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1、Western印跡印跡實(shí)驗(yàn)?zāi)康膶?shí)驗(yàn)?zāi)康膶?shí)驗(yàn)原理實(shí)驗(yàn)原理 Western印跡雜交法是利用特異性抗體做探針,對(duì)附著于固相支持體上的某些特異性蛋白進(jìn)行鑒別和定量的方法。它具有固相操作簡(jiǎn)便及不必對(duì)細(xì)胞進(jìn)行放射性預(yù)標(biāo)記等優(yōu)點(diǎn)。原理為:將待測(cè)樣品溶解于含有去污劑和還原劑的溶液中,SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳使蛋白變性并分離,用電轉(zhuǎn)移方法轉(zhuǎn)移到固相支持體上(NC膜、PVDF膜),濾膜與抗靶蛋白的非標(biāo)記抗體反應(yīng),再用二級(jí)免疫學(xué)試劑進(jìn)行檢測(cè)。檢測(cè)方法有放射性標(biāo)記、酶標(biāo)化學(xué)顯色或酶標(biāo)化學(xué)發(fā)光等。酶標(biāo)化學(xué)發(fā)光法以其高敏感性、結(jié)果可在X光片上長(zhǎng)期保存等優(yōu)點(diǎn)而優(yōu)于酶標(biāo)化學(xué)顯色法。 是蛋白水平檢測(cè),研究基因表達(dá)與功能的一種方

2、法。是蛋白水平檢測(cè),研究基因表達(dá)與功能的一種方法。 原理及步驟原理及步驟 T or cell 提取蛋白提取蛋白 聚丙烯酰胺凝膠電泳,分離蛋白(聚丙烯酰胺凝膠電泳,分離蛋白(SDS-PAGE ) 轉(zhuǎn)移(印跡)于硝酸纖維素膜轉(zhuǎn)移(印跡)于硝酸纖維素膜 加抗體檢測(cè)某種特異性蛋白質(zhì)加抗體檢測(cè)某種特異性蛋白質(zhì)Western Blot 實(shí)驗(yàn)材料實(shí)驗(yàn)材料129:1聚丙烯酰胺凝膠2Tris-甘氨酸電泳緩沖液:25mM Tris 堿250mM 甘氨酸0.1%(m/v) SDS31SDS凝膠加樣緩沖液: 50mmol/L Tris-Cl (pH6.8) 100 mmol/L 二硫蘇糖醇(DTT) 2% (m/v)

3、 SDS 0.1% (m/v) 溴酚藍(lán)10% 甘油臨用前加DTT,DTT可用0.01M 乙酸鈉(pH5.2)配成1mmol/L母液。4轉(zhuǎn)移緩沖液:25mM Tris 堿193mM 甘氨酸20% 甲醇51TBS:20mM Tris-HCl 150mM NaCl 最后調(diào)pH值至7.4 6TBST: TBS中加入0.05% Tween-20。7封閉液:用TBST配制5%脫脂奶粉。8Stripping Buffer:100mM 巰基乙醇2%(m/v) SDS62.5mM Tris-HCl最后調(diào)pH值至6.7方法和步驟一配膠注意一定要將玻璃板洗凈,最后用ddH2O沖洗,將與膠接觸的一面向下傾斜置于干凈的

4、紙巾晾干。分離膠及濃縮膠均可事先配好(除AP及TEMED外),過(guò)濾后作為儲(chǔ)存液避光存放于4,可至少存放1個(gè)月,臨用前取出室溫平衡(否則凝膠過(guò)程產(chǎn)生的熱量會(huì)使低溫時(shí)溶解于儲(chǔ)存液中的氣體析出而導(dǎo)致氣泡,有條件者可真空抽吸3分鐘),加入10%AP(0.70.8:100, 分離膠濃度越高AP濃度越低,15%的分離膠可用到0.5:100)及TEMED(分離膠用0.4:1000, 15%的可用到0.3:1000,濃縮膠用0.8:1000)即可,如室溫較低可升高10%AP及TEMED濃度。灌入2/3的分離膠后應(yīng)立即封膠,膠濃度10%時(shí)可用0.1%的SDS封,濃度10%時(shí)用水飽和的異丁醇或異戊醇,也可以用0.

5、1%的SDS。封膠后切記,勿動(dòng)。待膠凝后將封膠液倒掉,如用醇封膠需用大量清水及ddH2O沖洗干凈,然后加少量0.1%的SDS,目的是通過(guò)降低張力清除殘留水滴。片刻后倒掉SDS,將玻璃板倒立放置片刻控凈。灌好濃縮膠后1h拔除梳子,注意在拔除梳子時(shí)宜邊加水邊拔,以免有氣泡進(jìn)入梳孔使梳孔變形。撥出梳子后用ddH2O沖洗膠孔兩遍以去除殘膠,隨后用0.1%的SDS封膠。若上樣孔有變形,可用適當(dāng)粗細(xì)的針頭撥正;若變形嚴(yán)重,可在去除殘膠后用較薄的梳子再次插入梳孔后加水拔出。30min后即可上樣,長(zhǎng)時(shí)間有利于膠結(jié)構(gòu)的形成,因?yàn)槿庋塾^的膠凝時(shí)其內(nèi)部分子的排列尚未完成。 二樣品處理二樣品處理1培養(yǎng)的細(xì)胞(定性):

6、 去培養(yǎng)液后用溫的PBS沖洗23遍(冷的PBS有可能使細(xì)胞脫落)。 對(duì)于6孔板來(lái)說(shuō)每孔加200300l,6080的1loading buffer。 100,1min。 用細(xì)胞刮刀刮下細(xì)胞后在EP管中煮沸10min。 用干凈的針尖挑絲,如有團(tuán)塊則將團(tuán)塊棄掉,如果沒(méi)有團(tuán)塊但有拉絲現(xiàn)象,則可以將EP管置于0后在400016000g離心2min,再次挑絲。若無(wú)團(tuán)塊也無(wú)絲狀物但溶液有些粘稠,可通過(guò)使用1ml注射器反復(fù)抽吸來(lái)降低溶液粘滯度,便于上樣。 待樣品恢復(fù)到室溫后上樣。2培養(yǎng)的細(xì)胞(定量): 去培養(yǎng)液后用溫的PBS沖洗23遍(冷的PBS有可能使細(xì)胞脫落)。 加入適量的冰預(yù)冷的裂解液后置于冰上1020

7、min。 用細(xì)胞刮刀刮下細(xì)胞,收集在EP管后超聲(100200w)3s,2次。 12000g離心,4,2min。 取少量上清進(jìn)行定量。 將所有蛋白樣品調(diào)至等濃度,充分混合沉淀后加loading buffer后直接上樣最好,剩余溶液(溶于1loading buffer)可以低溫儲(chǔ)存,-70一個(gè)月,-20一周,4 12天,每次上樣前98,3min。3組織: 勻漿:對(duì)于心肝脾腎等組織可每50100mg加1ml裂解液,肺100200mg加1ml裂解液??墒謩?dòng)或電動(dòng)勻漿。注意盡量保持低溫,快速勻漿。 12000g離心,4,2min。 取少量上清進(jìn)行定量。 將所有蛋白樣品調(diào)至等濃度,充分混合沉淀加load

8、ing buffer后直接上樣最好,剩余溶液(溶于1loading buffer)可以低溫儲(chǔ)存,-70一個(gè)月,-20一周,4 12天,每次上樣前98,3min。 三電泳三電泳1上樣前將膠板下的氣泡趕走。2所有蛋白樣品調(diào)至等濃度后上樣,樣品兩側(cè)的泳道用等體積的1loading buffer上樣,Marker也用1loading buffer調(diào)整至與樣品等體積。3. 以初始電壓為45V時(shí)的電流強(qiáng)度進(jìn)行穩(wěn)流電泳,當(dāng)電壓達(dá)65V時(shí)改為穩(wěn)壓電泳。4. 在目的蛋白泳動(dòng)至距膠下緣1cm以上結(jié)束。 四轉(zhuǎn)膜四轉(zhuǎn)膜1電泳結(jié)束前20分鐘左右戴上手套開(kāi)始準(zhǔn)備:浸泡NC膜:將NC膜平鋪于去離子水面,靠毛細(xì)作用自然吸水后

9、再完全浸入水中10min以排除氣泡,隨后浸泡入轉(zhuǎn)移液中。PVDF膜則在M-OH中浸泡20min以上后轉(zhuǎn)入轉(zhuǎn)移液中。將濾紙也浸入轉(zhuǎn)移液中。2取膠:將膠卸下,保留30-100KD或分子量范圍更廣些的膠(以便以后雜其他感興趣的蛋白),左上切角,在轉(zhuǎn)移液中稍稍浸泡一下,置于潔凈玻璃板上,按“濾紙凝膠NC膜濾紙”(從上到下)的順序裝置好。注意用玻棒逐出氣泡,剪去濾紙與膜的過(guò)多部分(尤其是干轉(zhuǎn),以防止短路)3轉(zhuǎn)膜:濕轉(zhuǎn):電轉(zhuǎn)槽用去離子水淋洗晾干,加入1,000ml電轉(zhuǎn)液。將膠平鋪于海綿上,滴加少許電轉(zhuǎn)液再次驅(qū)趕氣泡,封緊后放入電轉(zhuǎn)槽,注意膜在正極一側(cè)。降溫,將電泳槽置于冰水混合物中。恒流100mA過(guò)夜,或

10、400mA,4h。注意不同蛋白的要求不同。干轉(zhuǎn):用電轉(zhuǎn)液淋洗石墨電極,濾紙吸干,鋪上膠,再滴少許電轉(zhuǎn)液,以1.5mA/cm2凝膠面積轉(zhuǎn)移1-2小時(shí)。負(fù)載電壓不宜超過(guò)1V/cm2膠面積。 五封閉及雜交五封閉及雜交1封閉:將膜從電轉(zhuǎn)槽中取出,去離子水與TBST稍加漂洗,浸沒(méi)于封閉液中緩慢搖蕩一小時(shí)。必要時(shí)可先用麗春紅染色(2%乙酸,0.5%麗春紅的水溶液)觀察蛋白條帶,再用去離子水和TTBS將麗春紅洗脫后封閉,如用蛋白marker則可省略此步。2結(jié)合一抗:一抗的準(zhǔn)備:使用反貼法時(shí)每張39cm2膜約需2ml一抗稀釋液。反貼法的操作:含一抗的封閉液滴加于搖床的塑料膜上,將Western膜從封閉液中取出

11、,濾紙貼角稍吸干,正面朝下貼在一抗上,注意不要留下氣泡,室溫下輕搖孵育一小時(shí)或4靜置過(guò)夜。在反應(yīng)體系外面罩一濕潤(rùn)平皿以防止液體過(guò)多蒸發(fā)。3洗滌:一抗孵育結(jié)束后,用TBST漂洗膜后再浸洗四次,每次10min。4結(jié)合二抗:根據(jù)一抗來(lái)源選擇合適的二抗,根據(jù)鑒定方法選擇HRP或AP標(biāo)記的抗體,按相應(yīng)比例稀釋(1:10001:10000),室溫輕搖一小時(shí)。5洗滌:二抗孵育結(jié)束后,用TBST漂洗膜后再浸洗六次,每次10min。 六發(fā)光鑒定六發(fā)光鑒定一般使用辣根過(guò)氧化物酶HRP-ECL發(fā)光法或堿性磷酸酶AP-NBT/BICP顯色法。1HRP-ECL發(fā)光法:將A、B發(fā)光液按比例稀釋混合。膜用去離子水稍加漂洗,

12、濾紙貼角吸干,反貼法覆于A、B混合液滴上,熄燈至可見(jiàn)淡綠色熒光條帶(5min左右)后濾紙貼角吸干,置于保鮮膜內(nèi)固定于片盒中,迅速蓋上膠片,關(guān)閉膠盒,根據(jù)所見(jiàn)熒光強(qiáng)度曝光。取出膠片立即完全浸入顯影液中1-2min,清水漂洗一下后放在定影液中至底片完全定影,清水沖凈晾干,標(biāo)定Marker,進(jìn)行分析與掃描。2AP-NBT/BICP顯色法:每片NBT/BICP可溶解于30ml水中,使用前將一片分裝在30個(gè) EP管中,每張39cm的膜取一管配成1ml即可。將PBST或TTBS洗滌過(guò)的膜用去離子水稍加漂洗,濾紙貼角吸干,反貼法覆于NBT/BICP溶液液滴上,并用不透明物體(如報(bào)紙)遮擋光線,顯色20s后每

13、10s觀察一次,至條帶明顯或有本底出現(xiàn)時(shí)將膜揭起置去離子水中漂洗后放濾紙上晾干即可觀察與掃描。 七膜再生七膜再生 如前次雜交結(jié)果條帶距離本次雜交的蛋白的預(yù)計(jì)位置差別較大則只需用TBST洗滌掉發(fā)光液(10min3次)后從一抗雜交開(kāi)始,后續(xù)步驟同前。 如前次雜交結(jié)果條帶距離本次雜交的蛋白的預(yù)計(jì)位置較近則需更強(qiáng)的洗滌,可用 strip液(可用雜交袋)于室溫?fù)u動(dòng)洗滌30min60min,然后用TBST洗滌10min3次,再?gòu)姆忾]開(kāi)始,后續(xù)步驟同前。 對(duì)于雜交若干次的膜,如果常規(guī)洗滌方法不易去掉眾多條帶,可用強(qiáng)度更強(qiáng)的自配的strip液(可用雜交袋)于50洗滌30min,然后用TBST洗滌10min3次

14、,再?gòu)姆忾]開(kāi)始,后續(xù)步驟同前。 四、注意事項(xiàng)四、注意事項(xiàng)內(nèi)參即是內(nèi)部參照,對(duì)于哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)來(lái)說(shuō)一般是指由管家基因編碼表達(dá)的蛋白,它們?cè)诟鹘M織和細(xì)胞中的表達(dá)相對(duì)恒定,在檢測(cè)蛋白的表達(dá)水平變化時(shí)常用它來(lái)做參照物。其作用是校正蛋白質(zhì)定量、上樣過(guò)程中存在的實(shí)驗(yàn)誤差,保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。 在Western Blotting中使用內(nèi)參其實(shí)就是在WB過(guò)程中的另外用內(nèi)參對(duì)應(yīng)的抗體檢測(cè)內(nèi)參,這樣在檢測(cè)目的產(chǎn)物的同時(shí)可以檢測(cè)內(nèi)參的表達(dá),由于內(nèi)參在各組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對(duì)恒定,借助檢測(cè)每個(gè)樣品內(nèi)參的量就可以用于校正上樣誤差,這樣半定量的結(jié)果才更為可信。此外使用內(nèi)參可以作為空白對(duì)照,檢測(cè)蛋白轉(zhuǎn)膜情況是否完全、整

15、個(gè)Western Blot顯色或者發(fā)光體系是否正常。常用的蛋白質(zhì)內(nèi)參有GAPDH和細(xì)胞骨架蛋白beta-actin或beta-tubulin。一般要選擇一個(gè)在處理因素作用的條件下蛋白含量不會(huì)發(fā)生改變的蛋白作內(nèi)參。1. 為了讓實(shí)驗(yàn)更加嚴(yán)謹(jǐn)有說(shuō)服力都要設(shè)計(jì)對(duì)照實(shí)驗(yàn),對(duì)照分為:陽(yáng) 性對(duì)照(最好有標(biāo)準(zhǔn)品(比如-actin,GAPDH)或陽(yáng)性血清);陰性 對(duì)照(測(cè)血時(shí)用相應(yīng)小鼠未免疫血清(即正常血);空白對(duì)照(不加一抗,用PBS代替);無(wú)關(guān)對(duì)照(用無(wú)關(guān)抗體)2. 一抗、二抗的濃度一般要參照抗體說(shuō)明書(shū)選擇最適當(dāng)?shù)谋壤?,一抗二抗的選擇直接影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果以及背景的深淺。3. 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)時(shí)所釆用的抗原批次要一樣,盡量的避免人為的帶來(lái)個(gè)體差異。特別在做裂解液時(shí)更要注意所釆用的操作條件,盡可能的排除可變因素給實(shí)驗(yàn)帶來(lái)不確定性。4. 凝膠的質(zhì)量直接影響以后的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,要特別注意幾點(diǎn):凝膠要均一沒(méi)有氣泡;積層膠與分離膠界面要水平;AP和TEMED的量不能過(guò)多,太多會(huì)導(dǎo)致膠易脆裂;拔梳子時(shí)要快,盡量保證點(diǎn)樣孔平整。5. 電泳、轉(zhuǎn)膜時(shí)特別要注意正負(fù)極,電壓電流都不能過(guò)高;轉(zhuǎn)膜時(shí)“三明治”的疊放次序不錯(cuò),同時(shí)要防止產(chǎn)生氣泡;盡量讓電轉(zhuǎn)溫度保持在

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