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實驗用禽(雞、鴨)-遺傳質量控制標準本文件適用于封閉群雞和鴨以及MHC單倍型雞修改單(不包括勘誤的內容)或修訂版均不適用本部分,鼓勵方,研究是否可以使用這些文件的最新版本。凡是不注日期的DB13/T804-2006雞住白DB32/T2130-2012普通級指人工豢養(yǎng)的鳥類動物,主要為了獲取其肉、卵和羽毛,也有作為其他用處。一般單倍體基因型的簡稱,也叫單體型,在遺傳學上是指3.4主要組織相容性復合體majorhistocompatibilityco主要組織相容性復合體是一組編碼動物主要組織相容免疫識別、排斥和免疫應答有關,在一定程度上雜合度又稱群體的平均雜合性,它是群體遺傳變異的觀測雜合度(Ho)是隨機抽取的兩個樣本的等位基因不相同的4.1.2封閉群繁殖的原則是盡量保持基因異質性及多態(tài)性,避免近交系數(shù)隨4.1.3各家系之間采用最佳避免近交法、循環(huán)交配或隨機交配法,每代近交4.2.1種禽的MHC核心區(qū)域保持單4.2.2繁殖原則是保持MHC核心4.2.3以全同胞或半同胞兄妹交配方式封閉群雞采用微衛(wèi)星分子標記封閉群鴨采用微衛(wèi)星分子4/16MHC單倍型鴨:測序結果與標),AADL0268ADL0278112~122GATCTCACCAGTATGAGCTGCTCTGTTGTTCAAAAGAAGATGCATGTTGGCACTCGAGAAAACTTCCTGCBGTTGCTGAGAGCCTGGTGCAGCCTGTATGTGGAATTACTTCTC88~100CTCCTGCCCTTAGCTAGCTCCATGTGAAGTGGTGGCTTCTGAAGCAGTTGCTATGG2 —用滅菌去離子水將PCR擴增產物適量稀釋。取稀釋產物2μL和含分子量標準的上儀上選擇DataCollection程序,電泳,收集熒光信號,形成膠圖。應用GeneMapper軟件進行數(shù)據(jù)提取、分子量標準設定和PCR產物P —取5μLPCR產物與1μL6×上樣緩沖液混勻,根據(jù)其產物片段的大小分別用DNA測序儀進行分析。上樣前,用滅菌去離子水將PCR的擴增產物根據(jù)檢測結果稀釋適宜倍數(shù)后,取稀釋產物2μL和含分子質量標準的上樣緩沖液8μL混合,95℃變性5min,取出后立即置于冰上。5min后,將變性的PCR產物上表B.2SPF鴨封閉群遺傳檢測ABC片段(1):2-F:5'-CCGTGGGATCCTCAGACC-3'2-R:5'-CGGCACTGCGCCATGGAG-3'擴增片段384bp。片段(2):3-F:5'-CTGTGTTTCAGGGTCTCACAC-3'3-R:5'-GCAGGACAAGGTCAGGATC-3'擴增長度為442bp。PCR反應結束后,用0.8%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,將檢測合格的PCR產物進行Sanger測序。序列分析軟件為Chromas2.0、MEGA4.0和LasergeneDNAStar7.0。片段(2)片段(2)GACGGCACCATCCGGGGGTATCATCAGGAGC片段(2)片段(2)GGACGTGGGGCGGGGGCTCAGCGTGGGGAGCTCAGCCCGGCCCTCATTGCCACCTGCCT-GCAGAGCGGCCCGAGGTGCGAGTGTGGGGGAAGGAGGCCGACGGGATCCTGACCTTGTCCTGC片段(2)GGATGGCACCATCCGGGGGTATCATCAG片段(2)D-TAP2-dR:5'-TGAAACCCATCAGGCACCATCCCAGGT-3'(Mg2plus)——PCR反應結束后,將電泳結果合格的PCR產物用于序列比對,DNAStar7.0用于比對序列和序列B1:ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGTGCCTGGCCTGTGTCCTGCTCCTGGCTGCTGGTGGGAGCTGGGAGGCTGTTGGCCCCCGGAGGACCCCGGGGAGCCCCGGCCCTGGTGAGCCCTGCCACCTTCCTTACCCTGCGGGGCTGCCTGGGTGGCCCTGGGGACCAAGGAGGTCAAGTACCAGGCGGCCCTGCACCGGCAGCCTCGCCTCTGCCAGCAGGTAGGGACCCCB2:ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGCGCCTGGCCTGTGTCCTGCTCCTGGCTGCCCGGTTGGCCCCGGCACTGGCACAGCTGGGTTGCTGGTGGGAGCTGGGAGGCTGTTGGCCCCCGGAGGACCCCAGGGAGCCGCAGCCCTGGTGAGCCCTGCCACCTTCCTTACCCTGCGGGGCTGCCTGGAGGTGGCCCTGGGGACCAAGGAGGTCAAGTACCAGGCGGCCCTGCGCCGGCAAGTGGCCCTTCCTCAGCGGAGCCTTCTTCTGCCTGCCTCGCCTCTGCCAGCAGGTAGGGACCCCCAGB3:ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGCGCCTGGCCTGTGTCCTGCTCCTGGCCCGGTTGGCCCCGGCACTTGCTGGTGGGAGCTGGGATGCTGTTGGCCCCCGGAGGACCCCGGGGCCTGCCACCTTCCTTACCCTGCGGGGCTGCCTGGGTGGCCCTGGGGACCAAGGAGGTCAAGTACCAGGCGGCCCTGCGCCGGCAAGTGGCCCTTCCTCAGCGGAGCCTTCTTCTTCCTTGCCTTGCCTCCGCCAGCAGGTAGGGA

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