Graphpadprism6.0的基礎(chǔ)應(yīng)用

1、張張妮妮妮妮2016-5-31 19:00圖書館二樓多媒體培訓(xùn)教室圖書館二樓多媒體培訓(xùn)教室醫(yī)學(xué)繪圖與分析軟件醫(yī)學(xué)繪圖與分析軟件GraphPad Prism 6.05基礎(chǔ)應(yīng)用基礎(chǔ)應(yīng)用 GraphPad Prism是一款集數(shù)據(jù)分析和作圖為一體的數(shù)據(jù)處理軟件，尤其適合生物醫(yī)學(xué)類，可以直接輸入原始數(shù)據(jù)獲得高質(zhì)量的科學(xué)圖表。 它在統(tǒng)計(jì)分析上劣于SPSS 等統(tǒng)計(jì)軟件。 不需要輸入程序語言，只需輸入原始數(shù)據(jù)。 容易操作，繪圖美觀。 可與ppt，word相鏈接。 Graphpad與origin的比較簡(jiǎn)介大綱 統(tǒng)計(jì)圖基本知識(shí) GraphPad Prism6繪圖界面 案例分析 統(tǒng)計(jì)圖的排版與導(dǎo)出 統(tǒng)計(jì)圖的基本知識(shí)

2、 統(tǒng)計(jì)圖基本要素 常見統(tǒng)計(jì)方法的圖形表達(dá)統(tǒng)計(jì)圖的基本要素 1.標(biāo)題：一般位于圖的正下方，簡(jiǎn)明扼要說明主要內(nèi)容 2.X軸：有兩種 分類軸：表示兩種不同的類別 數(shù)據(jù)軸：表示一個(gè)數(shù)值概念 3.Y軸：一般為數(shù)值軸 4.圖形區(qū)：二維平面內(nèi)點(diǎn)、線、條表達(dá)數(shù)據(jù)From 常見統(tǒng)計(jì)方法的圖形表達(dá) 1.獨(dú)立樣本t檢驗(yàn) 2.配對(duì)t檢驗(yàn) 3.完全隨機(jī)設(shè)計(jì)資料的方差分析 4.析因設(shè)計(jì)資料的方差分析 5.重復(fù)測(cè)量資料的方差分析 6.兩組獨(dú)立樣本的秩和檢驗(yàn) 7.多組獨(dú)立樣本的秩和檢驗(yàn) GraphPad Prism6繪圖界面 一、歡迎界面 二、軟件主界面 三、目錄樹 四、快捷菜單欄 五、圖像模塊詳解 六、坐標(biāo)軸調(diào)整 七、圖形

3、設(shè)定界面歡迎界面 歡迎界面要對(duì)統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行選擇 特定的統(tǒng)計(jì)方法對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)錄入格式和圖像類型設(shè)定統(tǒng)計(jì)類別、圖像類型和數(shù)據(jù)輸入格式后，進(jìn)入軟件主界面1.統(tǒng)計(jì)類型統(tǒng)計(jì)類型2.數(shù)據(jù)輸入格式數(shù)據(jù)輸入格式3.示例數(shù)據(jù)，示例數(shù)據(jù)，也是統(tǒng)計(jì)方法也是統(tǒng)計(jì)方法的提示的提示二、軟件主界面三、目錄樹數(shù)據(jù)集；點(diǎn)擊，進(jìn)入數(shù)據(jù)錄入窗口，在歡迎界面選擇不同的統(tǒng)計(jì)類型，數(shù)據(jù)集的表格會(huì)有所不同圖形；當(dāng)完成數(shù)據(jù)錄入，點(diǎn)擊該圖標(biāo)，則自動(dòng)生成圖像布局文檔操作模塊，如打開、新建、保存、前進(jìn)、后退、復(fù)制和粘貼。該模塊與office軟件操作一致。分析模塊。圖形模塊，將對(duì)圖形類型、坐標(biāo)軸和圖形本身進(jìn)行分析，將重點(diǎn)解釋。文字修飾模塊，可以繪制線

4、條、添加文字，并對(duì)文字進(jìn)行調(diào)整。圖形輸出模塊，包括圖形導(dǎo)出，打印和一鍵輸入至word，ppt中。四、快捷菜單欄五、圖形模塊詳解相當(dāng)于統(tǒng)計(jì)方法和圖形類型選擇項(xiàng)，可以對(duì)統(tǒng)計(jì)方法重新選擇，但一般只對(duì)圖形類型進(jìn)行選擇。對(duì)坐標(biāo)軸進(jìn)行具體設(shè)定，包括原點(diǎn)、X軸和Y軸。對(duì)圖形進(jìn)行具體調(diào)整。圖表的配色方案，默認(rèn)為黑白圖表。六、坐標(biāo)軸調(diào)整1.坐標(biāo)框與原點(diǎn)（1）Origin原點(diǎn)的設(shè)定（2）繪圖區(qū)的形狀、大小和位置進(jìn)行設(shè)定，一般不需要設(shè)定。繪圖區(qū)的顏色背景顏色（3）坐標(biāo)軸的顏色（4）對(duì)圖形框和網(wǎng)格線進(jìn)行設(shè)定 X axis(X軸) Gaps and Direction：只有XY圖形，才能進(jìn)行設(shè)定X軸是否分段和方向一般為

5、線性，濃度選擇logo刻度對(duì)刻度圖示進(jìn)行調(diào)整添加輔助線，還可對(duì)兩條輔助線內(nèi)區(qū)域進(jìn)行填色3. Left Y axis(左Y軸)4. Right Y axis(右Y軸)軟件默認(rèn)無右Y軸與X軸設(shè)定方法類似Note：添加右Y后，所有圖像仍跟隨左Y,如果某些數(shù)據(jù)需要按照右Y,需要在Format Graph對(duì)話框中實(shí)現(xiàn)。5. Titles & Fonts(標(biāo)題和字體)七、圖像設(shè)定界面Data SetStyle:樣式，不同的圖形Additional options可以選擇數(shù)據(jù)集是否依據(jù)左Y還是右Y進(jìn)行顯示，如果出現(xiàn)第二Y軸，此處應(yīng)進(jìn)行設(shè)定。案例分析配對(duì)t檢驗(yàn) 適用情況（4種）： 配對(duì)的兩組受試對(duì)象分

6、別接受兩種處理 同一受試對(duì)象處理前后的比較 同一受試對(duì)象兩個(gè)不同部位的比較 同一樣品用兩種方法（儀器等）檢索結(jié)果的比較*實(shí)例1 抽取15名某大學(xué)的學(xué)生進(jìn)行了為期3個(gè)月的發(fā)展腿部爆發(fā)力的訓(xùn)練，運(yùn)用實(shí)驗(yàn)的方法在訓(xùn)練前后分別測(cè)試了每一人的立定跳遠(yuǎn)成績(jī)。統(tǒng)計(jì)15名學(xué)生訓(xùn)練前后的數(shù)據(jù)。該實(shí)例的圖像表達(dá) 應(yīng)該采用單一研究對(duì)象前后值連線的方式表達(dá) 與獨(dú)立t檢驗(yàn)區(qū)別開來 若數(shù)據(jù)太多，則不適合用圖形表達(dá)圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗(yàn)、ANOVA、秩和檢驗(yàn) 2.新建數(shù)據(jù)集 進(jìn)入主界面圖形繪制圖形繪制 Step 2：數(shù)據(jù)錄入 1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù) 2.點(diǎn)擊左側(cè)目錄樹中的G

7、raphs。 3.選擇圖形。 4.圖形生成。初始圖形 Step 3：坐標(biāo)軸和圖形調(diào)整 1. 點(diǎn)擊快捷菜單欄change模塊中 彈出坐標(biāo)軸對(duì)話框 2.選擇左Y軸，對(duì)Y軸進(jìn)行調(diào)整修改前后對(duì)比 3.選擇標(biāo)題和字體，對(duì)其進(jìn)行調(diào)整Note：不論中文還是英文，一旦亂碼，就要對(duì)“字體”進(jìn)行調(diào)整。 4.選擇X軸，對(duì)X軸進(jìn)行調(diào)整 5.對(duì)圖形的Symbols（符號(hào)）進(jìn)行修改圖形繪制 Step 4：文字修飾 1. 不需要的文字點(diǎn)擊刪除即可 2.可通過Write插入文字 3.在Text菜單欄對(duì)字體進(jìn)行調(diào)整分析數(shù)據(jù)圖形繪制 最后圖形如下：*成組t檢驗(yàn)實(shí)例2該實(shí)例的圖形表達(dá) 1.散點(diǎn)圖（圖1）：清晰描述各點(diǎn)數(shù)據(jù)，易發(fā)現(xiàn)離

8、群點(diǎn)，橫線為均值，適合數(shù)據(jù)較少時(shí)。 2.誤差圖（圖2）：箱頂為均數(shù)，觸須線表示SD，也可表示SE,適合數(shù)據(jù)較多時(shí)。 3.誤差圖（圖3）：點(diǎn)表示均數(shù)，直線表示兩側(cè)SD。圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗(yàn)、ANOVA、秩和檢驗(yàn) 2.新建數(shù)據(jù)集圖形繪制 Step 2：數(shù)據(jù)錄入 1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù) 2.點(diǎn)擊左側(cè)目錄樹中的Graphs。 3.選擇圖形。 4.圖形生成。圖形繪制圖形繪制 添加P值的bar圖形繪制 最后圖形如下：實(shí)例3 為了探討雌激素預(yù)防骨質(zhì)疏松癥的作用，研究者將30只10月齡SD雌性大鼠隨機(jī)等分到假手術(shù)組（組1）、卵巢切除組（組2）和卵巢切除后補(bǔ)充

9、17-雌二醇組（組3），12周后處死大鼠，取其股骨，測(cè)量股骨重量。定量資料-統(tǒng)計(jì)方法選擇 定量資料 正態(tài)：均值的比較 兩組：t檢驗(yàn) 多組：方差分析 非正態(tài)：中位數(shù)的比較 兩組：非參（Mean-Whitney U檢驗(yàn)） 多組：非參（Cruskal-Wallis H檢驗(yàn)）圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗(yàn)、ANOVA、秩和檢驗(yàn) 2.新建數(shù)據(jù)集 3.選擇圖形類型 -垂直柱狀圖圖形繪制圖形繪制最終的圖形實(shí)例4 某醫(yī)生將病人隨機(jī)分為兩組，分別以新療法和傳統(tǒng)療法治療。比較兩種療法的退熱時(shí)間有無差別。兩組獨(dú)立樣本資料比較的秩和檢驗(yàn)兩組獨(dú)立樣本資料比較的檢驗(yàn)方法 - 滿足正態(tài)分

10、布和方差齊性 -可用t檢驗(yàn)或完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的方差分析 - 不滿足正態(tài)分布或方差齊性不滿足正態(tài)分布或方差齊性 -可采用可采用Wilcoxn秩和檢驗(yàn)（秩和檢驗(yàn)（rank sum test） -推斷兩獨(dú)立樣本分別代表總體分布位置是否不推斷兩獨(dú)立樣本分別代表總體分布位置是否不同。同。 二、圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗(yàn)、ANOVA、秩和檢驗(yàn)圖形繪制 Step 2：數(shù)據(jù)錄入 1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù) 2.點(diǎn)擊左側(cè)目錄樹中的GraphsData4，自動(dòng)生成圖形。 3. 選擇Median，用橫線表示中位數(shù)。圖形區(qū)：均值與中位數(shù)的修改最終的圖形實(shí)例5折線圖研究進(jìn)食量與體重增加的關(guān)系二、圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.XY 線性回歸，非線性回歸，相關(guān)分析 2.新建數(shù)據(jù)集 3.選擇圖形類型 -散點(diǎn)圖兩變量的關(guān)聯(lián)性分析二、圖形繪制圖形繪制-