22℃。
3.請(qǐng)選用與羅氏原裝耗材高度一致的96孔板或8聯(lián)管(lOOul白色/透明矮管),在操作過(guò)
程中,切忌戴有粉末的乳膠手套或裸手接觸光學(xué)透性封板膜或8聯(lián)管蓋。
4.先開電腦和儀器,編輯程序后,再配制反應(yīng)液,不能使用預(yù)混ROX參比染料的
SYBRmix試劑,加樣封膜完畢后在板式離心機(jī)中1500xg(3000rpm)離心兩分鐘,排
除氣泡。
5.打開儀器后方的電源開關(guān),儀器自動(dòng)進(jìn)行自檢,儀器正面兩盞燈呈桔黃色閃爍。打開
電腦,進(jìn)入系統(tǒng),雙擊LightCycler480軟件圖標(biāo),輸入軟件用戶名admin,密碼
MasterOlo如需安裝軟件則切換到LCinstall賬號(hào),密碼Aal23456。儀器自檢完畢左邊
的燈變綠,右邊的燈仍為桔黃色。這時(shí)按擊燈右邊雙箭頭的開關(guān),儀器的載板器會(huì)自動(dòng)
伸出,將準(zhǔn)備好的反應(yīng)板放入載板器中(反應(yīng)板的缺角在右下角)。再按一下帶雙箭頭
的開關(guān),儀器的載板器會(huì)自動(dòng)縮入儀器內(nèi),此時(shí)儀器能自動(dòng)檢測(cè)到反應(yīng)板,原來(lái)呈桔黃
色的燈會(huì)變綠,軟件中StartRun按鈕也同時(shí)變?yōu)榧せ顮顟B(tài)(儀器不能空機(jī)運(yùn)行,也不能
只放適配器)。
6.設(shè)定完實(shí)驗(yàn)程序并編輯完樣本后(樣本信息可以在實(shí)驗(yàn)完成后編輯),點(diǎn)擊軟件中
StartRun按鈕,保存實(shí)驗(yàn)文件到數(shù)據(jù)庫(kù)指定文件夾中后運(yùn)行實(shí)驗(yàn)。點(diǎn)擊EndProgram
將進(jìn)入下一個(gè)程序可以正常分析,點(diǎn)擊AbortRun將終止實(shí)驗(yàn)而且數(shù)據(jù)不能分析。
7.軟件界面上出現(xiàn)RunComplete….標(biāo)識(shí)時(shí)?,說(shuō)明實(shí)驗(yàn)運(yùn)行完畢,按儀器正面灰色按
鈕,使載板器伸出,取下反應(yīng)板,再按按鈕,使載板器縮回,關(guān)閉LightCycler480儀器
后方的電源開關(guān),在電腦上分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。
8.分析完實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)后保存結(jié)果,打印報(bào)告,并關(guān)閉電腦及總電源,拷貝數(shù)據(jù)時(shí)建議用光
盤或格式化的U盤,實(shí)驗(yàn)人員在離開PCR擴(kuò)增區(qū)時(shí)帶走用完的反應(yīng)板。
維護(hù)SOP
LightCycler480是一臺(tái)免維護(hù)的儀器。做任何維護(hù)工作前,須確認(rèn)主機(jī)電源已被關(guān)閉。
預(yù)防性維護(hù):
1.檢查L(zhǎng)ightCycler480主機(jī)兩側(cè)與背后空間,確保無(wú)任何阻礙空氣流通的物品,包
括書本、紙張或窗簾等;
2.若主機(jī)表面和桌面有灰塵,用不起毛的軟布蘸少量清水擦拭干凈。
清潔性維護(hù):
若有需要,可用性質(zhì)溫和的商品化清潔劑或70%的乙醇溶液對(duì)LightCycler48()主機(jī)表
面、熱循環(huán)96孔模塊和熱蓋進(jìn)行清潔。
清潔96孔熱循環(huán)模塊:
L用移液器移取125m70-75%乙醇溶液或異丙醇至所有孔內(nèi);
2.15分鐘后,使用移液器對(duì)孔內(nèi)溶液進(jìn)行多次吹洗;
3.移除孔內(nèi)的液體,并使96孔模塊孔內(nèi)自然風(fēng)干;注意操作時(shí)不要讓清洗液腐蝕熱循環(huán)
模塊的涂層。
售后服務(wù):
故障報(bào)修或?qū)浖氖褂霉δ芑蛘呦嚓P(guān)參數(shù)設(shè)置有任何問(wèn)題,請(qǐng)座機(jī)致電800-820-
8864或者手機(jī)400-820-8864o
LightCycler480Software1.5軟件操作(中文版)
第一部分基本界面及圖標(biāo)
Overview界面
物
Exit:關(guān)閉LC480軟件
刎
Logoff:從目前使用的數(shù)據(jù)庫(kù)中退出并可登陸其他的數(shù)據(jù)庫(kù)
翻
@Overview:點(diǎn)擊該圖標(biāo)進(jìn)入"Overview”界面
Navigator:點(diǎn)擊該圖標(biāo)進(jìn)入“Navigator”界面,可進(jìn)行數(shù)據(jù)的導(dǎo)入導(dǎo)出等操作,
1161Save:點(diǎn)擊該圖標(biāo)進(jìn)行保存
⑧Export:導(dǎo)出當(dāng)前打開的文件
Close:關(guān)閉當(dāng)前打開的文件
昌
/Print:打印當(dāng)前打開的窗口
Tools:打開“Took”界面,可進(jìn)行密碼修改,建立和編輯用戶,系統(tǒng)設(shè)置,查看數(shù)
@據(jù)庫(kù)狀態(tài)、儀器狀態(tài)、濾光片組合等操作
Help:查看軟件版本,操作說(shuō)明書等
二、NewExperiment界面
■LightCyclcr?480Softrarcrelease1.5.0
InstrumentVirtualLightCycler48096SystemI/NotConnectedDatabase:MyComputer(Traceable)
Window:|NevzExperiment3User:SystemAdmin
RunProtocolDataRunNotes
Fxperi-
ment
DetectionFormat|SYBRGreenI/HIJCcustomize^BlockSizePlateID|ReactionVolume|203ffBl
ColorCompID|LotNo|TestID|
.ProgramsS
.ProgramNameAnalysisMode
0⑥Program?
0
ReportX?
TemperatureTargets
⑥TargetfQAcquisitionModeHold(hh:mm:ss)RampRate「Acquisitions(perSecTargetStepSizefStepDelay
CMCQ(cyc?e^?
一[95:Nor-2?00:00:01:q.4::o:0"IJ"
3⑧
@
0
1
Experi-
mentRunModule:編輯、運(yùn)行或查看PCR程序及查看PCR實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)
Subset
EditorSubsetEditor:點(diǎn)擊該模塊后可進(jìn)行子集的編輯
ile
SampleEditor:點(diǎn)擊后進(jìn)行樣品信息的編輯
AnalysisModule:點(diǎn)擊進(jìn)行結(jié)果分析或查看已保存的分析結(jié)果
K6bou
ReportModule:選擇需要的內(nèi)容以報(bào)告的形式給出結(jié)果
SummaryModule:查看實(shí)驗(yàn)的總體概況,包括實(shí)驗(yàn)名稱,所用的程序,檢測(cè)模
式,濾光片組合等。概況的內(nèi)容由系統(tǒng)自動(dòng)生成
三、Navigator界面
?LightCycler?480Softwarerelense1.5.0
Instrument:VinualLightCycier48096SystemI/NotConnectedDatabase:MyComputer(Traceable)
(RQCQ
Window:|Navigator□User:SystemAdmin
ExpenmerttnemeDemoAbsQuonlwithSYBRGieiA
NavigatorQuery
Createdcn2007-10188:38:15
-工JRootC<e<Xodby.SystemAdamn?l
*_?JAdhirutrabonLa?tnxxiitedon:200813115:34:43
LastmodifBdbySystemAdmin
?_Jhp
SoitwareveuonHTC13
-_|RocheReviaonhgtotyccmpJeteNo
三_|Expaments
|OemoAbsQuantwth$YBRGroen”RsSlattedat2005-6-911:24:49andcomplelet
G)DanoDualCokxHydrdyz訟PiobesInrtiumecinsmePilot-510
ImliumetiIDHTC_510
循DemoEndt>oniGenotypngPCR-Rcad
Oprr.iloiDemo
QDemoEndpantGenotypingPost-ReadNotesDetectionFWIMI:SYBRGieenI
公DemoGeneScamrgAbsoluteQuantificationwith*tand<wddilutionsn
QDemoMeltCurveGenotypngMcllmgCutveAnalysistodutmguixhspecificpt<
口DeonReiQuantDudCcioi
Progsam?
QDemoRdQuartMonoCola
I:Preincubation1CJFCteJt)None
傘DemoTmCaftngwithHybProbeProbes2'Amplification45cycle㈤Quanl
IMacro*?.MeltingCmve1cj.cle(.|Meltir
4Cooling1eyeleft)None
IPreferencesE]
?+-._jSpecialDaUBlocklype384wells
*_JTemplate?
-_|SystemAdmnDetectionCarnal:
:
?_UExper?nenlxNameSYBRGreen
IrtograbontmemodeManual
IMacro?01
:+!_|PreferencesFrtetcombrahons:
?_JSpecialDataAcirveName
圖_JTemplatesYetSYBRGieen(483533)
Analysemodiiec
1AbtQuanl/2ndDerivativeMax(oftype"Abt(
GeHedcc20079-2614.52:45
CrMtedSysteMAdmin
Results
I黑:霜]|Imp?!盵[Export[〔BatchImport](BatchExp
NewNewFolderOpenRenameDelete
(1)Navigator:保存的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和模板
L溫港]Problemreporting:儀器出現(xiàn)故障時(shí)生成一^t*問(wèn)題報(bào)告
I]Import:導(dǎo)入一個(gè)文件
[志。"]Export:導(dǎo)出一個(gè)文件
Ji"。"〕BatchImport:導(dǎo)入一批數(shù)據(jù)
I?…。"IBatchExport:導(dǎo)出一批數(shù)據(jù)
「嬴】New:新建一個(gè)實(shí)驗(yàn)或文件夾
NewFolder:新建一個(gè)文件夾
則」Open:打開一個(gè)文件
Rename:重命名
Delete:刪除選中的目標(biāo)
'Copy:拷貝選中的目標(biāo)
(2)Queny:設(shè)定條件進(jìn)行數(shù)據(jù)搜索和篩選
Note:所有上述圖標(biāo)在深藍(lán)色時(shí)為激活狀態(tài),灰色時(shí)為滅活狀態(tài)也就是不可用狀態(tài)。
各圖標(biāo)的功能在不同狀態(tài)下以顏色來(lái)區(qū)分是否具備。
軟件操作
一.打開軟件
打開電腦,Windows操作系統(tǒng)的用戶名為operator,密碼為L(zhǎng)C480(區(qū)分大小
寫)。電腦操作系統(tǒng)啟動(dòng)完畢,檢查電腦右下角是否有令圖標(biāo)。如果沒(méi)有,點(diǎn)擊桌面
“Exor4forXDMS_R”快捷方式文件。然后右鍵點(diǎn)擊它圖標(biāo),左鍵點(diǎn)擊“Show”,如最后一
句話顯示“Exor4serverisrunning”表示數(shù)據(jù)庫(kù)加載成功。如果顯示“Exor4failedtostart”則
表示數(shù)據(jù)庫(kù)沒(méi)有加載上,關(guān)閉該窗口,右鍵點(diǎn)擊e圖標(biāo),選“Shutdown",退出數(shù)據(jù)庫(kù),
重新雙擊桌面“Exor4forXDMS_T”文件,加載數(shù)據(jù)庫(kù)。
然后點(diǎn)擊桌面“LightCycler480Software”快捷方式文件,運(yùn)行該軟件。
輸入用戶名和密碼。用戶名默認(rèn)為admin(管理者權(quán)限),密碼為L(zhǎng)ightCycler480(區(qū)分
大小寫),如用戶已經(jīng)建立新用戶名,則可以按照新用戶名登錄。
二.用戶管理
為了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的有效管理,可以建立不同級(jí)別的用戶。如:標(biāo)準(zhǔn)用戶(Standard
User)、專業(yè)用戶(ExpertUser)、管理者(LocalAdministrator)。一般實(shí)驗(yàn)室建議建
立專業(yè)用戶(ExpertUser)用戶名,然后以該用戶名登錄軟件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作。
建立新用戶操作:打開LightCycler480操作軟件,點(diǎn)擊右側(cè)[割按鈕打開“Tools”工
具欄,選擇“UserAccess/UsersandGroups”選項(xiàng)。在右邊窗口中點(diǎn)擊“NewUser”鍵,在右
邊“Entertheuser'sfullname”一欄中填寫用戶的全名,在“Enterthenametheuserwantsto
loginas”一欄填寫用戶登錄名,在“Entertheuser'spassword”一欄中輸入密碼(密碼須含
有6個(gè)以上字母,1個(gè)以上數(shù)字,其中有至少一個(gè)字母大寫),在“Confirmthepassword”
一欄中重新輸入一次密碼,加以確認(rèn),在“Selecttheuser'srole”一欄中選擇用戶級(jí)別,然
后點(diǎn)擊右下方“Close”按鈕加以確認(rèn)。
在國(guó)I“Tools”工具欄中的“SystemSettings”界面中可以設(shè)置各用戶級(jí)的權(quán)限,以及
密碼的時(shí)效。
新建檢測(cè)通道:在底卜Tools”工具欄中的“DetectionFormats”界面中,點(diǎn)擊“New”,
命名檢測(cè)通道名稱,根據(jù)實(shí)際檢測(cè)的熒光探針在界面右上角的filtercombination
selection,勾選每個(gè)探針?biāo)鶎?duì)應(yīng)的激發(fā)光波長(zhǎng)(Excitation)和檢測(cè)波長(zhǎng)(Emission);在
右下角的list中Name欄目編輯每個(gè)通道對(duì)應(yīng)的探針名稱,并將每個(gè)探針的QuantFactor
設(shè)置為10,Maxintegrationtime改為2即可。
三.儀器自檢
每次開機(jī)時(shí),儀器會(huì)自動(dòng)進(jìn)行初始化自檢程序。自檢通過(guò),儀器左側(cè)指示燈變綠。
如放置了樣本,儀器右側(cè)指示燈變綠。在自檢時(shí),不能放置反應(yīng)板,否則自檢無(wú)法通
過(guò),如果儀器有配置八連管適配器,則應(yīng)注意該適配器日常不用時(shí)不能放入儀器中。
四.建立實(shí)驗(yàn)程序
打開LightCycler480操作軟件,成功登錄后點(diǎn)擊■一一二一瓶____J按鈕,進(jìn)
入NewExperiment/RunProtocol程序設(shè)置界面。在“DetectionFormat”一欄中選擇所使用
的熒光檢測(cè)技術(shù),可選擇各類探針和染料,如常見的SYBRGreenl染料、MonoColor
HydrolysisProbe單色TaqMan水解探針、MultiColorHydrolysisProbe多色TaqMan水解
-Setup------------------------------------------------------------------------------
探針DetectionFormat[MultiColorHydrolysisProbt▼[
在進(jìn)行多色熒光PCR實(shí)驗(yàn)時(shí),須點(diǎn)擊回E遺按鈕選擇用戶所采用的熒光檢測(cè)通道,
點(diǎn)擊確認(rèn)。
DetectionFormats
Dele島onFormatMultiColorHydrolysisProbe
-IntegrationTimeMode------------------------------------
t*Dynamic「Manual
o⑧
在ReactionVolume忸過(guò)一欄中填寫反應(yīng)體積。
在“Programs”界面中設(shè)置實(shí)驗(yàn)程序:在“ProgramName”下方命名程序,“Cycles”一欄
內(nèi)填寫該程序的循環(huán)數(shù),在“AnalysisMode”一欄選擇該程序的分析模式。定量分析選擇
“Quantification”,溶解曲線分析選擇“MeltingCurves”,顏色補(bǔ)償實(shí)驗(yàn)選擇“Color
Compensation”。
而后在“TemperatureTargets”界面內(nèi)設(shè)置所指定程序的內(nèi)容,在“Target(℃)”處填寫目
標(biāo)溫度,“AcquisitionMode”處選擇信號(hào)采集方式,“HokT一欄填寫該溫度所持續(xù)的時(shí)
間,“RampRate(℃/s)”處填寫升降溫速率。如一個(gè)程序有多個(gè)步驟,則在Temperature
Targets界面的左側(cè)處點(diǎn)擊⑥,增加步驟;也可點(diǎn)擊上下箭頭£)(3調(diào)整各步驟的先后
順序。如一個(gè)實(shí)驗(yàn)中有多個(gè)程序,也可在“Programs”界面左側(cè)點(diǎn)L[十I,增加程序,也可
點(diǎn)擊上下箭頭調(diào)整各程序的先后順序。
實(shí)驗(yàn)程度設(shè)置完成后,在下方“Overview”界面內(nèi)會(huì)自動(dòng)生成溫度隨時(shí)間變化的溫控
曲線,以及估計(jì)的運(yùn)行時(shí)間,綠色點(diǎn)表示采集熒光信號(hào)的溫度和時(shí)間點(diǎn),可以依照該圖
檢查一下程度設(shè)置是否正確。
|crIlghtCvder2480So內(nèi)二
Instrument:VirtualLightCycler48096SystemI■'NotConnectedDatabase:MyComputer(Research)
<1toche>
Window:|NewExperimentUser:SystemAdmin
IExperlRunProtocolDataRunNotme
DetectionFormat(MultiColorHydrolysisPCustomBlockSizePlateID|ReactionVolume
ColorCompID|LotNo「?TestID「H
Programs
ProgramNameCyclesAnalystsMode
pre-denatureiNone
AmplificationQuant1tication
HelclngCurveBeltingCurves
BlMCoolm9(None
0
AmplificationTemperatureTargets
TargetfQAcquisitionModi:Hold(hh:mm:ss)RampRatefAcquisitions(per"SecTargetfStepSizofStepDelay
魚
⑥qQQ(cycles)
〉
aai-
Al
設(shè)置好的實(shí)驗(yàn)程序可以保存成模板文件,下次使用同樣的實(shí)驗(yàn)程序時(shí)可以調(diào)用。具
I!....Apply....iO
.Template_I
SaveAs~
體操作如下:點(diǎn)擊工嬴PXJ按鈕右側(cè)的下拉箭頭,選中"SaveAsTemplate”選項(xiàng),系統(tǒng)
默認(rèn)將實(shí)驗(yàn)程序模板文件保存在所登錄的用戶名下“Templates”目錄中,用戶可將其存放
在其下的子目錄“RunTemplates”下,填寫該程序模板文件的名稱,點(diǎn)擊T”按鈕即完成保
存。調(diào)用模板程序時(shí)可點(diǎn)擊“ApplyTemplate”按鈕,從目錄樹中選定所要調(diào)用的模板,點(diǎn)
擊按鈕確認(rèn)。
五.樣本設(shè)置
1、樣本亞組編輯:LightCycler480軟件擁有一個(gè)獨(dú)特的樣本編輯管理功能——亞
組編輯(SubsetEditor),即將反應(yīng)板上所有的樣本根據(jù)用戶需要分成亞組,對(duì)亞組進(jìn)行
獨(dú)立地分析定量。具體操作如下:
在“NewExperiment”界面中,點(diǎn)擊左側(cè)的?巡J按鈕,進(jìn)入Subset設(shè)置界面,點(diǎn)擊⑥
按鈕新建亞組,并給其命名。點(diǎn)擊國(guó)按鈕可復(fù)制所選定的亞組,點(diǎn)擊叵司按鈕可更改
所選定亞組的名稱,點(diǎn)擊“Delete”按鈕可刪除所選定的亞組。設(shè)置亞組:在Subsets界面
中選定要設(shè)置的亞組名,在右邊反應(yīng)板孔位處選定該亞組所包含的孔位,使所選定的孔
位中都出現(xiàn)深藍(lán)色凹陷的序,點(diǎn)擊下方的?"3按鈕加以確認(rèn)。
高
InctrumeotVirtualLightCycier4809&SystemI>'No<ConnedodDatabase:MyComputer(Research)
卸
Window:|N?wExp?dmn?TMsecSyMemAdmin
囹
蔗
函
H
S
⑧
IS3I
囹
設(shè)置亞組可以在一塊反應(yīng)板上實(shí)現(xiàn)多個(gè)檢測(cè)項(xiàng)目的實(shí)驗(yàn),前提是這些檢測(cè)項(xiàng)目的實(shí)
驗(yàn)運(yùn)行程序都一致(這在使用T叫Man水解探針時(shí)比較容易實(shí)現(xiàn)),由于各檢測(cè)項(xiàng)目均
有各自的質(zhì)控對(duì)照,因而,設(shè)定亞組可以單獨(dú)對(duì)各檢測(cè)項(xiàng)目進(jìn)行分析。
2.樣本屬性編輯
點(diǎn)擊NewExperiment界面左側(cè)^司按鈕設(shè)置樣本信息。在“Workflow”一欄在選擇實(shí)
驗(yàn)方案:AbsQuant:絕對(duì)定量或定性分析;ReiQuant:相對(duì)定量;Scanning:基因掃
描;ColorComp:顏色補(bǔ)償;Tm:熔解溫度檢測(cè);MeltGeno:熔解曲線法基因分型;
EndptGeno:終點(diǎn)法基因分型。
-Step1:SelectWorkflow-------------------------------------------------------------
「AbsQuant「ReiQuant「Scanning「ColorComp
CTm('MeltGenoCEndptGeno
在SelectSainples/Subset選項(xiàng)中選定待編輯的樣本亞組:
-Step2:SelectSamples----------------
Subset:|HBVsamples二]
在界面右方編輯各樣本的名稱屬性等:
Pos:樣本在96孔板或384孔板上的位置;ReplOf:重復(fù)樣本設(shè)置;
SampleName:樣本名稱;QuantificationSampleType:定量樣本類型;Concentration:濃
度;TargetName:檢測(cè)類型。
-SelectFilterCombinations-------------AbsQuant-
Units[
F483-533廠558-610
一
PosColorReplOfSampleQuantificationConce
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